5BRWA

Catalytic improvement of an artificial metalloenzyme by computational design
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGMAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSMTTPPLLESVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKLRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Improving the Catalytic Performance of an Artificial Metalloenzyme by Computational Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5brwA00
1FR7A 3SBIA 3OKUA 4QJWA 1CNIA 5CLUA 1EOUA 1CAMA 1JCZA 4K0TA 4Z1EA 2NWYA 1IF5A 4QK1A 3V3GB 1G54A 3PO6A 1BNNA 1ZFKA 2AW1A 3S73B 1I9MA 5E2SA 4IWZA 4KNJA 3PYKA 5DRSA 1BNUA 3MNUA 1CA2A 3R17B 3FW3A 2ZNCA 3D8WA 3IGPA 3M3XA 1CCTA 1RZCA 4Q90A 1KOPA 1MOOA 3MNJA 3U7CA 1LZVA 1UGFA 2POVA 5JESB 4ITOA 1HEDA 2WD3A 3S76A 4RUYA 4Q83A 4QY3A 1CRAA 1T9NA 2NNOA 4RIUA 5JQ0A 2OSFA 3IEOA 4CNRA 4COQA 4E3GA 1OKLA 4YXUA 1ZGEA 3TMJA 1THKA 1RJ5A 1RJ6A 1G45A 1FSNA 4QK2A 1TEQX 1CCSA 3HKNA 4TWLA 1CAYA 5CJFA 4BF6A 1FR4A 5FLSA 3CYUA 3DVCA 2QOAA 3R16A 1YO1A 1FQMA 1XEVA 4JS6A 4QSJA 4GL1X 1ZSBA 4HEZA 3DC9A 4YX4A 4RN4A 5FLQA 4CACA 3UYQA 1AVNA 4Q8XA 5EHWA 1Z97A 3HKTA 4JSAA 5FLOA 5BRWA 3GZ0A 3M96A 1YDAA 3JXHC 1CINA 1BN1A 1HCBA 4R59A 5DSPA 4WR7A 3KKXA 5DSQA 1TEUX 2CBCA 2EU3A 2NWZA 4QSBA 1LUGA 3M2ZA 5SZ7A 3D0NA 3IBNA 2O4ZA 1OQ5A 1HECA 3MYQA 5EKMA 1CVHA 4PYYA 4G0CA 5FLTA 3MNHA 3V5GA 4YHAA 2FOQA 5SZ2A 1CAHA 3S74B 3FFPX 5DOHA 4E4AA 4C3TA 1Y7WA 4Z1NA 5DSJA 3V3IB 1RZAA 3K2FA 1TTMA 3RZ8A 2FOSA 4CNVA 4Z0QA 3VBDA 1CANA 1BNVA 2W2JA 2Q1QA 4QJ0A 4MDLA 2HNCA 3M1JA 2FNNA 4WUPA 3KIGA 1YDDA 5SZ6A 5SZ5A 1XEGA 5FNMA 3M1KA 5JG5B 4WUQA 1CNKA 3RZ1B 4FVOA 1CNCA 1BNQA 4IDRX 4E9OX 2FNMA 4LP6A 1ZE8A 4RFCA 5E5RA 3S77B 1HVAA 3MHMA 2NNVA 4M2UA 2Q1BA 4HT2A 4WW6A 3UYNA 3DVBA 5E2RA 3RYJB 3EFTA 1KWQA 2HOCA 4Q8ZA 3N4BA 4YGKA 3T84A 3M04A 3P3JA 4XE1A 1CZMA 4X5SA 1IF9A 3OYSA 4R5BA 3W6HA 3IBLA 2NN1A 4YWPA 2CABA 3KNEA 2QP6A 4Q81A 5DSNA 1BCDA 3MHOA 4YVYA 1G4OA 4KP5A 4Q06A 3RLDA 9CA2A 2IT4A 3DVDA 3HLJA 4ITPA 4HEWA 1YO0A 3M98A 3NI5A 3ZP9A 3DCCA 5FL6A 3RYYA 4E5QA 4KUWA 5CACA 1DMYA 5SZ0A 2CBAA 3P55A 3KWAA 1CAJA 3MZCA 5E5UA 5BNLA 1I9NA 3MMFA 1IF6A 3S72B 7CA2A 5EOIA 5FNHA 1TG3A 4E3HA 5LMDA 1FQLA 3NJ9A 4KUVA 5AMLA 1G3ZA 1RZEA 5DSIA 1IF8A 3M5TA 4ZWXA 3BETA 4G7AA 3DAZA 4YGFA 3P4VA 2EU2A 3IBUA 4L5VA 3M67A 4ZWYA 1LGDA 4MO8A 5G0CA 1RZDA 4Q6EA 5G01A 1CNYA 1ZSAA 3DCWA 3DCSA 3ZNCA 3OIKA 1CILA 1CIMA 3RZ7A 1DMXA 3M2XA 2POWA 3T5ZA 4KNMA 2X7TA 3S78B 3NB5A 3S71B 1CNBA 1RAYA 5G03A 3V3FA 2HKKA 3RYZA 5FL5A 1BICA 1H4NA 1HCAA 1CAKA 1BN3A 2NXRA 4ZWIA 5FDIA 1CAZA 4RH2A 3OILA 4MDGA 4QJMA 1DCAA 5EIJA 4L5UA 1CVFA 4WL4A 3S97A 3DBUA 2CBBA 1YDCA 1FSQA 1OKNA 4HBAA 1AZMA 1UGAA 1CCUA 4FPTA 4N16A 4Q08A 3M2NA 1F2WA 1G6VA 3KOKA 3N0NA 4QJXA 3CA2A 2FW4A 1TG9A 1CRMA 1G52A 3N3JA 4Q49A 5JDVB 2CBDA 3SAPA 1JV0A 3DD8A 4FL7A 1CALA 3P5AA 3D92A 2VVAX 2OSMA 4QSIA 4ZAOA 1BNWA 1TE3X 5FNJA 3T82A 3S9TA 1I8ZA 3MNIA 1CVAA 3OKVA 1AM6A 3U3AX 4KNNA 3P5LA 1RAZA 1G46A 4XFWA 1G53A 4QIYA 2POUA 3MHCA 1CNHA 3MNKA 3M40A 3M1QA 1YO2A 2NXSA 3F8EA 1G1DA 2F14A 4E49A 1BNMA 3V7XA 4CNWA 1KWRA 1I9PA 2HD6A 2WEOA 5FL4A 4RUXA 1IF7A 4N0XB 3SAXA 1TB0X 4KUYA 1I9LA 1BNTA 4FU5A 1ZGFA 1CNWA 1G48A 1V9IC 1Z93A 3T85A 4L5WA 2CBEA 4Q0LA 4HT0A 2WEGA 4KNIA 3HKQA 3P3HA 4QIZA 5BRUA 1Z9YA 4K1QA 2NMXA 3JXGA 1UGEA 5BYIA 4M2VA 4MLXA 4Q78A 3IBIA 4RUZA 1CVEA 4ILXA 1CNXA 1RZBA 4QK3A 4RIVA 4DZ7A 1XQ0A 5JG3B 4M2RA 4HU1A 4LHIA 3V2MA 4XIWA 1ZNCA 5EZTX 5FLRA 4HF3A 3F7UA 3RG3A 2ILIA 2Q38A 4MDMA 5EKHA 4Q6DA 4KV0A 1I90A 3P44A 1HEAA 3D93A 3W6IA 4YGNA 5JEGB 3V3JA 1CNGA 3V2JA 1CA3A 1CVCA 4ZX0A 5SZ3A 4YXOA 4XIXA 4Z1KA 4DZ9A 1I9QA 4CA2A 1OKMA 3MHIA 5SZ4A 4Y0JA 3MNAA 3M1WA 5A6HA 1UGBA 1HEBA 4MLTA 2H15A 4WW8A 4CQ0A 5FNGA 2NN7A 4Q07A 1MUAA 4UOVA 3LXEA 5EKJA 1ZFQA 1H9NA 3KOIA 3M5EA 3HS4A 4K13A 4Q99A 4QJOA 4Q7WA 3T5UA 3K34A 1CAOA 2FNKA 1G0EA 4XZ5A 5G0BA 4YXIA 3CZVA 2NWPA 1ZH9A 5DSMA 3DV7A 4R5AA 1FQRA 5J8ZA 3U45X 4PZHA 3KS3A 5E2MA 4YYTA 1FSRA 1UGDA 2EZ7A 2NNGA 1A42A 5L3OA 3EFIA 3ML2A 1UGCA 4E3FA 2VVBX 4Q09A 2CA2A 3OYQA 1J9WA 3M5SA 1BN4A 2NXTA 4CNXA 2QO8A 3KONA 1CAIA 1HUHA 5E28A 2WEHA 3DD0A 4Q87A 3M14A 4HEYA 4M2WA 5AMDA 5IPZA 4Q7VA 5L6KA 4K0SA 2GEHA 2WD2A 4QSAA 4FIKA 2FOUA 3DA2A 5DOGA 5E2KA 3RZ5A 5CA2A 3MWOA 3BL0A 2AX2A 5A25A 5DVXA 5BRVA 5SZ1A 2GD8A 3RGEA 1TH9A 1CNJA 4BCWA 3B1BA 4KP8A 2FOYA 4Q7SA 1CVBA 4BF1A 5E2NA 3BL1A 1URTA 3PJJA 3F4XA 8CA2A 4PQ7A 4TWMA 2X7UA 1CVDA 4RFDA 5AMGA 3TVOX 3V3HB 4FVNA 5JGTB 1LG6A 1YDBA 1BV3A 4LU3A 3L14A 4KAPA 1HUGA 1TBTX 5FDCA 3OIMA 3OY0A 4Z1JA 3MHLA 5FLPA 1UGGA 3MDZA 3RYVB 1H9QA 1ZSCA 1DCBA 5DSOA 4Q7PA 12CAA 5EH5A 4JSWA 5C8IA 3T83A 5JQTA 3IAIA 4JSZA 4Q8YA 5EHEA 3S75B 4PXXA 5DSKA 3JXFA 4PYXA 4K0ZA 1I91A 4QTLA 2NNSA 3KLDB 3S8XA 3M2YA 2X7SA 3P58A 4FRCA 3RG4A 1G0FA 1IF4A 5FNLA 5JGSB 3RJ7A 3ML5A 3RYXB 5EH8A 2FMZA 5FNIA 1FLJA 2NWOA 5EH7A 1XPZA 4QEFA 2H4NA 3TVNX 3CAJA 3D9ZA 3N2PA 3DC3A 5FNKA 2FMGA 5EHVA 4ZX1A 4YGLA 3HFPA 3C7PA 3U47A 4MTYA 3FE4A 3QYKA 3Q31A 5JEHB 3HKUA 4QJPA 1JD0A 1KOQA 4YGJA 5JEPB 3F7BA 2ABEA 1FQNA 1I9OA 3RZ0B 5DSLA 4ETQC 2WEJA 5DSRA 5HPJA 1V9EA 3B4FA 1LG5A 3K7KA 4ZWZA 2FOVA 1KEQA 4Q9YA 6CA2A 1G4JA 4JSSA 2HFWA 3SBHA 2HL4A 1BZMA 4E3DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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