5L97A

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with 3-amino-2-methylpyridine derivative 3
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Derivatives of 3-Amino-2-methylpyridine as BAZ2B Bromodomain Ligands: In Silico Discovery and in Crystallo Validation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5l97A00
2N9GA 5TCMA 4QUTA 4YATA 4NRCA 4QEUA 4N4GA 4TU4A 5D3NA 5L8TA 4TZ2A 2H60A 4QSUA 5E7DA 3S91A 5HFQA 4LC2A 5AMEA 2LSPB 5CFWA 5A5OA 4MEQA 4QR5A 3UVXA 4TYLA 4CL9A 3P5OA 4NYXA 5LJ2A 4IR3A 4UYHA 5FFYA 5LKZA 3O37A 5F25A 5FH6A 4TTEA 5EICA 2L85A 5I7XA 3ONIA 4O78A 4A9FA 5HJCA 4NS5A 5HFRA 5F36A 5AMFA 4CFLA 3U5LA 4LZ2A 5EQ1A 2RNXA 5EWWA 2FSAA 5LKUA 5H85A 3Q2EA 1X0JA 5ETDA 4LZRA 4HBXA 5DKDA 4YAXA 5EISA 4NYWA 5CUGA 5C87A 5G4SA 5KTUA 5D25A 5A5NA 3HMFA 4UYDA 5I88A 2L84A 4A9EA 5D3RA 5HRWA 3U5JA 5H1VA 5FE2A 4F3IA 5LKTA 5FE7A 2DWWA 3UW9A 4UYFA 4NR8A 5K29A 4YC9A 4Q0NA 4NXJA 4ZQLA 4QB3A 5I83A 3QZTA 2YEMA 3UV4A 5IGNA 4QBMA 2I8NA 3O34A 2E7OA 5FB1A 5E3DA 2RI7A 5CQ6A 5DYXA 4PTBA 5FFWA 4A9OA 4HXRA 2DVSA 1JSPB 4XYAA 1ZS5A 4NUCA 4TU6A 4UIZA 5F60A 2DVVA 2G4AA 2D9EA 3SVHA 4ALHA 4UIUA 4MR4A 4N4FA 3O33A 2RFJA 4TT6A 2RO1A 5CU8A 4A9LA 4NR4A 5ENCA 4UYEA 3P1FA 3G0JA 5I29A 4RVRA 4OGIA 4CURA 5D3TA 2OO1A 5EA1A 4QSPA 5EV9A 4HXSA 3Q2FA 3NXBA 5E3GA 4YYJA 4QSSA 4ZC9A 4BJXA 5L96A 5D3SA 3MQMA 2R0VA 4NR6A 5L97A 5F63A 5E0RA 5I86A 1N72A 5CTLA 2OSSA 5EWHA 5JI8A 2E3KA 5LVQA 4QSWA 4LR6A 5EK9A 4PKLA 5A5QA 2MJVB 4Z6HA 5E73A 4IOQA 4Y03A 4BHWA 2RNWA 4XY9A 5FE4A 4LYWA 5EPRA 4YY4A 4NYVA 3UVWA 5DBMA 5FG4A 3QZVA 5CUDA 5CQ3A 5D3HA 5F61A 4WIVA 3DAIA 4MEPA 5EVAA 5JWMA 5D3LA 5HQ6A 5BT5A 5CQ8A 4UYFB 4IR4A 3SVFA 5H1TA 5CQAA 3IU5A 4Z1SA 5ENJA 3LQIA 4YYKA 4NRBA 3DWYA 4O7CA 3AQAA 4O70A 4YK0A 5F5ZA 4O7FA 4BW2A 4BW4A 5DYUA 5BT4A 4CUPA 3GG3A 5F1HA 4TT2A 5DKCA 5L99A 5EGUA 4IORA 5D26A 5G4RA 4CFKA 5CRMA 4QYDA 3LQJA 5KTXA 4UIYA 5D3PA 4YYHA 3U5OA 4CUQA 5I1QA 4J0SA 5KTWA 3UVDA 5I40A 5CQ7A 5DY7A 2D82A 5ENHA 5LJ1A 3MUKA 4QZSA 3MB4A 5FE8A 3U5KA 2YDWA 4GPJA 4QYLA 4PS5A 5CQTA 4KCXA 4O7EA 5FFVA 5HEMA 5EPSA 4BW3A 5CZGA 4NR5A 1JM4B 5IGLA 4O72A 5A5RA 2DVQA 5CGPA 5HRXA 5CP5A 2DVRA 5FG5A 5DW2A 5E9YA 4HBVA 5DW1A 4NUDA 5DYAA 2DKWA 5EU1A 5ENBA 5FE1A 2YW5A 4TT4A 5CQ4A 1EQFA 5BT3A 4BW1A 5CUBA 5CUCA 4QEWA 3S92A 4MR3A 5D24A 4A9JA 4YBMA 5ACYA 3AADA 3P1CA 4TZ8A 2DATA 5C4QA 4NUEA 4CUUA 5FH7A 4YH3A 4QSXA 5DFBA 1E6IA 5DFCA 4YY6A 4KV4A 4WHWA 5I80A 5AD3A 3O36A 4UITA 4QSQA 4A9MA 2F6NA 3UV5A 2RS9B 4FLPA 1WUMA 4YABA 4O7AA 4NQMA 5CQ5A 4OUFA 5II2A 3U5NA 4MEOA 4N4HA 5ENEA 4OGJA 3FKMX 5HCLA 4O7BA 2R0SA 4ZW1A 4YBTA 5L98A 2YELA 5C8GA 4TS8A 5II1A 3JVJA 2NXBA 4NRAA 2L5EA 5FH8A 4NR7A 4HXMA 4O71A 5EWCA 4QUUA 5E9LA 5C7NA 5IGKA 4LYIA 5IIDA 4HXNA 5ETBA 5A83A 5DKHA 4CUTA 3TLPA 4YADA 4A9HA 5DYCA 3ZYUA 3HMEA 5FB0A 5A5PA 3U5MA 5A82A 4UIXA 3RCWA 3QZSA 5EP7A 4LDFA 4CUSA 4N3WA 4YYIA 5DLXA 5I89A 4CLBA 4IOOA 3IU6A 4XY8A 4QEVA 2E7NA 5FBXA 5KHMA 3LQHA 2R0YA 5LVRA 4PY6A 4Z6IA 3K2JA 5D0CA 5E9MA 4YYMA 5A81A 5E74A 4QSRA 4WHUA 3LJWA 4QY4A 5CUAA 2YQDA 5IBNA 4PCEA 2KTBB 5IGMA 5FE9A 5HLSA 4KV1A 5FE5A 3P1EA 4C67A 3D7CA 5CS8A 4N4IA 5AD2A 5CY9A 3G0LA 5KU3A 4TQNA 5FDZA 4X2IA 4YYNA 4J1PA 4HXLA 2F6JA 5TB6A 3I3JA 2WP1A 4YYDA 5HQ5A 4QNSA 5DX4A 5HELA 5HM0A 4HXKA 4O76A 5L8UA 4XUBA 2RNYA 5E9IA 5FE3A 5FE6A 5J0DA 4IR6A 2OUOA 2GRCA 5LJ0A 3UV2A 4QC1A 5E9VA 5FG6A 4QR4A 5EPBA 4J3IA 3U5PA 2YYNA 3UVYA 3O35A 3P1DA 4QC3A 4C66A 5D7XA 4LZSA 5F2PA 4UIWA 3JVKA 5EWVA 4LYSA 4MR6A 3JVMA 5I7YA 4O74A 5A85A 3LXJA 5FE0A 3SVGA 4YH4A 5DFDA 4IR5A 5ENFA 5ENGA 5H1UA 5F1LA 3MB3A 4HXOA 5EI4A 4AKNA 2I7KA 4HXPA 4E96A 4DONA 5E9KA 4MR5A 4QR3A 5A7CA 5EM3A 5HRVA 4LRGA 4PCIA 4Z1QA 4O75A 4UIVA 2R10A 4ALGA 4HBWA 5LKXA 5IG6A 5DLZA 5HQ7A 1F68A 5ENIA 5C85A 4NR9A 4A9IA 5EWDA 5D3JA 4QSVA 5CRZA 4MENA 1WUGA 3MULA 4XUAA 5HENA 4QSTA 4A9NA 4HBYA 4A9KA 5A5SA 3JVLA 4O77A 5F3AA 5LUUA 5C89A 3MXFA 4Q0OA 5CPEA 4J0RA 4Z93A 4UYGA 5CUEA 4YYGA 5COIA 2WP2A 3HMHA 5F62A 5KO4A 2YEKA 4NQNA 4YBSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2N9GA 5TCMA 4QUTA 4YATA 4NRCA 4QEUA 4N4GA 4TU4A 5D3NA 5L8TA 4TZ2A 2H60A 4QSUA 5E7DA 3S91A 5HFQA 4LC2A 5AMEA 2LSPB 5CFWA 5A5OA 4MEQA 4QR5A 3UVXA 4TYLA 4CL9A 3P5OA 4NYXA 5LJ2A 4IR3A 4UYHA 5FFYA 5LKZA 3O37A 5F25A 5FH6A 4TTEA 5EICA 2L85A 5I7XA 3ONIA 4O78A 4A9FA 5HJCA 4NS5A 5HFRA 5F36A 5AMFA 1PUOA 4CFLA 3U5LA 4LZ2A 5EQ1A 2RNXA 5EWWA 2FSAA 5LKUA 5H85A 3Q2EA 1X0JA 4AKHA 5ETDA 4LZRA 4HBXA 5DKDA 4YAXA 5EISA 4NYWA 5CUGA 5C87A 5G4SA 5KTUA 5D25A 5A5NA 3HMFA 4UYDA 5I88A 4AKGA 2L84A 4A9EA 5D3RA 5HRWA 3U5JA 5H1VA 5FE2A 4F3IA 5LKTA 5FE7A 2DWWA 3UW9A 4UYFA 4NR8A 5K29A 4YC9A 4Q0NA 4NXJA 4ZQLA 3D1DA 4QB3A 5I83A 3QZTA 2YEMA 3UV4A 5IGNA 4QBMA 2I8NA 3O34A 2E7OA 5FB1A 5E3DA 2RI7A 5CQ6A 5DYXA 4PTBA 5FFWA 4A9OA 4HXRA 2DVSA 1JSPB 4XYAA 1ZS5A 4NUCA 4TU6A 4UIZA 5F60A 2DVVA 2G4AA 2D9EA 3SVHA 4ALHA 4UIUA 4MR4A 4N4FA 3O33A 2RFJA 4TT6A 2RO1A 5CU8A 4A9LA 4NR4A 5ENCA 4UYEA 3P1FA 3G0JA 5I29A 4RVRA 4OGIA 4CURA 5D3TA 2OO1A 5EA1A 4QSPA 5EV9A 4HXSA 3Q2FA 3NXBA 5E3GA 4YYJA 4QSSA 4ZC9A 4BJXA 5L96A 5D3SA 3MQMA 2R0VA 4NR6A 5L97A 5F63A 5E0RA 5I86A 1N72A 5CTLA 2OSSA 5EWHA 5JI8A 2E3KA 5LVQA 4QSWA 4LR6A 5EK9A 4PKLA 5A5QA 2MJVB 4Z6HA 5E73A 4IOQA 2EJNA 4Y03A 4BHWA 2RNWA 4XY9A 5FE4A 4LYWA 5EPRA 4YY4A 4NYVA 3UVWA 5DBMA 5FG4A 3QZVA 5CUDA 5CQ3A 5D3HA 5F61A 4WIVA 3DAIA 4MEPA 5EVAA 5JWMA 5D3LA 5HQ6A 5BT5A 5CQ8A 4UYFB 4IR4A 3SVFA 5H1TA 5CQAA 3IU5A 4Z1SA 5ENJA 3LQIA 4YYKA 4NRBA 3DWYA 4O7CA 3AQAA 4O70A 4YK0A 5F5ZA 4O7FA 4BW2A 4BW4A 5DYUA 1ZKRA 5BT4A 4CUPA 3GG3A 5F1HA 4TT2A 5DKCA 5L99A 5EGUA 4IORA 5D26A 5G4RA 4CFKA 5CRMA 4QYDA 3LQJA 5KTXA 4UIYA 5D3PA 4YYHA 3U5OA 4CUQA 5I1QA 4J0SA 5KTWA 3UVDA 5I40A 5CQ7A 5DY7A 2D82A 5ENHA 5LJ1A 3MUKA 4QZSA 3MB4A 5FE8A 3U5KA 2YDWA 4GPJA 4QYLA 4PS5A 5CQTA 4KCXA 4O7EA 5FFVA 5HEMA 5EPSA 4BW3A 5CZGA 4NR5A 1JM4B 5IGLA 4O72A 5A5RA 2DVQA 5CGPA 5HRXA 5CP5A 2DVRA 5FG5A 5DW2A 5E9YA 4HBVA 5DW1A 4NUDA 5DYAA 2DKWA 5EU1A 5ENBA 5FE1A 2YW5A 4TT4A 5CQ4A 1EQFA 5BT3A 4BW1A 5CUBA 5CUCA 4QEWA 3S92A 4MR3A 5D24A 4A9JA 4YBMA 5ACYA 3AADA 3P1CA 4TZ8A 2DATA 5C4QA 4NUEA 4CUUA 5FH7A 4YH3A 4QSXA 5DFBA 1E6IA 5DFCA 4YY6A 4KV4A 4WHWA 5I80A 5AD3A 3O36A 4UITA 4QSQA 4A9MA 2F6NA 3UV5A 2RS9B 4FLPA 1WUMA 4YABA 4O7AA 4NQMA 5CQ5A 4OUFA 5II2A 3U5NA 4MEOA 4N4HA 5ENEA 4OGJA 3FKMX 5HCLA 4O7BA 2R0SA 4ZW1A 4YBTA 5L98A 2YELA 5C8GA 4TS8A 5II1A 3JVJA 2NXBA 4NRAA 2L5EA 5FH8A 4NR7A 4HXMA 4O71A 5EWCA 4QUUA 5E9LA 5C7NA 5IGKA 4LYIA 5IIDA 4HXNA 5ETBA 5A83A 5DKHA 4CUTA 3TLPA 4YADA 4A9HA 5DYCA 3ZYUA 3HMEA 5FB0A 5A5PA 3U5MA 5A82A 4UIXA 3VKHA 3RCWA 3QZSA 5EP7A 4LDFA 4CUSA 4N3WA 4YYIA 5DLXA 5I89A 4CLBA 4IOOA 3IU6A 4XY8A 4QEVA 2E7NA 5FBXA 5KHMA 3LQHA 2R0YA 5LVRA 4PY6A 4Z6IA 3K2JA 5D0CA 5E9MA 4YYMA 5A81A 5E74A 4QSRA 4WHUA 3LJWA 4QY4A 5CUAA 2YQDA 5IBNA 4PCEA 2KTBB 5IGMA 5FE9A 5HLSA 4KV1A 5FE5A 3P1EA 4C67A 3D7CA 5CS8A 4N4IA 5AD2A 4AKIA 5CY9A 3G0LA 5KU3A 4TQNA 5FDZA 4X2IA 4YYNA 4J1PA 4HXLA 2F6JA 5TB6A 3VKGA 3I3JA 2WP1A 4YYDA 5HQ5A 4QNSA 5DX4A 5HELA 5HM0A 4HXKA 4O76A 5L8UA 4XUBA 2RNYA 5E9IA 5FE3A 5FE6A 5J0DA 4IR6A 2OUOA 2GRCA 5LJ0A 3UV2A 4QC1A 5E9VA 5FG6A 4QR4A 5EPBA 4J3IA 3U5PA 2YYNA 3UVYA 3O35A 3P1DA 4QC3A 4C66A 5D7XA 4LZSA 5F2PA 4UIWA 3ERRA 3JVKA 5EWVA 4LYSA 4MR6A 3JVMA 5I7YA 4O74A 5A85A 3LXJA 5FE0A 3SVGA 4YH4A 5DFDA 4IR5A 5ENFA 5ENGA 5H1UA 5F1LA 3MB3A 4HXOA 5EI4A 4AKNA 2I7KA 4HXPA 4E96A 4DONA 5E9KA 3D1BA 4MR5A 4QR3A 5A7CA 5EM3A 4AI6A 5HRVA 4LRGA 4PCIA 4Z1QA 4O75A 4UIVA 2R10A 4ALGA 4HBWA 5LKXA 5IG6A 5DLZA 5HQ7A 1F68A 5ENIA 5C85A 4NR9A 4A9IA 5EWDA 5D3JA 4QSVA 5CRZA 4MENA 1WUGA 3MULA 4XUAA 5HENA 4QSTA 4A9NA 4HBYA 4A9KA 5A5SA 3JVLA 4O77A 5F3AA 5LUUA 5C89A 3MXFA 4Q0OA 5CPEA 4J0RA 4Z93A 4UYGA 5CUEA 4YYGA 5COIA 2WP2A 3HMHA 5F62A 5KO4A 2YEKA 4NQNA 4YBSA
chains in the Genus database with same CATH topology
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