5EY4A

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 2'-deoxy-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
382
structure length
378
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDITKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 378
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5ey4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ey4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ey4A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5ey4A04
2I7NA 1C0FA 3VEYA 3RSEA 3ZX3A 4Y0WA 4FWRA 1CZAN 3O1BA 3VGMA 5AQPA 2GWJA 1NM1A 4ISGA 4M63C 3GBTA 1HLUA 2GELA 3OHRA 5AQNA 3EN9A 4FO0A 4JAXA 2P9IA 4YDUC 5BRFA 4BR4A 3UB5A 2P9PB 4L3QA 2P9SB 1J6ZA 2YHXA 3O08A 4K43A 3ULEA 1JCEA 4BVOA 3M6GA 2HF3A 2FSKA 2A3ZA 4BRLA 1HKBA 3WQTA 2NRHA 4BRAA 5BPLA 3GOIA 2BUPA 3O6WA 1NLVA 4CZGA 2ZWHA 4H0XB 4IJNA 3WQUA 4BRKA 3LM9A 5AQXA 3GDQA 3JXUA 1SAZA 3D2EB 2QW9A 2E8AA 1Z6RA 4FWLA 4BR9A 1K8KA 4BREA 2A41A 3VF4A 3CIPA 5JLHA 1BDGA 4CBWA 3S41A 1OKJA 2D0OA 3LDLA 4B1VA 1GLEG 3CHWA 4BRGA 4CZIA 4CZJA 4HWIA 4XH1A 5AQKA 2QWOA 5EY4A 1X9JA 3U9DA 5JLFA 5AQOA 4B1UB 5LJWA 3I8BA 2ZGZA 2E88A 2YCHA 1Z05A 1GLLO 4JNEA 3GG4A 2D1KA 4BC2A 3O80A 2QWQA 3FLCO 1X3MA 1HPMA 5BRDA 3UKRA 1EQYA 4Z94A 3RSEB 1U6ZA 2Q97A 2ZGYA 3EKSA 4A62A 1MDUB 5CE3A 4BC4A 4CZLA 3DJCA 4WQ5C 1TUUA 1KAXA 3O1WA 4HTLA 3VGLA 1Y64A 3U9ZA 2NLXA 1NGCA 1NGDA 3HM8A 1ATNA 3A0IX 3WXJA 2P9KA 1QQMA 4XH5A 4WQ4A 5AZIA 1SZ2A 2ZF5O 3L0QA 4O8KA 5AQVA 2YJFA 3MN7A 5BREA 1NGBA 4M7YA 5F2RA 4EHUA 4K42A 1QHAA 1NGHA 2FSJA 1GLDG 4BRDA 3CJ9A 2QWRA 2E2NA 2CGJA 3VETA 5KQDA 3FZMA 3UKUB 3HI0A 3ZETB 2DPNA 1T6CA 3G25A 3MMVA 5AR0A 4BQZA 3AAQA 4A61A 3KHYA 1XUPO 1BOTO 4FOEA 3H46O 1WUAA 5EX5A 1R59O 2CGKA 3CJBA 4BROA 3MK6A 5LY3A 2D4WA 4BC3A 3ATUA 4H0YB 5FPDA 4MO5A 5ADXH 2PAVA 5KPTA 4FOIA 3SJHA 5FPNA 3EKUA 1NBWA 5F1XA 3QMLA 1KAYA 3CJAA 4B1ZA 1ATSA 5EXWA 4H5WA 3CERA 1E4FT 4K25A 4H5RA 2HF4A 4BG8A 3LDPA 1NGFA 4FSVA 3FZFA 1YUWA 4H0OA 4BC5A 3DAWA 4IZ9A 4H0TB 3FGUA 1RGIA 2GEMA 3LDQA 1GLCG 1DEJA 1BA0A 1NWKA 5AQRA 2E1ZA 2P9KB 4BRIA 5ADXA 4CZHA 4FL9A 2Q36A 4PKGA 3VENA 3VPZA 4A2AA 3VOVA 1LOTB 4B9QA 3EO3A 2IVOA 1H1VA 5LJVA 3CQXA 3SK3A 3QFUA 2GTDA 3VF2A 1G99A 1DGKN 4GY2B 3ATVA 2V51B 4AM7A 1T44A 1TUYA 4FWQA 5E84A 2YJEA 3A5NC 3GE1A 4H5VA 5AQWA 1GLAG 4DB3A 4I6MA 5EOYA 4LC9B 4WYBA 5AQYA 2E20A 2EWSA 2YHWA 4RWTA 2HOEA 2WUSA 4H03B 1NGEA 3LL3A 4QS7A 4FWKA 4QS9A 4GNIA 1BG3A 2FSNA 3CJ1A 5BPNA 5ELZA 3F9MA 4QS8A 3WT0A 2W40A 4XH4A 3FZKA 3HTVA 3HSCA 4BRNA 1TYQA 2E1YA 1IG8A 3WUHA 3BF3A 1HJOA 1HKCA 5F0XA 2P9NB 4JD2B 4H5NA 1SQKA 2P9UA 3L4IA 4PL8A 4BG9A 5KPRA 3WXIA 3CJCA 4EHTA 5AZJB 5AQQA 3JS6A 3ID8A 4WQ4C 2NZTA 4K41A 3VERA 3AY9A 2FF3B 4CI6A 3U8XA 2CGLA 2P9LA 3QB0A 2CH6A 3ENOA 3H1VX 4EFHA 3H1QA 4ISFA 5AQJA 3D2FA 5JICA 2CH5A 3GL1A 3EL2A 2V52B 2P9IB 4MLEA 4BRMA 1HX1A 1D4XA 4EAHD 1QQNA 3BEXA 2A6AA 4BR2A 3A5OC 3ZEUA 3ULEB 2ASOA 3MDQA 4BRHA 3L6QA 4BVPA 3A5MC 3HBTA 5AQZA 2KHOA 4BGAA 1BA1A 2J4RA 3AAPA 2VCPA 3CI5A 3QBWA 1NGGA 3C0BA 3VESA 3CJ7A 4BRCA 1NGIA 2PBDA 4ISEA 5BN8A 4PL7A 1P8ZA 3DXMA 3UE5A 4PKHA 4I6MB 1K8KB 1KAZA 3AARA 2P9PA 1HKGA 3W3DA 4BRQA 4J8FA 4BRFA 3A8YA 4CZEA 4C23A 2QWMA 2QWNA 3M1FA 4FWSA 5AQHA 4CBUA 1ATRA 2QWPA 4RCHA 2ITMA 4F9OA 1TYQB 3CETA 3DXKA 4IWVA 4BQLA 3D2EA 4KBOA 1X3NA 3R8EA 1JCFA 2AA4A 3WXLA 1QZ5A 4CBXA 3FFKB 3ZX2A 2P9UB 1LCUA 2Q1NA 5KPZA 4PKIA 2W41A 5AFUH 3QDKA 4IO8A 3UKRB 2Q0RA 4CZFA 4IXCA 1V4SA 3HZ6A 5JMVA 1C0GA 1NMDA 3O8MA 4NO7A 5E26A 2VYPA 2E2OA 4CZMA 5I9EB 5EVZA 3WXKA 3LDNA 4FPAA 3VF6A 4A2BA 3CQYA 4FWPA 1ZXOA 3R6MA 2QXLA 3ZEUB 4RTFD 2FF6A 3IFRA 5AZIB 1NGAA 5BPMA 3WEEA 5AQIA 5AFUA 4XEIA 3U4LA 3VEOA 3TPQA 5BR9A 1QZ6A 2E2PA 1GLBG 4NB4A 4MLHA 3I33A 1JCGA 3DXMB 3FZHA 1RDWX 3FR0A 2V7ZA 1MWKA 3B8AX 2ASPA 2FLOA 4E1JA 2HMPA 3W0LA 1RFQA 3SMSA 1ZC6A 3DWLA 3MN5A 5BN9A 2H3GX 2Q0UA 2FXUA 2GWKA 3DXKB 3BF1A 4H0PA 3R9PA 4YDUA 2OANA 3UKUA 4CJ7A 5AQMA 4FWNA 3ZETA 4JN4A 3EZWA 3ZX0A 1IJJA 3KVGA 5B8HA 1MA9B 2F9TA 5AQSA 4BR0A 4BRPA 4DHYA 1YXQA 3ENHA 3VEXA 3MCPA 3P4IA 4JHDA 4CD3A 1QQOA 5FPMA 2YHYA 2IVNA 3QBXA 4O5FA 1GLFO 2VWBA 3C7NA 1T6DA 1U2VA 2V7YA 2IVPA 3D7EO 5BRHA 2E2QA 3J8AA 4AM6A 1YAGA 1ZBSA 4B1WB 1NGJA 4DCHA 3A5LC 3MN9A 3M3ZA 2AP1A 3BUZB 3QICA 2YI1A 5AQUA 3WEEB 4FWOA 3LDOA 3VEWA 1HUXA 4FWMA 2D0PA 2Q31A 2ASMA 4BR7A 4BR5A 1BWFO 1BUPA 3O5BA 5AQTA 5FPEA 1WOQA 2UYTA 2P9SA 3FZLA 4H0VB 4M7XA 3QFPA 2GUPA 3H3OB 3KZBA 3LM2A 3MN6A 4IJAA 3VGKA 4DQ8A 1ESVA 1XQSC 1MWMA 2QM1A 1KXPA 1YVNA 3BP8A 4WQ5A 5AQFA 3H3NO 4B1YB 5AQGA 1GLJO 1Q18A 5TKYA 3TU5A 3VEZA 4B1XB 4H5TA 2A5XA 2Q2RA 1S3XA 2I7PA 3SLCA 3O4WA 4BGBA 1BU6O 3VEVA 4JHDB 3H45C 5AQLA 4FPBA 2P9LB 1XC3A 3SMPA 2A42A 3FE1A 1V4TA 2F9WA 1E4GT 3D2FB 5KQ8A 4MO4A 3IMXA 2A40A 2BTFA 1S22A 2QWLA 2P9NA 4JD2A 3C7NB 1U2VB 1BO5O 4CD1A 3IDHA 5AZJA 3H6EA 4CZKA 2IIRA 3IUCA 1DKGD 4EIAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1W2BM 1C0FA 3RSEA 3ZX3A 2X74A 3K5MA 1VQ7N 3VGMA 2GWJA 3KK7A 2O8CA 1VSIA 4LFAK 2R7YA 2GELA 3OHRA 1VQPN 4JAXA 5BRFA 1WNSA 4BR4A 3UB5A 5CY4A 2P9PB 2W6KA 1C1AA 4L3QA 3VQDA 2ZJRL 3KC6A 4K43A 2GV9A 2OPPA 1JCEA 3ULEA 4RW8A 2HB5A 1QHTA 2FSKA 4W5QA 1K9MO 4BRAA 4KHNA 2O8FB 4JKGA 3O6WA 3V9ZA 1ZYVA 1TK5A 3LM9A 4CJUA 4ELUA 3KOXA 3VQAA 1SAZA 5M1NA 3SV3A 4KHYA 4OLBA 4BR9A 2ZQBA 1K8KA 4OKJA 1CZ9A 2A41A 1NK7A 2MZ0A 3G0ZA 4ID1A 3VF4A 1IBLK 5JLHA 2XHBA 4CBWA 1Q7YO 1OKJA 4PWDA 1EX4A 3ALYA 3CHWA 2LI7A 4HWIA 2HVIA 3O3HA 3OYCA 4DV3K 5EY4A 1X9JA 3U9DA 2GL1A 3LP1A 4F4KA 1Y97A 4B9SA 3I8BA 2ZGZA 1NJIO 2E88A 4DMNA 2JWLA 5JS2A 2QK9A 3FLCO 4B9UA 3CYMA 3AA5X 4TSXA 1HPMA 4IEIA 3UKRA 1IBKK 3TARA 2Q97A 1VQNN 4JI6K 4B08A 3KWGA 4J2DA 2YBRC 1C0MA 3AVMA 3O1WA 3DRPA 3U9ZA 1JZBA 3HM8A 4AHCA 5GAGP 5CR4A 4Z4FA 2OZSA 2P9KA 2F8TA 4V19S 5AZIA 1SZ2A 2O4GA 3L0QA 1MU2A 4O8KA 3HL8A 5BREA 2Y1JA 4PHTX 3O9UA 5F2RA 4R79A 4CFDA 3V1RA 4FJ5A 1QHAA 1U47A 3P5JA 1GLDG 4BRDA 3P83D 2KPYA 2QWRA 1B3CA 4DV2K 4JK7A 2HHHK 2RKIA 1N34K 4CGDA 1REVA 3QIPA 3SUNA 4OKKA 5AR0A 2RE2A 4BQZA 3AAQA 3RMBA 4A61A 1Q81O 1RDBA 4JKEA 4FOEA 1RDUA 3SQ1A 4YHHK 3QEWA 1QVGM 3DLLL 1R59O 4BROA 3EYZA 1DT9A 2D4WA 3KWIA 1MYNA 3O9QA 4H0YB 5FPDA 4IG0A 5M1PA 2HHSA 4MO5A 5M1FA 5KPTA 1K73O 5FPNA 2KFNA 3TSUA 4CGHA 4DV4K 5F1XA 3QMLA 4OGCA 4B1ZA 2GBZA 2LY5A 3SZ2A 1LWCA 4K25A 4DV6K 1X1PA 1OH6A 3LDPA 1RDDA 1HNXK 2YIPA 3FZFA 1LAWA 1TL3A 3DAWA 4HUEA 2DFFA 4DR5K 4H0TB 3FGUA 4FLXA 2GEMA 3LDQA 2QKKA 5AQRA 3OYNA 4ILJA 3TWHA 3L2WA 1KV0A 4JYAK 4GKJK 4OX9K 1T7AA 2QI2A 5M1KA 2PYLA 2YC1C 3VOVA 4B3OA 2EX3A 1DJTA 3ZLJA 2IVOA 3CQXA 3SK3A 3WNFA 2OTJN 1G99A 1TKTA 1N8RO 4M3XA 5E84A 3ZCMA 3GE1A 1NRAA 3IG1A 4H5VA 5AQWA 1RDAA 5EOYA 3K9JA 4BDYA 4C8NA 1FJGK 2JLEA 1VNBA 1YTAA 4HCBA 2FBXA 4FJNA 3LL3A 3EE9A 3K5OA 4QS9A 2B3CA 2XY7A 1BG3A 2FSNA 3F9MA 4OO1J 2W40A 4BRNA 1VQ6N 4YOWA 1AYJA 2E1YA 1IG8A 2KFZA 3WUHA 3BF3A 1HJOA 1HKCA 1SL1A 2AJQA 1UWBA 3TTDA 2P9NB 4JD2B 3EEQA 4GMJB 4BG9A 5KPRA 1RBRA 2P1JA 3CJCA 1NE5A 3JS6A 4WQ4C 3SPYA 3ZSYA 3VERA 2FF3B 2OTLN 3KLEA 2CGLA 2JGUA 3S3OA 3H1VX 4MFBA 2HVHA 1HYZA 3G4SN 3EY1A 3EL2A 3SNNA 4MLEA 1D4XA 4EAHD 3ZSXA 1JKHA 4CHQA 3SCXA 5HP1A 4F2SA 4DV0K 4B9MA 3L6QA 4DR4K 3HBTA 2DFEA 2YHAA 4KKOA 4KB1A 4E89A 2BDPA 3LALA 2VCPA 1NGGA 4JRQA 2O8DB 5T7BA 3HO1A 2KBJA 4ISEA 1VSEA 3CXCM 4I6MB 3AARA 3SPZA 2NRZA 4BRQA 4BRFA 4OPAA 4KHQA 4CZEA 2HHTA 3OVNA 4N47A 2O8EA 2OZMA 1ATRA 4YOYA 2QWPA 1BK8A 3AVIA 2HHQA 4F9OA 1TYQB 2UXCK 4IWVA 4BQLA 3D2EA 5CY0A 3R8EA 2D0CA 1ZBFA 3RVCA 1I3AA 4DWIA 4AHVA 3AGRA 4PKIA 4CEDA 1OVYA 3QDKA 2PY5A 1V4SA 1CHZA 4GKKK 3AO3A 3O8MA 3KLHA 3PV8A 2VG7A 4WE1A 2X6NA 4BDPA 5I9EB 4O0JA 2WTUA 4MQ3A 3WXKA 3CM5A 3LDNA 3PUFA 2VWKA 1KVCA 2A7TA 2QXLA 4DSKA 3HJFA 3O9RA 3G71N 1VSLA 2E4LA 5LMUK 4FK4A 1KVBA 3IFRA 5BPMA 5AFUA 3KLIA 4DFJA 1LQQA 1RT5A 3NVMA 4H8KA 1YTUA 4IBNA 1GLBG 4FLYA 4FZZA 1JLCA 3T69A 4KI4A 4KHUA 4FJMA 4PY5A 4JKCA 1MWKA 1RT2A 4E1JA 4AH9A 5LMNK 3AVJA 4DSIA 4CGIA 5DM6L 4OPJA 3KOYA 1N5YA 4C1NK 3MN5A 2H3GX 5IT9O 4IOCL 2Q0UA 1ASWA 4CESA 1B9FA 4NCGA 2D0BA 3DXKB 1XMQK 4FZXC 3BF1A 3T1YK 5AQMA 2OCEA 1S1UA 2ZJPL 5B8HA 1L3VA 4BRPA 4CEOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1W2B M;  1C0F A;  3RSE A;  3ZX3 A;  2X74 A;  3K5M A;  1VQ7 N;  3VGM A;  2GWJ A;  3KK7 A;  2O8C A;  1VSI A;  4LFA K;  2R7Y A;  2GEL A;  3OHR A;  1VQP N;  4JAX A;  5BRF A;  1WNS A;  4BR4 A;  3UB5 A;  5CY4 A;  2P9P B;  2W6K A;  1C1A A;  4L3Q A;  3VQD A;  2ZJR L;  3KC6 A;  4K43 A;  2GV9 A;  2OPP A;  1JCE A;  3ULE A;  4RW8 A;  2HB5 A;  1QHT A;  2FSK A;  4W5Q A;  1K9M O;  4BRA A;  4KHN A;  2O8F B;  4JKG A;  3O6W A;  3V9Z A;  1ZYV A;  1TK5 A;  3LM9 A;  4CJU A;  4ELU A;  3KOX A;  3VQA A;  1SAZ A;  5M1N A;  3SV3 A;  4KHY A;  4OLB A;  4BR9 A;  2ZQB A;  1K8K A;  4OKJ A;  1CZ9 A;  2A41 A;  1NK7 A;  2MZ0 A;  3G0Z A;  4ID1 A;  3VF4 A;  1IBL K;  5JLH A;  2XHB A;  4CBW A;  1Q7Y O;  1OKJ A;  4PWD A;  1EX4 A;  3ALY A;  3CHW A;  2LI7 A;  4HWI A;  2HVI A;  3O3H A;  3OYC A;  4DV3 K;  5EY4 A;  1X9J A;  3U9D A;  2GL1 A;  3LP1 A;  4F4K A;  1Y97 A;  4B9S A;  3I8B A;  2ZGZ A;  1NJI O;  2E88 A;  4DMN A;  2JWL A;  5JS2 A;  2QK9 A;  3FLC O;  4B9U A;  3CYM A;  3AA5 X;  4TSX A;  1HPM A;  4IEI A;  3UKR A;  1IBK K;  3TAR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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