5FL5A

Three dimensional structure of human carbonic anhydrase ix in complex with 5-(1-(4-methoxyphenyl)-1h-1,2,3-triazol-4-yl)thiophene-2- sulfonamide
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
Knots found
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
WRYGGDPPWPRVSPACAGRFQSPVDIRPQLAAFSPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQLHLHWGAAGRPGSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGPEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWTVFNQTVMLSAKQLHTLSDTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE IX
publication title An Efficient Expression and Crystallization System of the Cancer Asociated Carbonic Anhydrase Isoform Ix.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 68
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fl5A00
1HEDA 6CA2A 3D93A 2CABA 3FW3A 4KNMA 3MHOA 5A25A 1UGGA 5FNLA 4WL4A 7CA2A 3P44A 4XZ5A 1BN3A 4L5WA 1DMXA 3S73B 4QJWA 4N0XB 5JEPB 4YX4A 3LXEA 4CNVA 4Q0LA 4LP6A 4YXOA 5BRVA 4GL1X 5L6KA 3DA2A 3K34A 2QP6A 3M96A 4CACA 4IWZA 1CVBA 4Q90A 5FNHA 3DD8A 3NB5A 1LGDA 4E3HA 4ZWIA 1G4JA 3IGPA 4E5QA 4K1QA 5E2RA 5C8IA 4Q07A 5DRSA 4KV0A 4Q7WA 2NNOA 3BETA 3F4XA 5CA2A 2WEHA 4Q87A 1Z93A 5G03A 3HKQA 4ZAOA 2Q1BA 4HBAA 4M2WA 1UGEA 3M40A 5DSIA 2Q1QA 4Q8YA 1FQMA 3DC9A 1ZNCA 4ZX0A 5CLUA 2NWOA 3RYZA 1V9IC 1YDDA 1BNUA 1TBTX 4XIXA 3OKVA 3M14A 2HNCA 5JGTB 3MWOA 1ZFKA 4KUVA 3M5SA 4YHAA 5E2NA 5SZ7A 2CBAA 2FOSA 5JQ0A 1G52A 3RZ5A 8CA2A 5E2MA 1BNMA 4ITOA 4CNRA 4XE1A 1CA2A 4MO8A 5DSJA 3S76A 4CNXA 4PXXA 5EKHA 4Q78A 3SBIA 3MNIA 1BV3A 4K13A 3P58A 2Q38A 3DBUA 1JCZA 1TEQX 3P3HA 1J9WA 5G0BA 2H4NA 3B4FA 1G4OA 1FQLA 1G53A 5SZ5A 1ZGEA 2NNVA 3FE4A 5G0CA 2CBDA 4MLXA 4M2RA 3DAZA 3S78B 1BN1A 1RJ6A 4FVOA 1LG6A 4KUYA 3MHMA 5BNLA 4MDGA 3MHIA 1TEUX 4JSAA 1AVNA 4QJMA 3S77B 5DOGA 1ZSAA 2NXSA 4Z1EA 3M04A 1CZMA 5FL6A 1DMYA 3M5TA 1H4NA 5J8ZA 1YO0A 4CQ0A 9CA2A 4HEZA 1BNTA 3B1BA 4Y0JA 3HLJA 3RZ0B 5JEHB 3MZCA 4LHIA 3DVBA 3T83A 1I9QA 2VVBX 3W6IA 1KOPA 3M98A 4KUWA 5DSLA 4Q06A 1CNJA 3M1KA 1FSQA 3HKTA 4Q6EA 4E49A 2NXRA 2QO8A 1XQ0A 5SZ2A 5SZ6A 2NWYA 1CRAA 5EH5A 1BNQA 2FNNA 2WD3A 4K0SA 3S9TA 4E9OX 5AMLA 3R16A 1I8ZA 4RIUA 3RG4A 2CA2A 5JG5B 1RZEA 4QJOA 4CA2A 1CNIA 3HFPA 5FLTA 3JXGA 1ZH9A 5SZ1A 3SAPA 5EZTX 5JQTA 5FDIA 3KNEA 1I90A 3MNJA 3P3JA 4BCWA 1G6VA 4QJXA 2FOYA 4XFWA 4HT0A 1HEBA 1BNNA 3KIGA 3RG3A 2EU3A 3T84A 3V3IB 1XPZA 2FMZA 4HU1A 4UOVA 3OKUA 4WUQA 1Z9YA 1RJ5A 2NXTA 3MHLA 5A6HA 4QIYA 2OSMA 3ML5A 1RZBA 4PQ7A 1CA3A 3KOIA 3NJ9A 3S71B 3V3GB 4C3TA 3BL1A 4QSBA 4FU5A 4TWLA 5FNKA 4TWMA 3R17B 5L3OA 4ZWXA 5FL4A 1TE3X 1AM6A 4KAPA 3IBIA 3P5LA 1UGAA 4JSWA 1MOOA 1RAYA 1CALA 5HPJA 1THKA 1CVFA 1IF6A 2NNSA 3KOKA 5DSPA 3OY0A 5DSMA 5SZ0A 3IBLA 3W6HA 1CVCA 3EFTA 4QIZA 3M1QA 1TG3A 4Q81A 5G01A 5EKMA 2NWZA 4QK1A 3V7XA 1HVAA 5CJFA 1DCAA 4ITPA 5IPZA 1OKLA 1FR7A 1OKMA 1CCSA 3D92A 2HL4A 3KKXA 4IDRX 4FRCA 4YGJA 1H9QA 4COQA 4LU3A 4YGFA 3V3FA 5BRUA 4L5VA 1FQNA 4BF6A 1IF7A 3L14A 2CBBA 5BRWA 3GZ0A 3JXHC 3MDZA 4QSIA 1CAYA 1CNWA 3MYQA 2HD6A 3DD0A 1G46A 4X5SA 2VVAX 5AMGA 3V2JA 3U7CA 3P55A 2AW1A 1LZVA 2FOQA 3RYVB 3T85A 3MHCA 1G54A 4MDLA 1CAHA 1CNXA 1G1DA 5DVXA 1CAMA 1TG9A 3CA2A 3MNHA 1CAZA 1BNVA 2X7UA 1YO1A 4R5BA 3P5AA 1OQ5A 1CAKA 3Q31A 1BZMA 3IAIA 4Q99A 1CCUA 5LMDA 2OSFA 3DVCA 1CNGA 3V5GA 3S97A 3D0NA 4E4AA 3V3HB 3K7KA 1KEQA 3M2YA 3DCWA 1TTMA 1ZSCA 4FIKA 4HEWA 4YXUA 5JG3B 4M2UA 3DVDA 2X7TA 5DSQA 4PYXA 3S75B 4ETQC 3OYSA 2FNKA 1URTA 1CINA 4WUPA 5DSNA 1Z97A 5FNMA 2POVA 1I9PA 4YGNA 4R59A 1IF5A 3S72B 4YGLA 2AX2A 3N3JA 5FNGA 4MTYA 3DCCA 3PO6A 4M2VA 2WEGA 5EH8A 3T5UA 4Z0QA 5EH7A 4QY3A 4WW8A 1UGDA 1TB0X 4Q7PA 4Q6DA 3D8WA 2ZNCA 1BN4A 1BNWA 3V3JA 2H15A 4FL7A 1G48A 3F8EA 4WW6A 5E5RA 1MUAA 4MLTA 3BL0A 3CAJA 5FLQA 2CBEA 2GD8A 3RZ7A 4JSZA 4KNIA 4QK2A 3HS4A 1CNKA 3U3AX 4BF1A 4QEFA 3IBNA 2WD2A 2WEJA 4YVYA 5EHVA 3F7BA 3IBUA 4E3DA 1FR4A 2EZ7A 5E2SA 3HKUA 5FLRA 1CIMA 1CRMA 3CZVA 3JXFA 2HOCA 1CNHA 4KNNA 5EHEA 1G45A 3T82A 5BYIA 5FNIA 2NN1A 4Q7SA 3OIMA 2NNGA 3N2PA 3S8XA 3KONA 4PYYA 3DCSA 1I9OA 3CYUA 3U47A 4E3GA 5E2KA 1CVHA 1CVEA 2X7SA 4MDMA 1XEVA 1YDCA 1HUGA 3M1WA 1CNCA 4WR7A 5DSKA 4QSJA 1CANA 5CACA 1JV0A 1CAJA 2GEHA 1V9EA 4RUZA 2O4ZA 1LUGA 3OILA 2FOVA 2IT4A 1G0EA 3PYKA 5FLPA 3TVOX 1HCAA 4ZX1A 3M2NA 4HT2A 4ZWYA 5FNJA 3KS3A 3RZ1B 4R5AA 1DCBA 3PJJA 1UGCA 4RFCA 1CNBA 1KWQA 3ZNCA 5SZ4A 3OYQA 5EIJA 1H9NA 3SAXA 4E3FA 4QK3A 3DC3A 1UGFA 4L5UA 2EU2A 3KWAA 5AMDA 5E5UA 3M67A 1F2WA 2CBCA 1IF8A 3MNAA 5EKJA 1IF9A 2POUA 3KLDB 3UYNA 4G7AA 3RLDA 3IEOA 1FSNA 3M3XA 4RUXA 3MNKA 5FDCA 1CVAA 1ZE8A 1CNYA 2ABEA 2FNMA 4Z1JA 1G0FA 3C7PA 1HEAA 4Q8ZA 3RYJB 2FW4A 4PZHA 1G3ZA 3P4VA 3EFIA 4RUYA 4Q9YA 1YO2A 4Z1KA 3SBHA 4HF3A 3N4BA 1FLJA 3M2XA 4XIWA 2FMGA 5DSRA 5FLSA 3K2FA 5DSOA 4RIVA 1ZGFA 1I9NA 3RZ8A 3UYQA 1IF4A 3M5EA 4G0CA 4DZ7A 5JEGB 1HECA 5JESB 1UGBA 1TH9A 3M2ZA 4FPTA 1I91A 1I9MA 3D9ZA 1RAZA 4QTLA 5EHWA 3V2MA 4CNWA 4YYTA 1YDBA 4RFDA 3ML2A 1RZCA 1Y7WA 2NN7A 1RZDA 1OKNA 2QOAA 4N16A 5SZ3A 4K0TA 3QYKA 4ILXA 4KP8A 1FSRA 2HFWA 3ZP9A 5FLOA 1BCDA 3VBDA 1YDAA 4QJ0A 3RJ7A 5JDVB 3MMFA 1CAIA 4HEYA 4Q49A 1RZAA 1KWRA 4DZ9A 3MNUA 3TVNX 2WEOA 2HKKA 1KOQA 3FFPX 4Q83A 4JS6A 1JD0A 4YWPA 3RYXB 4QJPA 4FVNA 4Q08A 4K0ZA 4Q09A 3TMJA 4YGKA 3NI5A 1EOUA 2NWPA 1T9NA 1CVDA 1CCTA 1ZSBA 3U45X 1ZFQA 2F14A 3OIKA 5EOIA 4RH2A 4Q8XA 3M1JA 1HUHA 2W2JA 1LG5A 3N0NA 1CAOA 3F7UA 2NMXA 4JSSA 4ZWZA 1A42A 3RYYA 2ILIA 3HKNA 1FQRA 5FL5A 1CILA 3S74B 4KP5A 5E28A 12CAA 4YXIA 1BICA 5JGSB 2FOUA 5DOHA 3RGEA 4RN4A 3T5ZA 4QSAA 1XEGA 4Q7VA 1AZMA 1HCBA 2POWA 1I9LA 4KNJA 4Z1NA 3DV7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HED A;  6CA2 A;  3D93 A;  2CAB A;  3FW3 A;  4KNM A;  3MHO A;  5A25 A;  1UGG A;  5FNL A;  4WL4 A;  7CA2 A;  3P44 A;  4XZ5 A;  1BN3 A;  4L5W A;  1DMX A;  3S73 B;  4QJW A;  4N0X B;  5JEP B;  4YX4 A;  3LXE A;  4CNV A;  4Q0L A;  4LP6 A;  4YXO A;  5BRV A;  4GL1 X;  5L6K A;  3DA2 A;  3K34 A;  2QP6 A;  3M96 A;  4CAC A;  4IWZ A;  1CVB A;  4Q90 A;  5FNH A;  3DD8 A;  3NB5 A;  1LGD A;  4E3H A;  4ZWI A;  1G4J A;  3IGP A;  4E5Q A;  4K1Q A;  5E2R A;  5C8I A;  4Q07 A;  5DRS A;  4KV0 A;  4Q7W A;  2NNO A;  3BET A;  3F4X A;  5CA2 A;  2WEH A;  4Q87 A;  1Z93 A;  5G03 A;  3HKQ A;  4ZAO A;  2Q1B A;  4HBA A;  4M2W A;  1UGE A;  3M40 A;  5DSI A;  2Q1Q A;  4Q8Y A;  1FQM A;  3DC9 A;  1ZNC A;  4ZX0 A;  5CLU A;  2NWO A;  3RYZ A;  1V9I C;  1YDD A;  1BNU A;  1TBT X;  4XIX A;  3OKV A;  3M14 A;  2HNC A;  5JGT B;  3MWO A;  1ZFK A;  4KUV A;  3M5S A;  4YHA A;  5E2N A;  5SZ7 A;  2CBA A;  2FOS A;  5JQ0 A;  1G52 A;  3RZ5 A;  8CA2 A;  5E2M A;  1BNM A;  4ITO A;  4CNR A;  4XE1 A;  1CA2 A;  4MO8 A;  5DSJ A;  3S76 A;  4CNX A;  4PXX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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