Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1a5y_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 4.A N GLU 1.A O LYS 4.A H 2.973 1.996 LYS 4.A NZ GLU 7.A OE2 LYS 4.A HZ1 3.143 2.170 PHE 6.A N MET 2.A O PHE 6.A H 2.943 2.007 GLU 7.A N GLU 3.A O GLU 7.A H 3.033 2.116 GLN 8.A N LYS 4.A O GLN 8.A H 2.866 1.974 ILE 9.A N GLU 5.A O ILE 9.A H 2.852 1.876 ASP 10.A N PHE 6.A O ASP 10.A H 2.945 2.000 LYS 11.A N GLU 7.A O LYS 11.A H 3.024 2.090 SER 12.A N ILE 9.A O SER 12.A H 3.235 2.453 SER 12.A OG GLN 8.A O SER 12.A HG 2.819 1.935 GLY 13.A N ASP 10.A O GLY 13.A H 2.969 2.055 SER 14.A N ILE 9.A O SER 14.A H 2.923 2.049 TRP 15.A NE1 ASP 10.A OD1 TRP 15.A HE1 2.843 2.050 ILE 18.A N SER 14.A O ILE 18.A H 2.778 1.826 TYR 19.A N TRP 15.A O TYR 19.A H 2.913 1.961 TYR 19.A OH ILE 259.A O TYR 19.A HH 2.694 1.820 GLN 20.A N ALA 16.A O GLN 20.A H 2.867 1.929 ASP 21.A N ALA 17.A O ASP 21.A H 2.976 2.055 ILE 22.A N ILE 18.A O ILE 22.A H 3.276 2.423 ARG 23.A N TYR 19.A O ARG 23.A H 3.175 2.274 ARG 23.A NE TYR 19.A OH ARG 23.A HE 3.305 2.483 ARG 23.A NH2 TYR 19.A OH ARG 23.A HH21 3.156 2.276 HIS 24.A N GLN 20.A O HIS 24.A H 2.892 1.933 GLU 25.A N ASP 21.A O GLU 25.A H 2.822 1.986 ALA 26.A N ARG 23.A O ALA 26.A H 3.090 2.271 CYS 31.A SG PHE 29.A O no hydrogen 3.907 N/A CYS 31.A SG SER 49.A O no hydrogen 3.934 N/A CYS 31.A SG PRO 50.A O no hydrogen 3.287 N/A ARG 32.A N ASP 52.A OD2 ARG 32.A H 2.696 1.985 VAL 33.A N ASP 52.A OD1 VAL 33.A H 2.878 1.964 LYS 35.A N CYS 31.A O LYS 35.A H 3.245 2.429 LYS 35.A N ARG 32.A O LYS 35.A H 3.206 2.520 LYS 35.A NZ ARG 46.A O LYS 35.A HZ3 2.801 1.877 LEU 36.A N VAL 33.A O LEU 36.A H 3.164 2.258 ASN 39.A N LEU 36.A O ASN 39.A H 2.914 2.021 ASN 39.A ND2 VAL 33.A O ASN 39.A HD22 2.775 1.852 LYS 40.A N PRO 37.A O LYS 40.A H 3.221 2.275 ARG 42.A N ASN 39.A O ARG 42.A H 2.925 2.009 ARG 42.A NH1 ASN 63.A O ARG 42.A HH12 3.423 2.642 ARG 42.A NH1 TYR 65.A O ARG 42.A HH11 2.582 1.701 ASN 43.A N LYS 40.A O ASN 43.A H 3.327 2.411 ASN 43.A ND2 ALA 34.A O ASN 43.A HD21 3.025 2.276 ARG 44.A NE GLY 85.A O ARG 44.A HE 2.985 2.133 ARG 44.A NH2 GLY 85.A O ARG 44.A HH21 2.873 1.972 TYR 45.A OH SER 214.A OG TYR 45.A HH 2.754 1.915 VAL 48.A N TYR 45.A O VAL 48.A H 3.005 2.044 ASP 52.A N PRO 30.A O ASP 52.A H 2.843 1.867 HIS 53.A NE2 LYS 253.A O HIS 53.A HE2 2.651 1.845 SER 54.A N PHE 51.A O SER 54.A H 3.397 2.486 SER 54.A OG PHE 254.A O SER 54.A HG 2.562 1.893 ARG 55.A NH1 ASP 64.A O ARG 55.A HH12 3.383 2.580 ARG 55.A NH1 ASP 64.A OD1 ARG 55.A HH12 3.130 2.291 ARG 55.A NH2 ASP 64.A OD1 ARG 55.A HH22 3.004 2.090 ARG 55.A NH2 ASP 64.A OD2 ARG 55.A HH22 3.153 2.278 ILE 56.A N ALA 68.A O ILE 56.A H 2.824 1.907 LEU 58.A N ASP 64.A O LEU 58.A H 2.854 1.881 HIS 59.A N GLU 100.A OE1 HIS 59.A H 2.848 1.962 HIS 59.A N GLU 100.A OE2 HIS 59.A H 3.205 2.450 GLN 60.A N LEU 58.A O GLN 60.A H 2.924 2.111 GLN 60.A NE2 GLU 96.A OE1 GLN 60.A HE22 3.192 2.328 ASN 63.A N GLN 60.A OE1 ASN 63.A H 2.953 1.993 ASN 63.A ND2 ASN 39.A OD1 ASN 63.A HD21 2.823 1.866 TYR 65.A N ASN 63.A OD1 TYR 65.A H 3.108 2.210 TYR 65.A OH ASN 43.A OD1 TYR 65.A HH 2.708 1.749 ASN 67.A ND2 ASN 43.A OD1 ASN 67.A HD22 3.130 2.241 ASN 67.A ND2 VAL 48.A O ASN 67.A HD21 2.836 1.924 SER 69.A N LEU 82.A O SER 69.A H 2.959 1.989 LEU 70.A N SER 54.A O LEU 70.A H 2.782 1.808 ILE 71.A N TYR 80.A O ILE 71.A H 2.746 1.935 MET 73.A N ARG 78.A O MET 73.A H 2.879 1.965 GLN 77.A N GLU 74.A O GLN 77.A H 2.975 2.226 ARG 78.A N MET 73.A O ARG 78.A H 3.167 2.219 ARG 78.A NE ASP 227.A OD2 ARG 78.A HE 3.025 2.132 ARG 78.A NH2 ASP 227.A OD1 ARG 78.A HH21 3.064 2.142 ARG 78.A NH2 ASP 227.A OD2 ARG 78.A HH21 3.069 2.186 TYR 80.A N ILE 71.A O TYR 80.A H 2.919 1.979 TYR 80.A OH THR 228.A OG1 TYR 80.A HH 2.934 1.971 ILE 81.A N VAL 210.A O ILE 81.A H 2.945 1.972 LEU 82.A N SER 69.A O LEU 82.A H 2.923 2.017 THR 83.A N VAL 212.A O THR 83.A H 3.060 2.170 THR 83.A OG1 ASN 67.A O THR 83.A HG1 2.600 1.793 GLY 85.A N SER 214.A O GLY 85.A H 2.896 1.949 LEU 87.A N THR 90.A OG1 LEU 87.A H 2.767 1.824 ASN 89.A ND2 ASN 41.A O ASN 89.A HD21 2.976 2.014 THR 90.A N LEU 87.A O THR 90.A H 2.747 1.879 CYS 91.A SG LEU 87.A O no hydrogen 3.472 N/A PHE 94.A N THR 90.A O PHE 94.A H 3.015 2.073 TRP 95.A N CYS 91.A O TRP 95.A H 3.183 2.239 TRP 95.A NE1 TYR 123.A O TRP 95.A HE1 2.923 1.996 GLU 96.A N GLY 92.A O GLU 96.A H 2.853 2.026 MET 97.A N HIS 93.A O MET 97.A H 2.808 1.863 VAL 98.A N PHE 94.A O VAL 98.A H 2.922 1.992 TRP 99.A N TRP 95.A O TRP 99.A H 2.925 2.006 GLU 100.A N GLU 96.A O GLU 100.A H 2.799 1.819 GLN 101.A N MET 97.A O GLN 101.A H 2.905 1.971 LYS 102.A N TRP 99.A O LYS 102.A H 2.937 2.055 SER 103.A N VAL 98.A O SER 103.A H 3.002 2.091 SER 103.A OG PRO 209.A O SER 103.A HG 2.586 1.760 ARG 104.A NH2 GLU 169.A OE2 ARG 104.A HH22 2.724 1.969 VAL 106.A N LEU 171.A O VAL 106.A H 2.938 2.077 VAL 107.A N VAL 211.A O VAL 107.A H 2.839 1.877 MET 108.A N PHE 173.A O MET 108.A H 2.730 1.769 LEU 109.A N HIS 213.A O LEU 109.A H 3.004 2.051 ARG 111.A N GLU 114.A OE2 ARG 111.A H 3.344 2.459 GLU 114.A N SER 117.A O GLU 114.A H 2.782 1.848 SER 117.A N GLU 114.A O SER 117.A H 2.874 1.923 LYS 119.A N VAL 112.A O LYS 119.A H 2.883 2.079 CYS 120.A SG ALA 121.A O no hydrogen 3.195 N/A ALA 121.A N PRO 86.A O ALA 121.A H 3.070 2.151 GLU 128.A N GLU 128.A OE1 GLU 128.A H 2.674 1.814 LYS 130.A N LYS 127.A O LYS 130.A H 2.940 2.021 MET 132.A N LEU 141.A O MET 132.A H 2.953 2.010 PHE 134.A N LEU 139.A O PHE 134.A H 2.776 1.816 THR 137.A OG1 GLY 92.A O THR 137.A HG1 2.970 2.112 ASN 138.A N GLU 135.A O ASN 138.A H 3.101 2.340 ASN 138.A ND2 THR 163.A OG1 ASN 138.A HD22 2.621 1.901 LEU 139.A N PHE 134.A O LEU 139.A H 3.246 2.332 LYS 140.A N GLU 160.A O LYS 140.A H 2.852 1.904 LEU 141.A N MET 132.A O LEU 141.A H 2.722 1.767 THR 142.A N GLU 158.A O THR 142.A H 2.943 1.992 ILE 144.A N GLN 156.A O ILE 144.A H 2.828 1.884 SER 145.A N GLN 156.A O SER 145.A H 3.377 2.461 ASP 147.A N VAL 154.A O ASP 147.A H 2.817 1.858 LYS 149.A N TYR 152.A O LYS 149.A H 2.813 2.019 TYR 151.A OH SER 189.A O TYR 151.A HH 2.666 1.912 THR 153.A N HIS 174.A O THR 153.A H 2.923 2.006 VAL 154.A N ASP 147.A O VAL 154.A H 3.022 2.061 ARG 155.A N HIS 172.A O ARG 155.A H 2.711 1.836 ARG 155.A NE GLU 146.A OE1 ARG 155.A HE 3.499 2.696 GLN 156.A N SER 145.A O GLN 156.A H 2.783 1.814 GLN 156.A NE2 SER 145.A OG GLN 156.A HE22 2.878 2.134 LEU 157.A N ILE 170.A O LEU 157.A H 2.866 1.913 GLU 158.A N THR 142.A O GLU 158.A H 2.745 1.847 LEU 159.A N ARG 168.A O LEU 159.A H 2.774 1.823 GLU 160.A N LYS 140.A O GLU 160.A H 2.805 1.882 ASN 161.A N GLU 166.A O ASN 161.A H 2.831 1.919 ASN 161.A ND2 ASN 138.A O ASN 161.A HD22 3.532 2.688 LEU 162.A N ASN 138.A O LEU 162.A H 3.229 2.460 GLU 166.A N THR 164.A OG1 GLU 166.A H 3.093 2.215 ARG 168.A N LEU 159.A O ARG 168.A H 2.753 1.850 ARG 168.A NE GLU 166.A OE2 ARG 168.A HE 3.269 2.309 ARG 168.A NH1 TRP 99.A O ARG 168.A HH12 2.792 1.980 ILE 170.A N LEU 157.A O ILE 170.A H 2.797 1.826 LEU 171.A N ARG 104.A O LEU 171.A H 2.945 1.991 HIS 172.A N ARG 155.A O HIS 172.A H 2.758 1.799 HIS 172.A NE2 TYR 123.A OH HIS 172.A HE2 2.712 1.775 PHE 173.A N VAL 106.A O PHE 173.A H 2.735 1.802 HIS 174.A N THR 153.A O HIS 174.A H 2.838 1.891 HIS 174.A NE2 ASN 110.A O HIS 174.A HE2 2.645 1.877 TYR 175.A N MET 108.A O TYR 175.A H 2.784 1.880 THR 176.A N TYR 151.A O THR 176.A H 3.006 2.125 THR 177.A N TYR 151.A O THR 177.A H 3.399 2.571 TRP 178.A NE1 GLY 182.A O TRP 178.A HE1 2.727 1.769 GLY 182.A N PRO 179.A O GLY 182.A H 2.703 1.839 LEU 191.A N PRO 187.A O LEU 191.A H 2.766 1.809 ASN 192.A N ALA 188.A O ASN 192.A H 2.934 2.004 PHE 193.A N SER 189.A O PHE 193.A H 3.040 2.199 LEU 194.A N PHE 190.A O LEU 194.A H 2.782 1.821 PHE 195.A N LEU 191.A O PHE 195.A H 2.833 1.864 LYS 196.A N ASN 192.A O LYS 196.A H 3.091 2.273 VAL 197.A N PHE 193.A O VAL 197.A H 2.927 2.012 ARG 198.A N LEU 194.A O ARG 198.A H 2.874 1.938 ARG 198.A NE ASP 227.A OD1 ARG 198.A HE 2.592 1.869 ARG 198.A NH2 ASP 227.A OD1 ARG 198.A HH21 2.602 1.860 GLU 199.A N PHE 195.A O GLU 199.A H 2.867 1.897 SER 200.A N LYS 196.A O SER 200.A H 3.235 2.460 SER 200.A N VAL 197.A O SER 200.A H 3.258 2.476 SER 200.A OG VAL 197.A O SER 200.A HG 2.603 1.808 GLY 201.A N ARG 198.A O GLY 201.A H 2.821 1.885 SER 202.A N SER 200.A OG SER 202.A H 3.088 2.169 SER 202.A OG SER 200.A OG SER 202.A HG 2.634 1.808 SER 204.A N GLY 201.A O SER 204.A H 3.076 2.133 SER 204.A OG GLY 201.A O SER 204.A HG 3.000 2.336 GLU 206.A N GLU 206.A OE1 GLU 206.A H 3.142 2.301 HIS 207.A N SER 204.A O HIS 207.A H 3.018 2.137 HIS 207.A ND1 GLY 201.A O HIS 207.A HD1 3.142 2.309 GLY 208.A N LYS 102.A O GLY 208.A H 2.957 2.145 VAL 211.A N GLY 105.A O VAL 211.A H 3.237 2.293 VAL 212.A N ILE 81.A O VAL 212.A H 2.791 1.848 HIS 213.A N VAL 107.A O HIS 213.A H 2.877 1.949 SER 214.A OG LYS 119.A O SER 214.A HG 2.783 1.828 ARG 219.A NH1 GLU 114.A OE1 ARG 219.A HH12 3.515 2.691 ARG 219.A NH1 GLU 114.A OE2 ARG 219.A HH12 3.165 2.204 ARG 219.A NH1 TRP 178.A O ARG 219.A HH11 3.003 2.200 ARG 219.A NH2 GLU 114.A OE1 ARG 219.A HH22 3.194 2.265 GLY 221.A N ILE 217.A O GLY 221.A H 3.188 2.394 THR 222.A N GLY 218.A O THR 222.A H 3.140 2.195 THR 222.A OG1 GLY 218.A O THR 222.A HG1 3.011 2.055 PHE 223.A N ARG 219.A O PHE 223.A H 3.075 2.131 CYS 224.A N SER 220.A O CYS 224.A H 3.011 2.036 CYS 224.A SG SER 220.A O no hydrogen 3.353 N/A LEU 225.A N GLY 221.A O LEU 225.A H 2.680 1.782 ALA 226.A N THR 222.A O ALA 226.A H 2.890 1.913 ASP 227.A N PHE 223.A O ASP 227.A H 3.082 2.167 THR 228.A N CYS 224.A O THR 228.A H 3.045 2.070 CYS 229.A N LEU 225.A O CYS 229.A H 3.041 2.072 CYS 229.A SG LEU 225.A O no hydrogen 3.382 N/A LEU 230.A N ALA 226.A O LEU 230.A H 3.095 2.185 LEU 231.A N ASP 227.A O LEU 231.A H 2.817 1.920 LEU 232.A N THR 228.A O LEU 232.A H 2.858 1.919 MET 233.A N CYS 229.A O MET 233.A H 3.042 2.124 ASP 234.A N LEU 230.A O ASP 234.A H 2.954 2.065 LYS 235.A N LEU 231.A O LYS 235.A H 2.985 2.005 ARG 236.A N LEU 232.A O ARG 236.A H 3.361 2.421 LYS 237.A N ASP 234.A O LYS 237.A H 2.854 2.108 LYS 237.A NZ ASP 234.A OD1 LYS 237.A HZ1 2.818 1.978 ASP 238.A N MET 233.A O ASP 238.A H 3.116 2.245 SER 241.A N ASP 238.A O SER 241.A H 3.210 2.290 VAL 242.A N PRO 239.A O VAL 242.A H 3.461 2.528 LYS 245.A N ASP 243.A OD1 LYS 245.A H 3.173 2.422 LYS 245.A NZ GLU 5.A OE1 LYS 245.A HZ3 3.296 2.474 LYS 245.A NZ GLU 5.A OE2 LYS 245.A HZ3 2.913 1.897 LYS 245.A NZ ASP 243.A OD1 LYS 245.A HZ1 2.946 2.092 VAL 247.A N ASP 243.A O VAL 247.A H 3.009 2.048 LEU 248.A N ILE 244.A O LEU 248.A H 2.830 1.882 LEU 249.A N LYS 245.A O LEU 249.A H 2.910 1.979 ASP 250.A N LYS 246.A O ASP 250.A H 2.931 2.117 MET 251.A N VAL 247.A O MET 251.A H 3.036 2.166 ARG 252.A N LEU 248.A O ARG 252.A H 2.898 2.021 ARG 252.A NE LEU 258.A O ARG 252.A HE 3.013 2.272 ARG 252.A NH2 LEU 258.A O ARG 252.A HH21 2.786 1.989 ARG 252.A NH2 ILE 259.A O ARG 252.A HH21 3.165 2.545 LYS 253.A N ASP 250.A O LYS 253.A H 3.480 2.574 LYS 253.A NZ ASP 250.A OD1 LYS 253.A HZ1 2.923 1.984 PHE 254.A N MET 251.A O PHE 254.A H 3.074 2.153 ARG 255.A NE GLY 216.A O ARG 255.A HE 3.115 2.275 ARG 255.A NH1 ASN 67.A OD1 ARG 255.A HH12 3.029 2.204 ARG 255.A NH1 SER 69.A OG ARG 255.A HH11 3.082 2.137 ARG 255.A NH2 ASN 67.A OD1 ARG 255.A HH22 2.783 1.865 ARG 255.A NH2 ALA 215.A O ARG 255.A HH21 3.047 2.085 ILE 259.A N ILE 217.A O ILE 259.A H 2.863 1.905 ALA 260.A N GLN 264.A OE1 ALA 260.A H 2.774 1.966 GLN 264.A N THR 261.A OG1 GLN 264.A H 3.254 2.289 GLN 264.A NE2 GLY 182.A O GLN 264.A HE22 3.032 2.101 LEU 265.A N THR 261.A O LEU 265.A H 3.401 2.486 ARG 266.A N ALA 262.A O ARG 266.A H 2.989 2.037 ARG 266.A NE ASP 10.A OD1 ARG 266.A HE 2.842 1.919 ARG 266.A NH2 ASP 10.A OD1 ARG 266.A HH21 3.196 2.378 ARG 266.A NH2 ASP 10.A OD2 ARG 266.A HH21 2.733 1.823 PHE 267.A N GLU 263.A O PHE 267.A H 2.634 1.775 SER 268.A N GLN 264.A O SER 268.A H 2.846 1.919 SER 268.A OG GLN 264.A O SER 268.A HG 2.854 1.892 TYR 269.A N LEU 265.A O TYR 269.A H 3.225 2.277 LEU 270.A N ARG 266.A O LEU 270.A H 3.300 2.331 ALA 271.A N PHE 267.A O ALA 271.A H 2.856 1.897 VAL 272.A N SER 268.A O VAL 272.A H 2.917 1.961 ILE 273.A N TYR 269.A O ILE 273.A H 2.713 1.751 GLU 274.A N LEU 270.A O GLU 274.A H 3.092 2.181 GLY 275.A N ALA 271.A O GLY 275.A H 2.694 1.829 ALA 276.A N VAL 272.A O ALA 276.A H 2.829 2.018 LYS 277.A N GLU 274.A O LYS 277.A H 3.259 2.496 LYS 277.A NZ GLU 3.A OE2 LYS 277.A HZ3 3.274 2.514 LYS 277.A NZ ILE 273.A O LYS 277.A HZ2 3.215 2.512 ILE 279.A N GLY 275.A O ILE 279.A H 3.127 2.179 MET 280.A N ALA 276.A O MET 280.A H 2.694 1.967 MET 280.A N LYS 277.A O MET 280.A H 2.806 2.016 GLY 281.A N PHE 278.A O GLY 281.A H 2.764 1.981 ASP 282.A N LYS 277.A O ASP 282.A H 3.458 2.547