5FL0A

Structure of a hydrolase with an inhibitor
Total Genus 241
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
241
sequence length
712
structure length
668
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKQSSKKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMISKNLPLQVKANRVLISPANEVEIELDAIYPGENIQINLEISTDGKEWKTVDLLSAGLQKAPVKFVRFQFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
publication title Analysis of transition state mimicry by tight binding aminothiazoline inhibitors provides insight into catalysis by humanO-GlcNAcase.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
total genus 241
structure length 668
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2015-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 5fl0A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fl0A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 5fl0A01
1V08A 4M82A 5ABHA 4UFKA 3TTYA 3K8KA 1ODZA 1MQRA 2BY2A 2X0HA 3F5LA 1UR4A 3J7HA 3VGFA 2JF6A 1JFHA 1KXTA 1HL8A 1KFWA 2BFGA 5JIPA 2GDUA 2XSAA 4JFSA 3ARSA 1GNXA 1V3KA 4X9YA 4M24A 3CIVA 2QV4A 4JKMA 4U5IA 5BROA 3ZT7A 1ITCA 3AHYA 4MAZA 1HJWA 1GPFA 1UA7A 2WZHA 5FOOA 3CPUA 4CD4A 2W62A 4KRTA 4HPGA 3WD0A 1HX0A 3WDQA 4ZENA 1ZBCA 4CVUA 3CGTA 2O9RA 1MVYA 3T09A 4CN1A 1HKJA 5HNNA 2JFEX 2VVSA 4FLOA 3N1AA 3S6TA 2NT0A 2CKRA 2EXOA 3VD7A 5CLWA 1E9LA 3N11A 4PN2A 1E4LA 2X05A 4M81A 3UEQA 3SUVA 3IK2A 3N15A 3BMVA 4U31A 4QCEA 2E3ZA 3WH5A 1H09A 5I2UA 3BAXA 1QI0A 3QOMA 1NP0A 4JHOA 1BYDA 1CDGA 4E4PA 5A94A 2E40A 2E8ZA 1SFSA 3ZMRA 2GK1A 1QW9A 4DWSC 3WQ5A 1VIWA 1W9VA 2VCBA 4J3SA 4B9ZA 1PX8A 4WSJA 1CZ1A 2IUZA 5DFAA 3AZRA 1UR2A 1XD1A 2J78A 2VC9A 3K8LA 5A6MA 4XUYA 1W9XA 6TAAA 1WKYA 5E70A 1I75A 1G5AA 2A3BA 4B3LA 3ZOAA 3L4XA 4CD8A 1BG4A 1L8NA 2ZOXA 5FL0A 4GZJA 6CGTA 3PZTA 3WEMA 4MDPA 2WB5A 1XCXA 1BYBA 1OT2A 1CIUA 4DUWA 2PWDA 5A8OA 4UFIA 2XHYA 1MW0A 1WCGA 2FHCA 2V3DA 1J01A 3SCPA 2XWEA 4W8AA 2ZXBA 2GVYA 2PI6A 4PMUA 2DT3A 3F5JA 2CETA 1H0GA 1OD8A 4ATDA 1CLVA 2WNWA 3TTQA 2NSXA 1E6SM 4AZCA 4CN4A 1XSIA 3UG5A 1E71M 1B30A 5A6AA 4J3TA 2J7GA 1TG7A 4CN6A 3HU7A 4E8DA 4EKJA 3AZSA 4TTUA 4UNIA 3ALFA 1KGXA 3CUIA 3AMCA 1OSEA 4AD4A 4QFUA 2WVUA 4ZXOA 4H8UA 3ARQA 1GOQA 3KEHA 4L4OA 4D6CA 1P6WA 2WLZA 1BFNA 3KL0A 1CEOA 1JXJA 3OLGA 1C8YA 1XH0A 2GUYA 4MNKA 4X0NA 2PC8A 4CCDA 2Z1KA 3U57A 3UERA 3ZJ8A 2NW0A 1HNYA 3ZSTA 1QNSA 5E0CA 2WHLA 1M01A 4OKDA 3MSGA 3RJXA 1Z32X 3QHOA 2YLAA 5DO8A 2VT0A 3WMCA 3GNRA 1BGGA 4D6HA 2J8GA 1JZ8A 3AXIA 1E6NA 3PZIA 4AIEA 1BF2A 1V3HA 3F5KA 3SCNA 2CPUA 1XD0A 1HJVA 4X0VA 3GXDA 1VBUA 4LYPA 4PUEA 3NDYA 1JD7A 1BG9A 1JAEA 1VFFA 2WKLA 1WDSA 4HA3A 3WNOA 4N42A 2WSKA 4D6JA 3GTNA 1HN1A 1KCKA 1V0KA 1V6XA 2AAAA 5GNZA 4CUCA 4TUFA 3W6LA 4CD7A 3WIJA 1ZL1A 2XFRA 4P8UA 2C8NA 4S3JA 3TONA 3VILA 3WQVA 3AZTA 4U2YA 3ZJKA 3T0DA 7TAAA 3VO0A 1JDCA 3L4ZA 2V3FA 3WH6A 1V0MA 3WSUA 3WDRA 3ARRA 2VR5A 4DUXA 1B1YA 4AZ7A 3WF4A 1K6AA 1WDQA 1AMYA 5A1AA 3AI0A 1JZ7A 1KBBA 3KL5A 5GPRA 4CVWA 1SMDA 3WF2A 3OGSA 2DSZA 3BC9A 2G3MA 2WC3A 1PIFA 4Z2JA 3CLWA 3IJ7A 1X6LA 1L0PA 2D3LA 1UR8A 1ISWA 1U30A 3OLIA 3FAXA 1MXGA 3WBAA 4P7OA 1UYQA 2WMFA 2BVDA 2DT1A 4D1IA 5A95A 1HKKA 4WKHA 4LPCA 3MUAA 1TFVA 3AJ7A 3BSHA 1PEZA 4CU7A 3BXWA 3WEZA 4ATWA 5CJ5A 1GQLA 3KE0A 3GZAA 1ISXA 2WMGA 5A6SA 1XYFA 2JIEA 4PTVA 2WMIA 3EMCA 1JXKA 2EPOA 3I3EA 1E70M 3ARWA 4JHZA 1SYTA 3N17A 3VDAA 1NH6A 3VMOA 5A6JA 1W3HA 2QLYA 3VUPA 5BXSA 4CU8A 1JYWA 2ZX5A 4GZIA 2IXUA 1FH8A 1JZ4A 1GJUA 2VX5A 2GJRA 3AIRA 3AIVA 3AOFA 3OLEA 3VM5A 5EBAA 2QHAA 3TP4A 3ZJ6A 5ABFA 4FMVA 2E9MA 5GNYA 4CD5A 3VPLA 4C7DA 1H2JA 4QCFA 1W9DM 1GOOA 4XZBA 4U2ZA 4W7UA 1R86A 3VD4A 1ISVA 3RM8A 3ZT6A 1LL4A 2O92A 4JFTA 3ARPA 4AW7A 1G0CA 1OM0A 3A47A 3WMSA 2VZUA 3WQ6A 3WNMA 2VVNA 4BQ5A 5CZKA 2W61A 3ZR5A 2BVYA 3VX0A 4ZE4A 3WNPA 1OB0A 1CECA 1EOMA 1G01A 2CKSA 4JCMA 1W9PA 4ACZA 3F4VA 5M03A 3RIKA 5HXMA 3PZNA 1W1PA 1XH2A 2HVMA 3WMBA 4TVUA 3DECA 4CKQA 3AS0A 3MMDA 1W3JA 1KCLA 5BXRA 3B9DA 1GQIA 1CGWA 4D1JA 2J8FA 3UR7A 4P7RA 2VNCA 1VENA 1JIBA 2VQUA 3CZEA 2E8YA 1ZJAA 3ZIZA 5M3WA 5E9AA 2JALA 4EK7A 1EGZA 2G3JA 4B3KA 4WJXA 2F61A 1LLOA 3ECQA 4W84A 2UY3A 4W88A 2XVNA 6A3HA 4LXFA 1E40A 4PSPA 4GPNA 2DQXA 1GUVA 3WL0A 1XH1A 2WMHA 3HMCA 4MNMA 1FP9A 2CIPA 2DT0A 5IHSA 5A8MA 1A47A 3WH8A 2QPSA 3VOCA 2YDQA 3NSMA 4D6GA 1UOKA 2BY1A 3TTSA 4TX6A 4NI3A 1J0HA 4GXPA 3WELA 4M56A 5EFFA 1E15A 3AMLA 1FHLA 5A6LA 3L2MA 3AIBA 4BZYA 4RE4A 2B31A 1W9BM 4UR9A 1E4NA 2W67A 5CPQA 1GVYA 1CGXA 2WW5A 2YJQA 4TTGA 3W81A 3AXHA 1QOXA 1JZ3A 1G94A 4JL1A 2W63A 3PZUA 4UZSA 4M8UA 2GDVA 3BAKA 1E6PA 3RJYA 2DPEA 1GOKA 3NCOA 3AIUA 4H41A 1JL8A 4TX8A 1BAGA 2IXVA 2WAGA 3B9AA 3SUTA 3WENA 4OBSA 1MFVA 3II1A 1H1NA 3VIJA 2WSPA 4OOUA 2XM2A 1WO2A 2CHOA 2PWEA 1UD4A 1O7AA 4W89A 2OYLA 1TA3B 5HPOA 3L4UA 1JAKA 1R87A 1DHKA 2J74A 2PWFA 5A69A 3GNPA 3ZT5A 1ZS2A 3DYMA 3GXMA 4AZGA 1J0IA 2ZE0A 1BHGA 4ML4A 1O6IA 2HISA 5A6BD 2Y8VA 3VDHA 2EPKX 1OGSA 5AC5A 2EQDA 2FH8A 1CXKA 3CZGA 3PZVA 1OGBA 2YBTA 2D20A 1X6NA 3UCQA 5I5RA 4Q7NA 4PTMA 4AIOA 1BQCA 2WWCA 3M7SA 2ZXQA 5DT7A 1XSJA 4W87A 3CHFA 3W27A 4UFLA 5I23A 1NM9A 1OIMA 3PN8A 2XJ7A 1KR1A 1JF6A 4C90A 2CESA 2DT2A 2ZWZA 4FLSA 1BVZA 1UKQA 4BA0A 2JIWA 3WD2A 1B3VA 1FHDA 2O9OA 3W28A 2AMGA 1QI3A 3EDJA 3ARTA 1NWSA 1E3ZA 1WZMA 2G3IA 3N04A 1JYNA 1EOKA 2XIIA 5FIPA 3WKZA 4Z2GA 1CGYA 3BGAA 1RP8A 4U5KA 4GQQA 1Q6FA 2YOCA 1DP0A 4PMDA 4AYSA 4IISA 2DIJA 3A4XA 3SCVA 4AD1A 5JBFA 3GNOA 2DGAA 3VINA 5I24A 5E6ZA 2ZUWA 1CLXA 2G3NA 3SUSA 1TE1A 2O9PA 3DYPA 2EPLX 4QDMA 1K9TA 2J7CA 1UZ1A 2DH3A 5FKYA 2W91A 4FF5A 3VMNA 2XWDA 4P7NA 1H3GA 3VDCA 3A4AA 2C7FA 1PZ3A 4KWUA 1NOFA 9CGTA 3EMQA 2W5FA 2DDXA 1DWIM 3OB8A 2FHBA 4HOZA 1GW1A 2WC7A 4AEEA 2E9BA 4JZ5A 1KR0A 2WVVB 2J7EA 2XG9A 1JYVA 1LG2A 1W2VA 2CBIA 1OBAA 4FLRA 3ZM8A 1X1NA 1HXJA 2WMKA 3W38A 4MB1A 1E3XA 1U2YA 3VIGA 2FGZA 1M04A 1PX3A 1VFOA 4DWSD 4PMRA 3RM9A 1UD5A 2OYKA 2BY3A 3L4WA 1I1WA 1UR0A 5CLTA 3T2QA 3SURA 1BTCA 3EDKA 4BF7A 3NSNA 2GJXB 1WZAA 2VL4A 3W25A 1D7FA 2PWHA 3AHTA 5EMYA 3FHAA 2E0PA 1WDPA 5CQ1A 1GORA 1CBGA 2BS9A 3NIYA 2WVSA 1DWGM 3VU2A 1R7AA 3T2PA 5CGMA 3PHAA 2J77A 3VGBA 2YIHA 3K8MA 2G41A 5I0DA 1QNOA 4D72A 4GIAA 1XHGA 1HP4A 4WKFA 4A3YA 2XVPA 1UWQA 5C71A 4F79A 4U33A 3AMGA 1QHPA 4PMYA 1UWSA 1IT0A 1H41A 3AICA 1MW2A 2WHJA 2E4TA 1TVPA 1JI2A 1KXQA 2CERA 2DSUA 3QHNA 1CXHA 1PAMA 5ABEA 2D22A 2V3GA 4NRRA 3FY1A 4H2CA 1N82A 2XTKA 3MMWA 3QR3A 1VJSA 4HMEA 1UH2A 2YL5A 1IZKA 1IZJA 4HZ6A 1BSIA 3S2CA 1ODUA 4GI8A 1W9UA 4Z2LA 2WKGA 1V3IA 5IDIA 1UWTA 3MUZ1 5F7UA 3FHQA 4H8HA 3WUBA 2OSYA 1C90A 4L4PA 3VD9A 4TXEA 4MB4A 4ACYA 2VZVA 1V02A 3BAYA 4HP5A 1G1YA 2D1ZA 4YN5A 4AXNA 1E0VA 1J0ZA 5M17A 1C3FA 3AS2A 4PBGA 2QMJA 4YPJA 3ALGA 3VIFA 2WMIB 3WF0A 2VX4A 1C93A 2RGLA 1GQKA 4KGLA 1ITXA 3ZSSA 1PX4A 4URIA 3M6DA 2WZIA 3IJ9A 4J27A 2EPNA 3I3DA 1EDGA 4AZ6A 3BCFA 3EMZA 2YL9A 4XV0A 1FH9A 3QHMA 3CMJA 3NYDA 3WNNA 5AYBA 2BNJA 2YA0A 4DM2A 4MNLA 1HJQA 4NRSA 3VKKA 1EIBA 3FXYA 3KZSA 1CPUA 4YHGA 1V3JA 1H0IA 5JUVA 3LPFA 5LA1A 3OBAA 3VD5A 1E55A 3GXFA 5A2CA 1OIFA 4FK9A 3OIHA 1FA2A 3VIMA 3UR8A 4DM1A 3TTOA 1XYZA 2A3EA 1UZ4A 4CGTA 7CGTA 4W5UA 2QF8A 2WMJA 4MJ2A 5D9MA 1EDQA 3WFZA 4GI6A 1XC6A 1TZ7A 1UWRA 2ZWYA 4KGJA 4U3AA 1R7OA 4EE9A 3THDA 2OWCA 2EPMX 4JIEA 3RPMA 3ZO9A 1J0JA 3WBEA 2BHZA 4TVDA 4F9JA 3E1F1 2XUCA 3N13A 1KGUA 3ARUA 4MTVA 1EA9C 1QI4A 3CZLA 3M07A 3BLPX 4K68A 1QVBA 5CG0A 1MW3A 2VR4A 3O9NA 4D6EA 5I3DA 2ZUUA 3UESA 3K4DA 2BXYA 4U3CA 3MMUA 4JFUA 4ATLA 3PZMA 4IUGA 4HOWA 1JD9A 4QAWA 4OZOA 4M1RA 4GINA 1K9DA 4UQDA 1B90A 1HJSA 3OA5A 5LA2A 4PRWA 4WKAA 5D8WA 3GXIA 1UWUA 3AS1A 3MANA 3CHCA 2O9TA 3BAWA 3SUUA 2GJPA 3IAPA 3MSDA 3WQWA 4F8XA 3K1DA 2V5DA 2G8ZA 4UOZA 4UOQA 2OWWA 1US3A 4H7VA 1MXDA 1V02E 1OD0A 1D2KA 5FD0A 1XSKA 3AS3A 1CXFA 3G6LA 1FFRA 2W4XA 4S3KA 1CXLA 4HMCA 3WL1A 4AY1A 5A8QA 4BCEA 1GCYA 2TAAA 4MB5A 2YLLA 3VGEA 1DWAM 1QHOA 2YA1A 2J7FA 3ARVA 5A8PA 1JFXA 1M53A 2WWDA 4WIWA 1TUXA 4UQEA 2Z1SA 3A6OA 4DWSB 1W32A 4WSKA 2JEQA 4B16A 2ZICA 1E6XM 2J47A 3BMWA 4YHEA 3GH5A 1E0XA 5EFDA 2XGBA 1E6QM 1MQPA 3WQ8A 3W26A 1GOIA 5LA0A 2XFFA 2W66A 1W91A 4PCTA 5AY7A 4C91A 1JZ6A 2VMFA 1E4IA 1J10A 1K9EA 2DH2A 3L4TA 4AEFA 2ZUMA 5D9PA 4HU8A 1YHTA 5HPCA 1V0LA 4CU6A 1HL9A 2ZX8A 5D9OA 2BHUA 2W92A 1UHVA 3L4VA 2EEXA 2ZXDA 1QI5A 2ZX7A 1W1TA 1E56A 4C7GA 3EDDA 1V6UA 3IANA 3VIPA 5FL1A 4AIUA 2XPKA 1C8XA 4Z2KA 5BCAA 1JDDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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