5K4XA

M. thermoresistible impdh in complex with imp and compound 1
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
354
structure length
330
Chain Sequence
VPTGGDDPTKIAMLGLTFDDVLLLPAASDVLPANADTSSQLTKKIRLKVPLVSSAMDTVTEARMAIAMARAGGMGVLHRNLPVAEQAAQVETVKRSGGLLVGAAVGVGDDAWERAMALRDAGVDVLVVDTAHAHNRKVLDMVHRLKTTVGDEIEVVGGNVATRAAAAALVEAGADAVKVGVGPGSICTTRVVAGVGAPQITAILEAVAACAPHGVPVIADGGLQYSGDIAKALAAGASTAMLGSLLAGTAESPGELILVNGKQFKSYRGMGSLGAMQVPEGIEGRVPFRGPLSTVIHQLVGGLRAAMGYTGSATIEELQQAQFVQITAAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase,Inosine-5'-monophosph
publication title Essential but Not Vulnerable: Indazole Sulfonamides Targeting Inosine Monophosphate Dehydrogenase as Potential Leads against Mycobacterium tuberculosis.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium thermoresistibile
total genus 110
structure length 330
sequence length 354
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2016-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5k4xA00
2VELA 2QJGA 3GVGA 1ZAHA 4RR4A 4FX8A 3UZJA 3LRLA 3M6YA 2ZTJA 4U4MA 5D30A 1IF2A 3PVFA 5HWNA 3N9RA 1LDCA 1QCWA 4MYAA 3LBMA 2DORA 1TTPA 2NX1A 1OFBA 4CQ8A 3RMJA 4RZ5A 3KHJA 4FNSA 4IMFA 3W7QA 2PRHA 3W7GA 1RQHA 2TSYA 2NV1A 5L6UA 3TNOA 3CWOX 2NV2A 3NQVA 1YXDA 2A4AA 4RLIA 3MYOA 2G95A 3W2UA 4ONVA 3OVRA 3BVJA 3TC6A 5U7SA 2JKPA 4JDBA 4OQVA 3HO8A 3N73A 2AQWA 3L0GA 3O1NA 1A5BA 1QOQA 4FXRA 3LI0A 1P4CA 3TA6A 3MI2A 3V1PA 3ELFA 1LBFA 4N4PA 1G6CA 1FWTA 1JRCA 2W6RA 5AYXA 3W1XA 1QOPA 4GC4A 2OZ0A 3B8DA 1IIHA 1OABA 1OHLA 4PC8A 5BNKA 3NPXA 4GRSA 4JEQA 4LVDA 1V7YA 2RDUA 1F2JA 1QO5A 3RLVA 2NWRA 3L65A 4XWUA 3RNDA 3AJXA 2CLMA 4E0CA 3SSJA 3T40A 3LXBA 3M44A 2ZRUA 3VE7A 2YPIA 3DGRA 3EX3A 5G2HA 1OYAA 2A7PA 3INPA 4UFLA 5FEPA 4JYDA 2WNZA 2C15A 3DXIA 4PL2A 3W2JA 3ATYA 4YWIA 5CGQA 3TFXA 3LCGA 2V8ZA 4DO4A 4FB7A 2Z0IA 3ZS4A 1MZHA 1RQEA 2VENA 4AHPA 3LTSA 2Z1BA 1XCFA 1SW7A 1JCJA 2E6YA 1KFBA 1FWWA 2WV8A 4ZQRA 1EX5A 3VFLA 4HNUA 1OFDA 2YFOA 1F5ZA 3QC3A 1Z41A 3FS2A 2D73A 3GYEA 3U6WA 1F05A 4NJKA 2J88A 2V2DA 2NLIA 1T99A 3LCWA 2QDHA 3STCA 3I6RA 3T4CA 3WJWA 3M7WA 8TIMA 1GTHA 1FXQA 1TPVA 1YDNA 3IIOA 3IVTA 2CLFA 5FF7A 3G1VA 2Q8LA 2C1HA 2PURA 1DHPA 2BX7A 2V82A 4NQ1A 3M0ZA 2E6DA 3CHVA 4AVFA 5J5RA 1GYNA 1OYCA 3SECA 3IVUA 4H3DA 1FXPA 2G5WA 2H8XA 4GE8A 2XN1A 1YPIA 3W86A 1GVRA 4I7VA 3NDOA 1K02A 2CWNA 3WK0A 3LM7A 3SR7A 5E0KA 1K7FA 4X9SA 2R8WA 3ZFHA 3C2OA 5CSSA 2G96A 4O54A 1O60A 3GKAA 3NPVA 4K8HA 4Y6GA 4LRTA 3S1UA 1WV2A 3BG5A 3TAOA 1KW1A 1W5PA 1ZCOA 4NX5A 3LCIA 1LLWA 3ANYA 1XBVA 4Q4KA 4XBKA 1QFEA 5FEWA 2A6LA 2Y89A 1R30A 2JBMA 1VCFA 4O17A 3TSBA 1Y0EA 2Q8ZA 4KFNA 3E49A 5FESA 3P7YA 1MO0A 3LTPA 1ML1A 1VLIA 3P60A 4Q33A 3GDLA 3MI3A 3LHVA 5G4EA 4WQ6A 3C2RA 5LNRA 2J9ZA 3P61A 1S5TA 4UR8A 5F4XA 4LT9A 4MUZA 1K7EA 3WK2A 2HTMA 1GQNA 2J9XA 4CNNA 4R7JA 1ME9A 4O13A 1OFAA 4UFIA 4RCXA 4UNKA 4NZFA 5K9CA 3GB6A 1FQ0A 2EPHA 1J5TA 2HSAA 1DKWA 4K38A 1L6YA 3NQ7A 4LY8A 3O6DA 1TIMA 5HJLA 5DLCA 3MO7A 2R94A 2ZZ5A 3P67A 2ISSA 4U28A 1OFOA 3C61A 3O8AA 3C8FA 4DXVA 1BEUA 1FCQA 3N14A 2AGKA 3B0VC 3PUEA 3ABSA 4IQLA 2R91A 2FIQA 5FEXA 1OF6A 3USBA 2FPVA 3QF0A 4TX9A 2DZTA 5EL1A 5F2IA 4LOCA 3FYOA 4R53A 3IGUA 3B4UA 3LOTA 5E93A 4G1KA 3LB0A 4M7TA 2VOMA 3O05A 4YL2A 3HPSA 4KWVA 1TV8A 3QW4B 4C1KA 3LXCA 4HNVA 2ZFAA 1P5BA 3FOKA 4JY8A 1QAPA 4O52A 1W8SA 3W7RA 1F6PA 3UPWA 4FNPA 4Y96A 4UTJA 3TMLA 2ZRWA 5LZLA 1P0KA 3CEUA 3GNDA 1YXYA 4ZQMA 1FBAA 3NGJA 1BTMA 3CEPA 1SU5A 1VS1A 3N9SA 2W0UA 5CZTA 4O28A 5KTLA 3MHUA 4CNOA 1KTCA 1AW5A 1TSIA 1KLZA 1TCDA 5AN7A 5DELA 3QPZA 1JRBA 1IIGA 1AMKA 1TV5A 4IXHA 4O53A 3W07A 1W5NA 4PODA 2OCZA 2GJLA 1OFPA 4K36A 3EB2A 3NQ8A 1B57A 3BLFA 4IUOA 1GOXA 5HQEA 1KFEA 1MEHA 3EX6A 1CX9A 1LRNA 3CWNA 4P61A 2YXGA 2J24A 3S8HA 2WSYA 2OT0A 2E77A 3JRKA 4A3UA 2TRSA 4UFJA 3LCXA 4PCFA 4IMDA 1A5SA 5AC6A 1TO3A 1U83A 2PC4A 1EPXA 5C6MA 1LRTA 3S42A 4UTTC 2VEMA 1VGAA 2NUXA 2V2CA 4ALDA 5LGXA 6TIMA 3G8RA 4JR5A 2CLEA 1XM3A 1WX0A 4I7UA 2BWGA 1QR7A 4E38A 2X1TA 4JYFA 3P80A 1OK6A 4UUIA 3SW6A 4DPPA 2B7NA 1LOSA 4NVTA 3HOJA 4E2DA 4HKPA 3VNDA 3NZRA 4MIMA 3W2KA 5HMSA 5KZDA 1OX5A 5D05A 2ZZ3A 3LGEA 4NJIA 3N19B 2PRMA 2QR6A 2YYTA 4N9BA 3T78A 5F2MA 1D9EA 4QNWA 3GAYA 3FLUA 1AW1A 1H7NA 4UCGA 3LHTA 1K8ZA 3HGJA 3NM1A 1G4EA 4GBUA 2KZHA 5BMWA 2QJIA 2WSRA 4DO5A 3UNDA 1NFBA 4EWND 1OX4B 3TAKA 3MJYA 4EIVA 2BZNA 3DFSA 3BGGA 4FIRA 1ICPA 1I45A 1PCKA 3NQEA 1P0NA 3GIYA 2QEZA 1D3HA 4JIPA 2FB3A 3DU0A 4TO8A 4KFPA 1W56A 1H7OA 2G97A 1KFKA 2H3BA 3TKFA 5TIMA 1LOQA 3M5XA 4OGZA 2GVLA 3RF9A 2C14A 4NNAA 3C3NA 5F1UA 3LCFA 3W22A 4WXYA 3KRUA 3TW6A 4DQWA 1SZGA 1YTEA 3UZ5A 1OJXA 1FCBA 3DFQA 5FF2A 1XUUA 2BLEA 1MXSA 2FPYA 3BW3A 3SZ8A 2RHGA 1N8FA 1LROA 1O4UA 2V5LA 1KFLA 1W54A 1JQXA 4BI7A 4NUWA 4IWWA 2V30A 1FWSA 3KVJA 1JCYA 3OVQA 3TQKA 1WQ5A 3CC1A 4FXSA 2J9YA 5AHMA 3EX4A 3L21A 5KZMA 5D04C 1B9BA 4DELA 4H4IA 4Y9AA 5D2WA 3VE9A 1IXNA 1DBTA 4O4WA 4JTHA 5CZSA 1G4PA 3DFNA 1EP3A 1XI3A 4PA8A 4Y90A 5D2TA 4YCOA 4QSHA 1M7PA 4HPXA 4IMEA 3TE9A 4IX0A 2RH9A 1VLWA 3UQNA 1D3GA 1EB3A 3G18A 1PHWA 1KM3A 1WAUA 1IGSA 5E1QA 1QWGA 3OVPA 3CPRA 4ZMGA 4K7VA 2QUUA 2H3DA 2R14A 3NQMA 2ABAA 4QQ3A 3E12A 3EX1A 4N9CA 2GVGA 1SFLA 3G3DA 4MYXA 4TMBA 4JTJA 3C2FA 5DY2A 2GJNA 5K4XA 3G1XA 3N34A 4JD4A 1VHNA 1ZJIA 4LW7A 5G5IA 2Y7EA 3NL3A 3W1TA 1H1YA 3PS7A 2XFWA 3M1ZA 3NPUA 4XBSA 1LRQA 1F76A 4PL1A 5G1TA 3FJ6A 3TH6A 2CFFA 2DZSA 3PBUA 3HG5A 1K3UA 4FEZA 3FIGA 1PHQA 1EWDA 1MEIA 3QMSA 3OIXA 4N4QA 4RXGA 3W1RA 4O10A 1AG1O 5BOOA 3NL6A 3A23A 2C18A 4DO6A 2QDGA 3HIJA 4L4LA 5LGZA 5HR7A 4HNTA 3KRZA 2VC6A 2BSLA 4WJEA 1X7FA 4YCPA 4O0KA 4WY0F 2WOQA 4LVFA 1TV7A 5G2IA 4UFKA 3YPIA 1OFEA 3W73A 4WD0A 1Q3NA 1KLYA 1OVDA 5DY3A 5C55A 5AYZA 5LNSA 2Y88A 3DKJA 5CKSA 1LBLA 3S1XA 1XFBA 4A2SA 1JCNA 3CIXA 3W72A 1H7WA 4UTKA 1K7XA 3IEBA 1GJPA 4LS2A 3EWBX 3P8JA 3BLIA 1RPXA 4ORIA 5LHEA 3DENA 1TPH1 1GPWA 5SWUA 5G4WA 1DORA 1O94A 2ISWA 1SO3A 3G24A 4IMCA 1T0OA 3SIZA 3NZ1A 1FY6A 4LRSA 1THFD 5CZ0A 2YSWA 3ABRA 5HR6A 1FDJA 1EUAA 1TMHA 5LNWA 3HGRA 1NF0A 1TB3A 3QFEA 3UWYA 3HG4A 2DZXA 1TPUA 5D33A 4RXFA 4RKAA 2ALDA 4UTIA 4J9JA 2A5HA 1PV8A 4RX0A 2WO5A 1XDMA 2DP3A 3GZ3A 3N3MA 2JKAA 3W1MA 2QAPA 3O16A 4O50A 3O07A 4CLMA 5H91A 4XTIA 1OYBA 3IIZA 1SQ7A 3GLCA 4JICA 2QCDB 4QITA 5CZJA 4JTIA 3QH2A 2DU2A 2ZCGA 3A9IA 4OU1A 1EEPA 1T96A 2NWSA 2ABBA 2B7QA 3CLMA 5D2VA 3KVKA 2YCEA 3BLEA 3I7QA 1W31A 3QJAA 4O19A 5DBTA 2CZFA 4W9TA 2QCFA 1A5AA 1ZENA 1OX4A 3RU6A 3EWWA 3NL5A 3N2MA 2XN0A 2E5DA 1AK5A 4HSNA 4N9EA 1NF7A 3NO5A 2DZVA 3DH7A 3M41A 5K9DA 2YFNA 4FF7A 5DXXA 4ZZ9A 5I3FA 2XN2A 3S1VA 3WJYA 4O15A 5AYYA 1SZEA 2O7QA 1DVJA 3G1FA 1F7BA 3W7DA 5EMUA 4MJZA 5ABTA 3C4UA 1QPNA 3NNTA 4M6VA 5T26A 4FX7A 1H60A 4LU0A 4O1DA 2ZRYA 4I9AA 3W87A 3W2NA 3NAVA 2IQTA 4MJMA 5I3HA 2A85A 4A21A 4JTEA 1VJIA 1JCLA 4O12A 4C1LA 1FWNA 2GQ9A 4JDYA 1ICSA 5CPNA 5KINA 1G67A 3IGSA 3HPZA 3TJLA 5DCBA 1FWRA 3P82A 4RZ6A 4UMAA 4Z1CA 3W23A 1Z44A 4CCCA 5K4ZA 1GEQA 3IVSA 1VC4A 4AWTA 1MSSA 2PCQA 5HUOA 3TUUA 1H7XA 4ADUA 4OV4A 1M6JA 1JQVA 4EF8A 3NQGA 3BG3A 3HGOA 3WK3A 4XTDA 1NSJA 1YTKA 1M7OA 2Y63A 5EY5A 1Q6QA 5C2XA 4X3ZA 2YGYA 1H62A 1UBSA 3PG8A 1X1ZA 3NQDA 4NJGA 2GOUA 2CLKA 1PL9A 1X1OA 2EAWA 1SR9A 2I9EA 1RQBA 2FPTA 1KM4A 1TQJA 4LS1A 4X22A 1ZHAA 3R8RA 2CZ5A 4FNRA 3V75A 5D37A 1VZWA 3MP5A 5U4NA 3LRKA 1ADOA 1O95A 3E0IA 4BFAA 4JX4A 1SW0A 3TV8A 2WNNA 1NEYA 3W3OA 1SO6A 3FEMA 1KA9F 2WJZA 2VEPA 3S0CA 4JN6A 5A8GA 2YX0A 2Y7FA 1YDVA 3W83A 3NQFA 5KMYA 3KFTA 4BF9A 4OBTA 1JCXA 1QO2A 2RDWA 3W7IA 4FO4A 1F73A 2UV8G 4OHQA 1LP6A 1O5KA 2QCCA 3W7LA 1PE1A 3TX9A 3RK8A 3PWAA 2I1OA 3I7RA 3QSTA 4NJHA 3PBYA 1RV8A 2X1SA 4O0ZA 3FYPA 5TBOA 4HPJA 4UIOA 1HFBA 3UWWA 4CCEA 3CQ0A 3L68A 2ATSA 2A2IA 4R33A 1J4EA 1GVSA 1SSGA 3TSMA 1WBJA 1VPXA 1ZY9A 3LLFA 1X8FA 1SSDA 1H63A 4JXCA 2X1RA 3PUDA 3VI2A 1QMLA 4EOUA 1YTDA 2RFGA 1IXOA 2DJLA 1S3HA 2Z2UA 3W7HA 2YW3A 3KAOA 3W71A 2C6QA 2QCGA 2NX3A 1VYRA 5G2WA 2EF9A 4MFEA 1L6WA 4POCA 3A24A 3P84A 4Q32A 1LORA 4GUHA 1R47A 5HNRA 3LHUA 3TMQA 5D2YA 3UWVA 2NXHA 3M5YA 3W2MA 3NQ6A 1LM1A 4EVZA 4NXKA 1XC4A 3STEA 4FX6M 3FA5A 3LX9A 7TIMA 5C54A 4S2BA 2DZUA 4FNQA 3W1AA 1ALDA 5IBXC 1QPRA 3SJ3A 3BW2A 5A5WA 2JK2A 3BPWA 3CIWA 1GVOA 2ZQ0A 1PCWA 4MZ1A 1LOLA 4ZVJA 1OFRA 1YYAA 5FEZA 4NZJA 3U2OA 3M43A 4NNCA 1HTIA 2ZRVA 1GZGA 4NNBA 1JUEA 2QCDA 2Y62A 1PVNA 3MP3A 4N6FA 3R89A 3THQA 3GDMA 5TQLA 1AL8A 1H61A 2Y6ZA 5LHFA 4MZ8A 3R13A 5IM51 3QSRA 2A7RA 1LCOA 2NUYA 5EBUA 1SPQA 3WJSA 2V2HA 3ZWTA 4QAIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2QJG A;  4B9Z A;  2UBP C;  4FX8 A;  3TTO A;  2PP1 A;  1BVN P;  2ZTJ A;  2DW7 A;  1UA3 A;  4WDU A;  1Q66 A;  2XM1 A;  1UD8 A;  1RY8 A;  4MYA A;  3RCN A;  3UA3 A;  2DOR A;  3R6I A;  1TTP A;  2NX1 A;  1OFB A;  3NSM A;  1DXF A;  1EH9 A;  5MKG A;  4RZ5 A;  5HOS A;  3W7G A;  3DYM A;  2Q71 A;  3TNO A;  2I56 A;  4JIH A;  4ONV A;  1FWF C;  1ZUA X;  7XIM A;  3TN5 A;  3TC6 A;  5U7S A;  2BVW A;  3CQI A;  4OQV A;  3VDH A;  2PLJ A;  4BS0 A;  5H8P A;  1NH6 A;  1A5B A;  3ZT7 A;  3H2N A;  1WCG A;  1MWO A;  5FA5 A;  4X0N A;  1BWV A;  4CD4 A;  3MI2 A;  1LBF A;  1BXB A;  4N4P A;  2VC5 A;  2W6R A;  5AYX A;  3W1X A;  1QOP A;  4U5I A;  2OZ0 A;  3B8D A;  1H49 A;  3AML A;  4C6F A;  1IIH A;  1OAB A;  4GI4 A;  5C70 A;  3SRF A;  4V2X A;  5BNK A;  5GJP A;  3NPX A;  2WZH A;  5DEZ A;  4G7E B;  3KCJ A;  1BQG A;  2KAU C;  4JN7 A;  1XG3 A;  3RLV A;  5I6S A;  1CWY A;  2CLM A;  3VFC A;  4NYU A;  4E0C A;  4IGN A;  3T40 A;  2YPI A;  3N17 A;  2OX4 A;  1F3E A;  4LAU A;  5G2H A;  2A7P A;  1BXC A;  1AUS L;  4UFL A;  4KIR A;  3N2C A; 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