Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1aa4_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 5.A N THR 272.A O ALA 5.A H 2.845 1.887 SER 6.A N GLY 126.A O SER 6.A H 2.778 1.882 GLU 8.A N GLU 8.A OE1 GLU 8.A H 2.817 1.948 ARG 11.A N GLU 8.A O ARG 11.A H 2.968 2.014 ARG 11.A NH1 ASP 15.A OD1 ARG 11.A HH11 3.083 2.138 SER 12.A N ASP 15.A OD2 SER 12.A H 2.945 1.994 ASP 15.A N SER 12.A O ASP 15.A H 3.097 2.351 GLN 17.A N TYR 13.A O GLN 17.A H 2.946 1.980 GLN 17.A NE2 TYR 13.A OH GLN 17.A HE22 2.742 1.827 LYS 18.A N GLU 14.A O LYS 18.A H 3.104 2.247 VAL 19.A N ASP 15.A O VAL 19.A H 3.203 2.273 TYR 20.A N PHE 16.A O TYR 20.A H 2.829 1.860 TYR 20.A OH GLU 115.A OE2 TYR 20.A HH 2.759 1.920 ASN 21.A N GLN 17.A O ASN 21.A H 2.962 1.981 ASN 21.A ND2 GLN 289.A OE1 ASN 21.A HD21 2.798 2.012 ALA 22.A N LYS 18.A O ALA 22.A H 3.019 2.116 ILE 23.A N VAL 19.A O ILE 23.A H 3.044 2.068 ALA 24.A N TYR 20.A O ALA 24.A H 2.851 1.877 LEU 25.A N ASN 21.A O LEU 25.A H 2.848 1.933 LYS 26.A N ALA 22.A O LYS 26.A H 3.125 2.208 LYS 26.A NZ ASP 30.A OD2 LYS 26.A HZ3 3.102 2.296 LEU 27.A N ILE 23.A O LEU 27.A H 2.868 1.956 ARG 28.A N ALA 24.A O ARG 28.A H 3.253 2.376 ARG 28.A NH1 LEU 291.A O ARG 28.A HH12 3.127 2.168 ARG 28.A NH2 LEU 291.A O ARG 28.A HH22 3.442 2.611 ARG 28.A NH2 LEU 291.A OXT ARG 28.A HH22 2.772 1.891 GLU 29.A N LEU 25.A O GLU 29.A H 3.021 2.109 ASP 30.A N LYS 26.A O ASP 30.A H 2.829 1.877 ASP 31.A N GLU 29.A O ASP 31.A H 2.959 2.091 TYR 36.A N GLU 32.A O TYR 36.A H 3.041 2.095 ILE 37.A N ASP 34.A O ILE 37.A H 3.031 2.090 GLY 38.A N TYR 33.A O GLY 38.A H 2.939 2.000 LEU 43.A N TYR 39.A O LEU 43.A H 3.130 2.256 VAL 44.A N GLY 40.A O VAL 44.A H 2.993 2.087 ARG 45.A N PRO 41.A O ARG 45.A H 2.955 2.005 ARG 45.A NH1 ALA 80.A O ARG 45.A HH12 3.263 2.274 LEU 46.A N VAL 42.A O LEU 46.A H 2.915 1.989 ALA 47.A N LEU 43.A O ALA 47.A H 3.202 2.239 TRP 48.A N VAL 44.A O TRP 48.A H 3.074 2.140 HIS 49.A N ARG 45.A O HIS 49.A H 2.910 1.933 HIS 49.A ND1 ASN 79.A OD1 HIS 49.A HD1 2.745 1.818 ILE 50.A N LEU 46.A O ILE 50.A H 3.013 2.066 SER 51.A N ALA 47.A O SER 51.A H 3.393 2.574 GLY 52.A N TRP 48.A O GLY 52.A H 2.705 1.896 TRP 54.A N SER 51.A O TRP 54.A H 3.165 2.206 TRP 54.A NE1 ASN 59.A OD1 TRP 54.A HE1 2.816 1.846 ASP 55.A N THR 60.A O ASP 55.A H 2.945 2.046 LYS 56.A N ARG 157.A O LYS 56.A H 3.028 2.052 LYS 56.A NZ GLN 156.A O LYS 56.A HZ1 2.785 1.887 HIS 57.A N ASP 55.A OD1 HIS 57.A H 2.931 1.992 ASN 59.A ND2 LEU 1.A O ASN 59.A HD22 2.763 1.841 ASN 59.A ND2 GLY 270.A O ASN 59.A HD21 3.171 2.204 THR 60.A N ASP 58.A OD1 THR 60.A H 3.249 2.311 GLY 62.A N THR 53.A OG1 GLY 62.A H 2.857 1.922 GLY 66.A N SER 63.A O GLY 66.A H 3.463 2.537 ARG 69.A N GLY 66.A O ARG 69.A H 3.285 2.308 ARG 69.A NE GLY 66.A O ARG 69.A HE 3.035 2.315 ARG 69.A NH1 THR 130.A O ARG 69.A HH12 3.530 2.763 ARG 69.A NH2 GLY 65.A O ARG 69.A HH21 2.619 1.881 ARG 69.A NH2 THR 130.A O ARG 69.A HH22 3.086 2.179 PHE 70.A N THR 67.A O PHE 70.A H 2.954 2.039 LYS 72.A NZ THR 135.A O LYS 72.A HZ2 3.342 2.469 LYS 72.A NZ ASP 137.A OD1 LYS 72.A HZ3 3.174 2.154 PHE 74.A N PHE 70.A O PHE 74.A H 2.939 1.964 ASN 75.A N LYS 71.A O ASN 75.A H 2.761 1.868 ASP 76.A N GLU 73.A O ASP 76.A H 3.185 2.262 SER 78.A N ASP 76.A OD1 SER 78.A H 3.248 2.346 SER 78.A OG ASP 76.A OD1 SER 78.A HG 3.167 2.343 ASN 79.A N ASP 76.A O ASN 79.A H 2.924 2.025 ASN 79.A ND2 GLU 73.A O ASN 79.A HD22 2.812 1.884 ALA 80.A N PRO 77.A O ALA 80.A H 3.226 2.269 GLY 81.A N GLN 83.A OE1 GLY 81.A H 2.870 2.108 LEU 82.A N ASN 79.A O LEU 82.A H 2.866 1.920 GLN 83.A N GLN 83.A OE1 GLN 83.A H 2.820 1.932 ASN 84.A N GLY 81.A O ASN 84.A H 3.370 2.482 ASN 84.A ND2 GLY 81.A O ASN 84.A HD22 3.321 2.757 GLY 85.A N LEU 82.A O GLY 85.A H 2.852 2.161 PHE 86.A N LEU 82.A O PHE 86.A H 3.111 2.147 LYS 87.A N GLN 83.A O LYS 87.A H 2.958 1.982 PHE 88.A N ASN 84.A O PHE 88.A H 3.312 2.429 LEU 89.A N GLY 85.A O LEU 89.A H 3.059 2.126 GLU 90.A N PHE 86.A O GLU 90.A H 2.945 2.171 HIS 93.A N LEU 89.A O HIS 93.A H 3.106 2.205 HIS 93.A NE2 ILE 99.A O HIS 93.A HE2 2.685 1.801 LYS 94.A N GLU 90.A O LYS 94.A H 3.138 2.203 GLU 95.A N PRO 91.A O GLU 95.A H 3.100 2.185 PHE 96.A N ILE 92.A O PHE 96.A H 2.866 1.999 ILE 99.A N PHE 96.A O ILE 99.A H 3.184 2.251 SER 100.A N GLU 8.A OE2 SER 100.A H 3.221 2.246 SER 101.A N ASP 129.A OD1 SER 101.A H 2.952 2.135 LEU 104.A N SER 100.A O LEU 104.A H 2.939 1.991 PHE 105.A N SER 101.A O PHE 105.A H 2.936 1.957 SER 106.A N GLY 102.A O SER 106.A H 2.932 1.972 LEU 107.A N ASP 103.A O LEU 107.A H 2.911 1.968 GLY 108.A N LEU 104.A O GLY 108.A H 2.970 2.026 GLY 109.A N PHE 105.A O GLY 109.A H 3.509 2.570 VAL 110.A N SER 106.A O VAL 110.A H 3.145 2.186 THR 111.A N LEU 107.A O THR 111.A H 2.817 1.878 ALA 112.A N GLY 108.A O ALA 112.A H 3.029 2.068 VAL 113.A N GLY 109.A O VAL 113.A H 3.220 2.241 GLN 114.A N VAL 110.A O GLN 114.A H 3.156 2.175 GLN 114.A NE2 TYR 20.A OH GLN 114.A HE22 3.340 2.518 GLN 114.A NE2 PHE 283.A O GLN 114.A HE21 2.854 2.021 GLU 115.A N THR 111.A O GLU 115.A H 2.900 1.952 MET 116.A N ALA 112.A O MET 116.A H 2.862 1.976 GLN 117.A N GLN 114.A O GLN 117.A H 3.119 2.400 GLY 118.A N VAL 113.A O GLY 118.A H 2.774 1.910 LYS 120.A NZ PHE 283.A O LYS 120.A HZ2 3.269 2.294 LYS 120.A NZ GLU 288.A OE1 LYS 120.A HZ3 2.945 1.997 LYS 120.A NZ GLU 288.A OE2 LYS 120.A HZ3 3.532 2.658 ILE 121.A N GLN 114.A OE1 ILE 121.A H 2.999 2.108 TRP 123.A N PHE 281.A O TRP 123.A H 3.015 2.057 GLY 126.A N ASP 103.A OD2 GLY 126.A H 3.022 2.082 ARG 127.A N ASP 103.A OD1 ARG 127.A H 3.048 2.173 THR 130.A N GLY 65.A O THR 130.A H 3.171 2.219 THR 134.A N PRO 131.A O THR 134.A H 2.814 1.858 THR 135.A N GLU 132.A O THR 135.A H 3.110 2.186 ARG 140.A NH1 THR 53.A O ARG 140.A HH11 2.727 1.786 ARG 140.A NH1 THR 60.A O ARG 140.A HH12 3.534 2.839 ARG 140.A NH1 THR 60.A OG1 ARG 140.A HH12 3.131 2.264 ARG 140.A NH2 THR 60.A OG1 ARG 140.A HH22 3.028 2.113 ASP 143.A N TYR 150.A OH ASP 143.A H 2.892 1.938 LYS 146.A NZ ASP 145.A OD1 LYS 146.A HZ1 2.775 2.023 TYR 150.A N ASP 147.A OD1 TYR 150.A H 3.416 2.502 VAL 151.A N ASP 147.A O VAL 151.A H 3.143 2.188 ARG 152.A N ALA 148.A O ARG 152.A H 2.933 1.974 ARG 152.A NE ASP 162.A OD1 ARG 152.A HE 2.748 1.905 ARG 152.A NH1 ASP 238.A OD2 ARG 152.A HH12 2.908 1.932 ARG 152.A NH2 ASP 162.A OD1 ARG 152.A HH21 3.323 2.641 ARG 152.A NH2 ASP 238.A OD1 ARG 152.A HH22 2.929 1.948 ARG 152.A NH2 ASP 238.A OD2 ARG 152.A HH22 3.478 2.705 THR 153.A N GLY 149.A O THR 153.A H 3.067 2.128 THR 153.A OG1 GLY 149.A O THR 153.A HG1 3.096 2.397 PHE 154.A N TYR 150.A O PHE 154.A H 2.800 1.837 PHE 155.A N VAL 151.A O PHE 155.A H 3.080 2.113 GLN 156.A N ARG 152.A O GLN 156.A H 3.333 2.607 GLN 156.A N THR 153.A O GLN 156.A H 3.217 2.398 ARG 157.A N PHE 154.A O ARG 157.A H 3.134 2.258 ARG 157.A NE TRP 54.A O ARG 157.A HE 2.898 2.037 ARG 157.A NH1 ARG 140.A O ARG 157.A HH12 2.866 1.904 ARG 157.A NH2 TRP 54.A O ARG 157.A HH21 3.009 2.183 ARG 157.A NH2 ARG 140.A O ARG 157.A HH22 3.229 2.414 LEU 158.A N PHE 155.A O LEU 158.A H 3.201 2.473 MET 160.A N PHE 155.A O MET 160.A H 3.088 2.117 ASN 161.A N GLU 164.A OE1 ASN 161.A H 2.863 1.929 ARG 163.A NE ASP 258.A OD2 ARG 163.A HE 3.354 2.568 ARG 163.A NH1 GLU 247.A OE1 ARG 163.A HH12 3.037 2.136 ARG 163.A NH2 GLU 247.A OE1 ARG 163.A HH22 3.173 2.329 ARG 163.A NH2 GLU 247.A OE2 ARG 163.A HH22 2.801 1.901 ARG 163.A NH2 ASP 258.A OD2 ARG 163.A HH21 3.263 2.369 GLU 164.A N ASN 161.A OD1 GLU 164.A H 2.961 1.996 VAL 165.A N ASN 161.A O VAL 165.A H 2.923 1.944 VAL 166.A N ASP 162.A O VAL 166.A H 2.944 1.988 ALA 167.A N ARG 163.A O ALA 167.A H 2.989 2.028 LEU 168.A N GLU 164.A O LEU 168.A H 2.927 1.954 MET 169.A N VAL 165.A O MET 169.A H 3.007 2.053 GLY 170.A N ALA 167.A O GLY 170.A H 3.203 2.379 ALA 171.A N LEU 168.A O ALA 171.A H 3.156 2.196 HIS 172.A N MET 169.A O HIS 172.A H 2.927 1.975 HIS 172.A ND1 ASP 232.A OD1 HIS 172.A HD1 2.880 1.937 ALA 173.A N GLY 170.A O ALA 173.A H 3.229 2.263 LEU 174.A N ALA 171.A O LEU 174.A H 3.027 2.112 GLY 175.A N ASN 192.A O GLY 175.A H 2.765 1.800 LYS 176.A NZ THR 177.A O LYS 176.A HZ1 2.830 2.036 LYS 176.A NZ GLU 185.A OE2 LYS 176.A HZ2 2.976 1.981 THR 177.A N GLY 186.A O THR 177.A H 2.902 1.965 HIS 178.A NE2 ASP 34.A OD2 HIS 178.A HE2 2.823 1.926 LEU 179.A N GLU 185.A OE1 LEU 179.A H 2.938 1.974 ASN 181.A N HIS 178.A O ASN 181.A H 2.928 2.114 SER 182.A N HIS 178.A O SER 182.A H 3.051 2.073 GLY 183.A N LEU 179.A O GLY 183.A H 2.833 1.964 GLU 185.A N GLN 219.A OE1 GLU 185.A H 3.198 2.230 GLY 186.A N THR 177.A O GLY 186.A H 3.236 2.290 ALA 190.A N GLU 198.A OE2 ALA 190.A H 2.875 2.056 ALA 191.A N GLU 198.A OE1 ALA 191.A H 3.083 2.299 ASN 192.A N ALA 190.A O ASN 192.A H 3.127 2.420 ASN 193.A ND2 ILE 37.A O ASN 193.A HD22 2.913 1.953 PHE 195.A N MET 116.A O PHE 195.A H 2.811 1.835 ASN 197.A ND2 TYR 248.A O ASN 197.A HD22 2.912 1.964 TYR 200.A N ASN 197.A O TYR 200.A H 3.045 2.261 LEU 201.A N ASN 197.A O LEU 201.A H 3.363 2.405 ASN 202.A N GLU 198.A O ASN 202.A H 2.874 1.904 ASN 202.A ND2 GLY 188.A O ASN 202.A HD22 2.847 1.906 ASN 202.A ND2 GLU 198.A OE2 ASN 202.A HD21 3.480 2.621 LEU 203.A N PHE 199.A O LEU 203.A H 3.115 2.176 LEU 204.A N TYR 200.A O LEU 204.A H 3.217 2.253 ASN 205.A N LEU 201.A O ASN 205.A H 2.822 1.975 GLU 206.A N ASN 202.A O GLU 206.A H 2.929 2.005 TRP 208.A NE1 LEU 203.A O TRP 208.A HE1 3.245 2.389 LYS 209.A N ASP 221.A O LYS 209.A H 2.761 1.924 GLU 211.A N GLN 219.A O GLU 211.A H 2.932 1.986 ASN 213.A N ASN 217.A O ASN 213.A H 2.858 1.886 ASN 213.A ND2 GLY 183.A O ASN 213.A HD21 2.831 2.068 ASN 213.A ND2 GLN 219.A OE1 ASN 213.A HD22 2.806 1.854 ALA 215.A N ASN 213.A OD1 ALA 215.A H 3.030 2.310 ASN 216.A N ASN 213.A O ASN 216.A H 2.778 1.923 ASN 217.A N ASN 213.A OD1 ASN 217.A H 2.980 2.041 GLN 219.A N GLU 211.A O GLN 219.A H 2.982 2.024 GLN 219.A NE2 GLU 185.A O GLN 219.A HE21 2.935 2.007 GLN 219.A NE2 ASP 221.A OD1 GLN 219.A HE22 3.040 2.087 TRP 220.A N MET 228.A O TRP 220.A H 2.998 2.115 ASP 221.A N LYS 209.A O ASP 221.A H 2.837 1.866 SER 222.A N TYR 226.A O SER 222.A H 3.011 2.056 GLY 225.A N SER 222.A O GLY 225.A H 2.961 2.015 MET 227.A N PRO 187.A O MET 227.A H 2.868 1.988 MET 228.A N TRP 220.A O MET 228.A H 2.798 1.881 LEU 229.A N ASP 232.A OD2 LEU 229.A H 3.007 2.089 THR 231.A N ALA 144.A O THR 231.A H 3.039 2.114 TYR 233.A N LEU 229.A O TYR 233.A H 3.048 2.095 SER 234.A N PRO 230.A O SER 234.A H 3.077 2.134 LEU 235.A N ASP 232.A O LEU 235.A H 3.286 2.357 ILE 236.A N TYR 233.A O ILE 236.A H 3.018 2.145 GLN 237.A N SER 234.A O GLN 237.A H 3.025 2.319 ASP 238.A N SER 234.A O ASP 238.A H 3.159 2.414 TYR 241.A N ASP 238.A OD1 TYR 241.A H 3.111 2.138 LEU 242.A N ASP 238.A O LEU 242.A H 2.861 1.903 SER 243.A N PRO 239.A O SER 243.A H 3.347 2.399 ILE 244.A N LYS 240.A O ILE 244.A H 3.477 2.589 VAL 245.A N TYR 241.A O VAL 245.A H 3.012 2.036 LYS 246.A N LEU 242.A O LYS 246.A H 3.051 2.083 GLU 247.A N SER 243.A O GLU 247.A H 3.235 2.364 TYR 248.A N ILE 244.A O TYR 248.A H 3.020 2.083 TYR 248.A OH ASP 258.A OD2 TYR 248.A HH 2.722 1.841 ALA 249.A N VAL 245.A O ALA 249.A H 2.893 1.959 ASN 250.A N LYS 246.A O ASN 250.A H 3.055 2.193 ASN 250.A ND2 LYS 246.A O ASN 250.A HD22 2.799 1.874 LYS 254.A N ASP 251.A OD1 LYS 254.A H 3.210 2.244 LYS 254.A NZ ASP 258.A OD1 LYS 254.A HZ1 3.116 2.194 PHE 255.A N ASP 251.A O PHE 255.A H 3.202 2.224 PHE 256.A N GLN 252.A O PHE 256.A H 2.860 1.884 LYS 257.A N ASP 253.A O LYS 257.A H 2.970 1.975 ASP 258.A N LYS 254.A O ASP 258.A H 2.896 1.926 PHE 259.A N PHE 255.A O PHE 259.A H 2.825 1.888 SER 260.A N PHE 256.A O SER 260.A H 3.136 2.173 LYS 261.A N LYS 257.A O LYS 261.A H 3.325 2.351 LYS 261.A NZ ASP 258.A OD1 LYS 261.A HZ2 3.251 2.291 ALA 262.A N ASP 258.A O ALA 262.A H 3.126 2.158 PHE 263.A N PHE 259.A O PHE 263.A H 2.771 1.859 GLU 264.A N SER 260.A O GLU 264.A H 3.175 2.222 LYS 265.A N LYS 261.A O LYS 265.A H 3.115 2.146 LYS 265.A NZ ASN 159.A O LYS 265.A HZ2 2.785 1.957 LYS 265.A NZ GLU 164.A OE1 LYS 265.A HZ1 3.289 2.354 LYS 265.A NZ GLU 164.A OE2 LYS 265.A HZ1 3.022 2.060 LEU 266.A N ALA 262.A O LEU 266.A H 2.949 2.020 LEU 267.A N PHE 263.A O LEU 267.A H 3.014 2.097 GLU 268.A N GLU 264.A O GLU 268.A H 2.907 2.137 GLU 268.A N LYS 265.A O GLU 268.A H 3.163 2.437 ASN 269.A N LYS 265.A O ASN 269.A H 2.920 2.190 ILE 271.A N GLU 268.A O ILE 271.A H 3.212 2.251 THR 272.A N HIS 3.A O THR 272.A H 2.714 1.759 ALA 277.A N PRO 274.A O ALA 277.A H 2.891 1.962 PHE 281.A N TRP 123.A O PHE 281.A H 2.752 1.868 THR 285.A N GLU 288.A OE1 THR 285.A H 3.038 2.078 LEU 286.A N GLU 115.A OE2 LEU 286.A H 3.278 2.380 GLU 288.A N THR 285.A OG1 GLU 288.A H 3.063 2.107 GLN 289.A N THR 285.A O GLN 289.A H 3.084 2.234 GLN 289.A NE2 ASN 21.A OD1 GLN 289.A HE21 2.794 1.866 GLY 290.A N GLU 287.A O GLY 290.A H 3.112 2.175 LEU 291.A N LEU 286.A O LEU 291.A H 3.031 2.075