5I83A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp bound to the benzodiazepinone g02773986
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
KIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Protein binding/inhibitor
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Fragment-Based Discovery of a Selective and Cell-Active Benzodiazepinone CBP/EP300 Bromodomain Inhibitor (CPI-637).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5i83A00
4UYFB 5L97A 4Z6HA 5A5OA 5II2A 3P1CA 4O7EA 4TU6A 5DY7A 4QR5A 2FSAA 4HXPA 5F60A 4PCEA 5DFBA 4O75A 5ENHA 5EP7A 5LUUA 5DLXA 4O70A 5CY9A 4LZ2A 2RS9B 5ETDA 5E9VA 4QSSA 4PKLA 5FE8A 2GRCA 4LYWA 5E3GA 5FFYA 4QSQA 5DW2A 4Z1QA 3SVGA 5IGMA 4LR6A 3O36A 1JSPB 5C8GA 4X2IA 3MULA 4DONA 5D24A 5LJ0A 3U5NA 4NR7A 5CTLA 5AD2A 5ETBA 5A5PA 4PS5A 5BT3A 4QZSA 4YYMA 5CQ6A 4MEPA 4AKNA 5CUEA 5D3PA 5CQ4A 4UYFA 4Z93A 5KTUA 4TT2A 4QSRA 4NR8A 5HQ7A 5LJ1A 4N4HA 3LJWA 5I86A 2R0SA 5FFVA 4J0RA 5FH7A 4NUCA 5AMFA 3G0JA 5G4SA 5IG6A 4TS8A 2D82A 5FE2A 4ZW1A 5LKUA 5LVQA 4CUSA 3UW9A 3MQMA 1E6IA 3TLPA 2RO1A 3LQIA 2YEMA 4NRAA 5KTWA 4HXRA 4QEVA 3IU6A 4XUAA 5E9IA 4OUFA 4UYGA 2YW5A 3O33A 4QNSA 5IGNA 4NXJA 5HEMA 5EPBA 1EQFA 3LQHA 2YYNA 4J0SA 3Q2EA 4UITA 5E0RA 4N3WA 3ONIA 5FH8A 5EWHA 4YH4A 4NS5A 4QC1A 5D3NA 5DBMA 2DWWA 4O72A 2F6NA 2DKWA 4FLPA 5KTXA 3HMFA 4Q0NA 5EI4A 4UIXA 4HXOA 5FE1A 4UYDA 4ALGA 5H1VA 4MR4A 5E9YA 4CUQA 5DW1A 5E73A 5E3DA 2YDWA 5FE4A 5COIA 4ZC9A 5DYXA 4NR9A 4QEWA 4TZ2A 4CUUA 4LYIA 4N4GA 4QR3A 2DVRA 4O7AA 5CQ8A 4BW3A 4C67A 4HXLA 5D3SA 5DKHA 3P5OA 4A9NA 5LKTA 5ENIA 5ENCA 5I7XA 4YYIA 4HXSA 5A85A 5HQ6A 5A81A 4YH3A 5FE3A 4A9KA 4NRBA 2RNXA 5F1LA 4HBWA 5FG5A 4QBMA 5HCLA 4NR4A 5II1A 5E74A 5D26A 5DX4A 5H1TA 5I88A 4BHWA 3UV5A 4ALHA 5CGPA 4A9EA 4TTEA 4YC9A 5AD3A 5H85A 5F25A 4UIYA 4LDFA 3SVHA 4YADA 4YYHA 3Q2FA 4O77A 4UYEA 4YYNA 2E7NA 5LKZA 2I7KA 2MJVB 5EISA 5ENGA 5CQAA 1WUGA 5HJCA 4HBYA 5FE6A 4YABA 3U5KA 2D9EA 4J1PA 3G0LA 5HELA 4YK0A 2N9GA 4NYXA 4UIZA 5A7CA 2RNYA 3K2JA 4LZSA 3I3JA 5E9MA 4KCXA 5D3HA 3QZSA 5D3JA 4MR3A 4TU4A 5E9KA 5E7DA 5C4QA 5F5ZA 5A83A 2E7OA 4J3IA 5CU8A 5FFWA 4CLBA 5EQ1A 5DYCA 4QYDA 1ZS5A 4NRCA 5HLSA 5LVRA 4PTBA 3O37A 4TZ8A 5TB6A 4TQNA 5DYUA 5L8TA 5A5NA 5L99A 4YYGA 3UVXA 5HRWA 3MB4A 3SVFA 4QEUA 4Z1SA 5A5RA 5FBXA 4YYJA 4QSUA 4WHUA 5A5QA 2RFJA 4QSVA 5ENEA 4N4FA 5DFDA 4BW4A 3U5JA 4UYHA 5DYAA 5FG4A 4NYWA 4TT4A 4XY9A 5I40A 2RI7A 3UVYA 4HXMA 4Y03A 5DKCA 4N4IA 4O74A 3QZVA 5CPEA 5D0CA 5FE5A 1N72A 5FDZA 5KU3A 4YATA 3HMHA 3O35A 4YYKA 2F6JA 3AADA 3GG3A 5F3AA 4YY4A 3MB3A 5IGKA 5EWDA 4O71A 4KV4A 5J0DA 2WP1A 5L96A 3MXFA 5TCMA 4YBSA 5F1HA 4MENA 4LRGA 5FE9A 3JVKA 4QUUA 5DKDA 5CFWA 2OO1A 4QSTA 4O7CA 4MR6A 2DVQA 5I89A 4MEQA 2NXBA 4TYLA 5JI8A 5EK9A 3MUKA 3DAIA 2LSPB 5C87A 2R10A 4A9JA 4IOQA 5D25A 4HBVA 4HXKA 4MR5A 5CQ5A 2YQDA 4LYSA 5E9LA 5EICA 3U5OA 5LJ2A 5I83A 5I1QA 5CRZA 5ENFA 2L85A 4NQNA 5IBNA 1X0JA 3JVLA 3QZTA 5C89A 4A9HA 5K29A 4QSPA 5CQ7A 5ENJA 5JWMA 4PCIA 3DWYA 3UV4A 4CFKA 5EWWA 4O7FA 5EVAA 5EWCA 5F36A 5HFQA 4BJXA 4WHWA 3LXJA 5EGUA 4O7BA 5BT4A 4O78A 5FB0A 4YY6A 5HQ5A 4TT6A 5CUGA 5EPSA 5EV9A 2DVSA 4QUTA 4Q0OA 4NUDA 5D7XA 3UV2A 3UVWA 4A9OA 4IORA 1JM4B 3ZYUA 5ACYA 4BW1A 2R0VA 5KO4A 4CFLA 4IOOA 5CZGA 4IR4A 3RCWA 5HRVA 3S91A 2H60A 2OUOA 4KV1A 3IU5A 2WP2A 4BW2A 5FH6A 4XUBA 4IR6A 5HENA 1F68A 3U5LA 5IGLA 4CL9A 5L98A 4O76A 5D3LA 5EA1A 3NXBA 5C85A 4ZQLA 5FB1A 3S92A 2L5EA 5CUAA 5EM3A 5DLZA 4HBXA 5CRMA 5IIDA 5A5SA 2G4AA 3AQAA 3O34A 4PY6A 3U5PA 4QC3A 4E96A 4UIVA 5HRXA 5CUBA 2DVVA 4NYVA 2OSSA 4A9IA 5CQ3A 4OGJA 5I7YA 5EWVA 5CUDA 4Z6IA 4NR5A 3FKMX 3JVMA 4QSWA 4XY8A 5F2PA 5F63A 5CS8A 4NR6A 5D3TA 5LKXA 4RVRA 4CUPA 4OGIA 2L84A 2YEKA 4A9MA 4QR4A 4UIUA 2R0YA 4YAXA 5HM0A 2KTBB 5I29A 3JVJA 4QY4A 3HMEA 4QYLA 5KHMA 5HFRA 3P1DA 5ENBA 3P1EA 4XYAA 4QSXA 5EU1A 4IR5A 3LQJA 3P1FA 4MEOA 5CUCA 2RNWA 4GPJA 4IR3A 5FE0A 4A9FA 4LZRA 4UIWA 4WIVA 4YYDA 5L8UA 1WUMA 4YBMA 5AMEA 5I80A 5FG6A 5D3RA 5FE7A 4HXNA 3UVDA 5A82A 2DATA 4A9LA 3D7CA 4C66A 4F3IA 5H1UA 5CP5A 5DFCA 4CURA 4LC2A 5EPRA 4NUEA 4YBTA 5BT5A 5C7NA 3U5MA 2E3KA 4CUTA 5F62A 4NQMA 2I8NA 5CQTA 4QB3A 5F61A 2YELA 5G4RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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