5EM8A

Egfr kinase domain with pyridone compound 13: 4-[(2-methoxyphenyl)amino]-~{n}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{h}-pyridine-3-carboxamide
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
323
structure length
303
Chain Sequence
GEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKEATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPDMDDVVDADEYLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
publication title Pyridones as Highly Selective, Noncovalent Inhibitors of T790M Double Mutants of EGFR.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 303
sequence length 323
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5em8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5em8A01
4QRCA 3TKUA 3VC4A 1GZNA 4TY1A 5HE1A 5J95A 5CEOA 5A4QA 4RPVA 3DZQA 4XJ0A 2WQBA 1CDKA 3FKOA 1BL7A 5GZ9A 5HGIA 4RLLA 3BI6A 3WZKA 3NPCA 5AR3A 4IB3A 3BYOA 1XH9A 2ZOQA 3TNIA 4YJNA 1OKYA 2YCQA 3RPOA 2X1NA 2HWPA 3TZ9A 2UZLA 4FTKA 1PXNA 3MFRA 3O23A 3BBTB 4LOQA 1PF8A 4RQKA 5BVFA 3FMEA 5IG1A 1T45A 2FA2A 1DI8A 3DZOA 3DKOA 5FQDC 4UMRA 5JZJA 5KMMA 2CGXA 3VQHA 3ORNA 4FSWA 4RJ6A 4YR8A 4ZS0A 1Q8ZA 3QGYA 5AAFA 3LLAA 4QP6A 4F7NA 3RI1A 2YM4A 3DB8A 4TYEA 4C4GA 5HO7A 2ERKA 3QXPA 4QTBA 4GU6A 1Y6BA 2ZM1A 2OXXA 5AV1A 4RJ4A 3S00A 2Y9QA 3ACKA 3V8SA 4U42A 2IPXA 4S34A 1ZZ2A 5CEKA 3QRUA 3NYVA 1P5EA 4NEUA 1K3AA 4Z7HA 5CU4A 1FMOE 1TQPA 2YEXA 3R7UA 4QTAA 5DMZA 4FYOA 1UU9A 4WHZA 3CIKA 5FBOA 1RQQA 3LLTA 2RG6A 3OHTA 4USFA 4UZHA 4EHVA 5L3AA 3LE6A 4NH1A 3DTCA 4GS6A 4JS8A 2GQSA 3L9NA 4IZ5A 2IG7A 2GNLA 3TUDA 5CF4A 4AX8A 2C0TA 3G15A 5EYDA 4EOKA 1SM2A 3CY3A 2QHNA 1NY3A 5AX3A 2GNJA 3CTQA 4PL4A 4DFLA 3NUAA 2R2PA 4FTUA 5DT0A 2I40A 2XZSA 5DIAA 4D55A 3EHAA 4NKSA 4EK5A 2VWBA 4FZAB 4KKEA 1YWNA 3QLGA 4L53A 2XBJA 2IVTA 5KMJA 4O1PA 3HMPA 2WD1A 4PTCA 2FUMA 4HPTE 4FBXA 2QR7A 3W10A 4AW5A 3Q9ZA 3K2LA 5DI1A 3HECA 5E8YA 4BWKA 4GL9A 2R7IA 1WVXA 1XBAA 4FKVA 2UZOA 4M0ZA 3C13A 2XP2A 3MA6A 4BDAA 2YABA 1LEWA 1A9UA 4S32A 5JZNA 1YOLA 2OZAA 3PVWA 3FQHA 4BZNA 1BL6A 3QQLA 2KULA 5EHOA 4FF8A 1YI4A 3PLAE 4F4PA 5B2LA 3D2KA 3Q6UA 3MI9A 5HIDA 4X0MA 5BX0A 2C69A 5AV2A 4EOJA 4HVDA 4EZ7A 3TKHA 4FKTA 2PMIA 4O2PA 4M68A 1QPDA 2WMBA 3F88A 3F7ZA 3L8SA 1J1BA 1REJA 3KK9A 4HYIA 4N0SA 3TV6A 4BDHA 4E8AA 4ZLOA 4QT1A 4ASZA 5EM7A 2WGJA 3EN5A 3QXOA 1XHAA 2B52A 1YHSA 2GFSA 4ZXTA 3G0EA 4CMOA 4EZ3A 2P3GX 2ITWA 3BLHA 4QMWA 3F2AA 1ZOGA 3NAXA 2Y6OA 4IM2A 4RLKA 3ZS5A 4CT1A 2PU8A 4FKJA 5DHJA 3F2NA 4TPTA 3FL4A 3UC3A 1ZRZA 4WO5A 1XH4A 2O64A 3LZBA 4F99A 2BALA 3AC5A 4GRBA 3NSZA 1YDSE 2R3OA 4EH2A 2PHKA 3OFMA 4FI1A 2VNWA 1Q4LA 3JYAA 2JIUA 1URWA 4A9SA 2BVAA 5L2SA 4GVAA 3C9WA 2EU9A 3KCKA 3MH3A 4ZJJA 4DEGA 5IH6A 5AUYA 3PJ3A 5LMBA 3N4TA 4ENXA 3NUPA 5KMOA 3R2YA 4A4OA 1R0EA 3EIDA 3FXZA 4D9UA 3BHTA 3U54A 4C35A 2XS0A 4CKRA 4MQ2A 3C4EA 3RZBA 4YJPA 3VULA 3LFFA 2ZJWA 3OG7A 1HOWA 2YISA 2OIQA 2OF2A 2J2IB 3OTVA 1UU7A 4FL3A 4ZK5A 3ZCLA 4C2WA 4DHFA 3F7WA 3RWQA 3AT4A 1DAWA 2YDKA 3L8XA 4X2GA 4DFYA 4FG8A 5IA2A 2O2UA 4Q2AA 5IDPA 5KMLA 4OAUC 1WBPA 4ZEGA 3PXFA 1VZOA 2UVYA 3CQWA 4HOKA 2GS7A 2HZ4A 4O7LA 5CI7A 3O0GA 2VTPA 5JRQA 4QMZA 4Q9ZA 5CAUA 1SVHA 3VS0A 2OGVA 2V0DA 5C27A 3KRLA 3FYKX 4E4XA 3BZ3A 1WVWA 4O27B 2PYWA 2IW6A 4AW0A 5BVKA 2EB2A 3TIZA 4C59A 2PMNX 4HCVA 4PL5A 4QPSA 3SW4A 3QQUA 5E4HA 1UKHA 3EQBA 1YXSA 4I6FA 4BWXA 3MY0A 3MVHA 2ZMCA 4IZAA 2VWYA 3NNVA 1OKZA 4LM5A 2SRCA 4ZJVA 3TZMA 2X2MA 4C02A 4O7VA 3NUXA 3NX8A 4L3PA 4RJ3A 5F95A 4CZUA 3PY1A 3PG1A 3OXTA 5EG3A 2VTIA 3O51A 4DEDA 5CTPA 4YO4A 4ID7A 4JRNA 4JVGA 2Y7JA 2W1CA 3ZEWA 3SV0A 3UIXA 4EI4A 4O81A 1L8TA 4HZRA 4AE6A 5L6OA 5K9IA 2X7GA 4U79A 3WOWA 5EQYA 4V0GA 5M4IA 5C9CA 5BMSA 3G9NA 1SNUA 5DLSA 4DEHA 2O0UA 5ANGA 3C50A 3MB6A 1J91A 1PY5A 1WVYA 2WMQA 4G3FA 3RMFA 5GZ8A 3IDCA 3N51A 4CT2A 3MIYA 5DG5A 2C3KA 3KEXA 2ONLA 2YACA 3WYYA 5M07A 5CWZA 4CCUA 4DLJA 4PWNA 1JVPP 3LXKA 3VF8A 3GQIA 4KNBA 5DE2A 4XS2A 1W83A 2ZMDA 4NM0A 3IDPA 1FQ1B 2XNOA 3OCSA 2PMOX 3D5XA 2CN5A 3E92A 2JDRA 2VX0A 3O96A 4QTCA 4W4YA 5TT7A 2QG7A 3DB6A 4OTFA 4FK6A 2IJMA 1IASA 4L52A 3W8QA 3PA3A 4RVKA 5DRBA 4QP8A 5CX9A 2PVHA 2R3LA 4F6WA 2ZM4A 4XV1A 4YLLA 4DBXA 4WBBB 4RIWA 1UNGA 4D1ZA 4LFIA 1CM8A 3LMGA 5AR8A 5E8UA 3HV7A 4XMOA 4A9RA 1PXIA 3HKOA 3GNIB 3LFNA 3AXWA 5AUXA 3KRWA 4F6UA 1Q8WA 1U59A 4NTSA 1NT2A 3LFSA 4ONAA 1FBNA 2E9UA 2XK6A 3TG1A 4O7RA 3NVKI 4QMSA 2F2CB 1QPEA 2RF9A 4O0WA 4CLJA 3GC9A 4PP7A 5ETCA 1JPAA 3PIZA 4MK0A 3Q5IA 2BRMA 4I41A 1TQMA 5HORA 3UE4A 5C1QB 5L4QA 4JJRA 5TE0A 3U87A 3M11A 4BVUA 4EH7A 3CJFA 5AUUA 3FC2A 1Z5MA 3P86A 4CMUA 3R9OA 3GU6A 5A6NA 1UKIA 1WCCA 2Z7RA 3SGCA 3VHEA 2XYUA 1O6YA 5EH0A 3CTJA 2ITTA 1KE9A 3KXHA 1OPKA 3MY5A 3W2SA 4D2WA 4FIIA 5IQFA 4UALA 3A8XA 4IAYA 4FMQA 4BI1A 4EEVA 5LWMA 4O84A 4H3QA 4EK8A 2YM8A 5AP3A 3LHJA 4FG7A 3ORIA 3QTZA 4IX3A 3LFBA 4BCIA 1FVVA 2Z7QA 2BRNA 2BIYA 3QAME 5HE3A 3PXRA 4BHZA 1YI3A 3VQUA 4H3BA 4D2VA 1H07A 3PIYA 3V5PA 1ZMWA 2ITQA 1BX6A 3KXXA 4EWHA 3OCBA 4IWDA 3GOKA 5BVOA 4O0YA 3AD6A 3VS7A 3EJ1A 4FG9A 4D2SA 1GOLA 2JKQA 5AAGA 2WTVA 3P0MA 3PA5A 4MHAA 3U9NA 5D7VA 5EQPA 4HJOA 2UV2A 5IH5A 4AP7A 3UNZA 1K9AA 4OBPA 3PWDA 3QZFA 4GSBA 3LQ8A 1QCFA 4L42A 4DGOA 4OTDA 4ERKA 3O2MA 3ZTXA 2XJ1A 3F2RA 2CCHA 1I44A 3R9RA 5CENA 3VBVA 2JD5A 1A48A 4UN0C 2XIZA 4FT9A 5HD7A 5BYYA 1H1QA 2JKMA 2RGPA 4AT4A 3FZOA 2C4GA 5A4CA 1JKKA 5M4FA 3C1XA 4UZDA 5CEQA 4AFJA 4BGQA 4O82A 4XG9A 5CQWA 5GINE 3R8UA 3DXQA 3TDVA 4LRJA 3ZRKA 4ANNA 3PSCA 4FKOA 5E1SA 3DKGA 4FKPA 3JXWA 2XIRA 3HLLA 3K5UA 4IAKA 4LV5A 2VU3A 3KFAA 4JX7A 4BDGA 4FOBA 1P4FA 4G16A 4G5JA 1JQHA 4Y73A 1OUYA 4ITHA 1XWSA 3TV4A 3P78A 4I92A 4EH3A 3PJ1A 3DAKA 3ITZA 1IG1A 3UTOA 5AP4A 1KWPA 2V5QA 2ZV7A 1O6KA 5AP6A 5KUPA 5LXMA 3HUCA 1UU8A 2ITXA 4K11A 4K9YA 4RIXB 4TWNA 3TUCA 5G1XA 3Q4ZA 3FI4A 3PRFA 4J8MA 5AIRA 3Q9WA 3W33A 1V0OA 3VS4A 4RBLA 4XG2A 5EM8A 4C7TA 3UNKA 2ITYA 2C6KA 4XUFA 4Z16A 2C5OA 3EFKA 1OM1A 5HVKA 1OGUA 3R8PA 4AGUA 1VYZA 5C4LA 5F9EA 3QX4A 1Y57A 1ZOEA 4LL0A 4WSQA 4FSNA 4PF4A 4TW9A 2NNWB 5J9YA 5M55A 2C5YA 2CN8A 3IGOA 4FZFB 4IWQA 3G6GA 1ZLTA 3HRCA 4IBMA 4GT4A 3G5DA 2R3MA 3ZLXA 1LEZA 1XH7A 3VUTA 3QTQA 1OVEA 3R73A 3JY9A 3Q4UA 4FODA 4IQ6A 4NT4A 4W8EA 2ZM3A 5EFQA 3CC6A 5BVDA 3LXPA 4MKCA 3ZXZA 4C4FA 4OGRA 4FIEA 5KHXA 4WG5A 5AR7A 4O86A 1IAJA 5AA9A 3ZC6A 4FGBA 4MYGA 1GZOA 2BFYA 3BV2A 4UWYA 2XKFA 5AWMA 2CGWA 5CSWA 4UMQA 4ANOA 2PUIA 5CS6A 1YXTA 1DS5A 3GU4A 4YP8A 2NRUA 2WKMA 3QL8A 2C6LA 2ZV8A 4YC3A 5A4TA 4BKJA 3QCQA 3P1AA 4IDTA 4ZJIA 3ZLSA 3U6HA 3ORPA 4QP7A 4WUNA 3E8DA 3R22A 1RJBA 2UZNA 5DYJA 3WILA 3GOPA 3FBVA 4JG7A 4ZTRA 2UVXA 3UVQA 3A7FA 4LL5A 2C0OA 4KIKB 4MF0A 3ZRMA 3QC9A 3GBZA 3QRJA 4UWCA 4LG4A 1BI8A 2Q0BA 4XG8A 4JR7A 2GMXA 4L46A 1SNXA 4J53A 1GJOA 2W5AA 1BLXA 4F7LA 3EN9A 3GGFA 5J5TA 4W9WA 5HNBA 5JKGA 5CU6A 2OZOA 4H05A 2YM7A 2UW7A 5FM2A 4JR3A 3D83A 5IA4A 3RBWA 3C4ZA 2BZKB 1OIYA 1WAKA 2C6EA 3GCUA 4BCMA 4FV8A 1IAHA 4GUEA 5J9ZA 3AC8A 4FKGA 5M4CA 4PPAA 1ZY4A 2OLCA 2ITVA 2GSFA 2YM5A 4W9XA 4QTDA 2I0YA 2R3RA 1QPJA 4UBAA 2XNNA 3IW5A 3RAIA 2VO7A 5DFPA 1W0XC 4R5YA 5HHWA 4IC8A 4JDKA 3Q04A 4M84A 3P5KA 3ZFXA 2PSQA 3QTRA 4CFUA 2WMUA 3S1HA 2F7XE 3W55A 3RK5A 5LMKA 5KBRA 4NJDA 4YJRA 1OBDA 4KSQA 2UZBA 3B8QA 3DDQA 3A60A 1WBOA 3RNIA 3S95A 4FSZA 2XM8A 5HVJA 4YJVA 5HZNA 3MJ2A 5KCVA 3NW7A 4DG3E 3UIBA 4AZWA 2JAVA 4MNEB 4ZZNA 3R7YA 4QYGA 1UVRA 3ZYAA 3DJ5A 3QQGA 3QLFA 4JBVA 4DEAA 3E3PA 3DKFA 2WELA 2E9VA 3CQUA 2QOHA 4JRVA 3ORTA 3C4FA 4YZNA 5J8IA 3SW7A 2XIXA 3PPJA 3ZBFA 2YFXA 4ANLA 5HEZA 4YSJA 3U51A 3OBJA 5IQEA 2I0HA 5I0BA 1APME 4GK3A 4BCPA 2JIVA 4LMNA 2FH9A 2XK3A 4I23A 5HX6A 5E9EA 1E1VA 2CCIA 2PMLX 1PW2A 4FSQA 3IG7A 4FV0A 3VBWA 3ZH8A 4QP9A 3CEKA 3CBLA 2NP8A 5DNRA 3ZFMA 4DFBA 2YDIA 3TNQB 3MVLA 5HLWA 5JGBA 5HX8A 4DBNA 2HW6A 5CAOA 3C4WA 4QMQA 5DN3A 3FKNA 4Y83A 4AGCA 1M17A 3GC7A 3O17A 3FZRA 2QONA 4I6QA 1DAYA 1FVTA 4ALVA 5BUIA 3NR9A 3W16A 4Z7GA 2ZB0A 3UOKA 5I9XA 2RL5A 3NEWA 4M3QA 3MPAA 2GQGA 4S30A 5C8NA 4HVHA 5LVPA 4FEWA 2UZTA 5IQIA 2O63A 3ATSA 2XYNA 2JDOA 3QCXA 2WIHA 4BIEA 3RHXA 5ANEA 4CRLA 2WMAA 5FXQA 3I4BA 2FGIA 3C7QA 1YXVA 3QCYA 4FKSA 5B2KA 1ZOHA 1SZMA 3W8LA 4JT3A 1JNKA 4C8BA 3UQCA 3KVXA 1SVEA 2A2AA 2VTQA 3UQGA 4BIDA 2J0JA 4NCTA 4WD5A 4A06A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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