Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1ah4_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 3.A N MET 11.A O LEU 3.A H 2.934 2.028 LEU 5.A N ALA 9.A O LEU 5.A H 2.964 1.987 TYR 6.A OH LYS 177.A O TYR 6.A HH 2.811 1.966 GLY 8.A N LEU 5.A O GLY 8.A H 3.015 2.101 MET 11.A N LEU 3.A O MET 11.A H 2.945 1.980 ILE 13.A N SER 1.A O ILE 13.A H 2.938 1.972 GLY 15.A N VAL 258.A O GLY 15.A H 3.027 2.256 LEU 16.A N HIS 40.A O LEU 16.A H 2.897 1.973 GLY 17.A N PRO 260.A O GLY 17.A H 3.059 2.105 THR 18.A OG1 ASP 42.A O THR 18.A HG1 2.795 1.854 LYS 20.A NZ TRP 19.A O LYS 20.A HZ3 2.882 1.923 LYS 20.A NZ ASP 215.A OD2 LYS 20.A HZ1 3.056 2.063 SER 21.A N THR 18.A O SER 21.A H 3.101 2.158 LYS 25.A N PRO 22.A O LYS 25.A H 2.816 1.942 VAL 26.A N PRO 22.A O VAL 26.A H 2.984 2.099 THR 27.A OG1 GLU 52.A O THR 27.A HG1 2.782 1.833 ALA 29.A N LYS 25.A O ALA 29.A H 3.014 2.039 VAL 30.A N VAL 26.A O VAL 30.A H 2.871 1.902 LYS 31.A N THR 27.A O LYS 31.A H 2.890 1.983 LYS 31.A NZ GLU 59.A OE1 LYS 31.A HZ3 3.217 2.290 VAL 32.A N GLU 28.A O VAL 32.A H 2.761 1.826 ALA 33.A N ALA 29.A O ALA 33.A H 2.910 1.956 ILE 34.A N VAL 30.A O ILE 34.A H 3.081 2.109 ASP 35.A N LYS 31.A O ASP 35.A H 2.907 1.942 LEU 36.A N VAL 32.A O LEU 36.A H 2.826 2.033 GLY 37.A N ILE 34.A O GLY 37.A H 3.003 2.111 TYR 38.A N ALA 33.A O TYR 38.A H 2.893 1.957 TYR 38.A OH ILE 268.A O TYR 38.A HH 2.685 1.791 ARG 39.A NH1 ILE 34.A O ARG 39.A HH12 2.912 1.958 ARG 39.A NH1 TYR 38.A O ARG 39.A HH11 2.807 1.923 HIS 40.A ND1 PRO 12.A O HIS 40.A HD1 3.058 2.244 ILE 41.A N PHE 72.A O ILE 41.A H 2.958 2.070 ASP 42.A N LEU 16.A O ASP 42.A H 2.767 1.834 CYS 43.A N VAL 74.A O CYS 43.A H 2.689 1.901 TYR 47.A N ALA 44.A O TYR 47.A H 3.029 2.079 GLN 48.A N HIS 45.A O GLN 48.A H 3.226 2.272 ASN 49.A ND2 THR 18.A O ASN 49.A HD21 2.896 2.030 ASN 49.A ND2 SER 21.A O ASN 49.A HD22 2.810 1.857 VAL 53.A N ASN 49.A O VAL 53.A H 2.814 1.919 GLY 54.A N GLU 50.A O GLY 54.A H 2.732 1.824 LEU 55.A N ASN 51.A O LEU 55.A H 2.873 1.959 GLY 56.A N GLU 52.A O GLY 56.A H 3.422 2.493 LEU 57.A N VAL 53.A O LEU 57.A H 3.083 2.122 GLN 58.A N GLY 54.A O GLN 58.A H 2.782 1.846 GLU 59.A N LEU 55.A O GLU 59.A H 3.020 2.066 LYS 60.A N GLY 56.A O LYS 60.A H 3.066 2.128 LYS 60.A NZ ASP 35.A OD1 LYS 60.A HZ3 3.440 2.682 LYS 60.A NZ ASP 35.A OD2 LYS 60.A HZ3 3.208 2.262 LEU 61.A N LEU 57.A O LEU 61.A H 2.866 1.952 GLN 62.A N GLN 58.A O GLN 62.A H 2.769 1.841 GLY 63.A N GLU 59.A O GLY 63.A H 2.885 1.973 GLN 64.A N LEU 61.A O GLN 64.A H 3.475 2.586 VAL 65.A N LYS 60.A O VAL 65.A H 2.934 2.065 LYS 67.A N ASP 70.A OD2 LYS 67.A H 3.171 2.289 ARG 68.A NH1 ARG 68.A O ARG 68.A HH11 3.032 2.190 ARG 68.A NH1 LEU 71.A O ARG 68.A HH12 3.207 2.529 ARG 68.A NH1 ASP 104.A OD2 ARG 68.A HH12 2.970 2.126 ARG 68.A NH2 TYR 102.A O ARG 68.A HH21 2.926 1.980 ARG 68.A NH2 ASP 104.A OD2 ARG 68.A HH22 2.823 1.936 GLU 69.A N GLU 69.A OE1 GLU 69.A H 3.174 2.302 ASP 70.A N LYS 67.A O ASP 70.A H 2.717 1.825 LEU 71.A N ARG 68.A O LEU 71.A H 2.979 2.027 PHE 72.A N ARG 39.A O PHE 72.A H 2.688 1.848 ILE 73.A N ASP 104.A OD2 ILE 73.A H 3.021 2.053 VAL 74.A N ILE 41.A O VAL 74.A H 2.987 2.054 SER 75.A N LEU 105.A O SER 75.A H 3.130 2.211 LYS 76.A N SER 75.A OG LYS 76.A H 2.665 1.968 LYS 76.A NZ ASP 42.A OD2 LYS 76.A HZ2 2.772 1.897 LYS 76.A NZ CYS 43.A O LYS 76.A HZ3 2.991 2.001 LYS 76.A NZ TYR 47.A OH LYS 76.A HZ1 2.781 1.977 LEU 77.A N LEU 107.A O LEU 77.A H 2.788 1.843 TRP 78.A NE1 PRO 120.A O TRP 78.A HE1 2.853 1.878 CYS 79.A SG THR 112.A OG1 no hydrogen 3.754 N/A ASP 81.A N TRP 78.A O ASP 81.A H 2.857 1.938 LEU 86.A N GLU 83.A O LEU 86.A H 2.754 1.855 VAL 87.A N LYS 84.A O VAL 87.A H 3.546 2.611 ALA 90.A N LEU 86.A O ALA 90.A H 3.153 2.240 CYS 91.A N VAL 87.A O CYS 91.A H 2.982 2.033 GLN 92.A N LYS 88.A O GLN 92.A H 2.827 1.878 GLN 92.A NE2 LYS 88.A O GLN 92.A HE22 3.432 2.829 THR 93.A N GLY 89.A O THR 93.A H 2.899 1.941 THR 94.A N ALA 90.A O THR 94.A H 3.174 2.206 THR 94.A OG1 ALA 90.A O THR 94.A HG1 3.502 2.847 LEU 95.A N CYS 91.A O LEU 95.A H 2.912 2.010 ARG 96.A N GLN 92.A O ARG 96.A H 2.968 2.004 ASP 97.A N THR 93.A O ASP 97.A H 2.796 1.829 LEU 98.A N THR 94.A O LEU 98.A H 2.870 1.947 LYS 99.A N ARG 96.A O LYS 99.A H 2.879 2.160 LYS 99.A NZ ASN 51.A O LYS 99.A HZ2 3.351 2.468 LYS 99.A NZ ASN 51.A OD1 LYS 99.A HZ3 2.912 1.958 LEU 100.A N LEU 95.A O LEU 100.A H 2.932 1.974 LEU 103.A N LEU 151.A O LEU 103.A H 2.832 1.926 ASP 104.A N ILE 73.A O ASP 104.A H 2.975 2.067 LEU 105.A N ILE 73.A O LEU 105.A H 3.468 2.609 TYR 106.A N ALA 154.A O TYR 106.A H 3.182 2.287 LEU 107.A N SER 75.A O LEU 107.A H 2.885 1.946 ILE 108.A N GLY 156.A O ILE 108.A H 2.947 2.029 HIS 109.A N LEU 77.A O HIS 109.A H 3.069 2.128 PHE 114.A N CYS 79.A O PHE 114.A H 2.918 1.955 LYS 115.A N VAL 130.A O LYS 115.A H 2.891 1.989 PHE 121.A N ASP 119.A OD1 PHE 121.A H 3.281 2.460 ASP 124.A N ASN 128.A O ASP 124.A H 2.964 1.979 GLY 127.A N ASP 124.A O GLY 127.A H 2.734 1.901 VAL 129.A N SER 301.A O VAL 129.A H 3.270 2.343 VAL 130.A N PRO 122.A O VAL 130.A H 2.858 1.893 ASP 132.A N GLY 113.A O ASP 132.A H 3.263 2.362 GLU 133.A N GLU 83.A OE2 GLU 133.A H 3.327 2.552 SER 134.A N ASP 132.A OD1 SER 134.A H 3.051 2.363 ASP 135.A N GLU 138.A OE1 ASP 135.A H 3.035 2.140 GLU 138.A N ASP 135.A O GLU 138.A H 2.980 2.150 THR 139.A N ASP 135.A O THR 139.A H 3.399 2.466 THR 139.A OG1 HIS 82.A O THR 139.A HG1 2.642 1.810 TRP 140.A N PHE 136.A O TRP 140.A H 2.738 1.873 TRP 140.A NE1 TYR 176.A O TRP 140.A HE1 2.924 1.997 GLU 141.A N VAL 137.A O GLU 141.A H 3.147 2.217 ALA 142.A N GLU 138.A O ALA 142.A H 3.322 2.449 MET 143.A N THR 139.A O MET 143.A H 2.936 1.987 GLU 144.A N TRP 140.A O GLU 144.A H 2.949 2.027 GLU 145.A N GLU 141.A O GLU 145.A H 3.433 2.571 LEU 146.A N MET 143.A O LEU 146.A H 3.141 2.400 ASP 148.A N GLU 144.A O ASP 148.A H 3.075 2.094 GLU 149.A N GLU 145.A O GLU 149.A H 3.136 2.269 GLY 150.A N VAL 147.A O GLY 150.A H 2.888 2.045 LEU 151.A N LEU 146.A O LEU 151.A H 2.941 2.050 VAL 152.A N LEU 146.A O VAL 152.A H 3.442 2.538 LYS 153.A N LEU 103.A O LYS 153.A H 2.859 1.914 GLY 156.A N TYR 106.A O GLY 156.A H 2.986 2.116 VAL 157.A N VAL 180.A O VAL 157.A H 3.041 2.066 SER 158.A OG GLN 182.A O SER 158.A HG 2.910 1.964 ASN 159.A N GLN 182.A O ASN 159.A H 2.894 2.027 ASN 159.A ND2 HIS 109.A O ASN 159.A HD22 2.916 2.026 PHE 160.A N ASN 181.A OD1 PHE 160.A H 3.512 2.541 ASN 161.A N GLN 164.A OE1 ASN 161.A H 2.903 1.929 ASN 161.A ND2 PRO 309.A O ASN 161.A HD22 2.952 1.999 HIS 162.A N TYR 314.A OXT HIS 162.A H 2.876 1.905 HIS 162.A ND1 TYR 314.A O HIS 162.A HD1 2.616 1.795 LEU 163.A N ASN 161.A OD1 LEU 163.A H 2.992 2.269 GLN 164.A N ASN 161.A OD1 GLN 164.A H 2.778 1.921 GLN 164.A NE2 ASP 307.A O GLN 164.A HE21 2.823 2.032 VAL 165.A N ASN 161.A O VAL 165.A H 3.000 2.032 GLU 166.A N HIS 162.A O GLU 166.A H 2.935 1.976 LYS 167.A N LEU 163.A O LYS 167.A H 2.982 2.116 ILE 168.A N GLN 164.A O ILE 168.A H 3.325 2.441 LEU 169.A N VAL 165.A O LEU 169.A H 2.909 1.936 ASN 170.A N GLU 166.A O ASN 170.A H 2.881 1.993 LYS 171.A N ILE 168.A O LYS 171.A H 2.870 1.945 LYS 171.A NZ GLU 141.A OE2 LYS 171.A HZ1 3.425 2.413 LYS 171.A NZ PRO 172.A O LYS 171.A HZ3 2.974 2.083 LEU 174.A N LYS 171.A O LEU 174.A H 3.323 2.406 LYS 175.A N GLU 144.A OE2 LYS 175.A H 2.897 2.150 TYR 176.A N GLU 144.A OE2 TYR 176.A H 3.055 2.123 LYS 177.A N TYR 6.A OH LYS 177.A H 2.962 2.153 LYS 177.A NZ LYS 201.A O LYS 177.A HZ3 2.862 2.076 LYS 177.A NZ GLY 202.A O LYS 177.A HZ2 3.007 1.993 ALA 179.A N ILE 155.A O ALA 179.A H 2.856 1.917 ASN 181.A N VAL 204.A O ASN 181.A H 2.859 1.939 ASN 181.A ND2 PHE 160.A O ASN 181.A HD21 3.128 2.179 GLN 182.A N VAL 157.A O GLN 182.A H 3.072 2.131 GLN 182.A NE2 ASP 42.A OD1 GLN 182.A HE21 2.955 2.111 ILE 183.A N THR 206.A O ILE 183.A H 2.988 2.050 VAL 185.A N TYR 208.A O VAL 185.A H 3.317 2.344 HIS 186.A N LEU 189.A O HIS 186.A H 2.913 1.948 HIS 186.A ND1 SER 209.A O HIS 186.A HD1 2.989 2.009 HIS 186.A NE2 TRP 294.A O HIS 186.A HE2 3.108 2.115 TYR 188.A OH ASP 229.A OD2 TYR 188.A HH 3.061 2.317 LEU 189.A N HIS 186.A O LEU 189.A H 2.842 1.917 THR 190.A N ASN 291.A OD1 THR 190.A H 3.455 2.531 GLN 191.A NE2 GLU 184.A O GLN 191.A HE22 2.832 1.915 ILE 195.A N GLN 191.A O ILE 195.A H 2.894 1.921 GLU 196.A N GLU 192.A O GLU 196.A H 2.902 1.961 TYR 197.A N LYS 193.A O TYR 197.A H 2.884 1.965 CYS 198.A N LEU 194.A O CYS 198.A H 2.901 1.950 CYS 198.A SG LEU 194.A O no hydrogen 3.320 N/A LYS 199.A N ILE 195.A O LYS 199.A H 2.937 1.959 LYS 199.A NZ ARG 254.A O LYS 199.A HZ2 2.822 1.896 SER 200.A N GLU 196.A O SER 200.A H 2.782 1.867 SER 200.A OG TYR 197.A O SER 200.A HG 2.647 1.877 LYS 201.A N TYR 197.A O LYS 201.A H 3.084 2.307 LYS 201.A N CYS 198.A O LYS 201.A H 2.744 2.034 LYS 201.A NZ GLU 166.A OE2 LYS 201.A HZ3 3.511 2.645 GLY 202.A N LYS 199.A O GLY 202.A H 3.141 2.288 ILE 203.A N CYS 198.A O ILE 203.A H 3.005 2.058 VAL 204.A N ALA 179.A O VAL 204.A H 2.958 1.981 THR 206.A N ASN 181.A O THR 206.A H 3.190 2.260 ALA 207.A N ILE 257.A O ALA 207.A H 2.769 1.805 TYR 208.A N ILE 183.A O TYR 208.A H 2.913 1.965 TYR 208.A OH ASN 159.A OD1 TYR 208.A HH 2.740 1.814 GLY 212.A N SER 209.A O GLY 212.A H 2.926 1.971 ARG 216.A N SER 213.A O ARG 216.A H 2.943 2.063 ARG 216.A NE GLY 212.A O ARG 216.A HE 3.169 2.246 ARG 216.A NE SER 213.A O ARG 216.A HE 3.085 2.603 ARG 216.A NH1 ASP 223.A OD2 ARG 216.A HH12 3.012 2.290 TRP 218.A NE1 VAL 296.A O TRP 218.A HE1 2.949 2.156 ALA 219.A N ARG 216.A O ALA 219.A H 2.905 2.016 LYS 220.A N ASP 223.A OD1 LYS 220.A H 3.195 2.433 ASP 223.A N LYS 220.A O ASP 223.A H 3.074 2.215 GLU 228.A N SER 225.A O GLU 228.A H 2.973 2.090 ASP 229.A N LEU 226.A O ASP 229.A H 3.231 2.286 ILE 232.A N ASP 229.A O ILE 232.A H 2.934 2.149 ILE 232.A N ASP 229.A OD1 ILE 232.A H 3.309 2.468 LYS 233.A N ASP 229.A O LYS 233.A H 3.255 2.280 ALA 234.A N PRO 230.A O ALA 234.A H 2.889 1.999 ILE 235.A N ARG 231.A O ILE 235.A H 3.285 2.391 ALA 236.A N ILE 232.A O ALA 236.A H 2.896 2.045 ALA 237.A N LYS 233.A O ALA 237.A H 2.894 1.934 LYS 238.A N ALA 234.A O LYS 238.A H 3.138 2.192 TYR 239.A N ILE 235.A O TYR 239.A H 3.202 2.295 TYR 239.A OH ASP 283.A OD1 TYR 239.A HH 2.849 2.151 LYS 241.A N ALA 236.A O LYS 241.A H 3.411 2.544 LYS 241.A NZ ASP 276.A OD1 LYS 241.A HZ2 3.177 2.240 THR 242.A N GLN 245.A OE1 THR 242.A H 2.907 2.003 THR 242.A OG1 GLN 245.A OE1 THR 242.A HG1 2.666 1.979 THR 243.A OG1 LEU 227.A O THR 243.A HG1 3.037 2.125 GLN 245.A NE2 GLN 273.A O GLN 245.A HE22 2.690 1.870 VAL 246.A N THR 242.A O VAL 246.A H 3.066 2.124 LEU 247.A N THR 243.A O LEU 247.A H 2.936 1.993 ILE 248.A N ALA 244.A O ILE 248.A H 2.918 2.040 ARG 249.A N GLN 245.A O ARG 249.A H 2.956 2.018 ARG 249.A NE VAL 274.A O ARG 249.A HE 3.117 2.173 ARG 249.A NH1 GLN 253.A OE1 ARG 249.A HH11 3.401 2.464 PHE 250.A N VAL 246.A O PHE 250.A H 3.007 2.046 GLN 253.A N ARG 249.A O GLN 253.A H 2.860 1.943 GLN 253.A NE2 LEU 279.A O GLN 253.A HE21 3.039 2.098 ARG 254.A N PHE 250.A O ARG 254.A H 3.123 2.334 ARG 254.A NH1 THR 190.A O ARG 254.A HH12 3.045 2.276 ARG 254.A NH2 THR 190.A O ARG 254.A HH22 2.677 1.762 ASN 255.A N MET 252.A O ASN 255.A H 2.866 1.995 LEU 256.A N PRO 251.A O LEU 256.A H 2.822 1.967 ILE 257.A N VAL 205.A O ILE 257.A H 2.869 1.931 VAL 258.A N ILE 13.A O VAL 258.A H 2.761 1.825 ILE 259.A N ALA 207.A O ILE 259.A H 3.433 2.496 LYS 261.A NZ ASP 215.A OD2 LYS 261.A HZ3 3.042 2.084 THR 264.A N SER 262.A OG THR 264.A H 3.290 2.401 ILE 268.A N THR 264.A O ILE 268.A H 2.849 1.913 ALA 269.A N PRO 265.A O ALA 269.A H 2.941 2.028 GLU 270.A N GLU 266.A O GLU 270.A H 2.949 1.983 ASN 271.A N ARG 267.A O ASN 271.A H 2.877 1.907 PHE 272.A N ALA 269.A O PHE 272.A H 3.051 2.244 GLN 273.A N ALA 269.A O GLN 273.A H 3.036 2.296 GLN 273.A N GLU 270.A O GLN 273.A H 2.819 2.088 LEU 279.A N GLN 253.A OE1 LEU 279.A H 2.690 1.837 SER 280.A N TYR 239.A OH SER 280.A H 2.774 1.905 GLU 282.A N GLU 282.A OE1 GLU 282.A H 3.074 2.181 ASP 283.A N SER 280.A O ASP 283.A H 2.682 1.944 MET 284.A N SER 280.A O MET 284.A H 3.446 2.515 ASN 285.A N PRO 281.A O ASN 285.A H 3.004 2.064 THR 286.A N GLU 282.A O THR 286.A H 2.629 1.884 THR 286.A OG1 GLU 282.A O THR 286.A HG1 2.614 1.926 LEU 287.A N ASP 283.A O LEU 287.A H 2.848 1.973 LEU 288.A N MET 284.A O LEU 288.A H 2.984 2.005 SER 289.A N ASN 285.A O SER 289.A H 3.147 2.254 SER 289.A OG ASN 285.A O SER 289.A HG 3.237 2.503 SER 289.A OG THR 286.A O SER 289.A HG 2.750 2.054 TYR 290.A N LEU 287.A O TYR 290.A H 2.895 1.948 ASN 291.A N LEU 288.A O ASN 291.A H 3.343 2.430 ASN 291.A ND2 ASN 293.A OD1 ASN 291.A HD21 2.999 2.111 ASN 293.A N ASN 291.A OD1 ASN 293.A H 3.129 2.398 TRP 294.A N TYR 188.A O TRP 294.A H 2.747 1.829 VAL 296.A N GLU 184.A OE1 VAL 296.A H 3.238 2.357 VAL 296.A N GLU 184.A OE2 VAL 296.A H 2.814 1.974 CYS 297.A N GLU 184.A OE1 CYS 297.A H 2.768 2.004 CYS 302.A N LEU 299.A O CYS 302.A H 2.883 1.987 CYS 302.A SG SER 301.A OG no hydrogen 3.539 N/A ALA 303.A N MET 300.A O ALA 303.A H 2.986 2.034 HIS 305.A N CYS 302.A O HIS 305.A H 2.850 1.917 HIS 305.A NE2 GLY 113.A O HIS 305.A HE2 2.846 1.864 LYS 306.A NZ SER 134.A O LYS 306.A HZ2 3.339 2.402 TYR 308.A N HIS 305.A O TYR 308.A H 3.000 2.086 TYR 308.A OH ALA 298.A O TYR 308.A HH 2.824 1.856 HIS 311.A NE2 ALA 303.A O HIS 311.A HE2 2.697 1.894