5FNMA

Native state mass spectrometry, surface plasmon resonance and x-ray crystallography correlate strongly as a fragment screening combination
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
publication title Native State Mass Spectrometry, Surface Plasmon Resonance and X-Ray Crystallography Correlate Strongly as a Fragment Screening Combination.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fnmA00
1CCUA 1JV0A 3IEOA 3MHCA 4MDLA 3SAPA 1HCAA 3RZ5A 4GL1X 1G4JA 4QSAA 1I9QA 3DVCA 4QJ0A 1FSNA 1G0EA 1IF8A 3S76A 1YO0A 4LHIA 4QK2A 4JSAA 1FQMA 4WW8A 4Q06A 3T83A 4PZHA 4Q6EA 3IBLA 4RIVA 1CNHA 1FR7A 4WR7A 3S78B 4YXIA 3IAIA 2FOSA 8CA2A 1I8ZA 3W6IA 3LXEA 1LG6A 3JXHC 3KIGA 4M2RA 2NMXA 3M2XA 3RYVB 1FQNA 1UGGA 3MMFA 5JG3B 4E3FA 3M2ZA 4ZWIA 4RN4A 5BRWA 3IGPA 3P4VA 4CNWA 1YDAA 2WD2A 2NXSA 1G45A 4FRCA 1IF9A 4YX4A 1CRAA 1CNWA 2CBBA 3OKVA 5DVXA 1CVAA 1CZMA 4E5QA 1RJ6A 3KS3A 4HU1A 4QEFA 4CNRA 3CA2A 3TVOX 1JD0A 3BL1A 4Q99A 3S71B 4L5VA 3MHOA 5FLRA 4KUWA 3MHMA 3IBNA 4KNMA 3TVNX 4CNVA 2OSMA 3L14A 2NNVA 4YGFA 4JS6A 1CVEA 3EFIA 5E2SA 3B1BA 4Q8XA 1RAYA 3RYJB 3SBHA 5AMDA 3HKUA 1CNGA 1G52A 5JGTB 4YYTA 4Q08A 1CAYA 5EH5A 1ZNCA 2CBCA 2Q1BA 3U47A 4QSIA 1KOPA 4YVYA 4E49A 4BF1A 2AX2A 5CACA 2HD6A 4L5UA 3V3GB 5JGSB 3M1WA 4Q87A 3PYKA 1XQ0A 3DV7A 4HT0A 5CLUA 5J8ZA 4K0SA 1KOQA 3DBUA 2H4NA 1BN3A 2POWA 2AW1A 1BN1A 3D8WA 5E2KA 5DSJA 3ZP9A 1H4NA 2FNMA 1CINA 2EU2A 4QJOA 4FVNA 1TG9A 5FLOA 4E4AA 1HEDA 1Z9YA 4E3GA 1HUHA 5BYIA 12CAA 3MYQA 2NWZA 1TG3A 3HKQA 1ZSBA 1G48A 5JDVB 3RYXB 3V5GA 4HF3A 2EU3A 1CVFA 3DD0A 4PQ7A 4WUQA 1ZSCA 3MNKA 5JESB 3M98A 1BZMA 4QK3A 4CQ0A 3N4BA 3FE4A 2NNOA 2O4ZA 1UGCA 3KOKA 5SZ6A 3T5ZA 2CBDA 3N3JA 5FNLA 1BNUA 4MO8A 3HS4A 1JCZA 3U45X 3T84A 5C8IA 5DSPA 3V3FA 3SBIA 1DCBA 3B4FA 4KNNA 5EKMA 5FLSA 3ML2A 2VVBX 5SZ3A 4PYYA 3P55A 2FOYA 5FL4A 5DSQA 3DCSA 3RJ7A 4RH2A 3W6HA 1CALA 2WEGA 1V9EA 1EOUA 3OIMA 1DMXA 4MTYA 4XIWA 3KOIA 3U3AX 4DZ7A 1I9NA 3MHIA 4ETQC 1J9WA 1G4OA 1RJ5A 4ITOA 2FMGA 4Q7PA 2OSFA 4KAPA 2FNNA 1IF6A 3RZ7A 4MDMA 1YDCA 1RZBA 3IBUA 1CNIA 3DA2A 4ITPA 2FOVA 1FLJA 1CCTA 2F14A 1UGBA 3DCCA 3MNIA 4R5BA 4HEWA 4QIYA 4IDRX 4XFWA 1KWRA 4Z1NA 4KV0A 5EHVA 4Y0JA 4R59A 3S73B 5DSOA 2Q1QA 1A42A 1IF4A 1HUGA 2CBAA 4Z1JA 5DSLA 1IF5A 1KWQA 4YGKA 4QJPA 1G3ZA 4KP5A 4Q8ZA 4Q8YA 3MNJA 5A6HA 3MNHA 1CILA 1HCBA 1ZGFA 3DD8A 3P44A 5EHWA 1CRMA 3U7CA 1G46A 4XE1A 3C7PA 2HL4A 4ZX0A 4DZ9A 4QY3A 4RFDA 3BETA 5G0BA 4LP6A 3HLJA 2NNGA 5EKJA 5FLQA 2FMZA 4ZAOA 1TEQX 4M2UA 1LGDA 3MHLA 4RUXA 5JQTA 4Q49A 1LUGA 2GD8A 3TMJA 3OY0A 3MZCA 2WEHA 3M1KA 4K13A 3UYQA 3KKXA 5EH8A 3ZNCA 4Q6DA 3DVBA 1RZCA 3OKUA 4QIZA 2QOAA 3RG3A 1FSQA 2FOQA 4FIKA 4FPTA 3SAXA 4YXUA 1OKNA 4KUVA 1YDDA 1HEBA 2HKKA 3K2FA 3M1JA 4QJXA 5DSMA 4YWPA 4R5AA 1BNNA 5E2NA 4ZWYA 1CAHA 4Q78A 1BNVA 5L3OA 3V2JA 4CNXA 1BNWA 1TB0X 3CAJA 3P3JA 4BF6A 3EFTA 4YGLA 5BRVA 3P3HA 2ZNCA 5E2MA 3S8XA 1H9NA 1BV3A 2Q38A 1ZE8A 1G6VA 4C3TA 4ZX1A 3M40A 3DCWA 3M04A 4JSWA 1G0FA 1RZDA 3FW3A 1CNJA 4MLTA 4RUZA 5AMGA 5DSIA 2POVA 1CNBA 1OKMA 1UGDA 4CACA 9CA2A 1CAMA 2WEJA 3F7BA 2VVAX 3V3JA 1YDBA 5FNHA 1CNKA 5DRSA 4FL7A 2ILIA 3HKNA 2W2JA 5EIJA 5SZ1A 1UGFA 4Q7VA 1CA2A 3F8EA 3S97A 5E28A 1TBTX 2NXTA 4KUYA 3D9ZA 1TTMA 4Q7SA 3IBIA 5G01A 3CZVA 2HNCA 4N0XB 5DSRA 2H15A 3K7KA 5A25A 3P5AA 2IT4A 2QP6A 3DC9A 5DOHA 2NNSA 1G53A 1ZH9A 1TE3X 3D92A 4Q81A 4RIUA 3V3HB 4G0CA 3RGEA 1UGAA 3S72B 1CVDA 4LU3A 1RZEA 1G54A 3V3IB 2QO8A 4Q0LA 1ZGEA 3DVDA 3KNEA 5FL6A 5JEPB 5FDIA 5HPJA 5SZ7A 1CIMA 1Z93A 5SZ2A 5LMDA 4N16A 5E2RA 2X7TA 3PJJA 4K0TA 5EOIA 5FL5A 3MNAA 1DMYA 1I9MA 1YO1A 4X5SA 4Q07A 5FNIA 3OIKA 1OQ5A 4COQA 3S75B 3RZ0B 4FVOA 1RAZA 1LZVA 1RZAA 1CAZA 5SZ4A 2NWOA 2CBEA 5DSNA 3GZ0A 3OYQA 4JSZA 5JQ0A 4JSSA 1HECA 3S74B 3V7XA 1FR4A 4Q9YA 4XZ5A 1CNXA 5EH7A 3VBDA 3Q31A 4Q83A 1CNYA 4QJMA 4Z1EA 4MDGA 1YO2A 4WL4A 3KWAA 4Z1KA 3RG4A 1BN4A 3DC3A 5G03A 4Q7WA 3M2YA 3T82A 4Q90A 1CAJA 2EZ7A 1XEVA 1I9OA 5EKHA 3OYSA 4QTLA 5BNLA 2POUA 3BL0A 4YHAA 1Y7WA 2WEOA 4WW6A 4QSBA 4XIXA 1XPZA 3KLDB 4TWMA 1BNTA 1AM6A 1F2WA 3HKTA 4YGNA 4KNIA 3JXGA 3FFPX 4K1QA 1UGEA 5E5UA 3T5UA 3RYYA 4UOVA 4FU5A 7CA2A 1FQRA 4MLXA 3RZ8A 5L6KA 1CAKA 2FW4A 5FLPA 4E9OX 2FOUA 3DAZA 5SZ0A 4E3DA 1OKLA 5DOGA 3MWOA 5FNGA 4HBAA 3M96A 4QSJA 2NWYA 2NN1A 4PXXA 5CA2A 5FDCA 1HEAA 2CABA 1TEUX 3MNUA 3M1QA 5JEHB 3M3XA 5FNKA 1CNCA 3N0NA 4IWZA 3N2PA 4ZWXA 5EHEA 1BNMA 1MOOA 1I90A 4E3HA 3PO6A 1HVAA 1Z97A 3M14A 1CCSA 4M2WA 3MDZA 3NJ9A 5JG5B 3NB5A 3KONA 3T85A 4M2VA 3M67A 4K0ZA 1THKA 1XEGA 4KP8A 1AZMA 2WD3A 4YGJA 3S9TA 3NI5A 3K34A 1V9IC 4HT2A 1CVBA 1I9LA 4CA2A 4ZWZA 1FQLA 1CANA 1BCDA 1CAIA 5AMLA 4YXOA 3P5LA 1IF7A 1URTA 1ZFKA 6CA2A 2NN7A 1KEQA 1ZSAA 3V2MA 3P58A 1MUAA 5FNMA 3F7UA 1G1DA 3QYKA 4G7AA 4RUYA 2HFWA 3R17B 4HEZA 5EZTX 3M5SA 1T9NA 3R16A 2FNKA 5G0CA 3RLDA 1FSRA 2ABEA 3UYNA 1BNQA 3M5TA 1CVHA 2NXRA 1CA3A 3CYUA 1DCAA 1ZFQA 3M5EA 1BICA 4Q09A 5IPZA 5DSKA 5FLTA 3M2NA 5CJFA 1I91A 2GEHA 2X7UA 4RFCA 4QJWA 2X7SA 5E5RA 4TWLA 3ML5A 2NWPA 1CVCA 1AVNA 4HEYA 3OILA 3S77B 2HOCA 4Z0QA 5BRUA 4ILXA 4QK1A 3D93A 5FNJA 2CA2A 1CAOA 4PYXA 4WUPA 3JXFA 3F4XA 3RZ1B 3HFPA 4BCWA 1LG5A 1I9PA 1H9QA 4L5WA 4KNJA 5SZ5A 3D0NA 3RYZA 1TH9A 5JEGB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CCU A;  1JV0 A;  3IEO A;  3MHC A;  4MDL A;  3SAP A;  1HCA A;  3RZ5 A;  4GL1 X;  1G4J A;  4QSA A;  1I9Q A;  3DVC A;  4QJ0 A;  1FSN A;  1G0E A;  1IF8 A;  3S76 A;  1YO0 A;  4LHI A;  4QK2 A;  4JSA A;  1FQM A;  4WW8 A;  4Q06 A;  3T83 A;  4PZH A;  4Q6E A;  3IBL A;  4RIV A;  1CNH A;  1FR7 A;  4WR7 A;  3S78 B;  4YXI A;  3IAI A;  2FOS A;  8CA2 A;  1I8Z A;  3W6I A;  3LXE A;  1LG6 A;  3JXH C;  3KIG A;  4M2R A;  2NMX A;  3M2X A;  3RYV B;  1FQN A;  1UGG A;  3MMF A;  5JG3 B;  4E3F A;  3M2Z A;  4ZWI A;  4RN4 A;  5BRW A;  3IGP A;  3P4V A;  4CNW A;  1YDA A;  2WD2 A;  2NXS A;  1G45 A;  4FRC A;  1IF9 A;  4YX4 A;  1CRA A;  1CNW A;  2CBB A;  3OKV A;  5DVX A;  1CVA A;  1CZM A;  4E5Q A;  1RJ6 A;  3KS3 A;  4HU1 A;  4QEF A;  4CNR A;  3CA2 A;  3TVO X;  1JD0 A;  3BL1 A;  4Q99 A;  3S71 B;  4L5V A;  3MHO A;  5FLR A;  4KUW A;  3MHM A;  3IBN A;  4KNM A;  3TVN X;  4CNV A;  2OSM A;  3L14 A;  2NNV A;  4YGF A;  4JS6 A;  1CVE A;  3EFI A;  5E2S A;  3B1B A;  4Q8X A;  1RAY A;  3RYJ B;  3SBH A;  5AMD A;  3HKU A;  1CNG A;  1G52 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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