5CACA

Refined structure of human carbonic anhydrase ii at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE FORM C
publication title Refined structure of human carbonic anhydrase II at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase(oxo-acid)
total genus 78
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1991-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5cacA00
3D9ZA 3MHIA 4XIWA 4Q8ZA 4M2RA 4Z1EA 1CNIA 4KNMA 3KOKA 1CRMA 2WEHA 3FFPX 3HKQA 3S77B 3BL1A 3C7PA 3RZ7A 1IF6A 5FL5A 1CCSA 1YDBA 4JSAA 3P44A 1UGBA 2ABEA 5JEHB 1CNWA 5DSKA 3TVNX 4Q07A 2NNGA 3MNAA 1I90A 3RYYA 3JXHC 3M2XA 2HKKA 1UGCA 1BNUA 4QK1A 3V2MA 2CBEA 4LU3A 3GZ0A 4BF6A 4TWLA 6CA2A 2WEGA 1TH9A 4C3TA 1EOUA 2NN7A 1RZCA 1UGFA 1BZMA 4FVNA 1ZFKA 3M1QA 4Z1NA 5SZ4A 1UGDA 3P3JA 4E49A 3MNIA 4K1QA 4KNJA 5CA2A 3M5TA 2WEJA 5L6KA 1CRAA 1ZGFA 5JEPB 3F8EA 2GEHA 1CVHA 3DD0A 2CBDA 3HFPA 3U47A 1YO2A 3IEOA 4Q6DA 1CINA 2CBBA 2NWOA 3D92A 4YYTA 3DCWA 3VBDA 2NXSA 3V3IB 3KWAA 2W2JA 1G3ZA 1XQ0A 3FE4A 3M04A 4Q09A 4KUWA 4RIUA 1BNVA 4Q9YA 1G53A 1Z93A 3RGEA 4YGLA 4RFDA 2WEOA 4LHIA 4YGNA 2OSFA 1DCAA 5DOGA 1CANA 1MOOA 5FLTA 4MDMA 5SZ3A 5JGTB 1KWQA 1RJ5A 3K2FA 1FSNA 1AVNA 1RAZA 3KONA 3M14A 4YVYA 3MHCA 1BN1A 1CNYA 1G4JA 1YDCA 1TTMA 4TWMA 3M40A 3MDZA 2GD8A 3KIGA 3ZNCA 3N3JA 4XE1A 3DCCA 3OILA 3CAJA 3IBUA 3T5ZA 4MDGA 4Q6EA 1G0EA 4G0CA 3MMFA 1UGAA 5DSQA 1BNQA 4FRCA 5DRSA 4ZWXA 5HPJA 4QSJA 1V9IC 4QJMA 4N16A 3MZCA 4K0SA 2WD2A 3OIKA 5DSIA 3S97A 3CA2A 1CALA 4YGJA 1CIMA 5DSNA 1CNBA 2VVBX 3BETA 1CAMA 3B1BA 1ZSAA 5DSJA 3MWOA 4QY3A 1ZGEA 4YWPA 1HCBA 5C8IA 4MLTA 2FMZA 5AMLA 5CJFA 1THKA 4QSBA 4DZ9A 1G46A 2HFWA 1CA3A 5E5RA 5FL4A 3IAIA 2CA2A 2Q1QA 2ZNCA 4PXXA 3MNKA 4XZ5A 3MNUA 1I9NA 3KS3A 5JG3B 1CVCA 1G52A 5G01A 1FQMA 5SZ0A 1ZE8A 3U45X 1CAKA 1TBTX 4ZAOA 5EZTX 1LZVA 2QP6A 1CNXA 1LG6A 2CBAA 5JGSB 3JXGA 3MNJA 4ZX1A 3W6HA 3F7BA 5DSMA 4ZWIA 3F7UA 4ZX0A 1ZSBA 4Q8XA 1HUGA 4KUYA 3N4BA 1KOQA 5JEGB 4QTLA 3R16A 3RZ8A 1ZSCA 4RFCA 1LUGA 4QEFA 5CLUA 2FOYA 3RYJB 3M67A 4COQA 1CNKA 3MNHA 1FLJA 3S9TA 4WL4A 4XFWA 4HEWA 5FNIA 2FOUA 4KNIA 4Z1KA 2POUA 3M1KA 3HKTA 5DOHA 4GL1X 5SZ1A 1LGDA 5BRUA 2FNMA 1CNGA 1KWRA 3RG3A 4Q7VA 3Q31A 3SAPA 5FNLA 3DVCA 1HEAA 4Q06A 3D8WA 4YXUA 5SZ7A 4UOVA 1HECA 1I91A 4Q0LA 4K13A 3S74B 2EZ7A 3L14A 4XIXA 3T83A 2WD3A 1CILA 3M2NA 4QJXA 2QOAA 3DVBA 1ZFQA 4QK3A 5J8ZA 5FL6A 1KEQA 4YHAA 3UYQA 4PQ7A 1CAHA 2NXRA 1KOPA 4Q08A 5EHEA 4Z1JA 5DSLA 4HU1A 2X7SA 1TB0X 4HT2A 2FOQA 4FIKA 5FNKA 5CACA 1TE3X 5L3OA 2POWA 4JSZA 4M2UA 4R59A 5FLQA 5FNHA 1I9OA 5EH5A 3FW3A 2HL4A 5BRVA 4Q81A 4MDLA 2FOVA 4Q7WA 1FSQA 3S75B 1DMYA 3IBIA 1IF9A 1XPZA 4HF3A 4YX4A 5E28A 1H9QA 3NI5A 1I9PA 3MHMA 4L5UA 1CVAA 5EIJA 1FQRA 2AW1A 1DCBA 3EFTA 3M2YA 4IDRX 4ITPA 2NXTA 1CZMA 3M96A 1BCDA 4IWZA 5FLSA 5FLPA 1I9MA 4WW6A 2X7UA 1CNCA 2FNNA 3P55A 4Y0JA 1G0FA 2FNKA 2NMXA 3M5SA 4ITOA 5IPZA 1ZH9A 5AMGA 3TMJA 5JESB 2Q38A 5DSOA 3U7CA 3DC3A 5E2KA 3LXEA 1JD0A 1OKMA 1CAJA 4Q49A 4E3HA 1RJ6A 1H9NA 2NWYA 1TG3A 3KNEA 4E3DA 4CNWA 8CA2A 3W6IA 3N0NA 4RN4A 4MTYA 3V3GB 3T84A 4R5AA 1CVFA 4FPTA 4RUYA 4QJ0A 4JSSA 3TVOX 1URTA 1CNHA 3MHOA 4JSWA 2FW4A 4K0ZA 1I8ZA 4E3GA 3M1WA 5SZ5A 3NB5A 5G0CA 4BCWA 3KLDB 1YDDA 4FU5A 5BNLA 3OY0A 3QYKA 4KP8A 1HEDA 5BRWA 3DVDA 5A6HA 4KAPA 5FDCA 1BICA 2AX2A 5E2MA 3T85A 4DZ7A 3P4VA 1Y7WA 5AMDA 5G0BA 3CZVA 3KOIA 3P5AA 5SZ6A 4ZWZA 1J9WA 3DBUA 1HUHA 4CA2A 3B4FA 2IT4A 4FVOA 4WR7A 5LMDA 3RLDA 1G45A 2HNCA 12CAA 1IF7A 1I9QA 1BN4A 3D93A 3ZP9A 3PYKA 1IF8A 1I9LA 3NJ9A 4Q78A 5FLRA 1BNMA 5DSRA 5JQTA 3SAXA 3S71B 1T9NA 3S73B 4Q87A 3N2PA 3DV7A 3K7KA 4WW8A 2EU3A 4E4AA 1RZDA 3DD8A 4YXOA 3PO6A 4MO8A 1BNNA 4L5VA 4YGFA 4PYXA 1IF5A 2ILIA 4CNVA 3V3JA 5JDVB 1F2WA 2NWPA 5E2RA 7CA2A 5SZ2A 1CAOA 3SBHA 1CVEA 3SBIA 3JXFA 4PZHA 4KUVA 4YXIA 3MYQA 4E5QA 4HEYA 4ETQC 3T5UA 5EKJA 1XEVA 1G54A 4QIYA 1UGGA 3RYXB 3IGPA 4QSAA 1YDAA 2NNVA 3RJ7A 5G03A 3M98A 4Q8YA 1CAYA 3V7XA 9CA2A 3IBLA 1Z9YA 3OKUA 3BL0A 4HT0A 3HS4A 1H4NA 1YO1A 1V9EA 5DSPA 1G48A 2NNOA 3V2JA 4Q99A 3UYNA 4LP6A 3DCSA 4WUQA 2X7TA 3PJJA 1FSRA 4JS6A 1RZEA 4WUPA 5EKHA 1IF4A 3RYZA 4QJWA 4X5SA 2QO8A 3M3XA 3RZ1B 5A25A 3K34A 1OKNA 1RZAA 3OIMA 3CYUA 5EH8A 4Q7SA 3ML5A 5E2SA 1UGEA 3U3AX 2O4ZA 3P58A 1BN3A 3P3HA 4RUZA 1TEUX 3DC9A 5EHVA 2EU2A 4ILXA 3V3HB 1CNJA 1FQLA 1HEBA 1Z97A 5EOIA 4Q83A 4Q90A 3M5EA 1MUAA 3RG4A 3RYVB 3D0NA 2NN1A 1DMXA 3S72B 5JG5B 1CAIA 3HLJA 1OKLA 3EFIA 4HEZA 3S8XA 1A42A 1JV0A 2HD6A 4E9OX 3R17B 4RIVA 5BYIA 4CQ0A 4CACA 1YO0A 4K0TA 1BV3A 4PYYA 3M1JA 4Q7PA 4R5BA 1CVDA 5FDIA 3M2ZA 4RH2A 4Z0QA 4QSIA 1HVAA 3IBNA 4ZWYA 3OKVA 1CAZA 1AM6A 1LG5A 3V3FA 1CCUA 4KNNA 1CCTA 5E5UA 1AZMA 4QK2A 3RZ0B 3HKNA 2CABA 3OYSA 4HBAA 4M2WA 3HKUA 2F14A 5FNMA 4N0XB 2CBCA 2NNSA 3S76A 2POVA 3F4XA 1CA2A 1ZNCA 3DA2A 4RUXA 2Q1BA 5JQ0A 2OSMA 4CNXA 5FNJA 3V5GA 1FR4A 3RZ5A 1FQNA 4FL7A 4KP5A 1BNWA 5FLOA 4KV0A 5FNGA 5E2NA 2FOSA 3S78B 4BF1A 4YGKA 1HCAA 4QJPA 1TEQX 1JCZA 1TG9A 5EKMA 1G4OA 3DAZA 1OQ5A 4MLXA 4QIZA 2FMGA 1BNTA 2H4NA 3T82A 4L5WA 4E3FA 1CVBA 5DVXA 1RAYA 2NWZA 3MHLA 4CNRA 1XEGA 3OYQA 1RZBA 4G7AA 3KKXA 3P5LA 1FR7A 1G6VA 2HOCA 3ML2A 4QJOA 1G1DA 2VVAX 4M2VA 5EH7A 5EHWA 2H15A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3D9Z A;  3MHI A;  4XIW A;  4Q8Z A;  4M2R A;  4Z1E A;  1CNI A;  4KNM A;  3KOK A;  1CRM A;  2WEH A;  3FFP X;  3HKQ A;  3S77 B;  3BL1 A;  3C7P A;  3RZ7 A;  1IF6 A;  5FL5 A;  1CCS A;  1YDB A;  4JSA A;  3P44 A;  1UGB A;  2ABE A;  5JEH B;  1CNW A;  5DSK A;  3TVN X;  4Q07 A;  2NNG A;  3MNA A;  1I90 A;  3RYY A;  3JXH C;  3M2X A;  2HKK A;  1UGC A;  1BNU A;  4QK1 A;  3V2M A;  2CBE A;  4LU3 A;  3GZ0 A;  4BF6 A;  4TWL A;  6CA2 A;  2WEG A;  1TH9 A;  4C3T A;  1EOU A;  2NN7 A;  1RZC A;  1UGF A;  1BZM A;  4FVN A;  1ZFK A;  3M1Q A;  4Z1N A;  5SZ4 A;  1UGD A;  3P3J A;  4E49 A;  3MNI A;  4K1Q A;  4KNJ A;  5CA2 A;  3M5T A;  2WEJ A;  5L6K A;  1CRA A;  1ZGF A;  5JEP B;  3F8E A;  2GEH A;  1CVH A;  3DD0 A;  2CBD A;  3HFP A;  3U47 A;  1YO2 A;  3IEO A;  4Q6D A;  1CIN A;  2CBB A;  2NWO A;  3D92 A;  4YYT A;  3DCW A;  3VBD A;  2NXS A;  3V3I B;  3KWA A;  2W2J A;  1G3Z A;  1XQ0 A;  3FE4 A;  3M04 A;  4Q09 A;  4KUW A;  4RIU A;  1BNV A;  4Q9Y A;  1G53 A;  1Z93 A;  3RGE A;  4YGL A;  4RFD A;  2WEO A;  4LHI A;  4YGN A;  2OSF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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