5F0XA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 2'-deoxy-adp and inorganic phosphate
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5f0xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f0xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5f0xA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5f0xA04
3LDPA 2Q31A 2KHOA 4RCHA 5AQYA 3W3DA 5KQ8A 2PBDA 2QWPA 1JCGA 4DCHA 1YAGA 4RTFD 4CZKA 3WT0A 5BN9A 5AR0A 2D1KA 3QBWA 4H5NA 4FPBA 3SMPA 2D0OA 4JN4A 1JCEA 5EY4A 5BPLA 3U8XA 3WXIA 4FPAA 5AQSA 4YDUA 1KAXA 1HJOA 1TYQA 3GG4A 3SK3A 3M1FA 2P9IB 3H45C 3J8AA 4XH4A 5AQJA 5AQWA 3F9MA 3AY9A 2QM1A 2NZTA 4EIAA 5AQXA 1GLEG 2P9UB 1WOQA 1XC3A 2CH5A 3GDQA 4BQZA 2V52B 5JICA 3EZWA 1DKGD 2I7PA 4BRDA 5CE3A 4K43A 3WQUA 3HTVA 1NWKA 1T6CA 1WUAA 2GEMA 4FWLA 2E20A 1HKBA 2Q0UA 4FWOA 3WEEB 3DXMA 4BRIA 3H46O 1ESVA 5E84A 2VWBA 3VF4A 3JXUA 4BRQA 5FPNA 1NMDA 1C0FA 2V51B 3O08A 4H0YB 4JD2A 4NB4A 1SAZA 2V7ZA 3U4LA 4B1ZA 5EVZA 4B9QA 3FGUA 2A3ZA 2GUPA 2A6AA 1GLAG 2GELA 2ITMA 3GE1A 3ATUA 5BR9A 1GLBG 1Z05A 3BP8A 3H6EA 3TU5A 1U2VB 4C23A 3A5OC 4H5RA 4CBWA 4EHUA 4JHDB 2W41A 1SQKA 3WXJA 4BVPA 2FXUA 3ULEB 3R9PA 1ZXOA 3A0IX 4BRCA 3FZLA 4IWVA 3VEOA 3CJ1A 2E8AA 1HUXA 3RSEB 4F9OA 3D2FB 4IO8A 5AQUA 1BG3A 3HSCA 2P9PB 2P9UA 3CQXA 1Y64A 2ASPA 1XQSC 3VETA 3AARA 4CD1A 2FLOA 3MN9A 2YJEA 2GWJA 5AQMA 3VOVA 2E2QA 3VERA 5AQOA 2IIRA 2YHWA 4BR0A 2FSNA 2P9LB 3ZETB 2E2NA 3H1QA 4A2BA 1XUPO 2EWSA 4NO7A 4K42A 5KQDA 3R8EA 1H1VA 1Q18A 3CJCA 2A42A 4B1UB 3ZX0A 1K8KA 1NGAA 3ZEUB 4BC3A 4BREA 1X3MA 4DQ8A 4I6MB 4FWMA 4BC2A 4EAHD 1C0GA 1NM1A 5TKYA 3L6QA 2YJFA 3MN7A 5F1XA 1ZBSA 1IJJA 2CGLA 1U2VA 3WXLA 5JMVA 3WUHA 4A2AA 3CJAA 4FWNA 1NGHA 3G25A 4CZLA 1GLFO 4H0VB 4FWRA 4WQ4C 4JHDA 4YDUC 1RDWX 1SZ2A 2P9NA 1RFQA 1NGGA 1OKJA 1TUYA 3FFKB 3LDLA 3ULEA 2A5XA 4MLEA 4EHTA 3VESA 4J8FA 2P9PA 5ADXA 2ASMA 3FR0A 4CZJA 3IFRA 4WQ5A 3WQTA 3EKSA 1YUWA 4BROA 3MK6A 4CZEA 4CBXA 2Q97A 5JLFA 1ATRA 4PKGA 4BC4A 4B1VA 1YXQA 4BR7A 3HM8A 1S3XA 4M63C 5BREA 2IVPA 2P9LA 3EO3A 3O1BA 4GNIA 1HKCA 2QXLA 3ZX2A 5EX5A 4BRLA 3L0QA 3QDKA 4WQ4A 3LM2A 3UE5A 3SMSA 5LJVA 2P9KB 3VF6A 3M6GA 5BN8A 3ZEUA 1NLVA 4FWQA 1J6ZA 1P8ZA 2CGJA 3CQYA 5KPRA 4BR4A 2ZGYA 3U9DA 4A62A 4I6MA 2QWRA 3MDQA 3O6WA 3KHYA 3H1VX 4B1XB 3CJ9A 3OHRA 2QWQA 3HZ6A 3BF1A 1QQMA 2CH6A 4CJ7A 3LDNA 4MO5A 3QBXA 4JNEA 2E1ZA 3DJCA 1GLDG 5AZJB 3EN9A 3FZFA 5AQTA 3ENOA 1HPMA 1NGCA 3HBTA 2IVOA 2IVNA 4Y0WA 4CZGA 1X3NA 3LL3A 4HTLA 3UB5A 4M7YA 3D7EO 4FWKA 3VGMA 4H03B 2GWKA 5AQNA 3QFUA 3VENA 2ZF5O 5AQFA 3CI5A 4BRFA 1QZ6A 1NGEA 5FPMA 4BC5A 2A40A 4BRMA 3IUCA 4CBUA 2P9IA 4O8KA 4AM6A 3JS6A 3A5LC 1HKGA 3GOIA 2H3GX 3CJBA 3BEXA 2A41A 3UKRB 4CD3A 3CHWA 2QWNA 3P4IA 4BVOA 2QW9A 3IMXA 3LDQA 2P9SB 3VEWA 3BF3A 4XH5A 1BUPA 1MDUB 4BR9A 4L3QA 1GLLO 3KVGA 1KXPA 3WEEA 3FLCO 1BO5O 2I7NA 5ADXH 3ATVA 3VGKA 4BGBA 3MN5A 4IXCA 4BGAA 4CZMA 5ELZA 4CZIA 2E2OA 2V7YA 1S22A 4BRAA 2FF6A 3CIPA 4BRKA 4WQ5C 3H3OB 3ID8A 4BG8A 1NGFA 4H5WA 3KZBA 3MN6A 5BRHA 3ZX3A 4RWTA 1BA1A 2D0PA 5BRFA 2Q0RA 2HF3A 2AP1A 2ZGZA 5BPMA 2UYTA 3O8MA 3CERA 4H0OA 3VEZA 3C0BA 1RGIA 3VF2A 1QQOA 1KAZA 3VEXA 4PL7A 3UKUB 3FE1A 1E4GT 4GY2B 1MA9B 2FF3B 3I33A 1TYQB 1MWKA 3C7NB 4H5TA 1E4FT 3A5MC 1NGBA 3ENHA 4KBOA 3UKRA 2QWMA 4DB3A 1V4TA 3RSEA 3D2FA 1NGDA 2NLXA 4HWIA 3BUZB 2ZWHA 3GL1A 3DXKB 3SJHA 3U9ZA 4ISEA 1YVNA 3AAPA 2OANA 1EQYA 5KPZA 5AQGA 2P9SA 3VEVA 4M7XA 2W40A 5I9EB 1R59O 1LOTB 1TUUA 5AQPA 2E88A 2J4RA 3LM9A 5AZIB 1IG8A 3ZETA 1NBWA 1Z6RA 3DXMB 3WXKA 4ISGA 4CZHA 5LY3A 4Z94A 3FZMA 4ISFA 3D2EB 4XEIA 3VPZA 4JD2B 3L4IA 1NGIA 1V4SA 4E1JA 1G99A 2FSJA 2VCPA 2CGKA 4K41A 5AFUA 1HLUA 4BR2A 4WYBA 3QB0A 5EOYA 4QS7A 3CJ7A 3O5BA 3MCPA 4QS8A 4FOEA 2FSKA 3UKUA 2Q1NA 4B1WB 4BRPA 5AQHA 3C7NA 2Q2RA 3A5NC 2Q36A 4EFHA 1QZ5A 4BRHA 4PKHA 2VYPA 4JAXA 4XH1A 3DXKA 2F9TA 2DPNA 5BRDA 1DGKN 5AQQA 3IDHA 2YI1A 3EL2A 2QWOA 2GTDA 4BRGA 4H0TB 4FOIA 5F2RA 2E2PA 3O1WA 4LC9B 5AZIA 3O80A 1KAYA 5AQIA 4CI6A 1DEJA 4BRNA 3QMLA 3O4WA 4IZ9A 3D2EA 4O5FA 3VGLA 3DWLA 5KPTA 4BQLA 2P9KA 4BG9A 3W0LA 3A8YA 2QWLA 5AQZA 1U6ZA 3FZHA 2WUSA 1GLCG 4PL8A 2F9WA 3I8BA 1K8KB 1T6DA 4FWPA 4CZFA 5LJWA 2PAVA 3GBTA 4QS9A 3VEYA 4IJAA 5AQRA 3B8AX 3AAQA 3QICA 1GLJO 4IJNA 5FPEA 5EXWA 4FWSA 2D4WA 5AZJA 3HI0A 2HF4A 4DHYA 1X9JA 4FO0A 2P9NB 1CZAN 1MWMA 3LDOA 4BR5A 3MMVA 3H3NO 5AQVA 4MO4A 3QFPA 2YHXA 4H0PA 1LCUA 1QHAA 2E1YA 1BU6O 1JCFA 1BOTO 1ATSA 3DAWA 3M3ZA 2YHYA 4MLHA 3CETA 3EKUA 1HX1A 5AFUH 1BWFO 4PKIA 1BDGA 4FSVA 5BPNA 4FL9A 1T44A 4H0XB 2YCHA 5E26A 3S41A 2BUPA 2ASOA 2NRHA 1ATNA 5AQKA 2HMPA 2HOEA 4AM7A 5F0XA 5B8HA 1QQNA 4A61A 5AQLA 1BA0A 2BTFA 1ZC6A 2AA4A 4H5VA 5JLHA 1D4XA 4K25A 3SLCA 1NGJA 3TPQA 3FZKA 5FPDA 4B1YB 3R6MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KHOA 4E7HA 2UUCK 1EWRA 4CGHA 2O4IA 4B9LA 2D1KA 1VQPN 4CF0A 1KCFA 1BI4B 4A57A 2KBKA 1JCEA 5EY4A 3U8XA 1JZBA 4FPAA 3M8RA 1S1UA 4YDUA 3HVRA 1TYQA 3SK3A 1XRSB 3SUPA 3NGIA 1FH3A 1CZBA 1WAJA 2XRIA 3J7YP 1S9EA 3VQDA 3CYMA 5AQJA 5AQWA 4NLBA 3QEIA 3NVKA 4GVEA 2D0BA 2NZTA 1X9MA 3AVCA 1O13A 4OO1J 1WOQA 5JICA 2V52B 3EZWA 5CE3A 4Z4HA 2W42A 3HTVA 1O1WA 1VNAA 2A1RA 4BRIA 3G4SN 1U04A 1T7BA 2O8BB 2GUIA 2VWBA 3VF4A 1NMDA 1NRBA 2V51B 4JD2A 3OBYA 3O9RA 3L2WA 1SAZA 2V7ZA 3U4LA 5EVZA 4FJLA 2VG7A 4B9QA 5DM7L 3SI6A 4JKAA 3L4QA 1T7EA 1CLQA 2GELA 2HBMA 2ITMA 2QKBA 5BR9A 1GLBG 4BE1A 3ZT2A 2HVIA 3TARA 1Z25A 3TU5A 4CJTA 2NRRA 1P00A 1Q7YO 2LY5A 2DFFA 3A5OC 2W41A 1SQKA 4FYDA 4PHTX 4BVPA 3E7UX 3NE6A 3A0IX 4CK2A 3AA5X 2GX9A 3CJ1A 1HUXA 3AVHA 1BG3A 2P9UA 2P9PB 3HSCA 1PX9A 1XMOK 1LAVA 3PLAA 4OPHA 4CJEA 1RDCA 3PX6A 3VOVA 4LY7A 3VERA 4BR0A 2BH1A 2IIRA 2ATQA 4DTRA 4Y1DA 4A2BA 2EWSA 3NCIA 3VQ5A 2FBTA 3WXMB 1D5AA 3RMBA 3ID6A 1JLGA 3CJCA 4EP4A 2YNGA 3ZEUB 1RTDA 1LWFA 4BREA 1X3MA 1EKEA 4I6MB 3CPWM 1BQNA 1C0GA 5TKYA 2YHBA 2LR3A 4TSXA 4BACA 3R2VA 3ZSVA 2IAJA 1U2VA 5JMVA 3WUHA 4OLBA 4FWNA 1NGHA 1DTTA 4CF1A 3NF9A 4FWRA 1GOAA 4NYNA 4KH6A 1TUYA 2KFZA 1Q86O 3JAMO 4M3ZA 4ID1A 4JLHA 2JLEA 4AH9A 1ZBHA 2G8WA 4J8FA 4DV2K 3P1GA 4CZJA 2KQ2A 4I7FA 3WQTA 3QEVA 4YOTA 2X6NA 3AVBA 2Q97A 5JLFA 4BC4A 4DR5K 3HM8A 1S3XA 4M63C 5BREA 3EO3A 3OA9A 5E41A 2N2RA 5EX5A 3RRHA 2NY8X 1N36K 2D5RA 2Z1GA 4X62K 1J6ZA 5KPRA 1E3MA 4BR4A 4FW1A 2QWRA 5HP1A 2PFUA 3T1HK 4J2EA 2JWLA 1EXQA 3BGRA 4M42A 3KJVA 3NF8A 4FXDA 5HROA 4CHOA 1XC9A 4JNEA 4DTPA 1VQ4N 4E3SA 4LF4K 5C2FA 3VTHA 1TK8A 2QTDA 4DWIA 3ZT0A 3G71N 3RR8A 2IVNA 1TKTA 1N5YA 1KFDA 2M8BB 4FJ5A 1X3NA 3LL3A 4HTLA 1RDDA 3EY1A 3UB5A 4FVUA 4M7YA 1D9DA 4GV9A 4H03B 2GWKA 5AQNA 1WSJA 3K58A 2YILA 2HHHK 4V1DC 5AQFA 4BRFA 4CEQA 1ASUA 1QZ6A 4DTXA 3MXJA 1G15A 3VQ9A 3C6TA 4O8KA 1KSPA 1Q8IA 1L3SA 3K59A 3KKSA 2A41A 4CD3A 4DS4A 3DRSA 5KGWA 3P4IA 1VSLA 1VSHA 4JKHA 3CFPA 3IMXA 3LDQA 4B3RK 1BUPA 4L3QA 1NJIO 3FLCO 1C55A 3HO1A 1TAQA 1OH7A 1IO2A 3NGZA 1I94K 2E2OA 2FF6A 3KKRA 1VQMN 4NCGA 3KK1A 4WQ5C 1C0MA 3S9HA 1NGFA 3K0SA 1BRZA 1NPIA 1YTUA 3CCQN 2D0PA 5BRFA 3LZJA 3C0BA 1HYZA 2W6LA 3LDSA 3CC7N 1HQEA 3I33A 3C65A 5C10A 4IOAL 3C95A 4GV6A 1XI1A 4IKFA 2HHXA 3CC4N 3UKRA 2QWMA 2E4LA 4X64K 4KHPK 2NLXA 3HPHA 4ELVA 1VSKA 1HPZA 2P9SA 1IKVA 3KK3A 3LM9A 3HVTA 1IG8A 3CCJN 1NBWA 4DQQA 4DKWA 1XWLA 4ISGA 1RTIA 4DV5K 4XEIA 3VPZA 4HHTA 2ZJPL 1UGLA 2CGKA 4K41A 1YVUA 1BCOA 4KTZA 1UA0A 3K9KA 5EOYA 1HRHA 1D9FA 3TTFA 1JL2A 3UKUA 2FSKA 4LSLA 1WB9A 2EX3A 4BRPA 3SCXA 2BGGA 2Q36A 3MEEA 4BRHA 4PKHA 4UADE 1WLJA 4FJNA 4XH1A 4KREA 4DFJA 2DPNA 4CK1A 4IFYA 3M8QA 2YI1A 1IBMK 4Z4CA 2QWOA 3OYAA 1VQNN 4H0TB 1VQ9N 4FZYA 5F2RA 2UUBK 4DU4A 3O9UA 2LKBA 3OTOK 2AJQA 4BRNA 1T7AA 4CJRA 3HXMA 1NNEA 4O5FA 4NYFA 1RBTA 3DWLA 4OKJA 4CESA 4BG9A 3W0LA 3A8YA 4KH5A 5AQZA 2N69A 1RBSA 5JVGL 3LPTA 4FLWA 1GLCG 3QEWA 4PL8A 4ILHA 3AVIA 3QI7A 4CZFA 5LJWA 3DLRA 3GBTA 1TKDA 4QS9A 2HHSA 1WSFA 4LH4A 1RDAA 2LY6A 1GOCA 3B8AX 3V9SA 3E9LA 3MXIA 1NK8A 1GLJO 4IJNA 4Q0BA 3AV9A 4DFMA 1NOZA 4KRFA 4A5AA 1SNBA 3CPEA 1CZAN 2IGIA 3MMVA 3H3NO 3I55N 2YHAA 4DSJA 3KLFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2KHO A;  4E7H A;  2UUC K;  1EWR A;  4CGH A;  2O4I A;  4B9L A;  2D1K A;  1VQP N;  4CF0 A;  1KCF A;  1BI4 B;  4A57 A;  2KBK A;  1JCE A;  5EY4 A;  3U8X A;  1JZB A;  4FPA A;  3M8R A;  1S1U A;  4YDU A;  3HVR A;  1TYQ A;  3SK3 A;  1XRS B;  3SUP A;  3NGI A;  1FH3 A;  1CZB A;  1WAJ A;  2XRI A;  3J7Y P;  1S9E A;  3VQD A;  3CYM A;  5AQJ A;  5AQW A;  4NLB A;  3QEI A;  3NVK A;  4GVE A;  2D0B A;  2NZT A;  1X9M A;  3AVC A;  1O13 A;  4OO1 J;  1WOQ A;  5JIC A;  2V52 B;  3EZW A;  5CE3 A;  4Z4H A;  2W42 A;  3HTV A;  1O1W A;  1VNA A;  2A1R A;  4BRI A;  3G4S N;  1U04 A;  1T7B A;  2O8B B;  2GUI A;  2VWB A;  3VF4 A;  1NMD A;  1NRB A;  2V51 B;  4JD2 A;  3OBY A;  3O9R A;  3L2W A;  1SAZ A;  2V7Z A;  3U4L A;  5EVZ A;  4FJL A;  2VG7 A;  4B9Q A;  5DM7 L;  3SI6 A;  4JKA A;  3L4Q A;  1T7E A;  1CLQ A;  2GEL A;  2HBM A;  2ITM A;  2QKB A;  5BR9 A;  1GLB G;  4BE1 A;  3ZT2 A;  2HVI A;  3TAR A;  1Z25 A;  3TU5 A;  4CJT A;  2NRR A;  1P00 A;  1Q7Y O;  2LY5 A;  2DFF A;  3A5O C;  2W41 A;  1SQK A;  4FYD A;  4PHT X;  4BVP A;  3E7U X; 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