5K9D | Genus

Total Genus 136

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	136
sequence length	359
structure length	359
Chain Sequence	YAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title	Development of ML390: A Human DHODH Inhibitor That Induces Differentiation in Acute Myeloid Leukemia. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	136
structure length	359
sequence length	359
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2016-05-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5k9dA00

4JTTA 2CLMA 1GWJA 5D30A 1LOSA 2FJKA 3CQ0A 3HIJA 1QPNA 1F6PA 1RD5A 4UFJA 4FX7A 5I3HA 2B7NA 1H62A 3HBLA 1VYPX 5HJLA 3U2OA 4MJMA 1FCBA 1TPWA 3DHFA 5KZEA 3B05A 3P7YA 3UWUA 3GLCA 4UMBA 2FFCA 2NXGA 3TKFA 1G69A 3IIOA 1P0NA 3S1WA 5D2VA 1NF0A 3ATZA 4OGZA 2CZFA 3M5VA 5CSRA 1B57A 1FCVA 1OFOA 4BK9A 2YSWA 1J2WA 2YW4A 1FQ0A 1H7XA 3P80A 2NX9A 2C16A 1DORA 3QSTA 1Q45A 1W1ZA 1YXCA 3QW3A 4X9SA 5HUOA 2H8XA 4MZ1A 4NJIA 4WY0A 1LP6A 1JRBA 4A22A 1KBIA 4NX5A 1BKSA 1JCXA 1L2UA 4O1DA 3U6WA 5EY5A 3SGZA 3G1SA 3L5MA 3FIGA 1PVNA 1O94A 4AHQA 4UUIA 1KFEA 4LTSA 1YDNA 3JRKA 5KZMA 3TUUA 3LM7A 2DP3A 2ZZ5A 2J9YA 3V75A 5J5RA 4UFKA 2C13A 2ZYFA 3NPUA 4O4VA 2QAPA 1GZGA 2NXHA 5HWNA 4Z08A 2ZRYA 1KFBA 1ZALA 1SZNA 3DHDA 3W7IA 1EUNA 5HQEA 1IF2A 4DF2A 3G18A 2RKXA 4PCFA 2VXNA 3OVPA 3W07A 4JY9A 2E6AA 5G2IA 1B4EA 2CZDA 2CLEA 3UWVA 2TPSA 3MJYA 3QH2A 3TH6A 4DBEA 3MO7A 4JEQA 3BLEA 1G4TA 3KVKA 3LCXA 3G22A 4UXDA 4FNPA 4JTIA 4GUJA 4QAIA 2VFIA 3BPWA 3W1UA 3W70A 2J6XA 2RHGA 4PA8A 4GXMA 2ZRUA 3LCGA 2VC6A 4M6PA 1NF7A 2H8ZA 3R8RA 1XC4A 1MEWA 3O15A 4O11A 4MYXA 1H7OA 2VOMA 3TMQA 1OK4A 4BWLA 4O57A 1DV7A 3STCA 1X1OA 4IXXA 1MXSA 2Q8LA 1AG1O 3IV3A 2Q3OA 3UZJA 4M6QA 3M9YA 1I8JA 4JN6A 5L6UA 4MOZA 3O06A 1TTJA 3WFAA 4JXCA 1ZAHA 2E09A 4NNCA 5F1UA 3KVJA 1H50A 3Q37A 1E51A 4RZ6A 3PUOA 4O54A 1GYNA 3U8GA 3HOJA 4JDYA 4HNUA 3O07A 1OF8A 1ZAIA 3UXDA 4AMAA 4NXSA 2YXGA 1Q3NA 4HPXA 3DENA 5AB3A 2QCLA 4R33A 2LLEA 4PH6A 1RQBA 3SIZA 1OYAA 4AF0A 1UUMA 1U5JA 2JKPA 2X2GA 4QISA 3MHGA 1VQTA 3G1HA 4Y9AA 4Y90A 1TPUA 1ADOA 2D73A 2ATMA 1YADA 5E93A 1P1XA 2DZTA 1EWDA 5FF7A 5G5IA 2R94A 1GVSA 2J88A 3THQA 1F76A 4IOTA 1XXXA 4Z0SA 1JCMP 3TMLA 4CQ9A 3B04A 1LRNA 3A24A 3W7QA 1PCKA 3CHVA 3EWWA 4N9CA 1SU5A 4OV4A 1O60A 1SFLA 2RDWA 1HFBA 3BV4A 2XN1A 1SQ7A 2WNNA 3LCIA 4LOCA 3C52A 2C3ZA 3BLFA 3P8JA 3M6YA 4NJJA 3LCFA 3VKJA 3R5EA 1XCFA 1DJNA 3KVLA 4AB4A 1JRCA 2VEPA 1XDLA 3S5ZA 4DO4A 1G4PA 3QYQA 1VPXA 2WJZA 5CPLA 2CLIA 2QCMA 1ZNNA 3G1YA 1KM4A 3E12A 1IIHA 3GYEA 3P62A 5KSWA 2QCGA 4RKAA 4JY8A 1KA9F 2G5WA 3S1VA 3M41A 4LW7A 3STEA 3M5XA 3NM1A 3M5ZA 4NVTA 2V8ZA 2NUXA 1EA0A 1OVDA 3OVRA 4ICNA 3PBUA 2V2CA 3IGXA 4LVBA 3THAA 4KFOA 3L5AA 4IQLA 3EWXA 5EL1A 4WOZA 4DPPA 3W7MA 1DHPA 4GUFA 5KMYA 1K7XA 2NUYA 4FEZA 4NXKA 2Z6IA 3MP3A 1QR7A 3LBMA 2W0UA 5CZSA 5DY2A 1BTMA 3W2JA 5BRBA 1JVNA 3L9CA 5LNRA 3NZ1A 7TIMA 2YFOA 2ZFAA 3GDLA 3H54A 1TPDA 4JICA 4C1KA 3W85A 3W3OA 2WOQA 2DZSA 4K8HA 3NPVA 3W6YA 2ABBA 1A5CA 3ZR4A 5HWMA 1H1YA 5AYXA 4MY8A 2GVGA 3BW2A 5CPOA 3K30A 3S8HA 3PF3A 2TRSA 1LBLA 3GNNA 1JUKA 3JS3A 3N19B 3UPWA 3GR7A 5EPDA 3RFAA 4QNEA 3G1DA 5DBUA 2GJNA 3BLIA 3GNDA 3NPWA 1FY6A 5F1VA 2A7NA 1JULA 1KTCA 4E38A 1O5KA 3M16A 4JTSA 1MEHA 1I4NA 2R8WA 3LRMA 2B0MA 1VCGA 1HO4A 5DXYA 4XKYB 1JCNA 2DORA 1JQVA 2GQ8A 4ADSA 1R46A 3ELFA 1TPVA 1YXYA 1VC4A 2G95A 3T4CA 1GTHA 1IGSA 2BTMA 1K02A 4UTLA 1FXPA 2VEMA 1GG0A 3VCRA 1TV8A 2NV2A 4JTEA 4MPQA 1FWNA 2ZRWA 3A5VA 3IVUA 4WUIA 1XFBA 1XUZA 4OQVA 1BWLA 1PV8A 4CNPA 1QCWA 3TU9A 2A85A 3TK7A 2QF7A 3SR7A 3YPIA 3B0PA 1VRDA 2Y7EA 2EKCA 4UFHA 3GX9A 3NZRA 3A5FA 3BG9A 1TPC1 4IWWA 2C15A 4MLRA 5D09A 3HQ1A 3O05A 3VE9A 3PULA 1H7WA 1CI1A 4S1FA 5LZLA 1S5TA 3W1XA 3NQ7A 3PR2A 1SSDA 2A7RA 4I7WA 4GWEA 4WX2A 1A5AA 5FF2A 1WAUA 4BF9A 3EB2A 3R89A 4AF0B 3W74A 1LDCA 4WOQA 1O95A 3ABOA 3KFTA 2A5HA 1SO5A 4OWGA 1W5PA 3IIVA 3B03A 1I2NA 3UPBA 2O7SA 4WD0A 4NU7A 1ZJIA 3N9RA 5AFDA 4GE8A 1SR9A 1BEUA 1TQXA 3G1FA 3FA5A 3MWAA 1A5SA 2ISSA 2QDGA 3B8DA 2VENA 3EX6A 5FF3A 4HT3A 2E6FA 1OABA 1AW5A 4O28A 3W2LA 1OFBA 4AAJA 2C14A 2YX0A 3GB6A 2C1HA 4JNMA 2ZDRA 2X1RA 5EBUA 5AHEA 1OFEA 5A8GA 1GVFA 3HG2A 2ISWA 4O4WA 3W83A 3L21A 4JR5A 3IGSA 4FO4A 5FEWA 4LVGA 3NQMA 2Y7GA 1LOQA 2PCQA 3GZ3A 5AHFA 1LOLA 4UMCA 4WZHA 1G4EA 3LOTA 3LGEA 3W86A 1MSSA 1TB3A 1OJXA 4IPJA 1G6CA 4KFPA 3UWYA 2F84A 2WSRA 2VFFA 4FNSA 2A6NA 2ZZ2A 5HWJA 4FIQA 2E5DA 3TAOA 3TCEA 2Y85A 2V9DA 4BI6A 4UTUA 1I2RA 1QFEA 3LCWA 2FTPA 3DI0A 3W1PA 1T96A 1OFDA 2NWSA 3W1LA 1SSGA 4P61A 1DBTA 2OMAA 3TV8A 3HG4A 4X22A 1O5XA 4UFIA 1W3TA 3SZ8A 4JTKA 1MZHA 1GVRA 2ZTJA 1Q6LA 1ZHAA 2B4GA 1DVJA 5FEPA 3QMSA 3DFNA 5C55A 3TFXA 1DOSA 2CZEA 1XBYA 4IGHA 3H53A 4PL1A 4UNLA 3W72A 4QSHA 1X1ZA 1SO4A 4NZJA 2ZZ1A 1UJPA 4WXZA 2WKJA 1S5WA 3W7GA 4O53A 2ZTKA 4O15A 3OG3A 3LHUA 3P67A 3P8IA 5I3FA 3S9YA 2DZUA 4JGDA 2OCZA 3CEPA 5AYZA 3QF0A 3NXFA 4IX2A 5TBOA 4M6VA 1H1ZA 5I3GA 1VS1A 3F1QA 1OX5A 4R34A 3HPZA 3F03K 3PSWA 1YLVA 2CW6A 5AC6A 2CFFA 4JYEA 1YPIA 5LNUA 2YR1A 4ZQNA 1WYIA 2E5BA 4YLWA 5EKYA 3NQAA 3LHWA 3LLFA 4AWUA 5LSMA 1PE1A 1RR2A 5IBXC 4FXRA 5G4WA 3JR2A 4Z0JA 3CTLA 1VJIA 3EEGA 4A2RA 4BFAA 2ZZ7A 5DCBA 5CSSA 3NL5A 3W7EA 4TIMA 2FPTA 4LV9A 4EOUA 3TQVA 3WJXA 1C9DA 2DZXA 5AC8A 1HTIA 4O0ZA 4HIBA 1FWSA 3ZWSA 2BZNA 3KOFA 1TIMA 5HNRA 3LHYA 4UFLA 3L0GA 1L6YA 3LDVA 2DJXA 3GIYA 3UWQA 1TV5A 1GPWA 4M5PA 4KWVA 4XQ6A 3G3MA 2Q8ZA 1OFAA 5TIMA 3DAQA 3VNDA 2X1TA 1TTQA 1K8XA 3TR2A 3I6RA 4NNBA 2WNZA 4RR4A 1SO3A 4B5NA 2ZBTA 3M44A 5LHEA 3E49A 1QDSA 2J9ZA 1RPXA 2H3BA 3MYOA 2WQPA 4QQ3A 1WV2A 5AHIA 4ADUA 3LHZA 3LERA 3A9IA 3PBVA 1YDOA 4JYFA 1QMLA 3P81A 1ICSA 3NDOA 2G96A 5CPNA 1LROA 2W6RA 2QUTA 1XBXA 4HN4A 3KRSA 3MHFA 5C2XA 1YDVA 3IIZA 3LX9A 2OT0A 4LC6A 3ABSA 4ZL1A 4CLMA 2V5BA 4JTGA 1EX5A 5HR6A 3QJAA 1D3GA 3TSMA 3FYOA 3I68A 4TU1A 1LYXA 1KV8A 3BARA 1ME8A 3NQ8A 1EEPA 4BR1A 5D2YA 4N4PA 2Y63A 3HGSA 1P4CA 4CCEA 4ZVJA 1WQ5A 4JS3A 4RZ4A 3B0UX 3MW7A 4MKNA 4O16A 3D0CA 4E2DA 1NFBA 5DXXA 3P60A 3L67A 4M7TA 4FX8A 4ZMGA 3FS2A 1AL8A 3DGRA 5DN1A 3NR0A 4LU0A 2JGYA 2V2DA 1SPQA 3W2KA 3T78A 3L2IA 1OFQA 1W37A 3C2VA 4YCPA 3TFCA 2G97A 5DCDA 1M7PA 4BI5A 1KFKA 4YMZA 3W2UA 4FB7A 1JR1A 1YYAA 1YTKA 3BG5A 3S0CA 3I7QA 1QWGA 3HG3A 3OA3A 2W79A 3GXTA 2CLLA 4ALDA 1JQXA 2HS6A 1OX4B 3W7CA 4O13A 5D02A 1FDJA 1OHLA 3A22A 3Q58A 5K2ZA 3O6CA 3SSJA 4ZQRA 3MYPA 4JIQA 2ZRZA 4TX9A 4YL2A 1WX0A 3CIXA 4JTFA 3LTPA 1P5BA 3G1AA 4O1BA 5DBTA 4LWWA 4MUZA 4N2YA 4XZ9A 1TJRA 4ORIA 1FUYA 1DJQA 1QNVA 1SZFA 4N9EA 2JK2A 3TJLA 4K39A 2XFWA 3NAVA 1YTDA 3W22A 2ISVA 5IM51 4X3ZA 2QCCA 3W2NA 5LGZA 4NJKA 1SZGA 2Y88A 3HGRA 2BXVA 4OU1A 3DKJA 4ONVA 2YYUA 2NWRA 2J9XA 2QJIA 3MP4A 3UNDA 5I3JA 4CNNA 2OZ0A 3PM6A 4JX6A 4UFMA 4YCOA 5L9FA 3VFLA 2FPVA 4H6KA 1F74A 4JX5A 2B7QA 2A6LA 2Y6ZA 3A23A 3FYPA 1I2OA 1KM2A 5KZDA 1WOAA 4UIOA 1TV7A 4WJEA 3QSRA 4JD4A 3CU2A 3C4UA 2JGQA 2FIQA 3L68A 4DO6A 3NG3A 3IEBA 3NPXA 3Q2DA 3TIMA 2VELA 2VEKA 2PURA 2NV1A 5T26A 4JTLA 3TE9A 4A3UA 4MY9A 1Y0EA 1W31A 2ATSA 4O8RA 3GVGA 4LRTA 3PS7A 2H6RA 3HJZA 4AXKA 3F4WA 2ZA2A 4E2BA 3KRUA 3W1RA 3INPA 1N7KA 3Q94A 1JCYA 1C8VA 2JKAA 1K7FA 1PCWA 5SWUA 1GQNA 1NVMA 4QM1A 2PC4A 3R13A 2VFGA 4UCGA 4WY0B 4O50A 4YXGA 4ZQCA 2CLHA 3BVJA 1KFJA 3KXQA 3EWUA 3C56A 3C6CA 1CW2A 2NLIA 2QAFA 2YZRA 1TSIA 1KM5A 3IIPA 3W7OA 3C0JA 4FX6M 1H63A 1G7VA 2JBMA 3N73A 3RLVA 4UMAA 4LS1A 1KV5A 3W9ZA 5AOUA 3STGA 4UTTC 2QCNA 3EX3A 1EIXA 2OJPA 1KLZA 2AGKA 3AO0A 1LORA 5F4SA 5BMWA 5F4WA 1H51A 4LS0A 3GDMA 1VR6A 2I14A 4J9JA 5FF0A 1R2TA 4ZQPA 4RJEA 4Y8FA 1ICPA 2DZPA 3LBCA 3PWAA 4FIRA 1N55A 3PC0A 1EP1A 1B9BA 4O1CA 3N2MA 1EP3A 3L65A 3P82A 2E6DA 3RLUA 4FF7A 5KTLA 2V0TA 3WK3A 1VCFA 1UASA 5HINA 6ALDA 2QCDA 3NO5A 1AMKA 1R30A 4S2CA 2V30A 4DF1A 1QPRA 2VFDA 4RLIA 5CZJA 2FB3A 3CWNA 5AHNA 2I1OA 4O1AA 3NM3A 1O4UA 4A21A 3FKRA 4UTWC 4IMEA 5IBXA 3SI9A 1W5NA 3W1NA 2YDAA 5D2XA 4PEKA 1VYRA 4AHPA 1ICQA 3B06A 1KBJA 1GVQA 3GXNA 3PAJA 1TCDA 3QRHA 3PY2A 3N2XA 3ABRA 3M7WA 4NJGA 1TMHA 1SW0A 3EXSA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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