5AMLA

Three dimensional structure of human carbonic anhydrase ii in complex with 2-(but-2-yn-1-ylsulfamoyl)-4-sulfamoylbenzoic acid
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
publication title X-Ray Crystallography-Promoted Drug Design of Carbonic Anhydrase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5amlA00
1G52A 3DVBA 1YDCA 2QOAA 1XEVA 3V2MA 4BF6A 4KNJA 1TEUX 4Z1JA 1IF9A 3F7BA 4QJOA 5DRSA 1CNIA 1TE3X 3T85A 1FLJA 5L6KA 3HKQA 3V3IB 3P4VA 1G6VA 3OIKA 4L5VA 4G0CA 5AMLA 1AM6A 1UGDA 4Q49A 1BICA 3DVCA 1H4NA 1HUHA 3RYVB 2NWYA 4YXIA 3U47A 3KS3A 1YDDA 3CZVA 3MNJA 5G03A 4ZAOA 4FVOA 3JXHC 5AMDA 4JSAA 2GEHA 5JGTB 3NJ9A 2NN7A 1CA2A 4RUZA 2FNMA 2NMXA 3F4XA 1FQNA 1Z9YA 2CBBA 4MLXA 1HVAA 4RUYA 5EHEA 4ZWIA 3P3JA 1IF7A 1KWRA 3NI5A 2OSMA 4CACA 3S74B 5DSOA 1XPZA 3LXEA 3ML5A 4R59A 3BL1A 5SZ4A 5FL6A 1TH9A 3B1BA 1KOQA 3BETA 5FNMA 5EOIA 2WEGA 3V2JA 5FL4A 1Z93A 3F8EA 4L5UA 1RAZA 4WUPA 1HEBA 5EZTX 1CVDA 5DSKA 3MZCA 4K13A 2HD6A 4PZHA 2IT4A 3S97A 2NXTA 3PJJA 5DSMA 1KWQA 4YGFA 1YDAA 3ZP9A 4QSJA 3CA2A 1T9NA 4KV0A 5CJFA 4Q7PA 3RZ7A 3S77B 3DC3A 2NN1A 2WD3A 1HCBA 3PO6A 3MHLA 3RG3A 4Q07A 2CABA 1CAIA 2FOQA 3L14A 4K0ZA 3MHOA 1TB0X 4E3HA 4L5WA 2F14A 5EHWA 3RYYA 4K1QA 5AMGA 2WEHA 3OIMA 1UGFA 5HPJA 1CVFA 2POWA 3K2FA 5E2NA 3TMJA 1JD0A 4FIKA 4PYYA 1I90A 1HECA 2HNCA 3R17B 5FLSA 4Q8XA 2NNVA 4QSAA 1AZMA 2HL4A 3FE4A 2X7UA 4QK1A 4QIZA 2FOVA 5G0BA 3OILA 1CCSA 5FLTA 1LZVA 5SZ6A 4Q83A 3HFPA 4QTLA 5FNJA 1CNXA 4Q87A 3M2XA 1CINA 4BCWA 12CAA 3DVDA 3P44A 1RZEA 3M40A 1V9EA 3U3AX 2POUA 4Z1NA 1FR4A 3DCCA 4QSBA 5JEGB 4M2RA 3UYNA 3S75B 4JS6A 3MHCA 5FNLA 3S76A 3M67A 1BNTA 2CBEA 3FFPX 1BV3A 4PYXA 4XE1A 5JG3B 4QK3A 1CNWA 3HS4A 3TVNX 3Q31A 5FNHA 1CNBA 3HLJA 4RFCA 4HEZA 9CA2A 3M1JA 3N0NA 4QY3A 1I9LA 3DC9A 3R16A 5JEPB 3RZ1B 1CA3A 4MLTA 4QJMA 4X5SA 2CBDA 3OKUA 4YXOA 5JESB 4KUWA 4MO8A 1YO1A 2VVAX 4RUXA 2ABEA 3M3XA 3DAZA 5E5UA 5JQTA 2NWPA 1CNKA 2HOCA 3U7CA 1H9NA 1A42A 3MWOA 1CNCA 3T83A 3D8WA 5SZ0A 3S8XA 3OYQA 2X7SA 3MHIA 3S71B 4CNRA 1I8ZA 1RZDA 3RYXB 3D93A 1IF6A 4QJXA 2NNOA 2FMGA 8CA2A 5A25A 1DCAA 3MNUA 1DCBA 1TG3A 4Z0QA 1UGEA 3B4FA 1BN3A 1I9NA 1CNGA 4Q8ZA 1BZMA 3K34A 1ZFKA 1UGAA 3P5LA 4TWMA 1UGBA 1ZGFA 4N0XB 4PXXA 5G01A 1CAMA 4E49A 1LG5A 2NNSA 5EHVA 3S72B 4WW8A 1YO2A 5BRUA 5FDIA 4Q99A 1FSNA 4FL7A 2EU2A 4DZ7A 3MNKA 4HT0A 5FNKA 1RZBA 4COQA 5BRVA 3IBIA 4WL4A 1IF5A 1G45A 3DBUA 3P3HA 3RG4A 4ZWXA 3W6HA 5DOGA 4E9OX 4YGKA 4RIVA 4G7AA 4BF1A 5FLPA 1LUGA 1YDBA 4KNIA 3M1KA 4IWZA 4K0TA 1KEQA 3CAJA 4XIXA 1I9OA 5E2KA 3U45X 2EU3A 2WEJA 1I91A 4XZ5A 1URTA 1CNYA 3V7XA 1THKA 4Q90A 5A6HA 4RN4A 5DOHA 2QO8A 4RFDA 3SBHA 2CBAA 1XQ0A 4MDGA 2CA2A 4QJPA 4YVYA 1CCTA 1CVAA 4ILXA 1CAJA 3RLDA 4PQ7A 3SBIA 4M2VA 2CBCA 3M98A 4FU5A 2H4NA 3KNEA 4FPTA 4Q7WA 1CAZA 3KIGA 1BNMA 5DSRA 1UGGA 5JQ0A 1CNJA 3MNIA 5JDVB 1UGCA 1XEGA 4N16A 5EH8A 1CCUA 1G3ZA 1ZNCA 3KOKA 3D0NA 4CNVA 2FNKA 5CACA 1BCDA 4TWLA 5JGSB 1OQ5A 5LMDA 1IF8A 1RJ5A 4E3GA 3T5ZA 4Q9YA 5DSPA 3BL0A 3M2NA 3P55A 2HKKA 3D9ZA 1CANA 2NXRA 1RJ6A 5FDCA 4E5QA 1CZMA 1JCZA 2HFWA 2NWOA 1ZSBA 1MOOA 3RZ0B 3T84A 5SZ3A 3C7PA 5FLOA 2AW1A 3IBUA 3SAXA 4ZWZA 4QIYA 3TVOX 4YGNA 1DMYA 5DSJA 1G1DA 1G48A 1MUAA 3M2YA 1H9QA 1G4OA 1CIMA 3MYQA 2FMZA 4XFWA 1KOPA 4CA2A 3M5EA 3S78B 4YXUA 2FOYA 6CA2A 3IEOA 1FQLA 2W2JA 1BNQA 2ILIA 3V5GA 3ZNCA 3V3JA 3QYKA 3RYJB 1DMXA 5L3OA 3T5UA 4ZWYA 5JEHB 5E5RA 5DSLA 5E28A 4YGLA 2WEOA 1YO0A 5FLQA 3M1QA 1LG6A 2NWZA 3S73B 1BNVA 5BNLA 5E2SA 5FNGA 4M2WA 4ETQC 5DSQA 3MDZA 1LGDA 1F2WA 3RGEA 2POVA 4MTYA 4RIUA 3W6IA 1CRMA 4LP6A 4FRCA 3DCWA 1ZGEA 2X7TA 3MNHA 5FL5A 3VBDA 4LU3A 4Q09A 5SZ5A 1HEDA 3ML2A 4YYTA 1IF4A 2O4ZA 3KOIA 1FSQA 5FLRA 2AX2A 1Y7WA 4HBAA 2EZ7A 3DA2A 2NNGA 4R5AA 4Q81A 4KNNA 4GL1X 1RZCA 2FW4A 1I9MA 4Q0LA 5JG5B 1ZSAA 4E3DA 1CILA 4K0SA 3OKVA 4LHIA 4KNMA 1CVCA 1TEQX 3IBNA 2WD2A 3JXFA 4WW6A 1RZAA 3UYQA 4Y0JA 5DSIA 3CYUA 4CNWA 3DCSA 1ZE8A 2Q38A 1G53A 4HT2A 4YHAA 4Q06A 3F7UA 5EH5A 4CNXA 4E3FA 4QJWA 3N4BA 3RZ5A 1G0FA 4UOVA 1ZH9A 3OYSA 1G46A 3S9TA 1BN4A 3MMFA 3N3JA 7CA2A 5DSNA 1BNWA 4Q6EA 1G4JA 1BNUA 5EKHA 4YGJA 3FW3A 3IAIA 1G54A 2NXSA 1CALA 2Q1QA 1HCAA 1RAYA 3EFIA 5EKJA 4YX4A 4ITOA 1JV0A 1TG9A 3N2PA 1ZSCA 4YWPA 3SAPA 2OSFA 4IDRX 2H15A 3HKNA 5SZ2A 1CAOA 3NB5A 4JSWA 4QSIA 4WR7A 5CLUA 5EIJA 3M1WA 5SZ7A 5C8IA 3KLDB 4E4AA 1OKMA 3DD0A 3D92A 4JSSA 1FQRA 2Q1BA 4QK2A 4FVNA 3RJ7A 3DD8A 1EOUA 1TTMA 1Z97A 3MNAA 3T82A 3M5TA 5J8ZA 3KONA 3HKTA 1G0EA 4JSZA 3M2ZA 4HF3A 4Q08A 4Q6DA 5EKMA 4Z1KA 1OKNA 3M14A 1ZFQA 1CAYA 5EH7A 4QJ0A 4Q7SA 5DVXA 4KUVA 2FOUA 1CNHA 3JXGA 4WUQA 5BRWA 3IBLA 4ITPA 3V3HB 1HEAA 4HEWA 2VVBX 4MDLA 4ZX1A 5E2MA 5IPZA 1I9PA 4QEFA 1CAKA 4RH2A 1I9QA 4Z1EA 3PYKA 3M5SA 4KP8A 3V3GB 1FSRA 1CVEA 4MDMA 4C3TA 1CAHA 3M96A 2ZNCA 1HUGA 2FOSA 3GZ0A 3V3FA 4KP5A 3K7KA 5G0CA 4DZ9A 3DV7A 1CVHA 3OY0A 1CVBA 5E2RA 3P5AA 4M2UA 5FNIA 4CQ0A 4KUYA 3P58A 3KKXA 2GD8A 4Q7VA 1V9IC 1CRAA 4ZX0A 3RYZA 1BNNA 1J9WA 4HEYA 4Q78A 5CA2A 3HKUA 3MHMA 5SZ1A 2QP6A 1FR7A 1AVNA 1OKLA 4KAPA 4Q8YA 1BN1A 3RZ8A 3KWAA 4R5BA 3IGPA 1FQMA 1TBTX 2FNNA 4XIWA 3EFTA 4HU1A 3M04A 5BYIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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 1G52 A;  3DVB A;  1YDC A;  2QOA A;  1XEV A;  3V2M A;  4BF6 A;  4KNJ A;  1TEU X;  4Z1J A;  1IF9 A;  3F7B A;  4QJO A;  5DRS A;  1CNI A;  1TE3 X;  3T85 A;  1FLJ A;  5L6K A;  3HKQ A;  3V3I B;  3P4V A;  1G6V A;  3OIK A;  4L5V A;  4G0C A;  5AML A;  1AM6 A;  1UGD A;  4Q49 A;  1BIC A;  3DVC A;  1H4N A;  1HUH A;  3RYV B;  2NWY A;  4YXI A;  3U47 A;  3KS3 A;  1YDD A;  3CZV A;  3MNJ A;  5G03 A;  4ZAO A;  4FVO A;  3JXH C;  5AMD A;  4JSA A;  2GEH A;  5JGT B;  3NJ9 A;  2NN7 A;  1CA2 A;  4RUZ A;  2FNM A;  2NMX A;  3F4X A;  1FQN A;  1Z9Y A;  2CBB A;  4MLX A;  1HVA A;  4RUY A;  5EHE A;  4ZWI A;  3P3J A;  1IF7 A;  1KWR A;  3NI5 A;  2OSM A;  4CAC A;  3S74 B;  5DSO A;  1XPZ A;  3LXE A;  3ML5 A;  4R59 A;  3BL1 A;  5SZ4 A;  5FL6 A;  1TH9 A;  3B1B A;  1KOQ A;  3BET A;  5FNM A;  5EOI A;  2WEG A;  3V2J A;  5FL4 A;  1Z93 A;  3F8E A;  4L5U A;  1RAZ A;  4WUP A;  1HEB A;  5EZT X;  1CVD A;  5DSK A;  3MZC A;  4K13 A;  2HD6 A;  4PZH A;  2IT4 A;  3S97 A;  2NXT A;  3PJJ A;  5DSM A;  1KWQ A;  4YGF A;  1YDA A;  3ZP9 A;  4QSJ A; 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