5EKHA

Human carbonic anhydrase ii complexed with a two-faced guest
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Programming A Molecular Relay for Ultrasensitive Biodetection through (129) Xe NMR.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5ekhA00
3KIGA 1ZGFA 4RIVA 4QJWA 3MHMA 3HKUA 1CCUA 5JQ0A 3DVDA 2NNGA 1KOPA 4ITPA 1RJ6A 3RZ7A 4WR7A 4YXIA 1CNJA 4IWZA 3C7PA 1FSRA 3V3GB 3DD0A 5EHEA 4C3TA 1CVEA 3MNUA 2NNVA 4Q9YA 1CAOA 5FL5A 1G46A 6CA2A 1TBTX 2CA2A 3MHOA 3V7XA 3FE4A 4HEWA 2IT4A 4ZWIA 4G0CA 1BNVA 4QJXA 3KOKA 1CCTA 3KONA 2H15A 1DCAA 1IF7A 1OKLA 4MDLA 3T5UA 2POUA 3P5AA 3M67A 3SAPA 5DRSA 4L5UA 1J9WA 3PYKA 3HKQA 5L3OA 3TVOX 4YXUA 3S71B 4MTYA 4ZX1A 5DSRA 2FOSA 1YDCA 3D9ZA 1G52A 4YHAA 5LMDA 4Z1KA 2CBEA 2H4NA 4PYYA 2FOUA 5JGSB 4Q08A 4CACA 4E4AA 4QK2A 2HL4A 1CNWA 1KWRA 4Q8YA 5SZ6A 2WEHA 2NWPA 1XPZA 3HFPA 4LU3A 4K1QA 1EOUA 4JSAA 3PO6A 1LG5A 1Z97A 4QK1A 1FLJA 1IF5A 2OSMA 3RZ0B 4Q09A 3RG3A 3D0NA 2QP6A 1HUHA 1RZBA 2NXSA 1TTMA 4BF1A 3JXFA 4Q81A 2EU2A 1ZSBA 3QYKA 2ZNCA 5FLSA 2WEOA 12CAA 1CIMA 1AVNA 1UGAA 1YO0A 3W6HA 3RZ5A 3M2NA 1HEBA 3CYUA 4COQA 5EKHA 1URTA 1YO1A 1FSNA 1G3ZA 4M2WA 5EHWA 1CINA 5G0BA 3S9TA 1BICA 3F7BA 4MLXA 1BNNA 5FLRA 5E2KA 3RGEA 3T85A 1FSQA 1CRMA 3M2XA 3ML2A 4KP8A 2HFWA 1H9NA 1G0FA 1G6VA 1HEAA 3MNIA 5EH7A 4FU5A 4Q6EA 1CVCA 1RZEA 4XFWA 5CLUA 3T84A 5IPZA 1ZFKA 1CAIA 2Q38A 4JS6A 1CALA 1H9QA 4RIUA 5E28A 3V3FA 4K13A 5A6HA 3S77B 5SZ0A 3P4VA 4MLTA 1I9OA 5FNLA 4YYTA 3MHLA 5DSJA 2FMGA 4BF6A 3S73B 2FNKA 4RH2A 5EKJA 5SZ7A 1G4JA 1V9EA 5JEGB 2Q1QA 2X7SA 4L5WA 5FLTA 2FOQA 4DZ9A 5FNGA 3JXGA 1G53A 4JSZA 1DMYA 1ZE8A 3OYQA 5EH5A 1CA3A 4E49A 4ITOA 4FVOA 1XQ0A 1F2WA 9CA2A 3S8XA 3SBHA 1DCBA 3V3JA 4YGLA 4QJPA 5E2RA 4KUVA 4E5QA 4QJOA 2AX2A 4ZX0A 4FL7A 4QSIA 4QSJA 2QOAA 3IBUA 1ZNCA 2FW4A 5EIJA 4PYXA 4FVNA 2X7UA 1CZMA 4YGFA 4YXOA 5BRUA 5FDIA 4CA2A 4M2UA 3OIMA 3K7KA 1I9QA 2NXRA 3M96A 3HLJA 5DSMA 5FNHA 5DOHA 3P58A 3M1QA 3U3AX 4YGKA 5FL6A 1IF8A 5G0CA 2ILIA 3UYNA 4N0XB 3MHIA 4HF3A 2FMZA 3DVCA 4M2RA 3DA2A 1OKNA 1TE3X 5E2MA 1G48A 4Z1JA 1ZFQA 2FNMA 4ZWXA 3DCWA 3B1BA 4QSBA 4Q07A 1I9PA 5BYIA 1BV3A 1CRAA 2NWYA 4R59A 5DSQA 5FDCA 4CNWA 1IF9A 4R5AA 4DZ7A 5DSKA 5FNMA 4CNXA 1I8ZA 3V2MA 3B4FA 1TEUX 1RAYA 4WW8A 5E5RA 4R5BA 3N0NA 3OYSA 5FNKA 1HEDA 1UGEA 4ZWYA 3IBLA 2OSFA 3SAXA 4ILXA 4Q8ZA 2CABA 4KNJA 3BETA 3V3IB 3IBIA 1V9IC 3T5ZA 4ZAOA 3L14A 2FOVA 1HCAA 2CBBA 2CBAA 4Q7PA 5HPJA 3OKUA 1LGDA 3OY0A 2VVBX 4Q0LA 4QEFA 5BRWA 1A42A 1YDBA 3S78B 1IF4A 3DD8A 3OIKA 1CAYA 1UGFA 3MZCA 3RZ1B 5BNLA 1CNKA 3PJJA 5EZTX 1YO2A 1CVAA 3KNEA 1H4NA 3S97A 3EFTA 3SBIA 4E3GA 5SZ3A 4MDMA 4FPTA 4G7AA 1FQLA 1I9LA 1CAKA 1IF6A 3M14A 4KV0A 4PZHA 5AMGA 1ZSCA 4E3FA 3F4XA 4CQ0A 4KUYA 1JV0A 3RLDA 3RZ8A 4KNIA 1CANA 4L5VA 2HOCA 4KUWA 1LG6A 1RAZA 1OKMA 4QIZA 1CAHA 1FR4A 4QTLA 5JG5B 3N4BA 2CBDA 3RYZA 1XEGA 2EZ7A 2WD3A 4RUZA 4WUPA 3DVBA 1JD0A 3OILA 4RFDA 3KLDB 5JESB 3DCCA 3M5TA 3RJ7A 3IBNA 2NN1A 2NMXA 1I9MA 3JXHC 1UGBA 3V2JA 4Z1EA 2CBCA 5JEHB 2POWA 5SZ5A 4Q90A 3CAJA 4Q7WA 5DVXA 3UYQA 3Q31A 3NJ9A 1CNCA 4QY3A 1CA2A 3DC9A 5DSIA 4YVYA 1ZH9A 1Y7WA 4WL4A 2GEHA 2NWOA 3IAIA 1AM6A 1HVAA 5JEPB 5FNJA 1TEQX 4CNVA 4GL1X 1BNTA 1KWQA 1RZCA 1OQ5A 3N2PA 1BNQA 4YGJA 3HKTA 4KNMA 4RN4A 5FLPA 5CJFA 3DCSA 1TG3A 4Q99A 4E3DA 2WD2A 3P44A 4LHIA 3GZ0A 3P5LA 5DSPA 4QK3A 4Q83A 4WW6A 3MYQA 5DSOA 1UGDA 2NXTA 4M2VA 2AW1A 3D92A 2F14A 3M40A 5G03A 1BCDA 2FNNA 3CZVA 1XEVA 4XIXA 5DSLA 1CNBA 3M2YA 4Q87A 3IGPA 1UGCA 5E2NA 3ZP9A 3CA2A 5SZ2A 3DAZA 5JQTA 3M1JA 5A25A 1G4OA 4HEYA 4QJMA 4BCWA 3V3HB 4HEZA 3V5GA 3RYVB 4ETQC 3DC3A 3NB5A 5AMDA 1BN3A 3LXEA 5CACA 1FQNA 1KOQA 5E2SA 3M2ZA 4TWLA 1CCSA 3M1WA 5EH8A 8CA2A 5EHVA 1T9NA 2NN7A 1Z9YA 3F7UA 4UOVA 4N16A 2QO8A 1HECA 4YWPA 1CVBA 5FL4A 4K0TA 3U45X 1BN4A 4E9OX 2HD6A 2VVAX 4FRCA 5JDVB 1JCZA 5DOGA 2GD8A 1CNYA 2HKKA 1G54A 3N3JA 5J8ZA 4KP5A 2POVA 5SZ4A 1LZVA 3M5EA 3OKVA 1BNWA 5EKMA 4WUQA 1CNXA 2NWZA 2O4ZA 1CAZA 3IEOA 4Q7VA 3MWOA 4Q6DA 4HU1A 1ZSAA 2W2JA 4HT0A 1YDAA 2WEGA 4X5SA 3BL1A 3TVNX 4MDGA 2HNCA 4QJ0A 1TB0X 2EU3A 1G1DA 3U7CA 1AZMA 4Q49A 4Y0JA 5SZ1A 4XZ5A 3ML5A 1UGGA 3FFPX 3M04A 1G0EA 3HS4A 4MO8A 1I90A 2WEJA 1CILA 3D8WA 5FLOA 4XIWA 4IDRX 3MNJA 1CVDA 2Q1BA 7CA2A 3S74B 2NNOA 3DV7A 4PQ7A 3RYYA 3K34A 3M5SA 4XE1A 5G01A 3NI5A 1CNGA 3ZNCA 2X7TA 4K0ZA 1YDDA 3T83A 1I91A 4KAPA 1CAJA 1ZGEA 3S72B 1FQRA 1FQMA 3MNAA 1BNMA 3D93A 1MOOA 3MMFA 4Q78A 4Q7SA 4QSAA 1Z93A 3W6IA 1BNUA 1RJ5A 4Z0QA 3HKNA 4FIKA 2FOYA 3M98A 4RUXA 3VBDA 5C8IA 4PXXA 1CNIA 4QIYA 4CNRA 1G45A 1THKA 1TG9A 5BRVA 1DMXA 4Q06A 3M1KA 3T82A 3EFIA 1CAMA 3MDZA 1RZDA 4RUYA 4ZWZA 3S76A 1CVHA 1TH9A 4LP6A 3BL0A 1LUGA 4JSSA 4Q8XA 3FW3A 4KNNA 3MHCA 5CA2A 3KS3A 5JGTB 4JSWA 3TMJA 3RG4A 1I9NA 1CNHA 3P3JA 3KWAA 2NNSA 3RYJB 3R16A 5AMLA 3KKXA 4YGNA 3P55A 3U47A 1HUGA 5EOIA 1BZMA 1BN1A 4YX4A 3F8EA 5FNIA 5L6KA 4HT2A 3DBUA 5FLQA 5DSNA 5E5UA 1FR7A 2ABEA 3K2FA 1HCBA 1RZAA 3RYXB 4TWMA 1CVFA 3P3HA 5JG3B 3MNKA 3R17B 3S75B 4HBAA 1MUAA 3KOIA 4RFCA 3M3XA 4K0SA 4Z1NA 1KEQA 4E3HA 3MNHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3KIG A;  1ZGF A;  4RIV A;  4QJW A;  3MHM A;  3HKU A;  1CCU A;  5JQ0 A;  3DVD A;  2NNG A;  1KOP A;  4ITP A;  1RJ6 A;  3RZ7 A;  4WR7 A;  4YXI A;  1CNJ A;  4IWZ A;  3C7P A;  1FSR A;  3V3G B;  3DD0 A;  5EHE A;  4C3T A;  1CVE A;  3MNU A;  2NNV A;  4Q9Y A;  1CAO A;  5FL5 A;  1G46 A;  6CA2 A;  1TBT X;  2CA2 A;  3MHO A;  3V7X A;  3FE4 A;  4HEW A;  2IT4 A;  4ZWI A;  4G0C A;  1BNV A;  4QJX A;  3KOK A;  1CCT A;  3KON A;  2H15 A;  1DCA A;  1IF7 A;  1OKL A;  4MDL A;  3T5U A;  2POU A;  3P5A A;  3M67 A;  3SAP A;  5DRS A;  4L5U A;  1J9W A;  3PYK A;  3HKQ A;  5L3O A;  3TVO X;  4YXU A;  3S71 B;  4MTY A;  4ZX1 A;  5DSR A;  2FOS A;  1YDC A;  3D9Z A;  1G52 A;  4YHA A;  5LMD A;  4Z1K A;  2CBE A;  2H4N A;  4PYY A;  2FOU A;  5JGS B;  4Q08 A;  4CAC A;  4E4A A;  4QK2 A;  2HL4 A;  1CNW A;  1KWR A;  4Q8Y A;  5SZ6 A;  2WEH A;  2NWP A;  1XPZ A;  3HFP A;  4LU3 A;  4K1Q A;  1EOU A;  4JSA A;  3PO6 A;  1LG5 A;  1Z97 A;  4QK1 A;  1FLJ A;  1IF5 A;  2OSM A;  3RZ0 B;  4Q09 A;  3RG3 A;  3D0N A;  2QP6 A;  1HUH A;  1RZB A;  2NXS A; 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