5KX8A

Irak4-inhibitor co-structure
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
297
structure length
285
Chain Sequence
TRFHSFSFYELKNVTNNFDERPISVGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNTTVAVKKLATTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGINFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFTAKISDFGLARASEVMRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDKKMNDADSTSVEAMYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQEMTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Interleukin-1 receptor-associated kinase 4
publication title Efforts towards the optimization of a bi-aryl class of potent IRAK4 inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 98
structure length 285
sequence length 297
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5kx8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5kx8A01
3HP2A 3SRVB 3LOKA 1H0VA 4PL5A 5IQAA 2B0QA 3DQWA 3CY2A 3NUNA 4L43A 5E8ZA 2Y7JA 2REIA 3GFWA 4CMTA 3HMMA 4XG8A 4E6QA 4AOJA 2XEYA 4GJ2A 3MS9A 2C6DA 1LEZA 1YWVA 2CDZA 2OI4X 3PJ3A 2EXMA 3QKMA 4WUAA 3ATSA 4FL1A 1OIYA 3UOKA 1ZRZA 4FZ6A 1IAJA 3MJ2A 2FSMX 2J0LA 1J1BA 4ERWA 3QKLA 3B8QA 5CEIA 4A7CA 3WZEA 3KA0A 4JG6A 4MH7A 3ULZA 2OGVA 2R2PA 5IQBA 3TNQB 2C5XA 3NNWA 1W8CA 3F2RA 4RFMA 5J1WA 3PA4A 2OKRA 3QRIA 4LUEA 3EFKA 1OL7A 3BGQA 4OTFA 3V51A 4BDDA 3SW7A 3R02A 2J0KA 2R3FA 2EB3A 2WEVA 2OXYA 3Q60A 3W33A 3I79A 3WF7A 1PKGA 4U0IA 4LV5A 4XUFA 5FM3A 4GFOA 4DFXE 3FI8A 2HY0A 4DBXA 4YUQA 3BKBA 2ERZE 4IADA 3R1NA 3WF5A 3VW8A 3ACKA 1JAMA 3TV7A 1RE8A 2NPQA 5GZ9A 3KULA 3MPTA 2OFUA 2OZAA 3LFNA 3M42A 1QPCA 1R39A 3MTLA 5LVPA 2W17A 3OTVA 3LLTA 4X3FB 4DTKA 3ALOA 3GCSA 2RGPA 4M12A 4MEDA 2PYWA 4QP4A 3ZMMA 2CN8A 5IA5A 3UGCA 1GOLA 1ZZ2A 2V7AA 4IC8A 4YJQA 4EH6A 1OBDA 4UEUA 3FLYA 3VRZA 4R7HA 4YC8A 1IEPA 3D7ZA 3DKCA 3SW4A 5IUIA 4FKLA 3VRYA 5HTIA 2P33A 2OXXA 3PXRA 4NZWB 2WB8A 4B7TA 4U79A 1FPUA 4ORKA 2PHKA 3OZ6A 3P23A 5D7AA 4AW1A 3COIA 4JVGA 2I0EA 2XNMA 4YPSA 3UPZA 2Y0AA 3OY3A 4NJDA 2QQ7A 4HVSA 5A9UA 3GGFA 3ZM9A 4YBKA 5CT7A 5DEWA 5CU3A 3HX4A 5C4LA 3PSCA 2IZRA 2C6OA 4YGAA 5HI2A 5FWKK 5DLSA 3EQCA 3R22A 3TZ7A 5J9LA 4CQGA 2CNUA 4LV8A 1A48A 1P14A 1K9AA 4WRSA 4GV1A 4AT3A 4IM0A 2R3LA 5M09A 3O50A 4JXFA 2WEIA 5AX3A 3C5UA 2XNEA 3QA8A 3QC4A 5CEMA 2ZYBA 2UW0A 4ANQA 4RSSA 3ZONA 5FDXA 4M97A 1Z5MA 4TXCA 4QQTA 1PYEA 3UG2A 4UYNA 5E8SA 1SVGA 3DPKA 2ITWA 3WIGA 3TKHA 2FGIA 1TQPA 3Q9ZA 3UIBA 1P2AA 3W2PA 2VTRA 2PMNX 3DNEA 3F3ZA 4O83A 4BY9E 4JBQA 4AZWA 1Q3DA 5AR7A 3P79A 5DYJA 4FIJA 5FBNC 2QO9A 4NTSA 4C3RA 3G15A 2YAKA 4O7WA 3G6HA 4GW8A 2IW8A 4QMYA 5DFPA 4IAZA 4D0XA 3TI1A 3DXQA 2W06A 2R3IA 4MNEA 2OWBA 3RGFA 1QPJA 2VGPA 2RKUA 4GKHA 3D15A 2VTTA 4QP9A 4RLKA 4CEGA 1IASA 3OUNB 4ZP5A 4XS2A 4C34A 3D4QA 3F7WA 4B0GA 3RZFA 3CD8A 3P9JA 3E62A 2XIXA 2BDWA 2OFVA 4WG4A 3ZXZA 4FTMA 1L8TA 5JEBA 5D9HA 2R3MA 3OW4A 4IX3A 3NUPA 3RAWA 4OTGA 4O7NA 1BLXA 3L9PA 3VF9A 4FT0A 4NK9A 2YCSA 3SAYA 3HYHA 4M0ZA 5BVWA 4EHGA 5EOLA 4BCMA 3G9NA 1OMWA 4IAYA 1ZOGA 3EN4A 3BBWA 3K5UA 1MRVA 2R5TA 1YWNA 4MXYA 3E8DA 5AP1A 4OT5A 2XK4A 3ORTA 2C5NA 3P1AA 4FBXA 5HG9A 2GHGA 3CGFA 4UWCA 3T3VA 4KIOA 3OXIA 4FTAA 4DFNA 3R7IA 3S1HA 3UJGA 1OKWA 2PMOX 3R8ZA 2ZM1A 1OGUA 5HTCA 5FP5A 2R3OA 2BZKB 3NX8A 4YZBA 2V22A 2HZ4A 3LFBA 3Q6WA 5K3YA 2JFMA 3QCYA 5M51A 5C26A 5AEPA 5AA9A 4RC4A 3LJ0A 3IDBA 2I0YA 4EUTA 2VZ6A 4YZMA 4IJ9A 4RX7A 1MQ4A 3AGMA 4XOYA 4ZZMA 4L53A 4R8QA 2GS6A 3H3CA 3LQ8A 4U40A 3JR1A 2R7BA 2W1GA 2R7IA 2VTHA 3MYGA 1Q24A 2O5KA 2O3PA 2XIRA 3FE3A 3OCBA 3RAKA 2UZWE 5IMXA 5CU6A 4E4LA 5HU3A 4TW9A 5ANEA 5JKGA 3GNIB 1M17A 2WTJA 4FTJA 4PUZA 4B8MA 2CNQA 2UUEA 3CKXA 3KN6A 4FV5A 1KE6A 2QLUA 5J1VA 4JX7A 2CKEA 2IJMA 5K9IA 2ONLA 1KOAA 5DBXA 4ACDA 3BYVA 1NA7A 3UQFA 2Y6OA 3FHRA 1FGKA 3GQIA 5FRIA 3AMBA 4EYMA 2A4LA 4FSUA 4E5BA 3UNKA 3TNPC 4ZOGA 5TF9A 2BRNA 2YDKA 2BIKB 3O0GA 4KNBA 1H27A 3ZYAA 4EK4A 5JN2A 2PE1A 4QMVA 2VWUA 2WZJA 3OCSA 5A3XA 3VUDA 2R9SA 3VO3A 3BCEA 5E8VA 4UMQA 3O7LB 4LRJA 5IEYA 4J1RA 3DNDA 3BV2A 4IZ5A 3ZUVA 5EYKA 3QYZA 5J5SA 5EI2A 5BX0A 3BYUA 1W7HA 3IOPA 5HE0A 3KMUA 4EOIA 4PDOA 4LL0A 5CAVA 4EOPA 2EU9A 3QD4A 4C8BA 2XK8A 4E4MA 4QD6A 3EN9A 4D58A 2VGOA 5D10A 1TQMA 4K77A 3PVUA 4BDKA 4ZY5A 3PPJA 3D2IA 2YJRA 4DH1A 3MVHA 4NYEA 4NIFB 1LUFA 4UY9A 3CE3A 4OUCA 2BUJA 4L3PA 5FG8A 4E6CA 1PXMA 2WIHA 3PPKA 2O2UA 4C61A 1FINA 3DV3A 4D4YA 5HHWA 3U6JA 5CSVA 5LMKA 4AN3A 2XNPA 3MFUA 4O0TA 4A9SA 3SRVA 5CQWA 1UU9A 3WZUA 3QKKA 2HZIA 5CEQA 2G1TA 3G33A 1YKRA 4L68A 4MX9A 2PVKA 2CJMA 2WMRA 3LZBA 2H9VA 4YZDA 4DTAA 4BCJA 2RFSA 3FPQA 5AUTA 4IMYA 4UYAA 2ITTA 5C4KA 3R7UA 2JIVA 2YM6A 3POOA 4FG7A 1LP4A 2DQ7X 2UZDA 5CXHA 5HOAA 4BCNA 5BNJA 3DTCA 1UNGA 3HMNA 5I9XA 5M4CA 3UIUA 4D4SA 2OXDA 3DJ5A 2LGCA 4RX5A 4EH4A 5K0XA 1B39A 3NCZA 4H3BA 1W83A 2WU6A 4OBOA 1AGWA 3FYKX 5KBQA 4X6RA 2FUMA 3UG1A 4O86A 3QA0A 4FE2A 2IZTA 3VS1A 4CSVA 4DITA 4FNXA 1JKKA 2BZHB 3GXLA 3LFFA 3EFWA 3NUXA 4BZDA 5KX8A 3E92A 3VJNA 4CT2A 4WT6A 5IQHA 3JYAA 3ZO2A 3HLLA 3WZKA 3RWPA 2J4ZA 4RIXB 5C9CA 3RAHA 1YI6A 2PZIA 4W4YA 3R7OA 3THBA 4ARKA 4KIKA 4C7TA 2WQBA 1FQ1B 2PSQA 3TZ9A 5L2SA 2X7OA 4EOLA 1Y57A 3SHEA 2IVTA 2OJ9A 4EH8A 5E8UA 2OG8A 1Q41A 5CI7A 2BRMA 5I0BA 3ZXTA 5J95A 4IFGA 4YLJA 5DE2A 5T6KA 3UQGA 2W7XA 4GT3A 5E1SA 3NYVA 5E9EA 1H4LA 2XS0A 2ZDTA 2C1BA 3KXHA 3DBDA 3CQWA 4IIRA 4H05A 3BGPA 1SVEA 3HUCA 3A2CA 5HVJA 3SG9A 3ZDIA 3DCVA 4EOQA 4X2GA 5HEZA 3HAVA 5ANDA 4CFWA 3WYYA 2RG6A 3L9MA 4RVTA 4ZS4A 3PP0A 5DGZA 5ITAA 2OH0E 2X2KA 3F6XA 3LAUA 2GFSA 3L9NA 3PWDA 4F63A 3DOGA 4GK3A 3BHUA 4F9YA 4HCVA 2BFXA 2FVDA 3GFEA 4IEBA 4QMLA 4DN5A 4JR3A 1ZLTA 3HV7A 4PPBA 1YHWA 4GK4A 4JQ7A 4CTCA 4YO6A 3FV8A 3NR9A 4LMNA 1LEWA 3RM6A 3LE6A 4E26A 5HBHA 2CKQA 1ZXEA 4RMZA 5LVNA 1ERKA 2YEXA 1JOWB 3FSKA 2QOHA 2YM8A 3VBTA 2WQEA 3I6WA 1AD5A 2VWYA 5DG5A 4BI0A 4Q5HA 3EN7A 1NT2A 1F5QA 4FSZA 4KRCA 3NCGA 3OTUA 3AQVA 3S3IA 4AOIA 4J8NA 2PVFA 1VYZA 4A07A 4BCGA 2GHMA 4FICA 4Y5HA 3UNJA 5IQDA 3PFQA 3R73A 5CAQA 4NT4A 1W84A 5DNRA 3Q2MA 3DQXA 4ANBA 1FMKA 2PZRA 1XH4A 1MUOA 4RVLA 4WO5A 3BU5A 3QUEA 4QYYA 4PDSA 5DA3A 2A27A 3PWYA 1YXSA 5H8BA 3UBDA 3VIDA 4BDCA 4CFFA 2VWBA 4FUXA 4XP3A 4Y85A 5EYMA 2R0IA 4G1WA 3G6GA 3QTSA 5M55A 5E91A 2B7AA 4Q9SA 4RZWA 3FKNA 4IB1A 3W2RA 4D9UA 4FX3A 2JC6A 4KAOA 3I7BA 5DVRA 4O84A 3QHWA 1M52A 2OJGA 3V6RA 4C59A 3GC7A 3KKVA 3BQRA 4JR7A 2PL0A 4EZ5A 2XJ2A 3C7QA 4BR3A 2ITPA 3P7BA 4JDIA 4JNWA 3OUKA 4I0SA 3UC3A 2PULA 4EK3A 1UNHA 2O63A 4FKUA 1A06A 2XIYA 3R9NA 4ACHA 5C1QB 5IISA 5M56A 4EK6A 1CKJA 2GHLA 4G2FA 4C33A 1I09A 2C3LA 4QPMA 4X2JA 5CI6A 4L52A 4BGGA 2VNYA 2JDOA 5FTQA 3LPBA 2J2IB 4KKGA 4O0RA 5ACKA 4TWOA 4FYNA 3FL4A 4FV2A 3CP9A 5DT0A 3RAIA 3ZS5A 1A9UA 1IRKA 3COMA 3OVVA 3O23A 4YJRA 5E4HA 3DDPA 3DA6A 3NS9A 4B6LA 4FOBA 5LWMA 1LR4A 3UMWA 5JQ5A 1GZOA 3QRTA 3TKUA 5LMKC 3GQLA 3P86A 3E5AA 4X2NA 2WTDA 2PVJA 4KINA 4RVKA 3TV6A 3TUCA 4H3QA 4UN0C 3PXZA 1OKZA 4ACGA 2VWZA 4TY1A 4WHZA 3HL7A 4KSPA 2QOLA 4GIIA 1PXOA 2UVYA 4OW8A 1S9IA 5AUZA 5AADA 5CAOA 4IAAA 3LJ1A 3EKKA 3ORZA 4QMUA 3UO5A 1PXLA 5FEQA 5HU9A 2E9VA 3I0OA 2IG7A 2HZ0A 3R8MA 3D14A 4YNEA 2ETRA 2WMAA 4AQCA 4PRJA 5CU2A 1BUHA 3ENMA 2B9FA 5M57A 4F64A 2GNJA 2DUVA 2DWBA 4DT8A 3O96A 4MD7E 3GOPA 4X2KA 3Q6UA 2C3KA 4YSJA 3ULIA 5M4UA 5CT0A 1KV1A 2R3NA 4FEXA 1PRYA 2QOIA 3QQGA 4RJ4A 2UW6A 1MRYA 3MY0A 3IDCA 4NEUA 1LPUA 2OJFE 5DR9A 5H8EA 5I3OA 5TR6A 1ZMWA 4GS6A 4G9RA 4M69B 3TNWA 5E8YA 2WOUA 1JSTA 3CKWA 2XK9A 3OCGA 5CEOA 4XLVA 5CVFA 4X6QC 2UW9A 4GUBA 4Y46A 5CF8A 3ELJA 4X3FC 5HBEA 5KCVA 4NIFA 3IDPA 1KSWA 4F65A 1H28A 4D4VA 4R3PA 3PXQA 5EQYA 4GYGA 4QNAA 3AD6A 5H3QA 5FUTA 3RPSA 3D0EA 2FA2A 3BELA 2RF9A 4R3CA 5L4QA 4AX8A 4E93A 2WMWA 3P7AA 2PE0A 4DAWA 2I1MA 1Q5KA 3POZA 4EORA 4DFYA 3RTPA 3A7FA 3GOKA 3AC3A 2QU5A 3H9RA 1PW2A 2YZAA 3IONA 3QZFA 4L67A 2I0HA 4ZZNA 4CFUA 2W4JA 1SNUA 3QLGA 2AC3A 3BHHA 5H2UA 4ZSGA 3WBLA 4ZSAA 5CLPA 3ET7A 3NMUF 4OAVB 2UZBA 4BCPA 5AUXA 4EHZA 4MF1A 2Q0NA 3PUPA 2ZAZA 5AP4A 4C4GA 4Z16A 4XBRA 4FKWA 4Y5QA 4DF3A 4QTEA 2VAGA 2FSTX 3FQEA 2OSCA 4BBEA 4BFMA 2BAKA 4C58A 5LVMA 4U3ZA 3UP7A 2C5YA 2X9EA 4NKAA 4FTOA 5IG1A 4FTLA 3OC1A 4RBLA 3BE9A 1BL7A 5CAPA 1WVYA 3E8CA 4U44A 3ZFXA 2E9NA 3L9LA 2PUUA 4I6FA 4M68A 3QYWA 1Z9XA 4HGSA 4BBFA 5M07A 5EHYA 4YC6A 1PYXA 2QR8A 4E6DA 2CGXA 2EB2A 3R30A 1KE8A 2OZOA 4RIWB 4FC0A 4XH6A 3R83A 5J79A 5L6PA 4J98A 3V5WA 4AP7A 1T45A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HP2 A;  3SRV B;  3LOK A;  1H0V A;  4PL5 A;  5IQA A;  2B0Q A;  3DQW A;  3CY2 A;  3NUN A;  4L43 A;  5E8Z A;  2Y7J A;  2REI A;  3GFW A;  4CMT A;  3HMM A;  4XG8 A;  4E6Q A;  4AOJ A;  2XEY A;  4GJ2 A;  3MS9 A;  2C6D A;  1LEZ A;  4LDT A;  1YWV A;  2CDZ A;  2OI4 X;  3PJ3 A;  2EXM A;  3QKM A;  4WUA A;  3ATS A;  4FL1 A;  1OIY A;  3UOK A;  1ZRZ A;  4FZ6 A;  1IAJ A;  3MJ2 A;  2FSM X;  2J0L A;  1J1B A;  4DDI A;  4ERW A;  3QKL A;  3B8Q A;  5CEI A;  4A7C A;  3WZE A;  3KA0 A;  4JG6 A;  4MH7 A;  3ULZ A;  2OGV A;  2R2P A;  5IQB A;  3TNQ B;  2C5X A;  3NNW A;  1W8C A;  3F2R A;  4RFM A;  5J1W A;  3PA4 A;  2OKR A;  3QRI A;  4LUE A;  3EFK A;  1OL7 A;  3BGQ A;  4OTF A;  3V51 A;  4BDD A;  3SW7 A;  3R02 A;  1G8K A;  2J0K A;  2R3F A;  2EB3 A;  2WEV A;  2OXY A;  3Q60 A;  3W33 A;  3I79 A;  3WF7 A;  1PKG A;  4U0I A;  4LV5 A;  4XUF A;  5FM3 A;  4GFO A;  4DFX E;  3FI8 A;  2HY0 A;  4DBX A;  4YUQ A;  3BKB A;  2ERZ E;  4IAD A;  3R1N A;  3WF5 A;  3VW8 A;  3ACK A;  1JAM A;  3TV7 A;  1RE8 A;  2NPQ A;  5GZ9 A;  3KUL A;  3MPT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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