5FF7A

Tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from streptococcus pyogenes in complex with dhap and g3p
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
ITLTENKRKSMEKLSVDGVISALAFDQRGALKRMMAQHQTKEPTVEQIEELKSLVSEELTPFASSILLDPEYGLPASRVRSEEAGLLLAYEKTGYDATTTSRLPDCLDVWSAKRIKEAGAEAVKFLLYYDIDGDQDVNEQKKAYIERIGSECRAEDIPFYLEILTYDEKIADNASPEFAKVKAHKVNEAMKVFSKERFGVDVLKVEVPVNMKFVEGFADGEVLFTKEEAAQAFRDQEASTDLPYIYLSAGVSAKLFQDTLVFAAESGAKFNGVLCGRATWAGSVKVYIEEGPQAAREWLRTEGFKNIDELNKVLDKTASPWTEKM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2
publication title NON-STEREOSPECIFIC SUBSTRATE CLEAVAGE BY TAGATOSE-BISPHOSPHATE CLASS I ALDOLASE
rcsb
source organism Streptococcus pyogenes serotype m1
total genus 128
structure length 325
sequence length 325
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2015-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5ff7A00
1DORA 3TK7A 3DFSA 3GDMA 4O12A 5LNUA 4UR7A 4ADTA 1YYAA 1OX4A 3C56A 4RZ5A 2QCFA 3W07A 5L9FA 3NPUA 1C29A 3SJ3A 2Y70A 3LCLA 1GG1A 3I7SA 5TBOA 1F73A 6ALDA 1GZGA 3N19B 5HJLA 3M16A 3LCXA 3PUDA 4JTSA 2CW6A 4UTMA 3GK0A 4M6VA 4PL2A 2ZZ4A 3EX4A 1QCWA 2CLKA 1Q6QA 3GNDA 5AYZA 1SO4A 4BR1A 1ZFJA 2HSAA 4JS3A 4O18A 3H54A 1FUYA 3W83A 2QDGA 1TO3A 3S1WA 3MYOA 5FF2A 1GOXA 1PIIA 2VEKA 3TC6A 3NZRA 5D02A 1ZALA 3LLDA 1H50A 4Z08A 1FX6A 4UUIA 5AN7A 4AHQA 1IXQA 4R7JA 4MYAA 3GAYA 1P4CA 2E1DA 3KRUA 3HG4A 4ZQMA 4WY0A 1JCJA 4K37A 3L5LA 3W2NA 3AO0A 5LGXA 1JULA 2Y85A 5HQEA 2E77A 3DZ1A 2B0MA 1TJPA 3TSDA 2Y7FA 5EYWA 3ZFHA 1GT8A 4JX5A 3LTSA 5D30A 2WOQA 5LHEA 3STEA 5D38A 1T96A 4JX6A 3SECA 2B4GA 3T55A 2I9EA 1LROA 1XUUA 1JCYA 3W2LA 1G7UA 4UTHA 4X9SA 3UZJA 1W3TA 2TYSA 3GB6A 4S2CA 4MOZA 5K7JA 4RZ4A 3TKFA 5C6MA 4OT7A 1GVSA 3NL2A 2Y89A 2D73A 2DORA 3KFTA 4RX0A 2ZQ0A 3BV4A 4XWUA 5F2MA 4E38A 3PSWA 5CZSA 2DZXA 3EXSA 4JTFA 5IBXA 3W72A 3DFNA 5HWNA 3L9CA 3CEUA 1TPUA 2J27A 4RCXA 2IQTA 1A5BA 2EAWA 3FKRA 2DP3A 3EWBX 4LW7A 4DQWA 4UTKA 2JKAA 3BGJA 4H4IA 1FWTA 4MY1A 4N4PA 3A24A 4H6KA 2C1HA 2NLIA 1TV5A 4U4MA 1TQXA 5G4EA 4O28A 2FJKA 4PCFA 1G4SA 5F2LA 1WQ5A 3GXPA 5G2HA 4O14A 4YMZA 1IGSA 2VEIA 4K8HA 2UV8G 3HMJG 2XN1A 3ATYA 2G5WA 1XI3A 2G96A 2WPBA 2R8WA 3FIGA 2QDHA 1WBHA 3TIMA 1SZNA 4UXDA 1KFKA 1ICPA 3CU2A 4IUOA 3T78A 1LYXA 1FDJA 3MP4A 4UCGA 3BW4A 5CPMA 1TMHA 4L4LA 3EB2A 3MYPA 3BW3A 4K7VA 4O13A 1IXOA 4K7YA 3N14A 3T40A 3NL6A 4UMBA 1S5VA 1OFQA 3DI0A 1DQXA 1YXYA 3ZS4A 4IX2A 1D9EA 1DL3A 1A53A 4GE8A 2A21A 1F5ZA 4UFHA 1FXQA 2QAFA 4O50A 5LNSA 3L5MA 2Q3OA 3LHUA 4FNUA 2QKFA 4X22A 5E1QA 2Y62A 2O7QA 3TQVA 2FTPA 4JIQA 3THQA 4MPQA 5AOUA 2V82A 4DPQA 1Q6RA 1Z41A 3O6YX 1OJXA 4OU1A 4QM1A 1YXDA 1OFAA 3KX6A 2NUYA 4UTIA 4O10A 2ZBTA 3A5VA 4EIVA 4JGDA 3UPWA 3WJXA 1EWDA 4IQLA 1ZAIA 3QQ0A 3RLVA 3DFPA 5D2TA 1G4EA 3DXIA 2NUWA 1H51A 5FF7A 4NNAA 4GFSA 2PRMA 5HR7A 2DZSA 4FNTA 3BPWA 3NQFA 4ZQOA 2YR1A 2QCNA 1TTPA 4JX4A 1T8XA 1K7FA 1OFRA 3FS2A 2WSRA 4A29A 1S5WA 2X1TA 1JRBA 3ABQA 2C14A 4MZ1A 2V5BA 4YL2A 2FPYA 1R30A 5H2ZA 4NJIA 4N6FA 2C13A 2YW4A 1JUEA 2Z6JA 1TJRA 3LXCA 4FX6M 4O0ZA 3E49A 5U7SA 4DPPA 1MXSA 1XBXA 3WJYA 4E0CA 2YCEA 2W6RA 1MEIA 2JK2A 3TFXA 5BMWA 1SFJA 3W7EA 4HNTA 1T99A 1W56A 1R2RA 2Y7EA 1YDNA 3HG2A 1XC4A 1WX0A 3UWWA 1WAUA 3FYPA 4KWVA 1GTHA 1A5AA 3CB8A 2GQAA 2V2HA 3MP5A 2RDUA 4IMCA 2FB2A 3W3OA 4N02A 4JTLA 4JY9A 3RK8A 4O1BA 1H7WA 3LV6A 4IMGA 3M7WA 4FNPA 2PRLA 1DJNA 3C0JA 3QPYA 1LM1A 4OV4A 3TXVA 3LHZA 2X1UA 4GRSA 3RLUA 2Y88A 4IX0A 4LUIA 1QO5A 3LB0A 5HWJA 2AQWA 1OF8A 2VFFA 1S3HA 1F74A 2YFOA 3CWOX 1YTKA 3EWXA 3SR7A 3R13A 1AMKA 1XCFA 3VE7A 2ZA3A 3B06A 1GTEA 2VKZG 1G4PA 3UY8A 3USBA 3GXNA 3EX6A 4JTEA 1KLZA 5D05A 2YW3A 4UFIA 1HUVA 2WNNA 5FEWA 3C3NA 3IGSA 1W5NA 4MFDA 3OBKA 5J5RA 4ORMA 1KFCA 4K38A 1W3NA 3S5NA 3B0UX 5C5YA 5BMXA 1OF6A 2QJHA 2EF9A 3V1PA 3INPA 4UTWC 4N9DA 5D2YA 3G0SA 1H7OA 4JTHA 4TX9A 4UTTA 3HG5A 4GNJA 5D32A 1SQ7A 4JDBA 3LRLA 1ZAHA 4FXSA 2V9DA 3TU9A 1KM2A 2ZZ3A 5FF3A 1V7YA 5CZTA 3TX9A 4OE7A 3WJZA 3E12A 3GDRA 3LI0A 4FO4A 5CSRA 1W54A 3SY5A 1FCQA 2QR6A 1VZWA 5K4XA 4KKXA 5DCBA 1KFLA 3GX9A 1KM1A 3C2EA 1X1OA 1LRNA 1EP2A 2X2GA 1LP6A 2ZZ5A 4H3DA 1NAL1 3M6YA 3QQ1A 4RKAA 1JQVA 3EWYA 4FNRA 1H7XA 3GKFA 1IXNA 1TIMA 4PC8A 4XBSA 4K8EA 4PODA 4XKYB 3R8RA 1OABA 2NXHA 3LRMA 2NWRA 3PAJA 2Z0IA 2FDSA 4YCOA 1JUBA 3KAOA 1F2JA 3W71A 4N4QA 2CZEA 5LZLA 3UPBA 2QCEA 3W87A 3QSRA 3O15A 2ZZ1A 1Z48A 2G95A 3EWZA 3SGZA 3IIVA 4ML9A 1I2PA 1NEYA 3KXQA 3L68A 3U2OA 2PCQA 3IGXA 1DOSA 4WQ6A 3WJSA 3PUEA 1ZJIA 3HO8A 1SZEA 2X16A 2VEMA 5G2WA 1P0NA 4W9TA 3I6RA 2VFIA 3BVJA 3W7MA 3W1TA 2WKJA 1TCDA 1VR6A 3G3DA 3GAKA 1GVQA 5BOOA 3LERA 2YSWA 3NQGA 3O8AA 1LOSA 1QPOA 4JTGA 3CIXA 1ME8A 4OBTA 5L6UA 3NPWA 1XL9A 4LOCA 1O5XA 5AC6A 1C8VA 2NXIA 3PF3A 7TIMA 3G1VA 4AWTA 4HNNA 5ABTA 3W7DA 4NNCA 4NZJA 2ZZ7A 4LVAA 3H55A 2GVJA 3NM1A 2BZNA 1H62A 2QF7A 2QEZA 1VYPX 5DY3A 2ZCGA 4O53A 2E6YA 4WXYA 3NYZA 5I3KA 5J5DA 1TPDA 1KV5A 1QO2A 1QR7A 4NJHA 1QAPA 4O0KA 1W5PA 1HFBA 4FNSA 1SSGA 2C19A 3N73A 2B7OA 4GWEA 4JXCA 4NJKA 4NUWA 3MI6A 3HIJA 3LHYA 1RPXA 4N9CA 1G67A 5EKYA 4DXVA 3CQ0A 1IIGA 1VCGA 1E51A 3P74A 2H8ZA 4QJ1A 1TV7A 3W2KA 1SFLA 3QMTA 2H3BA 4KWWA 2QCGA 3HPSA 1MZHA 4CCCA 1GWJA 3LCIA 3TAOA 3M1ZA 4LTSA 1QDSA 1CW2A 3P81A 1H1ZA 4KFPA 4M6PA 3SGUA 2ZZ6A 1Q45A 1U83A 4P61A 2OT1A 3N3MA 4Y96A 3TQ0A 5AYYA 1VQTA 1BWLA 3PB2A 2ABAA 2PE4A 3P82A 3F4NA 2R91A 4GJ1A 2NX1A 4GXMA 2A4AA 2Q8ZA 4POCA 1XBZA 3NPVA 1RD5A 4LUJA 4JY8A 3DI1A 4O8RA 1OFBA 3W9ZA 3IVTA 3KOFA 1AW5A 3IIZA 3M44A 4LC8A 3PG8A 3CLMA 2FB3A 2ZRXA 3NQ6A 1K7EA 1F6KA 1SR9A 1XUZA 3UNDA 3WK0A 4N6EA 1KFBA 3GDTA 3GIYA 3G3MA 1W1ZA 4WY0F 5CPNA 5AYXA 5DCDA 1F76A 1G7VA 1THFD 2YZRA 3L21A 2X1RA 3IIXA 1OHLA 5GVJA 3L0GA 4IGHA 4IXHA 4O4VA 2A7RA 4JTIA 1Q3NA 4XTIA 1J4EA 2GQ9A 2H6RA 4PEKA 2ZRZA 1FXPA 3SSJA 4ZQRA 2BLEA 3PULA 5K3VA 3VFLA 2NWSA 1R47A 4NX5A 1OYCA 1ML1A 4QQ3A 5DELA 3G24A 3ABSA 1Q6OA 2J9ZA 5BNKA 3S0CA 2Q8LA 5KINA 3LXBA 3PG9A 3VCRA 1LBMA 2E68A 3WK2A 4O52A 2VXNA 4YWIA 2R94A 1L2UA 3CIWA 1V5XA 1VYSX 3DHDA 3TA6A 2CWNA 5HR6A 1FCVA 1QWGA 1I2NA 2NX9A 3M5VA 1QNVA 3KVLA 1YTEA 2B7PA 4NVTA 3TDFA 1EX5A 1EUNA 4BI5A 3B0VC 5FI8A 3W7OA 3SFKA 5T26A 4LU0A 2YGYA 3A9IA 2ZA1A 3BG3A 2CZFA 4Z1BA 3GDKA 1H63A 4EF8A 1VH7A 4OHQA 3DFOA 2P0OA 2CFFA 1LBFA 4DBEA 5U4NA 4KFNA 1YTDA 3BLEA 1PCKA 3TC7A 2NX3A 3NNTA 1VLWA 1WDWA 2E6AA 2J9XA 2BSLA 3W70A 3HF3A 3SI9A 4RLIA 1K3UA 4YXGA 2CLLA 3ABOA 4ADUA 2A6NA 2H3DA 5AHFA 1C9DA 1JQXA 3W1NA 2ZTJA 1TTQA 1H5YA 2QCCA 3U6WA 3PBVA 1GJPA 4M7TA 1LBLA 3W1QA 3W88A 3C2OA 1GVRA 1HG3A 3W7PA 2HMCA 4NZFA 4PFMA 2GJLA 2F84A 4NT0A 1ZCOA 3LTYA 2TMDA 4WD0A 1G6CA 1TRIA 3KHJA 3MHGA 2Q3RA 3LCFA 3LCHA 1W8SA 5AFDA 5AB3A 3BO9A 3GVGA 4WXZA 1VS1A 1EWEA 4OGZA 4DO6A 3WJWA 2JGQA 5CZJA 1SUXA 3VE9A 3W1PA 3W86A 2RDWA 5DLCA 4TMCA 3N9SA 2V8ZA 4S2BA 1FDYA 3BG9A 4TMBA 5I3JA 2I1OA 3RU6A 4GBUA 3W85A 2RFGA 5EA9A 3GR8A 4IMEA 3SZ8A 3NQAA 2GJNA 1KM3A 4CCDA 3KVJA 3NL5A 4LRTA 4A21A 3M5ZA 2QCLA 4JEQA 3A22A 4K6AA 5EPDA 4ZMGA 1XKYA 4UIOA 1UUOA 1VHNA 5CGQA 5BW6A 2BTMA 2OT0A 3ZR4A 1BEUA 4JTUA 3QJAA 1UBSA 1N7KA 4BWLC 3W1LA 1O60A 1PHQA 1TREA 2DZTA 1PVNA 3BK0A 4Z0JA 3GNNA 1KLYA 3P80A 3LV5A 2DZPA 2GOUA 2YDAA 4UNKA 5CKSA 5C2XA 5H91A 3GDLA 1Z42A 4ZVJA 1R46A 5EY5A 1SW0A 2BXVA 1D3HA 1OYBA 1CI1A 2VC6A 2A5HA 3BW2A 4QISA 4JR5A 1NFBA 1L6YA 5D2WA 1KTBA 2WNQA 3W7LA 4LS0A 4MJZA 4UFLA 1W3IA 1BWKA 3RNDA 1EUAA 1ADOA 1ALDA 4XKYA 4NXSA 1BKSA 4QITA 5AHLA 4ADSA 3QMRA 5KTLA 3MWAA 2R14A 1UUMA 4X3ZA 2ZRYA 2DZWA 1R2SA 3CPRA 5E0KA 5AC7A 5F4WA 1Z44A 3PB0A 3NQCA 4A2RA 3IIPA 3W7KA 1TPEA 4R34A 1H7PA 3MO7A 1DBTA 4FXRA 3EKZA 4LV9A 2QAPA 4EWND 1FDZA 3WK3A 3TJLA 3ANYA 3M5XA 3S1UA 2C18A 3B8DA 4RJEA 4JIPA 4UTLA 4Q32A 3DENA 4WX2A 3R89A 4I7UA 3G8EA 2VFDA 1O4UA 1W37A 3FLUA 4TIMA 4UR8A 4FF7A 5HMSA 1P1XA 2Z1BA 5LNVA 3G1XA 4EOUA 1KTNA 4AWUA 1W5MA 1WOAA 3UD6A 2ZDRA 5C55A 1LCOA 3STCA 3ZWTA 3G0XA 1TPC1 3NO5A 4N9BA 3LCWA 5AHMA 1PCWA 4MKNA 3L0KA 3W7JA 3W7HA 1K03A 5IBXC 4AF0A 5D2VA 3KRSA 3E9AA 1JR1A 1F05A 1XXXA 3A23A 3OIXA 2J88A 3W1XA 2YYUA 4CNOA 1NSJA 4RR4A 1UASA 3LTPA 4BI7A 2WSYA 4FB7A 1MO0A 2ISVA 2CZDA 3HG3A 4HNUA 5DBTA 1ZAJA 2EKCA 4GUFA 3O07A 1TPWA 1S5TA 3S9YA 1GVOA 3QMSA 1HL2A 4BF9A 5LNRA 1FWNA 1AW1A 2GPTA 4XBKA 3O06A 3M43A 3F4WA 2ISSA 2J9YA 5FEXA 3W23A 1RVGA 3QC3A 4E2BA 3W7IA 4IJBA 1R2TA 3CC1A 2QCMA 1PL9A 2NXGA 3LLFA 3NEVA 5F4SA 4DO4A 3QRHA 5DN1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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