5HD7A

Dissecting therapeutic resistance to erk inhibition rat mutant sch772984 in complex with (3r)-1-(2-oxo-2-{4-[4-(pyrimidin-2-yl)phenyl]piperazin-1-yl}ethyl)-n-[3-(pyridin-4-yl)-2h-indazol-5-yl]pyrrolidine-3-carboxamide
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFDLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
publication title Dissecting Therapeutic Resistance to ERK Inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 115
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2016-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5hd7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5hd7A01
2XEYA 5IMXA 2RFEA 2R3OA 4QMLA 4M8TA 2W1IA 4IH8A 3QD2B 1M2PA 2J4ZA 2HZNA 4F1OA 4BVUA 3QC9A 4FZFB 4KWPA 4C57A 4EK4A 4BKZA 2PE2A 3MVHA 3N4TA 5IISA 2BILB 3FLWA 1TVOA 2FA2A 2B9JA 3BQRA 3W32A 5TE0A 2PE0A 3ZLSA 1JKSA 3FZOA 3HMIA 5CEQA 2ZMCA 3ZDUA 4EONA 3R22A 4MXCA 5FEDA 3HP5A 4MF1A 4UXQA 1G8AA 3RAKA 4UN0C 4GS6A 5ICPA 1W8CA 2C6DA 3GC8A 4WNPA 2B54A 5EKOA 1R0PA 4V0GB 5ETIA 3V5WA 4XJ0A 4ERKA 1SNUA 5JRQA 3F3TA 3PPKA 4UMRA 2QQ7A 2ITNA 5D41A 4CFVA 5I0BA 1OIQA 4MBJA 5GJGA 1ZWSA 3OXZA 5IQEA 5DEWA 1UNLA 3QQKA 4O0YA 3NAYA 2V62A 3W2CA 4CYJA 5BUEA 3S1HA 5IQHA 4RWKA 4L01A 2CKOA 1V0BA 2YAAA 2Y9QA 3GUBA 4ORKA 3DFCB 1ZARA 3Q5ZA 3PUPA 4LGDA 3ULZA 2WMRA 1PF8A 4PUZA 5AMNA 3W2OA 2JFLA 3I79A 1H1WA 3D7TA 4E5BA 2HAKA 4MNFA 2W5BA 3CQEA 2QOLA 4EJNA 2YIXA 3IDBA 4ZZMA 1L3RE 2C3IB 4U6RA 3FC1X 3FMMA 4FICA 3ZRLA 2XUUA 2WXVA 4C3FA 4R77A 3FZRA 3EQPA 2OSCA 3IDCA 3QAME 3FHIA 4E7WA 3KVWA 3DLZA 3V6SA 4KS8A 2WEIA 2QO9A 3O0GA 1NVQA 1ZXEA 2UZBA 2WMUA 4F7LA 4EZ3A 1UWHA 3LM5A 5HTBA 3BE2A 3EQCA 3MFTA 4BDKA 3FMHA 3TZMA 5HOAA 2AUHA 2XCKA 4R3PA 3BGPA 2FO0A 4YJVA 1DAWA 3R71A 2X2MA 4JBOA 5L2QA 3TTIA 3ZDIA 1OI9A 5IA3A 4IZAA 5GHVA 4AN9A 3FC2A 3DA6A 4AG8A 3RK9A 3JXWA 3W2RA 4KBCA 2W0JA 4FIJA 2QOIA 2R3LA 4LQMA 3IOPA 1H08A 4RLLA 4FUXA 3MV5A 4X6QC 3FBVA 5GJFA 2UW4A 3PVBA 3OFMA 3DK6A 4HGEA 4G2FA 4RC3A 3D0EA 3EN5A 3PXQA 3CEKA 3OCSA 4GRBA 4K9YA 5CS6A 3WF5A 4WT6A 4MQ2A 5CF6A 3O17A 3VBVA 1KE5A 4ZSAA 2X6EA 3UO5A 4DTKA 3WE4A 4O84A 2FH9A 4Q9SA 3EL7A 2J7TA 5HQ0A 3EN7A 4CFXA 1GNGA 4MNEA 4IVDA 4WBOA 3EMGA 3I1AA 4ZS4A 2XBAA 3SW4A 5FEEA 2BRMA 2XKCA 4FSTA 1JOWB 3HA6A 5EK7A 3TV7A 4LGGA 4HOKA 3UVPA 4AN3A 2PUPA 5C4LA 1KE9A 5CY3A 1W83A 5CNOA 3PLSA 4Z9LA 2IVUA 3N51A 2WTKB 5IH6A 3ZS5A 5A4EA 2QU5A 5HG5A 3TTJA 4KBKA 3SW7A 4AW5A 2OF2A 3I6WA 4FTQA 3AD5A 2RFSA 4NSTA 5HG7A 5AADA 2C0TA 1W0XC 3UG1A 4DGOA 4DG0E 4ZTQA 3DXNA 4RSSA 3BQCA 3OT8A 3EQGA 3JY9A 4UWBA 4F64A 5HI2A 2CGVA 2YM4A 5CLPA 4FEUA 3DB6A 4M97A 4D5KA 3O51A 4AOTA 4IIRA 4TYEA 5CSVA 2IO6A 3UZRA 1O6YA 2XM9A 4DTBA 3PSCA 3R00A 3KRRA 3QCYA 1NY3A 3Q60A 2VO3A 3Q5IA 3L8XA 4PTEA 2WMWA 3E62A 2J2IB 3Q2MA 3WARA 4L42A 5CAUA 2VU3A 3HRFA 3IGOA 5F1ZA 4E20A 5HEZA 4BDJA 3MVMA 2JBOA 4L00A 1IR3A 3LFCA 4WNKA 4BIDA 3NIZA 4OR5A 3VBYA 2VD5A 4X3FB 3MYGA 2O64A 2WU6A 3LLTA 3LXNA 3VS7A 2CKQA 3LQ3A 2QLQA 4ASDA 3EN4A 5AV0A 3VULA 3Q2JA 5HHWA 4GFGA 2B9FA 3DKCA 3FYKX 4DTAA 1FMKA 5E8YA 3TI1A 2Y6MA 3MPMA 1T45A 3OEZA 3I81A 3A7FA 3OUNB 4JG8A 4JRVA 3S3IA 3UC3A 4ZTLA 4L67A 1WBNA 3F3UA 4BYJA 4FKQA 3CXWA 4JR3A 4R7BA 4CG9A 3VNTA 4QTEA 2HOGA 2YCSA 5TO8A 4C4HA 2VO0A 3ORMA 5CAQA 5M4IA 3BWFA 2IPXA 3A99A 3IECA 4FVPA 2I1MA 4I23A 3VBQA 5J79A 2HW7A 4HCTA 4JG7A 5ANOA 3TKIA 5BVDA 3N4UA 4CGAA 1H00A 1OUYA 3Q52A 3ZYAA 3KK9A 1BKXA 4AUAA 2P2IA 5E8SA 1XR1A 2W1FA 4UALA 1L8TA 4IZ5A 1OPKA 5HE3A 4C0TA 5CF5A 3R01A 2O5KA 4JDIA 5EM8A 5AIKA 4NCTA 1NT2A 4BCGA 4RFMA 3KL8A 3K54A 3C7QA 4O0VA 4KRDA 4J1RA 3NNXA 4TRLA 4AZTA 5A4LA 3MB7A 4JBPA 5JGAA 1W84A 4DBNA 5A6OA 4JLCA 3QQHA 4FT9A 2PUIA 5A4QA 5LVMA 4G5JA 4IWOA 4YHJA 5HX8A 4PNKA 3FZSA 4WBBB 3R7YA 4EOSA 4GG7A 4DHFA 5AA8A 3QA8A 4X2NA 5GZAA 4F9WA 1XH6A 4UBAA 5FD2A 4EHGA 4USFA 1U4DA 3N4VA 3FZ1A 4QYEA 4ZIMA 2VWXA 3QD4A 2WOUA 3NUUA 2Y0AA 3ZRKA 2HY81 4L3LA 4FKOA 3VUGA 2GQRA 4U3YA 1MQ4A 1PXJA 2B1PA 2X8DA 2CN5A 4XCUA 5J95A 3P5KA 3NYOA 3HDMA 3F7WA 5FQDC 2VGPA 4V0GA 2GNFA 3L9LA 3JR1A 4RJ5A 4I6HA 5KX8A 5EM6A 2OFUA 4EZ5A 3ZU7A 4XBRA 4GL9A 4C4IA 4ZLYA 3SGCA 4FSRA 4XG9A 5CEKA 2VTOA 3I0OA 3RM6A 3NW7A 4A9TA 2E9NA 1H26A 3D7ZA 4I92A 4CNHA 2WB8A 4YURA 2QHMA 3QTXA 4C34A 5HLWA 5DT4A 4AW1A 4ANMA 4D55A 3NEWA 5I3RA 1Q8YA 2ZOQA 3CS9A 1H28A 4O38A 4TXCA 3T8OA 4KUJA 5EYCA 2P55A 3UG2A 3NW6A 1E9HA 1Q99A 4I21A 4R8QA 3SX9A 3QL8A 3E8CA 3FMEA 5F4NA 2W7XA 2ITTA 1ZY4A 1QPJA 2WU7A 5E8UA 3TZ8A 4BCNA 2JLDA 5L6OA 4GT4A 2GHMA 5EW8A 3V5LA 3ZSGA 2VWBA 2ETKA 2VWYA 2A1AB 3KXXA 4AGCA 4GKHA 3R9OA 1OB3A 4OBQA 1OPJA 4TWPA 4EQMA 2ITOA 4O2ZA 1GIIA 1XHAA 4GU9A 4JX3A 3R7UA 5KMNA 5HKMA 1J1CA 2ITYA 2DYLA 4G6LA 2E9VA 3R8LA 4YTIA 4I5CA 4G3FA 4X6RA 3ORPA 3D2KA 3R6XA 4H1MA 5EG3A 2J0IA 2PK9A 5J8IA 2JDOA 1YWVA 2PVLA 5AV1A 5DBXA 3OTVA 4YBJA 3ZTXA 4QMXA 4B6LA 4QYFA 4DEEA 1OMWA 3PWYA 5E8XA 4BZOA 3TL8A 3C1XA 3C50A 3NUNA 4CMOA 4FIHA 5IA5A 4E3CA 5GIOE 3ORKA 2WMSA 2OIQA 5LMBA 2RL5A 2UUEA 3C4WA 4H36A 2ZM1A 3AT3A 4W4YA 5HIBA 3RTPA 3GCUA 4HYUA 5LMKC 3MH1A 2UW0A 2FB8A 1OIRA 3OTUA 5AP7A 5E8WA 5B2MA 3RBWA 2HYYA 3R8MA 2NNWB 4G17A 2X8EA 3M1SA 4YZNA 1QPDA 5FGKA 4K77A 2JGZA 4YMJA 3IKAA 3EFJA 5DR6A 3K5VA 4UXLA 3RKBA 4P5QA 4XG4A 4PY1A 4PP7A 2PZPA 5AR4A 4O21A 5CENA 2C0IA 4DFLA 3KXHA 3R0TA 4A9SA 4AW2A 4O2PA 2YWPA 3VS6A 3KF7A 3KF4A 3ZFYA 2I7QA 3P9JA 3C51A 2OJFE 4MWIA 3BBWA 3JUHA 4FK3A 2X7OA 5I9XA 3TDWA 2Z02A 2GPHA 3IS5A 4I24A 3FSFA 4JDKA 4YHTA 4YSMA 4NIFB 5DI1A 3LQ5A 3HMPA 3LQ8A 5AR8A 2OJ9A 4AA5A 3G2FA 4BWXA 2BTRA 4YC3A 3SVVA 5LQFA 4KA3A 3OXTA 4CZUA 3AC8A 4ZSLA 3UQGA 5DRBA 4LRKA 4FC0A 3GCPA 4J95A 2YDKA 4M15A 5H8GA 2XKDA 1M52A 4I0RA 2YERA 2BTSA 4O7YA 3HV5A 1PXIA 4ZOGA 4Q5HA 5CU0A 3ID6C 1ZRZA 3EYHA 3NYVA 4QTDA 2ZM4A 3RGFA 4BKJA 4QP8A 1UNGA 3ZZWA 5AEPA 1ZZLA 2YCFA 3MGYA 3C4CA 4XBUA 5JRSA 4EC8A 3LLAA 4M68A 3R9RA 3FJQE 3K5UA 4PF4A 4IX5A 3WZEA 2ITXA 2YABA 4FODA 3VS4A 4D2TA 3ZXZA 4E6CA 3ALOA 4NW6A 1H1PA 4YZMA 1U46A 2W5HA 3FDNA 5GNKA 3UP7A 5L8KA 2Y4PA 4FZDB 2C5XA 4LL0A 3KEXA 2X7FA 4X3FA 2F7EE 3DGKA 3ZSIA 2X9EA 4I22A 2P4IA 2FSTX 3PSDA 3LXLA 4JQ7A 4OT5A 4D1ZA 3Q3BA 2UZUE 3HV7A 1FVVA 4FIFA 4IADA 4IMYA 4IM2A 4BIBA 2UZVA 4QMNA 3L8PA 2BDJA 4BHZA 3TUCA 2R9SA 3KMUA 3LXPA 3QKMA 4EH8A 4FTAA 2OXDA 5IEXA 2JDTA 4YUQA 4UMQA 4M7IA 5CT7A 1KE6A 3D5VA 3L8VA 1LP4A 5CAOA 4FF8A 3HYHA 2CCHA 3Q4ZA 3RPOA 3DCVA 3HUCA 3BYOA 3VW8A 1XH9A 2VRXA 4LL5A 5FTOA 2ZM3A 3ZFMA 2PSQA 4AFEA 2XYUA 4FOCA 4MEDA 3S95A 1CKJA 3O7LB 1I09A 4FSMA 4ZZNA 4QNAA 2QG7A 3UOKA 3V5PA 2XM8A 3R04A 5F94A 4EI4A 4M3QA 4XYFA 1JLUE 1UWJA 4FV3A 4R3CA 3GU5A 3R73A 4EHVA 3O7LD 4C4EA 2ZJWA 4FKSA 5B2KA 1M2RA 3LOKA 3PIXA 5IEVA 3ZFXA 1JVPP 2P0CA 3C4ZA 4MYGA 4GK2A 2YDIA 5KUPA 3ZOSA 2CN8A 4RVKA 3PVUA 4D4YA 4YNOA 4Y72A 2OH4A 3EQDA 3HMMA 4NUSA 5DOSA 4ZTSA 4MHAA 1BLXA 2VUWA 4O0SA 1CSNA 4F08A 2HY0A 2JDRA 3R21A 5DT3A 3MDYA 4C62A 4E6QA 2X9FA 3ZRMA 2ETMA 2ITQA 2ONLC 4RX5A 1ZZ2A 3HMOA 2C30A 4OBPA 4MXXA 3TKUA 2B9HA 5HU9A 3LCDA 4HVIA 2YIYA 5JK3A 4K2RA 2YM7A 2WMTA 4FTLA 2QKRA 5EW9A 5A46A 5CNNA 4BI1A 5M08A 4E4NA 4D2SA 5KMOA 4IC8A 5LJJA 4TWCA 3E7OA 3IW5A 2AC5A 5DPVA 3C0GA 4OTFA 2F7XE 2XNBA 2J0JA 3E93A 3QALE 5AP2A 2VN9A 3OVVA 3MY1A 4FZ6A 5A14A 2BDWA 4KABA 4AE6A 4GU6A 4BRXA 4C59A 1OITA 4FKTA 3FMNA 3UNJA 4R3RA 3PSBA 4CT1A 3BYMA 4ERWA 3TWJA 1YQJA 2C4GA 4DGMA 4DG3E 2VNWA 3H10A 2XRUA 2A0CX 1OECA 2OKRA 2Y6OA 3EZRA 3ORZA 5HNGA 3WE8A 3RHKA 4RC4A 5DVRA 3Q4UA 3NRMA 3BRBA 2UZOA 4ONAA 2WKMA 4DBXA 4JX7A 2RIOA 2R0IA 3PJ3A 2PMIA 5CSXA 3GNIB 4QP1A 4FT0A 4YSJA 3V8TA 2WAJA 4UYAA 1TKIA 4TYJA 1WBPA 3EQHA 4BCJA 1XKKA 5BVNA 4CZYB 4P2KA 4CKJA 3C4EA 3DJ6A 4FTOA 3R8UA 3GOPA 4DITA 4QMMA 3JPVA 4RRVA 1Y8GA 5BUJA 4FMQA 3UVQA 5DLSA 4XMOA 3RWPA 4BF2A 3LMHA 4FTJA 4O0RA 1CKIA 4XV3A 4IBMA 5KMJA 3WYXA 2C3LA 3IGGA 3TV4A 3JS2A 3QZGA 3PE1A 1Q4LA 5E90A 3UQCA 2J0LA 3F5XA 2ZB0A 4ITHA 3CPCA 5EDPA 3UYTA 1UKIA 2R3QA 2GNHA 3PY0A 3FE3A 4AGWA 2VO6A 3DNDA 2JKKA 3ZO1A 4S2ZA 2V22A 4CSVA 5J5SA 4WSQA 4IZ7A 4U41A 2HZ4A 4GW8A 5IG1A 2WTJA 4RJ4A 5CVGA 4F0FA 4X2KA 3SOCA 4WA9A 4MWHA 3QCXA 3UOHA 3D9VA 3W1FA 5IA0A 2UW9A 4NTSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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