5FNJA

Native state mass spectrometry, surface plasmon resonance and x-ray crystallography correlate strongly as a fragment screening combination
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
publication title Native State Mass Spectrometry, Surface Plasmon Resonance and X-Ray Crystallography Correlate Strongly as a Fragment Screening Combination.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fnjA00
4Z0QA 4WW8A 4JS6A 4CACA 5JEHB 5JQTA 3ML2A 1BCDA 1ZSAA 3VBDA 9CA2A 3IBNA 1FR7A 1HCBA 5E2MA 5FL5A 1Y7WA 5CJFA 1RZDA 3U7CA 3RYYA 5FLPA 5DRSA 3M96A 4JSWA 1CNHA 3P58A 1I9PA 1CNBA 1KWQA 4QK2A 3RG4A 3D9ZA 1CVEA 1H9QA 1FQRA 2ABEA 4K13A 3QYKA 3TVNX 1I9MA 1JD0A 2Q1BA 4KUWA 3D8WA 4RFCA 5LMDA 5EHWA 5EIJA 2FOQA 1BNVA 4TWMA 1G4OA 3U47A 3KKXA 2OSMA 3V2JA 3M2YA 1G1DA 4KAPA 1BN3A 2FW4A 3W6IA 1BZMA 3P4VA 3F4XA 1I9OA 3KOKA 1CNXA 4GL1X 3DVCA 5L6KA 3N2PA 3T82A 2NXTA 4PZHA 2OSFA 2O4ZA 4L5UA 1CILA 2EU3A 2CBCA 4XIXA 4XE1A 3M2XA 1G6VA 1CCSA 1IF9A 2F14A 3BETA 4JSAA 5HPJA 1Z9YA 3OY0A 4Q87A 1CAKA 3TMJA 2NN1A 3OKVA 5J8ZA 4CNWA 5BRWA 3S73B 1XEVA 5EHVA 5SZ2A 2WEGA 1TB0X 3CYUA 3SBIA 5CLUA 1TG3A 1I9NA 4QJMA 5DSOA 1FR4A 2POUA 1HCAA 4RUXA 1CIMA 4QEFA 1ZE8A 3DD8A 2EU2A 3RJ7A 1JCZA 1CNIA 5DSIA 4ZX0A 3N0NA 3M3XA 2HKKA 2VVBX 4CNRA 4WR7A 2NNSA 3BL1A 5FL6A 1YDBA 4YGLA 2GEHA 1RJ6A 5FNGA 1BN1A 2GD8A 5AMLA 1DMYA 3OILA 5BRUA 3NB5A 5EKJA 3R17B 2WEOA 5EKHA 3MDZA 5SZ4A 3TVOX 1ZH9A 3S75B 1CNCA 5FLOA 3KONA 4KNNA 4YHAA 1CINA 1FSNA 3T5UA 3U45X 4YX4A 2FMZA 1UGGA 1I9QA 3SBHA 5E2SA 1YO1A 5FDIA 5FDCA 2NMXA 2CBBA 1HEDA 4Q90A 1TH9A 5FNLA 5E5RA 5EH7A 3RZ1B 5A6HA 1LGDA 5EKMA 2NWOA 1BNNA 3IEOA 1CAJA 4G7AA 3P5LA 3RYVB 3PO6A 5DSJA 3SAXA 4QJPA 3DAZA 4QJOA 3MNHA 1BN4A 1TEQX 1ZFQA 3M98A 5EH8A 1CVHA 2CA2A 3IBIA 1G52A 1CAYA 1I9LA 4JSZA 3IAIA 3IBLA 1CZMA 4M2RA 1RJ5A 4Q7WA 5A25A 3LXEA 2NWPA 3MYQA 2IT4A 3V3JA 4CNXA 1I91A 5AMGA 4YGNA 1HUGA 4Q8XA 1HEAA 5DSNA 1FQLA 5FNJA 4RFDA 1ZSCA 5JQ0A 1G45A 5SZ1A 4ETQC 5BYIA 4MDLA 3D93A 3D0NA 4E3FA 3DCSA 4YGJA 3Q31A 3N4BA 3P3HA 3V3FA 1TBTX 3MHCA 3KS3A 3RZ0B 3N3JA 1CAZA 1UGBA 3K2FA 4RH2A 5CACA 4HEWA 4FIKA 3S78B 1FLJA 3F7BA 3MMFA 3M40A 1BICA 1RZCA 3T83A 4Q9YA 1CRAA 3MHOA 1CNJA 3UYQA 2FOYA 1G4JA 3CZVA 1YO2A 1YO0A 5E2KA 1FQNA 1CNGA 4RUYA 4Z1NA 5DVXA 2AW1A 3JXHC 3IGPA 3M1QA 4DZ9A 1KWRA 4QTLA 3KIGA 5AMDA 1CCUA 2QP6A 4Q78A 3T5ZA 3V3IB 1OKLA 3SAPA 2NWZA 4WW6A 4R5AA 3OIKA 4FL7A 1CVCA 3P5AA 1IF8A 2EZ7A 4Z1KA 5G0BA 1URTA 4M2VA 1OKMA 4ZWXA 3F8EA 1BNWA 1UGEA 2CBEA 3CA2A 4R5BA 1T9NA 1KOPA 1TG9A 4RIVA 1DCBA 5FNMA 5JGSB 1AVNA 2HNCA 3M2ZA 1TEUX 3NJ9A 4ZX1A 4HT2A 1CAOA 5G01A 4ITPA 2FOVA 3DVBA 6CA2A 1RAYA 1AM6A 1ZSBA 2HOCA 4Q8ZA 4RN4A 4ILXA 4XIWA 2HL4A 3RYXB 4QJ0A 1CA3A 1CAHA 4CA2A 1ZNCA 4G0CA 2QOAA 3M2NA 4KNJA 5EOIA 5JESB 3P55A 4LP6A 1YDCA 2NN7A 4K0SA 1CVBA 1CNKA 3FE4A 4CQ0A 4HT0A 1FQMA 3KOIA 3RLDA 4ZWYA 12CAA 3MWOA 5FLRA 1CVAA 1LG5A 2Q1QA 5FLQA 3UYNA 4E9OX 1CA2A 1CNYA 4KP8A 4PXXA 3M67A 1TE3X 4Q7PA 3M5SA 2NXRA 3IBUA 3MNIA 3KLDB 3V2MA 5L3OA 5JG3B 5JG5B 1JV0A 3ZNCA 1IF6A 2H4NA 5DSRA 4MO8A 5E5UA 1CANA 3HFPA 3MNUA 2FNNA 1THKA 2AX2A 1IF4A 4ITOA 5DSKA 4HF3A 3S72B 1UGFA 4QSJA 4WL4A 2FNKA 1G48A 3K34A 4QJWA 1CALA 1ZGFA 4MLXA 4HEZA 1OKNA 5EH5A 3JXGA 3PJJA 2POVA 1RZAA 3PYKA 4YXIA 2CBAA 3K7KA 4E3GA 3DA2A 3M5EA 1HEBA 4Q09A 5G03A 5G0CA 3RYJB 3M1JA 3V3HB 4FU5A 3T84A 5BNLA 1LZVA 4PYYA 4MTYA 2X7TA 3DCCA 1Z93A 4FPTA 4XFWA 5E28A 1XQ0A 4RIUA 5FNIA 1FSQA 3B1BA 2ZNCA 1CRMA 4M2WA 2NNGA 4Q81A 4PQ7A 2X7UA 4KNIA 1ZGEA 3MZCA 1CVFA 4Z1JA 4QY3A 4COQA 2HD6A 5DSQA 1CNWA 1RAZA 1UGDA 2WEJA 4PYXA 3DD0A 4R59A 1HECA 1XEGA 1XPZA 3CAJA 4K1QA 1OQ5A 4N16A 4ZAOA 3HKUA 4N0XB 2NWYA 3ML5A 4DZ7A 1LUGA 4E5QA 1H9NA 2NXSA 2NNOA 2W2JA 1LG6A 5FLTA 4Z1EA 3V5GA 1CAIA 3DV7A 4WUPA 3RG3A 3V7XA 3OKUA 4Q49A 1V9IC 5SZ7A 3S76A 4QJXA 1RZBA 4Q99A 4XZ5A 3HKNA 5DSMA 3NI5A 4MDGA 4YVYA 2VVAX 5FNKA 4E3DA 4TWLA 3D92A 4QSIA 4CNVA 3R16A 4KV0A 5CA2A 5FL4A 1TTMA 2WD2A 4QK3A 4HBAA 5SZ5A 3RZ8A 4HU1A 5FLSA 4E49A 3T85A 3DBUA 5JEPB 4E3HA 4KUVA 1MOOA 8CA2A 4FVNA 1YDAA 2WD3A 1UGCA 1Z97A 1IF5A 3KNEA 1UGAA 3EFTA 3MNKA 4KUYA 5FNHA 3DC9A 3L14A 5JGTB 2FOUA 3EFIA 4Q08A 4Q06A 4X5SA 5SZ0A 4L5WA 1V9EA 1KOQA 3M1KA 5C8IA 5IPZA 3HKTA 3P3JA 4HEYA 4IDRX 4LU3A 1DCAA 5E2NA 1EOUA 3MHIA 3RGEA 3RZ7A 4KNMA 4MDMA 4QSBA 1F2WA 3FFPX 5BRVA 5DOHA 1G53A 3V3GB 2ILIA 1IF7A 1CAMA 3S9TA 4KP5A 5SZ3A 4BF6A 1BNMA 3MHMA 4Y0JA 1I8ZA 1MUAA 4QIZA 4Q83A 1BNUA 2POWA 3FW3A 1BNTA 4Q0LA 3DVDA 3M1WA 3P44A 1G0EA 3S77B 3RZ5A 3C7PA 5E2RA 3OYQA 3HKQA 1J9WA 4YGKA 4YXUA 4YGFA 1RZEA 5SZ6A 1YDDA 3MHLA 1I90A 4UOVA 3GZ0A 3OYSA 3DCWA 4ZWZA 5EHEA 3W6HA 5DOGA 4L5VA 4E4AA 4YYTA 3B4FA 4Q07A 2FMGA 1FSRA 2CBDA 1G54A 1CCTA 4ZWIA 3HS4A 1BNQA 5JDVB 3S74B 4YXOA 4LHIA 4Q6EA 5DSLA 7CA2A 1BV3A 4Q8YA 2QO8A 4FVOA 1AZMA 3KWAA 3BL0A 3RYZA 3F7UA 3M04A 4JSSA 4WUQA 4YWPA 3S71B 4K0TA 2H15A 3MNAA 1H4NA 4Q7SA 4QIYA 2WEHA 3MNJA 2X7SA 5EZTX 3U3AX 1CVDA 4RUZA 4BF1A 5JEGB 1A42A 4Q7VA 3ZP9A 4C3TA 4MLTA 4M2UA 1ZFKA 1G0FA 1G46A 4K0ZA 1HUHA 4IWZA 2FNMA 2HFWA 4QK1A 3M14A 3S8XA 2FOSA 3S97A 4QSAA 3M5TA 5DSPA 3JXFA 3HLJA 2NNVA 4Q6DA 1G3ZA 4FRCA 3OIMA 1KEQA 1DMXA 3DC3A 1HVAA 2CABA 4BCWA 2Q38A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Z0Q A;  4WW8 A;  4JS6 A;  4CAC A;  5JEH B;  5JQT A;  3ML2 A;  1BCD A;  1ZSA A;  3VBD A;  9CA2 A;  3IBN A;  1FR7 A;  1HCB A;  5E2M A;  5FL5 A;  1Y7W A;  5CJF A;  1RZD A;  3U7C A;  3RYY A;  5FLP A;  5DRS A;  3M96 A;  4JSW A;  1CNH A;  3P58 A;  1I9P A;  1CNB A;  1KWQ A;  4QK2 A;  3RG4 A;  3D9Z A;  1CVE A;  1H9Q A;  1FQR A;  2ABE A;  4K13 A;  3QYK A;  3TVN X;  1I9M A;  1JD0 A;  2Q1B A;  4KUW A;  3D8W A;  4RFC A;  5LMD A;  5EHW A;  5EIJ A;  2FOQ A;  1BNV A;  4TWM A;  1G4O A;  3U47 A;  3KKX A;  2OSM A;  3V2J A;  3M2Y A;  1G1D A;  4KAP A;  1BN3 A;  2FW4 A;  3W6I A;  1BZM A;  3P4V A;  3F4X A;  1I9O A;  3KOK A;  1CNX A;  4GL1 X;  3DVC A;  5L6K A;  3N2P A;  3T82 A;  2NXT A;  4PZH A;  2OSF A;  2O4Z A;  4L5U A;  1CIL A;  2EU3 A;  2CBC A;  4XIX A;  4XE1 A;  3M2X A;  1G6V A;  1CCS A;  1IF9 A;  2F14 A;  3BET A;  4JSA A;  5HPJ A;  1Z9Y A;  3OY0 A;  4Q87 A;  1CAK A;  3TMJ A;  2NN1 A;  3OKV A;  5J8Z A;  4CNW A;  5BRW A;  3S73 B;  1XEV A;  5EHV A;  5SZ2 A;  2WEG A;  1TB0 X;  3CYU A;  3SBI A;  5CLU A;  1TG3 A; 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