The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
65
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
LSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKHDRFKHLKTEAEMKASEDLKKAGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Regulating the nitrite reductase activity of myoglobin by redesigning the heme active center
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
65
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-01-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OR4 A; 2E2Y A; 1HBH A; 3D1K B; 3PIA B; 3UHK A; 1A00 B; 2HHD A; 3M3A A; 1O1O B; 3AT6 A; 3TM3 A; 1S5Y B; 3EU1 B; 5JGG A; 1O1K B; 5E6E A; 4AVD A; 3R0G A; 1XY0 A; 3UH7 A; 1LA6 A; 1PBX A; 4X0L B; 3QJC B; 3G4W A; 4MQJ B; 2DN2 A; 3M3B A; 1BAB B; 1BZ1 B; 2NX0 A; 3BJ2 A; 4MQC B; 3A9M A; 3BJ3 A; 2ZLX A; 2ZSQ A; 4M4A A; 3HEP A; 3QJE A; 2RAO B; 4NI1 A; 2V1G A; 1LFV A; 3NMM A; 1RSE A; 2EKT A; 109M A; 3QJB A; 1YDZ A; 1HBS B; 3PT8 A; 3MJP A; 2DN1 A; 1DKE A; 4KJT A; 1MLH A; 3WCT C; 3IC2 B; 3WTG A; 3WCT A; 1RPS B; 1IWH B; 4IRO A; 5HBI A; 3KMF C; 106M A; 3KMF A; 1FHJ A; 1A9W E; 3FS4 B; 1K1K A; 1MOC A; 2BWH A; 3PEL B; 4VHB A; 1OUT A; 3AT5 B; 3QZZ A; 1HBB A; 4MQH B; 1V4X B; 5CNF A; 5E83 A; 1G0B A; 1VXD A; 2PGH A; 6HBW A; 2HBF B; 2MHB B; 1JF3 A; 2DN3 A; 1OUU B; 3AQ9 A; 1MLL A; 3V2V A; 1BIJ B; 1YEO B; 2VHB A; 1HGB A; 3ZJO A; 3CY5 A; 2AV0 A; 1RQ3 A; 3PI4 A; 101M A; 1G0A A; 1Y35 A; 2R80 A; 5MBN A; 1JP6 A; 1CO8 A; 2D60 B; 4ESA A; 1CQX A; 1XZ7 B; 5EYJ A; 3D7O A; 1YE2 A; 3GQR B; 2ZFO C; 2MYC A; 2ZFO A; 3QZX A; 1FDH G; 5ILM A; 3MBA A; 1BVD A; 3GQP B; 4L2M A; 3ZH0 A; 1YEU B; 3ZJH A; 1BBB A; 3SDN A; 2GLN A; 5EUI B; 3E55 A; 3UHZ A; 1NQP A; 5F2A A; 3OZW A; 4ILZ A; 2VM0 A; 1Y0W B; 1Y8K A; 2O58 X; 1YIH B; 1YCB A; 1UIW B; 1CLS B; 1GCV B; 4PQ6 A; 4YU4 A; 4ROM B; 1Y4Q B; 1V4U A; 1N9X A; 1Y09 B; 3WCP B; 5HLQ A; 2OHB A; 1X9F C; 1Y4P A; 1X9F A; 3DHT B; 1Y8I B; 1DO7 A; 1F65 A; 1NS6 A; 3AQ8 A; 3G4U A; 3S1J A; 5EOH A; 3H58 A; 1HV4 A; 3OO4 A; 5CNE A; 4NXA A; 4WCH D; 1Y46 A; 1Y7G A; 108M A; 1ECN A; 1FSX A; 1Z8U B; 1JP9 A; 1C40 B; 1YHE B; 4YU3 A; 3UHD A; 1A6N A; 1C7C B; 5SW7 B; 2BKM A; 1LA6 B; 1GDK A; 5CHQ A; 1HHO B; 1MYJ A; 1Y45 A; 4MXK A; 1ABW B; 4U8U B; 3TM9 A; 3NG6 A; 2WTH A; 2IN4 A; 2H35 A; 1LH2 A; 1X3K A; 1MTK A; 1HCO A; 2RI4 A; 3LB3 A; 3WR1 B; 1JEB B; 4FH6 A; 2ZWJ A; 1YEV B; 2WTG A; 2VYW A; 2QLS B; 4B4Y A; 5JDO D; 1KD2 A; 1RQ4 B; 3UHE A; 5ILP A; 1H97 A; 1B86 B; 1ITH A; 2HBD B; 1YGD A; 1VRE A; 1CO9 A; 1JWN A; 4N7O A; 2BLH A; 4F4O B; 1XZ5 B; 1HBR B; 1DWR A; 2HBE B; 1VXF A; 1Y22 B; 1CP0 A; 3ECZ A; 1O1M A; 2XKG A; 1MBI A; 1N9F A; 1Y5F A; 3MJU B; 1HDB A; 3EOK B; 1LUE A; 4NI0 A; 4XDI A; 1UFJ A; 3HHB A; 3PI9 B; 1THB B; 1VWT A; 4O1T A; 1A4F A; 3P5Q A; 2FAL A; 2GRF A; 1IT2 A; 1HAB B; 4PQB A; 3DUT B; 2HCO B; 3BJ1 B; 1MDN A; 3A2G A; 5CHR A; 1YFF A; 1S0H B; 2B7H B; 1OJ6 A; 3G52 A; 4MPM A; 1ABY A; 1GBV A; 3AQ7 A; 1YZI A; 3ARK A; 5EQM A; 1XYE A; 3M38 A; 1SWM A; 1JY7 B; 3AQ6 A; 2W6W A; 2V1F A; 1MLN A; 2D5X B; 1J3Y B; 3D1K A; 3PIA A; 1A00 A; 4ODC B; 1Y5J B; 1UX9 A; 4L7Y B; 2ZT3 A; 2QU0 B; 1S5Y A; 3EU1 A; 2VYZ A; 1O1K A; 1N9H A; 1MKO B; 1MZ0 A; 1SDK B; 4H07 A; 2D2N D; 2MGI A; 1MBN A; 4X0L A; 3QJC A; 4NS2 A; 4HSW A; 4MQJ A; 1BAB A; 1S69 A; 1BZ1 A; 3HXN B; 3ZJI A; 1J41 B; 4MQC A; 1BIN A; 1CG8 B; 1SPE A; 5D1V A; 1DXV B; 7HBI A; 4G51 B; 2ZT4 A; 2RAO A; 1MLS A; 3UHI A; 1XZU B; 3WCV B; 2ZSZ A; 1Y4R B; 1HBS A; 1PMB A; 1BJE A; 3IC2 A; 4F68 A; 1RPS A; 1IWH A; 1MLU A; 3E4N A; 3GLN A; 1DWT A; 4FWX A; 1RTX A; 3QQQ A; 2AUQ A; 3FS4 A; 4O4T A; 5B84 A; 2V1H A; 3DR9 A; 3PEL A; 2BNL A; 5HAV A; 4MQH A; 3M39 A; 1NZ5 A; 1V4X A; 4MQG B; 1J7S B; 4B3W A; 3ZJM A; 2HBF A; 2MHB A; 3UHV A; 3UH5 A; 1OUU A; 1VXA A; 1GVH A; 3VRE B; 1BIJ A; 2ZSX A; 1HBA B; 4DWT A; 1YEO A; 2HBG A; 1G9V B; 3UHB A; 3VRF B; 2H8D B; 3ZJL A; 3LB4 A; 2D60 A; 2ZST A; 1FN3 B; 1XZ7 A; 1YEQ A; 2LH6 A; 1HCO B; 1WMU B; 1Y4V B; 2AUR A; 3GQR A; 2ZLV B; 1MTI A; 1JL6 A; 1JF4 A; 1DXU B; 1U7R A; 3IC0 B; 3GQP A; 1A01 B; 1HAC B; 1YEU A; 1MLR A; 2QFK A; 5EUI A; 2GDM A; 1NZ3 A; 1YGD B; 5HLU A; 3ZJJ A; 1QXE B; 5C6Y A; 1Y0W A; 1IT3 A; 1YIH A; 2HHE B; 1AJH A; 1XZ4 B; 107M A; 1UIW A; 1YCA A; 1HDB B; 4HRT B; 4OF9 A; 1CLS A; 1Y0A A; 1V9Q A; 1GCV A; 4NI0 B; 1HLB A; 3ASE A; 2AUO A; 3WCT D; 1Y4Q A; 1HDA B; 2MGE A; 1CH7 A; 1Y09 A; 1KR7 A; 3WCP A; 4MBA A; 1CPW A; 3W4U B; 3LQD B; 2MGL A; 2ZS0 B; 3DHT A; 1YEN B; 2VEB A; 1Y8I A; 2DXM A; 3EDA A; 3WI8 A; 1HDS B; 1MOH A; 4FC3 B; 3SZK B; 1GBU B; 1J3Z B; 3ARL A; 3RGK A; 1Q1F A; 2G10 A; 1C40 A; 1YHE A; 1C7C A; 1LH5 A; 5SW7 A; 4ROL B; 1SDL B; 3BA2 A; 3UHN A; 2ZFO D; 2QMB B; 1HHO A; 1VXG A; 1A0Z B; 2HBS B; 2XKI A; 1DWS A; 1ABW A; 3MYN A; 4U8U C; 2MYE A; 4U8U A; 4N7N B; 1Y85 B; 3G4R A; 5EU2 A; 1JZM A; 5CNB A; 2D2M A; 1JEB A; 3WR1 A; 4HBI A; 4H0B A; 1YEV A; 1A3N B; 3A5B A; 1BVC A; 1I3E A; 1MYZ A; 4WJG A; 1QPW B; 2QLS A; 3UHH A; 1RQ4 A; 1GDJ A; 1S6A A; 2NSS A; 1B86 A; 2HBD A; 1J40 B; 1T1N B; 4F4O A; 2D5Z B; 1XZ5 A; 3LR9 A; 1HBR A; 5KDQ A; 3QJD B; 3HRW B; 2HBE A; 3UHG A; 1MBD A; 4H2L B; 1Y22 A; 1Y5K B; 3MJU A; 3A5A A; 1QSI A; 4FH7 A; 3EOK A; 1BZ0 A; 2ZS1 B; 4UZV A; 3PI9 A; 2GTL B; 1THB A; 4G1B A; 2EB8 A; 1MLJ A; 1UVX A; 1MLF A; 3UI0 A; 1CIK A; 1HBG A; 1F63 A; 1S61 A; 4HHB B; 1HAB A; 3ONZ B; 3DUT A; 4MQK B; 1AZI A; 2HCO A; 3BJ1 A; 5AB8 A; 1S0H A; 3QM9 A; 2B7H A; 3MYM A; 4C0N A; 3CIU B; 1DO1 A; 3OO5 B; 3HF4 B; 1YHU B; 1J7Y B; 1JY7 A; 1YEQ B; 3G4Q A; 1NAZ A; 1QI8 B; 2D5X A; 2GRZ A; 1J3Y A; 110M A; 4ODC A; 1Y5J A; 4L7Y A; 1YHR B; 3GYS B; 2QU0 A; 4F6B A; 1CQ2 A; 1Y01 B; 1J3F A; 2EVP A; 1BZZ B; 1LJW B; 1MKO A; 2MBW A; 1SPG B; 1SDK A; 1WVP A; 1S5X B; 4O2G A; 1Y2Z B; 1Y4F A; 3D17 B; 3WCU B; 4KMV A; 1Y0A B; 3KUN A; 3HXN A; 1J41 A; 1CG8 A; 2QSP B; 1DTM A; 1DXV A; 3D4X B; 3WCW B; 2OH9 A; 2GL3 A; 4G51 A; 1IRD B; 4F6F A; 3WCV C; 1RVW B; 1XZU A; 1CIO A; 2MYB A; 3WCV A; 3G46 A; 1O1J B; 2ZT1 A; 1Y4R A; 2DXM B; 2MGA A; 2QSS B; 4FWZ A; 3ODQ A; 1K0Y B; 1MYG A; 2G0X A; 1C7D B; 3MN0 A; 3WFU A; 3B75 B; 2PEG B; 1ECA A; 3UHQ A; 3ECX A; 3A59 B; 1FDH A; 4MQG A; 1J7S A; 2Z6N B; 1YMC A; 1Y7D A; 2O5B X; 2MGF A; 3VRE A; 4PNJ A; 1LFQ B; 1HBA A; 2JHO A; 1JZK A; 1G9V A; 1VXC A; 3SDH A; 3VRF A; 1DUO A; 2H8D A; 1FN3 A; 1YVQ B; 1LHT A; 2BK9 A; 4N8T B; 3PT7 B; 3K9Z A; 1JP8 A; 3GOU B; 1WMU A; 1Y4V A; 1VHB A; 2D2M B; 2ZLV A; 2EKU A; 2LH2 A; 3E5I A; 5D5R A; 1BZP A; 1GZX B; 1DXU A; 3IC0 A; 3PI8 B; 1G08 A; 1HBI A; 1A01 A; 1MBA A; 1HAC A; 2NRM A; 3GQG B; 1R1Y B; 1NWI A; 5CND A; 5CMV A; 1XQ5 B; 2Z8A A; 2ZSP A; 2R50 A; 1QXE A; 5KDQ B; 1MYH A; 2IG3 A; 1Y8W B; 1MYT A; 2HHE A; 2WY4 A; 1XZ4 A; 1TES A; 1QSI B; 4HRT A; 2HZ2 A; 1NIH B; 3ZJN A; 1X46 A; 1BZ0 B; 3S48 C; 1A6G A; 1IOP A; 3D1A B; 1ASH A; 4NK2 A; 4MQI B; 1COH B; 1HDA A; 1SI4 B; 4F69 A; 2EVK A; 1MLK A; 2HHB B; 3W4U A; 1MWB A; 1Y4G B; 2ZS0 C; 3LQD A; 1Y8H B; 2ZS0 A; 1YEN A; 1C7B B; 1M9P B; 5ILE A; 1MWD A; 4NXC A; 1FLP A; 4O35 A; 1JDO A; 2V1K A; 3PI3 A; 1HDS A; 5CNG A; 3WFT A; 4FC3 A; 3BCQ B; 3SZK A; 1BUW B; 2ZSS A; 1F5P A; 2MGC A; 1GBU A; 1J3Z A; 1IBE B; 3VHB A; 2VLY A; 4G1V A; 1EMY A; 1LFL B; 3OJ1 A; 4ROL A; 3RJN B; 1LFT B; 1SDL A; 1OR6 A; 5KER B; 1GCW B; 2SPL A; 3G4V A; 3OVU C; 1XXT B; 2QMB A; 2W72 B; 2FAM A; 1Y4F B; 2R4W A; 1A0Z A; 2HBC B; 2HBS A; 4M4B B; 1HRM A; 4N7N A; 2LHB A; 3VRG B; 1Y85 A; 3WFW A; 1Y0D B; 2MGD A; 5C6E B; 1M6C A; 2O5L X; 1J7W B; 1DLW A; 5EYS A; 1A3N A; 1NGK A; 1UVY A; 3A0G B; 1YVT B; 4DC8 A; 5JDO C; 1QPW A; 2SPO A; 1URY A; 3G4Y A; 1CBM A; 1O16 A; 3IA3 B; 1J40 A; 1T1N A; 2D5Z A; 2DHB A; 4NK1 A; 3ODQ B; 3QJD A; 3HRW A; 3O89 A; 4H2L A; 1VXE A; 1VRF A; 1UMO A; 1Y5K A; 3HYU B; 1KFR A; 3UHX A; 1JL7 A; 1JPB A; 2ZS1 C; 5CN9 A; 4KMW A; 2GTL C; 2ZS1 A; 2GTL A; 2M6Z B; 5CNC A; 1A6M A; 1OBM A; 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2QRW A; 2Z6N A; 2BMM A; 1MLO A; 1HGC B; 2YRS B; 1MBC A; 1UFP A; 3UHU A; 1LFQ A; 4F6G A; 3DHR B; 1EBC A; 1V07 A; 4DC7 A; 3MKB B; 4QAU A; 4UIQ A; 1G09 B; 3AG0 A; 1MNO A; 1YVQ A; 4N8T A; 3PT7 A; 3GOU A; 5CN6 A; 3HEN A; 2D2M C; 3FH9 B; 4F6I A; 5E29 B; 1GZX A; 4F6J A; 3PI8 A; 1V75 B; 3GQG A; 1R1Y A; 1YE0 B; 5HU6 B; 5HY8 B; 1MYI A; 1XQ5 A; 2GRH A; 1Y83 B; 2DHB B; 1LH1 A; 1HLM A; 3RJ6 A; 2ZT2 A; 1MTJ A; 2W6Y A; 1Y8W A; 1A9W A; 1YH9 B; 1X9F D; 3WCV D; 1DXD A; 1NIH A; 1EWA A; 1UX8 A; 3D1A A; 3IXF A; 2OHA A; 4FWY A; 3MVC A; 4MQI A; 1COH A; 1O1I B; 5JOM A; 3S66 B; 1LH7 A; 2MGH A; 1SI4 A; 2FRJ X; 1V4W B; 4JAC A; 1FSL A; 1Y4B B; 2HHB A; 2AV3 A; 5F0B A; 1Y4G A; 3NL7 B; 1Y8H A; 5MBA A; 1C7B A; 1M9P A; 3NFE B; 2CMM A; 1N9I A; 4NZI A; 3BOM B; 1MBO A; 1YGF B; 3UGY A; 3ECL A; 3BCQ A; 2KSC A; 2BLI A; 1BUW A; 3GKT A; 2HZ3 A; 1IBE A; 3AQ5 A; 3ZOM A; 3UHR A; 3OZU A; 2G0V A; 3QQR A; 1NS9 B; 1LFL A; 5KKK A; 3PI1 A; 1LFT A; 2W6X A; 3S65 B; 3NML A; 1AJ9 B; 5KER A; 1GCW A; 2W72 C; 1XXT A; 2D2N B; 2Z6S A; 1CG5 B; 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