5T6KA

Crystal structure of tgcdpk1 from toxoplasma gondii complexed with gw780159x
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
464
structure length
432
Chain Sequence
TAIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEAKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGLDRAELIEGYKELMLDASAVEHEVDQVLDEYSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSTELATIFGVSDVDSETWKSVLSEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
publication title Crystal Structure of CDPK1 from toxoplasma gondii complexed with SGC-1-19
rcsb
source organism Toxoplasma gondii
total genus 140
structure length 432
sequence length 464
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13405 EF-hand_6 EF-hand domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5t6kA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5t6kA01
4FSWA 4F7NA 4OTRA 5AR8A 4GUEA 2RG5A 3EN4A 4YJNA 3VUKA 3MYGA 4EL9A 4DYMA 3F82A 4RJ4A 5CF5A 2XK8A 5CZHA 3R7EA 3R71A 3ZBFA 4FZDB 3P79A 5C03A 3VS1A 2X2LA 3SAYA 1OM1A 4MD8E 3V8SA 2ONLC 4FE2A 3FC1X 5IU2A 3RI1A 4XLIA 4JDIA 4O0YA 3CGOA 1PXLA 2PY3A 5IA0A 3VVHA 2BIKB 2XJ0A 4L7SA 4FKWA 2PK9A 1YXVA 2UW4A 2IW9A 4I20A 3G51A 2JFMA 5K9IA 1VZOA 4X3FC 5JEBA 5C9CA 4O38A 3VUTA 1YWVA 1ATPE 2C6IA 3QKKA 2VTIA 4MD7E 3SC1A 3DZOA 3RM7A 3V3VA 2ETKA 2ZJWA 2G01A 2J5EA 4G3EA 3UQGA 3LLAA 1H00A 2WOTA 4CEGA 5FDXA 4DCEA 2CGVA 4J8NA 4RC4A 3W16A 4RWJA 1YDTE 3FQHA 4C4JA 4FOCA 5L6WL 5E8ZA 2VNYA 5H8GA 1R0PA 3QQFA 2FA2A 4IMYA 2WD1A 3R8ZA 3NCZA 2XK3A 3U9CA 4BBFA 3OXZA 3PWYA 3DA6A 3R9OA 1H8FA 4BCOA 4GL9A 2R3OA 2I40A 4X2JA 4MX9A 3I6WA 4HZSA 4RIYB 4NUSA 3I7BA 3UOLA 3NYNA 2QOCA 3OT8A 4O7NA 3NZ0A 5J7HA 3NAYA 4J7BA 1Q3DA 3IONA 2YCFA 5DT3A 1VR2A 4RFZA 3GP0A 4LGDA 5AV3A 5ETCA 3A99A 2JEDA 4IZAA 3OW3A 5EYMA 4I24A 4DH3A 1YQJA 3W8LA 3B8QA 2QG5A 2IZTA 4D1XA 2VWUA 3U9NA 4FTJA 1H25A 1KOAA 3LE6A 5IQDA 2HAKA 2PVYA 4FV9A 4MYGA 1JLUE 2E9NA 4Q9ZA 2UW5A 3PXQA 4EOIA 2Y6MA 4O0SA 5H2UA 4IIRA 3VUHA 5B7VA 3S00A 4L01A 2QVSE 2Y9QA 1DM2A 5EK7A 4EQCA 2RSVA 4FUYA 4J52A 5DT0A 4IACA 3ZZEA 4ARKA 4LMNA 4TYGA 5A14A 3P08A 4KIQA 2VO7A 1M17A 3ET7A 4FSYA 4CQEA 3MFUA 4Z7HA 4L44A 3ULIA 3QD3A 2REIA 4HZRA 4M66A 4RWIA 3SXSA 3V6RA 1YW2A 4BZOA 4B8LA 4DA5A 5AP6A 3MFRA 3GXLA 3ORXA 4EZ5A 5AUTA 4C7TA 3E7OA 3OWKA 3ATSA 5EM5A 4M69B 4U5JA 3BYVA 2YIYA 3TKIA 3MTFA 4C4EA 3FDNA 5HORA 2VTRA 4FBXA 1LP4A 1CM8A 3SD0A 4G3GA 4M67A 2P55A 3A7JA 4BIEA 4FX3A 1CDKA 2WTDA 3OWJA 2OJ9A 2BZKB 4L8MA 5ACBC 2WQNA 3PRIA 3ZEPA 3TL8A 1G8SA 3VUMA 2XNEA 3VAPA 1HCLA 1YRPA 1ZLTA 4XBRA 3UOJA 4FKTA 3H10A 3I0QA 2XBJA 3SA0A 3ZZWA 1GZNA 4PX6A 5HLWA 5EYKA 4LL5A 4C4GA 2C3LA 4NEUA 1Q24A 3I81A 4KWPA 5JQ8A 4C3FA 4OTIA 5FXSA 4CLJA 3VS0A 4FKPA 3WF9A 4F99A 4JBPA 2W1HA 2OXYA 2ITZA 3UZTA 4W8DA 3DJ7A 3SXFA 2O64A 3DAEA 3BWFA 4YTCA 2FB8A 4Y73A 3GC8A 4JG6A 2PE2A 4O0UA 2R4BA 2IZRA 4L43A 4ZSLA 5HZNA 1DS5A 3HVCA 4D2WA 2DUVA 2W1CA 3HA6A 4QMVA 3AC1A 2Q83A 2BVAA 3FMLA 4IZ5A 3VS6A 3ZXTA 2FYSA 1WBTA 2YDIA 2PMOX 3AQVA 4QP6A 4DGOA 3C4WA 3N9XA 5L6PA 2OXDA 4FGRA 2HXQA 2GNHA 3R28A 2W5BA 4R1YA 4WSQA 3ZC5A 4D9UA 3OUNB 5HI2A 2H9VA 3DNDA 5AUZA 1O6LA 1OKVA 1APME 2I0EA 3C4XA 4U0IA 4WRSA 3ZLSA 5JFVA 3E8NA 3QUPA 1BMKA 3R9HA 4QT1A 5AAGA 3ORMA 3Q4ZA 4A9UA 2WIHA 5EYDA 3SW4A 5AP3A 2R3NA 3PYYA 2H34A 5AM6A 2G2IA 2YLEA 4UALA 4XH6A 2A4LA 4EOLA 4I0TA 4Q5EA 3R7IA 2AC5A 2P33A 4RX7A 4X7QA 4EQMA 2XNOA 4FEUA 4PRJA 5KKRB 4Z3VA 5C8MA 3WBLA 5IEXA 3KA0A 5I9VA 4N70A 5AUWA 2AC3A 5HVJA 3V04A 3VQUA 2PE0A 4DH1A 4EUUA 3QBNA 4AZEA 4I23A 1M7QA 4YHFA 2X8IA 4KB8A 4V05A 4EK5A 5CSPA 3GU4A 4FEWA 5HG9A 1W0XC 3EQDA 3D5XA 3T9TA 4JXFA 3I6UA 3R7YA 3ZXZA 3JVRA 4AX8A 4U79A 5LQFA 2R3GA 2XKCA 3OEZA 2YCSA 4YJRA 1ZYJA 4XG6A 2QR8A 3E3PA 2B9FA 1FGKA 5EOLA 4HCTA 4UMQA 5CAVA 1YHSA 3ENHA 1JKKA 1GAGA 2BALA 2IN6A 4RPVA 4NM3A 1SZMA 4LOPA 3AXWA 4DFBA 2JD5A 1LPUA 3GGFA 3FZRA 4PL3A 5CU6A 3ZSIA 4E6AA 4Z7GA 3H4JA 1KV2A 3DKFA 4X2KA 4ZTLA 3HMOA 3R0TA 5FWKK 3QKMA 2JITA 3ZLYA 5BUJA 5AWMA 2LAVA 2Y7JA 2GQSA 4BDFA 1AD5A 3DAKA 4OBQA 3OY3A 3DT1A 2A1AB 3PE1A 3RPVA 3M1SA 5J1WA 2GQRA 1Q8TA 2QCSA 4C57A 5L2WA 2GNIA 4ZY4A 1XBAA 4PY1A 4QP7A 1NVSA 2OFUA 2UV2A 3UBDA 3P4KA 1SMHA 5CZIA 5D1JA 4IVDA 4H39A 3SVVA 3HRCA 1IA9A 4QMLA 3QZFA 4RLLA 5DA3A 4CYIA 1R3CA 3PXZA 2Z8CA 2IVUA 2VTNA 3OCBA 3RAHA 4QQJA 4V0GA 1W8CA 4R3RA 3TDVA 4R7HA 3W2QA 4NFMA 3TTJA 2DQ7X 3WF7A 5HLPA 3UJGA 1M2QA 2XBAA 1OI9A 1P2AA 2O2UA 1ZOEA 2YM6A 5JFWA 1R1WA 4CTBA 2FO0A 2CGWA 5FLFA 4BCPA 2FSOX 5K4IA 2B4SB 3RCDA 1PXKA 3B2TA 3C0HA 5JGAA 2R7IA 5ETFA 3QKLA 2C68A 4FSTA 4IB3A 2ZM3A 3G0FA 3U8WA 4AOIA 2WMVA 3COHA 1X8BA 2IVVA 2OIBA 4FIEA 4YZDA 5EW9A 2XIKA 3D7ZA 1TVOA 3GC9A 2OICA 3Q53A 1KOBA 4RJ8A 2YDJA 2XF0A 2ITNA 1RDQE 2WMAA 4QP2A 3E8DA 2XK9A 3QC9A 1OL7A 2C0TA 4ZTNA 4DTAA 4J71A 1G8AA 1GIHA 2WQOA 1G5SA 2JDTA 3HGKA 3MPAA 3TIZA 1OPJA 2VWYA 2W0JA 4D2RA 3H0YA 1YOMA 3QCYA 4J99A 4DEBA 2IW6A 3IOPA 5KCVA 5FBOA 3NCGA 2UZNA 1AGWA 3HDNA 4FZ6A 2HWOA 4ASXA 3PTGA 4GU9A 2UUEA 4JIKA 4G2FA 5ANJA 4BDAA 5EW8A 2I0VA 1BL7A 1WAKA 1XH9A 4EHEA 4YBKA 3KREA 5EQEA 1XJDA 3BU3A 2JDOA 2ZYBA 4FL2A 1B39A 4PL5A 2JKQA 4YJPA 1NT2A 1PRYA 2Z7SA 5CEMA 2J0KA 3IDPA 4GFGA 5LVOA 4RJ7A 1F5QA 1GIIA 5EM7A 2E9PA 3QQJA 2QO9A 4K33A 1NY3A 1FMOE 1UWJA 3IW6A 4MBJA 5H3QA 5DG5A 4HCVA 5DMZA 3QYZA 5DHJA 4FKJA 5IH4A 5EQYA 4L7FA 4TN6A 2ITQA 3Q96A 3UO5A 4DG2E 3BIZA 5ANOA 3G2FA 3P7CA 1YKRA 5CAUA 1R39A 2V0DA 2XNMA 3MH3A 5CENA 4USDA 4AZWA 2QO2A 4AZSA 5IQGA 4LYNA 2CGUA 3RP9A 2GHGA 3F66A 1CKPA 4FIIA 4CKRA 5CASA 3MWUA 3UYSA 3DLZA 3DKGA 3D5UA 3G9NA 5IISA 4X3FB 5HO7A 4IADA 3HP5A 3CP9A 4O96A 3BE2A 2ZAZA 3U6IA 4L3JA 4HVDA 4CFNA 1YI4A 4NW6A 3K3IA 4E6QA 3R83A 2BZJA 2VTTA 3ZC6A 5CF8A 4MXXA 4U80A 5D9HA 4KD1A 4TYHA 4AA4A 5KMNA 3KCKA 5DH3A 5EYCA 2X4FA 4YJQA 5CS6A 4EKKA 5HU3A 2WFYA 3DJ6A 2QQ7A 3UQCA 3R30A 4JQ7A 3BBWA 4CRSA 4RIYA 4JVGA 4KA3A 3R8MA 4TZRA 3DNEA 4BDGA 1REKA 2UW0A 3ZUTA 3NSZA 3DB6A 3O7LB 1OZ1A 4BKJA 2HOGA 4DT8A 4M68A 5M08A 3MH0A 2OIQA 2WMBA 1UU7A 4CVAA 1SM2A 2I7QA 4NWMA 5EM6A 5HG8A 3LM5A 5AUXA 4AW1A 3PIXA 4DFNA 5LVMA 2GSFA 3O2MA 3OBJA 1ZMWA 4PMTA 5F95A 4CZYB 4G5JA 2B1PA 2Y4IC 2ITXA 3ALNA 3RHXA 1OKYA 4XS2A 4CFUA 4CFFA 3QX2A 3HUCA 4XP0A 3SX9A 3LCOA 2YIRA 3VW8A 3RAIA 4YTHA 3VBWA 4K8AA 4FTIA 4K0YA 5HO6A 4E26A 1WBOA 4EJNA 4M7IA 3MI9A 3S0OA 4RRVA 3MY1A 4YHTA 4Y5QA 3GU7A 1ZY4A 2XEZA 3H9OA 4FV4A 4Q5HA 5KHXA 3KULB 5AV1A 4U8ZA 5E7RA 4ALVA 3RAWA 1XH6A 4FVQA 1XBCA 3KXHA 5IQBA 3KQ7A 4Y5HA 2SRCA 2JDSA 1LEWA 3EB0A 2UW7A 4JX3A 2JDRA 4OBOA 4HGEA 4AZVA 4BYIA 4DLIA 4WG3A 5BQ0A 2XK7A 3LW0A 4HVHA 4I41A 4XHKB 5IMXA 3QZHA 3G15A 3IECA 3DZQA 4YR8A 2HW6A 4C0TA 3IO7A 3UMWA 4EONA 2G2FA 4XV9A 4UMRA 5B2LA 4BICA 3FMKA 1OL2A 3NAXA 3MJ1A 4M0ZA 4F9CA 2JKMA 4GIHA 2Z7QA 4G3FA 2HENA 2UW6A 3GCUA 4FKSA 3FYJX 5JSMA 3DFAA 4FKRA 5J9LA 3BWJA 4ACDA 1MRUA 3QXPA 3LFNA 2OF2A 3F5PA 4IX5A 4ZZMA 4TWPA 3PZEA 2OF4A 1EH4A 3GVUA 3R8PA 4L3LA 1YXUA 4FOBA 4HVGA 2ERKA 2VN9A 5CX9A 4RA4A 3LFAA 4EBVA 3PXFA 5JRQA 3BEGA 3IW7A 2XNBA 4XG8A 3SOAA 4CFWA 3HRBA 2GPHA 4Z16A 3F69A 2O63A 3I60A 4NFNA 2PE1A 2RFNA 4W4XA 4UMPA 4YPDA 2EXEA 4BTJA 3QCSA 1OL1A 4CXAA 3REPA 2CKEA 4XNEA 4KBCA 2OJFE 4FV5A 3BZ3A 2UZWE 5TKDA 3QTIA 2IW8A 3RZBA 5KMJA 2J6MA 3BLHA 4FZ7A 4LV8A 2BRHA 1UU9A 4OLIA 2V7AA 3UP2A 3QLGA 4GG5A 2WTKC 3UVRA 2YCRA 3EKKA 2J0IA 1W82A 5H8BA 2VU3A 2ZM1A 3V6SA 5B0XA 3QA8A 5HG5A 2PVHA 2W1ZA 3W2SA 3ZYAA 1ZZLA 4FV1A 3H0ZA 1KE9A 3MFTA 5EM8A 4PTEA 4FG9A 2RFDA 3LXNA 3RWPA 4XG9A 5AP7A 3VS3A 4ACMA 3CGFA 4O6LA 5IQCA 3UODA 1A06A 3MB6A 3DBQA 4Y83A 4CG9A 3SKCA 3LOKA 4QD6A 4LM5A 4AGUA 4F6SA 5JGDA 1K2PA 4YC8A 3VN9A 4AE6A 5AX3A 4CD0A 4E4XA 3HV7A 4BZDA 2UVYA 3LXPA 5G6VA 5CALA 5DEYA 5J5SA 3SQQA 4O7RA 3L8XA 4RVLA 3LMGA 4ENXA 2C6KA 3UC4A 4GK3A 4D9TA 1U5QA 4Q2AA 3HEGA 4E3CA 2CKOA 2DYLA 4EOSA 4TT7A 3CLYA 4PWNA 5DYJA 3L9NA 5LMKC 4GT5A 4NL0A 2BKZA 3NR9A 4RIXA 1GOLA 3ZRMA 3CR0A 4G9CA 3PG3A 4MBIA 4KSQA 4QYYA 5IUHA 3NUNA 3GT8A 4QO9A 3Q60A 4RZWA 3ENMA 1IG1A 2XIYA 2XP2A 4U40A 2PVRA 4E73A 1M2RA 4QTCA 3ORLA 3FUPA 4BDKA 3FXZA 2BMCA 2XIXA 2OK1A 5IUIA 1BLXA 2BDFA 2NP8A 3EZRA 3FSFA 3PIZA 3DTWA 3WI6A 5L2SA 1NW1A 3QFVA 4C62A 5E4HA 4QMXA 5HVYA 5BVKA 3TCPA 4EUTA 2O8YA 4C35A 4D2VA 1VEBA 3IDBA 5KX8A 4UYAA 4ZSGA 5LOHA 2R3KA 4WBOA 2XM9A 3FQEA 3R8VA 3CPCA 4A7CA 3EQIA 4NTSA 1W83A 4ZOGA 4EHZA 4ZLOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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