5MF5A

Pa3825-eal mg-cdg structure
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ASPSSELRRALEANEFIPYYQPLSPGQGGRWIGVEVLMRWRHPREGLIRPDLFIPFAERSGLIVPMTRALMRQVAEDLGGHAGKLEPGFHIGFNISATHCHELALVDDCRELLAAFPPGHITLVLELTERELIESSEVTDRLFDELHALGVKIAIDDFGTGHSSLAYLRKFQVDCLKIDQSFVARIGIDTLSGHILDSIVELSAKLDLDIVAEGVETPEQRDYLAARGVDYLQGYLIGRPMPLESLLSSLTVQEQQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Diguanylate phosphodiesterase
publication title Dimerisation induced formation of the active site and the identification of three metal sites in EAL-phosphodiesterases.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 91
structure length 256
sequence length 256
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00563 EAL EAL domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.450 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel EAL domain 5mf5A00
3GFZA 4AG0A 3U2EA 3GG1A 5MKGA 4FOKA 3GFXA 4FOUA 4LJ3A 4HJFA 4F48A 3S83A 4RNJA 5MKGB 3PJWA 4ES4A 3KZPA 4RNHA 3GFYA 3GG0A 2R6OA 3HV9A 4Q6JA 3SY8A 4Y9PA 5MF5A 5M1TA 3PJXA 4HU4A 2BASA 3PJTA 3PFMA 3TLQA 2W27A 4RNFA 4Y9MA 3HV8A 3N3TA 4FOJA 4RNIA 3PJUA 4F3HA 4Y9NA 4Y8EA 4J40A 4Y9OA 4HU3A 4KIEA 4AFYA 4LYKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OUIA 1QHOA 3CEUA 4O1AA 3M47A 3MWAA 5C70A 3UT0A 3IV3A 1MDLA 1EYEA 1F73A 4UOZA 2WV8A 1L2QA 1QOQA 1TJ1A 3WH8A 3B8SA 5C8BB 1WKYA 1VBRA 1EQCA 3WLOA 3I68A 4Y8FA 3RG6A 4N6EA 4UFHA 3WQPA 3GM8A 3KTCA 4UTLA 3GTIA 2BXVA 4AWTA 2YOCA 3DHUA 1WKFA 3BV7A 3S1XA 2OWWA 1YRRA 2J13A 2WSKA 3CUFA 5FJJA 1W56A 3OHMB 2V2DA 4DVOA 3UJRA 3HMCA 4ECLA 4QDPA 1YDOA 2J66A 1PZ0A 2I5QA 2YCLA 3TTEA 2ACUA 3QOMA 3TSBA 4HCHA 3CIVA 1JPHA 3KE0A 1Q6QA 1TVLA 1VBGA 4OT7A 1F9CA 3K5XA 4GMEA 4K8HA 4ORIA 4JDBA 3IUHA 4IQLA 5T91A 4NNBA 4GD0A 4AC7C 3OLGA 1JDEA 3H55A 4TIMA 3LUTA 3W82A 2CEQA 3BLFA 1SZNA 4DRSA 3SCSA 4PMXA 3W7DA 1T41A 2HWGA 3W25A 4LT9A 3LCLA 3GG0A 2ZBTA 2F61A 4GYJA 3N6HA 1L0PA 1QASA 3N12A 4S3CA 2EKGA 3TSMA 2OLAA 3T55A 3LLDA 4JNYA 2QCMA 4BF5A 4DBSA 3WDQA 1AW1A 1LDCA 3P3BA 1MXGA 4CNTA 2CESA 2PD9A 4X9SA 3OTRA 3SCVA 1FDJA 4PC8A 3AXXA 4C6KA 2VWTA 1LBMA 4NJIA 4RZBA 2VURA 3W0KA 1V3MA 1XUZA 3D47A 3GY1A 3PULA 1GW1A 3MSDA 4M56A 4GE8A 4E6MA 1Q63A 4WX2A 1CCWB 4ZMGA 2F2HA 4W89A 2YXOA 3AS3A 2C8NA 3NQGA 1TPDA 2NXIA 3DC8A 3RR1A 1KLYA 3VIJA 2ZQ0A 3A4WA 2WM1A 3W76A 2NQHA 2VR4A 1E1CB 1TPFA 5BOEA 1K77A 3OG3A 1W3JA 1ITXA 1X6UA 3IJIA 2WSYA 1TPWA 4B5TA 4KBXA 5E6YA 1US3A 3CAKA 5EBAA 2E68A 1NWUA 4RZ6A 1I1XA 5SWUA 2HVOA 3VNMA 5ABTA 2Y7DA 3HO8A 1FWJC 2G3FA 2OWXA 3UJSA 3B9AA 1W2VA 3H2NA 3C8FA 3KTSA 4AX7A 3WFAA 4US6A 3ICJA 2Y85A 3CEPA 2A3HA 1RD5A 3W6MA 1L6SA 1SO4A 2XYLA 4HIBA 2YL8A 3NQCA 5E6ZA 4LALA 1EBGA 1XL9A 3FHQA 4RCXA 3ARRA 3UXLA 3SFKA 5CCZA 4EWND 2ZXDA 3WEZA 4WCJA 1HFBA 5DMYA 4MF4A 3QQWA 1S2UA 3GH7A 4M6QA 1NY1A 4YHEA 2F38A 4IP7A 3MDWA 1EIBA 3SN4A 5AHMA 4AB4A 1J5SA 4A8IA 3K30A 5T26A 3TNBA 1OC5A 2Y7EA 3K46A 3CTTA 3NL2A 4NX0A 1NJJA 4PMJA 5FF7A 1GHRA 2EO7A 4E4FA 1VIWA 1J6OA 4H3DA 4CQAA 3QSRA 2DUAA 4ZQNA 2UY4A 2XGZA 5DN1A 2CLKA 5JBEA 3GHTA 2WC7A 3AMDA 4HOWA 3H12A 4NYUA 4AX6A 3AMGA 1FWAC 2G97A 3ARYA 2RFGA 3WBEA 4MY8A 2FZNA 3CUJA 2YZRA 1A5MC 1VEMA 1TWWA 3S3GA 4NZ5A 3GKAA 3VOJA 3L5MA 3UJ2A 2V30A 4XAFA 3PJUA 4G7FA 1GORA 3CMGA 1DKWA 4QM1A 1Q4WA 4I5XA 4AZBA 1S1PA 3P93A 5E93A 3ZLHA 1VCGA 4ERAA 5A2BA 3BSMA 3NEHA 2PDUA 1XPYA 5EKYA 1UPPA 2CLEA 1VGAA 2V3GA 4M29A 5M2FX 1IEVA 4C1KA 3LCHA 1UWUA 4RZ5A 3LGDA 1J18A 3SR7A 1XP3A 3UESA 1RJQA 4OTKA 3W74A 4QDMA 1BYBA 1K7EA 3UYIA 1DHPA 1X7FA 3PJXA 1KGXA 4I9MA 4NNAA 2YBVA 4MLJA 3F5JA 2OZ3A 3L4UA 4PMRA 5D05A 3O9NA 2ZUUA 2XM1A 1W1TA 3WJXA 5F4SA 5HANA 3IUDA 3C3NA 4XD3A 1FBAA 2YCLB 3HQPA 1K6WA 4YNGA 3G1SA 4HNCA 1FWBC 3W1PA 5IM51 3SJNA 5GJMA 3V35A 3LLFA 3AMKA 5F1VA 3P62A 1X6LA 2ZXAA 1JZ6A 1BVWA 2YL6A 4AD2A 2BY1A 4E2BA 3PPFA 5AZ1A 2W63A 4IX0A 3ABZA 3SY5A 1VR6A 1GQNA 3UZJA 3VKDA 4FNTA 3VX0A 1V0LA 5I77A 2O55A 4HYRA 4WF7A 4PSPA 4PCPA 4UTFA 1BAGA 2EJAA 4H00A 2HNEA 4FXJA 4HJFA 5DLCA 2FMNA 1E6PA 1E9ZB 3PZUA 3M07A 3OQEA 4XUGA 3T0DA 5J8LA 3CU2A 3CZJA 4GXPA 2ZOXA 1GG1A 4H41A 3F2DA 3NWRA 1W0MA 3MQTA 4A21A 2WAGA 3MJMA 3LGGA 2QV4A 4HA1A 1Z69A 5H8PA 4YCPA 1GVSA 3BCDA 3QV7A 4NF7A 1E55A 5FACA 4AD4A 3M4HA 4KWOA 4J3ZA 4XZNX 3E0WA 2V5KA 2YXGA 4PUWA 4WR3A 2FHCA 2QUTA 5XINA 2F6XA 2YW4A 3QRHA 3DECA 4JTQA 3TUUA 1EKOA 3M1ZA 1VB9A 2IQDA 2VXNA 4CGTA 3T4WA 1FWDC 1TJ2A 4AVOA 1OCQA 4ML4A 3XISA 3EA1A 4BA0A 4H9XA 4X3ZA 1IYXA 3FW6A 5T9BG 3GR4A 1E6ZA 3DFNA 5BU9A 4JY9A 3ARSA 4HSOA 2R1NA 3SUWA 1SMDA 4GBUA 3NG3A 1Y7VA 2F2KA 1F3EA 3ITXA 1Q7QA 3GIYA 3M5XA 1DVJA 1J0ZA 4KRUA 4QTGA 5M17A 3URNA 4AH7A 3H23A 5G4EA 3ZXWA 1H7RA 4PL2A 2DZWA 3ABRA 2OKTA 2PDIA 3DZ1A 4Q32A 5CPNA 3TX9A 2P10A 3W1RA 3SO7A 1DXEA 2LLEA 2BASA 4L1XA 3VNKA 3UZ5A 1VLWA 1HP4A 2KAUC 3SQLA 1UA7A 1CXIA 1RPKA 3AHYA 4YTTA 4W84A 3FY1A 3M0KA 3TW6A 3B9OA 3S6TA 1I60A 4GZIA 1AH4A 1JF5A 1FA2A 1W91A 3HGOA 5CPLA 4HK5A 1OFBA 3E9AA 1TMLA 2DY3A 4QQ3A 2Y8UA 3IJ8A 3S6DA 1P0KA 1GYLA 1E6NA 5KZMA 4TQTA 4AD3A 2QR6A 5D2TA 2NX3A 4L1WA 4KT2A 1R86A 1TJRA 1ML1A 5HR6A 1JDAA 1E5NA 2OB3A 3TQ0A 3A4XA 3W7JA 1W3NA 4E0CA 2VRKA 4Z1DA 4OHQA 3WD3A 1EEXA 4JTSA 4NT0A 3UG4A 4UTIA 4IGNA 2WW5A 3DG3A 4DNHA 1UH2A 2WJEA 5EY5A 3P80A 2BY2A 3SZ8A 2EPLX 1BD0A 2E1WA 4DWSD 2QQ6A 9CGTA 1IQ8A 1NOFA 5E70A 4LUTA 3PUEA 1H1YA 1VF8A 2V8ZA 4IL0A 4H9UA 4DJFD 4FLOA 2FB2A 2F84A 4IICA 1IR1A 4O53A 1R5YA 4ML9A 2OTDA 3O16A 1UR4A 1ZY9A 3Q65A 3UBPC 4DHGA 2HTMA 3SUSA 1RVKA 3DFQA 4NAFB 3KCLA 2Y2WA 2BXZA 3GDBA 5LGZA 5EPDA 2XZ9A 4ZO7A 3UERA 1JEZA 3LX9A 2GDVA 3P82A 1UKTA 3DUGA 4HHPA 2YYUA 4HSNA 2OJPA 5L9FA 2B81A 3H4XA 4DWDA 3OBAA 3F4NA 3WK3A 3L4TA 3GH5A 3JU2A 3LOTA 5DO8A 3WH7A 1UWTA 3Q58A 3H54A 3NOEA 1FRBA 5LNWA 1UP0A 5E0CA 3ZFHA 1TPEA 2ZA2A 3TMQA 5CBJA 1TMHA 4KGLA 3L7RA 2DVTA 2PCEA 1FHVA 3GC4A 3S1VA 5G4HC 4F2UA 4JICA 1X1OA 4F0HA 4XX6A 3OA3A 3QR1A 1EHNA 1FHDA 4QJ1A 4HA4A 3BZJA 4U10A 1AL8A 2QJHA 1I0DA 1J96A 2WOQA 3N14A 3KOZA 3MS8A 1XLFA 4U2YA 1NDWA 2ZZ4A 4O54A 4M7SA 3M0MA 4O4VA 1H50A 3NYDA 2CZFA 2YGYA 4PTDA 3UCDA 1MMFA 3PHAA 1TELA 2OSWA 3CAQA 1GOIA 1FWRA 1EH9A 2V68A 3BC9A 3VE7A 4U4MA 4J7RA 4D6JA 1XHGA 2HPIA 4HJWA 2XFRA 3ITOA 4PMVA 3SQMA 9XIMA 3BE7A 3WENA 3FJLA 2A85A 3TQPA 1AH3A 3VCNA 5LXXA 4GC3A 3H4WA 4KCTA 2WQPA 4R27A 4OQVA 1JG9A 3BMXA 3KOYA 2DT2A 1LOLA 3FEMA 1Q85A 3OZPA 2VD8A 3PF3A 1SZFA 2UZ9A 1FH8A 1DJQA 5BW6A 3VYLA 2BP1A 4DF1A 3WD0A 3N34A 4PTMA 4IPPA 3SUTA 5AECA 1A5LC 3S83A 3U8GA 2Y1HA 4KFPA 3W7OA 3VGEA 3RDKA 4DLMA 4JHMA 3SM0A 4L4MA 4HU3A 1AUSL 1KM5A 4ZSTA 1PPIA 2GZXA 2INEA 4U3CA 3VIIA 3WF4A 4Y2WA 3B8DA 4QJ3B 1P7TA 3QPZA 4QS5A 1EBHA 4BWLA 3QGKC 5HUPA 3WFZA 2Z24A 3DIPA 3GVWA 1C9DA 4X2RA 2WHJA 4ICMA 4UNKA 3O6YX 3EMZA 3MI3A 2QZRA 1G67A 2EAWA 4CD6A 3EOOA 2BGSA 2DZXA 3EKZA 1FWWA 1QW7A 4O28A 4IP4A 1W9VA 1TV5A 4XAZA 1N2VA 3CYJA 4MY9A 3R25A 1PS9A 4RW5A 4HYWA 4AZHA 3YPIA 3SN1A 2WZTA 1BFNA 4DF2A 2P8BA 1U1UA 1B57A 3NPUA 2ZC1A 2OQHA 2RDWA 2J7EA 4A3HA 3DCPA 4QGCA 1XQKA 1TREA 1OFQA 4G5DA 3NO1A 2P88A 3G0XA 1EPXA 3SCWA 4Z2GA 4ZE4A 1ZGDA 1XQLA 3KL5A 1RD6A 4QSHA 2CLMA 1G0CA 5EYWA 1OABA 4NI8A 1E1EA 4BHYA 3QOKA 4H9TA 3QW4B 2PCQA 4YYCA 1DXFA 4DO6A 3GFZA 1Q65A 3M0LA 1MDRA 3BCJA 4L5ZA 2PDHA 3W2JA 5FIPA 3GBDA 4E8DA 1GPFA 5CXPA 4N4QA 4AXNA 1UD3A 5MF5A 3CV2A 3KVLA 3VIHA 3MMDA 5BOFA 3MUXA 3OLDA 4W85A 5H6HA 2FHBA 1RBLA 2ZRVA 5FEPA 4FOUA 4JTTA 2E8YA 4LUTB 1N55A 3B0PA 3GZ3A 3VM7A 1OF8A 2B4GA 1LG2A 2RHGA 4NQ1A 3B9EA 3TROA 2RJHA 4QAIA 2Z26A 2Z1XA 5HUOA 2DVXA 1UWQA 1OT1A 3ALGA 1RALA 4QCFA 1BVZA 1UKQA 3HBLA 4AISA 1GOKA 5H2ZA 2PTYA 5H8MA 2CLPA 4H9YA 4ILSA 4L4LA 3EWXA 3W23A 2XM2A 7PTDA 4PFHA 4LTSA 3LQLA 3CB3A 4JYFA 2WBGA 3M6YA 2ATMA 2TRSA 1Z89A 3R0KA 2GGEA 2PDKA 3TNOA 5HMFA 4Q8OA 4AIOA 1HGYA 3NR0A 3OYXA 1UKOA 4RDZA 2VEKA 2QUVA 4NJHA 3VKAA 4ATWA 4U2ZA 4JIHA 3SCTA 1BVNP 2YBUA 1OZQA 1E5JA 1VFSA 3GUWA 3T05A 1RAKA 3E3HA 4R5EA 1FUYA 1JUBA 3LCXA 4Q7NA 4A2RA 4YHGA 1M04A 2GJXA 3HFTA 3AISA 3SIMA 2AKZA 2XIOA 3KLKA 2WB5A 2EEXA 4N7QA 3VDAA 5FF3A 1IXQA 1PVNA 1OADA 2ISWA 1GUVA 2W27A 3POCA 1Y0EA 1C8XA 5CSRA 1S2WA 2RGMA 3O1NA 4KWSA 3W7HA 5MKGA 1RV8A 2FGBA 3QHNA 4J2MA 1UYQA 4QG6A 3PUOA 1ADSA 4FIQA 2EG8A 4UR9A 3KRSA 2ISDA 2XSXA 2HS6A 1O5XA 2ZE3A 3SBFA 4GNJA 4DO7A 3LSBA 2J6VA 3PWGA 4OIFA 2ZRUA 1KO0A 4A4AA 4MB4A 1W5MA 3ARZA 3B04A 2FH8A 1VFMA 1IGSA 3MKVA 3V75A 2VO5A 3C52A 4ZCWA 2VFDA 1RCOB 2P0IA 1KR1A 1R2TA 4KEMA 4B4HA 1I1WA 4DJDD 3MCOA 1H4PA 1GVRA 5EBUA 1OFAA 3MBFA 3UF9A 1ICQA 3QPEA 3ITYA 1TWIA 1H62A 1WDSA 1PYFA 4LEQA 4O14A 1LWIA 4C6PA 3I4EA 5HQEA 1P48A 3BWWA 1M68A 3M41A 1P7TB 2B7PA 4YJ5A 2CXGA 2E9LA 5A8MA 4LCQA 3K4DA 4OBSA 1FP9A 2Y5SA 1V6WA 1OIMA 3CK5A 3WLIA 3WQCA 3CZLA 4TX9A 3TEVA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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