5TBOA

Crystal structure of plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase bound with inhibitor dsm421
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
374
structure length
362
Chain Sequence
NPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNDEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title A Triazolopyrimidine-Based Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitor with Improved Drug-like Properties for Treatment and Prevention of Malaria.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum (isolate 3d7)
total genus 138
structure length 362
sequence length 374
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2016-09-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5tboA00
4FXRA 4IOTA 3UPBA 5D2XA 2XFWA 5J5DA 4RXFA 4QSHA 5KMYA 3STFA 3LHUA 3W2MA 1IXNA 1TPH1 2V9DA 4L4MA 2F7FA 5D33A 4JTUA 2ZRYA 1QFEA 1WBHA 4YLWA 2V0TA 4S1FA 4ML9A 4NXKA 4LWWA 2V2DA 1B3OA 3N2XA 1TPUA 3B0PA 3W70A 1FWRA 3KX6A 3PSVA 1NVMA 3G3DA 4AEOA 3H53A 3R89A 3TA6A 5I3FA 4K7YA 1LBFA 3NQFA 5K2ZA 1VYSX 3DI1A 4FNRA 3PSWA 3LCHA 4JGDA 2X30A 2CW6A 2JGYA 2A1YA 3IIOA 2CLIA 4WY0F 2GJNA 5LHEA 3EX3A 3EX2A 1SR9A 3P62A 5K3VA 4XTIA 3B0VC 1SO3A 2CZDA 2NV1A 3KHJA 4O15A 4MIMA 4ALDA 3VE7A 5LNVA 3UY7A 3MWAA 3O6CA 3UXAA 4L4LA 5C54A 1ME9A 4PTNA 5ABTA 2QCMA 2V8ZA 3NQ7A 2BLEA 5LNWA 4XWUA 1AG1O 5BMXA 1VPXA 4NJHA 2X16A 3TUUA 1PVNA 3TDFA 2O7QA 3GR7A 4I7VA 3DHDA 1UUMA 4N4PA 5FF7A 2O7SA 4JTHA 4UTTA 1TQJA 1GQNA 4BK9A 4NNCA 3LERA 3P8JA 2J9ZA 2V2HA 3SY5A 3EKLA 1OYCA 4JTEA 4HPXA 4MJZA 2E5DA 2E09A 3CEPA 3KFTA 3B03A 3M1ZA 4RX0A 4NX5A 3O05A 3NVTA 3LHZA 4ZQCA 4DBDA 2CLFA 1QDSA 4HNVA 3BW2A 3M16A 5K7JA 1SW3A 4A22A 5KINA 3PC0A 1H61A 4FIQA 2C13A 3M44A 3EXSA 4JICA 3R13A 3A24A 2G95A 2WOQA 5CZJA 4WUIA 2HTMA 1RV8A 1P0KA 1WXJA 1RQHA 4GUJA 3RFAA 4O13A 2BSLA 3WK3A 3CC1A 1LROA 3L0KA 5D38A 1BTMA 4CQ8A 2FJKA 1UUOA 3W1NA 1FCVA 3VNDA 4XZ9A 4GE8A 4RLIA 2D73A 4AXKA 3CWNA 4OQVA 4R7JA 1LOLA 1W5MA 3IVUA 3W74A 3NQEA 3QC3A 1FUYA 3SFKA 4YCPA 3FJLA 3MP4A 3C56A 4MY9A 4AF0B 2WKJA 4EVZA 1VHNA 3C8FA 5G2IA 3G1SA 4WXYA 5AOUA 3L67A 3N73A 4W9TA 5HQEA 4K38A 4CNPA 5DY3A 4LS1A 1DV7A 3BLIA 3H54A 4O54A 3DGRA 1LM1A 3LB0A 2DZUA 2WSRA 4RR4A 4MLRA 3PUEA 3W7OA 3HGOA 1F76A 3ABQA 5BNKA 3S8HA 5C2XA 4MLJA 3TW7A 5FF0A 3NOEA 2Z6IA 4FF7A 3LV5A 1ICQA 3TQ0A 1D3GA 1W56A 2W0UA 3D0CA 4M7SA 2YX0A 3NZ1A 3UYCA 3LCLA 4FHAA 2R94A 1I2QA 1Q45A 3N9RA 4ORMA 5IBXC 3L65A 3QSTA 3TJLA 4LVBA 1DVJA 1PHWA 3SZ8A 2YCEA 3NA8A 3NQ8A 3HPZA 4S2BA 4AAJA 1VCGA 3S5OA 4FX6M 2DZTA 3W1MA 3QH2A 4DF2A 1I2NA 3F4WA 3ANYA 3H55A 3RMJA 3T55A 1O94A 1AK5A 1KM3A 3G1HA 2C16A 1H1ZA 1XBYA 1KFKA 3EX6A 4FO4A 3P7YA 1OYAA 1OVDA 4HSNA 2ZBTA 2QEZA 3IGUA 1K7XA 2V81A 3N3MA 1LYXA 3MYOA 3W87A 1TJPA 1J2WA 2XN2A 3IIPA 1ME7A 2QCHA 2ZTKA 1SZFA 1K8YA 3Q37A 3G24A 4JIQA 3W9ZA 3MP5A 3DKJA 5D04C 3MHFA 1OK6A 3W1RA 3EXTA 2YXGA 2W79A 4GUIA 2C6QA 3LRLA 3LOTA 3WK0A 3NPVA 3WK2A 4N9DA 1IXOA 1M7PA 3JRKA 4GUFA 5HINA 2FPTA 3OIXA 4FNQA 4GC4A 1K8XA 1F5ZA 4UFKA 3TIMA 4TX9A 1UASA 3V75A 4BI5A 4TU1A 3HG3A 2FLIA 2Y89A 4EOUA 1LRTA 3TK7A 3HMJG 2WQPA 1KV5A 3C2VA 3IVTA 4UTJA 1XDLA 4XBKA 4PEKA 5DY2A 4OGZA 5D02A 3W6YA 3WK1A 1XBZA 2Y63A 1WX0A 4BF9A 3M7WA 3CB8A 1W3NA 4O8RA 3HO8A 2QAPA 1LORA 4R33A 2ZRWA 4NX0A 1C9DA 1XUUA 3U2OA 4ZQOA 3A22A 3M5XA 1K8ZA 3LCXA 1R30A 3SGUA 1YTKA 4O17A 2C18A 1DJQA 1OX6A 2WNQA 3FJ6A 4RZ6A 1VHCA 3CHVA 3S6DA 3L5LA 3ABRA 1ICSA 4I7WA 1LLWA 2YW3A 2ZRXA 3S5ZA 3TR2A 4NNAA 2G96A 4TMBA 3C2RA 4JTIA 3FKRA 3W2LA 5AC7A 3IIZA 5TBOA 2R14A 1JULA 1OF6A 3P8IA 3PB2A 1KM0A 4O53A 4CNOA 1VGAA 5D2VA 4BI7A 5BW6A 1TPWA 2C1HA 4HN4A 2X1RA 4O1BA 1WOAA 3SR7A 1PIIA 5D37A 1TTQA 3QF0A 2I9EA 1I2OA 1ZFJA 4N6FA 3TFCA 5FEZA 4PL1A 1TTJA 3TMLA 4UTKA 4HKPA 1N7KA 4FIRA 4XKYA 1GTHA 2Y7GA 1FCUA 4K36A 3CIXA 4IXXA 1SZNA 3W75A 1L9WA 1QPQA 5CKSA 5AHEA 4HHPA 5FF2A 4UNLA 3HF3A 3W83A 3HB9A 3TROA 3C61A 3NL5A 5EPDA 3NQGA 4JX5A 3VI2A 1Z44A 4XTDA 4O4VA 3W1UA 3QQ0A 4NJKA 4O10A 5KSWA 1KM6A 1TRDA 1P1XA 1VCFA 1NEYA 4CQAA 1TPFA 3IV3A 2VFFA 1VCVA 4EF9A 1QR7A 3E12A 3T44A 3B8DA 4GRSA 1CI1A 2C0AA 4ORIA 1FBAA 3T7VA 1NF0A 2XN1A 4IXHA 4MUZA 2QCCA 3FEMA 3NPUA 2RDUA 3NO5A 1S5VA 1OJXA 4C1LA 2NUXA 2NUYA 3M9YA 3L5AA 1ZNNA 3IGXA 3LRMA 1EWEA 3A5FA 3NG3A 3CPRA 3LLFA 4LY8A 4O12A 4TMCA 3TSMA 3DFPA 3S5YA 4O4WA 2Z1BA 2ZRVA 3RLVA 3OG3A 4JTLA 1XCFA 3OEXA 2Y70A 1DHPA 3EX1A 1G6CA 5FF3A 4QM1A 1LZOA 3R5EA 1KM1A 4CLMA 3NL3A 2ZFAA 2Z2UA 3STCA 3M6YA 2FPYA 4IGHA 4RV8A 1PL9A 3BVJA 4QIUA 3I7QA 4Z1BA 1TCDA 3SIZA 4TR9A 1S5WA 4OU1A 3OBKA 3CWOX 3LX9A 4LS2A 1H7XA 5BRBA 3UZ5A 2NX9A 4AWTA 3FA5A 1XXXA 1OG0A 2HSAA 1QO2A 3QQ1A 3E49A 1Q6OA 3UWZA 3BLEA 3NYZA 3LHYA 3N34A 1ZJIA 3KVLA 1XFBA 2PC4A 3RU6A 3S9YA 3PS7A 4BFAA 4EIVA 2R91A 3LTYA 1Q6LA 4JTJA 1FWWA 4R34A 1KV8A 1L6SA 4ADSA 4ZZ9A 4GUGA 4LS0A 5TQLA 2ISSA 4PH6A 4Z1DA 4P61A 4NNBA 5KTLA 2JK2A 1SZGA 3KVKA 3TJXA 2UV8G 3MI3A 2RH9A 1W3IA 3GB6A 5AN7A 4NJGA 1JCLA 1X7FA 3QPZA 2H6RA 2GVLA 2I14A 3DFTA 4JIPA 1K3UA 2C19A 3FYPA 4LVGA 1KTBA 2YDAA 2HS6A 1GVFA 1W5PA 3ATZA 4WY0A 1GEQA 3BGGA 2WNZA 1FDZA 3QW4B 5DXYA 5LSMA 5DCBA 2CLKA 3CQ0A 3L9CA 3W73A 4Y8FA 1OABA 3C3NA 4M5PA 5K4XA 1VH7A 3I7SA 3C52A 4HNNA 2CZFA 1JRBA 3W71A 1Q3NA 4IWWA 3GNNA 3GK0A 1JCYA 1I8JA 4LU0A 3RF9A 1HG3A 1WDWA 3UY8A 1HO1A 3NQDA 5AFDA 1ONRA 3TW6A 5G5IA 1IF2A 3UWYA 1KTNA 2QCGA 4KFNA 3HOJA 2BTMA 4WX2A 4JX4A 3W7DA 3W22A 2QKFA 2H8ZA 1LBLA 1ICPA 2H8XA 2NWSA 3SECA 4AHQA 4OBTA 3INPA 4LNYA 4TIMA 3LXBA 5K9DA 2DU2A 2QCDA 1A5CA 1A5SA 4CCEA 3W7LA 3C4UA 2RFGA 3OVQA 3W7PA 5IBXA 5FEWA 2B7OA 4H4IA 1YDVA 1B4KA 3P67A 1GVSA 1W1ZA 1W0MA 2Y88A 3LBMA 4QJ1A 3HG5A 5LZLA 4E2BA 3LCWA 1EP2A 4JTTA 1SU5A 3DKLA 1LRQA 3N19B 4ZMGA 4MYAA 2ALDA 4DBEA 1OFRA 2GQAA 4K37A 3SGZA 1L2UA 1XC4A 4JY9A 2EPHA 5HWJA 3O07A 4HNTA 2AAMA 3M0ZA 5I3IA 1VRDA 1TB3A 4XUGA 1R2RA 3G22A 1S5TA 1JVNA 1YXDA 2NZLA 3G1YA 3MYPA 3BPWA 3W7KA 4DQWA 3L5MA 1GG0A 2A2IA 4LOCA 3EWZA 5FEXA 5LNRA 1H63A 4RJEA 3PBUA 1KBIA 5F4XA 3SW6A 3MHGA 2AGKA 1FCBA 2JKEA 4UMCA 3PBVA 2OJPA 1QWGA 5HWNA 3C6CA 1ZCOA 1O60A 5EMUA 2DJXA 1L6YA 4A2RA 1JCMP 3W1AA 1H51A 3MP3A 3DZ1A 4GNJA 2W6RA 4CNNA 4JTSA 3P5ZA 2QJGA 1J5TA 4QAIA 2Z0IA 4GUHA 5DCDA 3L2IA 3KAOA 4UNKA 4LT9A 3ELFA 1L6WA 4QISA 3MW7A 4OWGA 1WAUA 1W8SA 2EGZA 2H3BA 4M6PA 3HPXA 3FKKA 3TQVA 1B9BA 2V30A 1XUZA 1F73A 1ME8A 2VFDA 3STEA 1Z48A 1SFJA 3RLUA 2VEIA 3P81A 1R2TA 5AYZA 4QQ3A 4PFMA 1KFLA 1LCOA 3W7RA 4JX6A 1JUKA 2PCQA 3HJZA 3W7CA 2ZZ6A 3N9SA 5LGXA 4JTKA 2ZTJA 3DENA 4QNWA 5CG7A 4JY8A 1N8FA 1I45A 5AHNA 1VC4A 1FQ0A 4O19A 4GJ1A 2G5WA 2ABAA 1YTDA 2RDWA 3TMQA 1H7RA 3BV4A 4FEZA 1ALDA 2TMDA 4Z08A 3LM7A 1GJPA 3QSRA 4E2DA 1U5JA 1E51A 2QR6A 4BI6A 3NAVA 1AW5A 3L0GA 2XN0A 5CZSA 3M41A 1GYNA 4MJMA 2WNNA 3NQ2A 3UNDA 4IPJA 3IIXA 5AYXA 1EWDA 5CPLA 1G7UA 5LKYA 3MMTA 4LUIA 3HBLA 4MZ1A 1LLZA 5HMSA 3M5VA 4DELA 2Y6ZA 8TIMA 3UWUA 3BG9A 4UTWC 5LHFA 2A0NA 4UCGA 5F1VA 4PODA 2B7QA 4MFEA 2J27A 3FYOA 1B4EA 3HGJA 1A5AA 4Z0JA 3M43A 2ISVA 3CEUA 3W1XA 3HQ1A 5DCEA 1KA9F 2FTPA 3DHFA 3TXVA 1IIGA 2NUWA 3M5YA 3P60A 3W84A 2GJLA 3WFAA 1HUVA 3W7NA 1X6UA 4WQ6A 2J6XA 1EUNA 3S1UA 4FNSA 1RD5A 1YADA 2ZYFA 1F74A 2X1TA 3Q58A 4ZL1A 2QDHA 1C8VA 2FFCA 4ZQPA 4I9AA 1SUXA 4UXDA 1OFOA 2VFGA 1F05A 3LHTA 1EA0A 1B57A 4Z0SA 4NQ1A 1T99A 5C55A 3VE9A 4E38A 5MHBA 4N2YA 2ZZ2A 3EWWA 4M6VA 2WPBA 3KRZA 4EF8A 1OFAA 4JEQA 1P0NA 1TRIA 2B7PA 3S1XA 3QMSA 5D05A 3O6YX 3F1QA 4A3UA 1MEIA 5D2WA 2EKCA 1YTEA 4YL2A 1QCWA 2OCZA 2X1UA 5D03A 3RK8A 4GXMA 3BW3A 3L66A 1TYGA 1R47A 1H5YA 3O15A 4P2VA 3W7MA 1VS1A 1EX5A 4JDBA 1THFD 3O1NA 4UR7A 4I7UA 4AB4A 2Y85A 3GAYA 3GDLA 2OT0A 3NNTA 3S1VA 2GOUA 3KRSA 3C0JA 1FX6A 3DAQA 5E93A 2QUUA 4UTTC 4UMAA 3AJXA 1XBVA 3CM4A 1F6KA 1LTDA 1PHQA 1LP6A 1NAL1 1H7PA 2YW4A 5I3GA 4LVDA 1YPIA 4MYXA 4HPJA 3LDVA 2QAFA 4MY8A 3HG2A 4O52A 1DJNA 3W86A 2DORA 3G1FA 1AMKA 5FESA 4O28A 1WV2A 3PR2A 3HG4A 3ABSA 3NL6A 3VKJA 1J4EA 1EPXA 1TQXA 3GVGA 3GZ3A 3OA3A 1VYPX 2VKZG 3TH6A 1WA3A 2E6FA 4KFOA 3LRKA 4DPQA 4UFLA 1HTIA 3Q94A 5FF4A 4BWLA 3E0IA 3VCRA 4K39A 1UJPA 4PCFA 3FIGA 1OF8A 1RVGA 1WQ5A 3L0NA 3SI9A 3EWBX 1EP3A 3TAKA 2Z6JA 1TJRA 1WYIA 2P1FA 2J24A 1SO4A 4NZFA 5TIMA 4IQLA 2TSYA 5KZEA 1JR1A 2A7PA 4XKYB 3W2NA 4RKAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FXR A;  1A4M A;  5D2X A;  3FCP A;  1QI4 A;  3E5B A;  2EJA A;  4AZI A;  1RK5 A;  3ZJK A;  1JG9 A;  5KMY A;  3STF A;  1TPH 1;  4H01 A;  2F7F A;  1HN1 A;  1KR1 A;  2ZUN A;  2VEF A;  1KGU A;  4GBD A;  2ISD A;  4EPD C;  3OBE A;  4NXK A;  1OC6 A;  1TPU A;  3AXI A;  1OEP A;  2KAU C;  1GHS A;  1NVM A;  3R89 A;  5I3F A;  4F4R A;  3UW6 A;  2NQL A;  5EMJ A;  1FHV A;  2YCL B;  3IAN A;  3DI1 A;  3CMF A;  2E8Y A;  3PSW A;  2QMK A;  2INF A;  1HGW A;  3ZJ6 A;  2A1Y A;  4PSP A;  5CC5 A;  3CT2 A;  3B8S A;  2DFA A;  3SCP A;  5FJJ A;  3ZOA A;  5J8L A;  5K3V A;  2CZD A;  5IDI A;  1KKR A;  2E7F A;  4PB3 A;  3VE7 A;  4L4L A;  4L4O A;  2QCM A;  3RU8 X;  3NQ7 A;  4XWU A;  3QV6 A;  1VPX A;  4NJH A;  2G0W A;  1PVN A;  4WDT A;  3TDF A;  1UWU A;  4IGM A;  3W0K A;  3WNO A;  1MW2 A;  4BK9 A;  4DJF C;  2E25 A;  4NNC A;  3P8J A;  5JIW A;  4PUD A;  3EKL A;  4UOQ A;  4AD1 A;  3HFT A;  4AIO A;  4A3H A;  2OQH A;  3B03 A;  3D6N A;  3NVT A;  4DBD A;  2CLF A;  1QDS A;  1XYM A;  4HZM A;  3KBV A;  4WIW A;  1H0I A;  1KCX A;  4FIQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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