5IXEA

1.75a resolution structure of 5-fluoroindole bound beta-glycosidase (w33g) from sulfolobus solfataricus
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
489
structure length
485
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDGYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-galactosidase
publication title Full and Partial Agonism of a Designed Enzyme Switch.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 200
structure length 485
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2016-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5ixeA00
4AEEA 1CLVA 4HA1A 1E71M 2VC9A 4NZCA 3GH5A 1Z32X 3N18A 4FF5A 3ZM8A 3MUAA 1UR4A 1EDQA 5A6SA 2YDQA 3VMPA 1VEOA 1W1YA 5M03A 3IAQA 4W86A 1C8QA 1WNOA 2YJQA 2PWEA 1E4NA 4E8CA 5E70A 2ZUNA 5JBFA 3W28A 3MUY1 3F5LA 1I75A 4ZFMA 3KEHA 3ZIZA 5M3WA 1EXPA 1AQ0A 1K6AA 1BYDA 3W37A 3ECQA 1E72M 5D9MA 3VD7A 4DM2A 5BXRA 4UTFA 2XIBA 1JDCA 3GXMA 3PZIA 4E2OA 2GSJA 3VIPA 5CG0A 3EDKA 1K9FA 1TCMA 1JZ7A 4D1JA 3BC9A 1XSIA 2G3IA 3BAWA 4AD0A 3DHPA 2OSWA 2J7HA 1JNEA 1XYFA 2FHCA 2VVSA 4JIEA 2PC8A 2D1ZA 1ZB5A 2EPNA 2WC4A 1YQ2A 2Q8XA 4LPCA 4GIAA 1BGAA 2J7BA 1UR2A 1XSJA 3W0KA 5LA1A 1EH9A 1UD5A 1WAWA 4A4AA 4UFKA 3BMVA 3PTMA 4ZXOA 4P7LA 4TVUA 3CZJA 3GBEA 6A3HA 4UCFA 4J3TA 2VOTA 4TXEA 5A6AA 2B31A 3VOCA 3VGGA 1ZU8A 1Q6GA 5CPSA 4MNLA 4AD3A 5CGMA 3IJ8A 1UKOA 1VENA 2WK2A 1VFOA 5FKYA 5E09A 3RMEA 3O9NA 2VRKA 5LA0A 3S2CA 3GXDA 8CGTA 3UR8A 2G4FA 1PAMA 3PZUA 5IFPA 3TTOA 4UQBA 1JDDA 1S46A 1E5JA 4M81A 2JFEX 4RE2A 1V3HA 2GJPA 2WBGA 1XGZA 3WH5A 1B31A 4D6DA 3W4RA 1KXVA 3I3DA 3BGAA 4CGTA 5D4YA 3PZNA 5ABEA 3LPGA 1KWKA 3POHA 1JGIA 4HA3A 4DWSD 2BXYA 4HMDA 5DFAA 4X9YA 1B0IA 5HOSA 5ABFB 4J3UA 4KWUA 5JBDA 3WNLA 1JAKA 4GZIA 4MAVA 3A47A 3W53A 5BROA 4YPJA 1GOOA 3WQ4A 4AIUA 1JYXA 1SR0A 1HNYA 2YKKA 1DTUA 2J8FA 1F4HA 3AHYA 3T0AA 5I2UA 3NSXA 3WNKA 2J7CA 4GI9A 3VDHA 5I24A 1E6NA 1UR8A 1FH7A 1MQPA 1F4AA 1US2A 2VX5A 4TUFA 3M6DA 3GNPA 2X2YA 2XVPA 5IHRA 5IXEA 1O7AA 3WD4A 2CBVA 2VVNA 1C8XA 2JIEA 2Y8VA 3ARUA 3QOMA 4CN6A 1JG9A 3WBAA 3II1A 1LWHA 4BQ5A 1ISVA 3W81A 1GONA 4N0RA 5D9NA 2J75A 3CZGA 4JAWA 2PWGA 4ZE5A 4AD5A 4W88A 4GQQA 1MW3A 4W8AA 3RO8A 3O6AA 4JKLA 3VU2A 5A2BA 1JXKA 1QI3A 4J27A 1AMYA 1AVAA 3UERA 2GJXB 4ZENA 4F9DA 2CITA 4B9ZA 2XHYA 1E55A 3LPOA 2FHFA 3VPLA 2XVKA 3L4UA 4HOWA 2GJXA 1ZJAA 2XSAA 2D0GA 2GUYA 3FNDA 4U2ZA 5C8BB 3CMGA 3SCUA 2FGLA 3GNRA 1G0CA 3CH9A 3JUGA 4F8XA 2OYKA 1XD1A 2XVNA 5CQ1A 4JHZA 1ITCA 3CUJA 4W89A 3ARYA 3SUVA 2VURA 1ISWA 3N17A 1XH1A 3T2PA 5D9PA 1OIFA 2WYSA 3TOPA 3ZJKA 1HJUA 4H04A 3ZOAA 1KWGA 2JF7A 3AS0A 1JDAA 3QHNA 2DPEA 3ARXA 3AROA 1BVNP 3RJXA 2YDSA 4DWSC 1MW2A 4BF7A 1OM0A 3GBDA 2BY0A 4S3JA 3T08A 1OWQA 3ARPA 4KMQA 3OG2A 4TTUA 1XRVA 4IPNB 3RM4A 2W62A 4J3WA 3A4AA 2WLYA 5CZKA 5C70A 5BCAA 4DM1A 4PMYA 3WSUA 3NCOA 3AYSA 3CHEA 1RP8A 1GHSA 1UA7A 1EA9C 3WF1A 4UOZA 3T0DA 2E8YA 1GW1A 1VEPA 1JNDA 2ZUVA 2JIWA 1H5VA 5AYBA 1HJVA 1W9XA 3GZAA 4P7RA 1FFRA 1NARA 1ISZA 1I1WA 2E8ZA 2EXOA 2QF8A 3B9EA 3ARWA 1GOWA 4D6GA 2WVUA 1DEDA 2J7FA 1A3HA 1ZJBA 1LG1A 4OOZA 4PTWA 4AD1A 2ZUWA 4A3HA 4J7RA 4UFIA 5JBEA 3AMCA 5GNYA 4AZBA 1OINA 3KE0A 1W9DM 3N04A 3AIUA 4C7GA 4N42A 4CD7A 5FOOA 3VMNA 4HU8A 4P8VA 3VIGA 4AIOA 3L2LA 2DT0A 3WNPA 2VL4A 1IZJA 1W1VA 1HL9A 1FHLA 2JALA 3VIHA 1PX3A 2BHZA 3OB8A 4WKFA 4W5UA 1QNOA 2WMIB 2OLHA 1NWUA 3UESA 2D22A 4LYRA 4Z2KA 2X0YA 4B16A 1QPKA 1ZL1A 2YOCA 1HKJA 4BQ4A 1Q4NX 1GVIA 5DT5A 1XYZA 1KFWA 4JFVA 3VKKA 1R86A 2O92A 1JZ2A 1PJ9A 3AJ7A 2RGLA 1J0KA 3N13A 3K8MA 3FW6A 2MANA 4F9JA 3VVGA 2BV9A 3RILA 2YIHA 3U7BA 3WDJA 2D0FA 4H8HA 4ATWA 2AOSA 1JIBA 2DH3A 3VGEA 1DHKA 4LXFA 4C7FA 3VGBA 5D8WA 1UZ1A 1BGGA 4HPGA 4J3SA 2DEPA 3ZT5A 1I1XA 1A47A 2DSZA 4J3XA 4XV0A 1VBUA 3THCA 1CZ1A 3I3EA 2XWEA 3A4XA 2VQUA 3KL3A 4GI6A 2CEQA 3M07A 5TD4A 2EPOA 4PEEA 1V6UA 3WD0A 3VIMA 4KH2A 3DYOA 2O9TA 3WH8A 4U3CA 1IV8A 2E9LA 4WSJA 3UEQA 5EFFA 1UKSA 5A2CA 4WJXA 2VRJA 1FP8A 1GNXA 5AC5A 2EJ1A 4PMRA 3ARRA 2W5FA 1BG4A 3SCWA 3SCTA 3HJEA 1B3XA 2VZSA 1V0KA 2CKRA 2WZHA 3K4DA 3AZRA 2WVVB 1WZMA 2NW0A 5A6BD 2E9BA 3SCRA 2DGAA 2WKGA 2WZEA 3OLGA 1H0IA 2AAAA 2WVVA 2HISA 2YA1A 2XM1A 4AZCB 1H09A 2VTFA 3BMWA 5FCZA 2QPSA 1M53A 2E0PA 4U5KA 3VMOA 3ZT6A 1HX0A 5HPOA 1DWHM 4AY1A 2OYMA 4AZCA 4QFUA 1P6WA 3WIJA 1B2YA 4CUCA 1PX4A 5IFTA 1GPFA 1NM9A 2VCBA 2XWDA 2C7FA 1VJSA 3BLKA 2W61A 1VAHA 5A6LA 4PMDA 4AEFA 3U5UA 2WNWA 3IANA 1EHAA 2BY2A 4Y7EA 3CO4A 2ZUUA 2J4GA 3WQWA 4W84A 1WP6A 1E1FA 3N9KA 4OJYA 3WEZA 3ARSA 4QCEA 2J77A 1WZKA 4B9YA 1VB9A 4PMXA 1CEOA 5KZ6A 1VJZA 2YLLA 3W27A 1R87A 1TZ7A 3IK2A 4JHOA 4PBGA 3WNNA 1W3HA 1W2VA 1PIFA 2WPGA 2EQDA 4WF7A 1UD2A 5I6SA 3WUGA 2D23A 3OGVA 1UR9A 1TUXA 1Y7VA 1UKTA 1L8NA 4GO9A 3CPUA 2FGZA 2VMFA 1GOIA 1W3JA 5A6BA 2O9RA 2GK1B 1JZ3A 2WVTA 1EOMA 4TVCA 1E6PA 3F4VA 1KBBA 1N82A 2WMHA 3B8SA 5A6KA 2GK1A 3J7HA 2WVSA 2WCSA 1EDGA 1BF2A 3UETA 2FH8A 2V5DA 4NRSA 4Z2HA 5I0DA 1FP9A 4JL2A 3MMDA 3VD9A 1AQHA 3WDQA 1MVYA 4AYSA 2X0HA 4UOQA 3EDJA 4CVUA 1UD6A 1CYGA 3CUHA 1KB3A 4GINA 3BSGA 1JFHA 3WKZA 3PZ9A 1W9VA 2CETA 1WDPA 3SCQA 1OT1A 2XFFA 1G94A 1UQZA 2W91A 4UQEA 5GQBA 4M24A 1PBGA 4OKDA 2PF0A 1OGBA 1W2PA 3ARVA 1CNVA 1C7SA 4WK9A 4MJ4A 2YLAA 1EGZA 1R7OA 3OLEA 1JAEA 1BQCA 1ECEA 3PZTA 4C7DA 1DWJM 1ZBCA 1MQRA 3KL0A 4AD4A 4AZHA 3MV11 3FN9A 1DWAM 1XCXA 1V3LA 4EAMA 4PTXA 3AXIA 1CENA 4W7UA 2CHOA 1ZBKA 3A3HA 1MFUA 3K4AA 1UH2A 5CJ5A 3AIQA 1J0YA 1GJWA 4UOJA 3WNMA 3FHQA 1NQ6A 4CCCA 1KQZA 1PIGA 2F61A 1VEMA 2WAGA 2VZVA 4P8WA 2DT3A 1V0LA 4JL1A 1V6VA 3ARTA 3AIVA 3U5YA 4PSPA 4MADA 5HBFA 5HPCA 2ZWYA 2CBUA 1QHOA 1WZLA 4IUGA 3RCNA 2PWDA 3WELA 5BRQA 1GOMA 2WHLA 2ZX6A 1UWQA 1CGVA 4W93A 1W1TA 1EDTA 3AYRA 4QAWA 3GM8A 1W9UA 4AXNA 3SCSA 4PUEA 4W85A 1CGYA 1G1YA 4HZ7A 4HOZA 2YA0A 1TVNA 1R7AA 1V6XA 1UUQA 4MJ2A 2V3GA 1B3ZA 3LMYA 1KBKA 3N15A 1HF6A 4QLJA 1CXEA 1HJXA 1YHTA 4IPLA 2CBIA 3CMJA 4CCEA 1DWIM 4PMQA 2E40A 3VNYA 1JZ4A 5ABGA 4UZUA 3AISA 1H4PA 2VRQA 3EDDA 2ZUTA 1QNRA 3BAXA 4R5EA 2J62A 1WDSA 2ZE0A 1MW1A 2VZUA 2ZICA 4AZIA 3IJ7A 4F66A 3N1AA 4QP0A 3PTQA 4ATLA 5CXPA 1E70M 3CIVA 3WEMA 4L4OA 1RPKA 2V3DA 3BLPX 1K9EA 1J12A 3WEOA 1OD0A 1EHNA 4MB1A 4JKMA 4HTYA 4RE3A 1EOKA 3MMWA 4RL3A 1GQJA 1JI2A 4HZ8A 3B9AA 5FL0A 1SMAA 3EDFA 3THDA 5DF0A 2QMKA 1CXKA 4W87A 1QBAA 1HVQA 4NRRA 1J0JA 2ZXAA 2ZX8A 4YN5A 4KGLA 2YBUA 2GDVA 1NH6A 4Z2JA 3AFBA 3A4WA 1UWSA 4CU7A 1W91A 3AI0A 4DWSA 3AIWA 4GO8A 1FH9A 1X6LA 5EB8A 3TP4A 4OIFA 2VCCA 3F5KA 3OGRA 4ZXLA 5BXSA 6CGTA 4QLKA 2NT0A 4D6IA 4H8UA 2YL6A 4Z2LA 4U2YA 2BNJA 4V2XA 4ML4A 3CUIA 1QNQA 4P7QA 1NWRA 5A69A 4PMNA 3GYCA 4MPKA 5EMYA 4UZSA 4QDMA 3UG3A 5LYRA 1LG2A 1MW0A 2V3EA 3PZQA 1OGSA 2VNCA 5LA2A 1UD4A 2NT1A 3L4YA 1HP5A 4LGXA 1H3GA 2WMFA 1US3A 1E3XA 3WH7A 3BH4A 2VI0A 4B3KA 5GNZA 1CXIA 4U33A 3BCFA 3NDYA 1BHGA 4XUYA 2FDMA 1L0PA 3ZJ7A 2GDUA 3PHAA 4MB4A 2XSBA 1FHDA 5BXPA 1LJYA 1JZ8A 3MSGA 2Y2WA 1CPUA 4HZ6A 3SUTA 2OYLA 2HVMA 4NF7A 3AOFA 1KGWA 1KR0A 1B30A 1OIMA 2V38A 4E8DA 1NP0A 5I78A 3IJ9A 1KGXA 1V3KA 3T2QA 4W8LA 1JXJA 1LWJA 2ESCA 1ISXA 3T0BA 3VO0A 1JZ5A 3FAWA 3GNOA 3W26A 7TAAA 1TMQA 2XYLA 5CSYA 3GXIA 3AIEA 3N11A 1JL8A 2CKSA 4XZBA 2VX6A 1XHGA 4UFMA 5CSUA 1QHPA 3T2OA 3ZSSA 3ZJ8A 1GQKA 2Y4SA 2O9OA 1QI4A 2A3BA 1BTCA 4XZWA 5DMYA 4GZJA 1BFNA 1E1EA 1HJWA 1V3MA 1NOWA 3WL0A 3FXYA 2CERA 2UWFA 4UFJA 1GVYA 2BVYA 1OBAA 4LQ1A 2QLYA 3VGFA 1TVPA 1ODUA 4UQCA 3SCOA 4P7NA 1UZ4A 2DDXA 1DWGM 1W3KA 3POCA 4EE9A 5E0FA 2DSVA 1GQLA 3DC0A 3WD3A 3WH9A 1B9ZA 1C7TA 2OWCA 1E4IA 2UY5A 5E0CA 2OSXA 3NSMA 1QNSA 4TTGA 1NOUA 4H41A 4GXPA 3ALFA 5F7UA 5D9OA 2WWDA 3N12A 4IM4A 1SYTA 4MNJA 4TX8A 2J74A 2C0HA 5FL1A 2W4XA 1OT2A 3EYPA 3GXFA 3OZPA 3WQ6A 3HU7A 3ARQA 4LYQA 3DECA 3MUIA 3AMGA 4MB5A 2EEXA 1B90A 5BRPA 4HA4A 2WBKA 1B1YA 1UKPA 3AHVA 4W8BA 5BXTA 1QHZA 3VM7A 2VQTA 4BS0A 4D6EA 2YL9A 1KR1A 3VINA 1CGWA 3CZKA 2D3LA 1PX8A 1J0IA 1BVZA 2BS9A 5E6YA 4AMCA 1CGXA 1E15A 2CNCA 2DQXA 5EFDA 2ZOXA 3RIKA 4K68A 3SUSA 1H0GA 1PEZA 1KXHA 1K9DA 3WF0A 1J0ZA 3WUEA 2W92A 4HPHA 3PZGA 1E73M 4J3VA 3RDKA 2WC7A 5A8PA 3LPPA 2DSKA 3SIMA 3VDCA 3VDAA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4AEE A;  1CLV A;  4HA1 A;  1E71 M;  2VC9 A;  4NZC A;  3GH5 A;  1Z32 X;  3N18 A;  4FF5 A;  3ZM8 A;  3MUA A;  1UR4 A;  1EDQ A;  5A6S A;  2YDQ A;  3VMP A;  1VEO A;  1W1Y A;  5M03 A;  3IAQ A;  4W86 A;  1C8Q A;  1WNO A;  2YJQ A;  2PWE A;  1E4N A;  4E8C A;  5E70 A;  2ZUN A;  5JBF A;  3W28 A;  3MUY 1;  3F5L A;  1I75 A;  4ZFM A;  3KEH A;  3ZIZ A;  5M3W A;  1EXP A;  1AQ0 A;  1K6A A;  1BYD A;  3W37 A;  3ECQ A;  1E72 M;  5D9M A;  3VD7 A;  4DM2 A;  5BXR A;  4UTF A;  2XIB A;  1JDC A;  3GXM A;  3PZI A;  4E2O A;  2GSJ A;  3VIP A;  5CG0 A;  3EDK A;  1K9F A;  1TCM A;  1JZ7 A;  4D1J A;  3BC9 A;  1XSI A;  2G3I A;  3BAW A;  4AD0 A;  3DHP A;  2OSW A;  2J7H A;  1JNE A;  1XYF A;  2FHC A;  2VVS A;  4JIE A;  2PC8 A;  2D1Z A;  1ZB5 A;  2EPN A;  2WC4 A;  1YQ2 A;  2Q8X A;  4LPC A;  4GIA A;  1BGA A;  2J7B A;  1UR2 A;  1XSJ A;  3W0K A;  5LA1 A;  1EH9 A;  1UD5 A;  1WAW A;  4A4A A;  4UFK A;  3BMV A;  3PTM A;  4ZXO A;  4P7L A;  4TVU A;  3CZJ A;  3GBE A;  6A3H A;  4UCF A;  4J3T A;  2VOT A;  4TXE A;  5A6A A;  2B31 A;  3VOC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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