5HBFA

Crystal structure of human full-length chitotriosidase (chit1)
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
452
structure length
424
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLQDTFCQGKADGLYPNPRERSSFYSCAAGRLFQQSCPTGLVFSNSCKCCTWNLVPRGSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitotriosidase-1
publication title X-Ray Crystal Structure of the Full Length Human Chitotriosidase (CHIT1) Reveals Features of Its Chitin Binding Domain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 137
structure length 424
sequence length 452
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-12-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
A PF01607 CBM_14 Chitin binding Peritrophin-A domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 5hbfA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5hbfA01
1HX0A 4ACZB 2GDUA 5AC5A 4JFTA 3AIQA 2C0HA 5E6YA 3SUWA 1MXGA 1B31A 5HOSA 1NWTA 4ZE5A 1KXHA 1H49A 1DWIM 2NT0A 1PAMA 4AD1A 3BAYA 3AXIA 1RD6A 1KXVA 5JBDA 3TONA 1FHLA 1E0WA 2VVNA 1L8NA 1LF1A 3SCRA 6A3HA 1MWOA 2DIEA 3FXYA 1EH9A 3WNLA 2XG9A 1JDAA 1NP2A 1MQPA 2PBGA 4UTFA 4V27A 1HP4A 2RGLA 2E8ZA 2GJXA 2EPNA 1M53A 4D6DA 4DM2A 3K46A 4ATWA 4PEEA 4JFWA 3N15A 4IM4A 4KWUA 4MDOA 4W7VA 4UQBA 3J7HA 3UESA 1OM0A 2D24A 4E4PA 3EYPA 1WE5A 4M24A 3RMEA 2YA1A 5HPOA 3WF0A 1LWJA 2WMJA 4MB3A 1JZ8A 3LPOA 2BHYA 4J27A 1H5VA 1WAWA 2OSWA 4AZ6A 1E3ZA 9CGTA 1XGZA 1JZ6A 1M7XA 2VCBA 4H8UA 2W61A 2ZXQA 1GNXA 3GBEA 5AY7A 5BROA 2W67A 2ZUWA 2ZXBA 1NOWA 3RM4A 4UFJA 3CHEA 1V3KA 1E6PA 1BYCA 1JXJA 1W1YA 3BLKA 4HTYA 1L0PA 4V2XA 1XH0A 1E72M 5F7UA 2O9PA 3RDKA 1FH8A 3UG3A 1JGIA 1HVXA 3CZEA 4ACZA 3EMQA 4CKQA 2WSPA 4ZE4A 1US3A 1H3GA 4KGLA 5CQ1A 3FN9A 1JD7A 2UY5A 2WKLA 5CG0A 3ARQA 2PWGA 4QLLA 3OGSA 3LPPA 3WDJA 2YA2A 1XSKA 1H1NA 2DT3A 1K9TA 1LLOA 2DSKA 1ODZA 1VF8A 3WQVA 1EQCA 1KGUA 4JCMA 5IDIA 1OD0A 4K68A 1BYBA 3N12A 1AQHA 1E0XA 3BAJA 4FLQA 4OJYA 3SUVA 4GI9A 1E43A 4MAZA 2CESA 1UR4A 3AMLA 1OWQA 2WLYA 3T08A 1BF2A 3BGAA 1EO7A 4LPCA 2G41A 3UERA 2F61A 3VDAA 4KH2A 1JNEA 2E3ZA 5I78A 3SCTA 3OG2A 3S6TA 5LA2A 2WCAA 5FD0A 3GNOA 2VI0A 3LMYA 3AIEA 2WMFA 5IFPA 3S2CA 4J28A 3ZJ6A 5BRQA 3WH5A 1C7SA 3KWXA 3VIJA 3NDYA 1ECEA 3EMCA 2CEQA 4TVDA 3OB8A 1V08A 5GNZA 4HOZA 4D6IA 3GXIA 2Z1KA 1JDCA 1BSIA 2YL6A 2PBOA 1CXKA 3GXFA 3VGEA 2WHKA 2VURA 2A3AA 4XUYA 3W4RA 3L4YA 5A8NA 5A2BA 1LL6A 2D0GA 4DWSB 5I23A 1ZBVA 2D3LA 2VUYA 1HL9A 1P6WA 3QGVA 2WCSA 3T2PA 5IXEA 1WDPA 2VZVA 4A3HA 3WDPP 4RE4A 1OINA 1LL4A 4IPLA 2PWHA 2WMGA 2BY3A 2WKGA 3WDRA 1M04A 1YQ2A 2V3FA 5LA1A 1KWKA 4D1JA 2VX5A 1H4PA 2GDVA 2ZXAA 2A3EA 3CHFA 2PF0A 2OSXA 3K8KA 1UUQA 4MB4A 1OB0A 3VX1A 1K9DA 3D5HA 1R87A 1XD1A 3DECA 2IXVA 3MO4A 1BG4A 2Y5EA 1PIGA 2X09A 3VNZA 4DM1A 1H2JA 1J12A 1V6WA 3QOMA 1JNDA 4CU8A 4ACYA 5M03A 1FP9A 3HJEA 1E6RA 1Q6CA 1VBUA 2DSWA 2WVUA 3GH5A 1FP8A 3BLPX 2DDXA 3VILA 1JD9A 3F4VA 4AD4A 5A8OA 1JDDA 2V3DA 3PZ9A 3CGTA 3RO8A 1E5JA 2D0FA 3IAPA 3WELA 3L4VA 2YBTA 3AROA 3QOKA 3PZMA 5IFTA 1B9ZA 4PSPA 3WH9A 2JF7A 2A3CA 2DQXA 3WFLA 2BV9A 3SIMA 5EFDA 4PBGA 4U31A 4MDPA 1Q6EA 5GQBA 4NSBA 3EDKA 1IZKA 4DUVA 2JEPA 4PMZA 1HJWA 1LWHA 2G4FA 1WPCA 3VM5A 2J62A 2X0YA 3W6LA 5JIPA 3AMKA 4H8HA 2WBGA 1J0YA 2OWXA 4DWSA 2QMKA 1ZJAA 1GOMA 2WK2A 4QLKA 3W38A 2J7CA 1EXPA 2C8NA 4J3SA 1UKQA 3AOFA 1GZJA 2QHAA 1US2A 1C93A 3ALFA 2FGZA 3VIFA 4D1IA 4PTXA 3F5LA 3CHCA 3A4WA 1W9UA 1CDGA 2X1IA 4TOQA 1CGXA 4HMDA 2J77A 4AZCB 4W84A 3UETA 4OIFA 3ALGA 1LL7A 2CBUA 3CUHA 4JHOA 4P8VA 2O9RA 1OIFA 4PMQA 4PMXA 4V28A 1ZU8A 4AEFA 4NI3A 3O9NA 2WC7A 2WWDA 4J7RA 1BYDA 3NCOA 1C8YA 3UEQA 5JIWA 1KQZA 3AZSA 1RP9A 3VMNA 2ZX6A 3NDZA 4PCTA 3GM8A 3WEMA 2EPOA 5CGMA 1KFWA 2XGIA 3PHAA 1SMDA 3VMOA 4ATDA 3VNYA 5C8BB 4TUFA 2J7HA 1UH3A 1EDTA 5A6BA 3A3HA 1V3HA 3CMGA 5A6SA 3NIYA 1WCGA 4P8WA 3CZLA 1EGZA 1QNSA 3TP4A 3ZIZA 2J7GA 1CGUA 3VGGA 4WF7A 4TTUA 3WH7A 3VD3A 4F9DA 1ZBKA 1G01A 1PBGA 4UCFA 5EB8A 4A4AA 1UD4A 1WDRA 2YL9A 1W32A 2V3GA 5E0CA 5LYRA 2VRJA 1HKJA 1G94A 1W2VA 1WDQA 1GQIA 4OBSA 3AS3A 3WH8A 3GXMA 2OYKA 1I1WA 4S3JA 3SCVA 3RIKA 3FHAA 1J10A 4D6EA 3PZUA 2VJXA 3WQ6A 5I5RA 4BQ4A 3N17A 1O6IA 3N1AA 3N18A 4W7UA 3OLIA 5FL0A 1CBGA 4CD6A 1JF6A 4Z2GA 4JKLA 1J0HA 2XVKA 5A95A 2XJ7A 3K8LA 4AYSA 3DYOA 3N13A 4AD2A 3W37A 4X0VA 4EANA 2BHZA 1QI3A 2WMKA 2CYGA 4U2YA 2E9MA 2XM1A 4ATLA 4L4OA 3SCOA 3W25A 2XVNA 3VD9A 3HU7A 5EMYA 1S46A 3OGVA 4HMEA 3WENA 4AZCA 4HPGA 4R27A 1E6XM 5KEZA 1ZJBA 2D23A 5C70A 4GQQA 3TTQA 2XWDA 2GK1B 5HPCA 1DTUA 4Z2HA 3RM8A 1E40A 1SFSA 4CN4A 2GJPA 3CUFA 1ZL1A 1W2PA 4LQ1A 4QLJA 1V0NA 3MMUA 1GHRA 3E1F1 2F8QA 1R7OA 3THCA 1K9EA 4E2OA 3PTQA 2BS9A 4GXPA 4FK9A 1BHGA 3FAXA 4JCLA 3AYSA 4AZBA 1W9PA 4GINA 4PYSA 1V3LA 3NJ3A 4MNKA 1SR0A 5BRPA 1X1NA 4H2CA 2X0HA 5AYBA 5DO8A 3WSUA 1C92A 2O92A 1N82A 1Z32X 3VGDA 1HP5A 1PEZA 2AAAA 5ABFA 2DPEA 3W26A 5FIPA 1AQMA 1VFFA 1A3HA 1WB0A 1JI2A 4GI8A 2XSAA 3MMDA 2VRQA 1PJ9A 3ZMRA 4AZIA 1HKKA 4CCDA 3AJ7A 2WVVB 3WD4A 3NYDA 3WF2A 4C7FA 1CTNA 1G5AA 2BFGA 1CLXA 1CXFA 4BA0A 5A6MA 1JG9A 3N9KA 5CPSA 5D9NA 2G3JA 1W91A 3I3DA 3MUIA 1ZS2A 2Q8XA 1EDQA 4UQAA 2ZUNA 3ZSTA 3PZGA 2UY3A 4PCSA 5A8PA 3AHYA 4W8BA 2ZOXA 1VJSA 2XWEA 5I2UA 5JH8A 3BH4A 5ABGA 2JF6A 1TVPA 3BCFA 2HISA 1GUVA 1CYGA 1OSEA 2J7EA 4JHZA 4LYPA 5CXPA 3VM7A 4Z2IA 5M17A 4CGTA 1FH9A 2G8ZA 1BPLB 2VX7A 1UQZA 4GPNA 1XSIA 2DT0A 1RH9A 3A4AA 2WB5A 3IANA 1G9HA 2WHMA 1V0MA 2XVPA 1ODUA 1E1FA 1E4LA 2PC8A 4OOUA 3HN3A 4W88A 2B31A 1FOBA 4H04A 1NOFA 4J3VA 4CD7A 4M1RA 3OGRA 3B9AA 1JI1A 4PRWA 1TUXA 1VFUA 4BQ5A 4C7GA 5ABEA 4YPJA 1HF6A 1YHTA 2XFYA 2OYLA 1CENA 4UFIA 1R8LA 3EDFA 4WKAA 4AWEA 2W62A 1V3JA 1UYQA 1E70M 2XGBA 1B3WA 4NF7A 1FHDA 4BQ2A 1VB9A 1TMQA 3MANA 5DEZA 3BAWA 4HA4A 2GSJA 2CERA 2Y4SA 1BGAA 4CCEA 1QBBA 4F9JA 1V0KA 1AVAA 2Y8KA 2DT2A 4OUEA 1I75A 1XHGA 4B9ZA 4H41A 1J18A 4L4PA 4C7DA 4BZYA 3CPUA 3SUSA 3G6MA 3MUY1 4HZ8A 1W9BM 1G1YA 1DWJM 4Z2JA 3MSDA 3WDIA 3F5KA 3RPMA 1U2YA 3AHXA 2D20A 2EXOA 1KR0A 2ZWZA 3W28A 1CZ1A 2W4XA 5BXSA 2VT0A 4TTGA 3VKKA 2J79A 3U57A 3PZOA 5BXTA 3WQ8A 3WD2A 1VAHA 5E70A 3MUAA 3PZIA 3PN8A 1KXTA 3OLEA 3T0AA 1HN1A 1VBRA 4UFHA 2WVTA 3ECQA 4MADA 2NW0A 3K1DA 1K6AA 3AIBA 2V5CA 1UWIA 1E3XA 4Q22A 3L4ZA 3VGFA 2VNCA 4GZEA 2ZE0A 1BG9A 4RL3A 1E9LA 1WKYA 4QCFA 1BFNA 3WEOA 1UHVA 2W5FA 4PMYA 2YDQA 3B8SA 1Q6FA 1SMAA 3CLWA 1UKTA 3GYCA 2VZSA 1TZ7A 3CUGA 5HXMA 5D9MA 4BQ3A 3W53A 2W66A 4QFUA 2QPSA 4UOZA 3PZNA 1Y7VA 1JYXA 1MFUA 1KQYA 3OBAA 5A8MA 1B3ZA 2WC3A 1JL8A 1NWUA 1ISWA 3MV11 4M8UA 1AMYA 1M03A 2WCGA 2HVMA 5I6SA 3WEZA 2D22A 5JBEA 1C3FA 3GXDA 7A3HA 5FOOA 2FHFA 1QW8A 1OGGA 3KE0A 2G3IA 1X6NA 1J01A 1J9YA 4W5ZA 1DEDA 4OKDA 4UOQA 5M3WA 5D9OA 4XB3A 1GQKA 4PMOA 1MXDA 4AZHA 3VIOA 4JKKA 3KEHA 6TAAA 1OT1A 2XIIA 1ZBWA 1D3CA 4TXEA 2WBKA 1UWQA 4YHGA 1JYWA 2DT1A 1OD8A 2DH3A 3IJ9A 4B16A 4D6JA 2XM2A 2VQUA 1W1TA 2D0HA 1B3XA 5E9AA 4CD4A 3VINA 4FLOA 1TFVA 3AXHA 1J0JA 1QI4A 3VIHA 1LG2A 2CXGA 3VMPA 1BQCA 4PMUA 4QAWA 2WZEA 3ARYA 1KCKA 1B3YA 3TTOA 1A47A 1E5NA 1FFQA 2VX6A 1RP8A 2JIEA 4AZ7A 4D72A 8A3HA 3PTKA 2UY4A 1BGGA 3WD1A 3DYPA 5BWFA 2GVYA 1BAGA 3W24A 2VOTA 4P7QA 4F66A 3CZGA 1FFRA 3WBEA 1MQRA 5I24A 3AI0A 1HIZA 1HNYA 3VGBA 1EQPA 4QDMA 2CKRA 6CGTA 7CGTA 4QCEA 3D3AA 3U5YA 4MB1A 3VD4A 1R85A 3FHQA 3CUIA 3T2OA 1B2YA 3NUKA 3AS0A 1C90A 1DWAM 1KXQA 2EO7A 2RGMA 3A47A 4EAMA 3VIIA 1UR0A 1F4AA 3W82A 1CXIA 4UQEA 4DWSC 1ESWA 3DYMA 3VUPA 2VTFA 2YOCA 1FA2A 1XCWA 4H8VA 4U5IA 1KBBA 1UA7A 1K9FA 4D71A 4ZFMA 1O7AA 2VL4A 5CSYA 1UOKA 1UD5A 3B9DA 1B0IA 3NSXA 1UR8A 4ZENA 1GOIA 2D1ZA 2XYLA 3EMZA 3WUEA 4AMCA 4XZBA 1HT6A 4W7WA 4HA3A 2JALA 3T0DA 1TR1A 2WMIB 4U33A 4MNMA 1MYRA 4UZSA 1JXKA 1X6LA 1ISXA 1QI2A 2W92A 1NARA 2E8YA 4N42A 3OA5A 1HJSA 3ARPA 3BAIA 3LPGA 1XH2A 4HU8A 1E4IA 2XUCA 1GVYA 1JYNA 1CGVA 4GO9A 3OIHA 1OIMA 2YLLA 2ZUUA 3SCNA 1GOWA 1UKSA 3DHPA 2WW5A 1ZB5A 4JFVA 3GDBA 4HP5A 2XFFA 3ZJ8A 3AMDA 4U3CA 4OOZA 1VFMA 1QVBA 1KWGA 1XYFA 3WF4A 5DFAA 1MQQA 5DT5A 3ZOAA 3ZR5A 2WLZA 4W93A 2J78A 3BMVA 3DC0A 4LX4A 4WSJA 3RILA 2EPLX 3ARXA 4RE3A 4RE2A 3WF3A 4AZ5A 1BYAA 3PZVA 1UH4A 3SUTA 3IJ7A 3ZR6A 1KCLA 3ARUA 3L4TA 1OCQA 1B30A 2PWFA 1PIFA 2BVDA 2QV4A 1ZBCA 3WUBA 5M5DA 2E40A 2VZUA 5BXPA 4F79A 1E0VA 1VIWA 2J7FA 2WHLA 4P7NA 1EIBA 3VIGA 3VVGA 3CUJA 2JEQA 4AISA 3W0KA 1NM9A 4J3UA 4UQ9A 2VZTA 4CD8A 1DWGM 1TA3B 4UNIA 1XRVA 4DUXA 3MV01 4P7OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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