5I77A

Crystal structure of a beta-1,4-endoglucanase from aspergillus niger
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
VFEWFGSNESGAEFGTNIPGVWGTDYIFPDPSAISTLIDKGMNFFRVQFMMERLLPDSMTGSYDEEYLANLTTVIKAVTDGGAHALVDPHNYGRYNGEIISSTSDFQTFWENLAGQYKDNDLVMFDTNNEYHDMDQDLVLNLNQAAINGIRAAGATSQYIFVEGNSWTGAWTWVDVNDNMKNLTDPEDKIVYEMHQYLDSDGSGTSETCVSETIGKERVTEATQWLKDNKKVGFIGEYAGGSNDVCRSAVSGMLEYMANNTDVWKGASWWAAGPWWGDYIFSLEPPDGTAYTGMLDILEAYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endo-beta-1, 4-glucanase
publication title Functional and structural analysis of Pichia pastoris-expressed Aspergillus niger 1,4-beta-endoglucanase
pubmed doi rcsb
source organism Aspergillus niger
total genus 121
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2016-02-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5i77A00
3EBVA 2XM1A 4BQ5A 3VIJA 3AIRA 1F4HA 3OGVA 5HPOA 4RE4A 3ZQ9A 1FA2A 1WO2A 5EB8A 4FLSA 4LYPA 4PMNA 4XZBA 1D7FA 2WCSA 3CZKA 2XVLA 1CXIA 4NI3A 4PMXA 4AEFA 3WELA 3AS3A 4M24A 3WQ4A 3BH4A 1ZJBA 3M7SA 1FFRA 1NWUA 2VUYA 4UCFA 2ZUNA 3L4VA 4OIFA 1GOOA 4PMRA 4UFHA 1MFVA 2PWEA 4GQQA 1I75A 3MMWA 4D6IA 1XH2A 3ARYA 5A69A 3WMSA 4PBGA 4E8CA 2WK2A 1E3ZA 4H04A 1YHTA 2FHBA 1XCWA 3BAJA 2YA1A 3S2CA 4CKQA 4HU0A 1CECA 1H09A 2CNCA 3T2PA 3BMVA 3M6DA 4U2YA 1J18A 3LMYA 1KCKA 3VTRA 3UG5A 2UY2A 4P7LA 3WF3A 5HDRA 5JBDA 6TAAA 1V3LA 2XSAA 2XVKA 4KGLA 2YL8A 3DYMA 1IV8A 2PC8A 1LG2A 1HP4A 3PZMA 3ZT5A 3SCWA 1KXTA 1HT6A 2CBJA 4UOQA 1I1WA 3EMZA 1E0WA 1JI1A 1WDSA 4UOJA 3W53A 1JG9A 1E40A 3VGHA 1V6YA 3L4UA 4DUWA 1G5AA 3VMNA 3CHCA 3QGVA 2ZX9A 3L2MA 3W82A 1BPLB 3PZUA 3WH9A 1QNOA 2QPUA 3WMCA 3GXMA 1V08A 1HKKA 6CGTA 4Q7NA 2PWDA 3BCDA 4J3WA 4FLOA 1J0IA 4P7NA 1UA3A 1W3JA 4CVUA 1VFFA 1GQLA 1WE5A 1V6WA 1HL9A 1M53A 5ECUA 1MYRA 3WD0A 4U3CA 4B9ZA 3RJYA 3VGEA 1J0ZA 3VIMA 3M46A 1Q6CA 3VM7A 2VZVA 1UKPA 1OD0A 3WH8A 5DO8A 1B31A 3SCNA 3T08A 4CCCA 3GTNA 3LPOA 4TOQA 3WQ8A 3FN9A 4D6HA 1LWHA 3WBEA 2UY5A 1C90A 1C8XA 5I79A 3AZRA 2PB1A 1I1XA 4OJYA 3GXFA 3VD9A 3WDRA 5E0FA 1KGXA 3BAYA 4NSBA 4NRRA 3VINA 2GSJA 1CXEA 3ALFA 4F9DA 3APGA 1ESWA 2XVGA 4R5EA 1DWGM 1CIUA 2FH8A 5DT7A 3UR8A 1UH4A 4JKMA 1V3HA 1UA7A 2EXOA 4M80A 4W89A 1J0HA 2CHOA 1E4NA 3VGFA 4PEEA 8CGTA 1UR4A 2G8ZA 1WZAA 3SCPA 3UETA 4H8UA 5CPSA 4M8UA 1JXKA 1W1YA 2EPOA 3AHXA 2J47A 5EBAA 3K8KA 5A2CA 5FL1A 1JIBA 5CJ5A 1V0KA 1J11A 4HOWA 5ABGA 2DDXA 3I3BA 2NT0A 4NRSA 4AZHA 2VX4A 5E70A 2W63A 1UD2A 2CYGA 2QV4A 5I77A 3PBGA 1JL8A 3GH7A 3ZO9A 5A8MA 3RM4A 4KRUA 1BQCA 4D72A 2W62A 1C91A 1NOUA 1CLXA 3POCA 2QLYA 3ZT7A 1JNEA 5CGTA 1QNPA 3A6OA 2G3MA 1AQ0A 2OWXA 1ODUA 4OUEA 4UOZA 2WKGA 3WNPA 1FFQA 2WKLA 4CU8A 1Q6EA 2XGIA 3WH6A 1O7AA 2Y4SA 1XD0A 2ZXQA 4WKFA 3L2LA 4PMVA 4IISA 5A6AA 3VGDA 1UH3A 4ZE5A 1WCGA 4BF7A 1MVYA 5D8ZA 1VEOA 1BSIA 1C7SA 3SCQA 1JZ5A 1MQQA 4C7FA 2CIPA 1NM9A 4LYQA 1CBGA 5I3DA 3GYCA 1ZL1A 4DM2A 4PSPA 5DFAA 2CITA 3ZOAA 2GJPA 1DEDA 1WDPA 2J62A 2V5DA 1HX0A 2J7FA 2VRKA 3K1DA 1B90A 3EDFA 3VMOA 2AMGA 3SEPA 3IJ9A 3OBAA 3W38A 1WDQA 2WM0A 2ZX7A 5E09A 2WZEA 1EQPA 4EKJA 3U5YA 2G3IA 3O6AA 2WVUA 1E6ZA 1SFSA 2EJ1A 1JI2A 1VENA 3CZLA 1V02A 2O9RA 1GONA 3AJ7A 2E8YA 3II1A 2ZOXA 1WDRA 1MQPA 2WC7A 4CD7A 3N17A 3GBEA 2WXDM 5EFDA 1SR0A 1WZLA 4CCDA 4HU8A 1EGZA 3F5LA 4R27A 4D6EA 1H11A 2XJ7A 1QPKA 3O2LA 1HJWA 3T2QA 3VIFA 4XUYA 4DUXA 3ARRA 1DWHM 2XHYA 4LQ1A 2CBUA 1UD8A 1XSJA 5CQ1A 2B31A 1HJVA 1GPFA 4FLQA 2YLLA 4CD8A 2CERA 1BTCA 1V3MA 4CN1A 3CZJA 1GNXA 2C8NA 1PZ3A 5A94A 1MW3A 3ARQA 2D1ZA 3AI0A 3WUGA 5DMYA 1S46A 4QAWA 4M29A 3K8MA 2CXGA 2J78A 4UFIA 4HTYA 4EE9A 4UFKA 2E9MA 4A3YA 1V0NA 2GJRA 2EPNA 3WD4A 5FCZA 4QCEA 1BYDA 2MANA 3VGBA 1AQMA 4JFTA 1V0LA 3W28A 4XB3A 1OWQA 4N42A 2WC3A 2X0YA 3F5JA 4IM4A 4C7GA 2FDMA 1BGAA 5I5RA 2J7EA 3HN3A 1C7TA 3ZMRA 4AZ5A 1HIZA 3ARWA 1PX4A 2A3CA 3WF4A 2NT1A 3N11A 4LX4A 1KQZA 1J9YA 3K4DA 3SCVA 2J7GA 2ZICA 3D5HA 1KWKA 3NDYA 3BLKA 1IZJA 3WFZA 4IPLA 1TE1A 1ISVA 1E6PA 1W9XA 1H41A 1KFWA 4JZ5A 4W8LA 2V5CA 5BWFA 3SUTA 4BQ3A 4FLRA 3WFLA 1QNRA 3L4YA 2WMFA 2XG9A 3EDKA 4TX8A 5A2BA 3OLIA 5IXEA 1XV8A 4M81A 4E4PA 1J0JA 2VMFA 2XVPA 4XV0A 1DHKA 3UEQA 2JEQA 1XH1A 2WW5A 1DWJM 2WMGA 3AFBA 1VJSA 3AHTA 3THCA 1EO5A 3AHVA 4A4AA 1ISWA 1A47A 1WNOA 3SUVA 3VNYA 5BRPA 1CGWA 2VI0A 5A3HA 2A3EA 4FMVA 4AW7A 2IUZA 2W67A 2DH2A 3TP4A 1CENA 2BY3A 2XFYA 1EHAA 4JFWA 1B0IA 4EANA 5GQBA 1ZBVA 3B8SA 3BSHA 1GUVA 1MQRA 2X8RA 1TUXA 2JIEA 1JYWA 6A3HA 3WDIA 2WVVB 2CHNA 3WENA 5HPCA 1E6XM 3FHAA 3B9EA 1UKSA 4UQEA 1FH8A 1ECEA 1QW8A 1US3A 3A3HA 5BYWA 2Y8KA 2WHKA 1AQHA 4P7RA 1G94A 5D9NA 1DWFM 1IT0A 5IFPA 5IHRA 2JE8A 2GUYA 1FHLA 1UD3A 2CKSA 4CVWA 3PN8A 3CPUA 3QHNA 3WL0A 5I0DA 1J0KA 5JIWA 3T0BA 4MDPA 4AD3A 4AD5A 2J7DA 1W3KA 4JHZA 3OGRA 2E9BA 4K68A 1QVBA 2XYLA 3WUEA 2GJXB 5LA1A 1CGTA 1JXJA 2WVVA 1RD6A 1QI3A 3N04A 4JKKA 1HVQA 1E70M 3MSGA 4PTMA 4QLKA 1OBAA 3WDPP 4JL1A 1FP8A 5F7UA 2VRQA 3WNOA 1E6SM 1G0CA 2V3EA 1UKQA 2VQTA 3NSMA 3U7BA 2BHZA 3S6TA 1MW1A 1W1PA 3FY1A 1PAMA 2Y8VA 3KL0A 4BA0A 5GNXA 4UQAA 2VL4A 4JFSA 3ARTA 1JYXA 1BHGA 4F8XA 4AZBA 5KZ6A 1JF6A 2GJXA 1KBBA 4YHGA 2WHLA 5HXMA 4Q22A 4MB4A 4J3UA 2VNCA 4BQ4A 2CPUA 1Y7VA 1ZS2A 1R7AA 4H8HA 1L8NA 4JKLA 1NOWA 1EH9A 2D22A 1W3LA 4S3KA 1GQJA 1YQ2A 2G3NA 2VZUA 2JF7A 3I3EA 2A3HA 1OIMA 2QMKA 3OLDA 4U5KA 3QHOA 1W9VA 3A4WA 2VVSA 3PZTA 2E40A 5AYIA 3TONA 4MNJA 1CNVA 1J01A 3OLGA 4PUEA 4GIAA 4OBRA 1BGGA 1E3XA 1BYBA 4N0RA 4ML4A 1NWSA 3UCQA 3EYPA 1GHSA 4PUDA 1QI2A 5CZKA 5A6SA 1B30A 1C8YA 1SYTA 4KWUA 5E6YA 5AYBA 3EDEA 2YOCA 1TA3B 3W4RA 1PIGA 2YLAA 2XVNA 5I6SA 1V0MA 1JAEA 2E9LA 2GDUA 5A6BD 2C7FA 4W86A 5FD0A 2NSXA 4YN5A 2E3ZA 1CXHA 5BXRA 1UKOA 4M1RA 3CUIA 4QP0A 1JDAA 1XYFA 4AD1A 3CMGA 1KB3A 2WC4A 3BC9A 3F5KA 4JCMA 3MO4A 3IJ8A 4CCEA 3AS2A 4M82A 1V6XA 1GQKA 2W61A 1M01A 1TA3A 2X1IA 1BYCA 2RGLA 2W92A 2W4XA 2DSWA 1B3VA 4MNLA 1CEOA 2O92A 3MV11 4J3SA 1E5JA 1OB0A 2G3JA 3NIYA 1CPUA 1E71M 1FOBA 1GVYA 1QHZA 2CKRA 1OGSA 2VX5A 5A8QA 1UR1A 1H2JA 1E4LA 3HU7A 4GPNA 3WD3A 4V2XA 4IUGA 1H4PA 1A3HA 2YL9A 3VIGA 1IZKA 3PZGA 2DSZA 4AWEA 1VRXA 4PMOA 3TA9A 1AVAA 3AIVA 3AOFA 1JDCA 4AXNA 1R85A 4DWSB 3L4WA 1XYZA 4CU7A 3ALGA 1QI4A 3RO8A 4MPKA 3EMCA 1DWIM 1JDDA 4L4PA 2DT1A 3CLWA 3MUY1 2ZXDA 4W8BA 2EBNA 4CD4A 5D9MA 4DM1A 1UWSA 2CBVA 1Z32X 3CHDA 3WY1A 2YDSA 1OD8A 3OB8A 4HP5A 1W2VA 4A3HA 2DGAA 2ZUSA 1G9HA 4JAWA 1GJUA 2DH3A 4WKHA 1QHOA 4PYSA 1G1YA 3MS8A 4RE2A 3VOCA 3G6MA 4DWSA 3NSXA 3RJXA 1TVPA 4Z2IA 4RE3A 2V3GA 3WDJA 1CDGA 1LG1A 4TX6A 2XWDA 2XUCA 3ZJ6A 3N12A 4ZFMA 2XGBA 1SMDA 1ZB5A 1CGUA 2BVDA 1W32A 4CGTA 3HJEA 1W9BM 4HOXA 1FP9A 4WF7A 1DP0A 1HNYA 3G6LA 1JZ2A 3SCRA 1BVZA 3ZJKA 4MB1A 2PBGA 5ABEA 3FW6A 3SUSA 3VPLA 3T0DA 2OYLA 1JZ7A 3WNMA 5FOOA 4PCTA 5IHSA 2JALA 1MWOA 1FH9A 2EEXA 3AS0A 3A4AA 5CG0A 4J3TA 3UR7A 2VCAA 1XC6A 4W8AA 1MXGA 5M5DA 2J25A 1BFNA 1JZ4A 1UOKA 2WNWA 1QBAA 3E1F1 1GOMA 2FGZA 3NCOA 3VDCA 3CBWA 5A6MA 2YL5A 5FL0A 1OGBA 2BNJA 2WLYA 3WNLA 3KE0A 4MJ4A 5BROA 3AMDA 3KEHA 5CPTA 5I23A 4QLJA 3RIKA 4AD0A 1UD5A 3U57A 5GNYA 4KMQA 4DWSD 8A3HA 4MB3A 1E6RA 2WVTA 3GNPA 4B15A 4WJXA 1B3WA 1Q6DA 4XX6A 2YA2A 2C0HA 5I78A 1HKIA 3O9NA 2DT3A 3GXIA 3FAWA 1JZ8A 1JZ6A 1HJQA 4GI8A 4WIWA 3B9DA 1SMAA 1QNQA 3IANA 1HJSA 1V3IA 1EIBA 2Z1SA 3WNKA 1GOIA 4AZ6A 4GO9A 1KCLA 5BRQA 3ARVA 1U2YA 1VEMA 3PZNA 5CLWA 2FHCA 2HVMA 4GXPA 1JFXA 2X05A 1LJYA 2Y2WA 1ZJAA 3ZT6A 1HKMA 2Z1KA 2ZUWA 3OIHA 2BHUA 4CN4A 4D71A 1KBKA 3AYRA 3GZAA 3WQ6A 2D3LA 3NUKA 1F4AA 5CXPA 3WL1A 1M7XA 3AS1A 3VU2A 3VD4A 3SCTA 1KXHA 1M04A 1TFVA 2FGLA 4X9YA 4D6FA 5HNNA 3VDBA 3GDBA 2D24A 4ZE4A 5CPQA 1V3JA 4IPNB 1W1VA 4D6GA 2D20A 3VUPA 3KWXA 2OWCA 1WP6A 4PMZA 2VTFA 1VFUA 3ZJ7A 5M03A 2XFFA 1X6LA 4OOZA 1OM0A 1WZMA 4H8VA 5JBEA 4ZENA 1VBUA 2YL6A 2DPEA 4M56A 3AMLA 4P8WA 3WDHA 5AC4A 2VR5A 4GZIA 1OT2A 3L4XA 2VVNA 4KH2A 3VD5A 2WCGA 2ZX5A 3NJ3A 4WKAA 3VVGA 2WSPA 3W24A 3WUBA 3VGGA 1Q6GA 1VB9A 5JBFA 3RM9A 3VIKA 1CGYA 4GI6A 4F66A 4PN2A 4MNKA 4H41A 1VIWA 5D8WA 1BVNP 1JAKA 3AIUA 4XZWA 4PMQA 2OYKA 1VBRA 9CGTA 4TTGA 2VX7A 5A6JA 2JFEX 2CESA 1CXFA 2WANA 4D1JA 3CO4A 2G4FA 3AIEA 4Z2KA 5C70A 2AAAA 1H0IA 3CUGA 2VZSA 1MFUA 2PWHA 2YBTA 1KQYA 4AEEA 4UQCA 5A2AA 2D2OA 1DWAM 2W66A 1NWTA 1OIFA 1NWRA 1OINA 2XIIA 1XSIA 2WAGA 1KGWA 3GNRA 3N18A 3KZSA 4ZXOA 2J75A 2BVTA 2DIEA 2ZUVA 7A3HA 2VR4A 4PTWA 1NQ6A 3M07A 2ZUTA 1W1TA 3U5UA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3EBV A;  2XM1 A;  4BQ5 A;  3VIJ A;  3AIR A;  1F4H A;  3OGV A;  5HPO A;  4RE4 A;  3ZQ9 A;  1FA2 A;  1WO2 A;  5EB8 A;  4FLS A;  4LYP A;  4PMN A;  4XZB A;  1D7F A;  2WCS A;  3CZK A;  2XVL A;  1CXI A;  4NI3 A;  4PMX A;  4AEF A;  3WEL A;  3AS3 A;  4M24 A;  3WQ4 A;  3BH4 A;  1ZJB A;  3M7S A;  1FFR A;  1NWU A;  2VUY A;  4UCF A;  2ZUN A;  3L4V A;  4OIF A;  1GOO A;  4PMR A;  4UFH A;  1MFV A;  2PWE A;  4GQQ A;  1I75 A;  3MMW A;  4D6I A;  1XH2 A;  3ARY A;  5A69 A;  3WMS A;  4PBG A;  4E8C A;  2WK2 A;  1E3Z A;  4H04 A;  1YHT A;  2FHB A;  1XCW A;  3BAJ A;  2YA1 A;  3S2C A;  4CKQ A;  4HU0 A;  1CEC A;  1H09 A;  2CNC A;  3T2P A;  3BMV A;  3M6D A;  4U2Y A;  1J18 A;  3LMY A;  1KCK A;  3VTR A;  3UG5 A;  2UY2 A;  4P7L A;  3WF3 A;  5HDR A;  5JBD A;  6TAA A;  1V3L A;  2XSA A;  2XVK A;  4KGL A;  2YL8 A;  3DYM A;  1IV8 A;  2PC8 A;  1LG2 A;  1HP4 A;  3PZM A;  3ZT5 A;  3SCW A;  1KXT A;  1HT6 A;  2CBJ A;  4UOQ A;  1I1W A;  3EMZ A;  1E0W A;  1JI1 A;  1WDS A;  4UOJ A;  3W53 A;  1JG9 A;  1E40 A;  3VGH A;  1V6Y A;  3L4U A; 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