5FNGA

Native state mass spectrometry, surface plasmon resonance and x-ray crystallography correlate strongly as a fragment screening combination
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
publication title Native State Mass Spectrometry, Surface Plasmon Resonance and X-Ray Crystallography Correlate Strongly as a Fragment Screening Combination.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fngA00
5DSRA 5JEGB 3ML5A 3F4XA 1CCUA 5FLRA 4ZX1A 4WL4A 4M2WA 1CZMA 2NWZA 4XIWA 1UGGA 4HEYA 3BETA 5DOHA 4ZWZA 1ZFQA 2FMZA 4FU5A 9CA2A 3NI5A 5IPZA 1G1DA 1CNIA 3F8EA 4CNXA 4RFDA 1CAOA 2WEOA 4QY3A 3D0NA 1Z9YA 5FL5A 5E2RA 1HCBA 1HUHA 4HEWA 1BNQA 4RUYA 3M98A 3MWOA 1BNMA 1RAZA 4QJMA 1IF4A 1OKLA 2X7TA 1CNGA 3KOIA 4ITPA 3GZ0A 5JQ0A 3HFPA 1TH9A 1ZNCA 3EFTA 4M2UA 4QIZA 4RN4A 1HVAA 1YO1A 5EH5A 4Q7WA 1UGEA 1CAHA 1HEDA 4TWLA 1CILA 5SZ6A 5JQTA 1Z93A 3BL0A 3N0NA 3MHIA 4FL7A 3RG3A 4K13A 3RYVB 5E2NA 5FNGA 4QK3A 3Q31A 1I9OA 3S78B 1I9NA 1V9EA 1UGCA 1CA3A 1AZMA 2HL4A 3D93A 1CNXA 4Z1JA 3SBHA 3OY0A 5FLOA 3R16A 3SAXA 1CVDA 3W6IA 3OYQA 2EU2A 5EZTX 3DC3A 4MDGA 2WD3A 1G53A 4YYTA 1CALA 4XZ5A 5JEHB 1G6VA 5SZ3A 1CRAA 5EKMA 4PQ7A 3P3HA 5BRVA 1CRMA 3RYZA 4YVYA 5FDIA 1IF9A 3HS4A 4JSSA 3VBDA 3JXFA 4QJPA 3DCSA 2AX2A 1CA2A 5FLPA 1DMYA 3P3JA 3V3FA 4ZWXA 3P55A 3IGPA 3PYKA 1Y7WA 4L5UA 5DSQA 3DVBA 3PO6A 3SBIA 2POVA 3S71B 1ZFKA 1Z97A 3ZP9A 1DMXA 3N4BA 3MZCA 1CANA 2AW1A 4G7AA 3T83A 4L5WA 5JGTB 3M40A 1KWQA 1MUAA 4QJXA 5DRSA 1BNUA 3DVDA 4HEZA 4YXOA 1I9QA 3TVOX 1CNWA 3MHCA 4Q9YA 4QSIA 1THKA 4HBAA 4RFCA 1CVCA 2CABA 5E2SA 4E3DA 3RG4A 1RZDA 3S73B 1FLJA 4KV0A 4RUXA 4MLTA 5EKHA 3MNUA 5FL4A 2CBAA 3V7XA 4CA2A 2NMXA 3RZ7A 1I90A 5BYIA 3OKVA 4UOVA 4WW6A 1URTA 3T84A 1TTMA 3S8XA 3DA2A 3CAJA 3M14A 1ZGFA 1DCBA 2EU3A 4Q49A 4QJOA 4HT0A 4MTYA 3KKXA 1DCAA 1V9IC 3IEOA 4CNWA 4E49A 1TG9A 2POUA 1CNYA 5EIJA 4Q6EA 5CA2A 1TG3A 1LG5A 3S77B 4JSWA 7CA2A 1HUGA 4MDMA 1TEQX 3M1JA 1ZSCA 4E3GA 1ZGEA 5AMDA 2EZ7A 1YO0A 3F7UA 5CACA 3OKUA 1BNTA 3N2PA 3BL1A 1H4NA 3U47A 5DSIA 1JD0A 4Q7VA 3P5LA 1AVNA 4PXXA 4LHIA 2WEJA 5CLUA 2CBCA 1G48A 2NWOA 4KP5A 3CYUA 2NXTA 2H4NA 3RZ8A 4ILXA 4RIVA 3KNEA 4Z0QA 4KUYA 5C8IA 3DCWA 3T82A 4Z1NA 3MHMA 1JCZA 4E3FA 5E5RA 1UGFA 4IWZA 4ZAOA 5JDVB 3V3JA 3M3XA 2FNMA 3KIGA 4K0SA 4YXUA 3DV7A 3QYKA 4HU1A 4R5BA 5DSPA 5BNLA 1YDCA 3M5TA 4QK1A 4YGFA 5E2KA 4M2VA 4XE1A 1KEQA 2O4ZA 1ZE8A 1CAYA 2NNVA 4IDRX 2ILIA 1IF5A 1AM6A 2FOVA 4ITOA 4ZWIA 5SZ2A 4YGJA 3S74B 4C3TA 4Q07A 2NN7A 4QJ0A 3HKUA 5FLTA 1HCAA 4BF6A 1XPZA 2HFWA 3DAZA 2CBBA 4DZ9A 1FQNA 1TBTX 2NWPA 4QSJA 3MHOA 1ZH9A 1IF8A 4CNRA 5FNJA 4Q7SA 1J9WA 4JSAA 5EOIA 1CCSA 1G54A 1BN3A 5EH7A 5DSLA 3M2ZA 3UYNA 1BN4A 3M96A 4ZWYA 2X7SA 3M2YA 4Q8XA 5FNHA 1BICA 3RYXB 3V3IB 5E28A 1G4OA 3MNHA 3OIMA 4K0TA 4R5AA 2W2JA 5SZ1A 3RGEA 3M1QA 1RAYA 4Z1KA 4PYYA 3FFPX 5DVXA 4XIXA 1G52A 3MDZA 3S75B 5FNIA 4K1QA 3U3AX 5L3OA 3C7PA 3M5EA 1HEAA 4Q6DA 4KAPA 4Q99A 5DSNA 3RYYA 5G03A 3CZVA 3U45X 1I9PA 3M1KA 4PYXA 1CAMA 4KNMA 5DSKA 4KNJA 4Y0JA 5J8ZA 1CAJA 1OQ5A 2OSMA 3MNIA 4JSZA 5JG5B 3CA2A 5BRWA 5SZ7A 1BN1A 3M5SA 4FIKA 5FL6A 5EH8A 3M2NA 3MNKA 3HKQA 2CA2A 4JS6A 2CBDA 3D9ZA 4K0ZA 1XQ0A 3S76A 3S9TA 1CNKA 1TB0X 5DSMA 5G0BA 3RZ1B 1H9NA 2FOSA 3P4VA 4E5QA 4FVNA 4WUQA 5FLSA 1RZCA 2FOUA 1XEGA 4ZX0A 4X5SA 2HKKA 3IBUA 3V2MA 4QK2A 3RZ5A 1CCTA 3HKNA 2IT4A 3UYQA 1TEUX 3KWAA 3M1WA 3R17B 2FMGA 1XEVA 4QSBA 2WEHA 2HD6A 4YGLA 1LZVA 4YXIA 5SZ5A 2Q38A 3N3JA 1BCDA 4DZ7A 1IF6A 2VVAX 1EOUA 5E2MA 5EHEA 3OILA 4LP6A 4N16A 4L5VA 3PJJA 3DD8A 1TE3X 2FNNA 4YWPA 3TMJA 3T5UA 1UGDA 2FNKA 3V3HB 5JGSB 1CVFA 1FR7A 1G46A 4RH2A 5FNLA 3JXHC 1RJ5A 4TWMA 3W6HA 3DC9A 1F2WA 3NB5A 1FQMA 2NN1A 2X7UA 3MNJA 2FOQA 12CAA 3M04A 4PZHA 5HPJA 4FPTA 1OKMA 1I9LA 1I91A 5JESB 2H15A 1CIMA 5A6HA 2QP6A 1HEBA 5EHWA 5G0CA 3V5GA 3TVNX 3OYSA 4QSAA 1CNCA 4CNVA 1CAKA 2QOAA 3EFIA 3T5ZA 1BV3A 2NXSA 5JG3B 1LUGA 3LXEA 3IBIA 1KOPA 2F14A 5A25A 1HECA 4RIUA 1IF7A 1RZEA 4Q06A 4KNIA 4KUWA 1FSQA 1G0EA 1JV0A 1G0FA 4MDLA 5EKJA 3RYJB 4QJWA 4BF1A 4CACA 4Q0LA 3T85A 1G4JA 2QO8A 1A42A 3IBLA 3RJ7A 3IBNA 4E3HA 3KONA 1UGAA 5JEPB 4COQA 1ZSAA 4QTLA 1MOOA 4Q87A 3KOKA 5SZ0A 4MO8A 1T9NA 2NNSA 3MYQA 1CVBA 1YO2A 1LG6A 2GD8A 3IAIA 4G0CA 4YGNA 3DCCA 4Q8YA 1CVAA 3D92A 5AMLA 5G01A 3FW3A 2GEHA 4FVOA 4ETQC 5FNMA 3RZ0B 2FW4A 1ZSBA 5L6KA 3ML2A 3V2JA 5CJFA 3FE4A 4Q83A 3P5AA 4YGKA 1CAIA 3SAPA 2Q1QA 1FQLA 4Q08A 5E5UA 4KUVA 1CNBA 4KP8A 3ZNCA 4QIYA 4Q8ZA 3KS3A 3S72B 4HF3A 3K7KA 4M2RA 4KNNA 1OKNA 1KWRA 2NNGA 4YHAA 4E4AA 3U7CA 2ZNCA 1BZMA 1CNHA 4Z1EA 4XFWA 3HLJA 3NJ9A 1FR4A 1CINA 4Q7PA 1BNNA 1FSNA 2HOCA 1YDAA 1RZBA 6CA2A 1YDBA 5LMDA 3P44A 3L14A 4YX4A 1RZAA 2NXRA 3S97A 2VVBX 3KLDB 1CNJA 1I8ZA 2WEGA 1BNWA 1YDDA 3F7BA 5EHVA 4Q09A 2NWYA 5FDCA 1KOQA 4GL1X 5BRUA 1RJ6A 3OIKA 2OSFA 3K34A 3D8WA 3M2XA 1UGBA 2POWA 1I9MA 3HKTA 1BNVA 3RLDA 3V3GB 3DVCA 3K2FA 2CBEA 2FOYA 3DD0A 5SZ4A 5DSJA 1CAZA 4WR7A 4WUPA 4BCWA 3MMFA 4E9OX 1H9QA 2WD2A 2NNOA 1CVEA 5DOGA 4Q90A 5DSOA 4HT2A 4WW8A 1FSRA 3M67A 1G3ZA 4MLXA 2ABEA 5AMGA 4LU3A 4Q81A 3MHLA 4CQ0A 3B1BA 1CVHA 3DBUA 4QEFA 4RUZA 1G45A 4N0XB 3P58A 1FQRA 8CA2A 3B4FA 1LGDA 4Q78A 5FLQA 4FRCA 2Q1BA 4R59A 2HNCA 5FNKA 3MNAA 3JXGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5DSR A;  5JEG B;  3ML5 A;  3F4X A;  1CCU A;  5FLR A;  4ZX1 A;  4WL4 A;  4M2W A;  1CZM A;  2NWZ A;  4XIW A;  1UGG A;  4HEY A;  3BET A;  5DOH A;  4ZWZ A;  1ZFQ A;  2FMZ A;  4FU5 A;  9CA2 A;  3NI5 A;  5IPZ A;  1G1D A;  1CNI A;  3F8E A;  4CNX A;  4RFD A;  1CAO A;  2WEO A;  4QY3 A;  3D0N A;  1Z9Y A;  5FL5 A;  5E2R A;  1HCB A;  1HUH A;  4HEW A;  1BNQ A;  4RUY A;  3M98 A;  3MWO A;  1BNM A;  1RAZ A;  4QJM A;  1IF4 A;  1OKL A;  2X7T A;  1CNG A;  3KOI A;  4ITP A;  3GZ0 A;  5JQ0 A;  3HFP A;  1TH9 A;  1ZNC A;  3EFT A;  4M2U A;  4QIZ A;  4RN4 A;  1HVA A;  1YO1 A;  5EH5 A;  4Q7W A;  1UGE A;  1CAH A;  1HED A;  4TWL A;  1CIL A;  5SZ6 A;  5JQT A;  1Z93 A;  3BL0 A;  3N0N A;  3MHI A;  4FL7 A;  3RG3 A;  4K13 A;  3RYV B;  5E2N A;  5FNG A;  4QK3 A;  3Q31 A;  1I9O A;  3S78 B;  1I9N A;  1V9E A;  1UGC A;  1CA3 A;  1AZM A;  2HL4 A;  3D93 A;  1CNX A;  4Z1J A;  3SBH A;  3OY0 A;  5FLO A;  3R16 A;  3SAX A;  1CVD A;  3W6I A;  3OYQ A;  2EU2 A;  5EZT X;  3DC3 A;  4MDG A;  2WD3 A;  1G53 A;  4YYT A;  1CAL A;  4XZ5 A;  5JEH B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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