5AMDA

Three dimensional structure of human carbonic anhydrase ii in complex with 2-((2-phenylethyl)sulfamoyl)-4-sulfamoylbenzoic acid
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
publication title X-Ray Crystallography-Promoted Drug Design of Carbonic Anhydrase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5amdA00
4WUQA 1KOPA 3JXGA 2ZNCA 1LZVA 1I9OA 2IT4A 3FE4A 4YGLA 4KAPA 1HCAA 1CAJA 4RN4A 4LP6A 1CVAA 2W2JA 5IPZA 3IEOA 1I9MA 4QK1A 4KNJA 5DSLA 4BF6A 3M2NA 1I9LA 4LHIA 5JQ0A 4Q9YA 5E2MA 2CBBA 4CQ0A 12CAA 4Q0LA 1OKLA 5FNJA 1CNHA 1LUGA 2VVBX 1CAZA 3DCSA 3P5LA 2NXTA 5EKMA 2FOSA 1ZSBA 3DD8A 4K0TA 3NI5A 1CVFA 3BL0A 3M1WA 1H9NA 4ZWZA 2EZ7A 4ZWXA 1OKMA 1BNUA 9CA2A 5BNLA 2NNSA 1ZE8A 2HD6A 1TH9A 3M3XA 5JEPB 4FRCA 4QIZA 5FNKA 4Z1EA 1UGEA 4L5WA 4TWMA 3OILA 3KOIA 1ZSAA 1I9PA 2CA2A 3OKUA 4XFWA 2FW4A 3DVCA 3FW3A 3PYKA 3RYYA 5L3OA 1CANA 3W6HA 4Q81A 4QK2A 3N2PA 4FU5A 1AVNA 7CA2A 4C3TA 3R17B 4CA2A 4PYYA 3OY0A 3MNAA 2NMXA 1G4JA 2HFWA 2ILIA 2WEOA 3P4VA 4FPTA 1MOOA 4KP8A 2WEGA 3M96A 3V5GA 3MHIA 1FQNA 1HEBA 3KLDB 4Q87A 4CNXA 4RH2A 3D93A 1KEQA 1Z93A 2GEHA 3U3AX 3MNJA 4KP5A 4MLTA 1YO0A 3N4BA 4FVNA 1CVBA 4QJWA 1BN4A 4IWZA 4QEFA 2VVAX 5G03A 3IGPA 1XQ0A 3L14A 4QJMA 3RG3A 4M2UA 4E3FA 3T5UA 2EU2A 2HL4A 3CZVA 3P55A 4Y0JA 3DAZA 1T9NA 1BNTA 1UGCA 2FOYA 3FFPX 4ZX0A 5BRUA 1FQLA 3P3JA 3ML2A 1CNBA 4E3DA 1CAOA 1G4OA 4KUWA 3SAPA 5EHEA 4Z1NA 4YXIA 3MNKA 3GZ0A 4XIXA 5E28A 1KOQA 4DZ9A 3KONA 4Q7WA 5E2NA 1CNKA 4MDLA 2HNCA 5DSIA 1G53A 1TBTX 3M5SA 4CNRA 2X7UA 3ZNCA 2NN1A 3N3JA 1CNYA 1YDBA 1ZNCA 1HCBA 1HUGA 1CAYA 4K0ZA 1FQRA 1UGDA 4JS6A 5FLRA 4QIYA 1CINA 1Y7WA 1CALA 4E5QA 3S73B 3RZ5A 4MO8A 5FL4A 1BNVA 4RUXA 4XE1A 1FQMA 2Q1QA 1CVHA 1H9QA 5JDVB 5EKHA 4M2WA 4COQA 2QO8A 1ZSCA 3Q31A 1TB0X 3DA2A 1G0EA 3T83A 4TWLA 5FDIA 2HKKA 3F8EA 1G54A 2FOUA 4Q6DA 3B1BA 3KNEA 1MUAA 1TEUX 1IF9A 1G46A 3MNHA 3MNIA 3JXFA 1DCBA 4ILXA 1J9WA 3JXHC 1JCZA 5EHVA 1OQ5A 4Q78A 4RUYA 1YO2A 4WR7A 5DSQA 3RZ1B 3M40A 4Q6EA 2NXRA 1IF4A 3MZCA 4ETQC 4FL7A 5DSNA 4Q90A 5FL6A 1BICA 1BN3A 5DSJA 2AX2A 4ZWYA 4E49A 4QJPA 1RZEA 4PZHA 4YVYA 5EKJA 4YXUA 3RJ7A 4YWPA 1KWRA 4HT0A 4BCWA 3V3HB 1G0FA 4Q06A 4JSSA 3K34A 5SZ2A 3HKQA 4Q7VA 3M5EA 4M2RA 2CBEA 3M1KA 1HVAA 4CACA 2CABA 5SZ7A 1YDCA 1CRMA 5E2KA 1YDDA 1HUHA 1FSQA 1CNWA 4YGFA 4RFDA 3T5ZA 3V3FA 3M1QA 5G0CA 3OIMA 3PO6A 5G0BA 4KUYA 1CNCA 2X7SA 4WL4A 3F4XA 4IDRX 3S71B 3U7CA 3P58A 5EH8A 3D9ZA 2NNOA 2NNGA 1A42A 3UYQA 1BV3A 5C8IA 3QYKA 2HOCA 4JSZA 3IBIA 1HEAA 3S75B 4FIKA 2OSFA 1LG5A 5EOIA 1CCUA 5DSRA 1CA2A 1FSNA 5JGTB 3BETA 5DOGA 1BNQA 5FLTA 2OSMA 2CBCA 3RLDA 1DMXA 4QSBA 2Q1BA 3UYNA 1HEDA 4YGKA 3K7KA 3N0NA 4R5AA 1UGAA 1V9EA 1CZMA 4ZX1A 4HEZA 5SZ3A 3OIKA 3RZ0B 3S76A 5J8ZA 4PXXA 1XEVA 1ZGFA 5FNLA 3T82A 4YXOA 3OYSA 4RIUA 1RZDA 5BYIA 1CIMA 3DVBA 2WD3A 2NWPA 4ZAOA 5CACA 3S97A 3S8XA 3K2FA 3F7BA 3P44A 3DBUA 8CA2A 3MHCA 3MNUA 1CILA 2Q38A 3LXEA 3RYXB 4G0CA 4HF3A 1IF8A 2NNVA 1I9QA 4YGJA 5G01A 5A6HA 5JG5B 3T84A 1IF6A 5DSKA 4HBAA 5BRVA 3OKVA 3S74B 2H15A 1HECA 1ZGEA 2O4ZA 4MDMA 4R59A 1Z9YA 2POVA 5JEHB 3S72B 1I91A 3HKNA 1BZMA 4UOVA 5DSPA 3U45X 4K0SA 1CVDA 4ZWIA 3SAXA 4Q8YA 4Q07A 3M14A 5E5UA 5EIJA 2POUA 5AMDA 4KNNA 2NWYA 3M2YA 3MDZA 3V3JA 4YX4A 4Q09A 3IBNA 1BCDA 3M2XA 3RGEA 4JSWA 3DCCA 3TVNX 1UGGA 3DC9A 2NWOA 3HFPA 1ZH9A 4CNVA 1V9IC 4QSJA 1FR7A 5CA2A 2AW1A 4L5UA 1CNGA 5SZ0A 3ZP9A 5AMLA 3M04A 1IF7A 3BL1A 1CCTA 4QJ0A 5L6KA 3RZ7A 3S9TA 2FMGA 3KOKA 3U47A 1TTMA 4KNIA 3V3GB 2F14A 1XPZA 1CAMA 1CAKA 5DVXA 1RAYA 1UGBA 1BNWA 1H4NA 3RYVB 4KV0A 3T85A 3IAIA 4WUPA 4YYTA 2FNNA 4KUVA 5FNMA 3MHMA 1YO1A 5JEGB 2FMZA 3M98A 5SZ4A 3PJJA 1F2WA 1DCAA 2FNMA 4QY3A 3P3HA 5JQTA 3MHLA 4HT2A 1G52A 4YHAA 5DOHA 5FLOA 1EOUA 3EFIA 1G1DA 3S77B 1CVEA 4E4AA 3M67A 1CRAA 2EU3A 1ZFQA 1CAIA 5FDCA 5E2SA 5EH7A 1CNXA 5FL5A 1BNMA 1FR4A 3P5AA 5AMGA 2WEJA 3F7UA 4WW8A 4CNWA 4QSAA 5JGSB 5E5RA 4Q7PA 2FNKA 2QOAA 2GD8A 4HEWA 1RAZA 3HKUA 2X7TA 4Z1JA 5FNGA 5FLSA 5SZ6A 3CAJA 4K1QA 3V7XA 4QK3A 3HKTA 5EHWA 4Q49A 3DC3A 1RZBA 5DSOA 5CJFA 4RFCA 3NJ9A 1G3ZA 5SZ1A 3R16A 1CAHA 4N16A 3CA2A 2POWA 3TVOX 3DVDA 3NB5A 2NWZA 1BN1A 1RZCA 4K13A 4MDGA 5JG3B 1CNJA 1Z97A 3RYJB 3EFTA 4Q8XA 5FNHA 4E3GA 1LG6A 3D0NA 3B4FA 4QSIA 1TG3A 4Q83A 3KS3A 4MLXA 1TEQX 2QP6A 4KNMA 3IBLA 4BF1A 3M5TA 1RZAA 3KIGA 1CCSA 3C7PA 3MWOA 3VBDA 5CLUA 3D8WA 4PQ7A 5FLPA 4LU3A 1CA3A 4M2VA 5LMDA 1TG9A 3CYUA 4GL1X 4ITOA 2WEHA 1TE3X 1KWQA 1JD0A 1UGFA 5EZTX 3M1JA 1I90A 3RG4A 3OYQA 1LGDA 4WW6A 1XEGA 4JSAA 5FNIA 3W6IA 4FVOA 4ITPA 4YGNA 4Z1KA 4N0XB 1G48A 3D92A 1THKA 1IF5A 4RUZA 1RJ6A 2FOQA 2CBAA 5BRWA 3V2MA 1G45A 3DV7A 3S78B 3MHOA 1YDAA 1G6VA 1FLJA 4XZ5A 4E3HA 1FSRA 2FOVA 4RIVA 3ML5A 3KKXA 3SBIA 1RJ5A 2CBDA 3RZ8A 5EH5A 4L5VA 5E2RA 4XIWA 3SBHA 4Q8ZA 4QJOA 3MMFA 1CVCA 1URTA 3HLJA 3M2ZA 4QJXA 3MYQA 3KWAA 6CA2A 4Q7SA 3V3IB 4Q08A 4Z0QA 3RYZA 4G7AA 5DSMA 3IBUA 1AZMA 5DRSA 1OKNA 4HEYA 1BNNA 4R5BA 1AM6A 4QTLA 1JV0A 3V2JA 2NN7A 5A25A 1ZFKA 2ABEA 3DCWA 3TMJA 1I9NA 4DZ7A 4X5SA 1I8ZA 2WD2A 3DD0A 5FLQA 4Q99A 2H4NA 5SZ5A 5HPJA 4HU1A 1DMYA 4E9OX 1CNIA 4MTYA 3HS4A 2NXSA 5JESB 4PYXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WUQ A;  1KOP A;  3JXG A;  2ZNC A;  1LZV A;  1I9O A;  2IT4 A;  3FE4 A;  4YGL A;  4KAP A;  1HCA A;  1CAJ A;  4RN4 A;  4LP6 A;  1CVA A;  2W2J A;  5IPZ A;  3IEO A;  1I9M A;  4QK1 A;  4KNJ A;  5DSL A;  4BF6 A;  3M2N A;  1I9L A;  4LHI A;  5JQ0 A;  4Q9Y A;  5E2M A;  2CBB A;  4CQ0 A;  12CA A;  4Q0L A;  1OKL A;  5FNJ A;  1CNH A;  1LUG A;  2VVB X;  1CAZ A;  3DCS A;  3P5L A;  2NXT A;  5EKM A;  2FOS A;  1ZSB A;  3DD8 A;  4K0T A;  3NI5 A;  1CVF A;  3BL0 A;  3M1W A;  1H9N A;  4ZWZ A;  2EZ7 A;  4ZWX A;  1OKM A;  1BNU A;  9CA2 A;  5BNL A;  2NNS A;  1ZE8 A;  2HD6 A;  1TH9 A;  3M3X A;  5JEP B;  4FRC A;  4QIZ A;  5FNK A;  4Z1E A;  1UGE A;  4L5W A;  4TWM A;  3OIL A;  3KOI A;  1ZSA A;  1I9P A;  2CA2 A;  3OKU A;  4XFW A;  2FW4 A;  3DVC A;  3FW3 A;  3PYK A;  3RYY A;  5L3O A;  1CAN A;  3W6H A;  4Q81 A;  4QK2 A;  3N2P A;  4FU5 A;  1AVN A;  7CA2 A;  4C3T A;  3R17 B;  4CA2 A;  4PYY A;  3OY0 A;  3MNA A;  2NMX A;  1G4J A;  2HFW A;  2ILI A;  2WEO A;  3P4V A;  4FPT A;  1MOO A;  4KP8 A;  2WEG A;  3M96 A;  3V5G A;  3MHI A; 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