5GNYA

The structure of wt bgl6
Total Genus 176
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
176
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
SYRFPEGFLWGAATAAYQIEGSSMADGAGESIWDRFSHTPGNMKDGDTGDVACDHYNRWREDIELMKRLNLQAYRFSVSWSRVIPQGRGAINPKGLAFYDRLVDGLLEAGIEPLATLYHWDLPAALDDRGGWLNPDIADWFADYGQVLFEKFKGRVKTWGTINEPWVIVDGGYLHGALAPGHRSAYEAVIAGHNVLRAHGAAVRRFREVGEGQIGIVLNIEPKYPASDKPEDEAARRRAEAQMNRWFLDPLMGRGYPEELTDVYGAAWREFPKEDFELIAEPTDWMGLNWYTRAVPENAPDAWPTRSRPVRQTQHAHTETGWEVYPPALTDTLVWLSEQTGGKLPLMVTENGSAWYDPPHAIDGRIHDPMRVHYLQTHIKALHDAIGKGVDLRGYMAWSLLDNLEWSLGYSKRFGIVHVNFATQERTIKDSGLLYAEVIKTHGDVLNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Structures of a glucose-tolerant beta-glucosidase provide insights into its mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Metagenome
total genus 176
structure length 448
sequence length 448
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2016-07-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5gnyA00
4TVCA 4NZCA 1C8YA 1MW0A 5E0CA 2XGIA 3WH6A 2Y8KA 7CGTA 1GOKA 1CGTA 4P7NA 3AZSA 5C70A 3WUGA 1UR2A 1DWHM 1H2JA 3CHFA 5E0FA 4JHOA 2V5CA 1JXKA 3MV11 4PMRA 1JFHA 1US3A 3AMKA 5TD4A 3CZLA 2FGZA 2GJXA 4N42A 4PMQA 4S3JA 1O7AA 2VZSA 4AZGA 3VDBA 3UCQA 3VDAA 3QOMA 4EK7A 1DTUA 2PC8A 2WBGA 1E56A 3B8SA 2BXZA 3VGDA 2G41A 4DUWA 5A6KA 1QHPA 1GHRA 3WDJA 3W24A 2XVGA 3RILA 1UWQA 4QLKA 1F4AA 5LA0A 4CD4A 4MB3A 1J18A 2CKRA 1GVYA 1W3HA 4M82A 1JZ8A 4ZFMA 4H2CA 2XYLA 1V0LA 4JL2A 2YA0A 3VUPA 4PUDA 3WH5A 3AHTA 4F8XA 1LQ0A 3AS3A 3DYOA 2XFRA 2OWCA 3SUWA 4D6HA 1TA3B 2W67A 1P6WA 1EDGA 3IJ8A 3BAIA 4OIFA 1KWKA 1W3LA 5A2BA 1B3WA 1JGIA 3CHDA 2F2HA 3SCVA 2FH6A 4MJ4A 1JYVA 4IM4A 4LYPA 1CEOA 2X1IA 2VUYA 1E1FA 4TOQA 4MNKA 1XD0A 1EO5A 3WF1A 3O6AA 4E2OA 5IHSA 2O9OA 3ARVA 5IFPA 2DSWA 1C90A 3I3DA 3WDRA 4J3WA 4UFJA 1D7FA 5IXEA 2V3DA 3RM9A 3CLWA 3GXDA 3UERA 4JKKA 4WSKA 5ABEA 1E6RA 3PZVA 4HMEA 2VX6A 5IFTA 2XTKA 1UD6A 1CXKA 1N82A 2VRJA 3AS2A 1DWGM 3UR7A 1IZJA 1GW1A 3WD1A 3CH9A 3VD7A 3A4XA 4XV0A 3VOCA 1GHSA 1G94A 1OCQA 1V0NA 1E71M 2WANA 5KEZA 3VD3A 4MDOA 4HOXA 2W61A 3RDKA 3ZSSA 2E9MA 3WQ8A 1L0PA 1UYQA 3EMCA 1GONA 4TTGA 2XIIA 4UQAA 2A3EA 1J01A 1JNEA 3BAKA 4XX6A 5D9OA 1US2A 1JF6A 2G8ZA 1KXQA 5JBFA 2D0HA 4UFHA 1V08A 3VIGA 3WD2A 3ARXA 4U2YA 3GH7A 5ABHA 5CPTA 4PMYA 1W9DM 2GSJA 1CLXA 2J7DA 4P8VA 4CN1A 3PZQA 2AMGA 2J7EA 3VIPA 2BV9A 3MV01 2EPMX 1C8XA 5DO8A 1DEDA 2EXOA 2YA1A 3POCA 4D71A 4PCSA 2WC4A 1GOOA 3ZJ7A 1G9HA 2WCGA 3FXYA 1PX4A 1WP6A 1FOBA 5EFDA 3M6DA 4P8UA 2ZUUA 2VCAA 2FHBA 2EPNA 2W91A 2YDSA 3VGGA 2EJ1A 4B9YA 2ZUTA 2J47A 2GFTA 3FN9A 1JZ7A 1SR0A 3VX0A 2VMFA 3AYRA 1NOWA 1KQZA 4ZE5A 3VU2A 1UA3A 1XH2A 2JF6A 2QLYA 3BMWA 2J4GA 4RE2A 2GK1B 3WF3A 1RP8A 4HMCA 1EQCA 1WAWA 2FH8A 1MVYA 3GNPA 3I3EA 3N12A 4KGJA 1WO2A 1PEZA 2WNWA 1UKSA 2JIWA 2WM0A 4FLRA 2D0GA 1JYNA 8CGTA 4HU0A 3W0KA 1DWFM 5I5RA 1VAHA 3VVGA 2UY4A 4U2ZA 4B3KA 1H3GA 4N0RA 1ZBCA 1ISZA 4WK9A 1E73M 4PMVA 3HMCA 4J3XA 3N11A 1QHZA 2WB5A 1HJSA 1G5AA 3SCQA 2VVNA 4KWUA 3L4ZA 3THDA 2XSAA 4MPKA 1M04A 2MANA 4Z2GA 4FMVA 3AHVA 2PWEA 4EKJA 1MXGA 1H09A 4QP0A 5A8MA 3NCOA 1KBBA 3WEZA 4GQQA 2O9PA 3BXWA 5CSUA 1NWUA 3WNPA 4U5KA 1V6YA 4CCEA 4UFMA 1E3XA 2C8NA 1CTNA 1QNSA 4V28A 1UWUA 4PMOA 1J0IA 1AQMA 1C8QA 3MS8A 3EDDA 3WY1A 3CUGA 1E6QM 4JFSA 2VT0A 3ZR5A 2PWHA 3CTTA 3MUAA 1UR8A 4W8LA 3PZGA 1VBUA 4AD3A 2WC3A 3OGVA 2E8YA 3WQ5A 3MKKA 2PBOA 5I77A 2PF0A 3VTRA 2CHNA 5M5DA 4LX4A 5CQ1A 1J0HA 4L4OA 2JIEA 1IT0A 1MFVA 3LPGA 2OSYA 4NRRA 1KWGA 3W29A 4HA4A 6CGTA 4AXNA 1VENA 1JYXA 4Z2HA 1E0WA 1TVPA 1TA3A 1QW8A 2CETA 2PBGA 4V2XA 1OBAA 1XGZA 1TMQA 4OUEA 4IUGA 1JDAA 5A94A 1XD1A 3B9DA 5GPRA 4GQRA 4AEEA 3S2CA 1UD8A 1UKOA 1E70M 4MDPA 5I78A 4UQDA 1QNOA 2BY2A 4W5ZA 2WWCA 3N9KA 3VIKA 4AD0A 3AIVA 2Y24A 2J8FA 2CERA 1Z32X 3UESA 5FL1A 2GVYA 3VGHA 1XRVA 2DH3A 3WNLA 4F9JA 3U5YA 2ZUVA 5A8NA 2CKSA 2JF7A 1FHDA 1W1TA 3A4AA 1EH9A 4P8WA 2J8GA 4UQCA 1J0ZA 4D1JA 5BWFA 2UY5A 3MMUA 5M3WA 1KR0A 1VFUA 2WYSA 4PUEA 1ITXA 4JCLA 3WNOA 3CMJA 1J9YA 3A47A 3IAPA 3LPFA 4YHGA 3M7SA 1V3KA 1QI3A 4LXFA 3ZJ8A 1H0IA 2PWGA 1QNPA 2VVSA 3A3HA 1W9UA 3AMDA 4M56A 2PWFA 3N04A 1BTCA 3WBAA 3UR8A 3ZT5A 3ZIZA 2ZOXA 2Z1KA 1E4IA 4CKQA 2G3NA 4ACZB 2CXGA 3CZEA 5CG0A 3AMGA 1EHAA 3VD5A 4Z2JA 5I23A 1NWRA 1WPCA 1W2PA 1NARA 4WF7A 4F79A 4FLOA 1KXHA 2WMIB 3ARSA 3EDJA 2VQUA 3PZMA 1BVNP 1HL9A 3WD3A 1WDQA 1HNYA 3UETA 3L4VA 1MWOA 3AZTA 3K8MA 3PTMA 5D9PA 4GO8A 3KE0A 3WDQA 1B0IA 3W37A 5HXMA 2ZUSA 4H04A 3WNMA 4YHEA 2DT1A 5GNYA 4F9DA 4NSBA 3WKZA 1CGWA 3BAYA 4P7QA 5I0DA 4UFKA 3MU7A 1ZBKA 4F66A 5A6AA 2YLAA 4UFIA 3U57A 1QNRA 3ZSTA 2ZIDA 1OGSA 2CYGA 2EBNA 4BF7A 1V6UA 2A3CA 4RL3A 1NOFA 1C93A 1CXIA 4JL1A 1E6ZA 2XM2A 4C7FA 1HT6A 4CCDA 2DT0A 3CUJA 3KL0A 4QCFA 1V6WA 2Y4SA 2ESCA 1E1EA 4MNLA 3FHAA 3W25A 1Q4NX 3ARYA 4OKDA 4WKHA 1B1YA 3BGAA 3II1A 3WEOA 2V38A 1HJXA 2GK1A 1H4PA 4Q22A 3TTSA 4FLQA 4CVUA 1X6NA 2E8ZA 3AS1A 1J12A 1R7OA 4EANA 3DHUA 2E9LA 1XYZA 2WVUA 4WIWA 3WF2A 2VZVA 4S3KA 3CO4A 3QGVA 4JAWA 1V02E 1DWJM 4K68A 1UWTA 1BVZA 4CU8A 1UH3A 2WLZA 1HVQA 1MQPA 5AC4A 2J75A 4AZ6A 2J25A 2V3EA 1BGAA 4NRSA 5AYIA 2YBTA 3VNYA 3RIKA 3G6MA 3VILA 4GI8A 3AQUA 3TTOA 3NSNA 2D20A 2VRKA 2XSBA 3KWXA 2WCAA 3N15A 4AZCB 3VIMA 4OBSA 4XZBA 1LL4A 4HOWA 4HA3A 2GUYA 1TUXA 2D2OA 3TA9A 1J0YA 4PCTA 4J3TA 1UQZA 3EMQA 1WZKA 5FKYA 1RPKA 4JZ5A 3FW6A 3RO8A 2J74A 3OLDA 1EHNA 3W26A 3QR3A 2OYMA 4UZSA 1VBRA 1E6XM 1E4MM 1ZJAA 2WHLA 2YL9A 1G1YA 4M81A 1S46A 5BROA 1KCLA 3WD4A 3CMGA 2DH2A 1D2KA 2FDMA 3AICA 4BA0A 4FLSA 1ECEA 2E0PA 2QF8A 4HZ6A 1GZJA 2VCCA 1CWYA 1E40A 2WMHA 1GJWA 1UWIA 3GM8A 4C7DA 2VTFA 5CZKA 5I6SA 1W1VA 3WL1A 3QHMA 4PN2A 4GINA 2XWDA 2WHMA 1JD7A 3FAWA 1W91A 4YPJA 1ZS2A 2ZXBA 3K4DA 1OWQA 3D3AA 5D4YA 1UQYA 2C0HA 4CD5A 4UZUA 1JD9A 4J27A 2E9BA 3UG4A 1NWTA 4NI3A 1E0XA 4IPNB 4J3VA 1I75A 1MFUA 1WDPA 3VMOA 1QI2A 2YKKA 5D8ZA 1ISWA 3WUBA 1EXPA 5BYWA 4MAVA 3SUSA 4U3AA 1UWSA 3MUZ1 3RPMA 4CN4A 2XHYA 1KGUA 3PBGA 3T0AA 4J3UA 6TAAA 3ZOAA 1W1YA 4PEEA 4JHZA 1CECA 2DSZA 4AD2A 2HISA 1XH1A 3N17A 3CPUA 5M03A 4MB1A 1UWRA 1JDDA 1E72M 5I3DA 1FA2A 5GNXA 3BAJA 2G3IA 1H0GA 2XFFA 1QBAA 3ZT6A 1ESWA 2VR4A 3UG3A 1UZ1A 1QVBA 4AZIA 2RGLA 1AMYA 1UR4A 3WNNA 3PTQA 1HJUA 2VO5A 1C3FA 2BY3A 3T0BA 3WUEA 5D9NA 4AZ7A 3WFLA 1JZ6A 1GCYA 1JZ4A 4Q7NA 2WAGA 4UOQA 4D1IA 1HJVA 1WDSA 1MW2A 1OIFA 4KH2A 1J0JA 4DM2A 4R5EA 1R85A 3M46A 3DC0A 4ACZA 5HBFA 1JG9A 4HZ7A 5DT5A 1FP9A 1HVXA 1FFRA 4W88A 3VO0A 1PBGA 1GPFA 2XPKA 4WKAA 1JL8A 1GNXA 2WSKA 3APGA 4W93A 2WC7A 3VM5A 4B9ZA 2WMIA 2OSXA 2ZUNA 1K9DA 1ISVA 1KXTA 3TONA 2BVTA 2W5FA 5A6BA 4W7WA 4CU7A 4P7LA 4D6GA 4ZE4A 1GJUA 2ZXQA 3N13A 4D6FA 3ZT7A 5EBAA 5BXSA 2WVTA 2XVNA 1M03A 3WQ6A 1EQPA 3T09A 3SCSA 2W62A 3T2QA 2OLHA 4H7VA 4LQ1A 3WDIA 1JZ5A 4WJXA 5DF0A 3GNOA 4KRUA 3HU7A 2VQTA 3M07A 2VZTA 4GZIA 1KBKA 3WN6A 3IAQA 4U31A 4CGTA 3RJXA 1OD0A 3CZGA 1PX8A 5E9AA 5DT7A 1EDQA 3GH5A 2J79A 3S6TA 1EOMA 1QHOA 2WKLA 5DEZA 2WLYA 3WUFA 1HIZA 4H8HA 1V02A 5A1AA 1W9BM 5LA1A 1C92A 2J7HA 4UQBA 1EDTA 4MJ2A 1UD4A 2WMJA 2WMKA 4KGLA 1OM0A 2VRQA 4ZXLA 3AZRA 1XYFA 3T2OA 1NH6A 3AFBA 3OBAA 4BZYA 4GO9A 3ZMRA 1A3HA 2CBJA 4P7RA 4QLLA 1LWJA 4P7OA 3WFZA 1L8NA 3IJ9A 3POHA 3ARQA 4W86A 1CXEA 4TTUA 4IISA 2UWFA 2YDRA 3ZO9A 4AD1A 1JZ3A 4GI6A 1ZB5A 1KXVA 3K4AA 1UR0A 4WSJA 3SCWA 3ARWA 4TXEA 3RCNA 4AZCA 1R87A 1YQ2A 1PPIA 1UKTA 2X2YA 3U7VA 2D3NA 3CZKA 3BH4A 4B3LA 1EA9C 4WKFA 3PZIA 4KMQA 2D24A 3AIWA 3GBDA 1E5NA 3B9EA 1VFOA 3G6LA 2ZWZA 1DHKA 4DWSB 3GYCA 2G3JA 3TTYA 2E4TA 1XHGA 5A69A 5CSYA 4GI9A 1W1PA 2XFYA 2OYKA 2J7GA 3AYSA 5A8OA 3GXIA 4AIOA 1U30A 3W28A 3OIHA 1GQKA 3AIUA 4AW7A 1OGBA 5A6SA 5AC5A 3DHPA 3BCDA 2D23A 1RH9A 2YJQA 1GOQA 3GZAA 3O9NA 2WVVB 3O2LA 3WENA 2BHUA 1B3XA 2G4FA 3VGFA 1CGXA 1ITCA 1XSJA 4CD8A 1X1NA 1MW3A 2YL6A 3WQVA 2E3ZA 3EDEA 4GKLA 1CGUA 4D6JA 3OLGA 5EB8A 1YHTA 4HOZA 1SMAA 3DYMA 9CGTA 4AIUA 1GQJA 1U33A 2VZUA 3AXHA 4UQEA 1KB3A 1UH4A 3UEQA 2X0HA 3SUVA 1BAGA 1WCGA 4D6CA 1BPLB 1ISYA 1K9EA 3WH8A 3SCTA 2ZX5A 1UR9A 1BF2A 1UR1A 3WH9A 3CUIA 1UZ4A 1PX3A 3FNDA 2O9TA 1JYWA 4Y7EA 3OG2A 1TG7A 3SUTA 3MSGA 1NOUA 1W3JA 4LGXA 3AS0A 4QAWA 1ZBVA 1B2YA 1LG1A 4TX6A 5FCZA 4U33A 3JUGA 1OB0A 3AXXA 3SUUA 3RJYA 2JE8A 4AZ5A 3N18A 3VIJA 4HP5A 2WW5A 3GBEA 3ARZA 4UCFA 1ISXA 4HTYA 1K9TA 2QHAA 4OJYA 3WD0A 6A3HA 4D6DA 2HVMA 3VKKA 3WL0A 2VURA 1CBGA 2EQDA 5HPOA 1I1WA 2WBKA 5D8WA 1VEPA 4UOZA 3W6MA 5BXTA 2UY2A 3AISA 2BS9A 4OOZA 2XWEA 2RGMA 4D6EA 1KQYA 1GQLA 1GOWA 1BHGA 3GTNA 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3VDCA 2OSWA 1Q6GA 1K6AA 4AISA 1LL7A 4ATDA 3VIFA 1JDCA 4OBRA 4HPGA 3TP4A 3T2PA 4LYQA 4DWSA 3TTQA 3EDKA 4QLJA 1FH9A 3MANA 4ML4A 3VIIA 3ALFA 3BLKA 1E43A 5CGTA 1OGGA 4UNIA 2D1ZA 1CGVA 1ZJBA 1BYCA 5HDRA 1H11A 4LPCA 1O6IA 4U3CA 1KFWA 3W81A 1ODUA 4D72A 5BXPA 1CXHA 4Z2KA 2E40A 1AVAA 4GZJA 1HX0A 2WVVA 2ZE0A 2CBVA 1JF5A 1TR1A 1FHLA 5A6MA 5HNNA 1V6VA 2V5DA 1AQHA 2EPLX 2ZXAA 4ATLA 2XGBA 5IHRA 1LLOA 1IZKA 1MYRA 3CZJA 1HN1A 4M29A 2W63A 5A2CA 1GUVA 2WVSA 1TVNA 3K8LA 3VD4A 1E6SM 3L4UA 1VB9A 5D9MA 1CENA 1E6PA 2FHFA 3VX1A 1WB0A 2CESA 4XZWA 1HP5A 4A3HA 2BY1A 2VL4A 1Q6FA 4M80A 3SIMA 4BCEA 1MQQA 1JI2A 3BMVA 2J7FA 1PZ2A 1ZU8A 4M1RA 4B16A 4W87A 1B90A 3HJEA 4MADA 1R86A 3L4WA 4GXPA 4AYSA 2WMGA 3QOKA 4KRTA 4X0VA 3OB8A 1H49A 2WXDM 3GXFA 3DECA 4AIEA 1CNVA 2A3BA 1CGYA 4J28A 1H5VA 5E09A 4J7RA 4M8UA 2X05A 1B31A 3PHAA 1V03A 4U5IA 2WZEA 3W27A 4MB5A 1BGGA 2DT2A 2WK2A 2XVLA 2ZUMA 3VIOA 4TVDA 5I79A 1VFFA 2DSUA 2Y8VA 4CN6A 1XV8A 4L4PA 4P8XA 2WMFA 1OD8A 3ZQ9A 3ECQA 4JFUA 2A3HA 4PTWA 4AC1X 2XVKA 2VCBA 4ZENA 4XUYA 5DFAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4TVC A;  4NZC A;  1C8Y A;  1MW0 A;  5E0C A;  2XGI A;  3WH6 A;  2Y8K A;  7CGT A;  1GOK A;  1CGT A;  4P7N A;  3AZS A;  5C70 A;  3WUG A;  1UR2 A;  1DWH M;  1H2J A;  3CHF A;  5E0F A;  4JHO A;  2V5C A;  1JXK A;  3MV1 1;  4PMR A;  1JFH A;  1US3 A;  3AMK A;  5TD4 A;  3CZL A;  2FGZ A;  2GJX A;  4N42 A;  4PMQ A;  4S3J A;  1O7A A;  2VZS A;  4AZG A;  3VDB A;  3UCQ A;  3VDA A;  3QOM A;  4EK7 A;  1DTU A;  2PC8 A;  2WBG A;  1E56 A;  3B8S A;  2BXZ A;  3VGD A;  2G41 A;  4DUW A;  5A6K A;  1QHP A;  1GHR A;  3WDJ A;  3W24 A;  2XVG A;  3RIL A;  1UWQ A;  4QLK A;  1F4A A;  5LA0 A;  4CD4 A;  4MB3 A;  1J18 A;  2CKR A;  1GVY A;  1W3H A;  4M82 A;  1JZ8 A;  4ZFM A;  4H2C A;  2XYL A;  1V0L A;  4JL2 A;  2YA0 A;  3VUP A;  4PUD A;  3WH5 A;  3AHT A;  4F8X A;  1LQ0 A;  3AS3 A;  3DYO A;  2XFR A;  2OWC A;  3SUW A;  4D6H A;  1TA3 B;  2W67 A;  1P6W A;  1EDG A;  3IJ8 A;  3BAI A;  4OIF A;  1KWK A;  1W3L A;  5A2B A;  1B3W A;  1JGI A;  3CHD A;  2F2H A;  3SCV A;  2FH6 A;  4MJ4 A;  1JYV A;  4IM4 A;  4LYP A;  1CEO A;  2X1I A;  2VUY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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