5EKOA

Crystal structure of mapk13 complex with inhibitor
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
350
structure length
341
Chain Sequence
SLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPFQSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMGMEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTAAQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 13
publication title First comprehensive structural and biophysical analysis of MAPK13 inhibitors targeting DFG-in and DFG-out binding modes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 103
structure length 341
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2015-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ekoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ekoA01
1PJKA 5HIEA 1JPAA 3K5UA 3RBWA 1JSTA 2W05A 4FEWA 3OW4A 4NUSA 2Z7LA 4QQTA 2I6LA 2X9FA 2WO6A 3CTHA 3MVLA 4QRCA 4AW2A 2CGWA 2VX3A 3FLWA 3MI9A 4Y5HA 3RAWA 2PVRA 3GC0A 5K4JA 3LCTA 5A6OA 4RC4A 1ND4A 1OIQA 4L42A 3UVRA 1P2AA 2VWIA 2WFYA 4ZJVA 2G9XA 3ZFYA 4EOQA 2OU7A 2Y8OA 3ORNA 2OJFE 3SOCA 5BVDA 3NMUF 4FEQA 1OL5A 2Y7JA 3Q9YA 5EK7A 4BDCA 5JGAA 2XP2A 4IM3A 1IEPA 2W0JA 3UZTA 3Q9XA 3QGWA 4MK0A 3KA0A 3C51A 3L8XA 3L8SA 4QTBA 4GJ3A 2YIRA 2PUUA 4RZWA 3GFEA 5KHXA 2EB3A 1H00A 3PJCA 4GV1A 5K0KA 2HIWA 3UDBA 3ZLWA 1K9AA 4NM3A 2CNVA 2J51A 4IZ7A 4MNFA 1JSUA 2OWBA 1Y6BA 4AZFA 2XS0A 3D15A 3KXNA 2YAKA 5EW9A 1F0QA 4FTOA 4FTQA 4OTIA 4RC3A 1VYWA 2WTJA 3FMKA 3BYUA 5C8NA 1PRYA 4TW9A 4EZ7A 2IZUA 4XOYA 2J90A 3VUIA 1OKWA 4AGDA 2X1NA 2ZM1A 3PY1A 5J7BA 3HAMA 5KZIA 4BDFA 4E6CA 5CAOA 5M08A 3LQ5A 3ZRMA 4GFMA 3W1FA 4GG5A 4G2FA 3ZRKA 1R0EA 3GEQA 4AT4A 1OKZA 1J1CA 3VUKA 4DEIA 4R8QA 1KOAA 2ERKA 1PXKA 3GXLA 1WBVA 4MF1A 4AQCA 5CZIA 4FGBA 5AR3A 4RZVA 4RJ3A 2QR8A 2V7OA 3LFSA 2C1AA 2YISA 5HIDA 5I9YA 2PMLX 3E8CA 1FINA 3VVHA 4O82A 4BDGA 4O7YA 4FKPA 2BZHB 3U87A 2JIUA 3JVRA 2P2HA 2X6DA 3HP2A 4Z7GA 5ANIA 2LGCA 3ZTXA 5BMSA 4EYJA 2I40A 3FV8A 5F94A 1F3MC 4EUTA 3HKOA 5LVMA 3LKMA 1PW2A 1XWSA 2EB2A 3MB6A 3QTZA 5EQYA 3FMJA 2QVSE 5BVEA 2WD1A 3A7FA 2IN6A 1XHAA 2IWIA 2CLQA 5JRSA 3QZHA 3R7IA 1PKGA 5HO8A 3I4BA 5ACBC 2IVSA 4IC7A 2FA2A 4AE9A 5M57A 3GGFA 1YRPA 3KF7A 3WE4A 3NUAA 5CEIA 3AG9A 4JS8A 3EQGA 3PRFA 4EZ5A 4NJ3A 5CNOA 1O6LA 3FQEA 3NR9A 4WO5A 3SQQA 2DYLA 3KCKA 4G3GA 2YIXA 3KK8A 3DU8A 2ITXA 3AT2A 3BBTB 3Q04A 3QQUA 1ZMVA 3V01A 5HOAA 2UZDA 1ZYLA 4ANNA 3QRKA 1O9UA 4TNBA 3P7AA 5CTPA 4TNDA 4OBPA 4QMUA 3R8VA 4YZ9A 4QMWA 4DGMA 4RX8A 2WXVA 4EKKA 2AC3A 5DOSA 3QTQA 4WOVA 4J8NA 1J3HA 4EORA 4OTRA 1TQMA 5IQBA 4FV5A 1BX6A 3P86A 5L8JA 5C4KA 2X9EA 3C0HA 4MHAA 4XV9A 3OBJA 2WTIA 4AX8A 3Q60A 5J8IA 4PDSA 3BCEA 2QOIA 3R7EA 2Z8CA 3LM5A 3FMLA 4FR4A 4FV8A 5IH4A 4RWKA 3MFRA 4DCEA 1BMKA 1V0PA 2PPQA 2PMNX 3H0ZA 3OUKA 4FTAA 4X3FB 2YAAA 2YCQA 3EIDA 4WNMA 5FBNC 2W1HA 3TZ8A 3KC3A 4GL9A 4FV4A 4ZZNA 2XIXA 3C5IA 3EN6A 4GMYA 1APME 4UV0A 2XK4A 5TR6A 5CNNA 4NFMA 1GNGA 3DJ7A 1WVWA 3A61A 3C0IA 3HV3A 4KBCA 2P4IA 2XKCA 4X3FC 3C4WA 3EZRA 3FC1X 4I5PA 3AD5A 3KVXA 4EYMA 4NL0A 3S2PA 3UE4A 2VD5A 4GJ2A 4GEOA 4PNIA 4E8AA 3GU7A 3EN4A 4TYGA 2GNHA 4G17A 4FIHA 1QCFA 4NM7A 3FI3A 4ZZMA 5FRIA 3MBLA 1GIIA 4OR5A 2VTRA 3C4CA 4GVAA 4RLLA 3WZDA 4A4XA 4MX9A 3R1YA 4FKGA 4RA4A 3GCQA 2PMIA 1R39A 4K2RA 3CPBA 3VBVA 2PE1A 4MAOA 4L43A 1ZWSA 4YZDA 5CSXA 2UW7A 3U51A 3FQSA 4QMXA 3ZCLA 5HTBA 4F7JA 4MQ2A 1VR2A 2A2AA 3A99A 5ANKA 3FWQA 4EOSA 3QLFA 2R3FA 5AA8A 3DAJA 3WZEA 2GFSA 2GHLA 5IUHA 1J1BA 4FSWA 2JIVA 3K2LA 4L67A 3Q96A 2O65A 2OZAA 4B0GA 3ZFMA 4BKZA 1Q8YA 2BKKA 3CY3A 2HYYA 2W1CA 3VS0A 2Q83A 3LXPA 2XJ0A 2F7XE 4OT5A 5IQCA 3KRWA 2XBJA 3VS7A 4FVPA 4HVGA 4JQ7A 4X2NA 5DT0A 3QQHA 3FLSA 1SVEA 1XKKA 3VUHA 1M7QA 1Q5KA 3QZGA 4BHZA 2ZB1A 3A8WA 4FKWA 3RVGA 5KMJA 4BZNA 4RA5A 4IDVA 3BGZA 2PZ5A 2XCHA 2FSOX 3RK9A 4H36A 4FKTA 4GUBA 3LFAA 1B38A 1J7IA 1JQHA 1YWRA 3SV0A 1J7LA 3EQRA 4FIFA 4E4NA 5L2TA 4CG9A 5CAQA 1OL2A 4ACGA 3KMUA 1UVRA 3Q5IA 4D0WA 5DBXA 4ERKA 3BLHA 3OXIA 3K3JA 4MF0A 4X2JA 2XKDA 2WOUA 4I6QA 5CALA 1A48A 3RPVA 3LJ2A 1OECA 1PF8A 4W8DA 5E8SA 2PUIA 5GJDA 5CU0A 5IQHA 2LAVA 4BYJA 1H1QA 2KTYA 4HGSA 4FEVA 4OLIA 4ACMA 5AWMA 3MY5A 3NNUA 4F9BA 2VTLA 4I92A 4CD0A 4FT7A 5LXMA 3EFJA 5D10A 3QFVA 4EHEA 2VNYA 4MD7E 3PA5A 4QMPA 5CU4A 4XH6A 4YMJA 4BICA 5LVLA 5IH5A 5ITAA 2OG8A 3OD6X 5LVPA 1VYZA 2BIYA 4X7QA 1PMEA 4YZNA 4P5QA 4BDJA 5JKGA 2RFNA 4LL5A 4B8LA 3TDVA 1K3AA 1R0PA 1YXVA 2QLQA 5C03A 3RPRA 4F09A 4FIGA 4ZTNA 5DMZA 1FGIA 4BR3A 1B6CB 3BI6A 3N9XA 1OIRA 3PP1A 4OT6A 5DGZA 4DINA 3EKNA 3P0MA 4NK9A 4NIFB 2OICA 4Q2AA 3WYYA 4AXAA 1H07A 3BHUA 3LMGA 5DT4A 5AV0A 3GB2A 1YXXA 4BCOA 3S1HA 3R1QA 2IW6A 2B9IA 3FY0A 4TT7A 1DI8A 2XJ2A 3R9HA 3ZONA 4RIXB 1NT2A 1JAMA 4FODA 4U5JA 3ENMA 4LG4A 4FV9A 2V22A 3QRJA 3ZHPC 5J79A 1RW8A 4UWYA 4F7LA 3AC2A 5AUVA 4USFA 3FLZA 3VBTA 1YHVA 3ZM4A 4QTDA 2WQMA 3HAVA 4X0MA 5HEZA 1H27A 2I0HA 4G3DA 3R02A 2GCDA 4FZAB 5J95A 4C8BA 1JOWB 1YWNA 3DY7A 4IHPA 3RNIA 4C59A 3HECA 4TYEA 3RKBA 5CEQA 4YNOA 5K4IA 4AGWA 3R73A 1GIHA 1H1WA 4I22A 5J1VA 4LYNA 2WEIA 3MFSA 3DDPA 2BRNA 2NRUA 1KSWA 3U6IA 4HVDA 4MNEB 3LIJA 3BIZA 4K33A 3ENHA 3EQDA 5EYDA 3V3VA 5JZJA 1ERKA 4ZLYA 2R3MA 4GK2A 4QP3A 5ANJA 4IMYA 1YWVA 2C47A 3DTCA 3ZUTA 5M56A 2BRHA 5HICA 4O0XA 3QQJA 4FSYA 4BGQA 4YJTA 3QKKA 5LMKC 3UZRA 4Q9ZA 2R64A 2WKMA 3HA8A 4PMTA 5AMNA 1WBTA 3EYGA 4CLIA 2IG7A 4X6QC 4M69B 1GZOA 3OWLA 4JAIA 4KB8A 4XV3A 3PSBA 2XNEA 2BTRA 4PWNA 3QTSA 4KS8A 4OTQA 2J2IB 4WG5A 4O0RA 5JRQA 3PIYA 2BHHA 3RI1A 4CFVA 3QCQA 4LM5A 4E73A 3KRRA 1UKIA 3FE3A 5BVKA 2IPXA 4EONA 4DCAA 4A7CA 2Y6OA 3UTOA 5DEWA 1W0XC 4BCPA 3ORXA 4HYIA 1KV1A 3FEGA 1L8TA 3SC1A 3W2OA 4BRXA 3ZLSA 3CP9A 3R8MA 4FA2A 2OJJA 3Q6UA 5HLWA 2B0QA 4GYIA 3HUCA 2GTNA 4FMQA 3G15A 3L9PA 3O96A 4AS0A 5AR5A 5HCXA 3A7GA 3OY1A 4J97A 4E5BA 4CCBA 3PXYA 4LRMA 2J0JA 2J5FA 3CGFA 4BYIA 4D9UA 4F7SA 2XKEA 1WBOA 2X0GA 5CY3A 4HYUA 4EBWA 3F3UA 4JQ8A 3FLYA 4XG7A 4F6SA 5I3OA 2B4SB 4DGNA 5HE3A 3NYXA 4BKJA 5EH0A 4DEBA 1HCKA 3R00A 4O6EA 4EOOA 3T8OA 3HV7A 2BDFA 3I81A 4J98A 3LLAA 4YHJA 3CGOA 2ZOQA 4FK3A 1OIYA 2GNLA 4PDOA 4YJOA 4AWIA 3O7LB 3ZO2A 3AOXA 1PHKA 2YIYA 2XM9A 3EQFA 3U6HA 2PZIA 3HX4A 4FKVA 2XNGA 2PZYA 3A4OX 4EQMA 2C6KA 2GQSA 3B8QA 4RJ6A 4DT9A 2R0UA 4MBLA 4TWOA 4DEHA 3R7VA 3OF0A 4G9RA 5DT3A 3F82A 4YTIA 3UIUA 5BNJA 3FI8A 4QMVA 1H1RA 4ZS4A 4JBPA 1UNLA 4KKHA 2W5HA 2SRCA 4MVFA 4GRBA 1XH5A 3R22A 1TKIA 2YCFA 3COMA 3IW8A 2A1AB 2JBPA 3BLQA 1JKSA 3OT8A 4U8ZA 5CF5A 3LJ0A 3QX4A 4RIWA 4Z55A 2OJGA 2F2UA 4CNHA 2QLUA 4IDTA 5AIKA 4M7IA 4UX9A 4FTCA 2GHMA 4QP6A 2Y9QA 5DYJA 5IQEA 2YCRA 4KA3A 3TNPC 5CAPA 3PXQA 1M7NA 1FVRA 2PMOX 3QZFA 4AACA 4EH5A 2VO0A 4FTIA 4G6NA 4R78A 1H8FA 1YXTA 2OW3A 2Z2WA 1HOWA 4LMNA 5FLFA 4BVUA 4IXPA 1UKHA 2QC6A 1YI4A 3KKVA 3LVPA 4JVGA 3TN8A 4BWPA 4C3RA 3CEKA 1SYKA 4FKJA 5LMAA 1OBGA 3NW6A 3OROA 4GT5A 1KOBA 4OGRA 2PVFA 3S00A 2QKWB 1UU8A 4R7HA 3D9VA 4QP7A 3KMWA 5FEEA 4XRLA 2B1PA 5FM2A 3TNIA 4ZSGA 4WSYA 2JKMA 1IRKA 4X2FA 2UW3A 4BDBA 5IH6A 4OAUC 4CRLA 5IDPA 5E1SA 3HMOA 3ZXZA 3JUHA 4F64A 4ANLA 5C8MA 4Q9SA 3HL7A 1CKJA 4FYNA 2DQ7X 5G6VA 5DPVA 2PL0A 4U6RA 5JMSA 4W4WA 1PXLA 3G0EA 5EHLA 3ORKA 5ANGA 2UVYA 3D94A 4QMLA 5ETCA 2ONLC 4BCHA 4QO9A 4FICA 5CSPA 4S34A 3LW0A 1BL6A 5F95A 5FXSA 2YJRA 3RP9A 5CT0A 3U4WA 2YZLA 3K5VA 2H96A 3R9OA 5B2LA 4E20A 2I0YA 3AGLA 4MH7A 3WIKA 4L3PA 4M97A 1QPCA 3KL8A 4LUEA 5HNBA 2BRMA 4HPTE 5E1EA 3JY0A 4AOIA 2PYWA 3GC7A 3D2KA 3H9OA 1JVPP 2R3QA 3CQWA 3QC9A 3RJCA 1BLXA 2G01A 3KULB 3G5DA 4IAKA 4L8MA 5FTQA 3QUDA 2XNPA 2R3OA 4G5PA 3COHA 4KBAA 4DH7A 5M09A 1TQIA 4RRVA 2BUJA 1YQJA 1CKPA 4JBVA 4GKHA 2P55A 2VWUA 4GFOA 1OKVA 4KSQA 5BYLA 4WUNA 2X2MA 5L6OA 3VHKA 4OTWA 3HRBA 2W4JA 3UODA 4BDHA 4P7EA 4RQKA 4AA0A 1OITA 3DFAA 2QCSA 3MVJA 1Y8YA 3H30A 2X2KA 5AP2A 4F9YA 3BHTA 3DNEA 3KF4A 3DXQA 3JPVA 4M67A 1M14A 3QCSA 4RIYA 3F3WA 4FBXA 2QOKA 2JDRA 4Y95A 1OL1A 4I0SA 3SRVB 4A4LA 4AW5A 2ITTA 3D5XA 4ACHA 2H9VA 2R4BA 3CPCA 4I94A 1FQ1B 1ZRZA 2WU7A 3LE6A 2GTMA 5AP1A 3ODZX 2PE2A 3V04A 5KNJA 3UGCA 5KBQA 3HV4A 2J50A 3D5WA 2BPMA 3IECA 3OXTA 4PL5A 4U7ZA 3F5GA 4BGGA 3SAYA 3UPZA 2C68A 4APCA 4UY9A 4IAFA 3G9LX 5HLPA 4D9TA 4CFWA 4V0GB 4B8MA 3NGAA 2XIYA 4X21A 4A9UA 3UYSA 3A7IA 4CT1A 4LFIA 2E9PA 5CVGA 2WTDA 5L3AA 1OVEA 4FT5A 1NXKA 1ZLTA 4FSRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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