5F2I | Genus

Total Genus 125

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	125
sequence length	324
structure length	324
Chain Sequence	ITLTENKRKSMEKLSVDGVISALAFDQRGALKRMMAQHQTKEPTVEQIEELKSLVSEELTPFASSILLDPEYGLPASRVRSEEAGLLLAYEKTGYDATTTSRLPDCLDVWSAKRIKEAGAEAVKFLLYYDIDGDQDVNEQKKAYIERIGSECRAEDIPFYLQILTYDEKIADNASPEFAKVKAHKVNEAMKVFSKERFGVDVLKVEVPVNMKFVEGFADGEVLFTKEEAAQAFRDQEASTDLPYIYLSAGVSAKLFQDTLVFAAESGAKFNGVLCGRATWAGSVKVYIEEGPQAAREWLRTEGFKNIDELNKVLDKTASPWTEK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2
publication title	NON-STEREOSPECIFIC SUBSTRATE CLEAVAGE BY TAGATOSE-BISPHOSPHATE CLASS I ALDOLASE rcsb
source organism	Streptococcus pyogenes serotype m1
total genus	125
structure length	324
sequence length	324
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2015-12-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01791	DeoC	DeoC/LacD family aldolase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5f2iA00

1PCWA 1HTIA 3B0VC 2V9DA 1OFOA 5D38A 5LNWA 3CEPA 4M6QA 3VE7A 5LNUA 3W3OA 3W1QA 3GKFA 2B4GA 1Y0EA 1DORA 3RNDA 1OYAA 3PM6A 4MZ1A 1OFAA 4I9AA 5K9CA 2LLEA 1IXNA 3TXZA 2C14A 2CZEA 2BLEA 3BW3A 3LCFA 5F1UA 1MZHA 5FESA 3NZ1A 2NLIA 3BW4A 5F4WA 4UTJA 3HGOA 1LTDA 1KFBA 2ZRWA 3NPWA 3FKRA 2GJLA 3QH2A 4PODA 1PCKA 2DZXA 3OHIA 3W86A 3L65A 1HUVA 4RKAA 5E0KA 1QPOA 4DXVA 4NX0A 3BPWA 2ZDRA 1XDMA 2ZZ3A 4JTKA 1WOAA 5FF0A 2YFOA 4ZQCA 1SW0A 1X7FA 4YCPA 2R94A 1M5WA 2A21A 2JK2A 4AHQA 3PAJA 4Y8FA 5CSSA 3HOJA 4KFPA 1LBFA 4EF9A 4JTEA 3IVTA 3H55A 5AB3A 3BG3A 2H8ZA 1IGSA 3C52A 3MBFA 4O11A 3UYCA 1U5JA 3EXSA 4MJMA 3WJYA 4MIMA 3UPBA 3OVRA 1Z44A 5AHIA 2CZDA 1G7VA 1T99A 5AC6A 2FQIA 1H1ZA 1ME7A 4XKYA 1GVFA 3UZ5A 2VENA 3GXPA 2WPBA 2WSQA 4AWUA 4KWWA 4JYFA 2C0AA 5KITA 3NYZA 4H4IA 1VCFA 5SWUA 3QMRA 3I7SA 4PA8A 1YYAA 4RLIA 2H90A 1SFJA 5FEPA 1FWWA 3N14A 4CNNA 1FQ0A 4BI5A 4O4VA 2ZZ1A 1QAPA 3TKFA 3FOKA 5G2WA 4IX2A 2ATMA 1JR1A 3NA8A 3W70A 2WQPA 3HG5A 4MUZA 4HT3A 3LRMA 4BI6A 3G1DA 2V30A 3FJ6A 3WJXA 2QCNA 3O06A 4WD0A 4G1KA 3G3MA 2J9XA 1SPQA 1R47A 2JGYA 3S5YA 3LV6A 3DKLA 2F84A 3W7RA 4GRSA 3IEBA 5U4NA 3NEVA 2FB2A 1A5SA 4BWLC 4BFAA 3MHGA 3W6YA 2A85A 4IOTA 2O7QA 1W5QA 2CFFA 2ZBTA 4IGHA 3TK7A 3OA3A 4UFMA 3UY8A 4JTFA 3W87A 3L21A 4DPQA 1FCBA 3M16A 3W9ZA 4O1BA 5E1QA 1JULA 2PRLA 2Y7FA 3F4NA 2J88A 1FWSA 3G1AA 1GTEA 2YW4A 4XBKA 3NQ7A 2PC4A 4K36A 5LHEA 2Q8ZA 3DXIA 4LS1A 1JUEA 3VNDA 3PBVA 5FEZA 3AJXA 1PHWA 2G5WA 3PF3A 3TC6A 3B06A 5LKYA 3S42A 3O15A 3W84A 2Z1BA 3GDLA 3AO0A 1FUYA 3TQ0A 1VR6A 2P10A 3GIYA 1O60A 2CLHA 2E6FA 3S1VA 4CQAA 3LTSA 3MBDA 4JTIA 5I3HA 4K7VA 3BLEA 1K8ZA 3C2FA 3W1UA 1HO4A 4O28A 3PBYA 1H7WA 1TB3A 4WXYA 4B5NA 5CPLA 4KKXA 3UWVA 4ADSA 5LSMA 2AQWA 3P80A 4UFJA 4XTIA 1VYRA 5AN7A 4A21A 3CIXA 2ISWA 3HQ1A 3W75A 3WK0A 3UXDA 3CQ0A 3W85A 2PE4A 4NNCA 4MKNA 3HJZA 1WAUA 3G1FA 3B0UX 4R53A 2WNNA 1HL2A 4N9EA 5HWJA 2I1OA 3QW4B 1SQ7A 2GJNA 3NL6A 3QRHA 2J9ZA 5DCBA 1EP1A 3IRDA 2WSRA 1TRDA 2NX9A 4PCFA 1B4EA 3W7IA 3TSDA 4UNKA 3NQVA 1X1OA 4J9JA 2VEMA 3V1PA 1WXJA 4O15A 2W79A 3TE9A 1QO5A 2FTPA 3PUDA 1J2WA 2FPVA 3SGUA 1WV2A 1LCOA 5I3JA 2DZUA 1JCNA 3CWNA 2C6QA 4UNLA 1QOQA 2OMAA 2A5HA 5BRBA 1VHNA 3CU2A 1X6UA 3HPXA 2OZ0A 4UR8A 5D2VA 1L6YA 3I6RA 2E1DA 1B57A 2R91A 3NR0A 3GB6A 2BTMA 4GUJA 1KBJA 1GVRA 3NQDA 1IXQA 2H3DA 3EEGA 1A53A 1WBHA 1SZGA 4HIBA 2NV1A 2TYSA 1EEPA 4H6KA 1XUZA 1L6WA 2A7NA 1IXPA 4NJGA 3BW2A 2C15A 4E38A 4N9CA 3IGXA 2QCCA 1FCQA 3KOFA 3NNTA 3VI2A 1G4PA 3EKZA 3ELFA 3LHYA 1TPFA 2ZRVA 3SSJA 5K3VA 1KLYA 1TREA 3QF0A 2X30A 3C56A 1YXCA 1IIGA 4NJJA 4NX5A 1R2SA 4O52A 1NEYA 1GTHA 1VCVA 1LDCA 4O57A 4IUOA 1TPWA 5AYXA 1BWLA 3M43A 3R13A 1ZALA 4RX0A 5KZDA 1QDSA 1YDNA 1O5XA 4FX7A 5CZTA 5MHBA 3MO7A 4FNTA 1I8JA 2QAPA 3EWBX 1XI3A 3NQ6A 3D0CA 5H91A 3CC1A 4K6AA 3VE9A 4UTUA 1F6PA 5BOOA 1JCMP 1W0MA 4FF7A 4UTTA 5G2HA 1RQBA 2GVGA 4HN4A 3W71A 2HMCA 4ORMA 1YDOA 4LVAA 4FHAA 5CZSA 1QPQA 3P67A 1GJPA 3MW7A 1G4TA 1JUKA 1JRCA 3GDRA 1Q45A 3W7GA 3EX3A 3EXRA 4AXKA 1KBIA 1TSIA 4AF0A 3TUUA 3P5YA 3ZS4A 1YPFA 4RXFA 5HMSA 1OFRA 3E12A 3BGGA 1SU5A 3IGSA 2C1HA 1TPUA 4O4WA 3MI6A 1ZENA 5I3GA 2Y6ZA 4IPJA 8TIMA 4QIUA 3W76A 3S6DA 3STGA 1TPH1 3EXTA 2RH9A 4BI7A 1OVDA 2ZCGA 2NX1A 5AHLA 4GUFA 1THFD 3HGRA 3W7JA 1DJQA 4FNUA 1XCFA 3W1NA 4P61A 3KVLA 4JTJA 1OX4A 3C6CA 3OVPA 5TIMA 3BLIA 3M0ZA 3I7QA 4X3ZA 3W2LA 3EWZA 3TU9A 4M6VA 1DJNA 3GNNA 3ATZA 4MFDA 3DH7A 3NGJA 2OX1A 1K8YA 4TMCA 5IBXC 3NVTA 4UFLA 4O0ZA 1XFBA 5TBOA 4K38A 3SY5A 1H60A 2BSLA 4FXRA 1TTPA 1V7YA 5HINA 3C2EA 3IVSA 4Z0SA 3R5EA 5ABTA 4AMAA 4ML9A 3QW3A 1VJIA 4CNPA 3BVJA 2DU2A 3I65A 2RKXA 2FFCA 4NZJA 2CW6A 2Y89A 3P62A 3UWQA 4UTIA 3MP5A 1ALDA 3G1XA 3F1QA 1OK6A 2EKCA 3S9YA 3IIXA 4JR5A 4IXXA 1VPXA 5K7JA 2V5BA 4IMGA 1RVGA 5T26A 1YTKA 1PHQA 4MZ8A 4TR9A 3LV5A 1OFPA 3NOEA 1AW2A 5CPNA 3W7OA 2EF9A 3GLCA 3QPZA 3O07A 2ZZ5A 1GPWA 2FJKA 3NL3A 3QPYA 3O8AA 4POCA 2ZQ0A 3LRLA 1H7RA 5HJLA 5L6UA 6ALDA 3LOTA 1K3UA 1OK4A 5G5IA 3IIVA 3PBUA 1TQXA 1FCUA 5EL1A 3O6DA 3NPXA 2YYUA 2QUTA 4HKPA 4JN6A 2GVJA 3EX1A 3W7HA 3LCHA 1W37A 3FIGA 3U6WA 4N6FA 5DBUA 3NQAA 3W73A 1NF0A 3QEZA 1KM2A 3BARA 3QC3A 4MYAA 1H7OA 3TMQA 1N8FA 2QJHA 2JKPA 4HNVA 2BZNA 2ISVA 5KSWA 4UUIA 2J24A 3EX2A 3Q2DA 1XBZA 3EWWA 4GFSA 4NUWA 5EY5A 4IXHA 3EX4A 1QR7A 1TPC1 3P5ZA 3QSRA 4NXKA 2GQ9A 1QO2A 1LROA 4EF8A 5G2IA 1N7KA 1CX9A 5A5WA 3O6CA 3S8HA 5EPDA 4JICA 3GX9A 2DZTA 2CLEA 5KINA 1GEQA 4CCCA 3WK2A 3Q94A 1F7BA 3BGJA 4U4MA 3SW6A 3OIXA 3L67A 2XFWA 3W7CA 3LCXA 1ONRA 5F2MA 1A5BA 4X22A 2XN1A 6TIMA 5H2ZA 3N3MA 2Q3RA 4EOUA 3W2UA 4OBTA 3W1MA 3VFLA 4JDYA 1SZNA 2YGYA 3W2JA 2OJPA 3W1AA 3CWOX 4A2SA 3K30A 4OQVA 3S1WA 3W07A 4UTWA 1PS9A 1ME8A 3FFSA 5EKYA 1UUOA 4ONVA 2V0TA 4PTNA 1VLIA 3DFQA 2DZSA 3L68A 3RLUA 1EP2A 3LGEA 2Q8LA 3KVMA 3CPRA 4GBUA 1L2UA 3R89A 3UWUA 4UFKA 1SZEA 2HSAA 4NJKA 4R33A 1KFKA 4FNRA 1FWRA 4WUIA 2BXVA 3ATYA 1AMKA 3HB9A 3HGJA 1H7XA 4DEFA 2ZRXA 4JTGA 1LLZA 3E02A 1RPXA 4BWLA 3ZFHA 4CNOA 4OWGA 1JCJA 3UQNA 4HPJA 1TQJA 1UJPA 4ZQNA 4UMBA 3FA5A 2CLOA 4JX6A 4MY1A 3FYPA 1KA9F 3L5AA 1D9EA 1RD5A 5CG7A 5HQEA 4OV4A 1TMHA 4BR1A 1LOQA 3PB2A 4GE8A 1VCGA 1YPIA 1VZWA 4JTHA 3V75A 1G4SA 1NFBA 3SI9A 1ICSA 3GZ3A 1KM3A 2E6DA 4FB7A 1H62A 5D2XA 1JCYA 3KRUA 4O12A 3GKAA 2GQ8A 4C1LA 5HUOA 1P1XA 2ZA3A 4LC6A 1T8XA 4Y90A 3A5FA 3QJAA 1XUUA 4DQWA 1OF6A 2B7PA 1R46A 4NNAA 1OABA 4JY8A 4K8HA 5DCEA 2IQTA 3DI0A 3SR7A 4LNYA 4FO4A 1GZGA 3OEXA 1FBAA 1Z48A 1W3IA 3G1YA 4PC8A 2CLMA 3OG3A 1IIHA 3CB8A 2A1YA 1SZFA 2J6XA 3VCRA 3W74A 2JKEA 3TFXA 1ADOA 2CZFA 3HPSA 4JEQA 4FNSA 4N2YA 1KM6A 1CW2A 3TJXA 4UTLA 4DBEA 2JGQA 4LS0A 4CQ9A 3INPA 4K37A 1TO3A 4UTMA 1P0NA 3NM3A 1OJXA 1YXDA 2WNZA 1N55A 1P0KA 1ZY9A 4HHPA 3W7EA 4JS3A 3TCEA 4JX4A 2Z6IA 4QJ1A 2QEZA 3UD6A 1IF2A 3W7KA 1I2PA 3TH6A 1G4EA 5G4EA 4DO5A 5F2LA 2RDTA 1ZJIA 3G0SA 3QYQA 4HNUA 1QFEA 2DORA 1F2JA 1O4UA 3RU6A 1F05A 1V5XA 1MEHA 2UV8G 2NV2A 4QM1A 4YMZA 3Q37A 4S2CA 3NPUA 1TJRA 2QCFA 3B05A 4XKYB 1Q6OA 5K2ZA 3LDVA 1TPVA 1SO4A 3IIZA 2CWNA 1OX5A 4UFHA 4AAJA 3O16A 3CHVA 4AB4A 1I2NA 2HS8A 1ICQA 3W22A 1L6SA 3NQ2A 4WJEA 5D32A 1OFDA 5BW6A 3CIWA 1Q3NA 3HG4A 1LRNA 3P7YA 3DI1A 4JYEA 2VKZG 3M41A 3GDTA 5D30A 4DO6A 4FEZA 3TSMA 1ZAIA 2ZZ6A 1VHCA 5HULA 3ABRA 1OYBA 3CM4A 2TRSA 4WX2A 1QNVA 3LX9A 1GVSA 3BK0A 1WA3A 4PL1A 2YDAA 1K7XA 1QPRA 3IIPA 3W7PA 4LVFA 1B9BA 2A0NA 3HMJG 3M6YA 4GC4A 4QITA 2TPSA 2XN0A 3O63A 3SJ3A 3TFCA 4O50A 3PSWA 3KHJA 5K9XA 2AGKA 2OCZA 3TW7A 1H61A 2FDSA 4X2RA 3PB0A 3MP3A 3NXFA 3I68A 1EWEA 2I14A 1RV8A 4TU1A 3THAA 4O16A 5AYYA 3M9YA 3HG3A 3T55A 4Q4KA 1AW1A 4Q33A 3G1HA 2A2IA 3C0JA 4O17A 2ZRYA 3I7RA 4BK9A 3GK0A 1LOLA 1JCXA 4O14A 2Y7GA 3USBA 2B7QA 4HNTA 3M1ZA 3NQGA 3NO5A 3SECA 4LY8A 3ZWSA 3NG3A 5AC8A 1O5KA 2YXGA 4DF1A 4NQ1A 1OX6A 3GR8A 3H53A 3WJSA 1Z41A 4HSOA 3TIMA 2I9EA 2ZZ2A 4O1DA 1MEWA 2A7RA 4AHOA 5TQLA 3JS3A 4FX8A 3DHFA 1W56A 2X2GA 4Z1CA 3UY7A 2E09A 4NZFA 4QNEA 2CU0A 2WJZA 4JX5A 4R34A 4O10A 1KTCA 4WY0A 1YADA 3QMTA 2NXHA 2NWSA 2OT0A 2YPIA 3QQ0A 4S2BA 5LZLA 2ZTJA 4YXGA 4MLRA 4QQ3A 2EPHA 1RR2A 3A5VA 1VGAA 1SUXA 4NJHA 3W1LA 4ICNA 3GYEA 3R12A 4RXGA 4A22A 4W9TA 4O1CA 3GAKA 5IBXA 5A8GA 2W6RA 4JXCA 2TSYA 1RZMA 3SGZA 2QF7A 3MI3A 1BEUA 1DQXA 3WFAA 3W1PA 3W1TA 4Y6GA 3TAKA 1H50A 3TV8A 2TMDA 4AVFA 3L2IA 5DXXA 5CPMA 1Z42A 1YTEA 4HPXA 4AEOA 2ZZ7A 4QISA 4L4LA 5K9DA 2P0OA 1GVOA 2Y70A 4ADUA 1QOPA 4LU0A 2X16A 2G96A 3LTYA 3O05A 3C4UA 4LOCA 1G7UA 4N9BA 3N2MA 1OFEA 3GNDA 3TXVA 1XC4A 1FWNA 3NL2A 2YW3A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5F2IA

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