5I86A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp bound to the benzodiazepinone g02778174
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
KKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Protein binding/inhibitor
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Fragment-Based Discovery of a Selective and Cell-Active Benzodiazepinone CBP/EP300 Bromodomain Inhibitor (CPI-637).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5i86A00
4ZQLA 4UITA 4Z1SA 5EQ1A 4TU4A 2RS9B 4MEQA 2YYNA 2YDWA 4N4GA 4HXOA 4UYFB 5F62A 3P1EA 5EI4A 4O71A 1EQFA 2R0YA 4YABA 2RNXA 4IR6A 5HRWA 4TQNA 3U5NA 5EGUA 4N4IA 4QY4A 1JM4B 3UVYA 4KV1A 5I40A 4ALGA 5HQ5A 2N9GA 2YEKA 2L5EA 4E96A 4MEPA 2YW5A 1ZS5A 3U5OA 5CPEA 5CQ7A 3UVDA 4KCXA 5I1QA 4QUUA 4QUTA 5D25A 4J3IA 3UVXA 4PS5A 5FFVA 2YQDA 2R0VA 4IOQA 4CUSA 3QZTA 5ENBA 4IR3A 5CQTA 5CY9A 4QSRA 3UV5A 5FH6A 3U5PA 5H85A 4HXSA 5A5RA 2G4AA 3DAIA 4A9HA 5KTUA 4RVRA 5CUDA 4J0SA 4C67A 5FDZA 4NR6A 5D3TA 4TT4A 4BW2A 2DWWA 4PKLA 5D7XA 5E3GA 5C8GA 4KV4A 4UIZA 5JWMA 4YYDA 4QEWA 5DYXA 4Z1QA 5AD3A 2OO1A 5HENA 4TT6A 4QSUA 1WUGA 4OUFA 5ENCA 5FB1A 5EU1A 5LVRA 4NXJA 5CUAA 3S91A 5HLSA 4A9OA 5DLZA 5A5PA 5FE2A 3SVHA 3JVKA 4HXMA 2L85A 5DY7A 4YH3A 5ETDA 4PCIA 4NUCA 5CZGA 5FE1A 4A9FA 4MEOA 5IGKA 3MQMA 4LYSA 5LVQA 2DVVA 4TS8A 2F6NA 5D3JA 4UYGA 5F36A 3P1DA 4IR4A 4UIWA 4A9EA 1WUMA 5E9LA 5IG6A 3JVMA 4YYHA 4XUAA 5F1LA 5IIDA 5EWHA 4NR8A 5EPRA 4YYIA 3G0JA 4YY4A 5KTWA 3IU5A 5A5QA 3O36A 5FH8A 4Z93A 4QEUA 3AADA 4YBMA 5CUEA 4CUPA 5FFYA 5CQAA 5BT5A 5HCLA 5LUUA 5C87A 5KHMA 5EWWA 4LZRA 5C4QA 3LXJA 2WP1A 4NR9A 3O35A 4UIYA 4O70A 5EPSA 4NUEA 4MR4A 2I7KA 5DFDA 2RNWA 5CQ8A 5HJCA 4NR7A 4YYMA 1X0JA 3HMFA 5LKZA 4GPJA 5F3AA 5A7CA 5EISA 3MULA 5BT4A 1JSPB 5FG4A 2I8NA 4Z6HA 5HM0A 4AKNA 2RFJA 5F2PA 2DVSA 5FB0A 4BW1A 5IGLA 4QB3A 4O7AA 4NYXA 4UYDA 4NQNA 4HBYA 5E9VA 4N3WA 5KU3A 2E7NA 5CTLA 5D24A 4CL9A 5E3DA 5FE0A 5L8TA 5EV9A 2YEMA 3D7CA 4TTEA 4A9IA 5HFRA 4WHWA 4YY6A 5DKDA 5EA1A 5FE9A 5E9IA 5I7YA 4A9LA 2DATA 4NR5A 5E9YA 3UV4A 2DKWA 4LZ2A 4UYFA 4UIXA 2R0SA 3HMHA 4BJXA 5FE5A 5EVAA 5I89A 4HXNA 3JVJA 4YBSA 4IORA 5II1A 2F6JA 4BHWA 4CFLA 4NRBA 4ZW1A 4QYDA 5KTXA 5HELA 4O76A 5L96A 5C85A 4HBXA 4QC1A 4NUDA 4CUQA 5FE6A 4YK0A 2OUOA 5COIA 5FFWA 4YH4A 4UYHA 3QZVA 4QEVA 3UV2A 5DYCA 4X2IA 5ENEA 5A5NA 4YYGA 5FG6A 5AMFA 5A5OA 4HBVA 5IGMA 2E7OA 5EICA 4YATA 2YELA 3O37A 5ENFA 3LQHA 5CFWA 4YYJA 4LZSA 3TLPA 4HXKA 1E6IA 4O7FA 4PY6A 3MB4A 3LJWA 3NXBA 5TB6A 5L8UA 4YC9A 3SVGA 4QR4A 4Y03A 5EWCA 3JVLA 5D3LA 3U5KA 5CUCA 5D3RA 4MR6A 3U5LA 3MUKA 4MR3A 5II2A 2GRCA 4TU6A 3ONIA 3O34A 4Z6IA 4XY9A 5ENIA 4QZSA 5FE7A 5F63A 4CURA 5EPBA 4PTBA 4A9KA 5F61A 5C89A 2MJVB 3Q2EA 5G4RA 5JI8A 5L98A 4QSVA 5LJ1A 5HFQA 4NR4A 3IU6A 5CRMA 4QBMA 5FH7A 3GG3A 4N4HA 5LKTA 5DYUA 5J0DA 5DX4A 4NS5A 4QSQA 4YADA 5CS8A 5DW1A 4O7CA 4O78A 4LC2A 4C66A 3K2JA 1F68A 5IBNA 5HQ6A 4HXLA 3O33A 5D26A 4HXPA 4UIUA 5EWDA 5LJ2A 2E3KA 4YYKA 5FE3A 5DFBA 5DLXA 4O7EA 2DVQA 5D3NA 4BW4A 3UW9A 2DVRA 4LYWA 5F1HA 4ALHA 5HRVA 3LQIA 4OGJA 4O74A 4QC3A 3U5JA 3AQAA 2H60A 5CRZA 5ACYA 5HRXA 4XUBA 5LKXA 4CUTA 5TCMA 5ETBA 5ENHA 4QNSA 5DKCA 4CUUA 4QSWA 4LYIA 5E9MA 4QSPA 3P5OA 3P1CA 4FLPA 4TT2A 2FSAA 2R10A 3P1FA 4CLBA 3U5MA 4IOOA 5EM3A 5D3SA 4UIVA 4QYLA 4TZ2A 2D82A 5LKUA 5AMEA 5CP5A 5EWVA 4O75A 4O77A 4QSXA 4O72A 5E7DA 4BW3A 4DONA 2L84A 4N4FA 5I88A 5K29A 5FE8A 2LSPB 5L99A 4QSSA 4Q0OA 4CFKA 4TYLA 4TZ8A 4OGIA 5F5ZA 5L97A 5CQ3A 5IGNA 4NQMA 3SVFA 3UVWA 2KTBB 4QSTA 5F60A 5HQ7A 5F25A 4Q0NA 3MB3A 4O7BA 5H1TA 5H1VA 5I86A 4WIVA 4IR5A 3DWYA 5I83A 5BT3A 3QZSA 4LR6A 4QR5A 4A9NA 3Q2FA 5DFCA 4A9MA 5KO4A 5EP7A 4XYAA 5I80A 4PCEA 4MENA 2RI7A 3I3JA 5D0CA 5FBXA 5A5SA 4NYVA 3G0LA 4HXRA 5AD2A 5C7NA 4NYWA 5G4SA 5CUGA 5A82A 5D3PA 4ZC9A 2NXBA 4LDFA 5CU8A 5A81A 2WP2A 3FKMX 5EK9A 4LRGA 4XY8A 5A83A 4NRAA 5FE4A 3MXFA 5D3HA 5CUBA 5CQ6A 4UYEA 5I7XA 1N72A 3LQJA 4YYNA 5DYAA 2RO1A 4YBTA 4MR5A 4NRCA 4A9JA 4WHUA 5H1UA 5CQ4A 5E0RA 4QR3A 5HEMA 2OSSA 5I29A 4HBWA 3S92A 5CGPA 3ZYUA 2D9EA 4YAXA 5E9KA 5DW2A 5CQ5A 5ENJA 5A85A 2RNYA 5E73A 5ENGA 3HMEA 5FG5A 3RCWA 4J1PA 4J0RA 5LJ0A 5E74A 4F3IA 5DBMA 5DKHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZQLA 4UITA 4Z1SA 5EQ1A 4TU4A 2RS9B 4MEQA 2YYNA 2YDWA 4N4GA 4HXOA 4UYFB 5F62A 3P1EA 5EI4A 4O71A 1EQFA 2R0YA 4YABA 2RNXA 4IR6A 5HRWA 4TQNA 3U5NA 5EGUA 4AKIA 4N4IA 4QY4A 3ERRA 1JM4B 3UVYA 4KV1A 1ZKRA 5I40A 4ALGA 5HQ5A 2N9GA 2YEKA 2L5EA 4E96A 4MEPA 2YW5A 1ZS5A 3U5OA 5CPEA 5CQ7A 3UVDA 4KCXA 5I1QA 4QUUA 4QUTA 5D25A 4J3IA 3UVXA 4PS5A 5FFVA 2YQDA 2R0VA 4IOQA 4CUSA 3QZTA 5ENBA 4IR3A 5CQTA 5CY9A 4QSRA 3UV5A 5FH6A 3U5PA 5H85A 4HXSA 5A5RA 2G4AA 3DAIA 4A9HA 5KTUA 4RVRA 5CUDA 4J0SA 4C67A 5FDZA 4NR6A 5D3TA 4TT4A 4BW2A 2DWWA 4PKLA 5D7XA 5E3GA 5C8GA 4KV4A 4UIZA 5JWMA 4YYDA 4QEWA 5DYXA 4Z1QA 5AD3A 2OO1A 5HENA 4TT6A 4QSUA 1WUGA 4OUFA 5ENCA 5FB1A 5EU1A 5LVRA 4NXJA 5CUAA 3S91A 5HLSA 4A9OA 5DLZA 5A5PA 5FE2A 3SVHA 3JVKA 4HXMA 2L85A 5DY7A 4YH3A 5ETDA 4PCIA 4NUCA 5CZGA 5FE1A 4A9FA 4MEOA 5IGKA 3MQMA 4LYSA 5LVQA 4AKGA 2DVVA 4TS8A 2F6NA 5D3JA 4UYGA 5F36A 3P1DA 4IR4A 4UIWA 4A9EA 1WUMA 5E9LA 5IG6A 3JVMA 4YYHA 4XUAA 5F1LA 5IIDA 5EWHA 4NR8A 4AI6A 5EPRA 4YYIA 3G0JA 4YY4A 5KTWA 3IU5A 5A5QA 3O36A 5FH8A 4Z93A 4QEUA 3AADA 4YBMA 5CUEA 4CUPA 5FFYA 5CQAA 5BT5A 5HCLA 5LUUA 5C87A 5KHMA 5EWWA 4LZRA 5C4QA 3LXJA 2WP1A 4NR9A 3O35A 4UIYA 4O70A 5EPSA 4NUEA 4MR4A 2I7KA 5DFDA 2RNWA 5CQ8A 5HJCA 4NR7A 4YYMA 1X0JA 3HMFA 5LKZA 4GPJA 5F3AA 5A7CA 5EISA 3MULA 5BT4A 1JSPB 5FG4A 2I8NA 4Z6HA 5HM0A 4AKHA 4AKNA 3VKGA 2RFJA 5F2PA 2DVSA 5FB0A 4BW1A 5IGLA 4QB3A 4O7AA 4NYXA 4UYDA 4NQNA 4HBYA 5E9VA 4N3WA 5KU3A 2E7NA 5CTLA 5D24A 4CL9A 5E3DA 5FE0A 5L8TA 5EV9A 2YEMA 3D7CA 4TTEA 4A9IA 5HFRA 4YY6A 5DKDA 5EA1A 5FE9A 5E9IA 5I7YA 4A9LA 2DATA 4NR5A 5E9YA 3UV4A 1PUOA 2DKWA 4LZ2A 4UYFA 4UIXA 2R0SA 3HMHA 4BJXA 5FE5A 5EVAA 5I89A 4HXNA 3JVJA 4YBSA 4IORA 5II1A 2F6JA 4BHWA 4CFLA 4NRBA 4ZW1A 4QYDA 5KTXA 5HELA 4O76A 5L96A 5C85A 4HBXA 4QC1A 4NUDA 4CUQA 5FE6A 4YK0A 2OUOA 5COIA 5FFWA 4YH4A 4UYHA 3QZVA 4QEVA 3UV2A 5DYCA 4X2IA 5ENEA 5A5NA 4YYGA 5FG6A 5AMFA 5A5OA 4HBVA 5IGMA 2E7OA 5EICA 4YATA 2YELA 3O37A 5ENFA 3LQHA 5CFWA 4YYJA 4LZSA 3TLPA 4HXKA 1E6IA 4O7FA 4PY6A 3MB4A 3LJWA 3NXBA 5TB6A 5L8UA 4YC9A 3SVGA 4QR4A 4Y03A 5EWCA 3JVLA 5D3LA 3U5KA 5CUCA 5D3RA 4MR6A 3U5LA 3MUKA 4MR3A 5II2A 2GRCA 4TU6A 3ONIA 3O34A 4Z6IA 4XY9A 5ENIA 4QZSA 5FE7A 5F63A 4CURA 5EPBA 4PTBA 4A9KA 5F61A 5C89A 2MJVB 2EJNA 3Q2EA 5G4RA 5JI8A 5L98A 4QSVA 5LJ1A 5HFQA 4NR4A 3IU6A 5CRMA 4QBMA 5FH7A 3GG3A 4N4HA 5LKTA 5DYUA 5J0DA 5DX4A 4NS5A 4QSQA 4YADA 5CS8A 5DW1A 4O7CA 4O78A 4LC2A 4C66A 3K2JA 1F68A 5IBNA 5HQ6A 4HXLA 3O33A 5D26A 4HXPA 4UIUA 5EWDA 5LJ2A 2E3KA 4YYKA 5FE3A 5DFBA 5DLXA 4O7EA 2DVQA 5D3NA 4BW4A 3UW9A 2DVRA 4LYWA 5F1HA 4ALHA 5HRVA 3LQIA 4OGJA 4O74A 4QC3A 3U5JA 3AQAA 2H60A 5CRZA 5ACYA 5HRXA 4XUBA 5LKXA 3D1BA 4CUTA 5TCMA 5ETBA 5ENHA 4QNSA 5DKCA 3VKHA 4CUUA 4QSWA 4LYIA 5E9MA 4QSPA 3P5OA 3P1CA 4FLPA 4TT2A 2FSAA 2R10A 3P1FA 4CLBA 3U5MA 4IOOA 5EM3A 5D3SA 4UIVA 4QYLA 4TZ2A 2D82A 5LKUA 5AMEA 5CP5A 5EWVA 4O75A 4O77A 4QSXA 4O72A 5E7DA 4BW3A 4DONA 2L84A 4N4FA 5I88A 5K29A 5FE8A 2LSPB 5L99A 4QSSA 3D1DA 4Q0OA 4CFKA 4TYLA 4TZ8A 4OGIA 5F5ZA 5L97A 5CQ3A 5IGNA 4NQMA 3SVFA 3UVWA 2KTBB 4QSTA 5F60A 5HQ7A 5F25A 4Q0NA 3MB3A 4O7BA 5H1TA 5DBMA 5H1VA 5I86A 4WIVA 4IR5A 3DWYA 5I83A 5BT3A 3QZSA 4LR6A 4QR5A 4A9NA 3Q2FA 5DFCA 4A9MA 5KO4A 5EP7A 4XYAA 5I80A 4PCEA 4MENA 2RI7A 3I3JA 5D0CA 5FBXA 5A5SA 4NYVA 3G0LA 4HXRA 5AD2A 5C7NA 4NYWA 5G4SA 5CUGA 5A82A 5D3PA 4ZC9A 2NXBA 4LDFA 5CU8A 5A81A 3FKMX 2WP2A 5EK9A 4LRGA 4XY8A 5A83A 4NRAA 5FE4A 3MXFA 5D3HA 5CUBA 5CQ6A 4UYEA 5I7XA 1N72A 3LQJA 4YYNA 5DYAA 2RO1A 4YBTA 4MR5A 4NRCA 4A9JA 4WHUA 5H1UA 5CQ4A 5E0RA 4QR3A 5HEMA 2OSSA 5I29A 4HBWA 3S92A 5CGPA 3ZYUA 2D9EA 4YAXA 5E9KA 5DW2A 5CQ5A 5ENJA 5A85A 2RNYA 5E73A 5ENGA 3HMEA 5FG5A 3RCWA 4J1PA 4J0RA 5LJ0A 5E74A 4F3IA 4WHWA 5DKHA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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