5FE1A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with fragment br004 (fragment 1)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
DPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe1A00
2YW5A 5D3TA 4QSTA 4HXNA 2N9GA 4NR6A 4C66A 5AD3A 3NXBA 3QZVA 4Y03A 5CQAA 4NRAA 5H1UA 5CUDA 4TS8A 4NRCA 3IU6A 4IR5A 4MR6A 2E3KA 5EPRA 4BW1A 5EPBA 5ENIA 4NYXA 3JVKA 4TZ8A 3SVFA 4UIWA 4A9JA 5A5RA 5F1LA 4CFKA 5EICA 5J0DA 5A7CA 4O7FA 5DFBA 4WHUA 5A85A 5E73A 5IGKA 4NR7A 4A9OA 4N3WA 4LYWA 2H60A 2D82A 5G4SA 3P1CA 4PCEA 5D24A 4A9NA 5DX4A 5DYAA 3D7CA 3MQMA 4IR6A 5A82A 4BW2A 4NRBA 5CQ3A 5DW2A 2OUOA 2L85A 4UYFB 2GRCA 4A9HA 3JVMA 5DYCA 5FE5A 3HMFA 5HELA 5DKHA 4Z93A 4QSXA 4O7CA 2DKWA 5AMFA 4NUCA 5CP5A 3S92A 3TLPA 5F63A 4J0RA 4HXOA 4LC2A 5FE7A 5BT3A 5I89A 5CQ5A 4LDFA 4NR8A 4C67A 4MR5A 5A5OA 5HCLA 5D3PA 4OUFA 5HEMA 5CUAA 4J3IA 5FB1A 5KTXA 2R0VA 4IORA 5L8UA 5AMEA 4QYLA 4GPJA 4ALHA 5I83A 5FE1A 5F5ZA 5A81A 3FKMX 4KV4A 5HFQA 4AKNA 1WUMA 4NR5A 3UV2A 4PTBA 5LJ2A 3UVWA 4ZC9A 4Z6HA 3MB4A 5TB6A 4KV1A 5CZGA 5E9VA 4TQNA 5FH8A 5E9LA 5FB0A 4A9EA 4OGJA 2F6JA 4YYIA 4UYFA 4QSQA 4Z1QA 5I86A 4E96A 3LXJA 4ALGA 3AQAA 5EP7A 5IGMA 4TZ2A 4YAXA 4N4IA 2RFJA 4XY9A 4PY6A 5FDZA 4DONA 5CQ8A 5E3DA 5DY7A 5A83A 5C4QA 4QUTA 2D9EA 3P5OA 5K29A 5FH6A 5HRVA 4QEUA 2E7NA 2DWWA 4NQMA 4CUSA 4YYNA 2DVRA 5KTWA 3GG3A 4NYWA 4HXMA 3LQJA 5F2PA 5JI8A 5LKXA 5TCMA 2I7KA 5HENA 3U5PA 4A9LA 4QC1A 4HXRA 5EWWA 5FE8A 3UVXA 2OO1A 5DKCA 3P1EA 4QSVA 2RO1A 4NUEA 5FFYA 4NYVA 5F61A 5L8TA 2FSAA 4LR6A 4MEPA 4QR4A 1F68A 4UIXA 5EVAA 2YQDA 4CUUA 5IGNA 2YELA 3RCWA 2KTBB 4YYDA 5G4RA 4HXLA 2RS9B 4BJXA 4QR5A 4RVRA 4Z1SA 4O78A 4Z6IA 4OGIA 4O70A 4YH3A 2DVQA 5E74A 4WHWA 1JSPB 5FFVA 4YY6A 4QNSA 4QBMA 4QYDA 5D25A 5C89A 5FG6A 4XUBA 4QEWA 5CQ6A 5CTLA 1E6IA 2NXBA 5EM3A 5I88A 2YEKA 5I40A 5CPEA 4MR3A 3QZTA 4PS5A 5I7XA 5FE2A 3UV5A 5A5PA 4YH4A 3UV4A 4LRGA 3O37A 3ONIA 5DFCA 4TYLA 5ENEA 3SVHA 5BT5A 5F62A 5HQ5A 4X2IA 5E9YA 4KCXA 5H1TA 5IGLA 2DVVA 3SVGA 2E7OA 5F36A 4NUDA 2WP1A 5HFRA 5I29A 3UVYA 4TT4A 4N4HA 3JVLA 5E9MA 4UIZA 5FFWA 4QSPA 5DBMA 3U5MA 2R0YA 5DYUA 4O7BA 5DLXA 2L84A 2RNXA 5C8GA 2OSSA 5F3AA 5D0CA 5FG4A 3LQHA 4YABA 4MENA 5COIA 5FE3A 5FE4A 3DAIA 4A9KA 5CQ4A 4HBVA 4Q0OA 3MUKA 3U5KA 3G0LA 5D3HA 2WP2A 5ACYA 5D3NA 5HQ7A 5D3LA 4O74A 4J1PA 4BW3A 5CQ7A 4O71A 5EA1A 5I7YA 4UYGA 5D3RA 5FBXA 4NQNA 4YBTA 5ENFA 5EWCA 5LVRA 4HXKA 3IU5A 4N4GA 2R0SA 3U5NA 4ZQLA 5H85A 5D26A 5EPSA 5CU8A 4YYMA 4TT2A 4YBMA 4LZRA 2I8NA 4J0SA 5ENBA 3O33A 3G0JA 4TU4A 5CY9A 2G4AA 5FE6A 4NR9A 5CUEA 4MEOA 4O77A 4HXSA 4O72A 4O7EA 3Q2FA 3HMHA 1JM4B 4UYEA 5A5QA 5HQ6A 5HLSA 5IG6A 4YATA 2DATA 5CUBA 4BHWA 4UIYA 4CURA 5CFWA 3UW9A 5CQTA 5EK9A 4IOQA 4NXJA 1X0JA 4MR4A 4TT6A 5EWHA 2YDWA 4PKLA 4Q0NA 4MEQA 5D3SA 4IOOA 4IR4A 5CS8A 1WUGA 4HBWA 4UYDA 4YK0A 5HM0A 4YYJA 5I1QA 5CGPA 5EGUA 1EQFA 5H1VA 4O7AA 2RNWA 5L98A 5L97A 5FE9A 4QC3A 4YYKA 2DVSA 4UIUA 4QZSA 5CRZA 4CUPA 4HBXA 5DYXA 4QR3A 5LKUA 5KHMA 1ZS5A 5F60A 5AD2A 2R10A 5LJ1A 5DKDA 3HMEA 5EISA 5EWVA 4TU6A 5KO4A 4O75A 4LZSA 5II1A 5DW1A 3JVJA 5C87A 3U5JA 4LYSA 5A5NA 3I3JA 5EWDA 5HRWA 5A5SA 3P1DA 4YBSA 5LUUA 4ZW1A 5F1HA 4YADA 4IR3A 4CL9A 5LKTA 5HJCA 4XYAA 5I80A 3ZYUA 3O36A 4XY8A 4WIVA 5E9KA 3K2JA 4YY4A 1N72A 3P1FA 4NR4A 5C85A 2F6NA 5HRXA 3LJWA 4CUTA 3O34A 4HBYA 3O35A 4XUAA 4QSRA 4QY4A 5CUCA 3UVDA 4QSWA 3MULA 5L96A 3LQIA 4FLPA 5E7DA 4QSSA 5D7XA 5C7NA 5IBNA 5CRMA 5FE0A 5ENJA 4UYHA 5L99A 5FH7A 4CFLA 4N4FA 5ENCA 5KU3A 4QSUA 3AADA 4UITA 4YYHA 5ENGA 5EI4A 5DFDA 2YYNA 4HXPA 5JWMA 5IIDA 2MJVB 4UIVA 4LZ2A 2RI7A 5F25A 5ETDA 4A9FA 3MB3A 4O76A 5LKZA 4A9IA 5EQ1A 4YC9A 5LVQA 4A9MA 2RNYA 4NS5A 5E0RA 3MXFA 3U5OA 4CLBA 5E3GA 5FG5A 3DWYA 5ETBA 4CUQA 2L5EA 5EV9A 4BW4A 4F3IA 3U5LA 4LYIA 4TTEA 4QUUA 3QZSA 5E9IA 5BT4A 4PCIA 5ENHA 5CUGA 2YEMA 4QB3A 4QEVA 5II2A 5KTUA 3Q2EA 4YYGA 5LJ0A 5D3JA 3S91A 5EU1A 5DLZA 2LSPB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YW5A 5D3TA 4QSTA 4HXNA 2N9GA 4NR6A 4C66A 5AD3A 3NXBA 3QZVA 4Y03A 5CQAA 4NRAA 5H1UA 5CUDA 4TS8A 4NRCA 3IU6A 4IR5A 4MR6A 3VKGA 2E3KA 5EPRA 4BW1A 5EPBA 3D1BA 5ENIA 4NYXA 3JVKA 4TZ8A 3SVFA 4UIWA 4A9JA 5A5RA 5F1LA 4CFKA 5EICA 5J0DA 5A7CA 4O7FA 5DFBA 4WHUA 5A85A 5E73A 5IGKA 4NR7A 4A9OA 4N3WA 4LYWA 2H60A 2D82A 5G4SA 3P1CA 4PCEA 5D24A 3D1DA 4A9NA 5DX4A 5DYAA 3D7CA 3MQMA 4IR6A 5A82A 4BW2A 4NRBA 5CQ3A 5DW2A 2OUOA 2L85A 4UYFB 2GRCA 4A9HA 3JVMA 5DYCA 5FE5A 3HMFA 5HELA 5DKHA 4Z93A 4QSXA 4O7CA 2DKWA 5AMFA 4NUCA 5CP5A 3S92A 3TLPA 5F63A 4J0RA 4HXOA 4LC2A 5FE7A 5BT3A 5I89A 5CQ5A 4LDFA 4NR8A 4C67A 4MR5A 5A5OA 5HCLA 5D3PA 4OUFA 5HEMA 5CUAA 4J3IA 5FB1A 5KTXA 2R0VA 4IORA 5L8UA 5AMEA 4QYLA 4GPJA 4ALHA 5I83A 5FE1A 5F5ZA 5A81A 3FKMX 4KV4A 5HFQA 4AKNA 1WUMA 2EJNA 4NR5A 3UV2A 4PTBA 5LJ2A 3UVWA 4ZC9A 4Z6HA 3MB4A 5TB6A 4KV1A 5CZGA 5E9VA 4TQNA 5FH8A 5E9LA 5FB0A 4A9EA 4OGJA 2F6JA 4YYIA 4UYFA 4QSQA 4Z1QA 5I86A 4E96A 3LXJA 4ALGA 3AQAA 5EP7A 5IGMA 4TZ2A 4YAXA 4N4IA 2RFJA 4XY9A 4PY6A 5FDZA 4DONA 5CQ8A 5E3DA 5DY7A 5A83A 5C4QA 4QUTA 2D9EA 3P5OA 5K29A 5FH6A 5HRVA 4QEUA 2E7NA 2DWWA 4NQMA 4CUSA 4YYNA 2DVRA 5KTWA 3GG3A 4NYWA 4HXMA 3LQJA 5F2PA 5JI8A 5LKXA 5TCMA 2I7KA 5HENA 3U5PA 4A9LA 4QC1A 4HXRA 5EWWA 5FE8A 3UVXA 2OO1A 5DKCA 3P1EA 4QSVA 2RO1A 4NUEA 5FFYA 4NYVA 5F61A 5L8TA 2FSAA 4LR6A 4MEPA 4QR4A 1F68A 4UIXA 5EVAA 2YQDA 4CUUA 5IGNA 2YELA 3RCWA 2KTBB 4YYDA 5G4RA 4HXLA 2RS9B 4BJXA 4QR5A 4RVRA 4Z1SA 4O78A 4Z6IA 4OGIA 4O70A 4YH3A 2DVQA 5E74A 4WHWA 1JSPB 5FFVA 4YY6A 4QNSA 4QBMA 4QYDA 5D25A 5C89A 5FG6A 4XUBA 4QEWA 5CQ6A 5CTLA 1E6IA 2NXBA 5EM3A 5I88A 2YEKA 5I40A 5CPEA 4MR3A 3QZTA 4PS5A 5I7XA 5FE2A 3UV5A 5A5PA 4YH4A 3UV4A 4LRGA 3O37A 3ONIA 5DFCA 4TYLA 5ENEA 3SVHA 5BT5A 5F62A 5HQ5A 4AI6A 4X2IA 5E9YA 4KCXA 5H1TA 5IGLA 2DVVA 3SVGA 2E7OA 5F36A 4NUDA 2WP1A 5HFRA 5I29A 3UVYA 4TT4A 4N4HA 3JVLA 5E9MA 4UIZA 5FFWA 4QSPA 5DBMA 3U5MA 2R0YA 5DYUA 4O7BA 5DLXA 2L84A 2RNXA 5C8GA 2OSSA 5F3AA 5D0CA 5FG4A 3LQHA 4YABA 4MENA 5COIA 5FE3A 5FE4A 3DAIA 4A9KA 5CQ4A 4HBVA 4Q0OA 3MUKA 3U5KA 3G0LA 5D3HA 2WP2A 5ACYA 5D3NA 5HQ7A 5D3LA 4O74A 4J1PA 4BW3A 5CQ7A 4O71A 5EA1A 5I7YA 4UYGA 5D3RA 4AKGA 5FBXA 4NQNA 4YBTA 5ENFA 5EWCA 5LVRA 4AKHA 4HXKA 3IU5A 4N4GA 2R0SA 3U5NA 4ZQLA 5H85A 5D26A 5EPSA 5CU8A 4YYMA 4TT2A 4YBMA 4LZRA 2I8NA 4J0SA 5ENBA 3O33A 3G0JA 4TU4A 5CY9A 2G4AA 5FE6A 4NR9A 5CUEA 4MEOA 4O77A 4HXSA 4O72A 4O7EA 3Q2FA 3HMHA 1JM4B 4UYEA 5A5QA 5HQ6A 5HLSA 5IG6A 4YATA 2DATA 5CUBA 4BHWA 4UIYA 4CURA 5CFWA 3UW9A 5CQTA 5EK9A 4IOQA 4NXJA 1X0JA 4MR4A 4TT6A 5EWHA 2YDWA 4PKLA 4Q0NA 4MEQA 5D3SA 4IOOA 4IR4A 5CS8A 1WUGA 4HBWA 4UYDA 4YK0A 5HM0A 4YYJA 5I1QA 5CGPA 5EGUA 1EQFA 5H1VA 4O7AA 2RNWA 5L98A 5L97A 5FE9A 4QC3A 4YYKA 2DVSA 4UIUA 4QZSA 5CRZA 4CUPA 4HBXA 5DYXA 4QR3A 5LKUA 5KHMA 1ZS5A 5F60A 5AD2A 2R10A 5LJ1A 5DKDA 3HMEA 5EISA 5EWVA 4TU6A 5KO4A 1PUOA 4O75A 4LZSA 5II1A 5DW1A 3JVJA 5C87A 3U5JA 4LYSA 5A5NA 3I3JA 5EWDA 5HRWA 5A5SA 3P1DA 4YBSA 5LUUA 4ZW1A 5F1HA 4YADA 4IR3A 4CL9A 5LKTA 5HJCA 4XYAA 5I80A 3ZYUA 3O36A 4XY8A 4WIVA 5E9KA 3K2JA 4YY4A 1N72A 3P1FA 4NR4A 5C85A 2F6NA 1ZKRA 5HRXA 3LJWA 4CUTA 3O34A 4HBYA 3O35A 4XUAA 4QSRA 4QY4A 5CUCA 3UVDA 4QSWA 3MULA 5L96A 3LQIA 4FLPA 5E7DA 4QSSA 5D7XA 5C7NA 5IBNA 5CRMA 5FE0A 5ENJA 4UYHA 5L99A 5FH7A 3ERRA 4CFLA 4N4FA 5ENCA 5KU3A 4QSUA 3AADA 4UITA 4YYHA 5ENGA 5EI4A 5DFDA 2YYNA 4HXPA 5JWMA 5IIDA 2MJVB 4UIVA 4LZ2A 2RI7A 5F25A 5ETDA 4A9FA 4AKIA 3MB3A 4O76A 5LKZA 4A9IA 5EQ1A 4YC9A 5LVQA 4A9MA 2RNYA 4NS5A 5E0RA 3MXFA 3U5OA 4CLBA 5E3GA 5FG5A 3DWYA 5ETBA 4CUQA 2L5EA 5EV9A 4BW4A 4F3IA 3U5LA 4LYIA 4TTEA 4QUUA 3QZSA 5E9IA 5BT4A 4PCIA 5ENHA 5CUGA 2YEMA 4QB3A 3VKHA 4QEVA 5II2A 5KTUA 3Q2EA 4YYGA 5LJ0A 5D3JA 3S91A 5EU1A 5DLZA 2LSPB
chains in the Genus database with same CATH topology
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