5FOOA

6-phospho-beta-glucosidase
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
463
structure length
463
Chain Sequence
MLAFPKEFWWGGATSGPQSEGRFAKQHRNLFDYWYEEEPDLFYDYVGPDTASDAYHQIESDLTLLASLGHNSYRTSIQWTRLIDDFEQATINPDGLAYYNRVIDACLANGIRPVINLHHFDLPIALYQAYGGWESKHVVDLFVAFSKVCFEQFGDRVKDWFVHNEPMVVVEGSYLMQFHYPAIVDGKKAVQVAYNLALATAKVIQAYRRGPAELSDGRIGTILNLTPAYPASQSEADMAAAHFAELWNNDLFMEAAVHGKFPEELVAVLKKDGVLWQSTPEELALIAENRVDYLGLNFYHPKRVKAPDAIPVISPSWSPEWYYDPYLMPGHRMNVDKGWEIYPEAVYDIAIKMRDHYDNIPWFLSENGVGISGEDRYRDETGQIQDDYRIQFLKEHLTYLHKGIEAGSNCFGYHVWTPIDGWSWLNAYKNRYGLVENNIHTQVRRPKASAYWFKKVATHNRLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords 6-PHOSPHO-BETA-D GLYCOSIDASE
publication title Chemoenzymatic Synthesis of 6-Phospho-Cyclophellitol as a Novel Probe of 6-Phospho-Beta-Glucosidases.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pyogenes
total genus 194
structure length 463
sequence length 463
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2015-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fooA00
4BQ3A 4ZENA 1LG1A 4NRRA 3D3AA 4EANA 3QHNA 3WUEA 4X0VA 4B3KA 2EJ1A 2VX6A 2WHKA 2X2YA 5A2AA 3IJ8A 3SCSA 2CYGA 2OSWA 3II1A 1JF6A 1B9ZA 1E43A 1KXHA 1XV8A 1UD3A 3SUUA 2JIEA 2FH6A 2W5FA 3IK2A 2W62A 3M6DA 4Q22A 4GPNA 4FF5A 1J0KA 3OG2A 3GH7A 1H2JA 2WZEA 3WD2A 1IZKA 4OOZA 3CHFA 3VD5A 3WSUA 1NP2A 1BGGA 1CGTA 3N18A 2QPSA 1UKSA 1MXGA 2NT0A 1XSJA 1GOIA 4J3SA 1KWKA 3VNYA 2DSZA 3VIFA 2VT0A 2X8RA 2VNCA 2ZX5A 1OD0A 4CU7A 2CXGA 4HZ6A 4HOWA 1WDRA 4J3VA 3AOFA 1E1FA 4X0NA 2IUZA 1M7XA 3VMOA 3CHDA 1PAMA 3OA5A 4XV0A 1MFVA 2BVYA 1KXTA 1EHAA 3FY1A 3ARTA 1UR2A 1CTNA 3ARXA 2OWCA 4JFVA 4UCFA 5FL0A 3IJ7A 3L4WA 1UWTA 2WMJA 1IV8A 3U7VA 2WLYA 2FHCA 3MS8A 3EDEA 1EHNA 2DSVA 1W32A 1MQRA 1ZL1A 5A95A 3FAWA 3AMLA 1HJSA 5ABEA 5BXSA 1M53A 4PN2A 2EBNA 1HJXA 3S2CA 4CVUA 3VX0A 2VCCA 4PCTA 1ITCA 1HKKA 3A6OA 1A3HA 2VO5A 1FHDA 1R7AA 2W67A 4QCEA 2BY1A 3VIPA 1C91A 3WF4A 3T09A 1E3XA 4W89A 3ZMRA 4JCMA 5I5RA 1B2YA 2VZTA 2W92A 3GZAA 1B3ZA 5ECUA 2BVTA 3RILA 3A4WA 1V03A 1JYNA 3TTSA 1E40A 4ZE4A 2VL4A 4AZ5A 3EDJA 2XPKA 3W28A 3WNKA 3WUBA 4AC1X 3VKKA 1UOKA 3OGVA 2WLZA 2E8ZA 2DPEA 4QFUA 1UD5A 2ZUTA 1VRXA 1E6ZA 2ZXDA 2GDVA 1CWYA 4J7RA 2ZX7A 1ZJAA 1VENA 1XH2A 1CXHA 4FLQA 1LWHA 1ISXA 3N11A 4PYSA 2D0FA 3OLGA 2RGLA 3VIKA 1GJUA 1GW1A 1NWRA 1B30A 2ZE0A 3CMJA 3FHQA 5DEZA 3AXXA 5I2UA 2O9RA 2V38A 1C7TA 1LF1A 3GNPA 1E0WA 3N1AA 3EDKA 4XB3A 1Z32X 3G6MA 4PUDA 4Q7NA 3WF3A 5FIPA 5HNNA 2XYLA 4D6HA 2D23A 2DIJA 2QF8A 5JBDA 2G8ZA 3HMCA 1W3HA 3LPOA 1LWJA 5FL1A 3UESA 3QHOA 3UG4A 2WVVA 1V02A 1OSEA 2WBGA 1W1VA 4GI6A 3GH5A 3J7HA 5DO8A 2E0PA 1W9XA 1JDAA 1UWQA 3A3HA 2QHAA 4D6EA 3MO4A 4NI3A 2WXDM 4JAWA 3AIUA 2VX5A 2X1IA 4KWUA 4IPLA 2ZWYA 2DSUA 4W84A 1AMYA 1HT6A 1UA7A 2BXYA 3OZPA 8A3HA 2ZWZA 5A8NA 3T0DA 4Z2HA 2F2HA 1UD8A 1EH9A 1SMDA 5A6KA 3SCWA 3TOPA 3WDJA 5A1AA 4DWSA 1W3LA 2J8GA 4GZJA 2EPNA 4PEEA 1E70M 1PIGA 3CHCA 4FLSA 2WKGA 4PTWA 3ZIZA 1CXKA 4BS0A 1CIUA 3MMWA 1NWTA 2WVVB 5A6AA 2WVTA 3AS2A 5I3DA 5M03A 1KGWA 4UQEA 3VGFA 5A6JA 4FMVA 5F7UA 2ZUMA 2PBOA 3ECQA 3EBVA 1M04A 1GJWA 2WYSA 2BXZA 4F9JA 2WK2A 1JDCA 4MB3A 2J7FA 1OGSA 1LG2A 1EXPA 5IDIA 2G3NA 1MXDA 2FDMA 1F4AA 1U33A 3AHZA 1KQZA 1K9TA 4UQDA 2NT1A 2BV9A 3ZOAA 5C71A 1UKTA 3WQVA 4DWSB 1E71M 4CUCA 3WENA 4TTUA 1R87A 5D9NA 3DC0A 4U2YA 3ZM8A 4AEEA 1JYXA 1H3GA 2CBIA 3SCVA 4M56A 1B31A 2Y4SA 3QOKA 4W8AA 3WMSA 4XZWA 2B31A 1KR1A 4UQCA 3ZT6A 3MUAA 5E0FA 3WKZA 4AIOA 2FGZA 4GO9A 4W87A 2ZUWA 1V6VA 2ZX8A 2YKKA 3VGEA 1J0HA 1VBUA 2CITA 1NM9A 2PI6A 3W53A 3NIYA 2W91A 1GZJA 1V6XA 3CMGA 1W9PA 1BGAA 1HKJA 2VX4A 1OB0A 4PMNA 4N0RA 1QNQA 1QW9A 4JKMA 3WF0A 2DGAA 2DT3A 1FH7A 2E40A 4AIUA 1KCLA 1GOKA 4CN1A 2J78A 4JKLA 2D20A 3N12A 5A3HA 1G0CA 1GOWA 1KXQA 2VRKA 2RGMA 2J62A 5A6BD 1V3IA 4TX6A 4P7NA 3BH4A 4HMEA 4TXEA 2GJPA 5JBEA 4F8XA 3IAPA 4Y7EA 1LL4A 5C8BB 3M46A 4WJXA 1OT2A 4AIEA 3T2OA 2XGIA 1OWQA 4U3CA 4U31A 3SCOA 1B90A 4D6FA 2ZICA 4W85A 5KZ6A 3W0KA 4YN5A 1EOKA 2G3IA 1OCQA 2CETA 5A6LA 5BCAA 3ZJKA 3UERA 3SUSA 4DUVA 3WD1A 3WH7A 3PZOA 4FK9A 4MAZA 1OINA 4AZCB 2GDUA 3CGTA 2J74A 1E5NA 3TTYA 1FHLA 3CZ8A 2Z1KA 4RE2A 1O7AA 2DT0A 1GONA 4AW7A 1HL9A 1E55A 1E6NA 3CIVA 1BG4A 5EMYA 3G6LA 1L8NA 2VZVA 2EPKX 2XGBA 3NSNA 4JL2A 2TAAA 1GNXA 3VD3A 1JIBA 4HPHA 4NRSA 1JZ3A 3AHYA 3AIWA 3W82A 4JFWA 3WD0A 1JFXA 5E0CA 4UFMA 1QVBA 3UETA 1CGVA 1KFWA 2WKLA 3WIJA 2D24A 2VCAA 5D4YA 2CEQA 2XTKA 5E09A 3AS0A 1VJZA 3K46A 3AZSA 3F4VA 4KH2A 4ZXLA 1CLXA 5BROA 1L0PA 2JF6A 5DF0A 1JZ7A 2XWDA 3WDRA 4CU8A 1TG7A 1DWJM 1W91A 4AD3A 1ZJBA 3MMDA 1E6SM 1DTUA 3FHAA 3VDHA 3GDBA 2DT2A 1XSIA 5I6SA 1CXLA 5CPTA 5GNYA 3T0AA 3W6LA 5IFPA 3SCPA 1UKQA 3RO8A 2D22A 4LQ1A 1QNPA 4MADA 3WUGA 1RPKA 4H04A 2VVSA 1G5AA 4JKKA 4IISA 4OJYA 3MANA 1BAGA 1TR1A 3ZJ8A 2A3BA 4P8VA 1VB9A 3AFBA 5LYRA 5GNZA 1HN1A 1H09A 2Y8KA 2XM1A 4OBSA 1JXJA 4RL3A 3AQUA 4CD4A 4Z2IA 3KE0A 2ZXBA 3VILA 4MNJA 2XSAA 3I3DA 4WF7A 5I23A 2JIWA 1RP8A 4J3WA 3UR7A 2YBUA 1WZMA 3LMYA 4WKFA 5E6YA 3MSGA 3FW6A 4LYRA 4UFIA 1JYVA 2FGLA 2WMGA 4JHZA 2UY4A 5CXPA 2FHBA 4IM4A 4YHGA 1J12A 3HJEA 3VOCA 2Y24A 1VAHA 5AC5A 5ABGA 2DEPA 3WNMA 2X09A 1UHVA 5A2CA 1JZ2A 3D5HA 2VC9A 2J77A 3WNPA 4HU8A 4H8UA 2VZSA 1QW8A 1KGXA 5M5DA 1W9DM 1ISWA 4LPCA 6CGTA 1MW2A 1DWAM 5D8ZA 1UKPA 2VI0A 2ZX6A 3VIMA 4B16A 5A6BA 3WH6A 3WEZA 4AZ6A 4J28A 4MNMA 1VFMA 5CZKA 3PHAA 2YBTA 3GXDA 1J10A 2Y8VA 5BWFA 3QHMA 1CNVA 1JD9A 1H4PA 3SCRA 4R27A 1HJWA 3N9KA 4PRWA 4H8HA 5CJ5A 1BF2A 3AMCA 3NJ3A 3ARYA 2NW0A 5CSUA 1NQ6A 2DSKA 4F9DA 3WNNA 3CZEA 1X6LA 1UWIA 1YQ2A 2ZUVA 1MW3A 3DYMA 3K1DA 3MSDA 4GI8A 3O2LA 7TAAA 3VD7A 2VR4A 3B8SA 1DP0A 5GNXA 1KGUA 4MDOA 2D0GA 2WMKA 1TFVA 4EAMA 1UD6A 1I1WA 3I3BA 1GHSA 5JBFA 3RDKA 1MW1A 2YA2A 4P8XA 5AY7A 4D1JA 2XVKA 5A69A 5IHRA 1V0LA 2YDRA 4RE4A 1FFRA 4AD0A 4E2OA 1M03A 1XCXA 1E56A 3VINA 1US3A 4PMXA 3AS1A 1SR0A 2XFRA 4M29A 1ODUA 1C8QA 1E4LA 3NCOA 3MUIA 5A8MA 1E73M 1QBBA 1FP8A 3B9EA 2AOSA 1CGYA 1K6AA 1OM0A 3DECA 3PZQA 1YHTA 4GKLA 2DQXA 2QLYA 1UR8A 3MV11 5ABHA 1BQCA 3VD4A 1MQQA 3WNLA 3VU2A 3K4DA 4AWEA 1C90A 1H0IA 1WZLA 1TZ7A 1EQCA 3CHEA 4F79A 1WDPA 1WZAA 4TUFA 2XUCA 3POCA 2D3LA 3UEQA 1ISVA 5CG0A 1H41A 4U5IA 3NSMA 1GHRA 2XFYA 2VR5A 1CGUA 3L4YA 3AZTA 4LX4A 5EFFA 3WQ6A 1JL8A 1X6NA 2OWXA 3BSHA 3TTQA 4FLOA 2OSYA 1FH9A 4RE3A 1XH1A 4CN6A 3CUJA 3AMGA 2XIBA 3K4AA 4AZBA 2CKSA 1BG9A 4AZIA 2E8YA 2MANA 4CD8A 4UNIA 1TMQA 4MNLA 3WY1A 5A6SA 1BFNA 1B3VA 1KB3A 1VFFA 1UWSA 2W61A 3B9AA 1G01A 5JUVA 2D3NA 2E9LA 1JZ5A 1QI5A 4CVWA 2WMIA 3AMDA 3DYOA 2OSXA 1JDDA 5HBFA 1TA3A 4JIEA 1JYWA 1HP4A 1ZS2A 1JAKA 4NSBA 5TD4A 4R5EA 4LGXA 3OB8A 3BC9A 2OYKA 2EO7A 3BAWA 2C8NA 3N17A 4MB1A 2WCAA 3PZVA 3GXFA 3ZO9A 5JIPA 5CPSA 1WP6A 3VIGA 1FOBA 1HKMA 4J3UA 1E6RA 3ZSTA 3A47A 3BAKA 1Q4NX 2V5CA 2WSKA 4A3HA 1CENA 2YL6A 4F66A 5BXPA 3IANA 2VRJA 4HU0A 3KZSA 2WMFA 1I1XA 4ATLA 4ATDA 2XHYA 2WMIB 1G94A 3NSXA 2C7FA 3WD3A 4W93A 7A3HA 3L4TA 1UH3A 1HL8A 1TA3B 4L4OA 1UWUA 3WEMA 5IHSA 2DIEA 3BLKA 3W4RA 4KGLA 1BVZA 2WSPA 1EDTA 3WNOA 5HXMA 3CZJA 5EBAA 1W9UA 2J7DA 1CBGA 1E1EA 4J3TA 1RH9A 3FAXA 4W5UA 3L4UA 1BLIA 1WAWA 3F5LA 3QGVA 1W1YA 2JEPA 3FN9A 3SCUA 4HTYA 1C3FA 4D6IA 5I78A 3FXYA 4TTGA 2WVSA 1ZBKA 2FH8A 4AZGA 4BCEA 1GVYA 1J11A 1EGZA 1JZ8A 1CXFA 3GXIA 4QCFA 3SURA 4CCEA 1EOMA 4AD1A 4PTMA 2CHNA 1Q6EA 4M8UA 1O6IA 3LPPA 3W29A 4OUEA 3PTQA 2A3AA 1BTCA 3AHXA 2ZXAA 1KBKA 4U2ZA 3AIVA 3BMVA 1HNYA 1XYFA 3AXIA 3O9NA 1F4HA 1QNSA 2WZHA 3UCQA 2J7BA 4URIA 4E4PA 1V3LA 2XVPA 4XUYA 4M80A 3VDAA 1GOOA 3BAXA 1XSKA 5HOSA 3OGSA 3GBDA 5AYBA 2XVLA 5C70A 4AXNA 2E9MA 2G3JA 3WQWA 4P7LA 4JL1A 4CD7A 4CD6A 4DWSC 3RM4A 2YL9A 1D2KA 1WZKA 1J0JA 2BHZA 1QI0A 3CZGA 4J27A 4WKAA 2YA1A 2WBKA 1QOXA 2C0HA 1EIBA 1E0VA 3N15A 1E15A 1WPCA 1XRVA 4P7OA 4AZCA 2YLLA 3VGGA 1PZ2A 3HN3A 3T2QA 3CUHA 2ZIDA 4AZ7A 3W24A 2PWFA 1W3KA 1WB0A 4AYSA 3EYPA 1CEOA 4E8DA 2QV4A 3K8KA 3U5UA 3ZT7A 4W8LA 8CGTA 3T08A 5M3WA 4Z2KA 1CGWA 3WD4A 2VCBA 1W3JA 1NARA 3A4AA 1BYDA 2QMKA 2CIPA 4PMRA 1PJ9A 4V2XA 2BFGA 3EMZA 3AI0A 4JFTA 2CKRA 3POHA 4KRTA 4M1RA 1V3HA 4MJ4A 4V27A 1D7FA 1UR9A 2G3MA 1DWHM 2J8FA 2WC7A 1W9VA 2BHYA 2WCSA 1H0GA 3O6AA 4CU6A 1WKYA 3AICA 2AMGA 2F61A 3SCTA 1DWGM 3PZ9A 1EO7A 1CPUA 3WN6A 1HXJA 4H7VA 2CESA 1JF5A 3DHPA 4CCCA 1ISZA 5I24A 2CBJA 2J7GA 3KL0A 3PZGA 6A3HA 4K68A 1QBAA 3DYPA 1NWSA 4KGJA 1WNOA 2WAGA 1XH0A 4OIFA 5E70A 2ZUUA 4ZFMA 1KCKA 2PWGA 4MDPA 3NDZA 1CECA 3CH9A 4QLKA 5CLTA 2BVDA 3GNRA 1SFSA 5M17A 3WF2A 3PZNA 1J18A 4AZHA 3WL1A 4AISA 1PBGA 2GVYA 1AQ0A 2UY2A 3RCNA 2XJ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4BQ3 A;  4ZEN A;  1LG1 A;  4NRR A;  3D3A A;  4EAN A;  3QHN A;  3WUE A;  4X0V A;  4B3K A;  2EJ1 A;  2VX6 A;  2WHK A;  2X2Y A;  5A2A A;  3IJ8 A;  3SCS A;  2CYG A;  2OSW A;  3II1 A;  1JF6 A;  1B9Z A;  1E43 A;  1KXH A;  1XV8 A;  1UD3 A;  3SUU A;  2JIE A;  2FH6 A;  2W5F A;  3IK2 A;  2W62 A;  3M6D A;  4Q22 A;  4GPN A;  4FF5 A;  1J0K A;  3OG2 A;  3GH7 A;  1H2J A;  2WZE A;  3WD2 A;  1IZK A;  4OOZ A;  3CHF A;  3VD5 A;  3WSU A;  1NP2 A;  1BGG A;  1CGT A;  3N18 A;  2QPS A;  1UKS A;  1MXG A;  2NT0 A;  1XSJ A;  1GOI A;  4J3S A;  1KWK A;  3VNY A;  2DSZ A;  3VIF A;  2VT0 A;  2X8R A;  2VNC A;  2ZX5 A;  1OD0 A;  4CU7 A;  2CXG A;  4HZ6 A;  4HOW A;  1WDR A;  4J3V A;  3AOF A;  1E1F A;  4X0N A;  2IUZ A;  1M7X A;  3VMO A;  3CHD A;  1PAM A;  3OA5 A;  4XV0 A;  1MFV A;  2BVY A;  1KXT A;  1EHA A;  3FY1 A;  3ART A;  1UR2 A;  1CTN A;  3ARX A;  2OWC A;  4JFV A;  4UCF A;  5FL0 A;  3IJ7 A;  3L4W A;  1UWT A;  2WMJ A;  1IV8 A;  3U7V A;  2WLY A;  2FHC A;  3MS8 A;  3EDE A;  1EHN A;  2DSV A;  1W32 A;  1MQR A;  1ZL1 A;  5A95 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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