7A3H | Genus

Total Genus 118

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	118
sequence length	300
structure length	300
Chain Sequence	SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	ENDOGLUCANASE
publication title	Snapshots along an enzymatic reaction coordinate: analysis of a retaining beta-glycoside hydrolase. pubmed doi rcsb
source organism	Bacillus agaradhaerens
total genus	118
structure length	300
sequence length	300
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	1998-08-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	7a3hA00

3WN6A 1EDTA 1FH9A 1K9FA 3TP4A 3FHQA 4W93A 2EBNA 3WNLA 3AHYA 1XH2A 3WD2A 6CGTA 4RL3A 4WSKA 3UETA 1AQMA 3RPMA 3T2PA 1B90A 5FD0A 3BAWA 3DHPA 3BSGA 1VBRA 3WH9A 4UOJA 3RO8A 4EKJA 1MQQA 1WDPA 4M56A 4UNIA 4AZBA 2X0YA 1NOUA 3WD4A 2EXOA 3QOMA 2WZIA 1UQYA 3HJEA 1HJWA 4UOZA 3K8KA 3PBGA 4ZE4A 2WWDA 3UG3A 1E6NA 2DGAA 3VDCA 4P7QA 4TVCA 4ACYA 4UFMA 8CGTA 1M04A 5DEZA 5I23A 3AXXA 1UR1A 5C8BB 3SUWA 5BWFA 1LQ0A 3WDPP 3KE0A 2CBJA 2Y4SA 2CITA 5CGMA 1UYQA 4YHGA 4DM1A 4M29A 1HNYA 1E1EA 1C8YA 2WM0A 1CYGA 3UCQA 2DH3A 3OBAA 3MMDA 3MS8A 3T0AA 5CXPA 1PX3A 2XG9A 3JUGA 4BQ3A 5CGTA 1JIBA 3OGRA 1XC6A 3ARYA 3THDA 2XGIA 3EMZA 2W91A 3N04A 2GUYA 3ZIZA 3SEPA 1D3CA 1KGXA 1J0JA 3RM8A 2GJXB 1LL7A 1WZMA 2J8FA 4AWEA 4AD1A 2ZIDA 4S3JA 4U31A 5I78A 3WF2A 5M5DA 3BLKA 2YL9A 2VCBA 1GJWA 1H2JA 1BQCA 3WNPA 2VRJA 4CD8A 5EB8A 3PHAA 4GQQA 3RMEA 4GQRA 5IFPA 3WDRA 4TUFA 4V28A 1CGUA 2WCGA 3QHMA 1BVNP 1XSKA 4F9DA 2WLYA 3SCQA 1HJXA 4UTFA 3W37A 4TX6A 4XZBA 1E9LA 3ZSSA 4F9JA 2XWDA 1UA7A 4F79A 3E1F1 2F8QA 4EAMA 2D2OA 1J0YA 2VZSA 3AZSA 3BMWA 4W8LA 1HIZA 4PTWA 1H4PA 2WC7A 2YDRA 3AIUA 4ZENA 1CXEA 4PMYA 5BYWA 1JFXA 1OGBA 1E73M 1C93A 4AW7A 3VIMA 1H49A 5BXTA 2F2HA 3EMCA 3QHOA 3EMQA 4HA4A 1TA3A 2J8GA 4J27A 2CEQA 1H41A 3PZNA 3M46A 3AZTA 2XVPA 1JG9A 4HPGA 1BSIA 1GQJA 2QHAA 4MNLA 2ZXBA 1WCGA 3CUFA 4GPNA 1R7AA 3UERA 2WYSA 1C8QA 2WMGA 1MW2A 3OZOA 2JEPA 2PBOA 5A3HA 4JZ5A 5M03A 1TFVA 2J74A 2WVVA 1Q6FA 4TXEA 2XVLA 3WMBA 3EDJA 3OLGA 1X6LA 5IDIA 1R87A 1WAWA 4D72A 1HL8A 3AS1A 1RH9A 5HDRA 3F5LA 3A4XA 2Y5EA 3VDHA 1J0IA 1CWYA 1UKQA 4KRTA 3WEZA 4A3HA 2J77A 3KEHA 4FLOA 3FNDA 1MFVA 3VIPA 2VT0A 3IANA 3GH4A 1B3YA 4JFSA 3G6LA 3CHEA 1E0XA 1ZBVA 3NYDA 2WHKA 1ODZA 3MMWA 3IJ8A 3FHAA 1E3XA 4PTXA 5DT7A 4UQ9A 1CPUA 4AZHA 3N12A 4PCTA 3CBWA 3CLWA 2VI0A 1GOOA 5CQ1A 1WDSA 3WQ4A 5E0CA 2VRKA 1K9TA 3BC9A 2ZX5A 2FHCA 1FH7A 4Q7NA 5GNZA 3WBEA 6TAAA 2E9MA 4HU8A 4LYQA 2ZXQA 5A69A 3BGAA 1ZU8A 1RPKA 3FN9A 4PMOA 4FLRA 1ESWA 3TTYA 3F5JA 2C8NA 3WQ8A 3BAJA 4HA1A 1E55A 3AIWA 1EDQA 4YN5A 3DYOA 2EO7A 3DECA 3PZIA 3TONA 5A2CA 5LA2A 1DP0A 2A3AA 2E8ZA 4GZJA 1NWSA 5HPOA 4PUDA 2W66A 3W53A 1W9BM 3A47A 1BYDA 4CD4A 1UWUA 1CXKA 2BY1A 5EFFA 1VEOA 1DWFM 1OD0A 3I3DA 1EHAA 5D9PA 3VNYA 3II1A 3MUY1 1ZB5A 2ZE0A 3WNMA 2XFRA 1EA9C 1OSEA 4CN6A 4PSRA 3VGHA 2WWCA 1W9PA 3IK2A 5CG0A 1KGUA 4OOUA 2J47A 2WMIB 2VQUA 1CGYA 4AD2A 3T08A 2CETA 1QHOA 1DWIM 5DT5A 3TOPA 1EDGA 4CKQA 1Q6GA 4CN4A 3WL1A 2WKLA 2G41A 5A6LA 1UWRA 5E70A 1HT6A 3PZOA 4X9YA 1ECEA 3SUTA 4MNJA 1E0VA 2AAAA 1TA3B 2YOCA 2V38A 2UY2A 4J3XA 3WY1A 1DTUA 2CBUA 1UWIA 4AIEA 2YJQA 2D20A 1BVZA 3TTOA 3CPUA 3DYPA 4N42A 4U2YA 4Z2LA 2CIPA 4UZUA 3UG5A 1V03A 2EPLX 2J78A 3SIMA 3WNKA 2DPEA 2YDSA 3CZJA 3K46A 3WEMA 1D2KA 2BVTA 1AVAA 3B9DA 3L4WA 2D0FA 4DWSA 1ISZA 1PX8A 5A6SA 1J0KA 4A3YA 4CVWA 4QLKA 3VDBA 2FH8A 5GNYA 4NF7A 1UD8A 3ZT6A 4B9ZA 1B3XA 3N17A 1XH0A 1ITCA 4AY1A 2EPKX 2A3EA 1ISYA 3ZSTA 3WMCA 4C7GA 3ZT5A 4KRUA 2RGLA 4GI8A 4Z2JA 3PTKA 4CU6A 1FH8A 2BXZA 4H41A 3ZJ6A 3BLPX 3OLDA 4W85A 1JDDA 4PMRA 5FL1A 3VGDA 4V2XA 5IXEA 4UFLA 3GBEA 1OWQA 1Y7VA 2DSKA 2UWFA 5A6BD 1K6AA 1JFHA 1E6PA 4C7DA 3NDZA 1UKTA 4PMUA 4AD5A 3L4ZA 2W61A 1XSJA 1ISXA 2XYLA 3VIHA 5HXMA 4FMVA 4B3LA 1LLOA 1UWQA 4L4OA 5C71A 3OZPA 1EO7A 3WUGA 3VGFA 1V6UA 3AXHA 1OT1A 4QLJA 3W6LA 2V3DA 4BQ5A 4BZYA 2ZX7A 5CPTA 1XH1A 3GXMA 1MVYA 3VNZA 1UR8A 3OG2A 1GNXA 1NOFA 4JCMA 1GZJA 3CIVA 1JF5A 4XB3A 2CCRA 2V5CA 5E6YA 1CLXA 3QR3A 1KR0A 4PMXA 4D6DA 2XVNA 4HP5A 2ZX9A 2VMFA 4RE4A 3ZJ7A 5CSUA 1QHZA 1DWJM 5JBFA 3VILA 4J3TA 1FA2A 1GOKA 1W1YA 5I24A 2VCAA 3CH9A 1CIUA 1PX4A 3VIGA 3BAYA 4JFWA 5D9NA 1VBUA 3THCA 2BFGA 3M07A 3MANA 7A3HA 5IHRA 3AMCA 2WLZA 3WDIA 1OB0A 1VF8A 3N1AA 2BY2A 2VVSA 3GBDA 4KMQA 3WF4A 2VC9A 2X1IA 3W28A 2J25A 4TTUA 2QMKA 4P7LA 3LMYA 4MTVA 3KL3A 1QNSA 1B30A 4GXPA 3MKKA 1V3IA 1M01A 1XV8A 4D1IA 4W88A 3GNOA 3PTQA 3WUEA 1KWGA 3WUFA 1BPLB 3NCOA 3SCNA 2YA2A 3T09A 3AI0A 2E0PA 2BV9A 1FP8A 3L4YA 1NWRA 8A3HA 1M03A 1E0WA 2D24A 3GM8A 3CUHA 5D9MA 2WHMA 4AEEA 2YLLA 3ALFA 1KXVA 2DT1A 2DT0A 1YQ2A 1RP9A 4UOQA 1B9ZA 1UH3A 2WMFA 4ZEPA 1CLVA 3ZR5A 1H11A 3AIRA 3GYCA 4U3AA 2DQXA 3MSGA 1GOQA 3W0KA 1WE5A 3WD3A 1CXIA 4MDOA 1G1YA 4KGLA 4H8HA 1E6QM 1UD3A 2XSAA 1U33A 1BYAA 3CUIA 4J3UA 1W9XA 3RILA 2JEQA 2VUYA 3WF3A 1MYRA 1VENA 1BYCA 2YBTA 1HVQA 1MW3A 2J4GA 3D5HA 1Q6EA 3EYPA 2VRQA 1W1TA 3WQ5A 4F66A 2WAGA 2XM2A 5A6MA 2RGMA 5D4YA 1ISVA 1CZ1A 2OLHA 3WBAA 5EMYA 3W4RA 1OIFA 4S3KA 4UZSA 3VM5A 2BNJA 4J3VA 4CD5A 4W8BA 1GORA 2ZOXA 4BQ2A 1ZBCA 4U3CA 3ARQA 1IV8A 2GJPA 4JFVA 3VIOA 5LA1A 5CLTA 4HOZA 1GW1A 5CJ5A 1R85A 4AC1X 1QNPA 4H8VA 3VMOA 4B9YA 5I2UA 2YL8A 1MWOA 4PSPA 1QNOA 4D6GA 1C90A 4CUCA 1JYNA 1D7FA 1UD2A 3ARVA 1KCKA 5GPRA 1E56A 3VPLA 2G3MA 4P8UA 2WKGA 3FY1A 1V08A 4XX6A 4EE9A 1WDRA 4M1RA 1WPCA 1UHVA 1XRVA 1TCMA 3A4AA 3ARUA 4RE3A 4F8XA 3HU7A 4AZ7A 1EO5A 3K4DA 4PCSA 3I3EA 3AQUA 1GVYA 1CXHA 4IPNB 3RJYA 1W2VA 5KEZA 3VD9A 1JYVA 2WMHA 2PF0A 1C7TA 2VX4A 5BRQA 1FP9A 1GCYA 4HMCA 4M82A 3SUVA 1EQCA 5LYRA 3WDHA 1PBGA 1BTCA 2OSXA 1BYBA 1B31A 2WZEA 5F7UA 1QI4A 2W92A 4D6JA 1JDAA 3A4WA 2OYMA 3OLIA 1UWTA 2PWGA 3BCFA 2VZOA 2Z1SA 2OYKA 5M17A 1CBGA 1W1PA 3KZSA 5BCAA 2VX7A 1QBAA 3BMVA 3VD7A 3FXYA 2XIBA 4OBRA 1KQYA 3MV01 1OGGA 2YLAA 4B3KA 2W5FA 5JUVA 1XGZA 3K8MA 3WUBA 2DH2A 3BCDA 1JZ7A 4HZ8A 4UFKA 2VZUA 1ZBKA 4AZCA 1V3HA 3U7VA 1PEZA 1V3JA 2FGZA 3WNNA 1VFMA 4HU0A 1B2YA 3WQVA 3PZQA 2QMJA 1V0NA 4PUEA 1H09A 1NM9A 3CZ8A 3ARPA 1W3KA 3L2LA 2ZWZA 1W9VA 4LXFA 4AXNA 2VX6A 1VB9A 1JXJA 2XWEA 4GO9A 4PTMA 3VIIA 1SYTA 4OUEA 1E43A 1V6WA 2Q8XA 3AICA 1FHLA 4KWUA 3QGVA 2WSKA 2O92A 2DSZA 2AOSA 5BROA 4AIOA 1BF2A 1MQRA 4QAWA 4TVUA 1WKYA 3AS2A 1R8LA 1V6VA 4CCEA 3LPOA 2BHUA 5CLWA 4URIA 4FLQA 1W9DM 1S46A 1VRXA 3AIQA 1H3GA 3SUSA 1OINA 5BXSA 2HVMA 5ABGA 5JIWA 2DSWA 2ZXDA 4PEEA 4BS0A 2WCAA 4MDPA 9CGTA 5A6AA 4NZCA 1L0PA 1UD5A 1TG7A 2FGLA 3AYRA 5E0FA 3ZT7A 3OLEA 4AIUA 1RD6A 3GH7A 3N11A 5A6JA 1QNQA 5A8MA 1KBBA 3UESA 2J62A 5A8OA 5ECUA 1UR9A 2WNWA 2CXGA 1J0ZA 3LPPA 4JFTA 3GXDA 1C3FA 4GINA 4UFHA 2V3EA 1JF6A 4E4PA 3T0BA 5A94A 2D0GA 1J01A 2X05A 3VUPA 3PZMA 1C91A 4L4PA 3GH5A 3ZJKA 7CGTA 1EOMA 3SCPA 1JZ2A 2JIEA 2WXDM 3L4XA 1BFNA 4MPKA 5AY7A 3VX0A 1E5NA 2EEXA 4GZIA 3N9KA 1CGVA 3WELA 1V6YA 1JD7A 5JIPA 3MMUA 3DHUA 2XUCA 2XGBA 2WC4A 1JZ6A 2W4XA 1QVBA 4P8VA 1QBBA 5ABFA 1ZL1A 3GZAA 4DUXA 2X2YA 4D1JA 1CDGA 4HOXA 3U7BA 4DUWA 3TTQA 1JZ3A 1L8NA 1E4IA 1JI1A 3ALGA 1I1XA 2XFYA 2IXVA 3W82A 2XIIA 4J28A 3B9EA 4PMQA 2VOTA 5I6SA 5FOOA 1ZJBA 4E2OA 1BLIA 3F5KA 1MQPA 3AMDA 2YA0A 1NWUA 4QP0A 3EDKA 4NI3A 2DIJA 2GDUA 1IZKA 3ARSA 2EPMX 3ZOAA 2D0HA 4LX4A 3FAXA 2VTFA 4IPLA 3RDKA 3CZEA 1SMAA 3MUZ1 4PYSA 4GIAA 3QOKA 2UY4A 1H0GA 3EBVA 2GVYA 4GI6A 3B8SA 4AD3A 4DM2A 2DT2A 1K9DA 4DWSC 4AZIA 4UR9A 2CHNA 4QFUA 2QLYA 1GOIA 3VO0A 2ZUUA 1K9EA 4Q22A 1V3MA 4W86A 3PN8A 1BHGA 1V02E 1I75A 4U33A 4OKDA 1FOBA 1HN1A 2VO5A 2JF7A 2D23A 4ML4A 4Z2KA 3HN3A 3CHDA 4XZWA 2WVVB 1PPIA 2XSBA 1UKPA 4ATWA 2UY5A 2WMJA 3RCNA 3UG4A 1A3HA 3O2LA 1E4LA 4NRSA 1DEDA 4P7NA 3NSNA 2CESA 3NSMA 1R7OA 3BAXA 2CHOA 3KL0A 4M24A 2OSYA 4JHOA 5A2BA 3PZTA 1LL6A 4N0RA 3G6MA 2VNCA 3S2CA 3GTNA 1YHTA 1EGZA 2ZUNA 2AMGA 4WIWA 1BGAA 1SR0A 3MUIA 5M3WA 1V0KA 2WCSA 3WL0A 2WMKA 5AYBA 3HMCA 2BS9A 3AZRA 1QPKA 4D71A 1V3KA 3T0DA 5EFDA 2V3FA 2E40A 2CBVA 4OZOA 3TA9A 1EXPA 2W67A 3WD0A 2Z1KA 4GO8A 5HNNA 4OBSA 3A6OA 2JF6A 1ZJAA 3VMNA 1V0LA 4BA0A 2BXYA 3EDEA 2ZUVA 4D6CA 2YDQA 4E8CA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1VJS A;  1UR0 A;  1JAK A;  4HZ7 A;  4QCF A;  3VU2 A;  4XV0 A;  3AS0 A;  5E09 A;  2ZX8 A;  1TZ7 A;  4W89 A;  4AMC A;  4UCF A;  4IM4 A;  1Z32 X;  3VIN A;  4Z2G A;  3AMG A;  3DC0 A;  4HMD A;  3CMJ A;  2CYG A;  2J79 A;  1KGW A;  1W3L A;  4J7R A;  5A8N A;  1B1Y A;  3N13 A;  7TAA A;  5AC4 A;  2WHL A;  4QCE A;  2F61 A;  3OGS A;  1CXL A;  5A6B A;  3CUG A;  2J7D A;  4ZXL A;  2QV4 A;  4LYP A;  1CGW A;  1G9H A;  4H2C A;  1AQH A;  2PI6 A;  4TVD A;  2G8Z A;  3UR7 A;  2BHY A;  3K1D A;  3CHF A;  3L4U A;  3W81 A;  4A4A A;  3QHN A;  1U2Y A;  2WVS A;  5DF0 A;  1JAE A;  1GVI A;  6A3H A;  3APG A;  2DSU A;  2ZUT A;  1B3Z A;  4AYS A;  1B0I A;  1CGT A;  5HBF A;  4OJY A;  3BXW A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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7A3HA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations