5KINA

Crystal structure of tryptophan synthase alpha beta complex from streptococcus pneumoniae
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
257
structure length
247
Chain Sequence
PKTLTEKLNAIKAAGKGIFVPYIMAGDHEKGLDGLAETIHFLEDLGVSAIEVGIPFSDPVADGPVIEEAGLRSLAHGTSTQALVETLKTIETEIPLVIMTYFNPLFQYGVENFVKDLADTAVKGLIIPDLPHEHANFVEPFLANTDIALIPLVSLTTGIERQKELIEGAEGFIYAVAIRADLDKHLAQLHQVADIPVLTGFGVSSQADLERFNAVSDGVIVGSKIVKALHQGEPIQDFIRQAVAYQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
publication title Crystal structure of tryptophan synthase alpha beta complex from Streptococcus pneumoniae
rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae serotype 4 (strain atcc baa-334 / tigr4)
total genus 67
structure length 247
sequence length 257
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2016-06-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5kinA00
1EA0A 4OU1A 2F7FA 4FNQA 3BW2A 4UC5A 4TU1A 3WK1A 4XWUA 5DBTA 2RDUA 5BMWA 3LHYA 1TPC1 3S5ZA 3S5YA 3WK3A 3N19B 5I3HA 1KM6A 4OBTA 3HBLA 3EEGA 1JCLA 4ORMA 3TC6A 1U5JA 5DY3A 2ZDRA 3NPVA 4FXRA 1KLYA 1YTKA 1RQBA 5HR7A 5C5YA 1W1ZA 1MEHA 2BX7A 4DPQA 1JCNA 1R47A 2QKFA 1MO0A 4OE7A 4K6AA 1XI3A 3P62A 2QCLA 3E96A 1VJIA 3W84A 1TPDA 3LHTA 2VKZG 1EPXA 4KWVA 2NV1A 1KTBA 4AWUA 5LNUA 3L68A 1TTPA 1H5YA 4EF8A 3GVGA 3G1SA 3W1RA 1FDYA 3ABOA 4WOZA 1D3GA 4MY9A 3SGUA 3NQCA 1WQ5A 1SW0A 2NZLA 2WKJA 2ZBTA 3BO9A 4GXMA 1VS1A 3QW3A 2QCEA 3CC1A 3H53A 1JCJA 3A5FA 1PIIA 1VCGA 4IMFA 4JTSA 3WK0A 1H7OA 4ML9A 3DFQA 1H7XA 2WNNA 4FEZA 1L6SA 1F76A 5TIMA 4AF0B 4GUJA 4NU7A 2J6XA 3GIYA 4QQ3A 5GVJA 2CLKA 1JUEA 3P80A 5KINA 4MJMA 4UTIA 2CZ5A 3TIMA 1ME7A 2X16A 2B7NA 3U2OA 1XXXA 4JTKA 3S1WA 4QJ1A 3W7CA 4GJ1A 3BLIA 1AL7A 3BW3A 3UXAA 2NUWA 5CKSA 1W56A 1UCWA 2VFFA 1HUVA 4GUGA 3TXZA 5KSWA 3W1TA 2VEIA 3VKJA 1SO4A 4O11A 3W1PA 2G96A 4BWLC 3W7QA 3LGEA 3H55A 3PBYA 4JX6A 1K03A 1M7PA 5C55A 2DJXA 2BXVA 2FPYA 3L21A 1FDJA 3B04A 1SZNA 3TFXA 5BMXA 4RXFA 2PCQA 3NM3A 3NXFA 2R14A 3NDOA 4Q32A 2JK2A 1AW2A 3GAKA 4JIPA 3PUDA 3DI0A 1O5XA 1L6YA 1KV8A 4GBUA 3C0JA 1FUYA 1KLZA 4NNBA 3WK2A 3NQVA 3FEMA 2ZZ6A 4AHOA 3LRLA 1TRIA 3MI6A 4K8EA 3LTPA 5EPDA 3TSBA 3RFAA 2V2CA 3BVJA 1NAL1 2F84A 3NYZA 3CM4A 1LBMA 4KKXA 4JX5A 4O28A 1XBVA 1YDNA 4CQ8A 4FNPA 3OA3A 3TAOA 3B0VC 3ZFHA 1IXQA 3LCXA 3JS3A 3NPWA 3TNOA 3NQ2A 1VPXA 3DAQA 4H6KA 3M5ZA 8TIMA 3NO5A 4DBEA 1DBTA 1A5BA 3HJZA 5AHNA 2P0OA 1EWDA 4N02A 5FI8A 4XKYB 3W2NA 1VCVA 1RV8A 1LOSA 1O94A 1RZMA 1GTHA 3F4WA 3WJZA 4JS3A 5G1TA 4O52A 5DBUA 1JVNA 4N6FA 1H7RA 3W1QA 1OYBA 3P8JA 1H7WA 4JDBA 1Z44A 3MHFA 3W83A 1G4TA 3G0XA 4H3DA 2NUXA 4N9CA 1LLZA 4GWEA 4AWSA 3QM3A 1JUKA 2C3ZA 3RK8A 2JGQA 1SUXA 1WX0A 1TPB1 2QEZA 2ZRXA 4DO6A 1KFJA 2V30A 5K3VA 4BR1A 3PSWA 3PWAA 4A2SA 1FWNA 1PHQA 3GZ3A 3PVFA 3G1YA 3P61A 1A53A 4JTGA 4IXXA 5HQEA 5KZMA 1XFBA 4TR9A 4K7VA 1ZENA 3M9YA 1SZEA 1GVQA 3NZRA 2DP3A 3TH6A 2VEKA 4I7WA 3HPSA 2Y6ZA 4JTJA 4UFMA 3UY8A 2HMCA 4FNUA 2P10A 2QCGA 4NXSA 3BLEA 2Q8ZA 2RKXA 1SSGA 3DU0A 3B03A 5K9XA 1IGSA 3C6CA 3QFEA 4K8HA 4BI5A 1MXSA 2YGYA 1T0OA 3M43A 3DENA 1TTJA 2J9ZA 4WX2A 2PRLA 4JYFA 4JDYA 3IIXA 2VFGA 3NQEA 2O7SA 1LBFA 1ME8A 4DQWA 1TSIA 1N55A 2FB2A 4ZQCA 3LDVA 1KM4A 3LOTA 3TR2A 4FNRA 3EWBX 2NX9A 4YCPA 3A23A 5D04C 5ABTA 3CPRA 1B57A 3W1LA 1H62A 5CPOA 1RPXA 3R13A 3CT7A 1QPNA 2CLMA 3TXVA 4UXDA 3ABRA 1XBZA 4JTLA 3W1XA 1EIXA 3AO0A 1M5WA 1YTDA 3PUOA 4LV9A 3U8GA 3M41A 4PL1A 1LORA 4GC4A 1VYSX 5FF3A 1V5XA 3PULA 1JCMP 1I2NA 4G1KA 5LNRA 4MLRA 4K7YA 3PS7A 3DH7A 4ONVA 4UFKA 2B7QA 4MYAA 1QWGA 4MZ8A 3INPA 5AYYA 1VCFA 4E0CA 3KHJA 1GVOA 4LVGA 2WPBA 3NOEA 4IXHA 2EPHA 4QIUA 5CSRA 5H2ZA 1KFBA 2A1YA 4CCDA 4CNNA 3GLCA 4TMCA 7TIMA 4O53A 3DZ1A 1FCVA 4A22A 3HIJA 1HFBA 2FB3A 4HHPA 1I2PA 5CSSA 1TV8A 3W75A 4RR4A 3NM1A 3EX1A 5D2VA 3TK7A 1QPRA 3QPZA 4RZ6A 5DY2A 3NAVA 3BLFA 3HOJA 3SGZA 2PRHA 3UWYA 4JD4A 4UIOA 1EEPA 3CLMA 3T78A 4UFIA 1G67A 1ICPA 1OFPA 5FEPA 4RZ4A 1MSSA 2FLIA 3TUUA 3A9IA 4RV8A 5DCEA 3THQA 1TB3A 3W1MA 2ZQ0A 4IMEA 2ATMA 1LOLA 3B05A 3NVTA 3PM6A 1ZALA 1IXNA 5F1UA 5D02A 4HPXA 3L65A 2JGYA 4K38A 5HMSA 4WUIA 4FB7A 4HNUA 2ATSA 1K3UA 4IUOA 3C3NA 4N4QA 3R8RA 4MUZA 5IM51 3NQGA 2IQTA 3HGSA 1UB3A 2DZSA 5HWMA 1TPFA 3EWZA 3IGUA 4U28A 5SWUA 4O17A 1OFRA 4GE8A 3S1UA 4O14A 3WJSA 1P0NA 4OV9A 4TX9A 3GK0A 2JBMA 4O1DA 1TPWA 4CQAA 3HMJG 4GFSA 2QDHA 1KTCA 5KMYA 5DCDA 1LTDA 3A24A 3WFAA 2Y7GA 3TQ0A 3PY2A 3MMTA 2GVGA 4ZMGA 1KFCA 4LS0A 5D2WA 1OF8A 4O1BA 3CTLA 2YXGA 3SECA 5U4NA 5CZSA 3HF3A 2NXIA 3GYEA 1OFOA 3MP4A 3L66A 3M1ZA 1W54A 1X1OA 4R53A 2Z6JA 4S2BA 1LLWA 3T40A 3TQKA 3L0KA 1G69A 5I3FA 2ZZ2A 3GDRA 4NZFA 2BWGA 1DHPA 1ML1A 2WJZA 3OVQA 3W7JA 1O60A 2CZDA 4JGDA 5DELA 5FF4A 2Y85A 2GPTA 3LTSA 5LNVA 3N34A 2Y7DA 3QYQA 4Y90A 1XL9A 3LBMA 3EXRA 4ORIA 2EAWA 1KW1A 1Y0EA 1R2SA 1LDCA 4UUIA 1EX5A 3KXQA 2BSLA 2V2DA 5E93A 2YR1A 1JQVA 3I7QA 3GKFA 3BGJA 1O4UA 1HL2A 1W3NA 4YWIA 1K7XA 3CWOX 1XDMA 4EIVA 5LGXA 1WBJA 3W72A 1WA3A 2E6AA 1V7YA 4AH7A 1JRBA 3I65A 4MJZA 1DORA 5K4ZA 2NX1A 4EVZA 1OF6A 3NQFA 4UNKA 3L5AA 1GTEA 3PUEA 3VE7A 2HSAA 1WV2A 4DO5A 3M44A 1AG1O 3NQDA 1EWEA 3N73A 1KM3A 2PE4A 1H7NA 1KM5A 3W07A 3NL6A 3SSJA 3VCRA 3C2OA 3OVRA 3QQ1A 3DFNA 4O13A 2YFOA 2BTMA 4JTFA 2J88A 4NT0A 3SW6A 1Q6OA 3P8IA 1EUAA 3QJAA 1NFBA 4WY0F 1GG1A 2QCHA 5FF2A 3GXTA 4MKNA 2Q3RA 1GQNA 1S5VA 4LRSA 1F6KA 1WBHA 1VC4A 1K8YA 4WOQA 2G5WA 3DKLA 4MY1A 3C4UA 1WAUA 5E1QA 4J9JA 1TRDA 2ZTKA 4Q4KA 4P61A 5BW6A 4DPPA 4I9AA 4CLMA 1SFLA 2CLOA 3T4CA 1FXQA 3W7EA 1GEQA 3W7MA 4JTTA 5T26A 4GRSA 2OZ0A 3T55A 1GT8A 1TQJA 4IOTA 3LCFA 4HSNA 3P7YA 1WYIA 3DKJA 4LVBA 4UTJA 1VHNA 4JXCA 3S5OA 1QOQA 2GQ9A 4RCXA 1SW7A 4HPJA 1LCOA 1Z42A 3G22A 1N7KA 2QF7A 1IIHA 1LP6A 3VE9A 3ZS4A 4UNLA 1G4PA 3W7NA 1FWRA 2DU2A 3GR8A 3GX9A 1YXYA 4NQ1A 4LT9A 2E68A 2KZHA 3NA8A 3MHUA 1S5TA 4HN4A 3G1VA 3L0NA 3WJXA 5AHEA 2CZFA 5CGQA 3L67A 4X22A 4N9EA 3FS2A 3NQ6A 3L2IA 3S42A 2XN2A 3HB9A 2A85A 5HUOA 4JNMA 1QO2A 2A7NA 2I9EA 3NZ1A 1MZHA 1GVFA 4AHPA 4JTHA 2PURA 1H60A 4O12A 1ZCOA 4M6VA 2V5LA 3DHFA 2YW4A 3C56A 3OG3A 2QCNA 3QF0A 5AYXA 2YW3A 1FCQA 3UZ5A 4POCA 3W7OA 4ADUA 2ZZ7A 4M7TA 3NQ8A 3VI2A 3KVJA 3LCLA 4OWGA 1RR2A 3UQNA 2H8XA 3F4NA 3IGXA 2Q8LA 3FLUA 5D2TA 2QDGA 2EKCA 4O16A 2B7PA 1OFBA 4PCFA 1W5OA 5A5WA 1ME9A 2X2GA 4N2YA 1VYPX 1OFQA 4IMCA 4A3UA 3STGA 5FF0A 4JY9A 1D9EA 2YYTA 1W0MA 4N6EA 1LRQA 4NXKA 4AB4A 1H61A 5CG7A 3TAKA 4RK8A 5IBXA 5C2XA 4A21A 4O18A 1GVSA 3E02A 4YL2A 5IBXC 1XBXA 2RDWA 3W9ZA 3I68A 4M6PA 3W2LA 2A6LA 1LRTA 4WY0B 4E2DA 2X1SA 3P67A 4ZQNA 3KAOA 2B7OA 3PAJA 3LCHA 5EL1A 3LRMA 3GNNA 4QM1A 4OV4A 3C2FA 2NV2A 3KFTA 3SIZA 3HGRA 3LHVA 2CLLA 4KFNA 4LC8A 1GJPA 1LOQA 4IGHA 1SZFA 3P5ZA 1SQ7A 2QUTA 3C52A 2QCCA 2H8ZA 5DXXA 2Y89A 1QFEA 1GVRA 1R46A 3LCGA 4OGZA 3GR7A 3P82A 1A5CA 3FKKA 3LV6A 4FXSA 1AK5A 3LTYA 5LKYA 3D0CA 4UR8A 4DF0A 4I7VA 3KRZA 1JULA 1W5QA 1F2JA 3DFSA 4NNAA 4MFEA 4ADSA 5KITA 2ZZ1A 2A7PA 1FWWA 3TX9A 4HKPA 3ZWSA 3S8HA 4LW7A 4O4VA 3R2GA 2YYUA 4RXGA 3IIZA 4XZ9A 2QCMA 2CU0A 3G1DA 2WO5A 2TSYA 2V2HA 3ZR4A 4ZZ9A 1C9DA 3O6DA 3G18A 2E5CA 2YX0A 2AGKA 3N9SA 4JTUA 2QUUA 1I8JA 3O6CA 3VNDA 1JR1A 2A21A 2VFIA 4W9TA 4UTMA 3JRKA 2H3BA 1Q6QA 2E5BA 3N9RA 3MW7A 2EF9A 3ZWTA 4PODA 3NGJA 2DZPA 3LXAA 2GJLA 1PL9A 1G4EA 1DQWA 4DBDA 1S5WA 1SZGA 1YTEA 3CU2A 4A29A 3M7WA 1P4CA 1YXCA 2DZUA 1M6JA 5DXYA 2E6YA 1XKYA 3P74A 5FEZA 2WOQA 4N9BA 4OT7A 2R94A 3P60A 3PBWA 5D05A 1LM1A 4OQVA 4ZQOA 1RQHA 2NUYA 4UTKA 2I1OA 1K7FA 3FIGA 4ADTA 4Z08A 3BW4A 1LBLA 4WZHA 3MI3A 5D2YA 5F2IA 5HUPA 5HINA 3STEA 2UV8G 5AFDA 4WXYA 4PH6A 3Q94A 3IVSA 1W5NA 4H4IA 3KX6A 1RQEA 1K02A 2VC6A 5U7SA 3S1VA 4XTIA 5LNWA 1THFD 3TA6A 3CWNA 3QC3A 3TW6A 1JCYA 3EX4A 1TQXA 3W2KA 2C19A 2VELA 2Y63A 4NJHA 3G8RA 5AHIA 3CIXA 4XQ6A 1QMLA 1KV5A 3MHGA 1NEYA 4JTIA 2ZA2A 4JEQA 2ISSA 3TFCA 1KFLA 2W0UA 1ONRA 4N9DA 3USBA 1LROA 2NWSA 3LRKA 4NJJA 1EP2A 5F2GA 2QAPA 4M6QA 3E12A 5AC8A 5KTLA 1CW2A 4R34A 4FIRA 2VEMA 3NL2A 2ZCGA 4BI7A 1VQTA 4Z1BA 3QPYA 1T96A 3EX2A 3CEPA 1ZAJA 2VENA 4O8RA 2CW6A 3LX9A 2ABAA 1TPEA 1A5SA 3G3DA 5F2MA 3W22A 1G4SA 2YDAA 2DJLA 2V0TA 5HWNA 1TPUA 2FPTA 4RX0A 5E0KA 3L5LA 1TIMA 1ZAIA 1YADA 4JR5A 1KBIA 2C0AA 3IIOA 2Y7EA 3DHDA 1Q45A 4OHQA 3W71A 1UUMA 1TMHA 2PRMA 1I4NA 1BWKA 1DJNA 1VLIA 3PG9A 1GYNA 4B5NA 2WSYA 1YPIA 3ABQA 5AB3A 1ZAHA 3B06A 4M5PA 4AWTA 1NSJA 3W3OA 3S0CA 3ATZA 3W74A 5AYZA 3BG9A 3W7DA 4FX7A 3FOKA 4QSHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1EA0 A;  3OOD A;  5CCZ A;  2XH7 A;  3OG2 A;  4TU1 A;  3PP7 A;  3R0D A;  3WK1 A;  4WF7 A;  2FHF A;  4XWU A;  5DBT A;  4D8A A;  5BMW A;  1TPC 1;  1XLL A;  2BMB A;  3B9E A;  6PTD A;  3CAV A;  3MCO A;  4OVX A;  4OBT A;  3HBL A;  1UH3 A;  2INZ A;  3TC6 A;  2DEP A;  1TV4 A;  2V3E A;  4XAZ A;  1QK0 A;  3NPV A;  4FXR A;  4KES A;  5C5Y A;  4GJI A;  4V15 A;  3PJW A;  1R47 A;  5EGR A;  2WZI A;  3E96 A;  4L9X A;  2A3L A;  1VJS A;  3GDB A;  3H2F A;  3LHT A;  2VKZ G;  4NZ5 A;  4KWV A;  1MQQ A;  2Y1H A;  4C6C A;  1KTB A;  4AWU A;  5CAK A;  3CK5 A;  2VX7 A;  2OXN A;  3ABO A;  4WOZ A;  4A8L A;  1D3G A;  3THC A;  1R3T A;  4MY9 A;  3KW3 A;  3NQC A;  1SW0 A;  2ZBT A;  3BO9 A;  3FAW A;  3QW3 A;  3W00 A;  1JCJ A;  3A5F A;  4GX8 A;  1ZB5 A;  2W66 A;  2R6O A;  3WK0 A;  3NQB A;  1H11 A;  4AF0 B;  2J6X A;  3BMX A;  3GIY A;  3L2L A;  3LQG A;  1XLF A;  5BCA A;  2CZ5 A;  4BQ4 A;  1DQU A;  3WUG A;  4JTK A;  5HBF A;  2CZV A;  4MGG A;  2VR2 A;  1AQ0 A;  4YTS A;  3U2Z A;  3QV9 A;  3QR0 A;  2W63 A;  1UOK A;  1Q7Q A;  1W56 A; 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