The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLDGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Structure of the Human Hemoglobin Mutant Hb Providence (A-Gly-C:V1M; B,D:V1M,K82D; Ferrous, carbonmonoxy bound)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
58
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-08-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1H97 A; 2LH3 A; 1O1K B; 1J7W A; 1OUT A; 2DXM B; 1EBC A; 1DXD A; 1EMY A; 1SPE A; 5EUI B; 1G0B B; 1YDZ B; 3E5I A; 3ARK A; 2D5Z B; 5SW7 B; 2QSP B; 3M38 A; 1BIJ B; 3LQD A; 4ODC A; 1J41 B; 1Y83 A; 3G4V A; 4WJG 1; 5HY8 A; 1YH9 A; 4XS0 B; 1IBE B; 1LFV B; 1XZU A; 1UX9 A; 3D7O B; 2OH8 A; 5HU6 A; 1Y2Z A; 3VRG B; 2R4X A; 1HGB B; 1YZI A; 1OR4 A; 3ARJ A; 2R1H A; 3EOK B; 2AUQ A; 2VYW A; 1MBC A; 1C7C B; 5D5R A; 3M3B A; 3PI9 A; 5CNG A; 1Y4F A; 3ZJP A; 1YG5 A; 1DWR A; 3MVC A; 1A9W E; 5KER B; 1AJ9 B; 4H07 A; 2GTL D; 2PEG A; 4N7O A; 3EU1 A; 2ZLV A; 3A5A A; 1EWA A; 2FRI X; 1NQP A; 3HEP A; 3ZJL A; 1XQ5 A; 1A3N B; 2BLI A; 1BZZ B; 1GBV B; 3PT7 A; 4PQC A; 1MDN A; 3MJP A; 1MBS A; 2XKI A; 2HZ3 A; 1BAB B; 3PI8 B; 3QMA A; 1BUW A; 3UHN A; 4PNJ A; 2MGF A; 1MLN A; 3E55 A; 1MYM A; 3D4X A; 2HBF A; 2BWH A; 5CN6 A; 3LB4 A; 5E6E B; 2ZFO D; 2GKM A; 1SDK B; 3WTG A; 1SDL A; 5M3S A; 3AQ7 A; 2EVK A; 2CMM A; 1GZX A; 1RPS B; 3PEL B; 3NML A; 3WCU B; 1M6M A; 3K9Z A; 1FSX B; 1T1N B; 1V4X A; 1Y5K A; 2GKN A; 1HSY A; 1LFY A; 1TES A; 3SZK B; 1NPG A; 3PIA A; 2VRY A; 1MOC A; 1CG5 A; 1CQ2 A; 4BJA A; 1CH3 A; 1Y8I B; 5EQM A; 4U8U C; 4HHB A; 5EE4 D; 1VXC A; 1MBN A; 1QXE B; 3QJE A; 5JGG B; 3O7N A; 1Y8H B; 2MYC A; 4F4O A; 1J7S A; 5EYS A; 4DWU A; 3WFW A; 2V1G A; 2MGE A; 1Y0A A; 1QI8 B; 4HRT B; 3W4U A; 1V75 B; 3UHU A; 1RQ4 B; 1VHB A; 3HHB B; 1R1X A; 2EKT A; 3ZJH A; 4G51 A; 1UVY A; 1CBL A; 1RQA A; 1BBB B; 4GZG A; 3WI8 A; 1G09 B; 1VWT B; 1LJW A; 4FWZ A; 3TLD A; 1NEJ A; 1S69 A; 4H2L A; 1C7D B; 2SPN A; 4MBN A; 1A4F A; 3ECZ A; 2G12 A; 2HZ2 A; 2MGK A; 1DO3 A; 1CLS B; 5KDQ A; 2W6V A; 3ED9 A; 1WMU A; 3UHH A; 1F65 A; 1YEQ B; 1J3F A; 1JL7 A; 1ABY B; 2MGD A; 1JF4 A; 1HGA A; 5JOM A; 4MQG B; 3VAU A; 3WR1 A; 3FH9 A; 2ZS0 B; 3EDA A; 2OH9 A; 4U8U B; 4M4A B; 2AA1 B; 1XZ4 A; 1LFT B; 2W72 B; 5HBI A; 1UT0 A; 1OJ6 A; 1HBR B; 1MLU A; 2G0Z A; 3HXN A; 4L7Y A; 2ZSP A; 1DKE B; 1H1X A; 3QJD B; 1G9V A; 2D60 B; 1RVW A; 1J3Z B; 2G0R A; 3QM8 A; 1MLH A; 3S48 C; 5MBN A; 4N8T A; 2QMB A; 5MBA A; 3IXF A; 1Y4B A; 2LH6 A; 3R5I A; 5HLX A; 1HDB B; 4MQH B; 1CG8 B; 1DXU A; 3K8B A; 3OO5 A; 2D2N C; 2LH5 A; 1XY0 B; 1A00 A; 2G14 A; 1BVD A; 1HLB A; 1XZ7 A; 2RAO B; 3VRE A; 2AUP A; 1Y46 B; 3DHT A; 3S65 B; 1FDH A; 1HGC A; 1DO7 A; 1CIK A; 4NXA A; 1V07 A; 4MQI A; 5CN7 A; 2GTL C; 1LFZ B; 2H35 A; 1VRF A; 3OK5 A; 2NSR A; 3UHW A; 3MKB A; 1LFL B; 105M A; 1YE0 B; 4NI1 B; 4IRO B; 3UH7 A; 1YIE B; 1GBU B; 1LH5 A; 3HRW A; 1BVC A; 1DO4 A; 4TYX A; 2IN4 A; 5E83 A; 1Q1F A; 2GTL A; 3LHB A; 3WHM A; 2MBW A; 1MLR A; 3GQR B; 2MB5 A; 1CBM A; 1OBM A; 1HDS A; 4HBI A; 2BMM A; 4IT8 A; 1IOP A; 1JW8 A; 1JF3 A; 1YIH A; 5CHR A; 6HBW B; 1Y85 A; 1OFK A; 106M A; 4TWU A; 1K0Y B; 1DUO A; 1YEO B; 1Y4Q A; 2V1I A; 3UHD A; 4MQC A; 1Y45 A; 1KD2 B; 1Y4V B; 1V4U B; 1JL6 A; 3NL7 A; 1A01 A; 3MJU B; 4L2M A; 2D2N B; 3E5O A; 3UH6 A; 1EW6 A; 1YHR B; 1MNI A; 1QSH B; 1HCO B; 2DN1 A; 1YEV B; 2R4Z A; 2V1E A; 3HYU B; 3SDH A; 3GOU A; 3EDB A; 4X0L A; 3A59 A; 4FC3 A; 5AB8 A; 1Y22 A; 3GQG A; 3IC2 B; 3QJC A; 1S5Y A; 1XZ5 B; 4MAX A; 2SPL A; 2YRS B; 2DHB A; 1RQ3 A; 1TU9 A; 2QLS B; 1JP8 A; 2QFN A; 1Y0C B; 3U3E A; 1O1P B; 1UC3 A; 2MYD A; 1J3Y A; 3DR9 A; 1YOI A; 1YGF A; 1Y8K B; 4G1V A; 1MOA A; 2OIF A; 3QM9 A; 4DWT A; 1SHR A; 2QFK A; 2ZSX A; 1HDA B; 3RGK A; 3DHR B; 5JDO E; 1MYI A; 1GVH A; 3WCT D; 1JZM A; 4YU4 A; 2E2Y A; 3D1A A; 2GDM A; 1YVT B; 2RI4 A; 1NIH B; 4MXL A; 1J40 B; 1GLI A; 4PQB A; 1S0H B; 2ZLU B; 1U7S A; 1THB B; 1YGD A; 3DUT B; 1N9F A; 1MYZ A; 2KSC A; 2DN3 B; 2ZS0 D; 3AT5 B; 1M9P B; 1K1K A; 3HEN A; 1HBB B; 1LHS A; 1Y7C A; 5ILR A; 3UHE A; 1CMY A; 1Y5F A; 3P5Q B; 2O5Q X; 1FDH G; 3GDJ B; 2HZ1 A; 101M A; 5E29 B; 2BLH A; 1XZ2 B; 1UX8 A; 4KMV A; 2IG3 A; 3ARL A; 4O4Z A; 2GRF A; 2AUO A; 1AZI A; 1GCW B; 3WFU A; 3WCV C; 1HAB B; 1QXD B; 1C40 B; 3QQQ A; 1V4W A; 2VLX A; 1YFF B; 1XYE B; 1Y0W B; 1ABW B; 108M A; 1QSI B; 4FH6 A; 2DN2 B; 2B7H A; 3D7O A; 2R4Y A; 1LTW A; 1HGB A; 2R80 A; 3GKT A; 5C6E A; 1NXF A; 3UHI A; 3LR9 A; 3OZV A; 3S1I A; 3IC0 A; 1Y4R A; 6HBI A; 3BOM B; 2HHD A; 1M6C A; 1O1I B; 3AT6 A; 1IWH A; 4UUR A; 3WCW B; 1ECA A; 1OUU A; 1XXT A; 2AUR A; 3UBV A; 1O1N A; 3GLN A; 2D2M B; 4M4B B; 2ZT1 A; 1YOG A; 2ZS1 B; 4G1B A; 2ZLW B; 1BJE A; 2W31 A; 2EB8 A; 1O1M A; 5CHQ A; 1YHU C; 2Z6N B; 3UHS A; 1VXG A; 2VHB A; 1HAC B; 2VLY A; 1J7Y A; 4N7N A; 4F6I A; 2G0V A; 3OZU A; 5E6E A; 5EU2 A; 1YEN B; 1YHU A; 1HHO B; 1SDK A; 1A0Z A; 1XZV B; 2MGM A; 1R1Y A; 1CP0 A; 110M A; 3CY5 B; 1RPS A; 3PEL A; 1FAW B; 4F6D A; 2M6Z A; 3OGB A; 1IRD B; 2GNW A; 1NS9 A; 2HHE A; 1FCS A; 3G4U A; 1O1L B; 1AJH A; 1J7W B; 1OUT B; 4MBA A; 4NXC A; 1IRC A; 2GRZ A; 5F0B A; 1DXV A; 1Y8I A; 3LQD B; 4ODC B; 1Y83 B; 1WLA A; 3BJ3 A; 2EVP A; 3PT8 A; 3K3U A; 1QPW B; 2D6C A; 4WJG A; 1XZU B; 4HRR A; 1O1J A; 5HLQ A; 1A6G A; 1X9F D; 4KN3 A; 1YZI B; 2R1H B; 1MLM A; 1D8U A; 3UH5 A; 3D1K A; 1Y4F B; 4TWV A; 1YG5 B; 1RTE A; 1YCB A; 1X46 A; 3M39 A; 3TM3 A; 2PEG B; 1BZ1 A; 4MQJ A; 4N7O B; 2ZLV B; 1NQP B; 2FAL A; 2NRL A; 3MYN A; 3ZJQ A; 5JDO C; 1VXA A; 1XQ5 B; 1Y0D B; 2G11 A; 2NRM A; 2VEB A; 1UIW A; 2O5T X; 3PT7 B; 4F6J A; 2GLN A; 1L2K A; 3MJP B; 3WCT A; 1W92 A; 4NI0 A; 1BUW B; 2ZLX A; 2EKU A; 2HBF B; 1C7B B; 1Y0T A; 1B86 B; 1DXT B; 2MGI A; 3OZW A; 2EF2 A; 1GDI A; 1SDL B; 3WTG B; 2HHB A; 3UHX A; 3GKV A; 1URY A; 5EOH A; 2VLZ A; 1I3D A; 1GZX B; 2ZS0 A; 1Y8W A; 1SPG A; 5EET A; 4WCH D; 1V4X B; 1Y5K B; 1LUE A; 2H8D A; 1LFY B; 1NWN A; 3UH3 A; 4B3W A; 3MYM A; 3BCQ A; 1HBR A; 3NFE A; 1MBO A; 3HF4 B; 3BJ1 A; 1PMB A; 3VRF A; 3PIA B; 3E4N A; 2MGC A; 3AQ6 A; 1HV4 A; 1Y7D A; 2QU0 B; 2ZWJ A; 4YU3 A; 1O16 A; 1EBT A; 1JEB A; 2V1F A; 3MN0 A; 3QJE B; 1MYJ A; 1HBG A; 2ZT2 A; 2PGH A; 1NZ2 A; 2MYB A; 2R4W A; 4F4O B; 3TM9 A; 4FWX A; 1Y4P A; 3ZHW A; 1BIN A; 4UIQ A; 1Y09 A; 2RAO A; 1Y0A B; 2HBS A; 3UI0 A; 4DC8 A; 3W4U B; 3QZZ A; 3WCW D; 3S66 A; 1HBH A; 5D1V A; 5F2A A; 3UHC A; 2O5M X; 1MBA A; 2QSS A; 2MYA A; 5AZR A; 4G51 B; 1NZ5 A; 3ONZ A; 1LFZ A; 1YHE A; 1ASH A; 1VXH A; 5CND A; 4SDH A; 1ABS A; 1NEJ B; 4H2L B; 3R0G A; 3D17 B; 1ECD A; 1BZ0 B; 4ROM B; 1GBU A; 1MLG A; 1A4F B; 2C0K A; 3ASE A; 1JZL A; 1YEU A; 5KDQ B; 2W6V B; 4AVD A; 1YVQ A; 4OOD A; 3B75 A; 4XDI A; 1FLP A; 3UHY A; 2HBG A; 3RJ6 A; 1GCV A; 3WFT A; 1MOB A; 1BZR A; 1MOH A; 5CNE A; 3WR1 B; 1ECO A; 1DM1 A; 3FH9 B; 3AG0 A; 4NK2 A; 1CH4 A; 1K0Y A; 2VYY A; 1UVX A; 3LB2 A; 1XZ4 B; 5EYJ A; 1A3O A; 2O5L X; 2HBD B; 3ZJI A; 4NZI A; 1SI4 B; 1Z8U B; 1MTI A; 3ORD A; 3ODQ B; 4ZVA A; 5CN9 A; 1UFJ A; 2ZLT A; 2ZSN A; 3HXN B; 3A5G A; 1YHR A; 1Y31 A; 2NSS A; 2ZT3 A; 4NS2 A; 3HEO A; 2VM0 A; 3H58 A; 1HCO A; 1KFR A; 4LPI A; 3HYU A; 2BKM A; 1HBA A; 1RVW B; 3ZH0 A; 1Y7G A; 3UHK A; 1LA6 A; 1NZ4 A; 2ZFO C; 1IT3 A; 1Y7Z A; 2QMB B; 3UHZ A; 3WCU D; 2HCO B; 3R5I B; 4ROL A; 1LH2 A; 1XZ5 A; 1DXU B; 1Y35 A; 2O5B X; 2HBC B; 1CH9 A; 1Y4G A; 3LR7 A; 1A00 B; 1XZ7 B; 3VRE B; 1X9F C; 1F5O A; 3KMF A; 2ZFO A; 1YE2 A; 4VHB A; 2G10 A; 4ILZ A; 1BZP A; 3A0G A; 4N7P B; 1FHJ A; 1Y8K A; 1U7R A; 3WCP B; 2HBE B; 1X9F A; 2H35 B; 1G0A A; 1HDA A; 1MYT A; 2D5X A; 5CNC A; 1WVP A; 2AV3 A; 3GQP A; 1JY7 A; 3QM7 A; 5EE4 C; 1HBS A; 3HRW B; 1MNJ A; 1NIH A; 2O5S X; 5E83 B; 2GTL B; 3WHM B; 3OO4 B; 3IA3 B; 1NS6 A; 3CIU B; 2VYZ A; 1MTK A; 2ZT4 A; 1HDS B; 1MOD A; 1YMA A; 3MBA A; 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1Y5F B; 5KER A; 1AJ9 A; 1J52 A; 1FN3 B; 3HC9 A; 2MHB B; 4ZVB A; 4JYQ A; 1BZ6 A; 5B85 A; 1IT2 A; 2Z6T A; 1A3N A; 1BZZ A; 1GBV A; 1O1L A; 2WTH A; 1BAB A; 3PI8 A; 1V4W B; 1SWM A; 1DUK A; 3WFX A; 2EB9 A; 4NK1 A; 3WCU C; 1CP5 A; 3WCV B; 4O2G A; 1QPW A; 1LH7 A; 2GNV A; 2B7H B; 2D2N D; 5EV5 A; 2R80 B; 3RJN B; 5C6E B; 3IC0 B; 3WCU A; 3BJ2 B; 1FSX A; 1T1N A; 1Y4R B; 1MZ0 A; 2HHD B; 1VXF A; 3SZK A; 3AT6 B; 1IWH B; 1XCH A; 1OUU B; 1XXT B; 4KJT A; 1UFP A; 1O1N B; 2BK9 A; 1CQX A; 1CO9 A; 1Y0D A; 5CN5 A; 1QXE A; 1OR6 A; 5JGG A; 1S6A A; 3LB1 A; 5HY8 B; 1YH9 B; 2FRK X; 1O1M B; 3QZX A; 1Y8H A; 5HU6 B; 3AQ9 A; 1Y2Z B; 1J7Y B; 4N7N B; 2GL3 A; 1C7B A; 1MYG A; 1QI8 A; 1B86 A; 3PI9 B; 1DXT A; 4HRT A; 1YHU B; 1CH2 A; 1A0Z B; 1MLL A; 1V75 A; 1R1Y B; 1RQ4 A; 3HHB A; 3MOU A; 3WCT C; 3EU1 B; 2M6Z B; 4MU5 A; 1BBB A; 3G4Y A; 1VXB A; 1NS9 B; 2HHE B; 1G09 A; 1VWT A; 4AVE A; 4HSX A; 1C7D A; 4KMW A; 3HF4 A; 2ZSS A; 1CLS A; 1DXV B; 2QU0 A; 1YEQ A; 1VXD A; 2ZS0 C; 3D4X B; 1ABY A; 3PI3 A; 3UGZ A; 3UHR A; 3G52 A; 3BJ3 B; 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