5CACA

Refined structure of human carbonic anhydrase ii at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE FORM C
publication title Refined structure of human carbonic anhydrase II at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1991-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5cacA00
3FFPX 3OIKA 3IAIA 3S76A 1BNQA 1H9QA 5E28A 4MTYA 1JV0A 4R5BA 3RZ8A 3KNEA 1IF9A 4KNMA 1G1DA 1CVDA 1CAZA 3OIMA 1CZMA 4BCWA 3MMFA 3KLDB 3T83A 3TVNX 1CA3A 1BNMA 1YDDA 2OSMA 3MNAA 4XIWA 1G3ZA 1G52A 4CNRA 5BYIA 1G4JA 2NNOA 5L3OA 3U45X 2NMXA 3S74B 1XPZA 4XFWA 3KONA 3RZ5A 1YDAA 2WD3A 3T84A 4E5QA 3CAJA 4QJPA 3RYZA 4CACA 1ZFKA 1BNTA 3M2YA 1FR7A 5JEPB 3M3XA 3JXHC 5DSMA 5G01A 1F2WA 4HBAA 3MHMA 4Q07A 3F4XA 2AX2A 3RG4A 8CA2A 2CBBA 4CNXA 4KNJA 3SBIA 1FLJA 1OKLA 3M98A 5DVXA 3V7XA 5BRUA 1BNUA 1THKA 5DSKA 4R5AA 2FMGA 3D93A 1CVBA 3N4BA 4ZX0A 5JG5B 4MDLA 1LG5A 1CCUA 4Z1JA 4K0TA 3Q31A 3T5UA 5FNHA 1ZSBA 3BL1A 5CJFA 1ZFQA 5E2MA 1I90A 1CA2A 2W2JA 3UYNA 3PO6A 4QSJA 1Y7WA 5CACA 1LGDA 3W6IA 1CNKA 1CAOA 1I8ZA 4KNNA 3F7UA 1HUHA 5G0BA 1CAHA 3TMJA 1CAKA 2NWOA 5FLSA 1ZNCA 5CLUA 3U3AX 1Z93A 3M2NA 2POVA 1TBTX 2Q1BA 3P44A 4JSAA 1DMYA 1BNNA 1IF7A 3RYVB 2FNMA 2H15A 3HKNA 3M5EA 3P55A 4RFDA 1TG9A 3CYUA 3OKUA 1CVCA 4RIUA 2NXTA 3U7CA 4MLXA 1CAIA 4Q08A 5LMDA 3RYJB 4QSAA 5DOGA 3DD0A 4Q7SA 1BNWA 4MDMA 1CNWA 4LHIA 4WR7A 2Q1QA 6CA2A 5FDIA 5SZ2A 4YGLA 4ETQC 1RJ6A 4PQ7A 1MUAA 3DBUA 5E2KA 4YX4A 1FQRA 4E49A 1I9PA 5JQTA 3T5ZA 4FU5A 1CANA 1DMXA 4ZX1A 4C3TA 4Q7VA 1I9NA 1CILA 1T9NA 2X7UA 4Q83A 1CIMA 3TVOX 3GZ0A 4Q7PA 1G54A 3M2ZA 3RLDA 4YXUA 2CBEA 3MZCA 5FLTA 4Q81A 4L5VA 3V5GA 5AMLA 3L14A 3EFIA 3SAPA 5EKMA 4CA2A 4Q9YA 4QSBA 1CCTA 3RZ1B 1CRAA 2OSFA 3M04A 4YGJA 3S78B 4Q7WA 5BRWA 3NI5A 2X7SA 3IBIA 4QK1A 3K34A 4M2RA 4LU3A 4M2VA 4HEWA 2NNVA 5E2SA 3DV7A 3MHOA 1G0EA 1CVFA 5JGTB 5SZ6A 4YWPA 2WEGA 1UGCA 1UGDA 2FOVA 4MO8A 1TEQX 4GL1X 4QEFA 5EHVA 1YDCA 1HEAA 1G4OA 3S73B 4ZWZA 2F14A 4K1QA 4KNIA 4QK3A 3MNJA 4FVNA 3OY0A 5L6KA 3W6HA 3ZP9A 5E5UA 4RUZA 5FNJA 5EHEA 1CAMA 3D9ZA 3DVDA 1URTA 4KP5A 4KUVA 2WEJA 3S9TA 4M2UA 1RAZA 1IF4A 4L5WA 3RG3A 4E3FA 2HD6A 4JSWA 3DAZA 3HKTA 4WL4A 1RJ5A 3M2XA 4IDRX 4UOVA 1TEUX 7CA2A 1CRMA 2FOQA 2POWA 1BN1A 3CA2A 1RZEA 5EH8A 3MNKA 3K7KA 5JGSB 2NN7A 1I91A 4FL7A 1TE3X 1CAJA 4N16A 1FSQA 1CALA 1LUGA 1V9EA 1TG3A 4CNWA 4G7AA 1RZBA 5SZ0A 1CNYA 3F8EA 5EH5A 1HEDA 1KWRA 4Q8YA 5BNLA 5SZ4A 3OYSA 3DCWA 5FLQA 4HF3A 4E9OX 1CNXA 3DD8A 3DVCA 5JQ0A 9CA2A 2POUA 1FQNA 3M96A 3P3HA 3MNIA 4L5UA 4CQ0A 2NWPA 4Q6EA 3S75B 4BF6A 4FPTA 5FLRA 3IEOA 4N0XB 1YO1A 4RUYA 5DSIA 4E3DA 3M1JA 2QP6A 1RZCA 3BETA 4WUQA 4ZWIA 4QJXA 3RYYA 3M1QA 5SZ1A 1BCDA 4MDGA 5DSPA 2CBDA 4QTLA 1CVHA 3FW3A 1HECA 1FSRA 5DSNA 5HPJA 1CVAA 4RIVA 2EZ7A 3MYQA 4KUWA 4FVOA 5JEHB 4CNVA 4PYYA 3ML5A 2WD2A 2Q38A 4RFCA 1V9IC 12CAA 4XE1A 3S97A 1CNHA 5FLOA 1OKNA 3KKXA 2VVBX 2HL4A 1I9OA 4HEZA 4COQA 4QY3A 1LZVA 3MWOA 5E2NA 4ZWYA 3MDZA 5JEGB 1MOOA 4YHAA 3U47A 4WW8A 3V3GB 1J9WA 3D92A 1OKMA 3IBUA 1HVAA 2X7TA 3PJJA 1HUGA 1XEVA 4QJ0A 4QJWA 4YYTA 2NWZA 1YDBA 1H9NA 4Q99A 1G48A 3M5SA 2ABEA 3OYQA 1IF8A 5DOHA 4IWZA 4DZ7A 2HFWA 4HU1A 3DA2A 3C7PA 1CAYA 4JS6A 4FRCA 2NXSA 5SZ3A 4Z1KA 1Z9YA 1BICA 1CNJA 4PYXA 1AZMA 3KIGA 4LP6A 1DCAA 2QO8A 3ZNCA 2O4ZA 1UGAA 3M14A 3D8WA 5J8ZA 1KOQA 4WW6A 2NXRA 1BZMA 1G45A 1G6VA 3M1KA 4K0ZA 3MNUA 1RZDA 2FOSA 2IT4A 1UGEA 4WUPA 3VBDA 3P3JA 3B1BA 1BV3A 4QJMA 3S77B 5FNKA 1G0FA 3RZ0B 4ZAOA 2NNSA 3RYXB 3FE4A 3OILA 1HCAA 3MHCA 1ZH9A 2WEOA 3KOKA 1FQLA 1I9QA 4Q09A 4XZ5A 5G03A 2NN1A 4TWLA 2FMZA 3F7BA 3S71B 3RJ7A 2NWYA 2ZNCA 4YVYA 1G46A 5EKHA 5AMGA 1FSNA 4K0SA 3V3IB 5EIJA 1CCSA 1YO0A 3KOIA 4Q6DA 5EH7A 4ITOA 5G0CA 5IPZA 5JG3B 5FNLA 3HS4A 3OKVA 1TTMA 4Q06A 2NNGA 4YGKA 4YGFA 3P4VA 2FNNA 3MNHA 1UGBA 1AM6A 2H4NA 5JESB 2VVAX 4BF1A 3BL0A 1EOUA 3HLJA 3JXGA 5A6HA 5SZ5A 1A42A 5FNIA 2GD8A 3EFTA 1CNBA 1G53A 1I9LA 4MLTA 5E2RA 5AMDA 2ILIA 4ZWXA 3M1WA 1XEGA 3CZVA 4QIYA 4X5SA 3DC3A 1LG6A 4PZHA 5EZTX 5C8IA 5EHWA 4RUXA 1ZGEA 5EOIA 2HKKA 1BN4A 2FW4A 5FL4A 1FQMA 4R59A 3RZ7A 4TWMA 4E3GA 4ITPA 1JCZA 3V2MA 2CBAA 4Z1NA 4RN4A 3P5LA 4QJOA 3T82A 1FR4A 3HKQA 3M5TA 1CVEA 3KS3A 3B4FA 1OQ5A 1YO2A 5FL5A 2AW1A 3N0NA 4FIKA 4KAPA 1IF5A 1CNIA 5FNMA 1IF6A 4RH2A 1KOPA 5FLPA 4YXOA 1RZAA 4HEYA 4YXIA 4QSIA 2FOYA 5DSJA 1RAYA 1BNVA 4JSSA 3RGEA 1DCBA 3NJ9A 4KP8A 1XQ0A 4Q78A 2CA2A 1CNCA 3DVBA 1CINA 3D0NA 3R17B 3KWAA 3V2JA 3IBNA 5E5RA 4Q8XA 4JSZA 1AVNA 2GEHA 1TB0X 1BN3A 1KEQA 3UYQA 5DSQA 1ZSAA 2WEHA 3M67A 3LXEA 4Q87A 5DSOA 5DSRA 1ZE8A 1I9MA 3NB5A 4Y0JA 2FNKA 4G0CA 5CA2A 3K2FA 3S72B 4PXXA 3HFPA 4M2WA 5FNGA 3DC9A 5FL6A 3T85A 4YGNA 4Z0QA 1H4NA 4Z1EA 2FOUA 3V3JA 4DZ9A 4ILXA 2EU3A 2CBCA 1UGGA 3ML2A 3V3FA 4E4AA 2QOAA 4HT2A 3IBLA 3N2PA 3JXFA 3S8XA 1CNGA 4KV0A 5SZ7A 5DSLA 3SAXA 4Q49A 5DRSA 5BRVA 3SBHA 3M40A 4QIZA 3IGPA 1UGFA 1KWQA 4KUYA 4E3HA 4Q0LA 4HT0A 3MHLA 1HCBA 3P58A 5FDCA 3P5AA 3QYKA 3DCCA 4K13A 3HKUA 1ZGFA 1JD0A 3R16A 4QK2A 5A25A 5EKJA 2CABA 3MHIA 1ZSCA 1Z97A 2EU2A 3N3JA 1TH9A 3PYKA 4XIXA 1HEBA 4Q8ZA 3V3HB 3DCSA 5JDVB 2HOCA 2HNCA 4Q90A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FFP X;  3OIK A;  3IAI A;  3S76 A;  1BNQ A;  1H9Q A;  5E28 A;  4MTY A;  1JV0 A;  4R5B A;  3RZ8 A;  3KNE A;  1IF9 A;  4KNM A;  1G1D A;  1CVD A;  1CAZ A;  3OIM A;  1CZM A;  4BCW A;  3MMF A;  3KLD B;  3T83 A;  3TVN X;  1CA3 A;  1BNM A;  1YDD A;  2OSM A;  3MNA A;  4XIW A;  1G3Z A;  1G52 A;  4CNR A;  5BYI A;  1G4J A;  2NNO A;  5L3O A;  3U45 X;  2NMX A;  3S74 B;  1XPZ A;  4XFW A;  3KON A;  3RZ5 A;  1YDA A;  2WD3 A;  3T84 A;  4E5Q A;  3CAJ A;  4QJP A;  3RYZ A;  4CAC A;  1ZFK A;  1BNT A;  3M2Y A;  1FR7 A;  5JEP B;  3M3X A;  3JXH C;  5DSM A;  5G01 A;  1F2W A;  4HBA A;  3MHM A;  4Q07 A;  3F4X A;  2AX2 A;  3RG4 A;  8CA2 A;  2CBB A;  4CNX A;  4KNJ A;  3SBI A;  1FLJ A;  1OKL A;  3M98 A;  5DVX A;  3V7X A;  5BRU A;  1BNU A;  1THK A;  5DSK A;  4R5A A;  2FMG A;  3D93 A;  1CVB A;  3N4B A;  4ZX0 A;  5JG5 B;  4MDL A;  1LG5 A;  1CCU A;  4Z1J A;  4K0T A;  3Q31 A;  3T5U A;  5FNH A;  1ZSB A;  3BL1 A;  5CJF A;  1ZFQ A;  5E2M A;  1I90 A;  1CA2 A;  2W2J A;  3UYN A;  3PO6 A;  4QSJ A;  1Y7W A;  5CAC A;  1LGD A;  3W6I A; 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