5KSWA

Dhodb-i74d mutant
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
NRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNADGLQNPGLEVIMAEKLPWLNENFPDLPIIANVAGSEEDDYVAVCAKIGDAPNVKVIELNISCPNVKHGGQAFGTDPDVAAALVKACKAVSKVPLYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADGLTMINTLMGVRFDLKTRKPVLANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQVVDIPIIGMGGVESAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIEKLPEVMDQYGIDSLENLIQEVKNSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
publication title Isoleucine 74 Plays a Key Role in Controlling Electron Transfer Between Lactococcus lactis Dihydroorotate Dehydrogenase 1B Subunits
rcsb
source organism Lactococcus lactis
total genus 97
structure length 306
sequence length 306
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.3.1.14: Dihydroorotate dehydrogenase (NAD(+)).
pdb deposition date 2016-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5kswA00
1KBJA 1GYLA 4A21A 5F2LA 3PS7A 1EWDA 3OEXA 4YXGA 1K8YA 4O12A 5LNUA 2WV8A 2Q8ZA 1OX4A 2DZVA 4J9JA 4D2JA 2QCGA 3M5VA 4O0KA 5KTLA 1PIIA 3N9SA 1OX4B 4WY0A 3DHDA 2VEPA 1AK5A 2E77A 2YCEA 4WY0B 3N3MA 3G1VA 5C54A 3BLEA 1RZMA 1ZALA 4GUIA 6ALDA 3PBYA 4LC8A 1VZWA 1GZGA 3G8EA 5F4WA 1B57A 3MUXA 1TPH1 4B5NA 4GC4A 1I2QA 1KBIA 2GQAA 3NQGA 3A9IA 3KOFA 3TQKA 4HSNA 1R46A 1XI3A 3LXAA 5F2MA 1O60A 1ONRA 2QAPA 2A85A 1WOBA 3G1DA 3MWAA 5CZTA 1TTIA 4YL2A 4AHPA 1PCWA 1S5VA 1JCMP 2J27A 2Z0IA 1TRDA 3P84A 4BWLC 3B03A 2NZLA 2I14A 3UWVA 3W1TA 4MVAA 3CEUA 4QITA 4IMCA 5LNRA 3NXFA 4GUFA 4UTWC 1HL2A 4DO6A 1VH7A 3B06A 1UUOA 4IQLA 2NXIA 3STFA 3W87A 3R89A 1R2TA 2Z1BA 5G2IA 2TMDA 4RKAA 4JTJA 3TXZA 3PY2A 4O1BA 5EL1A 5D2WA 2YX0A 2Q3RA 3TSDA 2OT1A 4LC6A 3W7MA 4ZVJA 3HOJA 4G1KA 1TPDA 2E1DA 2A6LA 2C14A 2QUTA 1EB3A 5AHMA 1QDSA 4JTGA 3LXCA 3R5EA 4RV8A 3OIXA 2NX1A 4BI6A 1QO2A 3E12A 1UBSA 4IPJA 3MI2A 1QPOA 2GVGA 1YTEA 1OFOA 4TMCA 4CCDA 3QPYA 3W9ZA 4UTHA 2C0AA 4JIPA 1WV2A 3W2NA 2NUYA 3UWQA 1VS1A 2IQTA 3WFAA 4AMAA 4TIMA 3LTYA 1QWGA 3L67A 1OX5A 1SZGA 3NL3A 3IV3A 3S1VA 2FPTA 2J6XA 2FIQA 5G1TA 1OFDA 1H60A 2CLMA 4WZHA 4MZ1A 1BEUA 1W5NA 5I3FA 3MBFA 4QM1A 3NOEA 1FX6A 5BW6A 4NZFA 1ZNNA 3MMTA 3WJXA 3UWWA 2B4GA 5D2YA 1KM6A 3QSTA 3W7PA 1GPWA 4YWIA 3PR2A 2P1FA 3OVRA 3SR7A 3DFTA 3HGJA 4GUGA 3M41A 2CW6A 4GUJA 3V75A 3G0SA 1W3IA 4DF0A 3NPVA 5C2XA 3G1AA 2VFEA 1OFQA 3GLCA 3EEGA 2QDHA 5D30A 1XBXA 3T44A 5TBOA 3GXTA 3M16A 3D0CA 2QEZA 3NNTA 5U7SA 1QFEA 4I7UA 2ABAA 4JYEA 3MP3A 1SO4A 1YADA 2WJZA 4FXRA 4LT9A 1K03A 2X2GA 4LS2A 3DFSA 3W3OA 1LBMA 3NM1A 1YTKA 4EF8A 4O50A 3USBA 3DBPA 1SUXA 1W5MA 3SECA 2DZWA 3GAKA 2AAMA 3H54A 1FXPA 2R14A 1OK4A 3VCRA 3O06A 1AG1O 1Y0EA 3LRKA 3UY8A 3IVSA 2JGQA 1RV8A 1QNVA 4FNRA 3S6DA 2NX9A 4LS0A 3W7GA 4LVGA 1XUZA 3IGXA 4Q33A 2J24A 3N2XA 2OMAA 3N73A 1KA9F 3K30A 3P7YA 3LHWA 3HPSA 2ZTKA 2G95A 1GWJA 4Y96A 4RZ5A 1W3NA 4Z0SA 2H8ZA 2BZNA 5E1QA 2FPVA 2PE4A 3W72A 3WJWA 4UTTA 3GB6A 2EKCA 2R91A 3L65A 3GXNA 1IIGA 2EF9A 5CPLA 2DZXA 2QUUA 5HQEA 5A5WA 1GVQA 1U83A 1VPXA 3A24A 3I7SA 1XL9A 1H50A 1F6PA 3SY5A 3CTLA 3N2MA 2FDSA 2ISVA 3CQ0A 4WXZA 2DZUA 3EXSA 3M44A 3ZS4A 3QZEA 4PL1A 4C1LA 1GTEA 2GVJA 5BMXA 1LDCA 3C56A 2YSWA 3W1UA 3IIZA 4UUIA 1BTMA 2C13A 4NJKA 4O54A 1FCBA 4P2VA 4E2BA 1B4EA 3W1NA 1OFAA 1G4PA 5LZLA 3I7QA 3W7NA 4Z1BA 2QCDA 2F7FA 1LOLA 3THQA 4ORMA 1ZAJA 2CWNA 4WY0F 1AW1A 2QCDB 4ZQPA 4ZQMA 2JK2A 1GQNA 4E2DA 3PAJA 3HGOA 4FX6M 4N9DA 2GQ8A 1FDJA 4JY8A 1H7OA 4YLWA 1HTIA 2A21A 3EX6A 4FNSA 1MEHA 1WDWA 3TW7A 2YXGA 1OF8A 5C5YA 4O19A 4YCPA 1IXOA 2E5BA 2VFFA 2X30A 4DBEA 4MOZA 3AO0A 3JS3A 4TU1A 3TA6A 3CLMA 3GYEA 2FPYA 1ML1A 3ABOA 2ZRZA 4BR1A 5FEPA 3G1SA 5LHEA 2ZA3A 4WOZA 3STEA 2H3DA 1WXJA 4MFEA 3F03K 1KTCA 2A6NA 3HO8A 4M6QA 3DAQA 4IGHA 3GK0A 3G8RA 3E0IA 2A1YA 5E0KA 4ALDA 4AWTA 1V7YA 3DFOA 1KTBA 5D32A 1LRQA 3NQ2A 4N6EA 1DOSA 4UNKA 1DHPA 4PTNA 4LV4A 1SPQA 4UTKA 3QJAA 2VFHA 4K36A 4Z08A 5AHIA 2Y7EA 5EBUA 1GTHA 3G1HA 3HF3A 3INPA 5H91A 2FTPA 4HNUA 5FESA 2DZTA 5FEXA 2CU0A 3IIPA 1NVMA 4E38A 3W2UA 2PURA 4ORIA 1H7WA 1TPWA 4MYAA 4LWWA 2VXNA 4IMGA 4JTUA 2C6QA 4RXGA 1TCDA 4MYXA 2B7OA 4KFPA 3N14A 3NQAA 1Z42A 3TIMA 3MI3A 4AB4A 3I7RA 2CFFA 2BXVA 3S5NA 5F2IA 4YCOA 4O52A 4RLIA 3DH7A 3IRDA 3VNDA 3MYPA 3O6DA 4L4LA 4O15A 3GKAA 3EX1A 2DZSA 4Z1CA 3T78A 2WPBA 3NQMA 3LHUA 4JX4A 1S3HA 1KM5A 1YPFA 4NU7A 5AYZA 3ABSA 2WOQA 4GJ1A 1ME7A 3FLUA 4QNWA 2QJHA 3LCLA 5F1VA 3WK2A 4JTHA 3GKFA 3QFEA 1G4TA 3TJXA 1KLYA 4ADUA 3F4WA 3HG2A 2WKJA 3W7QA 3KHJA 4R7JA 4NVTA 4IJBA 5HR6A 1K3UA 1JUKA 3WK3A 4R34A 3UXDA 4N02A 1OYBA 1GG1A 3BG3A 4XBKA 1LZOA 1VYPX 3CB8A 4ZQCA 2DU2A 3CEPA 4W9TA 2WO5A 4PFMA 4N6FA 5CPOA 4BK9A 1TV7A 2FLIA 3BLFA 5HWNA 1MZHA 1P0KA 3LI1A 1B9BA 3NQDA 4MY9A 3QW3A 1VRDA 4HN4A 3TR2A 2LLEA 3FJ6A 3CU2A 5HJLA 1U5JA 5BRBA 5D2TA 1SO6A 2B7QA 4JTIA 1DJQA 4IMDA 1SR9A 2I9EA 3SW6A 2P0OA 4O28A 3W2KA 3EWYA 5HWJA 3ANYA 2EPHA 1DJNA 4AWSA 1QOQA 2ZZ4A 2ZRXA 2RFGA 3NG3A 4MPQA 3FKRA 2YW3A 1HFBA 2QR6A 3SSJA 3MJYA 4UIOA 5HINA 1O94A 4M7SA 4CCEA 4NXKA 1KM4A 1WBJA 3GZ3A 3OVPA 3P62A 3RK8A 3TROA 1M7PA 1YXDA 1TPEA 5TIMA 4MZ8A 3TSBA 2JKPA 1VQTA 4S1FA 4NT0A 1JJKA 2ZZ3A 4RX0A 3W07A 3V1PA 1UASA 2ZRVA 2V0TA 3IIVA 3W70A 1A5AA 3M6YA 1N8FA 2GOUA 2Z6JA 2OZ0A 1MO0A 1TMHA 1DQWA 4EIVA 3FOKA 3SJ3A 3EKLA 5F1UA 3C8FA 3R8RA 2J9YA 4LVFA 1EX5A 4JYDA 3EWBX 1UUMA 3R2GA 3TFXA 4WUIA 4LU0A 3VKJA 4HPJA 2DJXA 4PL2A 4EVZA 1TPVA 1G7UA 3M5ZA 3TC6A 2X1RA 4FNPA 3T4CA 1XFBA 1W0MA 2Y6ZA 5EY5A 4CNOA 2NV1A 1T8XA 2J9ZA 1KFBA 1SSDA 1JQVA 4K8HA 2W6RA 4O16A 2C16A 1EEPA 4A2RA 2V5LA 3N34A 2B7PA 4LUJA 1EP3A 1WQ5A 3W7RA 3Q58A 5IM51 4U28A 4XUGA 3CIXA 3VE7A 3W88A 3L0GA 3IVUA 1NF7A 1BKSA 4DO5A 1KW1A 4O10A 4QIUA 4JX5A 4UMBA 1H7NA 4MLJA 2ZZ5A 4UC5A 2ZZ1A 1W5PA 5J5RA 5F4SA 2HS8A 1N7KA 5FF4A 1HO1A 3UZ5A 3GR7A 1YXCA 2V82A 3NL2A 4HPXA 1QPRA 2YDAA 3W7KA 2GJLA 5FI8A 1FWNA 3OVQA 3LTSA 4JICA 3PG9A 1A5CA 4O57A 1M6JA 4KWVA 4OWGA 2QDGA 3L66A 1VCFA 2Y7DA 3PC0A 5HNRA 2RDWA 4LRSA 5DXXA 4K7YA 5K4ZA 2C1HA 3QSRA 4BI5A 4LNYA 4NX0A 3OA3A 1XCFA 1LOSA 5AFDA 1DQXA 4BWLA 4RJEA 4MY1A 1UB3A 4JS3A 3KVKA 4ONVA 3BG5A 3NQEA 4FX8A 3BG9A 3LXBA 3TNOA 4MFDA 5AC8A 2ATSA 4OBTA 3W1AA 3Q94A 1J5TA 3QQ1A 2QCMA 5D2VA 3EKZA 3T40A 4HSOA 3L2IA 2TRSA 1RD5A 3SGZA 4ICNA 2GVLA 3S1WA 1F5ZA 4UMAA 2VEMA 3GDKA 1W1ZA 3LHTA 4N9BA 4FF7A 4XKYA 1QPNA 4IMEA 3BARA 1EP2A 2ZRWA 4XKYB 2F84A 4LS1A 2Y62A 3QMRA 3W7HA 4XQ6A 1XUUA 3NQCA 5FEWA 3W1XA 3T7VA 7TIMA 2V81A 2GQ9A 5LHFA 1OABA 4C1KA 4ZQOA 4UMCA 1Z48A 3B4UA 2CZEA 3KRSA 4N2YA 1J4EA 3PB0A 4RR4A 3FEMA 2ISWA 3B0PA 1HG3A 5LKYA 1MSSA 3EWUA 3L5AA 2Y7FA 5KZDA 3L0KA 1TJRA 1ZENA 3G22A 1OG0A 4R33A 3P81A 3ZWSA 1NEYA 1ME9A 2BLEA 2HTMA 2ZBTA 5D05A 3NL6A 3N19B 3TW6A 4JNMA 1JRCA 4UTJA 3GDTA 2PRLA 3W75A 3P5ZA 4LTSA 1R47A 3HPXA 1OF6A 4NUWA 2ZZ2A 5GVJA 3UWUA 1VYRA 4NJJA 2WNZA 4XZ9A 1XBZA 3QH2A 2NV2A 1GG0A 3TFCA 2RDUA 3P5YA 3LLFA 5I3KA 3LTPA 5DBTA 2QAFA 3E49A 2QCLA 1Q6RA 4JN6A 2V5BA 3O6CA 3UD6A 1JVNA 1CW2A 4GFSA 3QF0A 1D3HA 5KZEA 1LOQA 3TC7A 2CLEA 1LP6A 3O15A 1K8XA 3QMTA 1JCNA 4ZMGA 1J2WA 4OV4A 3TV8A 1IXNA 1G7VA 4BFAA 1FCQA 5DXYA 1QPQA 2DJLA 4FEZA 2Q3OA 3L9CA 5G5IA 1Q3NA 3RU6A 1A50A 1KFJA 1EUAA 3NYZA 1EIXA 1T96A 4OV9A 1XDMA 1GOXA 4JY9A 4ML9A 4O8RA 1FWSA 3W76A 3ABQA 4U4MA 2ZQ0A 3W74A 2PRHA 3QMSA 1RQHA 1IXPA 5HR7A 2ABBA 1YPIA 1TTJA 3FS2A 1VCVA 3LLDA 1I2RA 5DCEA 2OJPA 1DV7A 4A3UA 4JTTA 2V30A 4UFHA 2A5HA 1YDOA 1BWKA 3NA8A 1GT8A 1AW5A 3SI9A 5CGQA 5G1YA 2Y7GA 2FJKA 3EWWA 1F7BA 3L5MA 3G18A 4NJGA 4RZ6A 3LCWA 3PG8A 1DBTA 3PUEA 2HSAA 5K4XA 3JR2A 1H51A 5DCBA 5CSRA 3PB2A 1YYAA 2ZRUA 3P80A 4NJIA 3BGJA 4HIBA 4QISA 2V8ZA 4H4IA 4MUZA 1KM2A 1XC4A 3U6WA 3LM7A 2PRMA 2WSYA 4UTTC 3LHZA 1QOPA 3HBLA 2V2CA 4NZJA 1WAUA 4H6KA 2NUXA 3FKKA 3TQVA 4UFJA 4JD4A 3P82A 4DEFA 1OHLA 3EXTA 5CG7A 4DXVA 2Z6IA 2ZZ6A 1SQ7A 3M7WA 3S5ZA 3W22A 3MYOA 4ZQRA 1JCYA 3RMJA 4O4WA 3AJXA 1GVOA 3W2MA 3H55A 3P67A 3FJLA 1W5QA 2RKXA 4LY8A 5CPMA 2P10A 3BGGA 2YFNA 5AHFA 3LCHA 2ZDRA 4UFLA 3WJZA 3IGSA 4IX0A 3GVGA 3S0CA 3A22A 5FF2A 4FHAA 4K37A 2TYSA 4M5PA 5EPDA 3WJYA 4XWUA 2FB2A 2YR1A 2PCQA 4HNVA 3O16A 3LGEA 4PEKA 3W7JA 5AHEA 4FIRA 1SSGA 3DFPA 1OX6A 1TJPA 4AWUA 3HGRA 2QCEA 1TPB1 3DZ1A 3MHFA 3FYOA 2E5DA 4Y90A 2Y63A 2UV8G 4JDYA 1LLWA 4X2RA 4WQ6A 4EF9A 1JCXA 1R2RA 4JYFA 2NWRA 3W85A 4UTUA 1NF0A 2Y61A 3ABRA 1DORA 3SZ8A 1TTPA 5G2WA 3DI1A 3O07A 1GVFA 2XN1A 1H1YA 3NAVA 5AYYA 2ZA2A 2V2HA 4X3ZA 1G6CA 3IIOA 1LBLA 3W83A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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