5FPDA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand pyrazine-2-carboxamide (at513) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
378
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 378
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpdA04
4H5RA 4FOIA 3IUCA 1X9JA 4GY2B 3SK3A 1BA0A 2CH5A 1BWFO 2F9TA 2A3ZA 1NM1A 3CJCA 3FZLA 3ATVA 3VOVA 2P9PB 1S3XA 5AFUA 5E26A 4KBOA 4DCHA 5AR0A 2QM1A 3HI0A 4NO7A 3VESA 3O5BA 2P9NB 3VEYA 4LC9B 2I7NA 4PKIA 4BROA 1MDUB 4BR2A 3ULEA 3M1FA 1NGHA 3P4IA 3UKRA 4JHDB 3GDQA 3D7EO 1NMDA 1HPMA 4CI6A 4B1WB 3DJCA 4QS8A 5LJWA 3IMXA 2PAVA 5KQ8A 1D4XA 2P9KB 1S22A 2D0OA 4H0PA 4B1YB 4CZHA 4XEIA 3C7NA 5BPLA 1QZ5A 2P9SB 4FWPA 2VCPA 3M3ZA 2J4RA 2V7ZA 4H0VB 1OKJA 3UKUA 4A61A 4M7XA 5FPDA 5AZJB 2BTFA 2OANA 1BA1A 1XQSC 3WXKA 3UE5A 4BG8A 1GLDG 4MLHA 5BN9A 3RSEB 4ISFA 2DPNA 3BEXA 5JLHA 1YVNA 2A6AA 3LDPA 1X3NA 4H0OA 3JXUA 2PBDA 3DAWA 1WUAA 1TYQB 2YCHA 3H45C 3AARA 4FWRA 4MLEA 3D2EB 1NGAA 2QWOA 1ZBSA 3IFRA 4QS7A 4RTFD 5AQQA 5BR9A 1KAYA 3R9PA 1HX1A 1ZC6A 3H1VX 4QS9A 4ISGA 3EN9A 1T6CA 4BR9A 4WQ4C 5AZIA 4FO0A 2ZGZA 3VEOA 4IWVA 5F1XA 2CGKA 1ATNA 1QQMA 1GLBG 1SAZA 1IJJA 3FZHA 2FF6A 4FWSA 5KPRA 2Q1NA 2Q0RA 2CGLA 2P9LA 4CD1A 3CQXA 3SMPA 1KXPA 3U9DA 4F9OA 5EXWA 2ASOA 1YXQA 1NGJA 4DHYA 1H1VA 1NBWA 1V4TA 3CJBA 4O8KA 3FZMA 3AAPA 3GG4A 3ZETB 4C23A 2E20A 2BUPA 4I6MB 4RWTA 3WXJA 5KPZA 3A8YA 2FSNA 4EHTA 2GEMA 1JCGA 5CE3A 3O4WA 4BQZA 3WEEB 5AFUH 5BRHA 1P8ZA 4FWMA 3O6WA 2NZTA 5BPNA 5TKYA 1BU6O 2A42A 3VERA 1JCFA 2FF3B 5AQOA 1HKGA 2ITMA 3A5MC 4CD3A 2FSKA 3CERA 3L4IA 3HTVA 1RFQA 3O08A 4Z94A 2A40A 4A2AA 3ZX0A 4ISEA 2IVPA 3CJ1A 3WQTA 2A5XA 5AQJA 4BRQA 1Y64A 4EIAA 3A0IX 2E1YA 3FLCO 4PKHA 3ID8A 4BC3A 1Q18A 4IJAA 4IXCA 3VGMA 5F0XA 1Z05A 3H1QA 1TUYA 4MO5A 2UYTA 3AY9A 1QHAA 4CZEA 4FWKA 2QWRA 5B8HA 5AQHA 1RDWX 5AQGA 4BC5A 2P9UB 2QWQA 3H3NO 4RCHA 2NLXA 3ZEUA 3CETA 1NGIA 3CHWA 3VEZA 3BP8A 3QMLA 3KVGA 4BRPA 4FL9A 4CZMA 3QFUA 2KHOA 3CJAA 5BREA 4H5NA 3FR0A 4PL8A 1HKCA 2P9PA 3C0BA 1SQKA 1R59O 3A5OC 2GWKA 3VF2A 4CZJA 3L6QA 3ATUA 4BR7A 5AQIA 2P9NA 4BR5A 3SLCA 3DWLA 1HLUA 3FZFA 1GLEG 4JNEA 2Q2RA 3CJ9A 3M6GA 1KAZA 3O1WA 3G25A 4JHDA 2CGJA 1V4SA 1CZAN 3CQYA 3O80A 4CZLA 2ZGYA 3WT0A 4XH1A 4FSVA 2P9IB 2P9KA 3HSCA 1BDGA 2V52B 1BO5O 3AAQA 2P9SA 3I33A 2QWPA 5EX5A 1QQOA 2HOEA 3W0LA 1KAXA 1SZ2A 4YDUC 1JCEA 5AZJA 5AQTA 3VF4A 2VYPA 2WUSA 1RGIA 4WYBA 1NGGA 4XH4A 3RSEA 3WXIA 2E88A 3HBTA 3QB0A 4K43A 4WQ5C 4BRLA 3J8AA 4HWIA 3D2FB 4BRKA 1TYQA 5AQKA 4BR4A 4JAXA 3MCPA 5JLFA 3D2EA 3FE1A 2Q36A 3O8MA 3H3OB 4CZKA 1MWMA 2IVNA 2E2PA 4EAHD 5AQWA 5ADXA 2YI1A 3F9MA 3MN9A 3MN5A 1BOTO 2Q31A 4H5VA 5JMVA 5LJVA 2ASMA 3A5NC 4M63C 3IDHA 3MN6A 3GE1A 3DXKB 4JD2B 1NGCA 1K8KB 3VETA 4IO8A 3EKUA 4CBUA 4K25A 5AQVA 2I7PA 1U6ZA 1ESVA 2V51B 3GBTA 2VWBA 5EVZA 3U9ZA 3DXMB 3LM9A 4HTLA 5BRDA 2QWNA 4GNIA 4BR0A 3VEVA 4CZFA 4B1UB 4BVOA 4BGBA 2AP1A 2ZF5O 4JD2A 3GL1A 2HF3A 3ZETA 3TPQA 1MA9B 1C0FA 4I6MA 1MWKA 2W40A 1NGBA 5FPEA 1G99A 3LL3A 4H0TB 5EOYA 3WXLA 4BRGA 2FLOA 4B1ZA 1LOTB 3WEEA 2IIRA 4CJ7A 1NLVA 4AM7A 3I8BA 4FWLA 3QBXA 5AQLA 2YHXA 2HF4A 2YJEA 2AA4A 1XUPO 3WQUA 3EL2A 5BPMA 2FSJA 3LM2A 4NB4A 1WOQA 2H3GX 1EQYA 1LCUA 5JICA 4B9QA 1YUWA 3H6EA 3VENA 5AQYA 4E1JA 3VGKA 2E2NA 3BUZB 2NRHA 3CIPA 2Q97A 5E84A 3LDOA 3EZWA 3L0QA 5AQNA 1T6DA 5AQRA 1HJOA 3U8XA 3ZX3A 3QICA 1GLLO 4BQLA 3QDKA 2F9WA 4B1XB 4BRFA 2CH6A 3ULEB 2Q0UA 3QBWA 5BRFA 3UKRB 2ASPA 2D4WA 2EWSA 2YJFA 1GLJO 2V7YA 2P9UA 4BREA 1J6ZA 4XH5A 3C7NB 4Y0WA 4BRNA 3KZBA 3VPZA 3CJ7A 3OHRA 3UKUB 2D1KA 2QWLA 2YHWA 1GLAG 4BG9A 5AQSA 2QW9A 3FFKB 4JN4A 4YDUA 4AM6A 4MO4A 4L3QA 5ADXH 1E4FT 1T44A 4H03B 1HKBA 4CBXA 1NWKA 4H5WA 3WUHA 4WQ4A 2HMPA 3KHYA 1HUXA 4H5TA 3A5LC 5F2RA 4FOEA 4WQ5A 4IZ9A 5LY3A 3LDNA 1BUPA 4EFHA 4A62A 3MDQA 1ATRA 3FZKA 1Z6RA 4BC4A 1YAGA 3ENOA 4BRDA 4PKGA 3FGUA 5AZIB 3SJHA 3R8EA 4B1VA 2P9IA 1QQNA 3LDLA 1NGDA 3ZX2A 4BRCA 4DQ8A 5AQUA 3JS6A 4O5FA 4CZIA 1E4GT 3MMVA 3ENHA 4A2BA 1QZ6A 3QFPA 2A41A 2P9LB 3GOIA 4K41A 4CZGA 4M7YA 4H0XB 3W3DA 1BG3A 2GWJA 5AQXA 2QXLA 3D2FA 4PL7A 1X3MA 3EO3A 3S41A 2E2QA 1GLFO 3UB5A 2W41A 2ZWHA 2D0PA 5AQFA 2E1ZA 4DB3A 3VGLA 2YHYA 3R6MA 1DEJA 2FXUA 1U2VB 3SMSA 2QWMA 5KPTA 4BRHA 1NGEA 2GTDA 4BC2A 4IJNA 3DXKA 5BN8A 1NGFA 1IG8A 1K8KA 3VF6A 4BRAA 2IVOA 2GUPA 3O1BA 5AQPA 4FWOA 1DKGD 4K42A 3TU5A 3MK6A 5ELZA 3H46O 3DXMA 1U2VA 5FPNA 3BF1A 4BVPA 5KQDA 2GELA 4FWQA 3U4LA 3EKSA 5I9EB 2E8AA 3CI5A 3HM8A 3MN7A 1ZXOA 4FPAA 3VEWA 5EY4A 4BRMA 1XC3A 1DGKN 4H0YB 4BGAA 4EHUA 5AQMA 3BF3A 3HZ6A 3B8AX 4FPBA 1GLCG 4FWNA 1ATSA 5FPMA 1TUUA 5AQZA 3VEXA 4J8FA 3ZEUB 1C0GA 4CBWA 2E2OA 3LDQA 4BRIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F2RA 3MEDA 2ZJQL 3CD6N 1NKBA 3IUCA 1X9JA 1RBRA 2DFFA 3SK3A 4FVUA 1ZYWA 4B9NA 2CH5A 1BWFO 1NM1A 3S9HA 3K5OA 4AHSA 3VOVA 5IWAK 2M8BB 3PLAA 5DM7L 3I0SA 5E26A 2E6MA 2HVIA 1RT3A 5AR0A 4GKJK 1I6GA 5GAHP 2Z1JA 3G71N 1QVFM 3PIOL 2O8CB 3R2VA 4LC9B 4CEEA 4BROA 3VQCA 2WTUA 3VA3A 1T8EA 4AHRA 2HBJA 1NGHA 3P4IA 5CZ2A 4FVMA 1HPMA 3G0ZA 4X64K 3DJCA 3IMXA 1S22A 2ASCA 4BY9C 4KTQA 2QI2A 2W6LA 5BPLA 1QZ5A 4FJMA 4CJSA 1R0AA 2VCPA 4CEZA 2LI7A 4A61A 1OKJA 4DQSA 1OH5A 4IFYA 3EZ5A 5KTQA 2WONA 4MLHA 3HO1A 1REVA 2G8FA 3BEXA 4M45A 4BDZA 3DAWA 3NH0A 1TYQB 3H45C 1JJ2M 3D2EB 2QWOA 1S9GA 1ZBSA 3IFRA 4FW1A 1HQEA 5AQQA 5BR9A 2OPSA 1HNWK 1HX1A 3V1RA 1D8YA 1RTHA 4QS9A 4GV9A 2ZGZA 2UXBK 1X1PA 3F5TA 2CGKA 1ATNA 3TI0A 4JKCA 4BDPA 1GLBG 1SAZA 4QAGA 5KPRA 1RTDA 2Q1NA 1XWLA 3LP2A 2NRWA 4B9MA 4LFBK 3CQXA 1KXPA 5EXWA 1GOBA 1DTTA 3MEGA 1YXQA 1NGJA 4DHYA 2G8KA 4J2DA 1VSKA 1PX9A 3CJBA 3FZMA 4Y1DA 3GG4A 1VSIA 4I6MB 2GBZA 4K0KK 3A8YA 4E7JA 4CEQA 1JCGA 4RW4A 4IEEA 2IDOA 4JI7K 5IT9O 3TAMA 3QEIA 1ZUTA 3O6WA 3DLHA 2W00A 2NZTA 1KCFA 3NE6A 4BECA 2HHIA 1J53A 1JCFA 2G8WA 3L3VA 4B3TK 3KLFA 2R7YA 2RF2A 3P5JA 3RMCA 4CJVA 3CERA 3L4IA 1NH5A 2X78A 3CG7A 4Z94A 4DU4A 3QO9A 4ISEA 2A5XA 2YNGA 3OW2M 4DU1A 3SAGA 5AQJA 4BRQA 4CEOA 1CXUA 4PKHA 4JKAA 4LH4A 1NRBA 4I9QA 5BR8K 4ID1A 4IXCA 3VGMA 5F0XA 3KLIA 3H1QA 4MO5A 2LSNA 2UYTA 4WCEL 2O8DB 1QHAA 3OY9A 1XRSB 4FWKA 2JGUA 2YEOA 3HT3A 4KHQA 4E7KA 2XY5A 4DUYK 4DSJA 3HYFA 4YOVA 1VQ8N 5GAGP 3L2RA 3CETA 4JI4K 4DV5K 3HRGA 4CJ4A 4O8UA 3BP8A 4BRPA 4CIGA 1RT1A 4FL9A 3MXJA 4JKGB 2KHOA 1TK0A 5TKWA 3WXMB 1WBDA 4RW9A 2P9PA 3AVLA 1SQKA 3A5OC 2GWKA 2OPQA 1NK0A 4OPHA 3TTFA 4CGDA 2HHSA 1Z26A 1JZBA 3OYLA 2ATQA 3NDKA 3DLBA 4F4KA 1KVBA 3DWLA 4NXNK 3TAGA 2PY5A 4Z4CA 4JNEA 3TAEA 1GPSA 3SV3A 3BDPA 1KAZA 3O1WA 2ATBA 1TVRA 3G25A 4JHDA 4ZTFA 1NK8A 1ZBHA 2CGJA 1V4SA 3CQYA 4CZLA 2ZGYA 3IAYA 4UAFE 1EX4A 2P9IB 2P9KA 2F4VK 2B3CA 4M3RA 1POIA 1KAXA 4YDUC 4W5QA 3VF4A 2P5OA 1RGIA 1NGGA 3RSEA 4JK9A 3PO5A 4IG0A 4K43A 4CEDA 2LN8A 3AO5A 5FDLA 2YILA 4WQ5C 3VQ6A 1LAWA 1L5UA 1M1KO 2YKNA 1X9SA 4KKOA 3VQ7A 3LZIA 1P90A 2YNIA 4AHCA 3J81O 2E3GA 3OYHA 3S3OA 3NBPA 2ZM6K 4GV3A 3F9MA 3RMDA 3VTIA 1BOTO 3DLKA 5LJVA 3V4IA 3E9OA 3IDHA 3KP1A 4NYFA 3KKRA 3LWLA 4FLZA 4LY7A 1NGCA 3AVIA 1RILA 4CBUA 3OJSA 4K25A 1T05A 2I7PA 1U6ZA 1U48A 1KRPA 3VQ8A 2Y1JA 2UUCK 1HYVA 4GVMA 1C0TA 3KC6A 1T0ZA 3VEVA 3THYB 4CJPA 4JRPA 1NK5A 4BVOA 1ASWA 3O3GA 4E72A 3TPQA 4B3OA 1B92A 5FPEA 3WXLA 3V6DA 3LALA 1VQNN 1QQCA 4CJ7A 5K14A 1IBMK 1JLGA 5AQLA 3CFPA 2G8HA 4CFDA 1VQ5N 4FJ5A 1RDDA 4KI4A 1NOZA 3HL8A 2FSJA 4U67L 1WOQA 4HVJA 1YUWA 1RDAA 4JKEA 4FLVA 3VGKA 3BUZB 1K8BA 2NRHA 3CCLN 3AA3A 3HPOA 4N41A 2WBNA 3P39A 1SEGA 4O0IA 4Y1CA 4DR2K 3HVRA 2E2FA 1HJOA 4BQLA 3QDKA 3KIOA 2F9WA 4GVEA 4BRFA 2CH6A 1JLCA 1IKYA 3EE8A 1EKEA 1XNRK 1YITN 3HM9A 1EWQA 1BK8A 2XY6A 1NU0A 4BREA 1J6ZA 4KH6A 4M3WA 5HRNA 3T19A 1RT4A 3LP3A 4BRNA 3NH2A 1VQPN 3DYAA 4KREA 4CJKA 4CVNE 4ILJA 5CR4A 1BI4A 3KLEA 3FFKB 4JN4A 2LR3A 4OPKA 3ASMA 4CGHA 2ZE2A 1HKBA 4E7HA 2VY6A 1NWKA 3S5TA 3WUHA 1U49A 3TAFA 3NAEA 1HJRA 4O44A 3A5LC 5F2RA 4FOEA 4FCYA 1JKHA 3LDNA 4DR4K 1FJGK 1BUPA 4IOCL 3MDQA 1ATRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4F2R A;  3MED A;  2ZJQ L;  3CD6 N;  1NKB A;  3IUC A;  1X9J A;  1RBR A;  2DFF A;  3SK3 A;  4FVU A;  1ZYW A;  4B9N A;  2CH5 A;  1BWF O;  1NM1 A;  3S9H A;  3K5O A;  4AHS A;  3VOV A;  5IWA K;  2M8B B;  3PLA A;  5DM7 L;  3I0S A;  5E26 A;  2E6M A;  2HVI A;  1RT3 A;  5AR0 A;  4GKJ K;  1I6G A;  5GAH P;  2Z1J A;  3G71 N;  1QVF M;  3PIO L;  2O8C B;  3R2V A;  4LC9 B;  4CEE A;  4BRO A;  3VQC A;  2WTU A;  3VA3 A;  1T8E A;  4AHR A;  2HBJ A;  1NGH A;  3P4I A;  5CZ2 A;  4FVM A;  1HPM A;  3G0Z A;  4X64 K;  3DJC A;  3IMX A;  1S22 A;  2ASC A;  4BY9 C;  4KTQ A;  2QI2 A;  2W6L A;  5BPL A;  1QZ5 A;  4FJM A;  4CJS A;  1R0A A;  2VCP A;  4CEZ A;  2LI7 A;  4A61 A;  1OKJ A;  4DQS A;  1OH5 A;  4IFY A;  3EZ5 A;  5KTQ A;  2WON A;  4MLH A;  3HO1 A;  1REV A;  2G8F A;  3BEX A;  4M45 A;  4BDZ A;  3DAW A;  3NH0 A;  1TYQ B;  3H45 C;  1JJ2 M;  3D2E B;  2QWO A;  1S9G A;  1ZBS A;  3IFR A;  4FW1 A;  1HQE A;  5AQQ A;  5BR9 A;  2OPS A;  1HNW K;  1HX1 A;  3V1R A;  1D8Y A;  1RTH A;  4QS9 A;  4GV9 A;  2ZGZ A;  2UXB K;  1X1P A;  3F5T A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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