5JQTA

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii in complex with benzoxaborole at ph 7.4
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
MSHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Benzoxaborole as a new chemotype for carbonic anhydrase inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 260
sequence length 260
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2016-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5jqtA00
4LHIA 5A25A 1RJ6A 1RZDA 4JSSA 1CA2A 5FDCA 3OKVA 4Q83A 3V3HB 2CA2A 2WEGA 4FU5A 5DOHA 4RFDA 2AX2A 1YDAA 2FOQA 2FOUA 3NB5A 1CNYA 3N4BA 5JG3B 2HFWA 1HCBA 1KOPA 5FNHA 4CNRA 3KKXA 4WUPA 4COQA 4MTYA 3M1JA 3D92A 3ZNCA 3MZCA 3JXGA 1CVHA 4ZX0A 1AVNA 3DCCA 1BNNA 5FL6A 3RG3A 5EKJA 1KEQA 2X7SA 4RH2A 4PZHA 4R5BA 2ZNCA 3MHMA 4WL4A 4JS6A 1G46A 4Q9YA 1IF9A 4YGNA 5SZ2A 5LMDA 3MHLA 3P44A 1I9PA 3M1QA 4Q7SA 4FPTA 5EHWA 3S76A 3BL0A 4FIKA 3T83A 4CA2A 4YGLA 3S8XA 3NJ9A 5BNLA 1DMXA 3DCSA 3PYKA 2NNSA 4K1QA 4JSZA 5DSQA 4K0ZA 2NWPA 1CNKA 3RGEA 5DRSA 3KOKA 1CVAA 3P3JA 1FQRA 1HEBA 4Q87A 2NXRA 1CNGA 1ZE8A 1UGFA 2W2JA 4R5AA 4Z1JA 4Z1EA 2NXSA 3DVDA 3V3FA 3D9ZA 4PYXA 2X7UA 4JSAA 3S74B 1IF6A 5G01A 2OSMA 3RYJB 1AM6A 1ZSCA 4K0SA 4HEWA 4IDRX 3F7UA 3M04A 4Q99A 4E4AA 5DOGA 4XZ5A 5EHVA 3F4XA 3IAIA 3T5UA 4ILXA 1FR7A 4HBAA 5FLQA 3RZ7A 4Q7VA 1LUGA 1OKNA 2POWA 1CRAA 5BYIA 1FQNA 2WEJA 3MMFA 2FOYA 2QOAA 1MUAA 4Q90A 2FNNA 2NMXA 1CANA 1LG6A 1FQMA 3SAPA 1ZSAA 4QK1A 3HLJA 3OYSA 2HKKA 4N0XB 2X7TA 1LG5A 5FNLA 3SBIA 4MDGA 4Q49A 4PXXA 1I9NA 1XQ0A 4ZAOA 5EHEA 3M3XA 5SZ1A 1TE3X 4DZ7A 1CRMA 5EH7A 2HL4A 4KNJA 3IBIA 5SZ4A 5FDIA 3V5GA 2NNGA 1ZNCA 3DV7A 3B1BA 3KWAA 3HKQA 5SZ5A 3DC3A 2ILIA 1V9EA 3S73B 4E49A 1THKA 3RYXB 3RG4A 1XEVA 1CINA 4CQ0A 2FNMA 1LGDA 3EFIA 3M2YA 3N2PA 5E5UA 3RYVB 5FLPA 1CAJA 5EZTX 5FNGA 4X5SA 4Q06A 5BRWA 2NN7A 3S97A 3KLDB 4HF3A 3N3JA 4HEYA 4HU1A 4TWMA 4E3HA 3M5SA 4GL1X 3R17B 3F8EA 1UGBA 4R59A 2Q38A 1FLJA 3FE4A 1ZSBA 1YDBA 1RAYA 4Q7WA 1HVAA 3RYYA 3P3HA 2NN1A 4G0CA 3ZP9A 4QIYA 3S78B 3MNHA 5G0CA 2NNOA 4HT0A 1EOUA 2EU2A 3IEOA 1T9NA 4IWZA 2HNCA 4K13A 2FOSA 5G03A 2Q1BA 1CVFA 5FNMA 4CNWA 3S72B 5DSRA 3V2JA 2H15A 5AMLA 5FLTA 1CAOA 3K2FA 3D8WA 3OILA 5JDVB 1G3ZA 4PQ7A 1RZAA 1FSRA 1IF7A 4Z0QA 1CNCA 4YGKA 1RJ5A 3MNKA 4M2VA 5E2NA 1BN3A 3IBNA 1CIMA 4YHAA 1CVEA 5FNIA 1I9OA 5FNJA 5DSLA 2WEOA 3M14A 4KNIA 4QK3A 1CAIA 3S71B 3V3GB 4YX4A 2QO8A 5JGSB 3HKNA 3RZ8A 4M2RA 4Q8ZA 1TBTX 3OIKA 5IPZA 3KNEA 5AMGA 1IF4A 5DSKA 5JGTB 4KP8A 1FQLA 1H4NA 4MO8A 1RZCA 1I9MA 2WEHA 4RIUA 8CA2A 1KWRA 1YO2A 4RUXA 4RUZA 3T5ZA 1OKLA 2POUA 3VBDA 2FMGA 4Q81A 3D0NA 4QJOA 5JG5B 3CZVA 4Q09A 4Q6EA 4C3TA 1HECA 4RUYA 4YXOA 4Q8YA 5FLSA 1G48A 1TEUX 3F7BA 2HOCA 3P5AA 4Y0JA 1JV0A 1Z9YA 5L6KA 7CA2A 1BNQA 4Q08A 1YDCA 1ZGFA 4DZ9A 3PO6A 2F14A 1JCZA 4KNNA 3TVOX 3K7KA 1DCAA 4KNMA 4KUWA 4HEZA 5JQ0A 4PYYA 3CAJA 3Q31A 5EIJA 2H4NA 5FLOA 5SZ0A 4RFCA 3NI5A 4N16A 4Q07A 3M67A 2FNKA 3BETA 1A42A 1YO0A 3PJJA 5FLRA 4BF1A 4YVYA 4YXIA 3UYQA 1CNIA 4K0TA 2WD2A 3CA2A 4XIWA 2OSFA 1G4JA 3P4VA 4E5QA 3DVBA 3OYQA 1BNTA 3RZ1B 2NWYA 1UGAA 4QK2A 3HS4A 4FVOA 3M2NA 4ZWXA 5SZ7A 3ML5A 1G54A 1DMYA 5BRVA 4L5WA 3P58A 1BNVA 2AW1A 4YGFA 3DCWA 1FSNA 1TTMA 1CAZA 4L5VA 1CNXA 4YWPA 1JD0A 1I90A 1ZH9A 1MOOA 1TH9A 2CBDA 4ITPA 3KIGA 2EZ7A 1FSQA 4L5UA 2HD6A 3W6IA 9CA2A 3RJ7A 3DC9A 3K34A 4MDLA 4YXUA 3RZ5A 1TB0X 1G45A 3T84A 2GEHA 3L14A 3OKUA 3W6HA 4QTLA 4RIVA 5FL5A 1CVBA 5E28A 3LXEA 2FOVA 3QYKA 1KWQA 3U45X 3SBHA 1G6VA 3FFPX 2GD8A 5AMDA 2VVAX 3M98A 1H9QA 4M2UA 5CACA 5DSIA 2WD3A 1BCDA 1CAYA 2NWOA 1HCAA 4QJ0A 4KP5A 4ZWZA 3D93A 3M2ZA 4Q0LA 2NWZA 1G53A 3R16A 5DSNA 3ML2A 5FL4A 3S9TA 4XFWA 4Q7PA 6CA2A 1Y7WA 4MLTA 3MYQA 1CAKA 4Q6DA 4MDMA 5CA2A 3P55A 2CBEA 3V2MA 4ZX1A 4QJMA 1HEAA 1UGGA 4XE1A 1BN1A 5EOIA 1LZVA 4LU3A 2O4ZA 1HEDA 4YYTA 4JSWA 3M1KA 2CBBA 1HUGA 1G52A 4RN4A 3JXHC 3UYNA 4QJXA 4WW8A 3KOIA 3RZ0B 3DBUA 4E3GA 3BL1A 4MLXA 1KOQA 4TWLA 2CBCA 1CCSA 1CVCA 4ITOA 4KUYA 3HKTA 1RZBA 2POVA 3CYUA 3DD8A 1CVDA 3M96A 4XIXA 5G0BA 1OQ5A 5EH5A 1BN4A 2CBAA 1CAHA 5C8IA 3EFTA 4FRCA 5E5RA 4Z1NA 3DVCA 3S75B 1CZMA 1TEQX 3MHIA 4E9OX 5EKMA 3M40A 4QSJA 1BZMA 4E3FA 1I9QA 4CACA 4KAPA 4UOVA 1HUHA 1CNBA 5E2RA 1Z97A 3MWOA 3OY0A 1G4OA 1TG9A 1ZGEA 3MHOA 5BRUA 1V9IC 1G0EA 4BF6A 4WUQA 4ZWIA 3GZ0A 3U7CA 3U3AX 3U47A 1UGEA 1G1DA 1CAMA 1J9WA 1H9NA 3KONA 4G7AA 1ZFQA 3M2XA 2IT4A 1CNJA 1TG3A 3FW3A 3RLDA 1CCTA 1IF5A 4ETQC 3IBLA 1Z93A 1XPZA 4FL7A 3MNUA 3IGPA 1CNHA 2NNVA 1I91A 3HFPA 4YGJA 3IBUA 3P5LA 2CABA 3B4FA 3TMJA 5E2SA 5L3OA 2FW4A 1BNMA 1BICA 3OIMA 4M2WA 5EKHA 3MNIA 5JEGB 4QSAA 5DSPA 5DVXA 1I8ZA 1BNWA 4QSBA 3T85A 3V3JA 4ZWYA 1BNUA 1CILA 3RYZA 1CNWA 1CA3A 1URTA 3DA2A 4QIZA 1FR4A 4HT2A 3M5EA 3T82A 1I9LA 3HKUA 1UGDA 5CJFA 3SAXA 2QP6A 3DAZA 5JESB 5J8ZA 3MHCA 1AZMA 2ABEA 1XEGA 3MNAA 4FVNA 4KV0A 5DSOA 1CCUA 4LP6A 5DSMA 4QJWA 3N0NA 2VVBX 4WW6A 4QEFA 1OKMA 1RZEA 2FMZA 1IF8A 1G0FA 4CNVA 3S77B 4Q8XA 5SZ3A 1CALA 3C7PA 2NXTA 5SZ6A 4KUVA 3DD0A 4QJPA 12CAA 1DCBA 5A6HA 3TVNX 5E2KA 1BV3A 1UGCA 1YDDA 5HPJA 1ZFKA 2Q1QA 4QSIA 3MNJA 4Q78A 4WR7A 4Z1KA 5DSJA 5JEHB 3V3IB 5E2MA 5EH8A 5JQTA 1YO1A 3JXFA 3M5TA 1F2WA 4QY3A 5FNKA 4E3DA 5JEPB 3V7XA 5CLUA 3M1WA 3MDZA 4CNXA 1RAZA 4BCWA 3KS3A 2EU3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4LHI A;  5A25 A;  1RJ6 A;  1RZD A;  4JSS A;  1CA2 A;  5FDC A;  3OKV A;  4Q83 A;  3V3H B;  2CA2 A;  2WEG A;  4FU5 A;  5DOH A;  4RFD A;  2AX2 A;  1YDA A;  2FOQ A;  2FOU A;  3NB5 A;  1CNY A;  3N4B A;  5JG3 B;  2HFW A;  1HCB A;  1KOP A;  5FNH A;  4CNR A;  3KKX A;  4WUP A;  4COQ A;  4MTY A;  3M1J A;  3D92 A;  3ZNC A;  3MZC A;  3JXG A;  1CVH A;  4ZX0 A;  1AVN A;  3DCC A;  1BNN A;  5FL6 A;  3RG3 A;  5EKJ A;  1KEQ A;  2X7S A;  4RH2 A;  4PZH A;  4R5B A;  2ZNC A;  3MHM A;  4WL4 A;  4JS6 A;  1G46 A;  4Q9Y A;  1IF9 A;  4YGN A;  5SZ2 A;  5LMD A;  3MHL A;  3P44 A;  1I9P A;  3M1Q A;  4Q7S A;  4FPT A;  5EHW A;  3S76 A;  3BL0 A;  4FIK A;  3T83 A;  4CA2 A;  4YGL A;  3S8X A;  3NJ9 A;  5BNL A;  1DMX A;  3DCS A;  3PYK A;  2NNS A;  4K1Q A;  4JSZ A;  5DSQ A;  4K0Z A;  2NWP A;  1CNK A;  3RGE A;  5DRS A;  3KOK A;  1CVA A;  3P3J A;  1FQR A;  1HEB A;  4Q87 A;  2NXR A;  1CNG A;  1ZE8 A;  1UGF A;  2W2J A;  4R5A A;  4Z1J A;  4Z1E A;  2NXS A;  3DVD A;  3V3F A;  3D9Z A;  4PYX A;  2X7U A;  4JSA A;  3S74 B;  1IF6 A;  5G01 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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