5LY3A

P. calidifontis crenactin in complex with arcadin-2 c-terminal peptide
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
427
structure length
427
Chain Sequence
ISDAYRLKYTFGVDFGTSYVKYGPITLNEPKMVQTRGLFLRDLPESVKMRIPPDVLARGLVVGDEEVRKYLSSVRDVQRNLKYPLKDGVARRDDEEAWRVLKELARYTLAQFPVSDPEFAGWLVAVALSALAPDYMYKAIFDIYDELASEFKIYAVTILPQPLAVAIAENAVNCVIVEGGHGNIQVAPISFALIREGLVALNRGGAEANAITREILKDIGYSDIAREEYAVEVVKRAVGLVPRRLKEAIRAAKSDPDRFVTKVRLSPVVEVEIPREYAWTRFLIGEIVFDPNHEEIKSYIEQSRLRIENAVIGDVTLYGEMDVASAIITSLRNVSVEIQERVASQIILSGGAFSWRVPPGMEDVAADSVTRVKIALEEKSPALASKVEVRLVSEPQYSVWRGAVIYGYALPLSLEWSDTTREGWRFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin/actin family protein
publication title Crenactin forms actin-like double helical filaments regulated by arcadin-2.
pubmed doi rcsb
source organism Pyrobaculum calidifontis
total genus 139
structure length 427
sequence length 427
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A01
3.30.420.570 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ly3A02
2HF4A 4A2AA 1KAYA 4BQZA 3WEEB 4DB3A 1NM1A 4H0PA 1QQNA 2I7NA 2UYTA 3ATUA 2F9TA 4CD3A 2FSKA 4K25A 2AP1A 3EN9A 5AQXA 1T6DA 3RSEB 3HM8A 4IWVA 3VEZA 5BPMA 3GE1A 3ZEUA 3ZETA 4FWSA 1GLDG 2Q97A 5E26A 1WUAA 3BUZB 3QBWA 4AM6A 3UKRB 4MO4A 2VCPA 3CIPA 3VETA 3FZKA 4PL7A 4FPBA 2A42A 4FWNA 3MCPA 4FO0A 1KAXA 2CGJA 1H1VA 2ASOA 2GWKA 2ZGZA 1NWKA 3D2FA 4BRLA 5CE3A 4QS9A 4DQ8A 3DXMA 5LJWA 1ATNA 3QDKA 1U2VB 3JS6A 3O80A 4O5FA 3QBXA 5FPNA 3UE5A 2A3ZA 2HOEA 4IJAA 3U8XA 3W3DA 1BDGA 5AQOA 3LDNA 4BRDA 5BRDA 4PKGA 5F2RA 2I7PA 3TPQA 3QB0A 1NLVA 4BC5A 4B1UB 4BVPA 1DGKN 5AR0A 2VYPA 3AAPA 4BRPA 4CJ7A 5AQSA 2P9PA 3B8AX 3H45C 3VESA 3J8AA 2Q36A 3R9PA 3MK6A 4GNIA 4XH5A 3BEXA 3VEVA 4I6MB 4BRIA 3QICA 1WOQA 1X3MA 2GEMA 3OHRA 3AAQA 4CZKA 4JNEA 4A2BA 1D4XA 3GOIA 3LM9A 2W41A 5LJVA 3QMLA 1SAZA 4FWQA 4BRQA 1E4GT 3FZMA 5AQZA 5ADXH 1KAZA 5ADXA 2ZF5O 3ZX3A 3IMXA 5AZJA 3W0LA 2D4WA 3VGLA 4FWLA 3L6QA 4BRMA 1IJJA 4MO5A 1YUWA 3WXIA 3R8EA 1JCGA 2P9IB 4FPAA 2P9IA 4RCHA 3EL2A 4BRHA 3ENOA 4H5NA 4JHDA 4FWMA 2GUPA 2CGLA 1GLJO 3BF1A 4YDUA 3D2EB 3O1WA 4B1VA 5EX5A 3D2EA 3GBTA 3VERA 3CJAA 4IO8A 4BC2A 2E8AA 2ASPA 3KVGA 1MA9B 1DEJA 3AY9A 4CI6A 5AQKA 1GLBG 2F9WA 1P8ZA 1Y64A 5AQUA 5JLFA 2P9KB 2IIRA 4HTLA 3IDHA 3IFRA 1RGIA 2GWJA 3C7NB 3UKUB 4JN4A 4M7XA 4LC9B 2H3GX 1BA0A 4BRGA 1HKGA 1TYQB 2YJFA 4B1WB 5FPEA 3BP8A 1GLAG 5FPMA 3DJCA 5JLHA 1YAGA 1BU6O 2D0PA 2BUPA 2V7ZA 4JAXA 3ZX0A 1HKBA 5BRFA 2QWMA 3H46O 1XQSC 5AQPA 5BRHA 2QWNA 3VGMA 4XH4A 4CD1A 2BTFA 1ESVA 3MMVA 2NLXA 5FPDA 3FFKB 3WEEA 5BN8A 1Q18A 5AQNA 5KPTA 4CBUA 1ZXOA 4DHYA 3M1FA 2Q1NA 5EY4A 3RSEA 1NMDA 3G25A 4BROA 5AQMA 2P9LB 2YHWA 2FXUA 1LOTB 3HSCA 2A41A 3WXKA 5I9EB 2P9UB 1ZC6A 4BRKA 4MLHA 5TKYA 3UKRA 4H5TA 2V51B 4AM7A 4FWRA 2WUSA 3EO3A 3BF3A 3M3ZA 4BGAA 5AFUH 4DCHA 4BRCA 5AFUA 3QFPA 4BR9A 1RDWX 1GLFO 3SMSA 4BR7A 3DXKB 2QXLA 4H0TB 4B1YB 5JMVA 3A8YA 2ASMA 3ATVA 5KQ8A 2P9SB 3VF4A 1U2VA 1J6ZA 2ZWHA 1HLUA 3IUCA 1V4SA 2E2QA 4PKIA 4YDUC 3LDPA 2D1KA 1KXPA 3VENA 5EXWA 4QS8A 1HUXA 4CZGA 3DWLA 1Z6RA 4FWKA 4ISGA 4BR4A 4EFHA 4BREA 2YJEA 3O1BA 5AQLA 4FWPA 2A5XA 1NGGA 5JICA 4EAHD 1ZBSA 4H03B 3CJBA 2FSJA 4FOIA 4Y0WA 1QQMA 1TUYA 3EZWA 3VEXA 1XC3A 2E2PA 3AARA 1NBWA 3CQXA 3MN9A 4I6MA 2IVOA 2YI1A 3FGUA 4K43A 4WYBA 5AQFA 1BWFO 2FSNA 3O8MA 1S22A 2KHOA 5AQYA 5KPZA 4IJNA 4A61A 3M6GA 3KHYA 3QFUA 2GTDA 4L3QA 5KQDA 3LL3A 5AQGA 1T6CA 3A5OC 4O8KA 4BQLA 4FSVA 4B9QA 2YHXA 1K8KB 2D0OA 3MN7A 2YCHA 4M63C 1X3NA 2V7YA 1LCUA 3VOVA 5BR9A 4RTFD 1BOTO 2E1YA 2Q2RA 5AQQA 4PKHA 4CZFA 3JXUA 2E88A 2J4RA 2Q0UA 2OANA 3SLCA 5LY3A 4BVOA 5AQTA 5BPNA 5AQVA 4BRNA 1RFQA 3HBTA 5AQIA 3FZLA 3A0IX 3O6WA 4BRFA 4PL8A 3ULEB 3U9DA 1NGBA 3F9MA 4BG8A 2FF3B 2P9KA 2E1ZA 5E84A 3C7NA 2DPNA 1ATSA 3UKUA 4H5VA 1EQYA 1G99A 3HTVA 3H3OB 1TYQA 3MN6A 1DKGD 3VGKA 4BR5A 3O4WA 1C0GA 3MDQA 4CZJA 2NRHA 3SK3A 4CZLA 2A6AA 4HWIA 4QS7A 4BRAA 3H1VX 1MWMA 2HF3A 4CZMA 3WQTA 1U6ZA 3I8BA 2FLOA 3CERA 4Z94A 1HJOA 3WXLA 3O08A 5AZIB 4BR2A 3H3NO 1XUPO 2QWQA 2Q0RA 1QZ6A 2PBDA 5EVZA 1QQOA 4CZIA 4IZ9A 3WXJA 3MN5A 3CJ9A 5AQJA 4JD2B 3U4LA 3WUHA 2P9LA 2VWBA 4CBXA 4NB4A 3CQYA 1T44A 3O5BA 5BPLA 4C23A 2CH5A 3H6EA 3ID8A 2P9UA 4H5RA 1R59O 3ENHA 1HX1A 3EKSA 4FWOA 4H0YB 2P9NB 4K42A 1YXQA 2P9NA 3A5MC 3FZFA 4H5WA 1JCEA 2QW9A 5BREA 2IVNA 3VF6A 3VEWA 1MWKA 3EKUA 2AA4A 3DXKA 3UB5A 3ZETB 3ZEUB 4EHUA 1NGHA 2P9SA 3U9ZA 1JCFA 2FF6A 1SZ2A 1GLEG 1NGIA 4J8FA 3HZ6A 1HPMA 3ZX2A 4E1JA 4K41A 5BN9A 1OKJA 4RWTA 5F0XA 1S3XA 4WQ5A 1QZ5A 1BO5O 3D2FB 2NZTA 4CZEA 1NGFA 4GY2B 3DXMB 3C0BA 3A5LC 4ISFA 2CGKA 2QM1A 4B1ZA 4BC4A 4KBOA 1NGJA 1GLCG 2EWSA 1YVNA 1X9JA 4CBWA 3H1QA 4H0OA 2PAVA 3FLCO 4F9OA 4WQ4A 3VPZA 3VEOA 3P4IA 1QHAA 5EOYA 2QWRA 3LM2A 1NGEA 1IG8A 3R6MA 3CETA 2E2OA 3CJ1A 3GG4A 2P9PB 5B8HA 3WT0A 4XH1A 3VEYA 4MLEA 3CJCA 1K8KA 3FZHA 4IXCA 1E4FT 4BG9A 1C0FA 2QWPA 3I33A 1V4TA 2QWLA 3CI5A 1NGCA 2A40A 4EHTA 3WQUA 1NGAA 1NGDA 1BG3A 3HI0A 3DAWA 3LDOA 5AQRA 2HMPA 4H0VB 1CZAN 5AQHA 4EIAA 5F1XA 1SQKA 5AZJB 2YHYA 2ZGYA 4BC3A 4BR0A 2GELA 1Z05A 2E20A 2QWOA 3ULEA 3LDQA 4CZHA 2E2NA 3CHWA 4ISEA 2ITMA 3SJHA 4B1XB 4JHDB 5AQWA 3VF2A 1BA1A 1GLLO 2IVPA 2Q31A 3KZBA 3L0QA 2W40A 4BGBA 3SMPA 1BUPA 4M7YA 1MDUB 4XEIA 5KPRA 3TU5A 5ELZA 3S41A 4WQ5C 4A62A 3GL1A 3L4IA 3FR0A 3CJ7A 3D7EO 4FOEA 3GDQA 1ATRA 1TUUA 4H0XB 4FL9A 5AZIA 4NO7A 3FE1A 3A5NC 4WQ4C 1HKCA 3LDLA 4JD2A 2CH6A 2V52B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CY4A 3TARA 1NK7A 4CIFA 4A2AA 1KAYA 4CF1A 2ZJRL 1NM1A 4IOAL 3ATUA 4F2SA 3OVNA 2F9TA 1UA0A 4C8NA 3EN9A 3RSEB 1TKDA 1RT7A 3HM8A 4IWVA 3VEZA 4KHWA 1T3VA 3GE1A 2YNHA 4DQQA 3ZETA 1A5VA 3EEQA 3CXCM 2XY7A 4MO4A 2VCPA 3TAGA 1KLNA 2KTQA 4FLTA 2YHBA 2LSNA 2A42A 5FRNA 2CGJA 4CHYA 1H1VA 2GWKA 3VQAA 3D2FA 5CE3A 1U45A 4KHQA 4RW4A 4QS9A 5CZ2A 2VGNA 3QDKA 1HNWK 1RDBA 4AHVA 3M8PA 5FPNA 1KD1O 2A3ZA 2HOEA 3BZCA 4IJAA 4LFBK 1BDGA 5AQOA 3BGRA 3OBYA 3DLGA 3LDNA 4BRDA 4E0DA 4PKGA 3G71N 1B92A 5HOOA 2FBVA 1L5UA 3P83D 4LSLA 4DSJA 1NK9A 1RILA 3VESA 2Q36A 2ATQA 4GNIA 3VEVA 2GBZA 4I6MB 3QICA 4M3ZA 4Z4FA 1ZBIA 1X3MA 3OHRA 4A2BA 4LD0A 2X78A 2W41A 3LWLA 2HHWA 4BDPA 5BR8K 4BRQA 3KD5E 2YKNA 5ADXA 2ZF5O 1XMQK 3SBGA 3IMXA 1RTHA 3W0LA 4XIUA 3AO2A 3Q7BA 1HMVA 3VGLA 4FWLA 1O1WA 4O0JA 3R8EA 4FPAA 4CJRA 3ENOA 3KWGA 1QVFM 4NYNA 3V1RA 2BE2A 5EX5A 3BDPA 3GBTA 3VERA 3CJAA 2JGUA 3O3HA 4Y1CA 3S3OA 2ASPA 1TL1A 3H08A 4HVJA 5GAHP 5AQKA 4DTNA 1GLBG 3KLIA 2F9WA 1P8ZA 1Y64A 3K0SA 1VQON 4F4KA 1N33K 4HTLA 3AVMA 4FJKA 5HRSA 1VQ8N 4M7XA 4JI0K 1RBVA 2YJFA 4B1WB 3OTOK 3I0SA 5JLHA 1BU6O 2BUPA 4JYAK 4AILC 2QWMA 2ZD1A 3AVIA 5AQPA 5BRHA 3E9OA 3KKRA 1ESVA 3AA4A 4Z4CA 3C94A 4DMNA 5FPDA 3FFKB 5BN8A 4MDBA 1IKXA 4KO0A 1IBLK 2QKKA 3P39A 1HYZA 4LSNA 3U3GA 1ZXOA 2Q1NA 5SZTA 3RSEA 1NMDA 2P9LB 2YHWA 1NK6A 1JXEA 5I9EB 2P9UB 1ZC6A 3HVTA 3K5OA 2HSTA 5HROA 4AM7A 3WXMB 1YVUA 4B3RK 3EO3A 4DCHA 4DKWA 3MCAB 1SL2A 2QXLA 4GMJB 4DV7K 4A5AA 3A8YA 2ASMA 2FBTA 3DI6A 1OH6A 2P9SB 4LF6K 3VTIA 3IUCA 2ZWHA 4CJVA 4FJ7A 3QESA 2E2QA 1QSSA 4OKKA 3CFRA 4HHTA 3CF5L 1L3SA 3QO9A 4CHOA 3KLFA 4CZGA 4ISGA 4BR4A 3DRSA 2YJEA 4X66K 2KW4A 4E7HA 4ZHRA 3VQ5A 2A5XA 1N8RO 3WNEA 2DFFA 3OS1A 2HNYA 3CJBA 2FSJA 4Y0WA 3TAQA 1QQMA 2RPIA 3EZWA 3VN5A 4Z4GA 1XC3A 4DS5A 4YOVA 4I6MA 3OBWA 3FGUA 5AQFA 1IKVA 3O8MA 5AQYA 2KHOA 3ZT0A 3ZSQA 1VQKN 4CF8A 4B3SK 4G1QA 3LL3A 3C95A 3HT3A 1T6CA 1B9DA 1QS4A 3IG1A 4CF9A 2PY5A 2XHBA 3QLHA 1X1PA 1X3NA 2F96A 4AHCA 1Q86O 3S3MA 4CHPA 5I42A 2GX9A 5JS2A 1RCHA 2OCEA 3SAHA 3SLCA 1VSDA 5AQVA 1RFQA 2GUIA 1RBUA 2KFNA 2YNGA 4NCAA 1HYVA 2Z1JA 3F2KA 4EP4A 1WB9A 4KHYA 4DQPA 2D0BA 2DPNA 4EZ6A 4ID5A 4H5VA 2FBYA 3SUPA 1JLBA 1KVAA 1TGOA 1L3UA 2G8IA 3WNGA 4DF4A 3J7AP 5AJ3K 4BACA 2HBKA 3SPYA 2PYJA 3H1VX 4IO9L 2HF3A 3WQTA 4ID1A 5CR4A 1BIZA 3WXLA 2HMIA 2HBMA 4BR2A 1HJRA 2Q3SA 4KH5A 1BISA 1XUPO 2QWQA 4FZXC 2PBDA 4CZIA 4IZ9A 3PO4A 5AQJA 2Z1GA 4JD2B 4I2PA 3U4LA 2P9LA 2VWBA 3WUHA 1NK8A 3O5BA 1T44A 3VQ4A 4HUFA 2CH5A 1EWQA 2P9UA 5J2PA 4FJMA 4GV3A 4OGEA 4K42A 4IFVA 2P9NA 3VQ7A 4YOXA 3HK2A 4K0KK 4RG8A 4H5WA 4OVLA 3C6TA 1BHLA 4CFAA 3VF6A 3BZKA 4H4MA 2PYLA 2HHQA 3UB5A 4KRFA 4DUYK 2P9SA 3J80O 1YF5L 4BDYA 4CEFA 4CEEA 4LFCK 1NGIA 2VWKA 4M3RA 1HPMA 5BN9A 2NRXA 3THXB 1SV5A 1K8AO 4RW8A 3NVMA 4WQ5A 3CYMA 2WTUA 1IH7A 3OYCA 3L3VA 1N5YA 4Z4HA 1JJ2M 3Q7CA 2OPRA 4DV4K 3TABA 1YVNA 4CIGA 4FM2A 1U49A 2HHTA 4F9OA 1M1KO 3SV3A 3CCUN 3VPZA 2HVHA 4JKBA 1RTJA 2QWRA 4C8MA 1NGEA 4IEIA 4B9UA 5C25A 2E2OA 1JLAA 4ELVA 5B8HA 1HR0K 4JKFA 1VSIA 3T1YK 4IXCA 2QWPA 4DR3K 4KHNA 4PHTX 1V4TA 2QWLA 3DLHA 1NGCA 2A40A 4EHTA 4F8RA 4FVUA 3F5TA 3NDKA 4LF5K 2WOMA 2HMPA 4KB0A 1VQ9N 4NXNK 3HPGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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