5HQEA

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with compound 18t
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with 18T at 1.62 A resolution
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 138
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2016-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5hqeA00
4IMCA 3KRSA 3PS7A 1EEPA 2YW3A 1NF7A 4KFOA 3PUOA 2FPYA 4LVBA 4XBKA 1TREA 2JGQA 4MJZA 1P0KA 5CPNA 4MVAA 2EGZA 3TE9A 1Q3NA 2NX1A 4RLIA 2VELA 3P62A 1XCFA 2FPTA 4HT3A 1F6PA 2RDUA 4IWWA 1ZAJA 4ZVJA 5KZMA 1FCUA 1OX4A 1KLZA 1FCVA 3IGSA 4FNRA 4Z0JA 4X22A 1XFBA 1F5ZA 1XKYA 3QQ0A 3A5FA 5I3IA 2J6XA 1YXDA 1TJRA 4HSOA 3CU2A 4FNPA 3HGSA 1DVJA 5CPMA 4DPPA 5TQLA 2WSYA 2VFGA 1U5JA 3GDRA 3WK3A 3QM3A 1RPXA 4I7WA 3MP4A 6ALDA 3O1NA 3TC7A 3G1FA 2CLMA 2Z6JA 4W9TA 4Y9AA 1SR9A 4JDYA 1A53A 4R7JA 2ISSA 3ATZA 2E6DA 3KX6A 1KFKA 5IBXC 2Y6ZA 3E0IA 2G97A 2CLLA 5FF0A 3W88A 5EYWA 2FFCA 5A5WA 1OFOA 3LI1A 3G22A 3HPXA 5C2XA 1VPXA 1BKSA 3BG9A 1UB3A 3CIWA 2HSAA 4YCPA 3PBWA 3L0KA 1HG3A 4TMCA 4TR9A 3IEBA 4GWEA 1O60A 4MJMA 3G0XA 3W7KA 5EL1A 2ZTJA 3TSDA 4FIQA 5CKSA 3O05A 2CZDA 1H60A 5EY5A 4AAJA 5EA9A 2CZ5A 4GUFA 3S5OA 4ADUA 5AHMA 1B57A 3N19B 3PB0A 3LCGA 2CLOA 4IUOA 4O1CA 1B9BA 3CB8A 2Y85A 4JTSA 3DH7A 4O11A 3OVRA 4FIRA 5FF2A 3EWXA 1D3HA 4JTHA 4YXGA 4UFIA 3TXVA 3M43A 5LNUA 1JULA 2YXGA 3L2IA 5LZLA 3C61A 1P0NA 5CZJA 4A2SA 5FF7A 3G3DA 1KM2A 2V81A 2ZZ3A 2HMCA 1ZENA 3NEVA 3W72A 5AYXA 1SZNA 4PODA 3R89A 4UTTA 3SR7A 3DGRA 1OK6A 1RZMA 5F4SA 3EXTA 5BRBA 5DXXA 4JNMA 1NSJA 1VR6A 3G0SA 4BWLC 5K4ZA 3EX3A 3UYCA 2Z1BA 5DCEA 2ZFAA 5HNRA 3GVGA 2OJPA 3QJAA 1W3NA 3C2OA 3TQKA 3RF9A 5LNWA 3ZWTA 1AW5A 1KTNA 3S6DA 2NX3A 1YTDA 2NWRA 2X1RA 3N2MA 3W1QA 1OABA 2DJLA 1F76A 4H3DA 3TJLA 5E1QA 2CWNA 3QPZA 1QMLA 4B5NA 3G18A 3SSJA 3W2LA 5DBUA 4LW7A 2YSWA 4HNNA 3IVUA 1ML1A 1HO1A 1R47A 2ZZ6A 4K39A 1JUKA 3W71A 3E02A 3W7CA 1KFEA 4FNQA 1AW2A 3ZWSA 1OFRA 4JN6A 3W2MA 1QAPA 1OVDA 3W85A 5K7JA 1AL7A 1SW3A 2ZRVA 1V7YA 4FX7A 3MP5A 4GUJA 3TMQA 4H4IA 2KZHA 1LZOA 1TPB1 1S5VA 1A5AA 3G8EA 4N2YA 2QCDB 3NVTA 4FXSA 3W1RA 3QRHA 5K9DA 3R8RA 3KXQA 3W9ZA 1OFDA 4GRSA 2QCGA 3UXDA 4IJBA 1ICPA 3EWWA 2YGYA 1L6WA 3C2RA 3EX2A 4O12A 5HR7A 2G5WA 1SW7A 4EIVA 4MOZA 2ZZ5A 1FBAA 4CNPA 1LLWA 2QEZA 3TJXA 1ZJIA 1ZALA 3NQVA 3P5YA 3R12A 3TX9A 1VH7A 3VE7A 3KRZA 5F4XA 2TYSA 5FEWA 2E5BA 1WDWA 3W7IA 5AC7A 2V2DA 4KFPA 3GXTA 1ZCOA 3MYOA 5TBOA 4QISA 3B4UA 5LGZA 3Q2DA 2F7FA 4ZL1A 4KWVA 1YDVA 5F1VA 3TC6A 3CM4A 4MYAA 3G1SA 1LOLA 1TRDA 2B4GA 4DELA 1W3TA 3W76A 1A50A 4XQ6A 1VLIA 4JYDA 4CCDA 3RLUA 3HPZA 2I9EA 3S8HA 4POCA 2B7PA 4JX6A 1OFPA 2VEKA 2A6NA 3ABOA 2ATMA 3UD6A 1R30A 1OK4A 4XKYB 4ZQRA 5D2TA 3FYPA 4JTLA 3M44A 7TIMA 4KWWA 1J2WA 3I7RA 3EXSA 3W6YA 1QPOA 3TW7A 1VCVA 3WJWA 1DORA 5D37A 2BTMA 3G1XA 2ZA3A 2J9XA 3SW6A 2H8ZA 3UY8A 4UMCA 4UFMA 1SO5A 2A4AA 5DCBA 3F03K 4JR5A 3L5LA 1O5KA 3IRDA 4WY0F 3T4CA 3W70A 3UZ5A 1RR2A 5AC8A 2TMDA 3W23A 3ZFHA 5BMWA 3BG3A 1ZFJA 1M6JA 2J9YA 1N7KA 3LHZA 1Q6LA 4X9SA 3GK0A 3HG5A 1SO6A 6TIMA 4O18A 3MHFA 3NPUA 3CQ0A 2WNNA 1GVOA 3DFOA 1B4KA 2QCFA 1L2UA 5DY2A 3M5YA 3L21A 3M47A 4C1LA 1QO5A 3EEGA 1I45A 1AG1O 1H7RA 2Q3RA 2NUWA 3STFA 3TFCA 1DV7A 2W0UA 3CIXA 3HG2A 5KMYA 2R8WA 3H55A 1ME9A 2BXVA 2WNZA 5IBXA 2RKXA 1YYAA 1JCNA 1SFJA 1X6UA 3RK8A 1OYAA 2DZVA 3F4WA 3H54A 1B3OA 4K6AA 3GKFA 4K38A 3T78A 5F2MA 1H7WA 4LU0A 2A0NA 1YADA 3SY5A 3LHUA 2XN0A 4ZMGA 3UY7A 5CPOA 2CZFA 3PBYA 1SU5A 3ABSA 3O06A 3TW6A 5HULA 3N2XA 1KM6A 2YFNA 4HPJA 3TQ0A 5AOUA 5HUPA 3IVSA 4FEZA 1LCOA 5C5YA 4PFMA 2DJXA 1PHQA 2A5HA 1C9DA 2O7QA 5KSWA 1TTIA 1LP6A 1FDZA 2H3BA 1WYIA 1LLZA 4QM1A 3W7NA 2P10A 4WQ6A 3EX1A 1IIGA 2X1SA 3GNDA 5KINA 4UTTC 4WZHA 3MI2A 1UJPA 3P61A 2TSYA 4S2BA 1GVSA 1QOPA 1IXPA 1F74A 3UWVA 3WJXA 1EWDA 4BWLA 1XDLA 3A24A 2YCEA 3IIPA 1DJQA 4RR4A 4CNNA 1KM3A 1Z48A 5LNRA 3QZEA 4O10A 3NPVA 2VKZG 2JKPA 5K9CA 5G2HA 3PAJA 2R14A 3NQFA 3CWNA 2NLIA 1JCXA 4IMFA 3WJYA 3OA3A 3P84A 4Z1CA 2E6FA 4LV4A 1GTHA 2Q8LA 3LI0A 3W74A 3NR0A 3T7VA 1TPEA 2RFGA 1C8VA 1OHLA 1W31A 1TTJA 4JGDA 3CC1A 4NNAA 3INPA 3FJLA 5HWNA 3NGJA 3BLIA 3TAOA 2CFFA 4O1BA 1YDOA 1NF0A 2C16A 1KW1A 1H7XA 4HNTA 2VOMA 2E1DA 3L65A 3MW7A 1LORA 3GDTA 1UASA 2CLEA 4PL2A 3OIXA 2R94A 1YDNA 3GAKA 1XUUA 4CQ8A 2UV8G 2VEMA 1YLVA 1TO3A 1YPIA 1X8FA 2DU2A 4JXCA 4UR8A 3HGOA 2PURA 2GVLA 1FDJA 2WSQA 2X2GA 4C1KA 4MY1A 3TDFA 1QOQA 4LY8A 2V30A 1W0MA 4DO6A 1GVQA 4O13A 2QCMA 3TSBA 2NXGA 2QCEA 3O63A 4FO4A 4LS2A 1ICSA 3W75A 2HS6A 1XC4A 5G4WA 2ZDRA 3TUUA 4NX5A 1QPNA 1W5MA 2EHHA 3VKJA 3Q94A 3W7JA 2PRHA 2RHGA 3M9YA 5K9XA 2ZTKA 4UTIA 1VHCA 1WOAA 3NOEA 3GR8A 3A5VA 4GC4A 3I65A 3KVMA 2TRSA 4RCXA 1FDYA 3AJXA 3TU9A 4ML9A 3WJSA 1MSSA 5F2GA 2CLFA 2E77A 3I68A 2J24A 2IQTA 2AAMA 4LS1A 4FF7A 4CNOA 1XM3A 1VLWA 4LC8A 3DZ1A 4LWWA 3B03A 3SIZA 1WQ5A 4O28A 1YXCA 5CG7A 5D04C 1JCYA 3W2KA 3C56A 1O94A 1PCWA 1JCMP 3GXPA 4NX0A 4K8HA 1VQTA 3M6YA 4TO8A 2WPBA 4ZZ9A 3THQA 3ELFA 2CW6A 3JS3A 1MXSA 4OV4A 3PB2A 1SZGA 1WOBA 3HPSA 1DHPA 3G1DA 2GQ8A 4JEQA 3K30A 1F73A 5G1YA 1IF2A 1JCLA 5DXYA 1W56A 3RLVA 1LBLA 3V75A 1FY6A 3BGJA 3W3OA 1GWJA 5HWMA 3P81A 5FF4A 3QSRA 3EX6A 2XN1A 1KM5A 1H5YA 4OU1A 3BPWA 4I7UA 1TJPA 4UNLA 3Q37A 3W73A 3TNOA 4ORMA 3EWUA 5AFDA 3OBKA 5AHFA 3QSTA 4YCOA 4N4PA 4AHQA 1S5TA 3A22A 4HPXA 2VFIA 3DFNA 4Q33A 2DORA 3N73A 1PVNA 3M5VA 3W2NA 4JDBA 3EWYA 4I9AA 1LYXA 1MO0A 5TIMA 1W5OA 5AHEA 4S1FA 4XBSA 4AMAA 2NX9A 4RV8A 4UFLA 1JRCA 5E0KA 1P1XA 2X1UA 1BWLA 3LB0A 4LVFA 5D2YA 4JY8A 3G0UA 2ZCGA 5HMSA 3STGA 1FCQA 3IGUA 1AL8A 2QCCA 4IMEA 4FNUA 4UFJA 4MY9A 5LNVA 3N14A 2FB3A 2QUVA 4M5PA 5DCDA 2ZRUA 2CLKA 3IV3A 3UWUA 1T8XA 4OGZA 4XTDA 5J5RA 1ZAHA 2A7PA 1W54A 4BI7A 1I8JA 4DF2A 3FYOA 2FDSA 1DBTA 1OG0A 3LHVA 4QJ1A 2QUUA 5LKYA 3KAOA 2NV1A 3LM7A 3M41A 2AQWA 5DLCA 4KFNA 1G69A 4L4LA 1HFBA 3W1PA 4S2CA 4NXSA 1KFCA 1I2PA 1Z41A 4PEKA 3CTLA 3LTPA 3FFSA 2X16A 2WV8A 2VFHA 3QEZA 4JTFA 3USBA 1IIHA 1SO3A 2LLEA 4LUJA 2NZLA 3B8DA 3O6CA 3BW4A 2Y61A 4LV9A 4QIUA 1HL2A 2VFEA 4NJHA 4NQ1A 1XBYA 2E68A 4LVDA 4A22A 1J5TA 1TPVA 1TYGA 3P7YA 3NQGA 1GG0A 2W79A 3DENA 5KZDA 2RH9A 2A7NA 4LT9A 2QJHA 4QSHA 3TKFA 3UXAA 3NPWA 2PC4A 4R53A 5KTLA 1M5WA 1EPXA 3ANYA 1D3GA 1LRQA 3NQCA 1TMHA 2NUXA 4RZ6A 4MFEA 3LCXA 4BI5A 4CCCA 1YPFA 4RZ4A 5HR6A 5ABTA 1DQXA 2EPHA 4WXYA 3PULA 1IXQA 3QPYA 3HOJA 3TXZA 1ZY9A 1LRNA 2E5DA 5D2VA 4RK8A 4DEFA 1N8FA 2QF7A 3DHFA 3NNTA 3NYZA 3L68A 1H62A 5BNKA 4MYXA 4O0ZA 5HQEA 5I3GA 5DY3A 3B06A 3W1UA 3W7LA 3RFAA 1V5XA 3LHWA 5D32A 4P61A 4U4MA 4X2RA 2V5BA 3DKLA 3IIVA 3LBCA 3W7HA 3UWQA 1LTDA 3R13A 4ORIA 2VFDA 1MEHA 2QCNA 3N9SA 4NNBA 4UC5A 4A21A 1UUMA 3QMTA 2PRMA 4YWIA 1KBJA 4K7YA 2ZZ4A 5H2ZA 2JKAA 3LHYA 4QITA 2GQAA 2XN2A 3GKAA 3W87A 1BEUA 1WAUA 1TSIA 3LBMA 5D30A 1BWKA 1TB3A 4IX0A 1WBJA 3UPBA 1G7VA 3WK0A 3LGEA 1JQXA 3CLMA 4Q4KA 3W7GA 1EX5A 1KM1A 2VC6A 2X30A 4KKXA 1QPQA 1F2JA 3W2UA 1VYPX 1RD5A 5G1TA 1QDSA 3LXBA 2NXIA 1A5CA 1Q6QA 3TA6A 1GT8A 1WX0A 1VYSX 4IPIA 3B04A 1O4UA 4WD0A 3LTSA 3PR2A 3HIJA 4Z1DA 4HNUA 4NJGA 4JX4A 3NQ7A 4AVFA 3TQVA 1FX6A 3A9IA 4JX5A 4M19A 3ZS4A 2C18A 1H7OA 5AB3A 1MZHA 1WXJA 1TPC1 4O8RA 3LRLA 5AYZA 1K7EA 1NAL1 3WFAA 1HO4A 2DZSA 4LTSA 3O07A 3MHUA 3EB2A 1CX9A 3HMJG 3PY2A 4G1KA 3VFLA 4DF1A 3HF3A 4MZYA 4GUIA 4NZFA 3THAA 4M6PA 4GNJA 1JUEA 3HQ1A 3B0PA 4OT7A 1XXXA 2ISWA 4JICA 1TCDA 5K2ZA 1PV8A 2R91A 1I2RA 4O1AA 1LBMA 4L4MA 3NQ6A 1L6YA 3GDLA 1SFLA 1W1ZA 4EF9A 1EP2A 4A2RA 1P4CA 1GG1A 2FJKA 3GX9A 5FEPA 3PWAA 1EUNA 2P0OA 1R2SA 4OE7A 1OX4B 1SSGA 2E6AA 2Y7GA 5AHIA 1S5WA 2VENA 3L66A 3FS2A 3NAVA 1GJPA 3LV6A 3B05A 1X1ZA 2WQPA 1K7FA 4K37A 2Y7EA 4LVAA 1WBHA 1A5SA 1M7OA 1IXOA 2YZRA 1UCWA 1GYNA 5LHFA 1P5BA 1MEIA 2J88A 3W7PA 4RX0A 1W5NA 4IX2A 4O15A 3GAYA 1QNVA 3S1XA 4Y6GA 4J9JA 4OWGA 2G96A 4AF0A 4GUGA 4D2JA 3FKKA 1QR7A 4LC6A 1JJKA 3W1AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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