The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
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| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| publication title |
Structure of fully protonated proteins by proton-detected magic-angle spinning NMR.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis
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| total genus |
10
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-05-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3FIL A; 1P7E A; 2JU6 X; 1YNT E; 5HFY A; 1HEZ E; 2N7J A; 2RMM A; 2LUM A; 1FD6 A; 1YMH E; 5HG2 A; 2LGI A; 2K0P A; 2NMQ A; 2GB1 A; 2QSD A; 2ZW1 A; 1K53 A; 1PGX A; 4MAC A; 1HZ6 A; 2RPV A; 2PLP A; 1MHX A; 1IBX B; 2LHE A; 1XCT L; 1HZ5 A; 3MP9 A; 4IOI E; 1GB4 A; 5BMG A; 4OZC A; 4D2K A; 2OED A; 3UI3 A; 2ON8 A; 1K51 A; 3GB1 A; 2N9L A; 4HKZ E; 4WH4 A; 5HHD G; 1KH0 A; 1D4B A; 2ONQ A; 5BMI A; 1MI0 A; 1EM7 A; 1JML A; 2IGD A; 2ZW0 A; 1QKZ A; 2I38 A; 1F2R I; 4KGT A; 2JSV X; 2J53 A; 1F2R C; 2EEL A; 2IGG A; 1UWX A; 2KWD A; 1MHH E; 2PTL A; 2KN4 A; 4KGS A; 4HJG E; 5HI1 A; 1FCL A; 1XCQ L; 2I2Y A; 1Q10 A; 2N9K A; 4OZB A; 1IGC A; 5BMH A; 1P7F A; 2JXT A; 1MPE A; 3FIL B; 2PW9 A; 1FCC C; 2QMT A; 1PGA A; 1MVK A; 1PGB A; 2KDM A; 2KAC A; 4IKG A; 1GB1 A; 2JWU A; 2J52 A; 2GI9 A; 2KQ4 X; 1IGD A; 1K52 A; 2LHD A; 1IBX A; 1XF5 L; 2JZP A; 2IGH A; 3V3X A; 4KGR A; 1K50 A; 4OZA A; 5JXV A; 1ZXH A; 1C9F A; 4GLS C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2G3Q B; 3DVG Y; 1BXT A; 4XDD A; 3R7R A; 5C2T B; 4AJW A; 2JU6 X; 1Q5W B; 1HEZ E; 4K3C A; 2C9W B; 2LUM A; 1YIW A; 2SAK A; 1CMX B; 3RNE C; 2IO3 B; 2VH2 A; 1NDD A; 3Q8F A; 1ZOY B; 3U7Z A; 2QSD A; 2MBQ A; 3QJZ A; 1I4Q A; 3PO0 A; 4OHJ A; 1GG3 A; 4XX5 A; 3NZ3 A; 2M4N A; 2MHJ A; 2D2Q A; 3I3T B; 2KMC A; 1DGJ A; 1L7Y A; 2L7R A; 4KIK B; 4W9E A; 2FCS A; 4RF1 A; 2JQR B; 1FM0 D; 3C8Y A; 3PHX B; 1TS2 A; 4WAA A; 1V49 A; 1TTN A; 2KFK B; 1MI0 A; 2V3S A; 3SU8 X; 3PZD A; 1PQS A; 4KGT A; 1YX5 B; 5AUI A; 3NG0 A; 4W9J A; 3ZKJ C; 2ZPY A; 2KDI A; 3Q3O C; 4DK5 A; 1FEH A; 4P1B C; 4HJG E; 1QF6 A; 3AE4 B; 3ZO5 B; 2KJ6 A; 2K1F A; 2L76 A; 2KLG A; 3R2T A; 2RSU A; 2YLM A; 3C19 A; 3EHV A; 1I4H A; 2QMT A; 1KF6 B; 4IC7 B; 2K39 A; 5IA7 A; 1EO6 A; 4JQW C; 2KDM A; 3DBL I; 3PLV A; 2J52 A; 3MC0 B; 3A1Q B; 3N32 A; 4LCD E; 3A33 B; 1FXA A; 4PS3 A; 3N9Y C; 3HVZ A; 3TSS A; 4GU2 A; 2HJ1 A; 3BYT B; 3ONS A; 1QQR A; 3URY A; 2IZV B; 2KWU B; 1VCB A; 2KTR A; 2MSE D; 2Z0D B; 4GIV A; 3MHS D; 4US9 A; 3RT3 B; 2L0F A; 4TQ0 A; 5HFY A; 4ANW A; 2GBK A; 2N7J A; 1FD6 A; 1VZ6 A; 3DCG A; 1C3T A; 4A6Q A; 1QT9 A; 1VRA B; 1IYF A; 2PPH A; 4NAM A; 1N62 A; 1RWS A; 2GB1 A; 2LGY A; 4WJN A; 1HZ6 A; 2JPH A; 3SD5 A; 4XWW A; 5LXH A; 4LLG M; 1N6Z A; 3VQI A; 2O2V A; 2XN9 C; 4LNK A; 3JYU A; 3AM9 A; 5IOI A; 1JRP A; 4A3P A; 3UI3 A; 5JHA A; 3Q8E A; 2LRW A; 3Q3J A; 1GOZ A; 1KH0 A; 2AYO B; 3A4S C; 4ZRP A; 4O1N A; 1CJE A; 2DEN B; 3NRZ A; 2W3R A; 1F2R I; 4K7S A; 2JRH A; 4JWU C; 4JIO U; 2WXP A; 3RNG C; 2WXL A; 1SE2 A; 2WX1 A; 4P16 A; 2BKR B; 1WE7 A; 2CHW A; 2LEK A; 3J9C A; 4LNI A; 1WJN A; 4C4V B; 4N6E B; 4AUQ C; 2BB5 A; 3IBE A; 1L0X B; 4NPN A; 3ZDM C; 4ZRJ A; 4PS7 A; 2V4I B; 3AEC B; 3DBR I; 2PW9 A; 1FFU A; 4X57 B; 1UNS A; 1C1Y B; 3RZW C; 2EMT A; 2KFK A; 2IND C; 1F77 A; 2WQY B; 3ENE A; 3SEB A; 1RRB A; 1WGK A; 1C76 A; 1R4M I; 1V9J A; 1U4A A; 4RM9 A; 2LXA A; 1VR9 A; 2Q5W D; 3QAR A; 5IAA C; 4TUU A; 4B9K A; 4DBG A; 2L83 A; 4GLS C; 2M19 A; 2ZCB A; 1P7E A; 3AB5 A; 4TV3 A; 3ABV B; 2DBY A; 3MC9 A; 3QA8 A; 2RR9 A; 3ZXR A; 1C4A A; 4DHJ D; 3L08 A; 5CHW A; 4CQN A; 3AEG B; 2IO2 B; 2AL6 A; 1TS5 A; 3RZF A; 4ASW C; 4TQ1 A; 3A1Q A; 2RD0 A; 1TIF A; 1N5X A; 2DZJ A; 4MGK E; 4WUR A; 2KO3 A; 4N58 A; 2LHE A; 4IOI E; 3NUH B; 4FLH A; 2DZK A; 1NYR A; 3HIZ A; 1OEY A; 1EM7 A; 1JML A; 1PFD A; 1Q0W B; 3EA6 A; 2XK5 B; 2I38 A; 4M8M A; 1LM8 B; 4PYU A; 4PT5 A; 2KWD A; 5TSS A; 1ZUD 2; 3BIN A; 1P3Q U; 3PHW B; 1RYJ A; 2WX0 A; 1TT5 B; 3LJ3 A; 2QC8 A; 4NAW B; 2MP2 B; 3ZVV A; 2KAJ A; 4G3X B; 1FCC C; 1E7V A; 1QOB A; 2BWF A; 4AWJ A; 1T6B X; 3RUL A; 4IUM B; 1ET9 A; 4TSS A; 2Z59 B; 1WXV A; 2KAC A; 3ZYY X; 2VRR B; 5EDS A; 3QQ8 B; 4KZ0 A; 3NVV A; 1KTK A; 4W9G A; 4A55 A; 2MH7 A; 4B0M A; 4C4V A; 2JRI B; 4ANV A; 4YTN B; 3TIX A; 4HPM B; 3RFZ B; 3KUZ A; 1WM3 A; 2KJH B; 2CU3 A; 3ZNI D; 2MA9 B; 1UZX B; 2C7M B; 3CSF A; 1XD3 B; 1WZ3 A; 1GC7 A; 1EF5 A; 3LXF A; 1L4Z B; 4MGY E; 3PRE A; 2ACZ B; 4XDC A; 2PE6 B; 1K53 A; 3AE5 B; 4GSW A; 1R4N B; 2PVO D; 3ZUN A; 1WX8 A; 1IBX B; 1V8C A; 4TMA B; 3EGR A; 4N59 A; 3T9L A; 4HKQ A; 1YN3 A; 1WJ4 A; 4NJ6 A; 2R2O A; 3GE3 C; 2SEB D; 3PLU A; 3WIM A; 1ZXI A; 3Q3F A; 4F1S A; 1D4B A; 2FNJ B; 2GRI A; 1XLQ A; 3PTF C; 3L0W B; 2WP9 B; 5D3D A; 1N63 A; 2IGG A; 2QHO A; 1WZ0 A; 4MSQ B; 4LJO B; 1TGZ B; 1YN5 A; 1I35 A; 1DOY A; 2MLB A; 3O13 A; 3ZW3 A; 1NVI D; 2AWT A; 4K1R B; 1PDX A; 1PYW D; 3AE7 B; 3TJP A; 1V5T A; 1I4P A; 3ECI A; 4RFB A; 3MHZ A; 4I6L B; 3RD2 A; 2L1A A; 2JWU A; 4KDL B; 2KX0 A; 2XK5 A; 2NCN A; 4FJZ A; 3VR8 B; 4MH8 A; 4ZRQ A; 1WSP A; 1ZDV A; 3ZLZ A; 3EEC A; 4NJ7 A; 5E6O A; 3MJ5 A; 4MEM A; 2YEP B; 1HA5 A; 2N1W A; 1FO4 A; 1D5M C; 1MFW A; 2AQ2 B; 1ZGU B; 2ZVN A; 2JX5 A; 2MP2 A; 4NAW A; 1JW9 D; 3FKY A; 2BQQ A; 3P4S B; 3QX1 A; 1E90 A; 4WWP A; 4XGA B; 1JRU A; 2DNF A; 2KDB A; 1SIJ A; 3IVF A; 3BK2 A; 3GS2 A; 1F0Z A; 2WXG A; 4ZDV A; 2JYT A; 1C78 A; 3AXC A; 2K0P A; 3W2D A; 2PKO A; 3U52 E; 3SFE B; 3HM3 A; 4MAC A; 1UUP A; 3KUD B; 3U7D A; 3WAM A; 1N61 A; 2FBW B; 2X8X X; 3R3M A; 3U4E G; 4WJP A; 1FPY A; 2V9H A; 1BUI C; 1WY8 A; 1YQ3 B; 3AH7 A; 4GOC A; 4ZYS A; 1WJ6 A; 1WFY A; 2Y3A A; 2KWC A; 1QKZ A; 3R2I A; 2DAF A; 4I6N B; 5J17 A; 1J7A A; 4MJS B; 1FCL A; 2NBU A; 1XCQ L; 1JWM D; 4IW0 A; 1AW7 A; 4US8 A; 3AU5 A; 3PPA A; 1JRO A; 3V6C B; 3BVG A; 5CHV C; 2LVQ A; 4MGI E; 1LQB A; 4PS8 A; 3AE1 B; 3ML8 A; 4J6I A; 4E3C A; 4ZYN A; 2C7H A; 3W5V B; 4YSY B; 2E6X A; 2WWZ A; 2KKC A; 1JWB D; 4RGO S; 1WXA A; 4M02 A; 5FKA C; 5BYS A; 3I63 C; 3VUX A; 3RNF C; 1ZKH A; 4BFR A; 3N1Z C; 2W82 A; 2EMS A; 2J4X A; 1SJH D; 4A90 A; 1ZDX A; 2D5G A; 3PV1 A; 3L10 B; 4HEA 1; 5G5H A; 3ZTC A; 1TKE A; 3DBH I; 1GNU A; 5AUK A; 5CTR C; 1TZ1 A; 4K7U A; 2N0S B; 2L0T A; 2M56 B; 4DXF A; 1LGR A; 4DXA B; 3NVW A; 3CST A; 1WH3 A; 3MP9 A; 3PS6 A; 4NQK E; 2FAZ A; 4HDQ A; 3Q69 A; 3DBR B; 2M0A A; 1DOI A; 3DHI C; 2EKI A; 3UF8 A; 4HXD A; 1A70 A; 4HKZ E; 2KK8 A; 1JWA D; 5HHD G; 1IPG A; 2BPS A; 3PRP B; 3C0R B; 1WGH A; 1ZP0 B; 3R8B A; 3KH0 A; 2KMM A; 5G5G A; 5EE0 A; 4C00 A; 4EZJ A; 4WWO A; 2C60 A; 4JL9 A; 1H4R A; 3IAS 1; 3DVG X; 1VJK A; 1RLF A; 3ZNZ B; 1R4M B; 2W9N A; 3ETR A; 4EOY A; 2LUE A; 3DPD A; 1UEL A; 3U2S C; 3TEW A; 5AEK B; 4RGM A; 2V3P A; 4ZRK A; 1QOF A; 2KT7 A; 5EE1 A; 4BBN F; 4DHZ B; 1F52 A; 3AEB B; 1P9D U; 3H6N A; 1FIQ A; 4ACF A; 4BBN C; 3AMZ A; 1GC6 A; 2N4F A; 4NQL B; 1XLN A; 2LHD A; 4ZHP A; 1WF9 A; 2YVC A; 5C3J B; 4MJS A; 1Z2M A; 1ZPS A; 1TYG B; 2LJ5 A; 4HPL B; 2QIE B; 3ALB A; 1WGD A; 1KLU D; 3AE3 B; 1ESF A; 2L32 A; 1NYQ A; 3CWI A; 4S0R A; 3QIJ A; 1WYG A; 2O6V A; 3B9J A; 2CHX A; 4URK A; 1V81 A; 2LZ6 A; 2LGI A; 1CZP A; 3H1U A; 4BZA A; 2LVP A; 2ZW1 A; 4FA6 A; 4ANX A; 2DYB A; 2GBN A; 1OGW A; 1QZE A; 3IXS A; 4KSK C; 1NI3 A; 1XCT L; 2KMA A; 5BMG A; 2MRP A; 4XYC A; 1Z5S B; 3OJ3 A; 4IG7 B; 2CU1 A; 2L8J A; 1K51 A; 5LLI A; 1KLV A; 2LJI A; 2GLS A; 1FXI A; 2L3Z A; 2KC2 A; 4FHK A; 4ICV A; 3NOB A; 4MM3 B; 4PK1 A; 1V1P B; 1SXT A; 4KV2 A; 2EEL A; 3ZJT A; 4P1C C; 2KVZ A; 3DHG C; 2QCZ A; 5JZE B; 5GMV A; 2WU5 B; 1ZW7 A; 2FUG 1; 1DOX A; 2LI5 A; 1RFA A; 3AUL A; 1Q10 A; 2K25 A; 4JX1 C; 2V0G A; 5BO4 B; 3SR6 A; 3HRD D; 2BGF A; 4WQM A; 2JUO A; 3L4P A; 3KYD D; 4A3O A; 1QOA A; 4HRS A; 3VH4 B; 3IT6 B; 1SE9 A; 3O65 B; 3ZXV A; 5E6J A; 1JCK B; 4KIK A; 3RMK C; 3ML9 A; 2R2Q A; 2FCM A; 2A4Z A; 5I4D A; 1VZ8 A; 3EFU A; 2KDF B; 2K5P A; 1L0Y B; 3RYT A; 2MJD A; 4NY0 A; 1E7P B; 1AYF A; 1NBF C; 2Y5P A; 5FR3 A; 2IO0 B; 2RGF A; 1D3Z A; 2J0M A; 2WLB A; 4TKN A; 1PGX A; 3NZS A; 5IKC M; 3ZNH B; 3A9K B; 4CO7 A; 1M94 A; 1EF1 A; 2FE8 A; 4OZC A; 4G11 A; 1Y8R C; 3B0A A; 1KFY B; 1J7B A; 2HD5 B; 3PRZ A; 4K81 A; 2KHW B; 3M62 B; 4EKU A; 2J42 A; 2WXM A; 2D3G A; 2GBR A; 4YTM B; 4DDI D; 4CYE A; 2EKE C; 1SGH A; 4YL8 A; 3ZQ4 A; 2UWQ A; 3KLS X; 2MBO A; 4WAF A; 2KNB A; 2D3A A; 4KGS A; 2REX A; 1SJE D; 3WAP A; 2WU2 B; 5FK9 C; 4WJQ A; 3QC8 B; 2CHZ A; 4UDU C; 2WS3 B; 2QDF A; 4HRO A; 1IGC A; 1Q1O A; 1LO5 D; 4G0N B; 4W9K A; 3PSE B; 2DLB A; 3AEF B; 2VH1 A; 3WA0 A; 5E6P A; 3K9P B; 4GDL B; 2G1E A; 5AZF A; 4IKG A; 4MM3 A; 1V1P A; 3A4R A; 3U8Z A; 4BKS D; 2MBB B; 1AAR A; 3DDC B; 1S1Q B; 2KQ4 X; 1WRD B; 3HK0 A; 2DZI A; 2KN5 A; 2MBH A; 4RGN A; 5IO9 A; 1V86 A; 3P1M A; 2DYM A; 3BWU D; 4JE3 B; 4DHZ E; 1I7H A; 3P4R B; 3DQV A; 3ZNG C; 2WDQ B; 4OZA A; 5JXV A; 5MPO A; 3OJ4 B; 1EWC A; 3AI5 A; 1V2Y A; 1QIL A; 3PZ7 A; 1NEK B; 4ITK A; 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3SHQ A; 4GDL A; 3JVZ X; 4BKG A; 2KQS A; 1WGG A; 4KSL C; 3ZIM A; 1WX7 A; 3UQB A; 3V6E B; 1KRH A; 1C77 A; 3AE8 B; 4H2A A; 2RPQ A; 1OFF A; 3R7Q A; 2D07 B; 5GXG B; 1JQ4 A; 2XEW A; 1MHX A; 2INN E; 4FN2 A; 3GZN I; 3Q3M C; 4HWI B; 1HZ5 A; 3B2G A; 1UGJ A; 1PUT A; 2KLC A; 5D7G A; 3QWZ B; 3Q8C A; 3T8M A; 3H7S A; 2G4D B; 3GB1 A; 2DAJ A; 4HK2 A; 1FNW A; 2ZW0 A; 2ZNV C; 1SE4 A; 1I4X A; 4HCP B; 2WHI A; 1AN8 A; 2J0J A; 3TCA A; 3TEX A; 2KVR A; 4RGT A; 1WMH B; 4IWO A; 1QLB B; 2JY6 A; 3NVY A; 4OVV A; 4ZOH C; 4HJK A; 3UGB B; 1SF0 A; 3GE8 C; 4IM0 A; 1UF0 A; 3ZRF A; 5BMH A; 5JH5 C; 3IG3 A; 4GMV A; 3DBL B; 1V1O A; 4GN1 A; 3CMM B; 3WAO A; 4P7I A; 3RCZ A; 4AOF A; 4IM3 A; 1SEB D; 5AZH A; 3VVW B; 1S3S G; 1T0Q C; 3VFK A; 3WCQ A; 1UWM A; 1IBX A; 4BKT A; 5H92 C; 3AE2 B; 3V3X A; 2WDR B; 2BTE A; 2DZM A; 1JWU D; 1XQQ A; 3VUW A; 2LRU A; 1WGR A; 2N1V A; 3FIL A; 3UQA A; 5L83 A; 3PRM B; 2AL3 A; 1VZ7 A; 1RAX A; 2CJN A; 5HG2 A; 4II3 B; 4BKS A; 3Q2A C; 4FBJ B; 2W55 A; 2ZEQ A; 2K6Q A; 2K8C A; 4J3O D; 2QIL A; 4E71 A; 3RNB C; 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