5FESA

Hyde from t. maritima in complex with (2r,4r)-mesetda
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
346
structure length
345
Chain Sequence
TGREILEKLERREFTREVLKEALSINDRGFNEALFKLADEIRRKYVGDEVHIRAIIEFSNVCRKNCLYCGLRRDNKNLKRYRMTPEEIVERARLAVQFGAKTIVLQSGEDPYMPDVISDIVKEIKKMGVAVTLSLGEWPREYYEKWKEAGADRYLLRHETANPVLHRKLRPDTSFENRLNCLLTLKELGYETGAGSMVGLPGQTIDDLVDDLLFLKEHDFDMVGIGPFIPHPDTPLANEKKGDFTLTLKMVALTRILLPDSNIPATTAMGTIVPGGREITLRCGANVIMPNWTPSPYRQLYQLYPGKISVFEKDTASIPSVMKMIELLGRKPGRDWGGRKRVFET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords [FeFe] hydrogenase maturase subunit HydE
publication title Carbon-sulfur bond-forming reaction catalysed by the radical SAM enzyme HydE.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 144
structure length 345
sequence length 346
ec nomenclature ec 1.8.-.-:
pdb deposition date 2015-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04055 Radical_SAM Radical SAM superfamily
A PF06968 BATS Biotin and Thiamin Synthesis associated domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5fesA00
3IRDA 3V1PA 4O13A 2HS6A 2NZLA 1BWLA 2Y7GA 3CM4A 1FCVA 3INPA 1RR2A 2C0AA 3MI3A 3TR2A 4R33A 4DXVA 1JJKA 1OYAA 4AEOA 3MBFA 1LOQA 3PAJA 1I4NA 4JIPA 4FNUA 3NPUA 3B06A 3FEMA 1P5BA 5E93A 3GAYA 1YDNA 4KWVA 1E51A 4I7UA 4X22A 1VCVA 3NPVA 4AB4A 3EXSA 2Y70A 4JN6A 1OYBA 1QWGA 2EHHA 4IJBA 5G5IA 1OFDA 2O7QA 3G8RA 4MLJA 5U7SA 3B0VC 1XM3A 3I7QA 2VEIA 5LNVA 1H7NA 1ZFJA 3RLVA 3NOEA 2NUWA 3I6RA 4HN4A 1JCNA 4UTWA 4QQ3A 3HQ1A 4UMBA 1NF7A 4UFMA 1QFEA 3BVJA 3DFSA 4ZQNA 3S0CA 4R7JA 1DKWA 3BPWA 4IXHA 5LHFA 1K7EA 3E0IA 1MXSA 3MP3A 5KITA 1AL8A 3UNDA 2ZZ2A 1ZENA 3LXAA 4JNMA 4M6PA 3EKLA 3VE7A 1OFPA 3QRHA 1LLWA 3E96A 3W7RA 2WQPA 3T7VA 3M43A 1B4KA 1GVRA 4NNCA 3M0ZA 1H1YA 3TNOA 1TQXA 1L6SA 5AFDA 5FF3A 3BK0A 2FB3A 3BG3A 2G95A 2WSRA 4GWEA 4JTHA 4TU1A 2B7PA 1SU5A 4AWSA 4OT7A 3PM6A 4MYAA 3MWAA 4CNOA 3L65A 8TIMA 1T99A 5LHEA 4NQ1A 4O19A 1JCMP 4RK8A 1SZGA 1TPWA 2NXHA 3TX9A 1D3HA 1M7OA 1XFBA 3HOJA 1I2OA 5IBXC 4FX7A 2WKJA 1YLVA 4DF1A 2YPIA 3EX6A 4IMCA 3TC7A 3GZ3A 3PBWA 2YW4A 4QITA 1LBLA 1VPXA 2EGZA 1SFJA 3W7QA 3PUDA 5CPMA 2CLKA 3O07A 4JTLA 1OX4A 3PBVA 1OK4A 4NJHA 3W7IA 3IV3A 5KSWA 1W5NA 3LRKA 1R47A 4N02A 4Y9AA 2TRSA 2NX9A 2HTMA 5H91A 3O1NA 1TPH1 2NXIA 5LNRA 1VCFA 4JTSA 4AVFA 1H7OA 4MOZA 4UTUA 4QNWA 3HB9A 4UTTA 1G4SA 3UWUA 3WK2A 1XDLA 2PC4A 3UZJA 2EPHA 3DU0A 1H62A 1ADOA 2NWSA 4HNVA 3G24A 5LKYA 2IQTA 2ISVA 3CWOX 2ZZ7A 3GXTA 2VFGA 3KHJA 5D32A 2C14A 3DFOA 3GYEA 3HGOA 3K30A 4K8EA 2DZVA 3W70A 5HMSA 1HG3A 2Y88A 3GDLA 3LI1A 4BR1A 2ZZ4A 1T96A 3LERA 2X30A 3RMJA 2ZYFA 2GOUA 1VH7A 3G1XA 4C1KA 3ZWSA 1TJPA 1TYGA 3TJLA 1ME7A 1V5XA 3NQ8A 3MYOA 4NNBA 4Z0SA 3MI2A 3O8AA 4QAIA 1W3TA 2V5LA 1K3UA 2DZTA 1KFEA 3SIZA 2E5BA 4QSHA 3B04A 1MEWA 3UY8A 2J9YA 2C18A 1VCGA 3A21A 3QF0A 4ZZ9A 5I3JA 3NQDA 1WQ5A 3QQ0A 5LGZA 1G7VA 2YYTA 4PH6A 4LRSA 1A5SA 3W7MA 4BI6A 1SZEA 1QOPA 3W6YA 1M7PA 2VFIA 3TJXA 4MY8A 2J6XA 4O1AA 1PL9A 1TMHA 3G1AA 1I2QA 2G5WA 2RFGA 3WK1A 1T0OA 2FPVA 1I2NA 3G0XA 2DZPA 5AOUA 4Y6GA 2R8WA 1H51A 3EX3A 3W1RA 3A5VA 2C15A 1C29A 1FX6A 1G4EA 5A5WA 1TREA 4IUOA 2BXVA 2GQ8A 5G2IA 2CLEA 2V8ZA 5C6MA 2X1SA 2DJXA 2Y61A 5EPDA 3HPXA 4O15A 3NZRA 1TQJA 1GVOA 1EP2A 3NZ1A 1RQBA 3NQEA 3W88A 3H53A 3UWWA 4MFEA 1N8FA 1FWWA 1JVNA 1TPC1 4GXMA 5HINA 6TIMA 3RNDA 4LW7A 1NEYA 2UV8G 6ALDA 4FNSA 1IXQA 4XZ9A 1TV7A 3W1NA 4Z1CA 3B0PA 3BARA 1WV2A 3LM7A 4O16A 3MBDA 4MPQA 3TW6A 2YGYA 1A53A 1LOSA 5CPOA 1QPNA 2VEKA 3QJAA 2GVGA 3TQKA 1WXJA 3FS2A 3VCRA 1ICPA 1DVJA 1L6YA 3N19B 1A5AA 3P82A 4EF8A 3M5YA 5K7JA 4MY1A 2W0UA 2VFDA 1W3NA 2ZZ6A 1AK5A 1JRBA 1YPIA 4A2SA 2PRHA 3THAA 4DELA 2ZZ5A 3NM1A 4OE7A 3S1UA 4QJ1A 4LV4A 1RPXA 4Z1BA 4K8HA 4O57A 3T4CA 2A2IA 4YMZA 4LY8A 1Q45A 1L2UA 1ZCOA 4NT0A 3WJXA 2A1YA 3ZR4A 5AHIA 3KVJA 3W73A 1KFBA 5U4NA 4BI7A 5G4WA 5KZMA 2BWGA 5CZJA 1ICQA 3OA3A 3QFEA 1FWSA 4JICA 1OG0A 2E6DA 5CZ0A 1QR7A 3W7OA 3P7YA 3T44A 4ICNA 3HG2A 2ZRWA 1DJQA 4JTTA 4XKYB 3U8GA 2Q3RA 1KW1A 4FNRA 5MHBA 1P0KA 3LLDA 1F73A 2V81A 2ZCGA 3W7DA 4O18A 4DF0A 1FY6A 3EB2A 3O63A 3B05A 1TB3A 2YW3A 2X2GA 4MLRA 1FDZA 3LBCA 3DI1A 3I7RA 1GTHA 3CC1A 1GVFA 3DFTA 4KFNA 5HUOA 4ML9A 3P8IA 1SSGA 3PR2A 5LSMA 1W5PA 2ZTKA 3NG3A 4FX8A 2TYSA 3AJXA 3W7CA 2O7SA 2YR1A 2NWRA 2E77A 1K8ZA 3OBKA 4Z1DA 3O16A 2FIQA 2BX7A 2ZTJA 3WJYA 1GOXA 4O4WA 3T78A 3STFA 3S6DA 4O14A 2XN0A 3IGXA 3UWYA 3T40A 2QCDB 2H90A 2Z2UA 3S42A 4ZMGA 3UZ5A 3O06A 1P4CA 4JDBA 1GQNA 4JY8A 3LCHA 3UWVA 3A5FA 5D30A 2WPBA 1IXNA 1X1ZA 4FNTA 4WUIA 1UUMA 4PEKA 1OHLA 4M6QA 2Z6IA 3UWQA 3USBA 1R2RA 3LTYA 2RKXA 2QUVA 1L6WA 2ZRVA 1W5MA 1NFBA 4S2CA 4HIBA 3A24A 4K37A 3O6DA 4M19A 1XL9A 3BGJA 5E1QA 3GR7A 1D3GA 4UTHA 3PULA 1VRDA 1YADA 1XBZA 4Y90A 2AAMA 3GDKA 2W79A 3LCWA 3W87A 3TQ0A 2H3DA 3B0UX 1TTPA 4JTKA 4O54A 1NF0A 1ZNNA 3WJZA 2H8ZA 4PCFA 2QCNA 4M7TA 1RQEA 3GAKA 4S2BA 1TRDA 1HO1A 5FEPA 4N9EA 2B4GA 4K39A 3TAKA 2J88A 2V0TA 5E0KA 3NPXA 1XBXA 3GK0A 1LYXA 2Z1BA 4FIQA 1SUXA 5L6UA 1RD5A 5CKSA 1B4EA 4JYDA 1Q3NA 3U2OA 5HR7A 1KFJA 3OVQA 1X1OA 3S8HA 3M16A 3LGEA 4RXGA 1EEPA 4A29A 4LVAA 3QW3A 4DF2A 1N7KA 2VFFA 3E9AA 3PF3A 2P0OA 3HGJA 4HPXA 4QNEA 4XQ6A 4FEZA 2LLEA 1QDSA 1JRCA 2GQAA 4H6KA 5F1UA 4RKAA 1ZAHA 1VZWA 2DZXA 1EUAA 4K7YA 3W2LA 2FB2A 1P0NA 1HUVA 2R94A 3BV4A 2JGQA 3TSMA 1O95A 1PIIA 3KVKA 4FXSA 2CLMA 5GVJA 1S3HA 5HJLA 2FFCA 1DL3A 3GDRA 2V2DA 4LS1A 1WOAA 3ATYA 4MZ1A 1O60A 2FDSA 3W1AA 1XUZA 4UMAA 4E2BA 5K4ZA 3NL3A 3KAOA 1JQVA 5EY5A 1B3OA 3W7LA 1NSJA 4YXGA 4QIUA 1QO2A 1GTEA 1I2RA 2A7PA 2QUTA 3UD6A 4BF9A 1EPXA 3DH7A 3NEVA 2C13A 3TSBA 5AC7A 2JKEA 4FO4A 4YLWA 4N2YA 1W8SA 4DBEA 4DO4A 4BWLA 1G67A 1OF8A 2OMAA 3TE9A 4O50A 5IM51 4DPQA 2X1UA 3P80A 4O17A 4K6AA 5EKYA 3QMTA 1OJXA 4O11A 3SZ8A 1R46A 2WV8A 2J9XA 2TPSA 3W74A 1NAL1 3QW4B 1MZHA 1F6PA 1V7YA 2C6QA 3HG4A 2QKFA 4A21A 3DFQA 1S5VA 3RK8A 4RJEA 2QJIA 1OFQA 4NJIA 5TQLA 1EB3A 4HT3A 1GWJA 2FJKA 2YCEA 4JX5A 4MZ8A 1SW7A 2QF7A 3Q58A 4Q33A 3UWZA 4CNNA 2Y7EA 2VEPA 3LRLA 5I3HA 3QM3A 2E5DA 3RU6A 3TUUA 5AHNA 1FCBA 4IWWA 2P10A 3W1QA 3W1PA 2VFEA 2HS8A 1SFLA 4AF0B 2NX3A 2B7OA 3KX6A 1OABA 2QJHA 5D37A 1O5KA 2JK2A 2E5CA 1KBJA 2ZZ1A 5D2YA 1RV8A 5CPNA 5AHLA 1ZJIA 2DZSA 1VQTA 1QAPA 3RFAA 3S1XA 2BTMA 1GG1A 4UFKA 1ML1A 2A21A 3IVTA 3P61A 1KTBA 3MP5A 5G4EA 1IXPA 1TIMA 2H8XA 2ZDRA 3PUOA 1H7PA 1FWNA 3MHGA 3MW7A 3IVSA 1EA0A 1KM3A 3BG9A 5DXYA 4A2RA 1KFCA 4WOZA 3CEUA 4UTIA 2QAFA 3C0JA 3CPRA 3QMSA 1G4TA 4P2VA 3NO5A 1PCWA 1WA3A 2YDAA 4FIRA 5K2ZA 1VGAA 4OV4A 2I14A 3L5AA 2VC6A 3QZEA 3GKFA 3M5VA 1KM6A 4IMFA 3NXFA 3TW7A 4UR7A 4POCA 2VENA 4K36A 4O1DA 1YXYA 1B9BA 3LRMA 2QCHA 3VI2A 4LVDA 1VJIA 2GVJA 4WQ6A 5DELA 5FEZA 4C1LA 3E12A 1Q6LA 2XFWA 5TIMA 3M6YA 4MJMA 5F2IA 3LDVA 2QCCA 3TMQA 3IVUA 4UFLA 5FESA 1BKSA 3O6CA 1KTNA 4WXYA 3DGRA 4MFDA 3HG3A 4KKXA 3LCFA 3LX9A 5AHFA 2XN2A 3S1VA 2CZ5A 4O0ZA 3EWWA 4I7WA 4XWUA 3TDFA 4JIQA 4UFIA 1W31A 3IIZA 3HPSA 4O53A 1YTDA 1YXCA 3BG5A 5C5YA 5AHMA 1SPQA 3CHVA 3VKJA 1JR1A 4JD4A 2DJLA 1KTCA 1SO5A 3W2KA 1JCXA 4LT9A 3ABQA 3W85A 5AHEA 3Q2DA 3S5NA 5CGQA 1F5ZA 4UUIA 3MHFA 3LHUA 4O8RA 3WFAA 2PURA 4S1FA 4NXSA 3GXNA 3P62A 3C56A 3HF3A 1K8XA 2Q8ZA 2TSYA 2VOMA 4E38A 1RZMA 1J4EA 5D2TA 4O28A 2X16A 3FOKA 5AC6A 3FA5A 1G4PA 4UFJA 1XCFA 5F2GA 4OWGA 2YSWA 3L2IA 5FF7A 1XDMA 1SW3A 3EKZA 3LB0A 1L9WA 4JTUA 1TO3A 2J9ZA 4UXDA 2YXGA 3W2NA 4RXFA 1EP3A 2GUUA 3NDOA 1UCWA 3DAQA 1FWTA 1R2SA 2RDTA 4IOTA 4JYFA 3TROA 1VC4A 3PWAA 2OT0A 3FJ6A 1J2WA 3LCIA 2ALDA 4GUGA 3IIVA 5G2WA 2QEZA 1H61A 2C3ZA 1TCDA 4GUHA 2VEMA 5DXXA 3QC3A 3W7EA 5AC8A 4RZ6A 4EVZA 1TTJA 2H6RA 2ATMA 1GG0A 3OG3A 5HQEA 4RLIA 1AW1A 7TIMA 3BGGA 3WJSA 1TV8A 5LNUA 4B5NA 5FEWA 1CI1A 3UY7A 1KFLA 1PV8A 3W1MA 3TFXA 2C16A 3QH2A 5F4XA 3ZWTA 3P67A 3MMTA 2A4AA 4NJGA 3MUXA 5BMWA 2E6FA 1AL7A 3G0SA 3VE9A 2CWNA 3TV8A 1CX9A 1BEUA 1F7BA 3N3MA 1A50A 5CSRA 5HWNA 3LCGA 2R91A 2DZUA 4UTMA 1QOQA 2CLLA 3QYQA 3LHWA 3R13A 3CWNA 3IIXA 3ABOA 1QPQA 5DLCA 4MY9A 3N14A 5J5DA 1I2PA 1YDVA 5HNRA 2A7RA 4NZFA 3TA6A 3M9YA 5FF4A 3NQAA 3UYCA 2Y6ZA 2EKCA 4HHPA 2WSYA 2NLIA 2FPTA 3FIGA 4KWWA 3Q37A 1W0MA 2OT1A 1F76A 2ZQ0A 3L68A 4FXRA 5D04C 4EF9A 5C55A 5I3IA 4AWUA 1MEHA 5BRBA 1H5YA 2WO5A 4JTJA 4TR9A 4IXXA 5AYYA 3UXDA 2A85A 2Y63A 2QCDA 4Z1AA 5F4WA 1YDOA 3TAOA 2VELA 1Q6OA 3KXQA 1QCWA 2ZA3A 2CZDA 1GZGA 1LLZA 3NM3A 4LRTA 2VFHA 3TQVA 1BWKA 4AHOA 4NU7A 2E1DA 3LCXA 3CIWA 4GE8A 5D33A 1YYAA 1HFBA 2YFNA 3HJZA 5BW6A 4CCEA 3HPZA 3PB0A 4RX0A 3R12A 4TMBA 1LTDA 4Y96A 2BZNA 4JEQA 4FX6M 1U5JA 2Y89A 3LLFA 4N4PA 3NQCA 3OHIA 3G18A 2JGYA 2YX0A 4LS2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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