5EM7A

Egfr kinase domain mutant "tmlr" with pyridone compound 13: 4-[(2-methoxyphenyl)amino]-~{n}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{h}-pyridine-3-carboxamide
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
324
structure length
300
Chain Sequence
GEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKEATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLIMQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGRAKLVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYDMDDVVDADEYLIP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
publication title Pyridones as Highly Selective, Noncovalent Inhibitors of T790M Double Mutants of EGFR.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 300
sequence length 324
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5em7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5em7A01
2IVSA 3SVVA 2OH0E 1VZOA 2OI4X 4YO6A 2YIXA 2W5HA 1IAJA 5L6OA 3PWYA 4HNIA 1M7NA 2ITUA 2Q0NA 3AG9A 3QRKA 4UZDA 4EEVA 2P2HA 2XRWA 3QWKA 3WILA 5IZFA 5EQPA 3OTUA 4J71A 5HE0A 2X8EA 4O6EA 1QL6A 4D2PA 3RHXA 2CKPA 3BLQA 4PPCA 3R7YA 3WBLA 3S00A 5KZ0A 2J6MA 2R5TA 3QKLA 3WZDA 3LMHA 3FXZA 4U43A 4YHTA 4LQMA 4C3FA 4J53A 1WAKA 2VTHA 1Q5KA 3OXIA 3D5VA 2IZRA 4FF8A 5HE3A 4YUQA 5L4QA 4ENYA 4MWIA 5LJJA 4EOIA 5HKMA 3BHTA 3NYXA 3UVQA 3UOHA 2XEZA 5DBXA 1OL2A 5CNNA 3U4WA 5CTPA 2CCHA 2R3OA 2WQMA 1JSTA 4TRLA 3V6SA 5FXRA 5L6WL 5J5SA 3RALA 2NRYA 4LOQA 4HNFA 4ZSAA 3PVUA 1Q3WA 4FEXA 4BCIA 2OJIA 3NYOA 4AOTA 4CFNA 4FIGA 3ACJA 4I5HA 4WO5A 5FGKA 5CVHA 3LQ3A 3JY0A 4I5PA 3TNWA 2AYPA 4E20A 4JI9A 5KZIA 3UPZA 3FDNA 4CV8A 3HMIA 3MIAA 3PG1A 5FQDC 3UTOA 3MH2A 3B2WA 4R1VA 4RVTA 4WRGA 4GUEA 1VR2A 3AMAA 4BCKA 2QC6A 3WIKA 4DITA 1GIIA 4BBMA 4EHZA 1ZMUA 1DS5A 2J0LA 3E3PA 3CQUA 4G9CA 4N6ZA 4GW8A 3ZXTA 4BR3A 4TN6A 5HNBA 4IACA 3K5VA 3KRWA 4F9CA 4L52A 4EH9A 3GCQA 5A9UA 3FZ1A 1IA9A 2YHVA 4NSTA 1B6CB 3G90X 2A1AB 4L00A 4W8EA 4HCUA 1MRVA 5E1SA 4CMUA 4FKUA 3VUDA 3NEWA 4BBEA 5FG8A 3VS5A 4EH8A 3U6JA 4O84A 4C57A 1ZYLA 3QX2A 4ZS4A 3OY3A 2WTWA 1SVEA 2B52A 3HP2A 3MVLA 4MXCA 3O2MA 4J8NA 1BLXA 1OL7A 3FLZA 3GXLA 4DCAA 1FGKA 2WMBA 4MXOA 2BDWA 3F5UA 4TWPA 1OBDA 2PE0A 3KVXA 3ZLXA 4ALVA 4HW7A 3GEQA 2PVLA 5DWRA 3IW7A 4TYHB 3ORPA 4FT9A 1WVXA 4BTMA 2JDSA 5J9YA 2O5KA 5DG5A 3RPVA 4KWPA 2W1HA 2XS0A 3BKBA 3PJ1A 3R28A 4J96A 3BEGA 3KRLA 3AT3A 1JSVA 2WIHA 4MD8E 2WTJA 5CEKA 2ZV7A 4LMUA 5AR8A 2VTSA 5KMOA 3D0EA 5HVJA 4WUAA 1Y57A 4IADA 3NNWA 4ANNA 2BHEA 3VULA 4QMUA 2VUWA 4RGJA 4Y85A 1KE6A 3FKOA 3EL7A 4L45A 3ZO1A 2C5NA 1NA7A 4ITHA 2C69A 2RKUA 4AS0A 4JNWA 4QOXA 4DFNA 2W99B 4DFBA 2FGIA 2EB3A 3ZLSA 2VTQA 3MN3A 3ORZA 1URCA 3C4ZA 3NSZA 3CY3A 5EDRA 3PY0A 5CASA 4IEBA 4GL9A 4BKYA 3CJGA 3OTVA 3PRFA 1MRYA 4ZY5A 5J87A 4LV8A 5CEMA 3MFSA 4IZ5A 3QQLA 1CSNA 3QTSA 5F20A 2ONLA 5FBNC 3LAUA 4CCBA 2GNGA 4JQ8A 3FC2A 2F7EE 3MH1A 3LFQA 4GIHA 5FXSA 4FKSA 5J5TA 3S4QA 4KD1A 2PMNX 5JKGA 5KMNA 4DH8A 2I7QA 1OL6A 1JKSA 4G5PA 4O2ZA 5IPJA 1W0XC 3W2SA 3LFEA 3KN6A 4JS8A 3SGCA 5LVLA 2HY0A 4IW0A 4BDIA 4I4EA 3BGQA 4X3JA 4OGRA 1Q8WA 2CCIA 3FMNA 4PDYA 4IZYA 3GU5A 5HG7A 3CSVA 1Q61A 4IAZA 2ETKA 5FEEA 3UYTA 2XIXA 3LM0A 4CQEA 3TL8A 5KMIA 4A9SA 1YRPA 4FV1A 3Q6WA 2ZOQA 4QP1A 3JYAA 3NUUA 4ZEGA 4ZLYA 5J79A 4YZCA 5CU6A 3GC0A 5M08A 4O0VA 2BKKA 2R2PA 4CYJA 2XYUA 3PWDA 3A8WA 1KOAA 1PXKA 3ZBFA 3FMJA 3BYMA 3R7OA 4BDJA 4USFA 5K4IA 1NVQA 2YM8A 3LMGA 4ZP5A 3LE6A 5B2MA 3F7ZA 3CP9A 3WZEA 3RNYA 1OGUA 3GU8A 4J52A 4YTCA 3TN8A 3VO3A 2R3PA 4GFMA 2PK9A 4UMQA 2IVUA 4RFZA 4ZZOA 4RVLA 3ZC6A 3VBXA 1Y91A 2PPQA 5EI8A 4IB1A 5ANIA 3WE4A 3RCJA 5J1WA 5I9YA 4JR7A 3ZLYA 5JFXA 2R7IA 2QOLA 3O23A 4I0SA 4F6SA 2WTIA 3R0TA 3KKVA 1YDTE 3FLWA 2C0OA 2C3LA 3L8SA 4ZTRA 3C5IA 2OW3A 2VWUA 4D55A 5JFWA 4FKLA 4IQ6A 2VTTA 3BQCA 2EWAA 2J9MA 3OUNB 4YC3A 4ZMFA 2YJSA 3ORNA 4CFMA 3D5WA 2W06A 4EBWA 2CPKE 2QHNA 1NXKA 3WF6A 4RJ6A 4NW5A 5AUXA 3U9NA 4FTLA 2C5YA 3QHWA 4QMNA 5EW3A 4KABA 4R8QA 5HHWA 5EW8A 3FWQA 4A9TA 4IC8A 3IW5A 3VS0A 4CVAA 2FSTX 3DU8A 5CVGA 4C7TA 3COKA 3S1HA 2JAMA 4L43A 1PXMA 4PDPA 3ZFXA 3OWLA 4TWNA 5K5NA 2C3KA 5E1EA 1XH9A 2WB8A 3QTQA 2W1EA 1P5EA 4G6NA 3O8TA 3CC6A 4X2JA 5GJFA 3T8OA 2O65A 5AM6A 4LMNA 4MF1A 2XNBA 3UNZA 4FZAB 4ZJIA 4MNEB 4QTCA 2WQEA 4V0GB 4GK2A 2PUUA 3R01A 2NO3A 2BRHA 2QLUA 4FTJA 4RIXA 3W18A 5KMLA 3OD6X 4UMPA 5AUZA 1XWSA 3ORIA 3QX4A 3I7BA 1M7QA 3HMMA 5AR3A 3T3VA 3LOKA 2Y0AA 3BHUA 1L3RE 4QQ5A 4RA4A 5E7RA 3NIEA 5E91A 3NVKI 2YAKA 4XS2A 5EHOA 2E9VA 5HE2A 2VTRA 3GOKA 5CQWA 5AV1A 1SMHA 5E8WA 4D4RA 3VRYA 4FIEA 3TUDA 4RBLA 4DH3A 2GS7A 3G9NA 3QLFA 4H1MA 1YOLA 4IDTA 3ZS5A 5CEPA 3HRCA 3F2RA 2P55A 1V0PA 2E9UA 2ZB0A 2PHKA 4D28A 4CKIA 1REKA 5D1JA 3OCTA 3RMFA 3DXNA 3FZOA 3DKFA 5IUHA 3EH9A 2G2HA 2Z7LA 4QMVA 5CSHA 4DH1A 5I5ZA 4NKSA 4XYFA 4Q9ZA 4FKJA 2VO0A 4NW6A 1K9AA 3PZEA 1GZ8A 4U45A 3CE3A 3ZMMA 2PUIA 3AT4A 2R3FA 4HYUA 4UXLA 4DLIA 2YIQA 3JVRA 4PPBA 5HBHA 4O21A 1S9JA 4P90A 3FE3A 4LGHA 3UOKA 3Q5IA 4CLJA 2BZJA 2Q83A 1Z5MA 5IU2A 4MBJA 3HV7A 4EH6A 3U6HA 4DCEA 3FQHA 5DLSA 4E5AX 4GUBA 4ZY6A 3VBWA 3PYYA 2C6MA 2Y4IB 3IDBA 3ZTXA 4CNHA 5GZ8A 5DGZA 5DR9A 4YO4A 5LVNA 4BY9E 4ZJJA 1O6KA 4WA9A 4FKIA 5AJQA 5HLWA 4K18A 3R2YA 5JQ5A 2ZAZA 2GFCA 2GNLA 1W82A 2I0EA 1QCFA 5FM2A 3HRBA 5GZ9A 5KX8A 2RFEA 5IH4A 3OG7A 2B9JA 3UO6A 4A4LA 2HWPA 3I81A 3GGFA 3QYWA 4K0YA 5IA4A 4GYGA 1KWPA 4ANMA 3SX9A 5A6OA 3Q9YA 4XG2A 4MK0A 3OBGA 4FTUA 4EKLA 3BE2A 4N57A 3WZKA 2JEDA 2IO6A 5IA3A 2HCKA 4QO9A 4E3CA 1U59A 2OSCA 3DJ5A 3KGAA 5J95A 3RPOA 5CNOA 2XVDA 4FVPA 5CU3A 4MVFA 3LFSA 4FVRA 4MXAA 4PP7A 3ZSHA 1Q3DA 1TQIA 4TZRA 4TYEA 1ZLTA 3VUHA 3D2IA 2QU6A 2XBAA 4J99A 2EXMA 3OBJA 4CFVA 3DAKA 2R0UA 4BZNA 1U46A 3R7IA 1ERKA 4EWQA 3MDYA 2R3HA 4JLCA 3F3ZA 3Q04A 1IA8A 3OEZA 4AFEA 3U4UA 1XH7A 3N4TA 3R2BA 4M13A 2YEXA 3ET7A 4FNXA 4JJRA 5DEWA 3VQUA 3V6RA 3R63A 5F4NA 5E9EA 2HYYA 4M66A 5A3XA 4IWOA 1GAGA 4FSYA 5AV0A 4O0SA 5BVDA 3LCOA 3KVWA 3PFQA 2QI8A 2OJJA 5M4FA 3FXWA 4JQ7A 2IG7A 3ACKA 5J8IA 2HXQA 1STCE 2PWLA 1XKKA 3OHTA 4DF3A 1OPKA 3GCPA 2E9OA 4NM7A 4FL2A 4JDIA 4C3RA 2YIWA 3ALOA 3QRTA 3PXKA 4FIHA 2A19B 2VNYA 1PXLA 4UWCA 5TKDA 3UO5A 5F1ZA 5CT7A 5AV3A 4EJNA 4JX3A 4PTGA 2JDTA 3P7BA 1H08A 3GC8A 3IDCA 1ZXEA 4C4IA 4AP7A 1R0EA 4LUEA 2OIBA 2ESMA 2Y6OA 3ELJA 3FLNC 2B9IA 3DQWA 4QMZA 4E8AA 2BIKB 3EJ1A 4RLLA 2WTDA 4BL1A 4JR3A 4BC6A 4QMQA 4NZWB 4R77A 5DYJA 1JKTA 3DDQA 3DNEA 4IAYA 4O27B 1Q62A 4NTTA 4YJSA 3UOJA 3PVBA 1FVTA 4KBAA 4CQGA 4EQMA 2RSVA 3HA8A 3SXFA 4RPVA 3VN9A 3HV3A 3RJCA 3MY0A 3QTZA 5H8EA 3V8SA 2XH5A 5AM7A 3TV4A 4EYMA 2JKKA 4QTAA 4FT0A 2BTRA 2XJ2A 3ORXA 5HO6A 3HMPA 1P4OA 1H1RA 4X3FC 3UGCA 3EN5A 2CDZA 2GU8A 5C4KA 1WBWA 3FL4A 5FDXA 4EOLA 1BI8A 3ULZA 2YM3A 4EUTA 3EN6A 5AIKA 4NYEA 1YHWA 3DA6A 4ASXA 4Z3VA 3GT8A 3MVMA 5FXQA 4L6QA 3EZVA 4WG3A 1GIHA 1YDRE 1VYWA 5CAOA 4D2RA 3KXXA 4HPUE 4EKKA 4HVSA 5M44A 1SZMA 3MA3A 4O2PA 2B4SB 2J90A 2FSMX 2PE2A 2F2UA 1RQQA 3CEKA 3LXLA 4O0YA 5E90A 3TZMA 3D14A 3N4VA 2OF4A 5CF5A 4PX6A 3QXPA 5CSPA 2PZIA 2PVNA 3LLTA 2ZYBA 4FTKA 3GCSA 3W8QA 3SOAA 5IA1A 4BDKA 4NM0A 2X9EA 2XK6A 2B9HA 4KBKA 5IEYA 4C4JA 3VS2A 1PKGA 3QXOA 1Q97A 4BTFA 2R3LA 2UVXA 5BVFA 4F1OA 2WMAA 3CTQA 1WBPA 3NW7A 3SG9A 3SG8A 4O0XA 3PUPA 2C68A 4JXFA 4TKSA 3PY3A 4AN2A 5JN2A 4BCFA 3F82A 5KMMA 2WTKC 2CHLA 2J7TA 4E5WA 2VO7A 2WO6A 1ZMWA 3QFVA 4C61A 4DH7A 3VRZA 2BILB 5DIAA 1FMOE 3CCNA 4QD6A 2IPXA 5FEQA 3RPSA 5TR6A 2BALA 4WRSA 3AC5A 3KC3A 2WOTA 4BDBA 1U4DA 4NWMA 4NIFA 2XKCA 3A4OX 4ANLA 2F2CB 5ANJA 4OTIA 3HGKA 3TJDA 1OIRA 3QA0A 4BCPA 1ZZ2A 3KRXA 4CT2A 5IQIA 3FAAA 4XH6A 2YLEA 2OZOA 3JPVA 3UE4A 2VX1A 3U87A 2YACA 4MQ1A 4FIFA 3DDPA 4D4VA 1URWA 4FBXA 4X3FB 4XG3A 3DK3A 5ANGA 4ZSLA 4CZUA 3E7OA 1DI8A 3OFMA 3ZH8A 5BUIA 4ALWA 4TPTA 5HCZA 2QURA 1LUFA 3NUXA 1Z9XA 2OZAA 4RIYA 4IX5A 1KE9A 3F3VA 4UY9A 3VBVA 2QO7A 3LCTA 2W1DA 4C0TA 1EH4A 4GFOA 4EWHA 5AUTA 4DG3E 4OTRA 4XNEA 5I4NA 3VS4A 2QODA 2R3NA 3DFCB 4AW0A 3ZUTA 2XNOA 4B99A 4EZ7A 2UZUE 3O50A 4H58A 5EOLA 5GINE 1PY5A 4GCJA 4HGTA 2REIA 4AZEA 4YMJA 2VWIA 4I4FA 3VBQA 4H3PA 1G8SA 2GHLA 1JKLA 3OT3A 4H36A 3A61A 4FTTA 4M84A 2QOCA 4ACHA 2XZSA 4FX3A 3OS3A 3G15A 4C37A 3E8NA 3BBTB 3REPA 4FTOA 3TKHA 3HV6A 4EJ7A 3V5LA 2IWIA 3E8DA 2OF2A 4YPSA 4W8DA 1YI3A 4W4WA 4FG8A 3AD5A 4FTNA 4YZMA 4EK6A 2GNJA 4HCTA 4X0MA 3HKOA 3HAVA 2WTKB 3R04A 4IZ7A 2PMOX 4YJUA 3ZONA 5I9WA 4KRDA 5CYIA 4ZSEA 4PPAA 3I5NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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