5FTOA

Crystal structure of the alk kinase domain in complex with entrectinib
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
309
structure length
298
Chain Sequence
GPNYCFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMARDIYRGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords ALK TYROSINE KINASE RECEPTOR
publication title Discovery of Entrectinib: A New 3-Aminoindazole as a Potent Anaplastic Lymphoma Kinase (Alk), C-Ros Oncogene 1 Kinase (Ros1), and Pan-Tropomyosin Receptor Kinases (Pan-Trks) Inhibitor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 97
structure length 298
sequence length 309
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2016-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ftoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ftoA01
2ZV2A 2QHNA 4N70A 4FTJA 4IWQA 3R8LA 3BGZA 3CJGA 3MH1A 1UWJA 1YW2A 3ZSHA 1DI8A 1URCA 1Z9XA 4XJ0A 4MWIA 3PIXA 1B38A 4FL3A 2OGVA 4MD7E 2GNJA 4RLLA 4JBPA 4L3LA 4LI5A 4RFZA 1LEZA 2FUMA 2VO0A 3ENMA 2BAQA 4YHJA 4D2WA 4YU2A 3GCPA 4ZZOA 1YHVA 4WG4A 1IR3A 2VO7A 3TG1A 2VTRA 5I4NA 2YM3A 4GJ3A 3VW8A 4EH8A 2ZAZA 4YHFA 4E73A 4IANA 5IQHA 2OBJA 2P2IA 3U4UA 3E8NA 4F9AA 3DDPA 4IVAA 4DFYA 2WNTA 5IQCA 2X7OA 3W2RA 4CRLA 1W98A 3SD0A 2XA4A 3POOA 5LOHA 1YXUA 2CNVA 4QMOA 4GCJA 4NW6A 2IZTA 3AOXA 2OIQA 2ZM4A 3GCUA 4KKHA 1PXNA 4PL3A 1H8FA 4F63A 5CF8A 4DCEA 3SDJA 3AC2A 3IDPA 2X6DA 3C0IA 3PG3A 4KINA 3ATSA 4PMTA 1Q99A 2A0CX 2C0TA 3PVUA 5EOBA 3FZTA 3SOCA 2Y6MA 4LM5A 5ETFA 3ORXA 1OB3A 2BDWA 4I4EA 4CEGA 4MF1A 3PP1A 2O8YA 3THBA 4YMJA 2XEZA 3MIAA 4XG7A 2G2HA 3DKGA 4I41A 3PY1A 3PVWA 5CX9A 5HLNA 3GCQA 4U3ZA 1YXXA 1YOJA 4I20A 1HOWA 3GC0A 2C0IA 2F7EE 3PFQA 3R7VA 3FKOA 2QI8A 3OWPA 2I0YA 3HRBA 3HP5A 4HVSA 1S9JA 4U5JA 5F9EA 5EHYA 3EL8A 4LL0A 4O84A 3F3UA 2WD1A 5EDRA 5A54A 4J99A 5CAOA 5CEQA 3KL8A 2SRCA 3P7CA 5FLFA 3QUPA 3TV6A 2Q0BA 1K2PA 2ZJWA 3MVLA 3ZC5A 2PPQA 2O5KA 4QQTA 4N0SA 4RQKA 3QX2A 5E8UA 2C6OA 3I81A 4W8EA 2UZEA 2PSQA 1U46A 2W9ZB 1J1BA 1R39A 5E7RA 3FXXA 5IKWA 4BL1A 3RPRA 2PE2A 1Q8ZA 4CKRA 5CT7A 4AT4A 1QPJA 4XBRA 2PMNX 5AR3A 1IA9A 3NUSA 2GCDA 4HVDA 1SVGA 4YJTA 2I0HA 3ZS5A 5BPYA 4R5SA 5C4LA 3QQGA 2HWPA 3EN4A 3EFKA 3F5UA 5DN3A 5M57A 2Y6OA 1OVEA 4K2RA 1Y57A 3F5GA 5D7VA 4CKIA 1XH8A 4MX9A 3T9TA 3E92A 3HDMA 4KS8A 4HGTA 4EH3A 3KY2A 3EN6A 5I9YA 3HA6A 4LL5A 4UXLA 3IW5A 3ZOSA 3QX4A 3D2IA 4H1JA 3C4EA 4MKCA 4U42A 1QCFA 3RAKA 5KMMA 2WHBA 3O8PA 5FWKK 3OCSA 4BYIA 3V5QA 2C6MA 2C30A 4DH5A 5JFSA 4XP2A 3LMHA 3UPXA 4D1XA 2O65A 5KMOA 1PY5A 5H3QA 3GQIA 5CWZA 4RJ5A 3MY1A 3DQXA 1GIHA 1QPDA 4KAOA 3VBQA 4QD6A 3VN9A 1NW1A 4A9RA 1G5SA 3NYNA 1NVRA 1XJDA 5AP3A 5DH3A 3TV4A 4HVGA 1YKRA 4CYIA 5FTGA 2I6LA 4K1BA 2C3JA 4NWMA 3ZH8A 4G17A 1J7UA 3FE3A 4ZMFA 3FMEA 4BTMA 5AP1A 2P3GX 5BUEA 3FAAA 2ZB1A 5F20A 4BTJA 1KE8A 4A9SA 5CENA 5EKOA 4D2PA 1CKIA 4BKJA 4FT9A 2BROA 4IFGA 5EHOA 4GT4A 4G3FA 2UZOA 4ZJIA 3IGGA 3VO3A 5AUYA 3HMPA 5IH6A 3A7HA 1GAGA 4TTHB 2UW3A 2WMQA 3HUBA 3FI2A 3P86A 3Q4ZA 3FL4A 3R0TA 2B1PA 4A7CA 1CSNA 4QYYA 4ZY5A 3PA3A 5BNJA 4W9XA 4D28A 4ZTRA 4X7QA 3R7GA 3NUNA 1K3AA 2UV2A 4RFYA 4KB8A 4QTCA 3GP0A 4LUEA 4H39A 3RZBA 1VR2A 3OUKA 3U9NA 2PVKA 5FUTA 3QXOA 5FP5A 4O6LA 3AGMA 3L8XA 2IG7A 4J7BA 3HAMA 4PDOA 2W05A 3QLGA 4F9BA 2QLQA 4ASEA 4WT6A 3DV3A 2CGVA 2R3HA 2XF0A 3DS6A 4N6ZA 3RI1A 4AN3A 2FYSA 2B0QA 3GVUA 2R3IA 1JWHA 1OKWA 1TKIA 3PJ8A 4X2KA 5FDPA 2QU6A 3AC5A 3E64A 4XV2A 1IEPA 4E6CA 3EFWA 4ENXA 4BZOA 3CCNA 4AFJA 2F2CB 4LUDA 5FDXA 4QMMA 3W2OA 3FWQA 5H8GA 4X2GA 3PPZA 3BPRA 5G6VA 3FMNA 4M14A 4L3JA 1XR1A 4EKKA 2PMLX 3F61A 5HTCA 3FLSA 4F7NA 4FTUA 4L6QA 1GZ8A 2GNHA 2OICA 1R78A 5HE3A 3V5WA 2ACXA 2EXMA 4GU6A 5TT7A 3KVWA 3UIUA 2WEIA 2BCJA 3F5XA 5EFQA 2CMWA 5IDPA 2DWBA 1IA8A 4TYEA 1YHSA 3WILA 3F2AA 4DG3E 4OTQA 5GINE 2CDZA 2R3PA 3AC4A 5D9HA 4JX3A 3MY5A 4O7ZA 4FV0A 3F5PA 3BI6A 4YTIA 4AXAA 4O7RA 1Q24A 4G34A 2W4KA 1W7HA 4YZ9A 5BYZA 3TKUA 2Z2WA 4W4WA 4FIFA 3PUPA 4BB4A 4XG9A 1KOBA 4ERKA 3EKKA 3ZUTA 2YCFA 3FSFA 5FXRA 1XKKA 2C5OA 5L2TA 1WBOA 3PIZA 5DI1A 3LVPA 4RJ6A 3DBFA 2UW8A 2F7ZE 2XIZA 5DG5A 2VD5A 3CP9A 3ZO3A 4QMQA 4U41A 2H96A 4I0RA 3HL7A 3LXKA 5ACKA 3MH3A 4BWPA 4E6DA 4FGRA 2ERKA 1H25A 1R0EA 3RNIA 4CSVA 4J53A 3PY3A 5M56A 2C6EA 3D9VA 3MPAA 3L1SA 3H3CA 4W9WA 4BKZA 2PL0A 4E5BA 3SRVB 3TDVA 4QTBA 3KVXA 2C6DA 1GJOA 5B2KA 5EQPA 2WTVA 4FKOA 1V0OA 3Q4UA 5CZHA 4QTEA 4G9RA 3CJFA 3CPBA 3PJ1A 4QQCA 5CAQA 4JL9A 4P5ZA 5J9YA 3KRJA 4IHPA 1OKYA 1NA7A 2J2IB 4LV8A 5CTPA 3SKCA 3FXWA 5EG3A 4BDEA 5TKDA 4L01A 3VULA 3UPZA 4E6QA 4EQUA 4FIGA 3R71A 4ZY4A 5AAEA 3SXRA 4FTTA 4NM7A 1OIQA 3QZHA 3IOKA 2IZUA 3C4FA 4FKJA 5CSPA 4MQ2A 2VN9A 2YIRA 2V7OA 2CKPA 4WKQA 3NNWA 3U55A 1HCKA 3Q32A 1ZY5A 4JG8A 3RPSA 2JAVA 1IRKA 5IUGA 4V01A 3QFVA 4O1PA 4F6UA 1BMKA 3PIYA 2J5FA 3KMUA 4CZTA 1URWA 3FMDA 3IK3A 1OPJA 3KXXA 3LCDA 4G3DA 4AUAA 5KMNA 1GY3A 2NP8A 3OW4A 5IF1A 2YCRA 4YHTA 4V05A 2XIYA 4YBJA 4BTKA 1DAYA 1KE6A 4G3GA 3AC8A 4QP4A 2FH9A 2C4GA 2WKMA 1QL6A 3M11A 5HG7A 3VRYA 4HNFA 4C0TA 3QQUA 4XUFA 2HIWA 3R00A 2YWPA 3HEGA 3SXFA 3GEQA 3RK7A 3DKFA 5EI2A 5AADA 1OIUA 4M67A 1OZ1A 2R3KA 3A7FA 4X0MA 5JMSA 4XV9A 4ANBA 3K54A 5AA8A 1UV5A 1WVYA 4D9TA 3ZC6A 2YDJA 4RQVA 4F1OA 3E3PA 4NYEA 3EB0A 3ZO2A 3LIJA 3R7UA 4ZS0A 4BHNA 4Q5HA 5IA4A 2E9UA 3UO5A 4FL1A 1O9UA 1ZYLA 4OTWA 1M7QA 1OM1A 4PMSA 3HKOA 1PXLA 4J52A 3N4VA 3QRUA 2AC3A 4AG8A 2OXDA 3ALOA 2F57A 3TIZA 2B54A 1JKKA 2IO6A 4IVDA 4HW7A 5BUJA 4DFNA 4BF2A 2XNPA 5CF4A 1Y6BA 4AP7A 4E5AX 5CF6A 3UQFA 3P4KA 1Q8UA 4B7TA 4YURA 3DAKA 2J0MB 1NT2A 3G0EA 3EYHA 3MS9A 3QWKA 3TZ9A 3MA3A 1W0XC 3GOKA 3HVCA 3RK5A 3Q6WA 4LRJA 4HNIA 5EM5A 1DS5A 4O2ZA 5LVNA 2OJIA 5E8YA 3I5ZA 2IW9A 3IW4A 3VQUA 4PWNA 4A06A 3C5UA 4LMUA 1ZYDA 3JUHA 4BDJA 4R7BA 3ZUUA 5ICPA 5DYJA 3MIYA 3R6XA 3ANQA 5E9EA 3NRMA 1UWHA 3QCSA 2XIRA 4U79A 3NLBA 2W5BA 3EHAA 4AW5A 4QO9A 4P2KA 5D1JA 3UDBA 3NUAA 2UVYA 1UU8A 3FPMA 1WBPA 2IZSA 2IPXA 4EJ7A 5H2UA 3ZRLA 3U51A 4GFGA 3DA6A 3E7VA 3BYMA 3QD2B 4FG8A 3LMGA 3NNXA 5BVEA 3HYHA 3Q52A 1GZOA 5ETCA 5HTBA 1WBWA 3T9IA 3W2QA 2C1AA 4KUJA 1YDRE 5DBXA 3UNZA 4XLVA 5E8XA 3FJQE 3PY0A 3VF9A 4CTBA 2RKUA 3ODZX 3ZBXA 3NW5A 4UMPA 1GIIA 1ZY4A 4TT7A 5CT0A 1M2PA 3ORIA 4NJDA 5K4IA 3CXWA 4IB5A 1MQBA 3QCXA 3QCYA 4MAOA 3L9MA 4E4NA 1J7IA 5CEOA 4JRNA 3V51A 4EH7A 2QR8A 3NYXA 3OOMA 4D2SA 3NCGA 3R2BA 4G6LA 4L8MA 2ZMDA 4AGDA 1H0VA 1GNGA 4CFVA 3SHEA 3LJ0A 3EQRA 4YZCA 2P4IA 4YPSA 3UGCA 4HZRA 5JSMA 4YO4A 2GU8A 4XHKB 5J5TA 2OH4A 4W4YA 4YC6A 4ZAUA 1A48A 3R9HA 4XP0A 1O6KA 2PZYA 5HD4A 3ORNA 4N4SA 3BHVA 3R8MA 4QPSA 5AP7A 2QONA 2UZDA 4FVPA 4IX4A 3UG2A 4FSUA 3F9NA 4NJ3A 2ZYBA 3VVHA 2UZTA 3UO4A 5I9VA 1I44A 4WUNA 3GB2A 4USDA 3VIDA 3S00A 4FKGA 2YIYA 3R83A 3QYWA 4DA5A 3WI6A 4GT3A 3AT2A 4YZBA 3ZO4A 3KA0A 4E93A 4NCTA 3BYOA 4OTPA 4PY1A 2JIUA 4MWHA 2VTPA 2ZM1A 3VBXA 3OCTA 3DKCA 3F69A 3ACKA 4UX9A 1JPAA 3PXQA 2FO0A 2PU8A 4QP6A 2CKEA 5HLWA 2JKMA 4GL9A 4RMZA 4CXAA 3PXKA 5HO8A 3NSZA 4EOOA 3IOPA 5LWNA 3VS4A 5JEBA 2ITPA 4FSMA 3NAXA 3HP2A 4ANQA 4RG0A 3A60A 3ODYX 4D4VA 3GFEA 4IB0A 4X6RA 4PNKA 4FSRA 1BYGA 4Q9ZA 3RM7A 1ZARA 5E8SA 5HD7A 2C5XA 3GC7A 4C33A 2BMCA 4HGEA 4X2JA 3KRLA 4GUEA 3LM5A 4PL4A 4LMNA 4Q2AA 5E1SA 5H9BA 4K18A 5HBEA 4EH9A 3VBTA 2VX1A 3FQEA 2VTMA 3M2WA 4Y72A 3LLTA 3NUYA 4GG7A 4V0GA 5I9ZA 5A4TA 2IW8A 4OR5A 4AA5A 3NEWA 5F94A 3GU5A 3EN7A 1YI3A 3EN5A 5JZNA 3EQFA 3CQWA 3A4OX 4FTCA 4YJRA 4AZFA 2BALA 4YJQA 2BPMA 4G16A 2JFLA 3E93A 2ITWA 5IQFA 3VS7A 5HO7A 5C8NA 5L6OA 1PF8A 3K5VA 5HLPA 3QA8A 5D41A 3BU3A 2YWVA 5AP2A 3QQFA 2CNUA 4EUUA 5J1VA 3Q9WA 3N4UA 2BZHB 3BE2A 4BCJA 2J0LA 3DTCA 3PJ3A 2GQGA 4CLIA 4DLJA 2FB8A 2VTHA 5E4HA 4OBOA 5D12A 2A4LA 2C6IA 3DBDA 4RGJA 4FSNA 4NW5A 4FIEA 4YC3A 1V1KA 4RC2A 4XMOA 5AIKA 3B8QA 1R0PA 2QOOA 3Q2MA 4E3CA 4IWDA 4EOJA 4X3JA 3ZO1A 4M12A 4B9DA 5HQ0A 3QUEA 4JDHA 5AAGA 4AE6A 4NK9A 2UZVA 3E8EA 2BTSA 4ZS4A 3R22A 3NIZA 4QMLA 3H9FA 4EK5A 2RG6A 2YM6A 3EFJA 4C3FA 1L3RE 3A8WA 2W1FA 3GUBA 4XLIA 2EB3A 3F66A 5DT0A 3U6JA 4TYGA 5AP0A 4DBNA 3H4JA 5IEVA 3LQ5A 4IM0A 2HZ4A 3HV7A 3AMYA 3R7IA 3KXZA 3EL7A 4ACHA 4GIHA 5BVFA 2ZB0A 3BLHA 3DNEA 4F6WA 3VBWA 2HWOA 2ESMA 4D4YA 4E6AA 2R3LA 5FRIA 3DAEA 5EHLA 1ZYCA 3NIEA 1SVHA 3MWUA 4FKTA 4FZ6A 4OBQA 5EYMA 5JGBA 5A6OA 3GCSA 5AP6A 4ITHA 3PLAE 2X2MA 2C5YA 2CPKE 3ORKA 4MBLA 3V5TA 5FM3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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