5F1VA

Biomimetic design results in a potent allosteric inhibitor of dihydrodipicolinate synthase from campylobacter jejuni
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
296
structure length
295
Chain Sequence
KNIIIGAMTALITPFKNGKVDEQSYARLIKRQIENGIDAVVPVGTTGESATLTHEEHRTCIEIAVETCKGTKVKVLAGAGSNATHEAVGLAKFAKEHGADGILSVAPYYNKPTQQGLYEHYKAIAQSVDIPVLLYNVPGRTGCEISTDTIIKLFRDCENIYGVEASGNIDKCVDLLAHEPRMMLISGEDAINYPILSNGGKGVISVTSNLLPDMISALTHFALDENYKEAKKINDELYNINKILFCESNPIPIKTAMYLAGLIESLEFRLPLCSPSKENFAKIEEVMKKYKIKGF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase
publication title Biomimetic Design Results in a Potent Allosteric Inhibitor of Dihydrodipicolinate Synthase from Campylobacter jejuni.
pubmed doi rcsb
source organism Campylobacter jejuni
total genus 121
structure length 295
sequence length 296
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2015-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5f1vA00
3IEBA 1TTIA 3T4CA 4M7SA 1I8JA 2V30A 3DFOA 4JXCA 4RZ5A 4QJ1A 3EB2A 4ZQCA 1G4SA 3TC6A 4KFPA 3P8JA 3SZ8A 1L6YA 5KZMA 1FCBA 2VXNA 4AWUA 3PWAA 2ZTJA 3EWBX 4NJIA 3C61A 4HNUA 3GNNA 3DKJA 4EIVA 3GDRA 5H91A 1FX6A 1NF0A 3V1PA 1KBJA 3KRZA 4UTIA 4WQ6A 1F6PA 1VS1A 4Q32A 1F74A 4O53A 2ZRWA 1LOSA 4YXGA 1DBTA 3L5MA 3STEA 3EXTA 3QEZA 3P84A 2ATMA 3N14A 4IPIA 3U6WA 3DGRA 4BWLC 1PV8A 1H62A 3PUEA 4WY0A 2FLIA 2R8WA 3G1FA 2H8XA 5J5DA 1QAPA 3QRHA 1VYPX 4MYAA 2WJZA 3A22A 3NQVA 3PB2A 1CW2A 2CLHA 1MEWA 2A85A 1H7PA 3NQAA 4JNMA 4EVZA 3HG3A 1ZNNA 5F2GA 3GVGA 3SW6A 1LTDA 3TU9A 4YLWA 3TV8A 3OVQA 1TPUA 5G4EA 4A21A 3G1DA 5AHIA 4NXSA 3OHIA 1OK4A 2R94A 4NNBA 3SIZA 3LTYA 2VENA 4Y9AA 1ZAIA 2X1TA 3LTPA 3SGZA 3ABSA 1FWSA 2W79A 3LHWA 4E2BA 4BI6A 3UY8A 3P5ZA 3NQMA 4QIUA 1W5QA 3B4UA 2WO5A 4IMGA 3VE7A 4RKAA 5G2WA 3LBCA 3NQ7A 4OWGA 4LVAA 4LVDA 4JGDA 3N3MA 3C2FA 2DU2A 3PSWA 1H7WA 4HHPA 2ISSA 5F2IA 4ZQPA 3IIPA 4ZQOA 1JUBA 1A5BA 3LHTA 3Q2DA 3A5FA 2J88A 4MUZA 1H61A 4CNPA 4LUIA 4LVGA 1OYCA 4NNCA 3ATZA 4UMBA 3NO5A 4KKXA 4QITA 4TR9A 2J9ZA 3TAOA 3FYPA 3GB6A 4O28A 3KVMA 4WY0B 2V5LA 4GUGA 3CLMA 1QDSA 3LRMA 1O5KA 1D3HA 3P62A 1TPC1 4NJGA 1WAUA 1YADA 5KTLA 2CW6A 1OYBA 2QAPA 3EX1A 3KRSA 2I14A 1I2RA 4RCXA 5D09A 1OYAA 3HJZA 4O0KA 4JDBA 3QM3A 5AHFA 4BI7A 4HPJA 3TSDA 2Q8ZA 3RU6A 1F5ZA 4JIPA 4WXZA 3O15A 1ADOA 3WJYA 1XFBA 2H8ZA 1JUEA 1LZOA 2E6DA 4Z0JA 1QMLA 2C13A 5I3KA 3NVTA 4BI5A 1M7PA 1A50A 2CLFA 5CGQA 3IVTA 3IGXA 4KFNA 1X7FA 3HB9A 3W71A 3W7OA 2Y89A 4HPXA 5BW6A 2Z6JA 3P67A 3C3NA 3L67A 4JTIA 1JUKA 1SPQA 4LNYA 3ZWTA 5G4WA 3KAOA 2X1SA 2NV2A 3M5VA 2A0NA 5CPOA 1KV5A 2DZSA 3G8RA 1OFQA 3GKFA 5FEXA 4MVAA 3LCHA 4D2JA 1YXYA 4ZQNA 1VC4A 2YZRA 1RV8A 1OVDA 4H6KA 2F84A 4N6FA 3WJWA 3NXFA 1QWGA 5IBXA 3W7MA 3HGRA 1KA9F 1R46A 3W88A 4JYDA 4N4PA 1LBMA 2VFHA 3H55A 2B7QA 5C55A 2OT1A 3LCGA 1R30A 1VCVA 3LTSA 4BF9A 4DBDA 5SWUA 1RQHA 3G1HA 3PF3A 3F1QA 5BNKA 4XWUA 2BXVA 2ALDA 4UTJA 2VKZG 1DJQA 1K03A 4XUGA 5K7JA 1J2WA 1UBSA 3TC7A 4JYEA 1FY6A 5DCEA 3ANYA 4IWWA 4HNTA 3TJLA 1XBXA 4QSHA 3W7IA 2QF7A 5DBUA 1E51A 2DP3A 1WBHA 2ZZ3A 1DOSA 5AN7A 1P4CA 4HSOA 2A1YA 1EA0A 4MY1A 5HJLA 3O16A 1NVMA 4K38A 1EP3A 1A5AA 3O6CA 1GVSA 2V81A 1KTCA 4XQ6A 4RR4A 1LBFA 1W5PA 1FDYA 1IXOA 4JX5A 1H50A 2EF9A 4ZL1A 3DBPA 3B0VC 2CZFA 5FF3A 1KFLA 2B0MA 2Y88A 1QR7A 3ELFA 5I3JA 3M5ZA 1Q6RA 2G96A 4Y96A 4BK9A 3UWVA 1RQBA 4IXHA 2TMDA 1SSDA 2TYSA 1VHNA 1XBYA 3O06A 3BARA 4IMDA 3BPWA 5KZDA 3TCEA 1A5SA 1N7KA 1IIGA 5E0KA 4AB4A 5MHBA 3TR2A 1WDWA 2ZFAA 1HL2A 5FESA 1SSGA 3W1XA 3L68A 3NM3A 4HN4A 3LCLA 2X16A 4U28A 3TW7A 1WV2A 1EX5A 4MOZA 5IBXC 2Y7EA 3O6DA 1YPIA 3RLVA 1QFEA 2J27A 2CLEA 1PVNA 1I2NA 3DU0A 4MZYA 5D38A 1GQNA 1SZFA 3M1ZA 1N55A 3O1NA 5K3VA 3W7JA 4UMAA 5GVJA 3TA6A 1S5TA 3W23A 4N9CA 1TREA 2FPVA 1TB3A 3NYZA 4ZQRA 1B57A 3CIWA 3EWUA 4CLMA 2DZPA 1Q3NA 1ZJIA 3NEVA 4O1CA 3TSBA 3BK0A 2H6RA 4HIBA 1TJPA 2NWRA 5I3HA 1KM4A 1R47A 2ZZ2A 3EX3A 5D2XA 3S1VA 1XUUA 3M0ZA 4M5PA 3N9RA 3P5YA 2PRHA 3B04A 4NJKA 3NPVA 1GG1A 2F7FA 4CQ9A 3QQ1A 4JS3A 1WBJA 2E6YA 3SJ3A 2DZUA 2PRLA 3M7WA 5LNRA 4UTWA 4ZQMA 3G1YA 2YW4A 1XBVA 1KLZA 1W5MA 1XBZA 1GJPA 1UCWA 4LC6A 3IVUA 3I68A 3TMLA 3L65A 3P74A 4MY8A 3DFQA 2ZBTA 4LWWA 1JCMP 2QAFA 3CIXA 5BOOA 3B06A 4NJJA 1TIMA 3TXZA 3MI3A 2E1DA 1QPRA 3M16A 3H53A 3HIJA 4UR7A 1Z41A 1TCDA 3HG5A 4JEQA 1W5NA 3G24A 3W72A 2RDTA 2Q3OA 5AHLA 3W2UA 1Z44A 3PUOA 1J4EA 4UMCA 2YYUA 3EX2A 4XBKA 3F4WA 1Q6QA 4KWVA 1UJPA 4HNVA 3EXRA 2GUUA 4FNSA 3UWWA 4O1AA 2YX0A 2X2GA 4NX5A 5F4SA 1ICQA 4O15A 2ABAA 4LRTA 1VCGA 2H3BA 3W76A 1I2QA 3L5AA 1XUZA 4K8HA 1JRBA 1OFDA 2YCEA 2Z2UA 3NPXA 4I7VA 4N6EA 4IX2A 2ZYFA 1TTQA 2WNQA 4NZJA 2CLMA 3LHZA 4FX7A 4DPQA 1KV8A 2RKXA 5HR6A 1H5YA 5KZEA 3FA5A 2A6LA 3BGGA 2ZZ1A 1G67A 4EOUA 1GYNA 4AH7A 4O54A 5C6MA 5LNWA 5AC6A 1TPWA 1C8VA 4FXSA 1WOBA 3ABQA 5LGXA 1JCJA 2AGKA 1AW1A 1XC4A 2NWSA 4LOCA 2VFFA 1WOAA 2Y6ZA 2P1FA 3O05A 5HUOA 1MZHA 3NAVA 3W2MA 4NU7A 3NNTA 4LW7A 3W7RA 4XZ9A 3EWWA 1YLVA 4UR8A 4ZMGA 4K7VA 2YYTA 2AAMA 1WYIA 2PURA 3B05A 3DZ1A 3OA3A 3CEPA 3P61A 4JX4A 5F1VA 3HG2A 3TIMA 4G1KA 4MLJA 2FQIA 3S1UA 3LXAA 1A53A 4IPJA 4Y6GA 4X3ZA 3VE9A 5CZJA 2GQAA 2VEPA 4RV8A 4U4MA 1I2PA 3DFSA 3LDVA 5DY3A 4YCOA 3NGJA 2E5DA 2CU0A 3IV3A 3QFEA 4R33A 3THQA 5ABTA 3G18A 3LHVA 4UNLA 1OJXA 1KM2A 2NUYA 4MFEA 4AMAA 3AO0A 4BFAA 2QCCA 2DJXA 1FWRA 5L9FA 3TMQA 2ISVA 5A5WA 4JTGA 2WSYA 4UTHA 4OE7A 5I3IA 2GJLA 3USBA 4YMZA 4M6PA 1OX6A 1G7UA 4FEZA 5K2ZA 4Z1CA 2I1OA 1TPDA 2YW3A 3W85A 3LHYA 2ZZ5A 4ONVA 4YCPA 1XCFA 5CZ0A 1KM6A 3S1WA 4O52A 3WK1A 3NQEA 4I9AA 5F1UA 3WK2A 4UUIA 5KINA 4E2DA 1K3UA 5HINA 3LBMA 3LCIA 5AC7A 3W84A 3G1SA 1RZMA 3IIVA 2HS8A 4R7JA 4IMCA 4O4VA 3L0GA 1ICPA 3FYOA 2VOMA 2A21A 2DZVA 3A21A 1TRDA 3FIGA 4DQWA 3UZJA 3MW7A 1DQWA 5CZTA 3LLFA 4PL1A 3BG5A 1EP1A 3W2LA 3R12A 1R2TA 5AHEA 4K37A 1NAL1 1VRDA 1W8SA 2Y7GA 3EWXA 3UWQA 1M5WA 4UTUA 1XI3A 5DY2A 3L21A 3KXQA 4LRSA 3QQ0A 1XDLA 2EKCA 3ABOA 3TFXA 4E0CA 1ZAHA 3N19B 4QNWA 3FKKA 3W1AA 4FNUA 4PC8A 3W1QA 4UXDA 1OHLA 5G2IA 4DO5A 3HG4A 3M6YA 1ICSA 3C2EA 1IF2A 2FB2A 2JBMA 2JKAA 1MEIA 1G4EA 3W07A 3B0UX 4OQVA 1DQXA 2ZZ7A 4UNKA 1R2SA 1CI1A 1DL3A 1OFOA 2NXIA 5LZLA 4DO4A 3VCRA 1T96A 1K7FA 1OABA 3QF0A 4LTSA 4UFHA 1J5TA 4OU1A 1F2JA 3UZ5A 1H7RA 3SY5A 5LNVA 1FCVA 3DFTA 2VFEA 4MYXA 1Q6OA 1YYAA 1LBLA 1YDNA 3HQ1A 2OT0A 3P60A 2FPTA 4GWEA 2JK2A 1X8FA 4JTKA 1NF7A 1S5VA 3W70A 4QQ3A 4N2YA 3JRKA 3C4UA 3H54A 1G4TA 3R13A 2CLKA 3MHFA 1ME8A 5F4XA 3DAQA 4GRSA 3LRLA 2QCNA 4MFDA 5EKYA 1KLYA 1XKYA 2NZLA 4GE8A 2ZRVA 1AMKA 5DELA 1GT8A 3DI0A 1PIIA 3C2VA 2V5BA 1QPQA 3RNDA 1SFJA 4K8EA 5HUPA 1C29A 2ZDRA 5KSWA 4EWND 1GVQA 2YFOA 2ZRUA 1GOXA 5LNUA 5D03A 4GXMA 3TK7A 3U2OA 4AHOA 2Y7DA 4JTUA 1W31A 3W7DA 2QUUA 3EWZA 1BWKA 3BW3A 2V8ZA 5HWMA 4XTDA 1SW3A 1TV7A 3L5LA 1VLWA 3NL5A 4TO8A 2BWGA 3S5OA 4O11A 1TV5A 1EUNA 1WA3A 3C6CA 4ZZ9A 2FJKA 5FI8A 3FS2A 1OX5A 2QJHA 2X1RA 4FNTA 3LCWA 5T26A 5HWNA 1VLIA 4Z1AA 1HUVA 1QNVA 5K9XA 1OFEA 1IXPA 3NA8A 2NUWA 5CKSA 4AF0B 3GIYA 1F05A 3CC1A 2Z0IA 3DHDA 3T7VA 2VFIA 4DELA 3P8IA 3W7CA 2A7NA 5F4WA 4FF7A 3BLEA 2NX1A 3R89A 4ALDA 5LHEA 5FF2A 1EB3A 1TTJA 3TROA 2V2HA 3MBFA 2C16A 3NPUA 4PH6A 4JTFA 4FO4A 3QSRA 4A29A 3PAJA 4S2BA 3W1MA 5C2XA 3CU2A 3MHGA 3FLUA 3NQ6A 2HMCA 3STFA 3BW4A 1WQ5A 4A2RA 3KHJA 4JTTA 4NUWA 3C8FA 4Q33A 3CWNA 4N9BA 4AHQA 2YSWA 2ZA1A 4MLRA 5DXXA 1QOQA 5D2YA 1L9WA 4O18A 2X30A 5D2VA 4FB7A 4IJBA 5TIMA 4AAJA 4UFKA 3MI2A 3W75A 2OX1A 3W9ZA 1LM1A 5DBTA 1ZCOA 1WXJA 3MYPA 4IMFA 3OBKA 4CQAA 2DJLA 4MKNA 5KMYA 1B3OA 1YTKA 2E5CA 1UASA 3FEMA 3CT7A 3EWYA 1L6WA 3FOKA 4ORIA 1RPXA 2WPBA 1O60A 4J9JA 1ME7A 2BLEA 4LU0A 1LCOA 1K8XA 2QEZA 3O07A 1X1ZA 1QO2A 1A5CA 1U5JA 2EGZA 2NXHA 1O5XA 3S5ZA 3G3DA 3QMRA 1OF8A 1SO4A 4FIQA 1KTBA 4HNNA 3DH7A 1SZNA 3BG3A 1NSJA 3E02A 4NZFA 1Z42A 1DHPA 2FFCA 4NX0A 3BLIA 2Y62A 3HMJG 3FKRA 3NZ1A 4TU1A 1TTPA 5DN1A 3M5XA 1SU5A 1PE1A 1MSSA 4OT7A 3C2OA 2WNNA 3LV5A 3SR7A 1TMHA 4UCGA 4UTTA 3S6DA 2GVJA 3S0CA 2QDGA 2GOUA 4DBEA 5D02A 3MYOA 3L66A 2A4AA 2CLLA 3GDMA 3VKJA 4H3DA 4GUHA 3L0KA 3A9IA 1JCNA 1W3TA 3NG3A 1KM5A 2WSQA 1ME9A 3PY2A 4ADSA 3BG9A 1QOPA 3INPA 2QDHA 1W56A 1SR9A 3P82A 4O12A 4WX2A 2NV1A 2R14A 1EWEA 2P0OA 2WV8A 3TKFA 4RXFA 3I65A 3JR2A 5FEWA 2DZWA 4RZ6A 3W3OA 3WJXA 4CCCA 3LOTA 3W87A 2C18A 4Y90A 1TPB1 1EUAA 3NL3A 1HTIA 3W1LA 2Y70A 2QR6A 3DFPA 3MP3A 5TQLA 3N34A 4AHPA 1SZGA 3PC0A 4UFIA 4UFMA 3I7QA 2Y61A 3W1UA 3I7RA 1FUYA 1Q45A 3Q58A 1TQJA 4WZHA 5HQEA 3WK0A 1VQTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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