5I79 | Genus

Total Genus 120

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	120
sequence length	302
structure length	302
Chain Sequence	VFEWFGSNESGAEFGTNIPGVWGTDYIFPDPSAISTLIDKGMNFFRVQFMMERLLPDSMTGSYDEEYLANLTTVIKAVTDGGAHALVDPHNYGRYNGEIISSTSDFQTFWENLAGQYKDNDLVMFDTNNEYHDMDQDLVLNLNQAAINGIRAAGATSQYIFVEGNSWTGAWTWVDVNDNMKNLTDPEDKIVYEMHQYLDSDGSGTSETCVSETIGKERVTEATQWLKDNKKVGFIGAYAGGSNDVCRSAVSGMLEYMANNTDVWKGASWWAAGPWWGDYIFSLEPPDGTAYTGMLDILEAYL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Endo-beta-1, 4-glucanase
publication title	Functional and structural analysis of Pichia pastoris-expressed Aspergillus niger 1,4-beta-endoglucanase pubmed doi rcsb
source organism	Aspergillus niger
total genus	120
structure length	302
sequence length	302
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2016-02-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	5i79A00

1L8NA 1HN1A 1CDGA 2BHYA 2W63A 2G3IA 1UQYA 1TA3B 2WHKA 1OD8A 4UNIA 2VCBA 5AC5A 3DHUA 1FHDA 2E3ZA 1KCKA 4UFMA 2W91A 1QI3A 2X05A 4Z2HA 1J9YA 2VQTA 5BXRA 1W9UA 3KL0A 1W9DM 1EOKA 4AZHA 2C8NA 4CU6A 1MXGA 3AMGA 2W67A 3AS0A 2ZX5A 4U5IA 1UD4A 3W37A 4Z2IA 2VZUA 5A8NA 5A2BA 2XFYA 4J3VA 2XSBA 2WANA 4GZIA 3ARYA 2GVYA 3WDIA 1BPLB 2J8FA 2ZX6A 1BHGA 2WNWA 3SUSA 4B15A 3POHA 3D3AA 3SUTA 1C91A 2VRKA 2ZICA 2OSXA 1DEDA 1KQYA 3W27A 1HVXA 4AEEA 3RJYA 4HA4A 1K9FA 3IANA 3W38A 3WEOA 1UWTA 2QHAA 3NIYA 1OIFA 1NOFA 1AMYA 1E5NA 3T2OA 4WJXA 2JFEX 5AYBA 3EDEA 3ZO9A 3D5HA 5IDIA 4L4PA 2C7FA 4AZBA 1GZJA 4EKJA 5I2UA 3SCRA 3WD2A 4OKDA 1LL7A 1CENA 1OT1A 1QI4A 3LPFA 3T0DA 2VO5A 1K6AA 1H49A 3WD4A 1FP9A 1EH9A 1CNVA 2ZXAA 3WUFA 4RE4A 5JIPA 5CPSA 3WNMA 1XSKA 3OBAA 4U2YA 3MANA 5E0FA 1W9BM 3ECQA 3ARVA 1ESWA 1HL8A 1ITCA 3CO4A 1W91A 4V2XA 4B9YA 1LG1A 3TP4A 3FAWA 4IM4A 3G6MA 1UZ1A 2DGAA 3N15A 3PTQA 1JYWA 2OWWA 3AMKA 4PTMA 5E70A 3QHMA 1V3MA 3AHYA 4DWSB 2DH3A 2E0PA 4MB1A 4AEFA 4JZ5A 2RGLA 1IV8A 4P7OA 1GQKA 4PMZA 1UUQA 1FH9A 3J7HA 3W81A 4W8LA 3WBAA 2WWDA 1D2KA 1MW1A 2BY0A 2EQDA 3WQ4A 1XCWA 5A8OA 2AAAA 2GK1B 1B3YA 2CYGA 3W28A 4AIOA 4TOQA 1C8YA 3AIQA 4JFSA 1HP5A 1VJSA 2FHCA 2VRJA 2VZSA 3VVGA 3AYRA 4TVDA 3UG5A 1JYXA 3VGBA 1EOMA 1HJUA 2D3LA 2CEQA 1ISVA 1VRXA 4P7NA 3SUVA 1H0GA 2J7HA 3AS2A 3SCVA 2XYLA 1JI1A 1FH7A 4H7VA 1BVNP 1HJXA 3SIMA 4GZEA 4NZCA 2J8GA 4CD4A 3AYSA 4W93A 5DF0A 4AD3A 4F8XA 2BXYA 1FHLA 4WIWA 5DMYA 4GI9A 1CXHA 1MW3A 2XGIA 4ZXLA 3MUIA 4IPNB 2E9LA 5LA2A 5BRPA 4TX8A 2WAGA 1ISYA 4RE3A 1NWUA 4B9ZA 5CPTA 3CZEA 3TTYA 2V3EA 3VD3A 3DECA 4MB3A 1IT0A 3WNKA 1TR1A 2ESCA 4D1IA 3VIOA 1PIGA 2J75A 4HPGA 4JFVA 4CU7A 1IZJA 1C3FA 3UETA 1GOMA 1N82A 1Q6CA 3RIKA 1OWQA 1KXVA 2WW5A 1XSJA 4TTUA 4HMEA 2D1ZA 1JD7A 1JFXA 1LL6A 5A1AA 3VD7A 4CD6A 2D23A 2XM2A 5IXEA 3K8KA 1NOWA 1V3LA 3ZSTA 3F5LA 4HMDA 4P8VA 3EMZA 1JNEA 2ZXQA 2W66A 3WELA 1ZS2A 3UESA 5CLTA 2BV9A 2YDRA 4C7DA 2F61A 5ABHA 3WUEA 3WH6A 4AD5A 2YOCA 4CN4A 4E8CA 4FK9A 1V0NA 3VD4A 3SCNA 5I79A 4AZCA 4P7RA 4K68A 2UY5A 2DT0A 4MNJA 3M6DA 2DH2A 2XFRA 1E55A 4JHOA 4U5KA 4BA0A 2XVKA 2WCAA 3GYCA 1J01A 3UR7A 2FGLA 5D9NA 2FH6A 5EBAA 3CHDA 3PZGA 1SMDA 1M01A 2VI0A 2X1IA 3SCQA 2CIPA 4JKLA 4UTFA 1PX3A 5A6SA 5LA1A 2V5DA 2X0HA 1UHVA 2XM1A 1NWSA 1BG9A 1YHTA 1UD6A 2DDXA 3OLDA 4F66A 4WKFA 2VL4A 1J0JA 4AISA 2XVLA 3A47A 3WUGA 4AYSA 1I1WA 2PB1A 2VX5A 3BGAA 3I3BA 3N18A 5FD0A 2GJRA 3AOFA 3VDCA 1TCMA 1JL8A 1ZL1A 1JG9A 3W6LA 4JFUA 2WMIA 2BY2A 5E6ZA 1WDSA 2WMJA 1J0IA 1JDDA 1LLOA 1E15A 3GZAA 1W1VA 3O9NA 5BCAA 1BYAA 2OYKA 1O6IA 1H2JA 4HZ7A 1GONA 3K4AA 5JBFA 5I24A 4PMNA 2JIEA 3ZQ9A 4QLLA 1QHZA 3VNYA 4PMRA 1B31A 4A3YA 2WMFA 1UWIA 1J11A 4OBRA 1JGIA 4PMQA 1GVYA 3WQVA 2CITA 4PUDA 1TFVA 1GOWA 3ARQA 2CHNA 1M53A 3NSNA 3THDA 2CBIA 1B90A 5ABEA 1Q6FA 2QMJA 1QPKA 1E6ZA 1UR4A 2DSKA 3SCSA 5EMYA 1KCLA 7TAAA 1EHNA 3GH7A 3UCQA 3VIHA 2XUCA 3L2LA 1GHSA 4UQCA 5LA0A 3CMJA 5DFAA 3CUIA 5E6YA 4DM2A 1CGXA 3WL1A 3ARPA 2C0HA 2AOSA 3ZJKA 3U7BA 4CN1A 3WQWA 4U3CA 4UFJA 2ZUNA 4CCCA 5BXPA 3THCA 3VIMA 1HNYA 1G5AA 4WKHA 4ATLA 2E9BA 4GIAA 1E6QM 4AC1X 1GJUA 3BMVA 4AMCA 2DSVA 4J3TA 4JAWA 1WDRA 4F9JA 1EDQA 3GNOA 4MNLA 2YIHA 1JFHA 2O9RA 4AXNA 1C92A 1E3ZA 5CJ5A 3CHEA 1LF1A 4OIFA 5A6KA 1UR2A 5I77A 1HIZA 1HP4A 5CSYA 3F5KA 2VJXA 4GPNA 2WM0A 4F9DA 4GQQA 1H4PA 2YL9A 4LYRA 2BHZA 3O2LA 1XYFA 1OGGA 1CXKA 1V3KA 1CPUA 1W3HA 5BROA 4CN6A 5CGMA 1UG6A 2J7DA 5I3DA 3BAWA 1WZAA 1UQZA 4MNKA 1E73M 3ALFA 1E56A 1J0ZA 3WUBA 3EDFA 4DM1A 3AIUA 7CGTA 2JF6A 3AIEA 2X0YA 4ZE5A 3VX1A 4URIA 2OYMA 4V27A 5CSUA 3GH5A 2NT0A 1GOQA 1OM0A 2V5CA 1XSIA 3WD0A 3WDHA 1V3JA 4P7LA 3OG2A 4TX6A 5DT7A 4ATWA 3VIKA 1VFOA 5A6LA 1HVQA 2J77A 1JZ2A 1E1FA 4J28A 3BSHA 1FA2A 1E72M 5IHRA 3ZJ6A 1CXLA 2GDUA 4W89A 3MUY1 3AMCA 5A6MA 4D6CA 1XD1A 1GOOA 1NOUA 1GQIA 3AHVA 4BCEA 3WDQA 4X0VA 1HKIA 1DWAM 2ZIDA 1R86A 3VM7A 5D9MA 4UCFA 1H3GA 5FOOA 1BTCA 2DQXA 5FL1A 4UQEA 1UR9A 2VVSA 3HMCA 2FGZA 1CBGA 1MW2A 4BS0A 3B9DA 1W32A 1X1NA 2GUYA 5CLWA 2BXZA 1VB9A 4H2CA 4TUFA 4JL2A 2J7EA 2ZXDA 1M03A 5I6SA 4H8UA 1MFVA 1HJVA 4AY1A 4NI3A 4AZGA 1WP6A 2WHLA 3IJ7A 1Q6GA 2G3MA 3SEPA 1WKYA 3VD5A 3CUFA 4JFWA 1XH0A 2BHUA 2ZWZA 2YL6A 1E0XA 1VFFA 1GOIA 1GORA 4EK7A 4JCLA 4CUCA 3N11A 1MVYA 3PZUA 3KE0A 1KGUA 2Y8VA 3GM8A 1SFSA 4QP0A 2J25A 1JZ7A 1K9DA 3ARRA 2EJ1A 4GXPA 3WL0A 5GNYA 4MAVA 3EBVA 4J3WA 1UKTA 1W9VA 6TAAA 2XTKA 4BZYA 1B3WA 5A94A 6CGTA 3PZOA 3WF2A 4CVWA 1UWRA 3A6OA 3DC0A 5I78A 3BLPX 3AI0A 1V0MA 3AXHA 4UQAA 1VAHA 4PUEA 3VD9A 8A3HA 3WNPA 5A6AA 1BG4A 5HPOA 1JZ6A 3W0KA 1GUVA 2VC9A 1R7AA 1GPFA 4P8XA 2G8ZA 2CETA 1OT2A 1QOXA 3VMOA 1TVPA 4UOQA 2ZXBA 1KWGA 3MUZ1 3AZTA 1B0IA 1KR0A 1EDTA 3MUAA 3PTMA 1C8XA 1GNXA 4UOZA 4BQ4A 4PCTA 3WQ6A 2B31A 3W82A 1MQQA 2VCAA 5IFPA 2WMGA 2XVPA 3GDBA 2WVUA 5FKYA 3WY1A 3WH8A 4UQDA 3MMDA 4PRWA 5ABFA 4W8AA 2BVYA 2WB5A 3CHFA 2WVTA 3RO8A 3FW6A 1PBGA 3B8SA 1EO5A 3L4ZA 1G94A 4KGLA 2CHOA 3AIBA 2PC8A 1V03A 2A3BA 2BVDA 5A2AA 1BYDA 3N12A 3UERA 1HL9A 2NW0A 4HOXA 3EDDA 5FL0A 4OBSA 1QNRA 5GNZA 3DHPA 3CIVA 1MQRA 3APGA 3IAPA 2QF8A 2NT1A 2VR5A 3TONA 2DSWA 2EEXA 3W25A 3A3HA 1V3HA 5JBEA 3OLGA 3SCWA 4D71A 1UH3A 4LQ1A 4PMUA 3CUJA 4UOJA 4X9YA 2G3NA 4PMXA 1GOKA 2WVVA 3FY1A 1VEOA 4JFTA 1Q6DA 3M46A 4QLKA 3VIJA 5KEZA 4KRTA 4FLRA 1PJ9A 4TTGA 2W62A 2XIIA 1XH1A 2E4TA 4W7WA 2WLYA 3OZPA 1HKKA 1JAKA 1HKJA 2IXUA 4BF7A 1QBBA 3VIFA 3F5JA 2ZUSA 4Q22A 4QAWA 3VM5A 3K4DA 1HJQA 3E1F1 1BVZA 1UWSA 4PTVA 4NF7A 3N9KA 3CUHA 3ZM8A 4MB4A 3ZR6A 4ACYA 3II1A 4AD2A 4IPLA 3CGTA 3CZJA 3W29A 2XJ7A 5CZKA 3WQ8A 2XWEA 3NDZA 4M56A 4HU0A 2VR4A 3T09A 4XB3A 2Z1KA 2WC3A 3MS8A 4KMQA 4AZCB 4W84A 3DYPA 2VCCA 2D0GA 2YBUA 2WMKA 3WDRA 2D0FA 1E6PA 2W61A 4R27A 2QPSA 4PMDA 4JKMA 3MSGA 4HA1A 1CECA 3OIHA 4GKLA 5I5RA 4N42A 3GBDA 3TOPA 4CD7A 1G9HA 1F4HA 2ZOXA 3UG3A 3L4TA 2EPKX 5A69A 1K9EA 2ZUUA 3WFZA 5DO8A 2X8RA 4EANA 3SURA 4Z2GA 4MNMA 3WH7A 1V6UA 2WZEA 1VFMA 1QW8A 3WH5A 1DWHM 1OIMA 4U3AA 1UR0A 1EHAA 2A3CA 4DUVA 1WAWA 1BSIA 3WEZA 2CERA 3RMEA 3GH4A 3VNZA 1EGZA 2J7FA 1E1EA 1KBKA 2OWXA 3AIWA 2JEPA 1NWRA 3EDKA 1R7OA 2JIWA 2WMIB 1FOBA 2WPGA 1PPIA 1W3KA 4MPKA 3ZIZA 4LYQA 1GVIA 1DWJM 4D72A 1GHRA 3JUGA 4XX6A 4FF5A 3RDKA 1G1YA 2D22A 1CWYA 3L4YA 4B16A 4WKAA 4MDPA 2HISA 2WVSA 3AS1A 1NM9A 3AS3A 3KZSA 4UQ9A 3AIVA 1ODUA 4PMOA 2ZX7A 4ZFMA 1M7XA 2CNCA 3WDJA 4CU8A 3QHOA 4CD8A 4HTYA 4D6DA 3PZMA 2Y4SA 5A8QA 2EPMX 2WWCA 3SCPA 1WNOA 3UEQA 7A3HA 2FH8A 3BCDA 1HF6A 1QNSA 4MADA 2O9TA 3MV11 5CQ1A 2EO7A 3NJ3A 3WKZA 3BC9A 3ARZA 3WIJA 4CD5A 2PI6A 1NQ6A 2QPUA 3MSDA 3AXXA 1W1TA 4P7QA 5A6JA 2WZIA 1ZBCA 4UFLA 4UFIA 1LQ0A 3VILA 4D6EA 4MJ2A 2RGMA 3KEHA 1V3IA 3B9EA 3RM4A 4JCMA 4PN2A 4ZEPA 1J10A 4D6FA 3BLKA 3SCUA 2J74A 2XHYA 3AIRA 3I3DA 1WZLA 4PSPA 2V3GA 4LX4A 4DWSC 1TVNA 2Y24A 4HOWA 1UA7A 1VEPA 4D1JA 2GJXA 3VGFA 1UOKA 1UA3A 4F79A 1GW1A 5JIWA 2YDSA 3BAKA 1H5VA 2ZX8A 1V6YA 3ARXA 1KGXA 4WSKA 1P6WA 2FDMA 4JL1A 1B3VA 3AZSA 3MKKA 3RCNA 2VRQA 3NYDA 1UD2A 1W1PA 1ZBKA 1V02A 3NSXA 2F2HA 5FCZA 2O9OA 1WE5A 1XRVA 4J3XA 1MWOA 1BFNA 1DWIM 3EMCA 4WK9A 2D3NA 1JZ4A 4XUYA 1XC6A 1J18A 1S46A 5D9PA 2VZOA 3N13A 2WHMA 3AHZA 3VMNA 1E6SM 1GJWA 4YPJA 3CPUA 4CVUA 4D6HA 1E5JA 2WC7A 3RJXA 3FNDA 1SMAA 1ITXA 5AY7A 5C8BB 1E0WA 4GO9A 3ZOAA 1WO2A 2VVNA 3MU7A 5D4YA 1XGZA 1UKPA 1LL4A 2CBVA 3K8LA 2VTFA 5ECUA 3VGDA 4W5UA 1BYBA 3PZQA 4FLOA 3K46A 4H41A 2YDQA 2PWHA 4ZE4A 4J7RA 3GBEA 1KQZA 3IJ8A 2OSYA 4GINA 1E6RA 3VINA 1JXJA 1OD0A 3VGHA 2JALA 2NSXA 5A6BA 4X0NA 3WDPP 3GXMA 1C7SA 4OOUA 3IK2A 1JNDA 1KBBA 4PMVA 1MQPA 3PZVA 4LXFA 1ZB5A 4GZJA 1QNPA 2PWGA 1XH2A 3POCA 3BAIA 2VQUA 1CTNA 1US2A 3K1DA 3O6AA 3AQUA 1WDQA 2V3FA 4P8UA 1E70M 4EE9A 1H1NA 4MTVA 1TZ7A 4PTXA 4WSJA 1DWFM 1B3XA 1WPCA 5CPQA 3T08A 4AZ7A 4BQ3A 2DIEA 1EIBA 1W2VA 2J7CA 2WKLA 5A95A 4PBGA 2XIBA 1E4LA 2V3DA 1IZKA 1E3XA 1H0IA 1W3LA 3IAQA 1EQCA 2YA2A 3WD3A 4BQ2A 1D7FA 1NP0A 1UH4A 1PZ3A 2EXOA 1L0PA 3OB8A 1E9LA 2D20A 2DEPA 2VURA 3QR3A 3VIPA 5LYRA 1J12A 4HZ6A 2PWDA 3A4AA 1AQ0A 1BYCA 2JEQA 1GQLA 4FMVA 1DHKA 2OWCA 2O9PA 5GNXA 1RPKA 2EBNA 1B9ZA 3PZTA 3QOKA 5JUVA 4MJ4A 4H04A 4QDMA 5C70A 3WENA 1NWTA 4M82A 4UFKA 1LG2A 1U2YA 2BVTA 5GQBA 3S6TA 1JD9A 3LPGA 1FH8A 3VKKA 4ATDA 1QBAA 1CGYA 2YLAA 1CLVA 1HJSA 1MFUA 2W92A 1CYGA 5HDRA 4W7VA 3ZJ7A 4MAZA 3AFBA 2D24A 1RP9A 1XV8A 2PWFA 5ABFB 2WSPA 2WYSA 2ZWYA 3AHTA 2WBGA 1O7AA 2ZE0A 1JF6A 5CG0A 1PAMA 1TMQA 3WF0A 3RM8A 1US3A 3VDBA 1ZU8A 3NUKA 3GXDA 2G3JA 2AMGA 3VUPA 1QI0A 2GJPA 4YHEA 1Q4NX 6A3HA 4CCEA 3WMCA 2WSKA 1U30A 1PX4A 3ALGA 2OSWA 5FIPA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5I79A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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